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GrainGenes Sequence Report: AA042163

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Sequence
AA042163
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042163
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
CDO465_WHE2G0092
DNA
ATGCGCCCACCACCCTACGCGTCGCTGCCCGATTGGCCCCACGCAGGGCG
TCCAGCGACGAGACCCCAAAGGCCCGAAATACCACGGCCCCAAACAAAAA
CACAAACGCACCAGAGAGGAAGAGAGAGAGAGACACACACAGAAGAGAGA
GGGAAAAACTTATCTGCCCTCCCTAATCTCCCTTACCCCTCTCTTGATAG
ATAACCACCCCCTCCCCCTGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGCGCCATC
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ATGTGCTGTAGATTTACATGATGCTGCTGCTAACTTGTAAGCTGTATGGT
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GCAGTCGAAACGACTTAAGGTCGGAGGAACTAAAGCTTCCCAGGGAAGAA
AACTTCCCATGCAGGCTCCTCGCAAACGAGGGGTATCTTTCACGGATGAA
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TCATCGATCAAAAAAACCTGTTAGGTTGCATCTGAAAACTCTGGGTCATA
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ATTTTGATCAACAGTGGGATGATGTAGAGTTCTATATAAAATGGAAAGGG
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TAGCAACCATAAGTTAATCTTGGAGGTTGCAAAAGAAATTTATGGGCAAT
GCTTCAGAAATAATGTTTTGTATTATCTTATTCATCATGATATGTTTACT
ATTAATAATATGTAATAATGACTGGATGGCTTGTCACCGTACTTCTAAAA
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TTGCCAGTTTTTACAAAATGTCGACTCTTTGGTACTCCATCTGGTTCATA
TTAATGGCCTCAACTTTATCTAGATTCATATGTATCTAGTTAAGTATTTA
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GAGGGAGTATATTTATTCATAAGGTCCGTGGCTTCTGTTAATTTCTTCAT
CTATCAGGTCGAGGTGCATGATGTGGGGAAGGAAATGGAGTTGGATCTTA
TTAAGCAATATAGCCAGGTTTTCCCATTAAGCCCAACTTGGATTATTATA
TACACTTCCTATTACAGTTGTATTTTGTACCTTTTCTTAAGTATCAATCT
TCAGGTTGAACGGGTATTTGCTGATAGGGCAACAAAAATGGATGGTGATG
ATCTGGTGCCAGAATATTTAGTGAAATGGCAAGGACTTCCTTATGCAGAA
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GATAATACCTTACATGTTGCTGTTCATTTGTTCTACCCCATTGTATGGGA
TGAATATGATACAAGTGATTCTATGCATAAATTGTTTGGTTGAAGCTCTA
TCTGTTGTATGAGGATGCTGTTGTTTGCTGATAATACTTATTCGTGTTCC
CCATATTGTTGTGTTGCAGGGAGAAAGATACAGATATTGAATTTGCTCAA
GAAGCAATAGATGAATACAAGGTAGGCATGTATCAGATTTACACGTAGTG
CAAAGATGCATAAGACTTCAATGATAAATTGGGTTTACGCTAAACAACAG
GCCCGTGAAGTTGCCACTGCTATACTGGGAAAAACGGTCGATTTCCAAAG
GAAGAAAAGCAAAGGTAGCTTTTCATGCTTAATTTGTGCTTCCTTGATGA
CTGAACTTGCCATAGTTTTCTTGGCTTTGATGACTAATGTTTTTGATGTC
GAATGTAATTTTTCCTTGTTGGCCTAGAAAGCATAAATACATTTAGAGAT
ATATTTTTTTGTGGAATGTCATTTTCTCTTTTGAAGCCTAGAAATCACAA
ATTCCTGATAGTCTGTGACTACCATGATGTGATGCTATGCTGCTGCTATC
TATTTACATAGTGCATTTCTCTTGTGAATTTGGCGCACCATCACTATTAT
CATTGTGAATTACTCAAGCAAAATGCATGATCTGGTCAATTCTATTTCTT
GAATTGTCGGATTACTATTCTTGAGTTTCATCTAATACTAAATTCATATT
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TTATTCTTGCTGATGAGATGGGTCTGGGAAAAACCATACAATCAGTTTCC
ATGCTTGGCTTCCTTCATGTAATTCTTTCACATTGTCCTTATTTTGCATG
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CAAATTGGGCAAAGGAATTTCGGAAGTGGCTACCTGACATGAATGTTGTA
ATTTATGTCGGAAATCGTGCTAGCAGAGAGGTAAAACTCAGTAAAGTTCT
TGCACTTGTTTTGCTTTCTTTGAGGTTTATATGTAACCTCAATGTCGTTC
TCTTATTCTAGGACCTTTTTTTATGACACCTGGTCAATGTAAATAATGCT
ACATACAGGCAATTCATGTAATTATAGATGTTATTTCTTGTTATACGGCA
TGCTGGTTGTCCTTTTCAACTCATATATTATGTAAGCTTGATTGATAGGA
AGTTACTGACATTTTCTGAGACTCTTGAGTAAGCTTTCGTGTGTGGCATG
TAGTTTGCAGTTTGTTCCATTTTGAAGCTCAGAGCTTTGCTGTTCTGCTA
GTTTGTCATTTGATGAGCGACACACTGAACACCTGCAATAGCAGCCTACA
CTTTACTTCAAACACTATCTTCGTACAACCTTAGTTCTCTACCCGCAATC
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GGGGTGATATAGAAAGCTCTTGGCGGACAACAGAGGGAACGCAGGCGTTC
GCCGAGCGTAGTGTAAATATGTCAAATACCTAGACGGCTACCTAGATCTT
TTTTACAGGCTCATTATTCAAGTCACAGAGTGTACCTGGGTGATTTGGGC
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CTTTTGTAAGGCTTTAAGAAAAGTGGCAAAAAGAAATAAATAAATAAGCA
TGTAAATTTGTCAGTGCTTACAGTGAAAATATAATTTGCTATTATGACAT
TTATTTGGAATCATGGAGTATTATATTTGAGAGACCAACACTTTCTTAAC
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TTCATACCTTCACCAGGAGGGCCAGAAAGCTATAGCATCTCTAGCTATTT
ATCAAAATATTGATTTTTTTTGCCTTTGTGGTGAGGACCCAAAAACAGAA
TAGCGAGACTGAGATTTATCTCTCGCATGCTTTTGCAAAATAATAATATT
CTCTATTACTGTACCGAGCTTCATGAATGTTGTGATATATATCAAATTGT
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CTGCATAACTTAATCAGTGTTGCACAACATGTTTTGGGCACTACTGTGTT
TATACTTTATATATGTCTAGCAGGTTGTTTTTAGGATATGTAACTCTTTT
TGCTCACGTGGCTCTTGCTTTTCATCCTATTTTCTGGACTTCGTATTCAA
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GTTACGTATTTGACATTTTCCCAATCCATTTGCTTCAGATGTGTCAGCAG
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GTTGATTACTACTTATGAGGTGATACTTAAGGACAAATCTGTCCTTTCGA
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TGTGAAGCCTCACTGTATATTACTCTTTTGGTATGAACATAATCACTTGA
ACTAAGCGTAAGTCTTATGTATTGGGTGGCTGTTGTGAAATGATAAAACG
GCATTTGTTCTCACCCTCAGGAGTTCAGCACCAAGAATAAGGTGCTAATA
ACCGGGACCCCTTTGCAGAATAGTGTTGAAGAACTGTGGTATGTATTTTC
TATGTAGACTTGTGCTAGGCAAATTTATACATGTGCTTTACACTTTAAGT
ATGTGGGTAATTCAAAAGTGAAACAGGCTGCATGCACATTTCCTCTCCTT
TGCAGCCACTTTTTTTCAGAAAACACAAAAAGCCTTTGTGTTTCTTTTCA
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TTTATTTTTTTGGGAAAGAATCATGGATGTTTCTCATAATATAAAATGAA
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AAAAAAGATAAGGCACGCGTAGTGAATATTATGATATTAAAAGTTGCAGA
ATGTCTTTTTGTGTGCAAGGCACATGTGGTTATATTTTAGCACTAAATTT
TGCAAGTGCACACCATATCATGGACACTCATGATCTATTTTATAGAAAAT
AATATTCGTGAAGTGGATTAAAAAGAGAGCGAACATAGGTTGCGTGTGCA
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TTTACCTCCAAAAATTGAGCGGATCCTTCGTATTGAAATGTCTCCCCTGC
AGAAACAGTATGTACTTTCGTGTTAATTTAAGTTCAGTAATGCAATTCAT
CACTCTTTGAAATGAACCCTTTTTAAATATATTGCTAGATATTACAAGTG
GATTCTAGAGCGAAATTTTCAGAATTTAAATAAAGGAGTTCGTGGAAATC
AGGTATTGATTTATCATTAATGTTAAATTATTTTAATCTTCATATCTTAT
TAGGTTTTTATTTATCCAGATGGTATCTGAATTCAGTTTTCTCAGTGTGC
GCTGTTGACTTTTTAGCGAAACTGTTTGTATAGGTTGTTCAATATGTTAG
TCTCAGGATTAGGTTGACCAGTGTGAAACATCCTGTATTTGGGAAATGAG
AAACAGTTGATAAATAATGGCTCTGATTAGTGGTCTTGGACTGTTTTTTT
AGTAATGCTGTCATGCTGTAATGCTTCCCAGTCAGATATGAAAGAGCCAC
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GACAGAACTTGAACTCAATTAGTGTGTTTATGCTGCGGTATTACTGGTCA
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GAACGTCGTTGTTGAGTTGAAAAAGTGCTGCAACCATCCATTCTTGTTTG
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TTACTTACTGGGGCTTCTATTAGTTTTGGATGTGTTCATCTACTATCGAT
ACTAATGGAACCACCAATTCTTCTATATAGTGCACACCCTCAAAACTATA
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GTTGGATTTGTTGACAGTGGACATAATTTGATGTGTTAGTTACCTTTACT
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TTGCAGATGGTGAGGATGTTGGACATCCTTTCTGAGTACCTATCCCTTCG
AGGATTCCAGTTTCAGAGGCTTGATGGCAGTACAAGAGCGGATCTTCGTC
ATCAGGCCATGGAGCATTTTAATGCTCCTGGTAGTGATGATTTTTGTTTC
CTTCTGTCAACACGTGCTGGTGGTCTTGGTATCAATCTTGCAACAGCAGA
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TCCCCTCATCGCTCTCTGATTACATTTTTATGCTTTTTCTTGGTTATGAA
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TGTAGAAATTGTGTTATCAACTTGTTTACAAGACATGTTTTAAATTTATA
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AGTTTTATTCACTTTCATGTTTCATGTACAGCATGCTTTTGTTATCTGCC
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AATCTATACCATCTGGCAGAATGAACTTTCAGCCATACTCAGATTTGGGG
CAGAGGAGTTGTTCAAAGAAGAGAAGACCGATGAAGAGACCAAGAGGAAG
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TACATTGGAGTTTCTAAGTATTTTGGGCAAGTTACTAATTGTTCTTAATG
TATTGGATAGGTTGCCAATTTTTCTAGCGGTGAGGATGACGCCACATTCT
GGAGTAGACTGATACAGCCAGATCCTGGAGATATGGTTCAGGTATTGATC
TGAATAGCTGATTCAGTTCCTGCTTGCTGTCAACTTAATCAGTGAGTAAC
GACAGATATCTTCCCAGGAAACTTTAGCACCTCGTGCTGCACGAAATAGA
AAGAGCTATGTTGAAGATCACCAACTCGACAAAAACAGCAACAGGAAACG
GCGAGCGATTGATGCACAAGAGAAGCCGAGAAGACGCTCTAGCAGATCAG
TCGATACAATTGTTTCATTACCATTGATTGATGGAGCTGTAGCCCAAGTA
CGGGAATGGTCATTTGGAAACGTGCCTAAGAAGGATGCCTCCCGATTTGT
TCGAGCGGTAATCTGCGCCTTTTACCAACATATTTGGTTATTCTGCTTTT
GTGACTGGTCGTATTTGCAAATATTTTGAAGTATGCATTGTATATCTTAG
CTCCATGTTTATTAGGGATATTATAACTGAGCCATAGAGGAGGCATCTCA
TGCTATCACCTATTTTAGCTGTCGGACTGTGACTCCGAGTGTTTCATAGC
CGTTTGATGCGCTATTTGCTCCTGCGTGGGTATCTACTCTAATATGAGTT
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ACCACTAGTTTCTAGATAATCGTAGTCATTGGTGTGTCAGTGTCTAACCA
TCAAATTATATTTTCCTTTGATGATGTTTTCTGCTACCTTCGTATTTTAA
CTTACTATAAGATGATGACGACCCGTGTTATGGATCGGATGTGTGATGCT
AGTGCATTTATTATGCTGTAAAAATTTGAAAGTTCGGTTATTTGATTTTA
TTAGAATTACATGGGGTCTGCAAGTTTTTCCAGCACAAATTCTGCAGTGG
TACTGATACCATGTTTGTCTCTTCAGATTTTCTGATATTCCTGTGATTGT
TTGCATGACATGTATTGCATCGAATTGTTTTGGAGTTATGGATGTGTCAG
GTGTATTTTCTCAAGCTTCATCTATCTAATTCTGATCATGAATTTTAGGT
TAAAAAGTTTGGGAACCCAAGCCAAATTGGCTTAATTGTGGATGATGTCG
GTGGTGCAATAGCAAAGTCCCCATATGAAGCACAAATCGAGCTGTATGAT
TTGCTCATTGATGGCTGTCAGGAAGCTGTTAAAGAGAACACAGACATCAA
GGTATAATTTGTTGTGATGTCTCTTAGAGAAAATGACAATTGTTCCTTGT
GCCTTATCTACCTTTACTGAGTTCAGTTCATTGTGCTTCAAATGTAGGGC
ACAGTGTTGGATTTTTTTGGTGTATCCGTGAAGGCCTATGAGTTGTTAGC
TCGTGTCGAAGAGCTTCAATGCTTGGCAAAGCGCATTGCACGTTACAAAG
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TCAGCAAGCTGTGGATGGATTGAAAGTAAATGCTGTTTGACTCCTCTTTT
ATCATTGAAAATGTTTGAGAATATAGGCTCATTAATCTTTTATATCCTTA
GCTGATGATGCAAGATTGCTGCTTGGCATTCATTGGTATGGTTATGGAAA
CTGGGAGAAGATAAGGTTGGATTCAAATCTTGGTCTGACAACAAAAATTG
CACCAGCAACACTTGGTGAAAGAGAAACGTTCTTACCACGCGCACCAAAC
TTGGATAATCGTGCTAGTGCTCTCCTGCAAAAGGTGCTCTCCCTTGCCTT
TTGTACTCCCCCTTGTGTGCACTTCTTCCTCTCTCTGTGCTGTTTATGTG
CAAGTGCATCTTTTGTTCTTTATTCTGTATGCCAAGTGTGCATGCAATTG
CTAGTGTTAATTTTAAAGCAGGAGGTACTATCTTCCTGGAGTGAGCTGAG
TGTCTATTTTGCTCGTGTTTGGATGTCTTGTGTCAGATGTGATTAATTTA
GTCGTAGCTAGCTAGCATCTGGTGCTCTTATTCCACATTTATCCAAACTT
TTGATGTTCTCGGGATCCATTAATGTTAGTTGTACCATCCTACTCATGAT
ATCCCTGTACACATATTTACAGGGTACACTTTTTTGCAAGCAACTTGTGA
TTTTTTGCTTCACTATCTGTTATACTTCTTAGTTTACTTGAAAAATATAA
GTTGACTCTTCAGTTGAATTCCATGTCAATTCTTGTATACAGTAGTTGTA
TCTTTTGCATGCGGTCAGCTTTTGACTATTTTATCCATTGACAAGAAATT
CTGTTTTTCTAGGAATTTGCCAATCTGAGTGGGAAGAGCTCAAAAGCCAA
AGGAGGTGCTAGCCAACCAGTCACTAATGAAAGCAATGGTGGTGCCCGAT
CGTTGAGAGGACGACAAAAAGATGCAAAGCCAAAAGATGATATTAAGTCA
AACAAAGATGACATTAAGAAGCGCAAGGTGGTGGAAGCTGAAGCAAGAGA
AGAGGGTGAAATTTCAGAGTCTGAAGCGGAGACTAAATATCGTTTGGACA
AGGAGGAAAAATGGCTGGAATGGTGCTCTGAAGTTTTGGATGATGAGCAG
GACATATTGAAACGCCTGGATAGGCTACAGAATACAAGTGTAAATCTTCC
GAAGGAAAAGGTTTCTGCTTTACCTGCAGATAGTGATAATCTATTCTTAA
AATTCTTCCACTAACTTCATAACCCTATGTCCCAGGTTCTTTCAAGGATT
CGCAGGTACCTCCAAACAATTGGTGAAAAGATTGGAAAGGTCGTTGTCCA
ACATGGAGAATCATACAAGCAATCCCGTAAGTGTCTAGTAGGTCCTACCT
TTATGTAGGAAGCATATGCATTGAATTTGATTTGCTTCATGAGCATTGTG
AAGGCATTTTTCATGATAATTTATTTTCATTTTTTAGCAAAACCCTTTAT
TCCGTCAAAGAATACGATCTAAATAGGTGCATTGGTTGCAGGTATGACCA
CAAGATTATGGAATTATGTGGCAACCTTTTCAAATATGTCTGGGGAGCAA
TTGCGGGATCTCTACTTAAAACTTAGTCAGGACCAAATGGAAGCTGGAGC
TGGCCCCTCACATGGGGGCAATTTTGCACCTGCTCCTCCCAACAGAGGAG
GTGCTTCAAACCAGCCTCATCCTCCTAGAAACCAAAGGTCGACAAGGTCT
TTCCAGAACACTCCAGAATCTCTCAATAATGACGAAAACACTGGGAATTC
GGAAGCCTGGAAACGCCGGAGGAGAGCTGATCCAGATAATCAGTTTGACA
CCCAACCGTTGTATCAACCTCCTCCAATCATGACAAATGGAAATAAGGTG
CAGGAATCTAGCAGTTCTGCTGGCATTCTTGGTTGGGGTCCAGTTGAAAT
GAGACGGTATGGCACTGAAAGACCAAAACGAGGTGTTCATCCCAATCGTT
TTCCTGGCGGGCCTGGGCCTTTGCTTTAGCTGAAAGTAGTAAACTTGTCA
GTTTCTAGGAGTTTTCAGCTTCTACCCAGGTAGAAATGGAGAATTGAAAT
TCTTTTTTTGCAAGAGAAAAGAATAAGATGTCAATATCTGAATCACAGCT
TGGAGTCTGTGCCTCAAAGAAACACCAGGGATCGAGGAGATTTAGGTACT
TGAACAGATGTACACAAAAGATTCCTCCGACACCAAAACATATATATGGA
TCTTGTAAACTGCCAAGAGAAAGAGTCTCAAAAATTTTGTCGGTTCAGTT
TTGTGAAATAGAAGAAAATCAGTTGGGCTCTTTAAGAAGGTTCATCTCAA
ACAATGATCTATAGTTCAGCCTCAGTACATGTATGATCTTTTGCATTGGA
ATATATAATGAATTATGGTTCAGTTGAGCCTTTTCCCCCCTCTTTATCTC
TAGCTCCACACAAATACAAACAAATTGGATGTTTCTGCAGTTTTTTTTGG
CTCTTTTAACATATGAAAGAAATGCATCATTACTTCCTTTCCAAGGCAAC
AACATATATAGTGGGTACATGATCGCGTATTTGCTTTCCTATGTTGACAT
GTAAAGAGAGGTGGGATGACTGGGTACTAATGTTGCTTCAAGCCTACCAT
AGTGTTTTTAATGATGGACACAATGCAGAACATGCGTGCTCCTGCATTGG
AGTGTGAGAAATAGGTTGGATTCTATCTGTGTTTGACAAATTATCGTTTG
CTATCATGTTCTCTACATAGTAACTGTAGTTTCATCTTTTGTTCCAGATC
ATGTGGTACAGGTGAACTGAATAAAGCTTGTGATACTGGTGATGTTTGTA
CTAACTACCTGGCTGGTTTACTGTCCAAATATCTGCGCGATTTGTTTCCT
GGGTACTATGTATTCATGTAGTGGATGAATCACACCAGATTTGTCATCAG
AGTGTTAGCTACAAATCACAGCTGAAGCAAGCAAACCTTTGGTGAGTTTG
TGGTTGCACTGTGAGTTGATTTTGAATTTTGACTTGGAATTTTTTGGAGT
TGTGCCTTAGATTTTCTCATAACTTTACAACGGTTGCACATGTTCCCATC
TTAGGATCTTCATTTGCTTCCGGTCACAGCTGGCATTGCGAAGTCATGCA
TGTGATAACTAGATGAAATGTGTTATTTTGAAACGCTGGACATGCATCTC
GATAGCTTAATTATATGCACAGTAGGTCCAAACTAAAAGATGATAGCACA
ACAAATCTGTAGCTGCACTATGTATGTAATTGAATGTATTACCTCCGTTC
GGGTGTATCGAGCTTCCATTTTTCAGAAGGTTCAGGAGTTTATGGTGTGC
TTAATTAATGAGCCCCTCTTCATCCCCCAAAAAACCCATTTGATTATTTT
TCATTGGCTTCATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.