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GrainGenes Sequence Report: AA034622

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Sequence
AA034622
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA034622
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
CDO749-3
DNA
CTTGTCGCCGCGAAACTATAGCTAGCTACTCTCTCCTCAGTCGCCTGTGA
CTAGCTAGCTTTGTAAGTTTGGGCCGAGATGGGTGAGCAGACGCTTGAGT
TGACGCCGACGTGGATCGTAGCTGGGATGTGCTCCTTCGTCGTGCTGCCC
TCGCTCGTCGCCGAGCGCTGCCTCCATTACCTCGCCAAGGTAACCAACCA
GCACAAGCCAGCTAGCTCTTGATCTTGCATTTGTCCTCTGGACGACAGTC
AGATTCCTTCTCCCGCCGATGTGTGTGCTCACCATACTCTCTTTCTGAGG
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TTTTAGATAGGCCGTGAGCGGTCAAGGCGTGATACTGGGATCCTGCTGGG
CGACGACTCTGGCGCTGCTGCGGTGGTTCCCGGTTTGGCTCTCTTCCTTT
TTGCCTGCTCGATCCGTCCTCCAGGAACCGGCCGACGGTGTGGGGATCGT
TGTGTCGGATCTAATAAAGGCGGTGGTCCTTTGATTTCTTTCGCACGAAG
ACGAAGATATGCTTGATGTTTGTCCTCCTTGATCTGATCTGGAGAGGCGG
GTTCCGGAAGGCTTCGCTGGCGAACTCCCATGGGCATATCATGCCTGGAG
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TTTGGTTTCAGCGGGAGCGTTACGAAGCTCTGTTGTTTGTTCCCACCAAG
TGCCATGCTTAGAGCCATGATGATGTCAGATGCGGAGAATGTCAGGAAAG
CTGAAATTTGAGGGTAGCGATGGTGATTTTTGTTCTTATGGAGACGGAGA
TCTGGCTGCGTGATCTGGGGCTCGTTGCAGCGACTGTTGGTGCGGGAAGA
CAACATAGGGGGAGTTCCCAGTCTTATCTTGCAGGGTGAAAATCCAAGGT
CTAGCCTTAACTGGTTGTGCCTGGCAATGACCTTGTTGAAGGCATTGTTT
TGTGAGTAAGGACTTTCTCCAGGGTGAAAACCTATGATCTTTGGTCGGGC
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AGAAAGACCCCATCGAATCAAATAGCGGTTCGCTGTGGCAACTACACCAC
CAGTAGGTACTCCTCGACTCCAAAGAAAAAACTTCTCCAAAATGGGGTAT
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GTATGAAAGGTGTCAATAACACATTAAACGTAGCACAAAGCAGCCCTCTA
GCCGCGCAAAATATCACTATGTACGCAACCGGCCGATCAAGACAGTCTCC
TAGTTCCGTCACGCCTGTTTTTCTTTGTATGTTTCTTACCGACTACACTT
CTCCCCTGCAACCAGTCGTCCCCAAATTCTATTTCGGAAAACCTAAAATG
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GTGGTCCGGCCTCCACCAATCTGGCGGTATTCCTCTATAGGGACTACTAT
CTATATTGATCGCTTCGATAGATCATCCTCGGCTGAAGGTTAGAAGATTT
TCAACCCCCCCCCCCCCCCTAAGGTGTGGAATAGGTATGTACCAATACAA
GTAGTTTTTTTTTATGTTTGATAATTTTTATCCTAGCTAGACTTTTCTAA
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CCATGGTAATCTTACCTTAAGGCATCTGCGCAAGTGGATCTTGGAGACCA
GTGGCGGAGCCAGCTCAATCACTGAGCCTGGGCAGGCTTTGCATGCAGTT
GTATTGACCAAAATTTGTCCTAAAAACTCCTTACTTAGCTAGCTCTATCC
TGTAAACCACAAAGGTAATTAGCAGCCGGAGCCCGGGCAGCCGCCCGGGC
AATGCCGGGCTGTAGCTCCGTCACTGTTGGAGCCGCCAATGGCCCCTTGG
ATTTAACACACCGACAACAAAATCATAGGCCAAAAGCCAGGGCAAACAAA
CGGCGCACTCCGCTACCATCCATGGCCACATTAACCACGTGGGCACTTGG
ACGACCGGCCATGGAACGCCGGCGATCTAGAAAAGATGCTCGCTCATGAA
GAAGAATTGAATATCAGAGATAAGTGAATTAGAGAAAGATGATAGGATGT
AGGGAAAAACGAAAAAGGGACCTCCCCGCCGGTGCCTTCCACCGTTGGAT
GGCCTCCGGTGGCGGCTGCAGGGGGAGAGAGCGCGAGGAAGAAAGCTAGC
GGCGACACTAGGGTAAGGTTCCCCCTTCTTTCCTCAAAGACGACCGTGGA
GGGTCAGGGACACTGTCTTTTTAGTTTGCATTAGTTGCACATGTTTTGTT
GCACACATTGCACCAGACCTTAAACCACTAATTATAGTTTGAACCATATA
TATCCCCGCTTTTGATAACTGATGTGAATGTCCTTTTGGAGTTCTCACTA
GTACATAATAGTGGGTAAAGAATGAATATGATAGAACCCTATGCTTACAG
ATTGTGATGCGATGCTTATGGGTTATATAGAGTGTACATCATGTGACCAC
AGTCTTGGAGTGGAAATTTAGTCATGCTAGGCTTAAACATAATCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATCTC
TCGATCTCTACGATACATAGTATATACTTCGAACGTCCCATTGGTTACGG
TGGGAGAGAGTGCAATGCTGCGACTGGACTTGAGATCTTGTGTTTTTGTC
GTCTTTTCTACTTTCTTATTAGCAACCACATCTTTGATAAAGTATAAAAT
TATTCACACCATGTTCAGAAATAATTTATCTGTATCTCTAGAGTTTATAT
GTAATACTCCTATGTTCCTAACCTCACATAAATATAATTCTTTGTTTCTA
ACCCCAACTGTTAAGTAAGCGCATTATAAGCAACATAGACCAGTAAAATA
TGACTAACACTCACAAGTTAAATTTTATGAGAAAAAGGTTTACAAGTTGA
CAAGCCACCGAACAGAAAATACAAACTAAGATATCATAATTAACACCCAG
CACTAACTTCCTCGCATGTTAGATATCTTGTTTTTGTCTTTGCCTTAGCT
GAAAAAGTGCCGGAGGAAAATATTAGAATTGTGTTTCGTCATTTTTTTCA
TGATTCCGCCTATGAAGCCTGATGCGGATCGTAATTACAACATCATCATC
GCGCTCTCAACACAATTTACACCAATGTGATGATTTAAACACAAACCAGC
TACAAAATTATAGTTCAAATGACTATACCTAGTAAGCACGAGAGAAGAGG
ATAATTTCAACTAAACATTTTAAGCGATGTGGAGGCAAGAAATGTGGCAC
ATAGCCATGATATCTTCAACAGGACAGGAGAACACTTCTTGTACCGTGTC
ACCGAAATTCTTATATCTACACAACCAAGCTCCCAAATTCCATAAAATTT
CTATCAACTTGAGAATGTAAACATGAAAAAATGTTAAATTAAAACAATCT
AGCTCAAATAATGAACACAACAATTATACTTTATCGGTGATGGTCGTATA
TGGATAAATCTCTAGCGTGCGCGAAATAACCCCAGAGAGAACTTCTAAAC
AGACATGAACACCCAACTCGAAAAGAATTGAAGTCATGAATTTATGCTAT
AACCGCGGTCACCAGAATACTTTTATAATATGGAAATACTACCAACTTTG
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AATGATCTGTTGCTAAACCAAAAACATTACCATGTTCATTATTCTAGGTT
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ATCCGGAAACCTATATACCCTGAAAAGAGTGCAACCAGTTGCATGTCATC
GGCATGATATCTGGTACCAGAATGTATGTACGTTGAAGGCCTCGCCCTCC
AATCCGTCTAGTGGGCCTCCACTCTCGGTTATTTTATTGTCATATAAATG
AAATTATGTTTATAAATGATTACTTTTTTCCTTGTCTCGGCAGACGATAT
CCTCTTTTATCCTGATGGGTCACTCTTAGAAGGGCCTCCCTAGGCTGTTT
TTTTTCTGACAGTGAAAAAATCATCTAGTCGCGTTTCTAGGCGCCCAGAC
TTCGCCGGATTTGGCCCAAAATTATATCCGGGGTTCCCAAACCAAACCTA
GGGCACCGGGAGTCATCTGGAAACGCCAGATGAAGCAAAAAGAGGGTGGG
CCAACCATGTCGGCGACATTAGGCCGAGCTCCCGCCTTTCTTCTCCCCTT
CCCACCTTTCTTCTCCATTCCCCAATTCCTCATGGGGGCGAAGGCACCTC
GGCGATGAACCCCCATATCAAGTCCTGGTACATGGCGCGGCGCAACGCCA
TTCTAGACGAGGAAATCCTCGCCGCCAACACACCGAGCTCTGTCTCCGCC
ACCAACACGCCGAGCTCTATGCTGACCATCTCCGCCACCACGCCGTCACC
GAGCTCTGTCTCCACCTCCTCGAACCTGTCGACGAGCTCTGCCGCAGCTG
ACCTGGCGGAGGAGCCCATCCCCGTCGATGAGTGATCGCCAAATTTCATG
TTTTTTTTAATAATGCTGAACCATTTTGGGCGAGTTTCTGTAGAACTGTT
TTGGACGATTTCTGCCATACACATTTGGGCGAGATATTGCCAGCGGGAAG
ACAAATTTTAAATATGTCGCCAGATTTTAGGTTTGGTTGGAAACACGACC
GAAAACTGGCCGTTTTCAGGCCAAAAGTTACATCCATCCCCACTGATGTA
ATATTATCTACCGACATGTATCTCGACCGTGCCATTGAACAATCCGGCGT
AGCGACCACGCATCAGTGCCGCGCATAGAGGGTCTTCTTCATATTAGTTG
TAGAGTACATCTGGGCTAAAACCTTGGCCAAACTGCCTCCTCCGTATGAT
GTGCGCCTGCAGGTATACATAGATCAACCGTGGACTGGATACCGTCAGTT
ATTGGACCCACCATTATTTGTATGGAGACATATTTTAAGATAGTTGTGGC
GCGATCTACGGATTACACTGAACGCACATGTTTCTTAGTGATACATCGAT
TACTTCTCTCGAAATAGGCTTTCGCCCCGCTATATTAATATAGCACACAC
TGATACACAAGTTCGAACAAAGAAAAGCTGGGGCAACAGCACAAACATGC
CCAAAGAAAAAGAAATGAAGACAATGGTGAATTGACAGAAGATGATGACT
CGCGATCGCTGCGCCCTCCAACTTATGCCCACCACACTCCCAAGCACCCC
GTAGCGCCGAGTATCAAGCAACACCTTCAAGAAGGGGAGCACCGTCGACA
CGGAGCTGCTGCCCGGACGCGCTGGCCCTAGGGTTTCCCCCGACACTCAG
AGTAAAGTGGGCAGAGGCTTCCCAAGACGCCCTCCAGGAAGGAATGGTGC
CACTCGAAGGCGGCACCGCGTCAGGGTCGGACGAGCCGACAGAGATTTCT
CCCGCCCCCTGTCCACAAAAAAACCCTGGCACAACGGCGCACCACCACCA
AACTTCGACGCCCACCAACACGCGCCACCACGATCAGGAAGTCACCAACA
CCGTCGCTTCGTGAATGCTGGCACGCGACCTGAAGGACGAAGACACACGA
CATCGCCGGACCGGGAGAGAGCAGCCTCGCAGCCGCGCGGGAGGAGCCCA
CCTCCACCGCCAAGAGACGGTCGTCGACCGGACAGAGCAGCGAGGGCACG
CCAGGCCTTGGCAGGGCCCGGCCGGGCCACGAAGGGCCCGTAAAGCCCTG
GCCGCCCTGCAGCGACAAGCGGGGCACGACGCCGTCGTCCCCAGTCTAGC
ACCGTCGCTGCCTCCACCTCCAGCGAGCACAGCCGCCGCCGAGCCCGGCC
CGCCCAAGCCCATCTGGACCCGCCCGCAGATGGCCAGATCTGGGCCGGGA
CAGCCGCCGGCGGAGCTCGGACCATGGCGCCCCGCCTTGCCGACGTCACC
ATGCCGACGCCGCCACCAGCCATCACCCGGCCACGCCGGACCAGCACCTC
CCGAGCTGCACCGCCGCCTAGGGTTACAGAGCCCCGACTCACCCACCATG
GCGCGGGGAAGGACAAGCCGCCGCCGCCGGCGTCGCCCGGGCTTCGCCCG
GCGACCCTTGCCGGCGGCGGCGACGAAGGGGAGGGGTGGAGGGAGGGAGG
GAGGCGGCGGGGACTGGGGGCGAGCCCGTCGCCCTCGGGGGGGGGGGGGG
GCGAGAGCTCGCGAAACGGTCTGGTTCCATACATCGATTACTTGGCATTG
ATTTTCTTTGATCTAGAATGATCTTGACATATTTTGTGGCGGCAGTTCGT
TCTAACCTGTCGGCCTTATCCGAGAACACATGTTGAATGATAAAATGGGA
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GGAATTCACTCTTAAATTAATTAAGATGGATACATGTTACCTCTCCATAG
ATCGGGTGTACTATTGAAATACTTAGCAAATTAATTACCACGGGAATTAT
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TCGTCGCCCTACTGCTCACGGTGTTCCAAAACCTGATCCAGAAGACATGC
ATTTCTCCTAGCTTGGCAGACCACATGCTGCCATGCCAGAGGGCAAGTGA
AATGGGGCCAACAAAGCGGCACTATGTGGCCTCCCAGATCATCGGCATAT
TCGGGAGCCGGATGCTGAACGAGGATGCTGAAGGGAGCGCACACTGCCGT
TTAAAGGTAACTAATAAAACGATTTTTTTTGCTTGTTCATTTGATCGCTG
TTTTAGATGGTGTATCAAAAGTTTGTTAATACTTGTCATTGGGTATTGTT
GAATTTTTGAATTTCATAATTTACAAGAGGCAAAGTTTATAATTAATATA
CTCCTTTCGATCTAAATTAATAGATTTAGATTTGTCTAGATTCAGTTATA
TCTAGTCACTATATTTATTTTTTGGAAGGCAAACCACGTTCGATCTGGCC
AGTCGGTATTTTTTTTATTATCTCTCTGCCAAAAAAATCTTGATTGAAAA
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CTCAATGAGTTTCCATTCAGCATTCGTTTGGCACCGATAGGATAGTGAAT
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TGCTCGCGGACCATAGTGTCTGAAATCCGATTCGTGCAACAAAGTGTCTT
CGTGGCCAACTCCAACCATATAAGATTGGAGGCCACGATGAGGGATATTT
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TCGGCTGTCTGCATCCTTGTTATATAGAGGCCGGGTACAAACATTGTTAT
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TCTTTAGAATAGGATAACTTCACAGTTGGATGGGCCAAACAATCATAAAT
ATAACAGTAATGCACAACTTTATAGTATGAGTGTCAAGCGCACACTTCCA
ACACCTGACAAGGTTGCTACTTTGTTTCTATAACGTCTCCCTCCTTTTTA
GCTCAGTTCTTTCTGTGCTTTGCTGACACACGTGAGCTCAAGCGTATGAT
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AAATTTTTATATTTGTGCTGGCAGTCACACATGTTACTTTCAGTGTTTCA
ACAATGTTTTTAGGAGTTGCAAAGGTAAGCCTTTCACGAGGTAGGTATGC
AGCGCAATAAACCACAGGGTTCGTTTAGCTATTTTAGCTGATTTCGCCGT
CTTCTCTTACTCAGATGCGTAAATGGAAACAATGGGAAGTTCAGATTCGG
AGAGAAATCGAACGGAATCGGCAACTGCAATCGGATTCGGGTTGACAGCA
GTTTTTCTCTTCCGTGAAATGAAAATCGATAAACCAAGAAAAGCGGGTTT
CATTATATTTTCGAACATATTGTTAGCAATCGGATGATGATTTCCTCTTT
ACCTGTAGGGCCCAGGAGGACATTCCTTGTACATGAAAACTTATATATTA
GGAATCATTCGAACGGTTTTGGTCAAGACTCAAGAGTATTGAGTTGGCTG
GTAAGCAGTTCTATGGATCAGTAATTATACCATGAACAATTATATCAGAT
ATCTTATTTTGGGTTATGATGGACTAATCAAGATTTTTCATATGGCATTC
ATCAGCATTCTTTTGTTAAGCAGTTCTATGGATCAGTAACTAAAATAGAC
TATACCACAATGCGTCTTGGTTTTGTCATGGTAAGCACCACCTCAGCATC
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AACGTTGAGGCCATATTCGATTGCAGAGTCACTTTCGTCTGTACACAAGT
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GGTTTAAATCCTTAATGGTGTGTCTAAATGTGTGTATTGAGGAAGATTCA
CCTTGGTAAACAATATTCTGTCCCATTAGACAGGCAGCTGCTAGCTACTG
CAGAATGCAGTAATCTAGGTATTGAAAATCATTTGTTAAATAAATTTACT
CAGAAATAGCTGTAATTTAAAATTTTATATTTGACCAGATTATAATTTGA
AAATATGAATATTTTTTACTAGTTACCGCGCGCTGTTAAAGGAAAATTGA
CAGAACCTGCAACTGAACTGTTGTGTGGTTTCCAAAAATGGTTTTGTAAC
CCTTGTCAGTAACATTTCTTGGTTTAAACTTCTCGAAGCTATCTTATGGC
TTGTTTTAACTAATCTGCAGGGTGGCACACATACTTTTGGATATCATTCC
TTCCTCTTCTGGTAAGTGCCTATATAATATAATATGCTGTTTTAACATGA
CATTGGAGTTTGCTCTTTGAAGATGGCTTAGAACAATACTTGATGTGACA
TCACATCATACATTTCAATGTTAGGCATGACTGTTTGACACTTTTATGCA
GGAGCCCAGTATACGTAGTAGTAGTAATTTTTTCCCAGCCAGTATTAAGC
AACATGTAGAAGTATCAGCTACACACCGTGAATTAATGGTGTATATATAT
TTGGCAATATATGCTTACTGCACACTACTATATCCTCCTTTCAGCTTCTA
TTGGCCATTGGCACCAAGCTACAACACATCATAGATAAGCTAGCCCAGGA
TATCGCTGAGAGCCACTCAGTGACTGATGGTGATTTGGTTGTAAAACCAT
CGGATGACCTCTTCTGGTTTAGACAGCCAAGGATTATCCTGTACCTAATC
CACTTCATCCTCTTCCAGAATGCGTTTGAGATTGCCTTCTTCATCTGGAT
ACTGGTAAGCGTTATGCTATGTCGCTTATGAATTGCTCTCACAGTTTGGA
TTCTATGACCGACCGCGAAATTCTTTTCCTGCTTCCGTCGTAGATCACCT
ATGGCTTCAACTCCTGCATCATGGGGAAAGCTGGATTTACCGTTCCCAGG
CTTGTCATTGGGTATGTTATGTTTCTCCAGTTTGAAAAGAAGTAAAAATG
ATCCTTCTCTTGACTCCCTACATACATCCTTGTAATTGCAGGGTCATTAT
CCAATTTGTGTGCAGCTACAGCACACTGCCTCTGTATGCAATTGTAACAC
AGGTGCATGGGACATGTCTCTACTCGATCGATCGTGTACATGTTTCCAGT
CGATACTGGGTAGTAATTAAACGGACTGTCTATCTGTGTTGCATGCGTGC
AGATGGGAAGCGGCTTCAACAAGGAGTTCTTCAGCAATAATGTGCAGCAG
GGCCTACGGGGATGGGCTAGAGGAGCTAAGATGAGAAGGCGGTATAGCTT
ATTCCATGCCAGGGCTGGATCCATAACCACAAACACAAGTGGCGATCCCG
CAGGGCTTTCCATAGAAATGACGAGACGGACTTCACGGGAGGGCAATTTT
TCTGACGAAAACATCGAGTGATGGTCTATCGGGGTAGTGTCTACTCCCTC
CGTTCTAAAATATAAGACGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATAAATCTAAAC
TTTTTTTAGTGTGTAGATTCATCCAAAGTTAAATGAACTACATATTAAAA
TAAGTCTAGATTCGTTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTAGA
ACGGAGTGAGTAGTATGTTGTTCGGCAAAGTATCCGTAGTGTGCAATGCT
TTCTTGTGTAGTATTTCTGTTAGGTAACAGGCCGGGGGTGCAGGAGAAGG
GCTTTACTATCGTTCTGAGGCGTTTCTCTGAGTAGCATGAAATTAAATAA
CTAGAATATTCTTTAAAGGCAAGTCGGTCGCTTTCAAATTTCATACTATT
CTTTAAAGTTTCAGCGTGCTGCTTGAGCTCACCAACACCGATCGGTCCAA
GGAAGAGCAGGACCTCGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.