Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA041153

[Submit comment/correction]

Sequence	AA041153
External Databases	Data at GenBank Data at EMBL Data at DDBJ
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA041153
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology	BCD157_WHE1C0061 [ Show all 7 ]
DNA	CGGGGACGCGTAGGCCTGTCCTAAAAGAAAACACTACCAAACCCTAACCT GCTGTGCCTGTCCTGTCCCCTTCCTAGACGGCGGCTTTGCAGCAAGGGGC TCCGACGAGCGGGTAGGGCTTCGGGATCAAGGTTTTCGTGATGGCCGACA TCGCGTACAGCGCATGCTGTGTCGACGAGTTGGGGGCATCACCTGTCCTC AACTGCGCCCACACCCGCTTGAGCCCGTGAGTTCGTGCCCTCCTCCTCTT TGCCTGTTCTCGCCTTCTGTTGACATAAAAAAAAATGCGATTTTTGTATT GCCCCGCTCAACTATTCTGTTCCAATTTGGAATTCATGTTCAAATTGTGA TTTTTTATTGCCGCACCCAACTCTTCTGTTCCAATTTGGAATTTTACCTA CTGCTGATTGCCATCTTCTTTTGTTGCTGCAGAGAACCTTCTATGTTTGA ATCAAACCGCGCAGCCATGGATGACCCACCTGCTGCAAACGTCGGAATCC ACAGGTACAAATGCTCGCGTGGAATTTGTAAGTTGACCCCAACAGTTGTA GTAATGGCATGCAAATTTGACGTTACTCTTAGGGATTCCATGGAGATATG TTCCGATGATAGGTTTGCAGCTCTGAGTAGCATTGAGGGGGAGCATATCG GCGATGATCTCCTCCTCCTTCTGAAGAAGAAGGTTGCACCCATTTGTTAT GTTTGGTTTGAACCATCTGACATGATGGACATAGAGCAGGTATATCAACA CACTTTTTTGTTGCTGCATTCTTGTTAGTGTTACTGGAACTTAAAGGCTT AAAAGTTATCGAGGATTGGTAATATTGGATTTGTTTTTCTCTTGAATCTA TCTTTATGGCATGCTACTGTGCCCAGCACCAGACTTCCACACTCATTCTA TAGTCCTGTATGCCCATAGGGTAATTTTTAGTGATCCAGAAGATATACAA TTGAGTCTACATGCATAATCCAGAAGTTGCGCTGCATTTTTTTCTTTACT TAAAACTGGACTTATATAGAAATTGGGCGGGGATTGGAGGGAAATCGGGG GCCAGAGAGAGGGAAAAACTAGAGGGGAGAGAGAGGGGAACGGACCTAGG GCATCAGTTCACAGGAAATTGGGCGGGGATTGGAGGGAAACTTGCTGCCA TGTTTGCTCTGCCTTAATTGTTCAAGATGGACTAAGGCGTCGCATCGCCT AGCGCTTTGAGCTCCTAGGCGTTGAGGCGCCCCCCAGCGCCTTAAGACGC CTGGGCGCCTTAAAAACCATGGCCAACACCTCTCCTCACTGTCATCCATG GTCGCCACCAGGTGTCAGGTGACATCAATTAGTATCTCCTGTTCATGGAT TCCAATGAAGGCAGGAGGTGACATCGACTAGTCTCTCACCTGGGGATACC GTGGGGACGAGACCGCTAGAAGGCTGCCATAGTTTTTCTGATTGATTTTG TATTGATCTAAATCCACACTTCACTGTAGTCCAGATCTTGATTTCTTGGA TTTCTCCTTCCTGTTCTTATATTTCTTCTCTCTTCTGCTCATGATTCCAG TCGTTGAGTGCTGGATTCATGGCTGAAATATTTTATGATTATTAAGATGC ATGAATTTGTACATTTATGTGGATGAATGCAATACAAAGAAGTTTAAAAC CTCTTGATGATTTTCCCTGAAGCTTGCTCAACAATAGGGGTGGTGTACTA TTCTTATACAACCAACTTGATCAATCAGATGTTAAAACATAAAATAAATT GGCCTGCATGATGACATCAAAAGGTTAAAGGAGAGAGTATGGGATTATTT TTATTCTCCTATCACTATGTCTGTTCTTTGCATGGGAGACTTGAACTAAG CCAAACATAAAGCTGTCCTTTTTATTTTGTAGTACTTGCACTTTCCAATA GTTTCTGTGTGGCTTGCACTTTTCTCTAGTTGCTGCTTGACTTACACTTT TCACTAGTTCATGTTTGGAATTCATATCTAGTCTACCCCAACTTGCTTGG GACAAAAGGCTTGGTTGTTGTTGTTAGAAAAGAAAAGAACACGCAAAGGT AATCCACCAGAGTCCATGGTTCGTCGCCCTGCTTTGTCCATCGATTTCAT TTATATTTTGAGGTTACAGCGAAAGCCCTAGAAACTGCTGTAGTCTGACA GGGTGGTGTGCTAATAATTGTCACAGATTGCTTTACATGGGAAGAAAAAT GAACAGTGATGTATTTAGGGCATACGTGATTCCCACCCTAACGGCCGTTA GACTGATAATAGTATAGATGTGCCTATAATGATGTAAATGTGCAACGCTA ATAAGACTAGCCTACATGGGGGTTTGACCTGTACGAATATACTATAGCAG TAAATCAGACGGTTATATGGGGGGTGGGGTGTGTAGCTCTATTGGCTGGA GACAGTTTTCGATATGTATGTATATATATATACACACACACACATACATA CATACATAGAGGAGAGGGATCTCCTATCAATGATGTGTAGGGAACCTTTT AAAGGTTTTAACGGTGTAGAAGTTTCCGAGAATCATGAAAAAAATTTACT GGAACAGTCTATATAGCCCTGGGTGCTACAAAGCACTGACATGAATTTGG CGATATGGGTACAGGGACATGGGATATGGCAATTTCTAGAAACAGCAATA CAGGGAGTCTATATAAATAATCAATAAAATGCCATGTAATAAAGAAAAAA TAATAATTGAATGCGTGAGATGAGATAAAAAAACTGCTCATTTGTTGCCT CTTCAAGTCCTCAATCAATGACTGAATGATCATCAATTTCCTCAATCCTC GTGGTACTTGCAAATTACAATTTGAGTCTATATAGCCCTGGGTGCTACAA AGCACTGACACGAATATGGTGATGCGGGTACGGGGACATCGGATATGGCA CTTTCTAGAAACAGCAATACGAGGAGTCTATATTTTTTCAGTAAAATGCC ATGTAATGAAGAAAAGAATAATTGAGTGCATGAGATGAAATCAAAATACT GCCCCATTTGTTGCCTCTTCAAGTCCTCAATGACTGAATGATCACCACTT TCCTCAATCCTCGTGGTACTTGCAAATTACTTCATATGCTAGTATTAGAA TTTGAGATAGACATACCACATAAGCTTAAGAAATTGAAAAACAGTAAAGA GAGTTGGCTTGTACCTCCTGTGTCCTCACTGTGTCGATGAAGTTCCCAAC CCCATATCGGCATTCTTTTTGTTAAAAGCACAAAATGGGACAGTCCAGAG ATATGCATATCACTTGCCTATCGTGTGTATCAGCCATAATTGCACGTGGC CATTCCGGACATGCATATACTGGTGCTTCGTAGCCTGGGTGAGCTGAAAT GCTCATTTTTTCGCCTAGGGTACGTAAATTCGTGTTTTCCCAGTTGCTCC GTTGGATCTTATTGTATTATTGTAGTGATTTTCTAGTATTTTTCATATTT TTGACAACTTTTAAACCGTGGAAACCTTAGCAGGTTCTCCAGACTAGCAA TAGCTACCCATTTTGCCTATATATGTAGTATGAAGATGCACCTGCCATCT TTTGCACTTCTCAATATATCATTTTTCTTATGTTTTAGCGTATTAGTTAT TGCTCGTGTCCAGTTTGTTCTAACTTGGTGCATTGTCCACAAATGTATTG GTTGGATCAATATGATCTCATATTGCAGGGGATTATGAAGACAATCTATG TCAACAAGATTATCCAAGCTGGCTGCACAGTTAAAATATTGATGGCAGAT TGGTTGCTGCAGCAACATTTCAAGATTGGCACGGACCTGAATAAAATTCG TGACATTGGCAACTACAATATAGAGATGTGGAAAGCAACTGGTATGAACC TTGACAGAGTAGAGCTTGTATGGTTGTCAGATGAATTAAATCGCCATGCA GTCAATTACTGGCCACTTGCGGTTGATGTCTCCAGAAAATACAGCATGGA AAAAATGGCAAGGTATCTCTTATTTTAACTAGTCAACTGCAAATCATTTG TTGTTCTTATAACAAACAAGTTTGTTTACTGTTTGCCAAGCAGTTATTGT CGAAACAGGTCATACGGGCCACAAGGACTACCTGCTGCTACGATCTTCTA CCCTTGCATGCAGGTTGCTGCTATATTATTCCAGAAGGTTGGTTTATCTA ATAGAGGGTTGAAAAGAACATAGTAATTTTTGTTGTGTTTGTGCTCTTAG CAATATGAATTCACTTATACAGCCACACTAGATTTTGACCAAATCAGTTA GCGCAGGGTACATCTTAGACATGTGAAAGCGAAGTCTTCATGGATTTCTC TATTACTTGTGTGCTACTTCAGCAGAAGGGAACTAGAGATGTTGAACGTA GATCAGTAGGCTTGTTTTTTAAATAGTGAACACTGCATAAACACCATGCT TTGGGACCATATTAAGGTCCCCATATAATTTATCTTACATATATAGAACC TTGGGAAAAAGAGCATATACTGTTTTTTTAATAATCAGAACATAATTTCT AGGAAATCATGCAGGACTGATGCTTTGTGGGAATATTTTAAGTCAGTTGT TTGAATGGAACATCCTTTATGTTGGATCAACAATATATATTACTCCCTCC GATCCAAATTAATTGACTCGAATTTGTCTAGATTCGGATGTCTCTAGACA TGTTTTAGTGCTAGATACATCCGAATCTAGACAAATCCAAGTCAATTAAT TTGGATCAGAGGGAGTACAACATTTGCTTCCAAGCGATATCTTGCAAGTT CTAGTTATAAACCATTTCTTTTTTACTTCTGCACCCAGTTTTGTGATCAT TGTATCCATACATTGGAACTGTTTGTAGTGGAAACACATTTCAACACATG TTGACTCAGACCATTTTGTTTTGTTGTTTCAGGCTGACATCTGGCTCTTT AGCATGGATCAGCGAGACATTGTCATGCTAGCTAGAGATTATGCTGAAGA CATAAATAAGGAAACGAAACCAGCTATCATACTGCATAGTATCCTCATCC AGACCTGTTATGTTTTGTTCTTTGTGTGTCGTCCAGTTTGGTGTTTGGAG CTTTAATGGTAATATTCAATGCAATATATCCTTAACTTGAAATACAGATA AGTTACCTCTTTTACCAGAAGACCCTGACTTGAACTTGCTGAGATATCCA GCGAGGACTCTCTACATGGATGATGCGGAGGTATCTAATTATAATCATTT TGTAGTGGCAGATGGTTGACCTTCAGTACTATGGTTTTATCATAATGGGT GTACGTGTACCTTTTGCATTTCCATGATAAATTCACACAAGTGTTTCAAT CCAGTTCTAGCACTCTGCTCCTTGCAATTCCTTGGCTATTATTTATTCTC TCCGAATGAATTGTCGCTGAATTGGATGTATCTAGACATGTTTTAGTGCT AGATACATCTGATTCAATGACAATTAATATGGATCGGAGGGAGTAGCTAA AATGTAATCATGAAATGAACTTATTCTACTTTTACTTGACTTTCTACCCT CACAATGGAACTTCTTAGATTTTTTTTGCAAAATTTCTGCGAGCTGAATT TAGAACTTAAACATGTCAAGCAATTCCATTTGTTCACAAGAAATTTGTCC TTGGCCATATTTCCGTTCCGTCTGTTTGTCCACTTCATTGCGTGAAACTT TTGATGTAAACTATCTAGATTGGTAATGTAAAAATTATGCCATTCAACTT ATTAAAAACAAAGAGAGTAGAAATCTTGGAAATACAAAGAGCAATACAAT TTAATCCTCGTAACTTTGAGCCCTATAGATTTCACTGCCCATTTGTACAG GTAGTGCCCCCACCCCCCAAGCACACGCACACAGTTTTTGTGAGTAAGTT GGGTCCTTTTAGGTAATTTTTTCTTCCAAGAGGTTGAATAATGGGATTGC TTAAGCAGTAAAACAGTTTTATCTCAAGCCTCTGTATTGGCTCCATTCAT TGGGTCCTTCTAAATGTGGATCAGTTAAAGTAAATATACTACCCTGCTGC CCACCGGACACCGACGCGACGCTGACAGACTGGTGTCGCGTCGCAAGGCG AAGCATACCGAAGCCAATGCACAAAGGCCTTGGGTCTGCTATCCTGCTCA TCCCAACGAGTGTGTCTTTGACGGCGTTCGCCCTTCGGTCAGCACCCTGG TCGCCAGGATCAAAGAAGACACCGCCCTATGGGCAAGATCCGGAGCCCTG GGCCTACGAGCCATCCTGCGACAAACATGGGATGTCCACTGATTTTCCTT TATTGGACCTGTAAAACGCCTCCTAGGAGGATTGTAACAAACTCTGCCTT TTCAATATAATGAAACTCAAAAGTCTTTTGTGTTTTCTGAAAAAAAGGTA GTTAAAATATAACAGTTCTGTCATTCTTTTTGGTTTATTCTGCCAGTGTG ACCTTCCATATGCATATCTAGTGTATTATATTTTTAGTGGACAATCATAT TTCAATTTTTCACGGCAATCTTTAACTCCTGAGTTCATTGTTTGCTACAA AAATTGTAACGGTTTGTATGAAATGCTCGTCTGTTTATTTCAGGAGGCTT CGAATCGGAAAATAAAACTGGCTTTCTGCCCACCTGAAGTAACAGTGTGC AACACATTTCTGGAGTACATCAAATATGTTATATTCCCTTGGTTTGGAAA ATTGGAGATAGTTGAGAAGAAAGGGAATGGTAGTAACAAGTAATATTCTT TCTTTTATCTACCAAATGTTATTCCTTTCTGTTTGTTGTGAAAGTCTGGT TTTTAATTTAGCAGTAGGATGCACAAAACTATATACAGGTTAATAAATCT ATATAATGCTCCAGTATTTATGAGAATCATTATCGTATGCAGGACATATG CAAGCATGGAAGATCTTGTTGTTGACTATGGAAGTGGCAATCTTGATTCT GATGATGTTAAGCTGGCTTTTGAAAAAGGAATAAACAACATATTAAAGGT AACATTTGCTTTCTTAATTGTGTGTATCCAAATCACACCCAAAGTCAAAT GTTGAATTGTTGATAACATCTGCCAGTATAAGTGTTTCGATTCTCTTCAA AAGGGAATTTACCATTGTTACTAAGGTGAGTCTAAAACCTCATGTCAATT AGACAACCAGTGGCAAATACAAATTTCTGGCTAATTCTTTCTTAGGCATA GTCAGCCAACTGAATTTTGATTCTCTTCAAAAGGGAATTTACCATTGTTG CTAAGAGGGCGAGTCTAAAACCTCATGTCAATTAGACAACCAGTGGCAAA TACAAATTTCTGGCTAATTCTTTCTTAGGCATAGTCAGTCAACCAAATAG CCACCATATGTTATGGCATGTGGGTGGTCTAGTTTCTATCAGCATGAGGT TTAATGACGAATAAATGCGCAAGGTAACAACCAAAGCTGAGGGCGGATTT GATGAATGCTTGCCGATATTAAGACCTGTTTCTGATTAAAAAATATACAC TCACAATTACATCTTTCATGTGTTAATAATAGAAATTTTAATATACCATC CTCATTTTCTTGGAATTAAAATAGTGACATTGTAGAGCTATAAACTTTGG TGCAGGATAGATTTACATTCTGTAACGTAGGTTTGATTCACTGTAGTGCT GATGAATCGTGGAACATTTTCCTTCGCAACTCTCATCTTTTGTAGGGTGA CAAGCAGGAGATGTAAAAATAGACCCCTGTAACTCTTTCGAAACTGAAAT AACCGGTGTACCTTTTTCCTAACCTGTAAGGTTGGGCTGAATTATTTAGT GTTATCATTCAAAATTGTTTTTTGTGTTTTTCCTGACTTGAACTTTATGT TCTTACTCAAAAGCAAGAATCTACCCTGACAATTTCTATGCACTTTTTGT CCTTACAGCCTGTCCGTGACCACTTCAATAGCAACACTGAAGCCCAAAAT CTATATTTCGCCAGTAAGGTACAGTTATTTCTTGCTATCTGTATTTGTTT TGGTAGAACACCTGAAAATGACTTGTAATGTTTGAAGTTGGTATAACTCC CAAAAAATACTTCTAATGTTCGAAATTGAGTGTTTATGTTTACGCGCTAT CTTACTAGTTAACACAAAGGAAATCTATATGTAACACCACTATATTGGAT TAATCCATTTTGGCTCGAGGTTTTGATAAATAACAGCACAAATAGTCATG TTAGCCCACATTGCATGATCACCTGATGATGATACATTGGTTACCTATGT GTAATTGAGTATCTTTATAATACGTTCACCTGGTGTCCACAAACTTAGTT TTGTTGGTTCTGTATGGGGCCTACCAGGGTACTTCAGTAGGTGTTGGCAG TTTCACTTAGTAATTCATCTGTGTTAATTTCTGCAGAACCCATGCTTTCA CATACTGTAGATTAACTGACAAGAAAAAAAAGCAACATATGTCATCAGAA ACAATTTGAATGAATAGAATTTGCATGCAGTTGTTTTTATCAGAGAATAG ATAAATGGAGATGTCTTGTTTGGGGAATGGTTTGTCCTTAAGATAAGCCA ACTCCAAATTTGTAATGCACAATGCTGATAGGAAAGGAAGAACGGGACCA TCCCTCATCAAAATATCAAAGAATGACCTCATTAACCATAATATGCAAGG ATTGTCTCATTCTTCCAAGCATATTAAGCAAGAAAATGTGTGATGCTTAA TTTTGTGTTTTTTCCACCTCAGTTGCAGGATCAAATTGCTGCAGATACTC TGAAGATTATACTACAGAACAAGGAGATTGACAGTCCTGTAAGTTTTCTC GTTCTGAACAGATAGATCTGCTGGATGTCTTGTTAGCGTAGCCAGCGCTG CCTAGTTTCTAGTGCCTATACATGCAGGTTCAGGTTATCCACCCTGCTGG TGGAATACGAAGTAATCAAATTTCACGTTAATCTCAAAATATTTTTCTAT TACATCATTTACCTTTCGGCGGCATCATATGTTTTAACTTTCTAACCTTT TTTTTTTCCAGTGGTAGAGTCCCTGAACAGCAGGAGCGAGCTGCCATGAA TTTAGGCAAAGCCTTTAGTGAATTGCTGCTTATAAAAGCGCAAGTGTTCT TGCCCATTGAACATTTTGGCTGGCTACGCGCGGAAGAGGAGGAAATATTA GATTGCCAGAGGAATAAAGGCTTGATAGTAACCCACCCCGTGTTCACTTG CATATGCAAGAATTTTTTTTTCTTTATTTTGCGAAGTCATATGCAAGGAA TTGTTAGATAGGCTGCTTAACTTAATGTCCGGTTGGTTGGTTCTCCTTTC CGTGTGTGTACATTGTGCAACATTGTCTATATATTTAAGGCAATGTACAG GTTTTGTGTACGTTTTATCTCAATCAAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.