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GrainGenes Sequence Report: AA042148

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Sequence
AA042148
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042148
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
WHE10A02.s1
DNA
TCTCTCTCCTCTCCGGGCGGTGACCGGTGACGCAACTCAGATCCGCGCCG
CCAACCTCCTCCTCTCCGATCAAGGATCATCCACCTCTCCGTAGGCGTAG
GTATGGCACCTCTCCCCTCCTCTCTCCTATTATCTTCTCCATCCCTTCCC
CTCTCTTCCCTATCCGATCTCTCTTTTCTTCTCTCCGCCTTTCCCTACTA
TGTCTTCCACTCTTTCTCGATGCTCTGTTTCTATGTATGCCTGCCTACCT
TCCTTCTCCTTTTATTTTCACCACGACTAACCCTTCTCTTCAAAGATCCA
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GTCCCCACAGCCGGCCGCGCTTGTAAATGGGCTGTCGAATCGGGAAGTGC
TTGCCACGCCCGCGGGGAGGAGAGGGGGCGCGGGAAATGGGGTAGTGATG
GCGGAGACTGGCGATAAGAAGCGGAAGGTCGACCCTGGTCCGGAATCTTC
CAGGCCAGTTCGTCGCAGCGCGAGGCAAGCCAAGGCGGCCGCATTGGCTG
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GCTTCAGCAGCTGACTCCGTGTCTCCAGTTCCGGTTGCCGCTACGCCGCA
GCAGTCCACTAGGAAGCGTCAGCGCGCAAATGGGAGCGGCCGGTATCGCT
CGGTCGCGAGGGATTTAGAGGACGCAGCTGCGGATAGGCTCCCGCCAAAG
CCAGAGCTGCCACCGTCGTCGCAGTGCTTGGATTTGGAAGGCCTCCCTGT
TTTGGATGTATTCCAAGTCTACTCCTGCTTGAGATCATTTAGTAAGCAGC
TTTTCCTGAGCCCATTTGCGCTGGACACATTTGTGTCTGCGCTGCGGTGT
ATGCACGTGAACCCTTTGATCGACTGGGTGCATTTTGCATTGCTCCGCTC
TCTGAAGAGCCACTTAGAAGATCTGGCCCAGGAAGGAGACCCTCCAGCAA
TACACTGTATTAGGTAAGAGTCTTTGATTGCTTGTTTTAATATAAGTTTA
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CTGGGAATGGATCCACATGGACGACTATACTTCGGCACCTGTGGCTATCT
TTTGGTGTAAGTCAATATAGACTTTCTTCTTTGGTCTCCTTATATGTATA
TCATTCTGAGAGTTACTTAGCCCTATCGTGATTGCTTAGGCTTCCTAATG
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GCTTACAGAAAAATGAAATACTCATATTGCAGAGATGTGATTATTTCCTT
ACCTTGAGATTTTAATCCTACATGTTTGTACTATAGTTGAATGGTTGCTT
GTTGCATTAACAGATAGATCACCTTATTAATTTGCAGGGTTGATTCATGT
GATGCGGACTCTCCATGCCATTATTATGGTCAGACTGATCTTCATTCCCT
TGCTACAGCGTTAGTTCATCATTCGTACAATTCAATCGTAAATGTGATCT
CATCATTTCGGGATATTGCAACTGAAACATCTAATATTAACGAGCGATAT
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TAACGCCTTAATTGCCAACAAGGATAGCTGCAAATCTCAGCAAGATGATG
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TAAAGCACAAGCTTTCTGAGAATGTGGAAGGAAAGAAGCATGGTCAGGAT
GCAGTTTCTTTTTGGCTAAAAACAATATGCAAGAAATATGTTAATATTTT
TGCACTGACTGACAGAAAGTTATCTGTGGAGCTTCTAAAAGAAAAATGTG
GCTGGTGTAACTCCTGCCAAATCAGTGGTGGTATTGATTGCATTTTCAGA
GTTACTGATGTTAAGTGTATGGAGAGTCCTAAACCATGTGCTGTTGGTCT
TTTGTCAGAGAAGTATCAGGGAAGTCATATTGTCCTTGCTACACATAACA
TTTTGTCAATTGAAGAACGTCTGAACGGTTTGCTATCTGGTCCATGGCAA
AATCCGCAATATAGCATTTATTGGCGTAAGGCAGTTCTGATGGCTTCAGA
TGTATCGTCACTAAAGCAGCCTCTTCTCATGGTATAACTTGTTGAATCTT
TTTTCCTTATTAAAGGCTTGATTTAATCTGTGTACTAAACTCTTACATGA
TTATTTCCTGATACTCTGCAGCTAGAGTCCAGTCTGAGACGCGTTGCCTT
CTCAGGAGATTGGCAAAAACCAGCAGACTCTGTTGAAGTCGTTGGGTCTG
CAGCTCATATCTTGGTCCGTTCATCCAATAAATCTTTAGGAGATGCAATT
GCTAGAAAGCCAGGAAAGAAGCCACTTAATGTTGAGCTCAAAGTTGACTC
TCGCGATGTTGGTGTTTATTGGTGGAGGGGTGGAATATTGTCTCGTCAAG
TGTTCCATTGGAAGAGGTTGCCTCAGTCATTGGCTTGCAAATGTGCTCGG
CAAGGTTGTATCTCTAATCTTCTGCAAGCTTTCAGATACGCTGTTCTCCA
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TCCCACCATAGTGTATCCTGAGGGTTCACAGTTCGCCAGGAGGCTCAAAT
ACATAGCTTGGCGAGCTGCTGTGGAAATGGCACAAAATGTGTCCCAGCTC
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ATTGAATATCAAGTGGGCTGAGATATTGAGGACTCTCTCTTCTGTTTCAA
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AGCCCTCTAGTGAGAGGAACAGGTACTGGTTGAGTGAAAGTCATGTCCCT
CTGAGTCTTCTAAAGGCATATGAAGCCAAAGGAATAACTCGTTCACTGAA
AAAGATAGACAAAGATGATCTTCCTAAGAACATGACTGACTTTAGATCCA
AAAAGCCAAAAAGATCAGTGTTTGATGACCTCCTAGAGAAAGCAAAAAAG
CTACCCAGCAGGCTCTGTGGTCAGTGTTATAAAACAGTAATTGACAGGTA
CGGAAATAAGTCCATTGTTTTTTATTATATAAAGCAAATGTTTAACAGTT
CATTGCATTTCCCCCAACCAGAACACTCACTGAATCATTTTTCATACCTA
CTAACAAAAGCTTGCAGATTCTATTGAAGTCCTGTGAACCTATAAGCGTT
AGAGTGGCTAAGTGTTTGTTTATATTTGGATTATTTTGTTGGAAAACAAT
AGATTGATCTGCTGTTACCATGGTTTGTTATTTTCTGACAAAAGGCAGTA
GGCCAATCCCATGGTTAAATAACTGTGTCGGTAAAAGCTTATCTTTTAGC
ATCTCTGGAAAGCAAGTACAAGAATACATGACTGCAATAATCAAGTATAA
TTAACTCTGCTTTCACCATTTTTTGATTTGCCTGTTTTCGTAGTTCGCTA
GAAAAGAGAGTCAGCTCTTTTTCCTTATCCACATTTGCGTAGTGTATTCA
GGACATGTCTTGCTGATTACATACACTGATATAGTTAAACTTTGCTCAAG
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TAAGAGGAAGCATCTAATGAAAGTAGGAAATTTCTTGCATGACTGGGTTT
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CCTCCCCGTGTACCTACAGTCTCGTGTCTCCACACTCTTGTGGTATGTAC
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TGTAAATCTTAATCATATTTGACTAATATTTTGGTAAAGTTTGTTGGTAT
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TATGTTCTGTGTTTTGTTCAATGATATATTCCTTTTGGCAAGTTATCTGA
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GTATTTACAATTACATAGACATTTTTTCATTACATGTGCATCAGTATAGC
CCTTAAGTCCGTTGAAGAAATGCAACCTTTGAAATTTTGTGTTATTATGT
TGCCATCTTAATTTTGTGGAGCCACCTAACCTATGTATCTCATGATAAAA
TATTTCATCAATTGTTAGGAATTTCTTAGGTGATCGATCATTAACTCTTA
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AGCTGCAATATTCTCATTATATGCAGCACTTTTCCATAGAAAACATTTCA
ATGTTCCTAGAGGTGGTGCTGCGGATACTGTCTATGTTTGCAACAAGTGC
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AAACCCAGTTAGTTATCAACCTCAAGAAGAAAGCTGGCCGGAAGAATGGC
AAGCTAGGCCGGTCTCGAAAGGATCCGTTGACTGTGTCGAAGAATGAGTC
GGTAAAGATGCCTGACAGTCCAGCATCAAATGAGCCCAAGAGTGAACCCG
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GCATTATTCATACTGGTTAGATGGCCTTCGATTGACACATAATGAAGATG
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GATTCAAAGATTTCAGAAAGCAGTCCAGTTTGCCGTCTTTGTAAAAAATG
CTACAGTGGAGATGCCATTTATATTGCTTGTGAGAATTGCGAAGGTAAGA
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TGCATATTTGTGATCTTTAGATCAACTTGTTCACTTGGCAACTGTGCGGC
CTAAAAATCTTCTTTGTTGTCATTTTTTTGGCCTGTCCCTTGCAAATATT
CTGATCCAAATTAATTGACTTTGATTTATCTAGATTCAGATATATCTGGT
ACTAAAACATGTCTAAATACATCGGAATCTAGACAAATCCGAGTCAATTA
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ACTTACCCGTCCCATTTTTCGTCTCCGTCCTCTGAAATAGTAACTACTAT
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CTTAGTAAGTTTACAAGACAAACAATTGTTTTTGGAATTCCATATGTTGG
CCGTGTAATGCCATTCACTTCAGTTGCTCTTCACCCCATGGGAAGATTTC
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GTTCCATGGGGATATCTATTCTATCACCATGGAAAATGTCAATAAACTCG
CGGGCTTCAAGTGCCATGCGTGCCGTCTCAGAGCTGTTCCTGTTTGTCCA
TATTCACAAGCTGATACGATTCTTAAGGATCAATCAGATAGGGAGGATGA
CATTCACATGTCTGTGGAGGACGAGGACAGCAATCGTCCGAAAGATCTGT
GCACTTCCGATGGTCTGAAAGAGCTTCACGATCATAACATTGAGGGGGAG
CTCCACTGTCATAGCATTGAGAAACAGGTTGGTAATCGTATTGGTTTGGA
AGTGCTTGAAGATTGTAATGATCTGAAAGAGACAGGCAGTCATGATCATA
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CATAGCACTGAGAAACAGCCTGATGATTGTAATTGGTTAAAAGAGCCAGA
CAGTTGCAACAAGATGGAAGAGCTTGACAGTCATAACACTGAGAAAGGTC
CTCATGATCATAATAATCTGAATGAGCTTGACAATCACTGGGGTGAGAAA
GAGCGTGTTGATTATAATTTTCTTAGTGAACTTGGCTCTGATAACAATGT
GAAAGATCTCGACAATGGGGACGGTCCAGAAGAGCTTGGCACTACTGAAG
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ATACAGATGGTTCTCTAGCTGAGCAGTTCAATACTAGCTTATCTTGCAAA
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TTTGCAGTCCAAGGTCAGTCCTGAGGATACCGTTCTTCCTACTGAACATG
AGATGGACCTTCTGGTTCCCCCGAGCTTCTTGACTTTATAGGATATATGC
CAAAAGGAAAGTGCATTCTAGCATGAGTTTCTGTGATCTTGTACTGTTCA
CTCTTCTGCTGCTTTGTTAGAGGGTTCTTTTGATTAGTTTGGGTTGTTGA
GCTACCTGACAGCTAGTTTTGTGCTATAGATAGATATTACATAATTACAT
CGGTGATGCAACCCAGTAATAAGAATCTGCAAAAAGGAAAATATATTTTT
GTGGATTCATCATATTTTGGTCGTTTCCGTAGGGAAATATGCTGACCTGA
CAAGCAGCGTTGGAGCTTTTGACTATGACATTACAACTTCAAAATTCTCA
GTAGGTATGACATGCAATATCTGGCCAGAATTTGTGATTCATTTTGCACT
GACTGGATATTTCATCGAGTACAAGTGGCTGGTTTTTGGTGGCGCTGCAC
TTGCTCATGATGCACAAGGTGAGGCTCATTTTTGTTTTATACCCTATTTG
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CGTGTGTCCTTGTTTGTTGTCTAGCTAAAGTACACTAAGCTCTCTCTACT
GGGTTTATCATGATCTCGGTAATGGACCAAAATTGATGAAAATACTTCTG
TAGGAAGTCTAGCTAAGTTTCATGCTCTAGTGGGTTTACCATGTTCTGAG
TAATAGGCAAAAAGCGATAGGAATAACTGAGTGTTAATTTTATACTGTAA
AACGTGGTTAAAGGGGGAATTTCTCTCCCTTAACTACGCTGTTAGGTAGA
AGTGAGGCACCTGCGGAGGCTGCGCCTCGAACGCGGGTGGGCGAGCTCAC
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TACTATAAATGAGTTATGTTACCATTATGGACTCATGAATGTCTTCTATT
CGAGTGGAATTTGAAGTTGCTAATGTGTGATTTATGTCATGTTGAAGCAT
TGGGAAAAGTAGAAGTGAGGCACATGCGAAGGCTGTGCCTCGAACGCTGC
TGGGCAGCTCACTGGCGTGCGCTCTAGCCAACCTAGCACTGCTCGGTTCT
CATTAGATTGTATACTATAAATAAATGATTTAAGTTACCATTGTGGGCTC
ATTAAGGTTCACATAAGCTCTCTCTACCAGGTTTATCATGATCTCTACCA
GTGCTGTTGGAAGTCCAGCTGAGATTCACGGTTAAGTTCTCTCTGCTGGG
TTTACCATGTTCTGAGTAATAGGCAAAAAGTGATGGGAACATTGCTATAG
GTATAACAATGGGAATAACATAGTGGTATTAATTTTATATACTATAAAGT
GTGGTTAAAGGGGGAAGTTCCCTCCCTTAACTGTACCTTGGGTATAAGTG
AGGTATCTGCGGAGGCTGAGCTTCGAACGCGGGTGGGCGAGCTCACAGAC
GTGTGCTCTAGCCAACCAAGCACCGCTCGGTTCTCATTAAATTTTATACT
ATATATGATTTGTGTTACCATTGTGAGCTCATTAAGGTCTTCTATTCTTG
TGGAATTTGAAGTTGCTGAAGTATGAGTTATATCCATCCTGTTTACATCC
TACTTTCCGTATTAACATTTGTTCCGTACCATATGAAATCATCAAGTTGG
CGAATTCACTGATTGTCCTCCCTGTAATATTCCTTTTTGTCGGCACTCAG
CCATGTACCTGACCATGTTTATTCTCCTTGTAAACAGGACGGAGATAGGG
ATGAAGCATTCTCAACCGTCGTTAAGCATCTAAAGCTCCCATTCTCCAGA
TTACCCTTGTACCAAGATTGACCAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.