Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035301

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035301
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035301
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology	ABC161-5
DNA	ACAGGAGACAGGAGAGGCACCTTCTCCTGGAAGGCAAGGGAAGCCACTCT GCAATTCACTCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCGTCGTGCGCGCCTCGACTC GAACACCACCAAAAAATACAAACCCCGGCGCCTCTCCTCTCAATCTCCCT CCCCTCTCGCTCTCTAGTCTCTCCCCGTCTCCGCCTCCCGAAACCCCCCG CCGCCGCTAGGAGCGATGGCGACCGGCGCCGCCGCCGGACGGGCGTCGGT GCGGCCCGTCGACAGGAACGGCGCGGCGCCACGCGGCAGCGCGCGCTCCA AGTCGGTCGCGCCGCGGCGCCCGCCTTCCCCCGCCCGCGCGCGAAATCCC GCCGCCGACCACGACGGCGCCGCAGGTACGTCTGTCCCTTCCGCTCGTTG AAATGCATCAGACAGAGGAAGCGCGTGTGCGGTGTTTAGGGGTTTCGGGC AGGAGGCGACGTGGAAGTGGCTTCAGAGCTGAAATGGAACAGGGAATGCT GTAGCTAGACGCCCATCACACGATTAGCAGCTGCTCCATAATACTTAGTA CTATACCTGGTACTACTAATTAACGGCAGTTGCGTGAAATGTATGTGCTT ATTCCCGTCAGGGCTGGCAATCCACACTCTCCAGTTACATCATGATACAG TGATGCCGGCACATTATTATTCTTATTATCGTTACCATTTACAAGTTTTA GAATCGTTTCCGGAACTGATAAAGGGTGCTCTTCTCAGATTTGTGCAGAG TGAGGGTCGCCGTAAGGATCCGGCCTAAGAACTCCGATGAATTAGCTCAG GGTGCCGACTTCGACACCTGTGTTGAGTTGCAGCCTGAGGTAAGCCTGTC CATCCTATTTTTGATTTTTACTCTCTGCCTGCTCCCAGCTTCGTTGTTAG CATCACCAGCATCGAGTAAAGTTTTGTTTATGTGATGCTCTCGTTCCCCG CAGTGTAAGAAGCTGAAGCTAAAGAAGAATAATTGGGCCTCTGAATCCTA CCAGTTCGATGAGATCTTCACTGAAAATGCCTCACAGAAGCGCATATACC AGGTCGTCGCCAAGCCTGTAGTCGAGGCAAGTCATGCAACATAAAATTAT TTGGGAGCAATGTTTAAGTTACTTGCTAGAACTTCAAATACTGCTAGTAA TTTCTAGTCCATTATTGGAAATAAGAAATTTCTGAAATCTCTGGTATACC CTGTGATAGTTAGCAACCCTTTTGTGCCTCAAAGTAGCTTACTGCGCCTG CTCAAATTTTTGTGTGGCTCATCTGTGATGCTAAACAGTATTGCAGAAGT ATTTTTTGCTTCAGTTACAACAGTTCAGTTAGACTCTCGCTTATTTTTGG TTTGCTAGATAACTTTTCATTTTTCATTTGTTGCTTCAAAAACTACTTTC ATCAGTCCCTTTTCTCGGATTTTATTAGACATGAAGTCATATACCTATCT TGAGCTTTTGACCTGAGAAATCGTAGAATCTATTCTGATAAACCTTTGCA GAGTGTATTAGAAGGGTATAATGGGACTGTGATGGCTTACGGTCAAACAG GTACTGGCAAGACATACACAGTAGGTCAGCTTGGAAAACAAGACCCTTCT GAACGTGGTATAATGGTCAGAGCGCTGGAGCATATCCTTTCCAGCATATC TTTGGAGACAGACAGCGTGGCTGTATCATATCTCCAGGTTCAGTTCACGA CTACTAACCCTATTTTCTTTATATACATGTTACCATTTCTTATCAGTGGA CACTTTTTTTTGCACGGATAGCTTTATAGCTTTCTACTAAGGACTCACAA TATCCATTTAGGTTTGGTTTGTGCACGAATGATCACACCTTAAGCTTACC TTATGGCACATATATTGAGTCATTGACATAAACTGCGATGAATGAGTGGC ATGTTTAGGTAGTAGTAAATTTGGATTGATTACGGAGAAGCACGAATTTT GCGAACTGATCTTATGCCTTTGGAGACATAGTAATTTATAAAATGGTTTT GACTATTTTCACTTGTTTGATTAAGCCTCCACTTGTCCATAATGCAAGAA AAACGACAAGTTATCATGCTAGAATGAATTGTATGACACACAACATGAAT GAATGTTAGTGAACTTTGAACTATTGTATCTGTTGATGACCACAAATCTT CTTATTGACCTTGCGACGCAAAAGTTGTAAAAATGGACCATGATTCATCC AAGCAAGTCATCAGTAACTCGTGCTTATGCTTATATCTACTCCCTCTGTT TCAAAATATAAGATGTTTTACCTTTGTGAAGGAAATGAATCTAGACTTGT TTTAGTACGTAGGTTCACTCAACTTTAAGATGAATCTACACACTAAAAGA AGTCTAGGTTCATTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAAC GGAGGGAGTATATATTTAAGGACTGATAACATATACTTAGAATTCTTGAT CTAACATCACCTTTATTTTATAATATCTTGTCATATTTACGTTGTATCTG CTTGATTTATAGCTATACTTAGAATCTGTTCAAGATTTACTGGCCCCGGA GAAGACCAATATTCCAATAGTCGAGGATCCTAAAAGTGGTGAAGTTTCGT TGCCAGGTGCTGCAATAGTTGAAATCAAAGATCTTGAACACGTTTTTCAA CTTCTACAAATTGGTGAGACAAATCGTCATGCTGCTAATACTAAGATGAA CACCGAGTCATCTCGCAGTCACGCTATTCTAATTGTATGTTGGTCGATTT CTATCTTCTTAGTGTATGCTGCTTTTATTAAGATTCTTTAATGAAAATTC AATGTATTTTCAGATTTATGTACAAAGAAGTGTAAGATTAAAAGAAGAAA GCACTAGCACTTACAATAGTGTTCCAGAACATATTATTCCTGATGATTTA CCACTTGTTCTGAAAAGCAAACTCTTGATTGTGGATCTTGCTGGATCAGA ACGAATTGACAAGTCAGGTGAAATCCCTCTCCATATTATTTTCCTAATAT TGGACTTCTGATTATTTGATGTTGATGCAAACATCTTCATACTTCATATA TTGTATTGATAGATATGATTCGTTTCTCAGGAAGTGAAGGCCACATGATT GAAGAAGCCAAGTTTATTAATCTTTCATTATCATCTCTAGGGAAGTGCAT TAATGCACTAGCAGAAAATAGTTCTCATATACCAACAAGAGATTCGAAGC TTACAAGGATGCTTCGTGATTCATTTGGAGGTGCCATTCTCTTCATGTGC TTTTTTTAATGACATGCTTCTTGATAGCTAACCAATGTTTGCTAGAAGTT TTTCATTGGTTTGTCTCAATTTCTGACCTAATAAACATATAGGTTTATAT TCGAATGTGCAACGACATTTGTTCAAGCTCACCTACGAGGCTAGGGCATA TGTTGTGTGCTACTGGCCAACAAAAGAGTAGCAGCTAACTACATCACACT TCTATAGTTTGATACTTGATTTCGGGCCATTTTATCTTTTATGATAATAC AAAAAAGCTTTGCATCTCAATGCCTTCGTAGAAGGAAAGTTACAGTACAA GCATATGATCTAGGCCAACCCCTAGGGTGCACACACTACAACCCAATATT TACACAGCACACATGTTTCTTAGCCAACAATGGCAACTTAACATAAGGAG CACCTACAATTGTGCAGTCTCTAGGACCTTCCTTGATTATCTCCACGTAG TCTTCAAAAGCAGCGTCTCAACTTACAGCAGACAATGCAATAAGTATTTA TAATGGAAAACAAGCAATTCAAAAAGAAGGTTTTCCGAGGCATGAGGAGC TAAGAGTTAACAAGTGCCAATTCCCTACAAATAAGAATTAGCAACTGCCA AGGTTTAAAATAGTTAAGGGGTCAAATCATTGTTATTTAATTTTTCCATG ATATAGGCATACAGTTTATCTGCTCAAATCCGCAATTGTTTGCAGGAACT GCTAGGACTTCCCTTGTTGTGACAGTAGGTCCATCCGTAAGGCATTACTC GGAAACTTCAAGCACAATTTTGTTTGGTCAGAGAGTAAGTTCAGTTGCTC ATTTTCTCCTTTCTAGTTCCTAGAAATATGCCTTCCTTCTATGGAAGTGA ACTCTGTATAGTTAGGTCGACATAACTTTCCCCACTTGACATACGGTGCT TACTAAGATCTAATCCTAATCGCTCTCAAAAAAAAAAAGATCTAATCCTA ATCAGTTGTAGACCATCATGTTTCGGCACTTACTCACCTTACCTAATGTG CTTTCTTGTACTTTAAGCTGGTCATGTCATCCAAACTGCTTAAATCGTAC AAATTGCTATAGTGAAACTAGGTGGCGTTAAATTTGCACAAGGTGTGGAC GTTTATAATATTGGAGCCTTAGTTCATGAGATCTACTCCATTTCTTGTTC TTTGATCTTTCCTATCCAAAGAAACTCTTTTGGACATTTTCTCAAATAGA CTTGTTTGTTCAGTTGCTTCATATTGCTTCTTCTCGCTTACGCTTCTAAA ACTGTACCGAGTACTTCAATTGTGATTTTCAGGCTATGAAAATAGTAAAC ACAATAAGGTTAAAGGAGGAAGTTGATTACGAAAGCCTATATAAGAAGGT AGAAAGTGAGGTTGATCATCTCACATCAGAGATTGAGAGACAGCAAAAGC TCAAACATGATGAGAAAATACATTTGGAGGAAAGATTGAAAGAGTCAGAA ACATTCTTGAATGATTTAAGAATGACCTCTGGCATGCAAATTGAGGTATA TTTTGTTCATATGAACTTTGGATTATATATGTTCATTTTTCTATTGATTC TTTAACACTGCAGTAACAGTCTACTTTGATATGTTCATATGAACATTATA TATGTTCATTGTTCTATTATCTTTTTGCTTCCCGAACAATGACCCACTAC TTCCTATTGAGAGATTGATTTACATTAGGGCTGTTCATTGTTGTAATGCA AGAAAAACAGCCTTTGCATTTATTTTTATTTTTCCAGAAAGTGGTTTGTT CTGAGCATTAAAAAATAACTACTTTGAATTCAAAAAAGTGTGTTCCAGGA GTAATAGGTGATTTATTTAACAGAATCTGCAGAAGGAAAAACATCAATTT GAATACGCAATAAAAAGATTGATGCATGAGCTAGAGGAAAAGGAACACCA AAATAAAGTTTTATCCGAGAGAATCATTCATTTAGAAACATCACTGAACG AAAAGAAGGTATCTTTTCTTTGCCACTTTGATCCATACTTTGAATTTGTA TTCCTTACATTGTAATGCAAATTTCTGTTTGGATGATAATTTTTGTGTTA AAAAAATTTGTTGATAGTAGCAACAACAGCTTGAGATTTTCTCAAGCACA AAAATTCTTGCTGAAACATCTAAAGGCCATGAGAGGAAAATGGGAGAATT GGTAAAGCAGCTTGAGGATGAAAGGTCTCGTTCTGCTAATATGAAGAGCC ATTTTAATATGCTACAACAACAACTGAGTGATGCTCAGAATTCTGCTCAG GTATACTTTCAGAATTGGAAATTCGTCCATCATATCACTTGTAAGCTAGC CATACTTTGTACTCTTCTTTGTTACTTCCTGCCGTCATGCTTGGTACAAA GTGCTATAACTAATTAACTATTTCTTCATCTCTAAATGAATAACTTCTTA TTAATTAACTAAATTGTACCAACTGTTTGGATTCACCTTGGATAGTTTGT TGAGCTTCCTGAACAAGACTCGTGTTTCATGCCTGAAATGAAAATTCCCA GGATATCTTCTACCTAGTTCAGACCCAACTAAGTTCAATCTTATATCAAT TTAAAACGCATGTTTTCAGCTATTTAAGATGGCTTATTATATATCGAAGT AATTTACGCTGGAGACCTGTCTGTGTATGCATGAAATAACAACCACAAGA AACAACAAAACTTGCCTAAACAATGTTGAAAAGTGGCTCCAACTTGCGTT ATCAGGATAAGTCTGATGTATATGCCAAGAACTACTGATATTGGCGGTAC ATATGTTAGATACTTCCTTGGCATATAAGTCAGACTTATGCCTATAAAGA ATTTTAAACACTACGTCGATATCAACTTGACCAAGCCCACCACTATCAAG AAATTATGTACAGTGTTCTTGGAATTTAGCTTTCATCTAGTACTATTCTA TCTGGCATTAGTTGGTTGCTTTCCTACATGTCTGTAGCATGTCATGTCAT TACTTTCCTACTGTGCAAATATACAATATGTCTGCTCGAGGGTCTACTTT TGTCTTACAGAAATTTTGGAGAAAATAATCCAAGGATTTTTTTTTCAGCT CCAGGAAAATACGGCCTGTGAGTTGAAAAGAGAGCTATCCAAAATCACTA AAGAATTTACTAGTCAAGTACACTCACTAGAAGAAAAAATCAGTCAACTC ATATCAGAGAAGGTATGTGAAACCAAGGATAGTTCTGTCTCCATGTGTAA CATTTTTCATTTCTTCTAAAAATATGGTTATAAATGTTTGCCTTAAAATC ACAAAAAATATCAACCACCTGTTTTTCGCATAATTCTTGTAGGACTTGAT ACATGAAAAACTGATATCTGCACAAGAAAAGGTGCAATATGAAACGAGGC ATAGGGAGAGCCTTGAAGCTGAAGCTCTAAGGTTGAAGCGATCTTGGACT GATAATTGTGTTGAAGAGGTACCATTATTATATTATGACACTGTTGTTCT GATCCTTGTTCTATAAGAACACTAATGTTTATTCCTCTTTGACAGTCTAA AACATCATGTGGTATGGTTAGATCAGGATCTGGATTCGGTAGTGAGGCAC TTATGTCTAAATCAGGAAAACTGAAGGAGAGCCTATCAAGTCAGAGAGGT ATCATTTCAAAGATACTTGAAGAAGGTACTACTACTCCATGGAAGAATAC ATGGGAACATGTTTTTCTTTCTCGGGACACCATCTTAACATTGCTTGTGC TCTAATTGGGATTCAGTTGGTCTTACAAATGTCCTGGCTCTGCTGAAGTC TAAAGAGCTGGAGGTGCAAATCCATGCTGTCAAAACGGTCGCTAATCTTG CTGCTCAAGGTGTGGCATTTACCCTTTTCTTTGTAAATCTACGTAAATTT TGTGATATGATCTATGCACACGCACAATTTCTAGTTTAGATGTTAGCATG TGCAAACAGCTCTTGTTATTATTCAATGACTAGTTCATAAACCCTCTTTT TACCTTTTATTTTTGCGCGAGGCACTATCATAATCTTGAATAGTTCTTAT TTCAGTGAACTCAACTTTCTATATTTATGTTTTCTCTTCTAGAAGATACT TGTTAAAATCATGAAAAGTTCTCCCATGCCCTTTAATTTGCAACTGCAGA TATTAATCAGGAAAGAATCGTCCAGGAAGGAGGGCTCGACGCTCTTCTGT CACTTCTAGAAACATCAGAAAGCACTACAATTCATCGAGCCACTGCTGTT GCCATTGCTAACTTGGCAATGAATGGTACTGAATCTATTCCAGATGCTTA TCAGTATTATTTCAAAAAGACTAATCCATTGGATTGCTGGTCTAATATTG GTACCGCGGAAATAGTTGTTAATGTATTTTTGTTGATTGTTAACCGGACT CCCCCTCCCCTCCCCACCCCACCACGGCCCACCCTGGACACATGCACGCA CGCGTGGGTGTGCGCACAAATTAATTCCAAATTGCCAAGTGGTCGCACTG CTAAAGAAAGATTCAGTCTCGTTTTGTCGTCAGCTAAACTACCTCCTGCA TTACAATGTCCTGGCTCTGCTGAAGTCATAACTCTTAGTCATGCCATTTT CTCAAAAAAGGAGGTTTAATATATATGTATTTGAACTATATCTTCATTAT GATGAAAAATTTAAATCAAATTAATATGTTGACTCTTATGTAGGCTGAAG TGATTGTAATTTATTTCGTTGCCTTCTTAAGTATTACATTAATATTTGTT ATGGCAGTATCAAACCAGGGACTTATAATGAGCAAAGGAGCAGTTCGACT ATTAGCAAATGTTGCGTCTAAAACAGATGATCCTCAAACTATGCGGATTG TGGCTGGTGCAATTGCCAACTTATGTGGAAATGGTACTGATTCTTATATT CAATGTTATCTACTATGTTTTTGAACAACATTCTGTTTAATTAAAATATA ATGTTGAATCTGAAATCTAACACTTGTTGAACCTGAGCCATGCCATCACG ATCCTTACTCGCACTAAACGCCATCAAATTGCTAAAGCTGGAACTAACAC GAAGGTAACATTCATGTCCATGTCTAATAAATGGGGATATAGGAAAACTG GAAAAGCTAGTCTCTGTCTTCGAACAAAGGATATCATAGCCCAAAGAGAA AACTAGTGTTTTCTAGCTGAATCCATCCCATACAACTATTTTCTAGACTC CTCACCTCAGGAAAGGACTACGTCTTTGGCTTCAGTTCAAGACTAAAGTT GCCACCTGCCAAACTTGCTTATTTGTGGAGTAGAAACATTGAAATTGGCT TATTTATTTGAAACATCACTCAAGCAGTATCCAAGAGGCCAAGATGGCAT ATAGGATGATGAAATCTGTGACCTTTTCTAGTTTTTTGTTCTTAAATAAG AGTTGGGACAGCTGCCAATTACTTTATATTAAATTGACACTGAAAATATG AGACTTGTGTTATGTGTATCATTTTCCAGAAAAATTGCACGTGATGTTGA AACGAGATGGTGGAATAAAAGCGCTGCTAGGGATGTTTGAAACTGGACAT AATGATGTCATAGCTCAGATTGCACGAGGACTAGCAAACTTTGCAAAATG TGAATCCCGAGTAACGAGCCAAGGTTTGTAACATCTCATTTATTTTTCAT AAATTCTTTCATGATCTGTTTTTGTTGGGCTCAGTATGGTTGCATGAATA TTAACTGTAAGTGCAGAACTGTTTAGTAAATGTGATTTTGTATTATGGCA ACAAGAATCAAGCCGTTATGATAATTTACGCCAATCTTGGTTTACTTCCG CAATACATAATTACGAAGATGGGATTACACACTACAGAGGCATGTTGTTG TTAAAATGGTGTGTTAATATAAAATTGCTCTCTTATTATTGGACCTGAAC TGAAATTTTGAAGAAATCTACTACAGTAAAATAGAAAAAAATGTACATGA TGATCTGTGATCGAACAAAGGTTCTAATAAAAAATGATTAATGACATGGC CATTTTAACGTGACTGATAATGTACCATTGTAATTGTACATGAAAATTCA AGCAAGGAAAGTTGTTATAATCATATAACATATTATCACCTAACAAATGC ATTCATAACTCGCAACCTTCAAATGTCAAATGTCTGCTACCATGGAATTA TGGAGGCGCTACTGTCGTCTTCTCTAAATAAGTGAAGATACATACACATA CTTCAATAGATTGAGTCCGTGTACTTTGAGTGTGGAACATTGATGTTTCT GATGATCCAGTAAACTACTCAAAATAGGCCACAGGAAAGGAAAGTCCCTT CTCGTCGAAGATGGTGTCCTCACTTGGATCGCGGTCAATTCTACCATGTT TTCTCCTTCGACGCGAAGACATATTGAGCTTGCATTTTGCCATCTAGCTC AAAACGGTACGTAATACCGAAGCTTTGCCTCCTACCTGTATTCCGTTCAT AAGCTTGTTTACTTGAACAAAGACAATAGAGGACCTTCAATTTTTAATAG AGATTGTTGACGGTGTGCGTTCTTTAATATCAAATGCCCGCACTCACATT TGTAGAGGAGAACTCCCGTGATATCATTGTAACCGGAGGGATTAAGGAGC TCCTCCGCATCTCAAGAGAGTCTTCAAGCGAAGATGCCAAGAAACTGGCG AAGAAGGCATTAAATTCAAACCCGGCTTTCTTTAAGGAGATACAGTGATT CTCTTGTTTTTGATCTCGTATTCGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.