Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA034860

[Submit comment/correction]

Sequence	AA034860
External Databases	Data at GenBank Data at EMBL Data at DDBJ
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA034860
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology	WHE10F12.s1 CMWG645-5
DNA	AAAAAGCTCCGACACTCCTCTGCCATTTCTGTCTCGCCACAAGGCCCACA ACCGTCTCATTCCTCGTCGGGTTTCTCTCACCGTCGCTCTCTGCTTAGTC CACCGCGCGCCGCCCACCAGTCCACCACCCAGACCCCACCCTCTCCTTCC TCCACCCCGTCGCACCGGCGATCCCCGCCGTCTCTTCCCCTCCTCGGTAA GCTTCCGGACGACCCGATCCTCCTCGCCCGCTCCTCCCCTAACCCCTAGC AGTTTCCCCGTTTCCATCCGACCCTCTCGTGTGTTGCGCCCCTTGTCAGC TGTCGCTTAGGTAGGTCAATCGCGGTCCTGTGGAGTTCGTCCGCGCTTGC GGGCGACGAAATTCCAGTTCCTTATCTGCGATTAGGATCGGCGTGTCAGC TCGAAACGTCGTCATCTTCGCGCGATTGGATTGCGGCCGCCGCTTATACT TTTCTGCGATGGTGCTGCTAGGGCTATGGGTATCATTATCAAGTAATGAT CTCGGTTTAGACTAGACAGTCATGGGCGGGTCATTAGTTAGGGCATGACG ATTAGAGAAAGTGACGGGTCTTTTTCTATCATTTGTGTAGCATCAAGTGG GTCCGGATCACTCCAAATCATTTGATTAGACTCAGCTGCGCACAACAGGA GTTGATCTCCTTGACCATGGCTTTGACTGTTTTGTTTTAATTTCGGAGTA TATATTCCAGTTGTTCCTTTGCTTATTCTCGGAATAAATTTATCAGAATT ATTCTCTTTTTGCATCCAGTTTGGTTGCTCGAGCAGATGGATCCTTCGGA ATTGGATGGCGAATCAAGGAAAATCAATAAGCCTAAATGTACTTTTTGCT CCCCGCCACCTTATTTATCTTATCTCGAATGGATCCCTTATCTGTATGGT CTTATTGTTTTGGATCAAGTACTATTTCAACAAATTGACAGATATTATTT CTTGGTTCTGTTTGCAGATTCCAAGTTTACGCAGCAGGAGCTTCCAGCAT GCAAGCCGCTGCTGACACCTGGAATTGTAACTATCACAGTCACCAACTTG TTTTGTTTTTCAGATATGCATTTGCTCTATTACACATGGAGTTTATGAGC TCCTTGTATGTGGTGATATGTGTACATGCATAGGTCATTACTGCTTTCTC GCTCATCGGCGTCCTATTTGTTCCGATTGGGATTGCATCTCTGTTTGCAT CACAGCAGGTTAAATGAAAATTTCCTTGATCATATTAGATTTCCCTGTTG TTATTCTTTACGGTGCATTTATTTTGTTATGTACCTTCTGTGATGTAGGT TGTCGAATTGGTGGATCGATATGATATAAGTTGTGTGCCCGTGGATGACA AGATCGGATTCATTCAGAACTCCAACATTGACAAAACATGCACAGTCAAT TTGACTGTGAGTTTGCAATTAAATTTTTTTCTCAGTTATTACATATTTAC TTGTGATGGCTATTGCTTCTGATGAGATGCAGTGTTTTAATATCGTAATT TTTTTAATGAAGTAACTGGTTATTGTATACCTTTTAGGTCCCTAAATACA TGAAGAGTCCAATACATGTATATTACCAGATTAGCAACTTCTATCAAAAC CATCGAAGGTATATTCCAAAATGAAATGCTGTATTGGAAAAATTATATTC CTTCCCCATGTGGTTCTCAATTAGTGATTTGCAAGGAACTTGAGAAAATT CATTTCTCACCTTTATTGCATTTTATTAAGACAATGTCGAACTTGATCAA TACTGGCCTGTTAGAATAAATTGTGTTAGACATACTCAGGCCAATTGTTG CGCTCTTTTCCTAGGTATGTGAAAAGTCGAAATGACAAACAACTGCTGTA TAAGAATGTGCATTTGGGAATAGAATGTGATCCTGAAAGTCATGCCGCCG GTGGTGCTCCAATTGTTCCATGTGGCCTTGTTGCTTGGAGTCTGTTCAAC GACACATATACAGTTAAGGTCAATGGGGAGACTGTTGAAGTGAATAAAAA GGATATAGCTTGGAAGAGTGACAAGAACAACAAATTCGGCAATGATATCT ATCCTAGTAACTTCCAGAAGGGAAGTCTCATAGGTGGTGCTAAGCTAAAC GAGAGCATTCCAGTACGTGAATTTTCCTCTTTCTGGAATATATGGCAGAT CTCCATTATCATCGTTGTACACATAAATTTCTAGATATTTTACTCGTTAT TTGTTTCCTTGTCATAATTTTTAGTTAAGTGAGCAAGAAGATCTCATCGT TTGGATGAGAACCGCTGCCCTCCCAACTTTCAGAAAGCTATATGGCAGAA TTGAGAAAGATATCATGGCAAATGATAATATAACAGTAGTTATTCAGAAT AACTATAACACATATAGTATTGGAGGCTCAAAAGCGGTGGTCCTTTCTAC TGCATCTTGGATTGGAGGGAGAAATAACTTCATTGGTATTGCGTATCTGA CCGTTGGTGGTTTGTGCCTTTCCCTTGCTTTGGGCTTCACAGTTCTGTAC ATGGTTAAGCGAAGGTATGTTCCATAATTTGCTCACTGGTATTTGGCCAT ACAGTTTATGCATCCAAAACATGTTTTTAAGCGTTCATACCACTTACTTT CATCAACCCTTTGTTATCTAGTTGAATGTATGTTGTTCTATTTGATTGAG CCAATGCTATTTTTGGTCCTGTCAATTTCAGTGAGATGAAGAAAATACTA CAATTGAATCAAATCGTGTTTTTATCTTTCCATGATATAGAAGCTTGAGC TCTTGTGACCAGCTTGTTGCATATGAACAATTATAACCATTATATGAAAT TTGGCAATTGATTATTTCTGATGGCTCTAATCGTTGCACCAAGATAATCA CATTCAGTTATTTTCAGGACCCTTGGAGACCCCTTGTACATGTCATGGAA CAGAGATGAATCAAATTGTGTTTTTATCTTTCCATGATATAGAAGCTTGA GCTCTTGTGACCAGCTTGTTGCATATGAACAATTATAACCATTATATGAA ATTTGGCAATTGATTATTTCTGATGGCTCTAATCGTTGCACCAAGATAAT CACAATCACATTCAGTTATTTTCAGGACCCTTGGAGACCCCTTGTACATG TCATGGAACAGAGATGAATAGAGATACCCATCTATATCAAAACTAATAGA CTGAAGTTCCTTTCTGGGAATAAAAGGACATTTCAGTGGGTAAATTTCTT CCAGTTGGATCTATGGCTGTTTGCTCTTATTCTCATTCAACGTGCTTGTG ATGGCTCATAGGGAGCCGTAGTAGTATGATACATATATGAGGCAAAATGT ACTGTAATCTGTTGTCTTAGATCTTATCTGACCATGCCGAGAGTTTCTGG ATTCTGACTATGGAGTATAAGCTAACAAAAGTGCGCTCTGGTACCAGATT TCATAGTTATTCTTGCAGTTCCTGTTTCATGCTTCAATATTTTTACCACA CAAAAGGTATCTGTGGTGCTAATCTTACTGTTCACGAATGTCCTGCAGTT TCTTCTTGAATGTCTTTTGCCTGACTAACCCAAACAACGTGACTAATCCG TAACTGACCTTACAAGGCATGAACAGTTGCGATAGATCATTCAACAAAAC TGTAAATATTTGTACAAAGAATAGTTTAGTCACTCTCAGGTGATAGTATT CCTGAAACAAGCTGGCATTGGTTCTGTAACCGCTTTATCAGATGGTCGAC AGGTGAAGATACGACTTTTGCTCTTGGATCGAACATGCTTAACAAACGCT CGAGCACAGTATCTTGAATTGTCTTAATGTTCATGTATGGTCGTCATTGG CAGGACAGGATCACAGGCTCAATTCTCCTAGTGCACATTGCAGGGTTTTA TTCCGTGACCCCCTCTTCCTGAATAATCATAATGCTGCTGGTCAACGTCC TTTCTTATTTTTTTGGAACAGAGTGAGTAGAAGGGAAAAATTAGCCTGGA GAAAACACAGAACATAGCTTTGCAAGGTTCCTGAAGTAAATTCTCGTGTA GTTTCCCGTTTGGAAGAAAGCTTCTATTAGATCAGCCAGAACCGTTTAGG CGTGACATTAGGTTCATTATTATTAGTACTGGCACAAAGAATAGCATGTA GGTTGACATATCCTCTGGATTGGAAACTTTGAATCTCTTGTCAGTAATAG TTGCATCAACTATTTCTGCACCTGCATCTGTGACATACTGCTCATGGCGT AAACACAGAAATGTACATCAGTTGACCATTTAATTTTAAAAAAATTGTAA CTGCTGCAATATGAATTGATGCTACCTGTAACTTGTACAGTAAATTTCTT TGACAAATGTCAACACTCCCTACAGCTGTAGATACAGTACATTGATGATC ATCAAGTATATCTATGTTTTGGTGATTTTCTTGCTTAAATGGATCAGAAA TACATGATTCCATTGGTGTAAACTCGCATACATCTGTGTATTCAATCCCT GCTACTATGGGTTTGAAACGGGTGCTGAGGTTCGCAGCTGCTTTGCTTAA GCACAAATAGTTTGTCTTAATCTGCATTAGTCACAATTATCTTATTTGCA TTAGTCACAATTAACTGATGACCCGCCCATGAATCACAACAGAAAATAAA CTTTAGATCCGAGCAAAACTGAATAAAATGACTATAATAGAAATAAAAAA AGACAGACCTCAGACAAAACCCAGCACCGGAAAAGGAGTGAAAAAAAGAA AGCTCATCCGAAATCCCGAATTGGCCCGATGGGCCTCAGCCAGAGCGTGG CGTGCCACCACAGAGCTCCTACACTCCTGTGCCGTCTCTGTCTCGCCACA GCCGTCTCATTCCTCGTCGGGTTTCTCTCACAGCCGCTCTCTGCTTTTAG TCCACCGCGCGCCGTCCACCAGTCCACCACCCAGACCCCACCCCTCTCCT TCTCCACCCCCTTCCTCCACCCCGTCGCACCGTCGATCCCCGCCGTCTCT TCCCCTCCCAGGTAAGCTGCCGGACGACCCGATCCTCCTCGCCGCTCCTC CCCTAACCCCTAGCAGTTTCCCCGTTTCCATCCGACCCTCTCGTGTGTTG CGCCCCTTGTCAGCTGTCGCTTAGGTAGGTCAATCGCGGTCCTGTGGAGT TCGTCCGCGCTTGCGGGCGACGAAATTCCAGTTCCTTATGTGCGATTAGT TTCGGTGTGTCAGCTTGAAACGTTGTCATCTTCGCGCGATTGGATTGCGG CCGCCGCGTATACTTTTCTGCGATGCTGCTGCTAGGGCTATGGGTAATTG GGTATCATGATCAAGTAATGATCTCGGTTTAGACTAGACAGGAACTGGGA GAGACCGTAGAAGAGACTGACAGTCATGGGCGGGTCATTAGTTAGGGCTT GATGATTAGAGAAAGGGACGGGGTCTTTTTCTATCATTTGTGTAGCATCA GGTGGGCCCCGATCACTCCAAATTCCCCTTTGCACCACAGCAGTTGGTCT CAGTGGACCGTGGCTTTGACTATTGTGTGTTTTTATTTCGAAGTATATAT ATATTCCAATTGTTCCCCGATTCTAATTGCATTTGCTTATTCTCTGAATA AATTTATGAAACTTATTTTATTTTTGCCTCCAGTTTGGCTGCTCGAGCAG ATGGATCCTTCGGAATTGGATGGGGACTCAAGGAAAACCAATAGGCCCAA ATGTATTTCTTGCCCCCTGCCACCTTTATATATTTATTTAATCCTGAATA GATGTCTTATCTGTAAAATGATCTTTCTACTTAAAGTACTATTTCAAGAA AAAAATTGACGTGTATGGTTTGGTTCATTCTATGTGCAGATTCTAAGTTT TCGCAGCAGGAGCTTCCAGCATGGAAGCCAGTACTGACACCTGAAACTGT AACTATCCCAGTCACCAATTTCTTTTGTCTTTCAGATTTACATTTGCTCC ATTACACATGAAATTTATGTGCTCCTTCCGTGTGATGATACTTCACCATG CGTAGGTCATTACAACCTTCTCTCTCATGGCCTTCCTATTCATTCCGATT GGGCTTGCGTCTCTGAATGCATCACAAGAGGTTAGGTGCAAATGTCTTTG ATCATATTGGTTTTGATTCTTTATGGTGCATTTGTTTATTTCGTACCTTC GCTGTGATGCAGGTTGCTGAACTGGTGGGGAGATATGATATAAGCTGTGC GCCTGTGGATGACAAGATCGGGTTCATTCAGAACTCCAAGATTGACAAAA CATGCACACTCAATTTGACTGTGAGTTTGCAATTAAAATGTTTTCTCAGT TATTACTTGTGATCCCTTATTGCTTGTGATGTTAAGATGCAATGTTCTAA TATCCTGATTTTTTAATGAACTAACCGGTTATTGTATGCCTCTCAGGCGC ATAAATACATGAAGAGTCCAATCCATGTGTATTACCAGATCAGCAACTTC TATCAAAACCATCGAAGGTATATTCCCAAATGAAATGCTTTATGGAAAAA TGATATTCCTTCCCCGTGTGGTTCTCAATCTGTGGTCTGCAAAGAACTTG GGAAAATTCATTTCCCTCCTGTTGCATTTTAGTATGACACTTTTGAACTG GATCGCATGTATTCATTTGTCTACTACATTCTGTTGTATTTATTTTGATA GTTTCCTGTCAGAACAAATTATGTTGACATACTCAGACCAATTGTTGCCC TCTTATCCAAGTTATGTGACAAGTCGAAATGTCAAACAACTGCGGTATAA GAATGTGCATTTGGGAGAAGAATGTGGTCCTGAAAATTATACCACTGATG GAGCTCCAATTGTTCCATGTGGCCTTGCTGCTTGGAGTCTGTTCAACGAC ACATTTACAGTTAAGGTCAATGGGAAGACTATTGATGTGAATAAAAAGGA TATAGCTTGGAAGAGTGACAAGAAGGATAGATTCAGCAATGATATCTACC CTAGTAACTTCCAGAAGGGAAGTTTCATAGGTGGTGCTAAGCTAAATGAG AGCATACCGGTACGTGGAATTTTCCTCTTTCTGGACTATGGCAGATCTCC GTTATCATTGTTCTACGCATCATCTTCGAGATATTGTACCCATTAATTAT TATTCTTGTCCCATTTTTTAGTTAAGTGAGCAAGAAGATCTCATTGTTTG GATGAGAACTGCTGCTCTCCCAACTTTCAGAAAGCTATATGGCAGAATTG AGAAAGATATCATGGCAAATGAAACTATAACTGTCGTTATACAGAACAAC TATAACACGTACAGTTTTGGAGGATCTAAAGCGGTGGTCCTTTCTACTGC ATCTTGGATTGGAGGAAGAAATAACTTCATTGGTATTGCGTATCTGACTA TTGGTGGTTTGTGCCTTTCCGTTGCTTTGGGATTCATAGTTCTGTACATG GTTAAGCCAAGGTATGTTCCATAATTATCTCACTGCTATTAATGGACATA CCATTTATCCATCCGAAACATGTTTTGAAGCGTTCATACCACTTACTTTC ACAAACCCTTTGTTATCTACTTGAATGTATTTTGTTCTATTATATTAAGT CATGCAGTTCTTGGTTCTGAAAATTTCAATGAAATGAGGAAAATACTACA ACTGAACCAAATTGCGTTTTTATCTTTACATGATTTAGAAGGTTGAGCTC TAGTACCACTGACCAGCTTGTTGCATCTGAACCATTCTATGAAATTTCGC AATTGGTTATTAGTGATGGCTCTGATTGTTGCACCAAGATAATCACATTC AGTTATTCTCTCAGGACCCTTGGAGACCCCGTGTGCCTGTCATGGAACAG AGATGAATAGAGATACCTGTCTACATCAAAACTAATAGACTGCAGTTTCC TTACTGGGAATAAAAGAGCATTTCATTGGGTAAATTTCTTCCAGTTGGAT GTATGGCTGCTTGTTCTTATTCCCATTCAATGCGCTTGTGATGGCTTTGG AGCCGTAGTAGTATGATACATATATGAGGCAAAATGTATTGTAATCTGTT GTCTTGAATCTAATCTGACCATGCTGTGAGTTTCTGAATTCTGACTATGG AGTATAAGCTAACAAAAGTGTGCTCTTGTAGAAGATACTTATAGTTGTTC TTGCAGTTCCTGTTTCATGTTTCCATATATTTACCACACAAAAGGTATCA CTTGTGCTAATCTTACTGTTCACGAATGTCCTGCAATTTTTTCTTGCATG TCTTTTGTCTGCCTGTAAACCCAAACTACACAACTAATCCTGTAAGACAG TAACTGAGCTTACAAGGCATAACCAGTTCATATATCAGCCTCAAAAGAAG TTGTGATAGATCATTCTATAAAACTGTAAATATTTGTACCAAGAATAGTT TAGTCATTCTCAAGTGATATTATTCCTGAAACAAGCTGGTATTGGTTCTG TAACCACTTTATCAGATGATCGACAGGTAAAGATAGGCTTTTGCTTTTGG GTAAGTCAATGGATGACTATAGTGATATGTCTCTGTCAAGTATGCAGTCT AACATGCTTAACAAACACTGGCGGTCAAGCCACCTTGTCAGTAACCTACA AAATTAGAATAGTTCCACACTTCCACTGTTTTGCGAGCACAGTAGCTTGA ATTGTAATAATATTCATCTAGGGGCGTCATTGGCAGGACAGGATCGTAGG CTCCATTGGCGTGGATATGCTCCTACTGCACAGTGCAGGGTTTAGTTCTG TGACCCCCTCTTCCTGAGTAATTATAATGGTCCTAGTCAACATCCTTTCC TATGGAGATACTGGTTTAATTTAATAGAAGGGAAAAAATTAACCTGGAGA AAACAAATCACATACCTTTGCAAGGTTCCTGAAGTAAATTGTTGTATAGT TTCCCGTTTGGAAGAAAACTTCTATTAGATCAGCCAGAACCAACTGGGGC TGGGACATAGCTCCATCAAACCAATCTTATAAAAACAAGATAATTCGTTA GACCATTACTACATGAAACCATATGACACATTCGGGTTCGGGCATATCAC ACTGACTAAACATAGATATTTTCTTGTGTATAAACACGAAAGGTAACTGT CATTACCAAGTGTCTTTGAAACTCCTATTCTCTTGTCAAATCTCCATATA CTTTGGTTAGTAATAAAACTGAAACAAGAGTCACGGCCCACATTAATATT CTCCAGAAATGTGGATAGCTTGTACTCTGCAGGATCTGAGGCAGATGTCT GATCTATGACCACATCTACTGTCTGAAAGGATGAACCAAACTTGGTTAGA TGGTAGTAAACAATTGTGAGACAATAGATCATTTGTCATTTCACAGAATG TTTTCTTATATAAGTGATCAAGTTAGTTTTACAATGTTAAAGTTCATATA AAATCAGAGTCAAATAGTAGAAAATTGTTTTTTTTAGCATCATCTCAAAT GTTGATCTGGCTGACGTTTTAGCAGTAGTGTGGCATTTGGTTCATAATTA TTTGTACTCACACAAAGAATAGCATGTAGGTTGTCCATATCCTCAGGATC GGAAATGTTGAATCTCTTATCAGTAATAGTTGCATCAACTATTTCTGCGC CTGCATCTGTGACATACTGCCCATGGAATAAATGCAGAAATGCACATCAG TTGTCCACTTTTTTAAAAAAAAATTGTAACTGCTGCAATACAAATTGATG CTACCTGTAACTTGTAACTTTCTTTGACAAATGTCCACACTTCCTACAGT AGTAGATACAGTACATTGATGATCATCAATTATTCGTATTTTGGTGAAAA TTTTGCTTAGATGGATCAGAAATGCATGATTCTATTGATGTCAAGTTGCA TACCTCCGAGTATTCAATCCATGCTACAATCGGTTTGAATCGGGCGCTGA GGTTCGCAGCTGCTTTGCTTAAGCACAAATAGTTTGTCTTAATCTGCATT AGGCACAACTATCTTAATTTGCTAGAGGAATGAAGAAATAGACATGTAAA TTTCTACAAGCTACTACAGCCTCTGTTCCATATTAAGTGTCAGCTGCTTT AGTGCAACTTTGTACTAAATCAGCGACATTTAATATGGAACGGAGAGAGC AGTACATAAATTATCTCCCCTAGCTAGTAGACAAAAACTTGTTTCCAGAA TCACCCTTTTCGAGATAAAGTTACATTTGCTGGTCTTAACTGCGTCATAT ACTGCATTAGCCCTGTCTTCGGAATTTGTGAACGTTCCCAGGTATTTGAT CCACTCAGCCCTCTGGACAGAAGCAATATCAGTTTCTGAAGTGTAGATAG AGTGAAATCTTCCCATACCTTGCAAATGGATCAGAAATGCCAGGTAGTGA TTCACCTGCAAGGGTGTATCCTCTTCTGAGGGTACATAAGCTGCAAAATT GCAGCCTTTATCTTCATCTGTACTGCCCATGAAGTGTGTGCTAAATTGCG AGAGCTTCCGTGCGTCTGTCCTGTTCACAAGCTGCACATTTCCACTTGCA TATGCCTGGAGCACACACTGAGAGGCAACTTGAGCTGAGGTTATCCCCTT CAAGTTTTCCAGCACTCCAAGTAGCTGCATACATGCCAACGGTACTCTTG GGCTCAAATAGATGCAGCATTCTAAACACAAAGCATACTAAAACTCTACA AATACTGAACAGAGGATCTTTCCCTTTTTGAGTTTTTGTTGTTGCTTGCT TTTGTCGATATCATGTATTTATGTAGAATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.