Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA020057

[Submit comment/correction]

Sequence
AA020057
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020057
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
BCD1231_WHE04B02.s1
CMWG646-5
DNA
CGCTTGACGGCCTGAGCATTCCCTCCGTCCATCGCCCCTCCATCCCCTTC
CGCCCAAACGAACACAGAAAATTCGGCGAATCAAAGCTAGGGTTTACCCC
TCTCGCCGCCGATGAAGGGCGGCCGCTTACACCGCCCGGAGCCCCCGGGC
CCTCACACATCCGCTGCCCCGGCCGCGCCCGCGCCCGCTCCCACGCCCGC
CGACGACTGGGTGGACGGCTCCTGGACGGTGGATTGCTCCTGCGGCGTCA
CGTTCGACGACGGCGAGGAGATGGTGAGCTGCGACGACTGCAACGTATGG
GTGCACACGCGGTGCGCGCGCTACGTCCGCGGCGTGCACACCTCCTTCTC
TTGCCACAATTGCAAGTACAAGCGCGCCCCCTCCTCCGCCGACGAGACCG
AGGTCGCCGAGCTCCTCGCCGAACTTCCCACCCACCGCCCGCCGCCGGTC
TACCGCCGGTGGGCCGAGGTCCCGCTCCCCGCCCGTGTCCACGTCCACGG
CCTCCCGGGCGGGACCGACGCGGCCCTGTTCCGCGGAGCCCCCTCATCGT
CCGTTTTCTCCGCGGCCCTGTGGCGTTGCGCTGGCTACGTCCCCAAGAAA
TTCGGCTTCCGCTACTGCGAGTTCCCCTCCTGGGCCGAGGACAAGGACGG
CGCCGACGCTCTTTTCGCGCTGGCCAGAGAGAAGCGGAAGGAGACGCCGG
CGGCAGCCAGATTTACCCTCCCTCTTGGAAATAAGGGCACCAATAACGCT
CAAACCCTAAGCAAGAAGGCTGAAGGCAGTCAGCACGCCGGCGATGACGG
TACAAAGGAAGTTCCTCCTCAGACTGAGGCTAAGACCAAAGGTGAGTAGT
TAGTTTGGTCATGATTCTTATTTAATTGCTGCACAGCGAATAGTTAGATG
CTCAGTGATGTCGCCTACGTTTCGATTATGGATTGTTTAGTTTGTTCATT
TTAGGAGCATCCAAGATAGCTGCAGATGCTGATACAAGGGATAATGGGTT
TGAGACGAAAGGGGATCTTAACATGCCCGATATCATGCATAAGGATGAGT
TTGCCGACACCAGCATAGCCAAATCTGATCTTCATGTAGTTGAAGCTAAT
AAGAAGGCGAAGGAATCCTTGGGACCAAGTAGGGAGAAGAAGAGTTCTGA
TGGAACTCCAAGGATGCTGAAAAAGGATGAATCTAAGGAGACGATGAGGC
CGGAGATCTCCTCTGGAGGTAGAGCTACATCAGCTGTGGCAGAACAAGAA
GCGCACTCACGGTTTGTCAAGGCAGAGGTTAGTATCTCATATGTAAACTG
CATAATACTGGATCTACTTCCTTCATTTACTGTTAGTAGATTGCAAAAGC
GCTGCAGTGCTGTTTGCTACTTCAAGAGCACACATCCAGAGAGTTTTATG
TGGTCATACAAGGCAGGTTGTGCTGCTAGCTCAAACTTAGCCTATTGTAA
ATTTAATTAAACTTTAGTTGTGCCGATCAACTTAACCAAATTCATTTCAG
AATTAACCTACCTTAAATTAATTTTCTTTTTTGCATGCACAATGCATTCC
CCTGCATGTAGCACCTTATTTCCTCCATCGGCAATGTATCTTCATCCCAA
ACAACAGTGATGTTCTCCTAATATATTATTCTCCATGTCCTGGCTTCCCA
TAGTACTTCCATTGCCCCACTATAGGTTGCTATTCTATCAATTTTAATAA
GCACGAAGCTAATTTTGCTTTATGGTCTTACATGACCTTAATTTCAACAA
TTGAATCTTCTTGTCTTTTGATATTCTACCAATCAAACTCTTCCAAAGTG
ATCATTATAATATATCTCTGCTGTGGCATGCGACGTCTGACATGACACTA
TATGCTTGGATGTGAACATAGAATTAAGTTAATGGCAAGCTTGCTGTGAT
GAACGGCCATCCTAGACTCCTAGTAATACCTTCTGGCATGCGATGCCATG
TTGGAGTTGACAGCTAATGTCAGGCTTCCAAAAAATTGAAATGGAGTAGT
GTAAATATATGAGACCTTCTTAAGAACAATGACAAGCCTGGTTTGTACAA
TCTCTGTCATAAGCCACATGAAGAAAAAGTAGCAGGTCAAAGCTTATGAG
AATGTGTGATTCTATTGTGAATGTTATTCACATTGGGTTATTGTTGTGAA
GAATGCTGGAAAGAATGATTTGAAGGGTCAGGGTAATGAATGCGAGAGAT
TAACTGGGTTGATATAACTTTATGCAAGGGCTCGAGGGCATTTTTATCAA
ATTGGCAGCTAGTTGTCAAGCAGGTGGGAGACTGCTGAATGGTAGCCAGG
TAAAAACACTTAATGAGATTAACTCTAATTTTACCCAAAATTAGCCCACT
ATTTGCGGTGACCTAGAAAACACTTATAATGAGGTTAACTCTAGTTTTAC
TAGAAACCTAACAAAACTTCGTTTGGAACAATAACAAAATCACGAAAACT
ACCGAATCGTGTAGTGCGTGTCTTCTCTAGCAGGATTTACGTGGTGGCGA
TGCACTGATGCTCTGCTGAAAAGGGCGTCCTGTCGTGAGGTGGTACCAGC
ATTAGGAGGCTGCTCTGCCATTAAGGCTGGGGCTTTGTGGCTTTGTGATA
GTGTACAGTCTGTTTGGTCCTTTGGGACGGGGGGAGTATCTTGGGATGAA
GAACTGCAGCGCTTGATTGCCAGTTTGTCACAGTCGTTTAATAGGGGAGC
ATACAAAATCCTATAGGATTGGAGTGGTCTTGTTTGTTGTTTGTGCTGTA
AAAATTGGTCTGTGGTGTAGGGGGTCAAAGGCAGCGCCTAGACAGTGGTT
CAGAGCAGAACGGGTGGAAGAAAACGGCATGATAGGTGCACTGTGGAGTC
TAGGGCTCCAGGCTACCGCCTATTGATTCTTACTTGCCGTCGATTATGTG
TTGCTGCTGGGAATGATATGCTTACCTCCGTTGCCTTCACATAGTTGCCG
CTTGATCTTGTTCGCCATCTCCTTTGCCATCACGATAGTTGTCATTGAGA
ACTTGGGAAAAAAATCATGAGTGTGGCAGCGTCCTTGGACAAAAGGGTCA
TTTATTCGTGGTTTGGTTGAACTAGACCATCGCCTCATGGCTAACATTCA
CTTTCGACGGTCTTTTTGTGCCCTGCAGAGGCATCCTCACCTCTTGAAAT
TTTCTACCAGCAGTCGCTGTAAGTGAATGCCTAATTATATTTTGATAGTG
GACGCATTACCGCCATATGCAGATATTTAGCTTGTACAGTTGTTTATAGC
CATATGTTCTTTATTACGTTTTCAGCCATATGTTCTTTATTACGATTTCA
AGCGGCTACACATATTTACAGTATTGTGGCAAACTTACTTTTTTATTTAA
TGGAATTTTAGCATCTAATGTTAGATCGTTTCTATTTTATCAAGTAGGTT
TAGTTCTTGAGTCTTGACATGAATACACTGGGAATATGCAGGTTAACATG
TGTAAGAAACAAATTGAAGGAAGTCGAAATGTGGGCTTACAGTCCAGCAT
AATGGATGCAGGTAACTAAAGCTCCTGAGCTACTATCTTTGCACAATTAA
GTTTTTTTTACTATAGTGTTAGTAATGCTTGTAACATTACACAGTTGCAG
AAATGGATGGAGATACACAAATCCATGCTGGTTCCGTGAAAGTGCATGAC
GGGCTGTGTCTTCAGAAGCAATCAAATCAAGCTTCTTCAAATTTGCAGGT
TGCTATTGGTGTACTAGCTTTGCCGATTCAGTCAAAACCAAAGCATATTA
AGAGCAAGGTTAATTTTCAGGATCATGAGAGAACAAAGGCTACCCAGTTC
ATTAACGATGAGCATAGGAGCGATAGGCAAGGTCAAGGGGCCAGTGCAGG
TTCTTTAATCGCTCAAAGAAATTCAGCCATGTCAAACTCTGATTCAGGCT
CTGACCTTCCAAATTCCGAGACAAAAAAACAGATGCACACAGTACCTGAA
CAAAACTCAGTTTCAGGTGCTCAGAAAGTTTGCACAGCCTCTTCTGGGCC
TACCTCTTCAGTATCAGCAGAGCCATCATCAGTAGGGAAGACTGGTCGTT
TAATGAAAAAGGAAGAGACGAGGTTGATTGCTCCTGTTGATATCAAATAT
GAGTCTGTAAAGCATTCTGCAGAGAGTTCCAAGGAATTTAGTAGGTCCTC
TGAGAAAGTTCAACCGAAAGGCTCTCTTTCTTCTGCACCAAAATCATCTC
AAACAAGCAGATCATATGTTCCTTCATCCAAACATAGAGCACCCTTATCA
AAGGAGCAGACACACAAGACATCTACGACAGGAGGCACCCCAGCAAGATC
ATTCCATGGAGAAGTGACACCATCTCATTCTCGTAATAAGGCAATGCCTT
CTAACTTACCACAGAAAAAAGATAAGACCCACCACCGCTTTGTTCATGTT
ACACAAGATGGTTCTACTAATTCAACATCAACTGAGTTGCGAGCCTCTGA
TGTGACAGCTTCATTGAGTGATGAACAGGTGTGAACATAATGAAGTTTCC
ATTATCAATATTTCTGTTGATGAATAAGTTAAGGATTTCTCACGTCCTGC
AATTTATTTTTTGTAGCTTGCATTGTTATTACATCAACAATTAAACAGCT
CCCCCAGAGTACCAAGGGTTCCACGTTGCAATCAGACAGGTAGCATGCAG
ATGCTTCATCAAACTGGAGCTACTGTTTTCTCAAAGCGGCCTTCAGCACA
TGGGGGAAGGGATCAAACACCGGTGAGGTCACCTGTACTGAATGTTGTTA
ATATGTGTTTATTCATCTTTTTTCCATTATGTAAAAAATATGATGTCTGT
TGGTGTAGGTGTTAAAGAAGAGACACAAAGATGATGTGGCATTGAGAGAT
AATGATGACAGCAAGAGGTCAGGAAAGGTGTCTCTTGTTGAACGGAGGCA
TAAAGATAATAGCACTGAGCGTACTCCTTCTGTGAAGGACCCATGCAGAT
TAGCTGACAATATAGGAGTGAAAGAGCAAAATCATGGTATGTGTTCAGAT
AAAGCTACCACTGGGTTAGTAAAGGACAATCTGATTGATAGCGGTCTTCC
ACGCAGTTTACCTGGTATGTAGTTTGGTTCATTTTGTTTTTTGGCATGTA
GACATCTGTATGCTGACATACATTCTATCAACAGGATTTATTGATGAAAT
CATCAGCAGGAACAGAAATATAACTTATGAAGAACTCTGTGATGCTATCG
GTGAGGTATGTTAATTTAAAAAAGCAGTTCGTGCATACATATTCATTTTT
AAATATCCACTTTACAACCTTACTGCTTGCAAAAGTTCACATTACAACCT
TCAAGTCCTATGTCCTAAACTGTTTATTTTTATCCCTGGACAATGAAATC
CATTTGCTTTACAACCTCGCCCCATCTCAGGTTGTTTTGTGCTGAATCAG
ATGCCATGTGACAGGCAACTTGGATAACTTGTCAATGTCAGCGTACAGCC
ATATCTGCAACTTGCATAAAAACTTATTCTTCTCTAAGCTATTGGTCTTG
GTAGCAAGAACACGTTCTTTATGTAGTTGGTTGGCGTGGCAGCCTGCTGA
CACGGATAAGTTGTCCACGTTCTTTATGTAGTTGGTCTAAGTCATCATGA
AACCACCTGAGGCAGGACCAGGGTTGTAAAGTGAACAGATTCCGTAGTTC
AGGTTTAGAATTGAACGGATTTTAAAGGTGAATGTTGTGAAGTCGATTTA
TTTCTTCAGATTCTTACGACGCACACTGATTTTACTTTACTTCTCAGCAT
TGGAGGGATTTCGTTAAACCCAAAGGAGAAGATTATGTGTATTCCAGCTT
TTTACATGCTGTCAACGAATGCCTCAGGACAAAGAGCGAGTGGGCTCACC
TTGTTCACCAGGCTCCAAAGGTGAGATCTTCTTTTAAATTATCCGTACTT
GTATTTGTTTTTCCTTGTACGAGTAATGCTTTGCTAGCATGACCTGATTT
TATCATCCTTAACACACAAGTAACAACTTTTAACTTCTTTTTCGTTGTGT
GTATGTGTGCACTTGCATGCGGGTGCCTTCGCTCATGTGGGTTTCAGACT
GTTGAGTCACTCAGCATATTTCTTTCTAATTCATGTTTTCAAACACCAGA
TGCAAGATAAACCATTTTTTTTACTTTCATTTTGCAATTCTAGAACTCCA
ATGATTGCTATGTATCTTGAAAATTACTGGTATGCTGCAGTACCTCTTAT
TACTATGTTGTATAGCACACTGTAATATTGTTGTTTCATATCCTCACAGT
CCTCAAAATCCTACATTTTAATTTTAATATCACAATGTTACAAACCAAGG
TTAAGGACCGCCACAAGCAATGGGTGGAAACTGACCAGAGAACAGCCGCT
GTTCCATCGCTGTGGTAAGGCTCTGATCGCTGGAGTTGGTGAAGGCAGAG
TAGGGATGAGAGAAGAGAGCTAAATGGGGTTAGGAGATAACTTCTTGTTT
CTTTCTCACAAAGTGCTAGGTCTTTTATAACCGGCTTACATGGGGAGATG
GCAACTCAACCTTAAGAGGGTAACTAATTAACAAGATTATTAGGAGAAAT
AGATATCTGCCTAATTTGGCGGGCTAACAAACTAGCGAGATAATCTAGGA
GGGAGTGATCTCTATCTCCGACGCTGCAGCCTGCACACCTGGTCATGCGC
CCTTGGTGTGACTGGTGCAGCTTGAGGATGGGTGTGATGCTATAGCCTAT
AGGCATGTGACACAGAACCAGGATAGGAGAAAACTCAATAATATGACATG
AGTGCAGCGCTACACTTTGCATTTTTGGGTTCTGTACCGAGTTTAAATCG
CTCCTACGGTTTTTAGAGTCATTTTATTTTCCTTTTACATGGTGACTATG
GTAACTTTGGTTAAAATAAGGATTACACCTTCCAAAACTAGTTATTAATA
AAGTATTTAGCTCTTAGGATAAAATCATTGTATAAACTTGTCTATTTTTG
AAATTTCAATTCTATGTTGCCCTATAAATTAGTTTCACAGGGGAAAAAAT
TAATACAATCTTCATGTTTGCTGCTAACTGGAAAATAAACCAAGGTATTC
TTTGTTTATTACTCCTTGGTACTTTAGCTGTCTGCTGTTGAAATACAAAA
TATAATATTTTGTTTCCAAACAAGACAATGCATAAATCGCATTTAGTCAT
GTAATACTATTTGATGTATAATAACAAAACAAGTATATTGTATGATGGCT
GAAGAATTCATTCAACTTTGTTAAAAAAAGCATAGTTCAACTGATTTTAG
TTTAGAGGTTTTGCATGGTCTGATGTATGAAGATTTGTGTTGGCTTGGTT
TTTTGTTTCAGACGAATCCGAATAAGCGCCGTAGGGTGGAGAGCGACTCT
TTGTCGGCTGATGCAATGGAAACAGAGAAGATGAGAAACCAGGCTGAAAG
ATATCCAGCAGAAGAGGGTAGTTCTGAGTCACAAGGTATGCCAAGGGGCA
AACGGAAGGGCTGGAAACACTCCCATCATGAAATGAAAGCTTCGAGTGAC
AAGAACGCGAGGAAGAGACCGAACATCAATTCATCCTCGGAGGACGCTGC
TGCCTCCTTGTCAGATTCAAGTACTAACCCTATGGATGATGAGAGCCAAG
AAGATGATTCTTCTGGTGGTGACAGGCAACCGAACTCTACAGATTCAGGC
TCATAGGACGTTGGTTGACTCAGTGCCGTTTGAGAACACATCTAACTGAT
AGGAGGAACCACCTGATTTCTTCCTTTCTTCCCCTCTTTGTGTGATGGGC
CATTTGTTGGGGCCGAGGTCCAGAAAAGCCGTGGCCTGGGAATGCACCTT
TCCCTGAACAGGAGTATAAGTCCATATCTCATGCCCAGCAAACTGCGCAT
ATATGTAACAATAGTGTAATCTAGCGTAGCCATTTCTTCCGCAGGTCATT
TTGCCTAACTTAGTATGTTTGTGGATTTTGTATGGACATGAGCAAATGCC
CCAAAAATAAATATAGTATGCAGCTTTGTACAGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.