Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018417

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018417
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018417
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology	MWG812-5
DNA	GGGATATTTAAGCAGCACTACTAGCTAGTCGTGGGGAGGAGAAAAGAGGG AGATACAGAGGTCAATGGGCGAAGAGACAATGAGAGACAGAGGAGACAGC AATGAGGAGGCGGAGGGGAGCGAGAAGAAGGGTGCGGGGGCGACGAAGGT GCCGTTCTTCAGCATGTTCAGGTACGCCGGACGCGGCGACCTGGCGCTGA TGGCCGTCGGCACCGTCGCGGCGATGGTGAACGGCATGTCGGACCCGCTC ATGACGGTCGTCTTCTCCACGGTCATCGAGTCCTTCGGCGCCGGCGACAA CAGCACCGTCCTCCAGCGGGTCAGCAAGGTACGGATGTGCATTTTCAGCC ACCGGTTCTGATTCTGAGTGTCTAGTCCAGAGAACTCGGCCATACCTTCG GCCGTCGGGATTACATGAACGGTCTGAGAATATTTTTGATCCAAATAATC ATGAGACACTTAACCTTAGGCTTGTGTGCAGCTCATTAGCAAAAAACAAA CGTAGTAATACATCTTTTACTCTCGTCTCTCTCTTGGATGGGCTACCTTT TCAAGCTAAAGTAGGCCCTAGCATAACCTTAATACATTGTGGATGTTTCT GAGACTATATATGTGAACCCAGCTTATGGCAGCATTATCTGCAAGGATGT ATTTAGAAAGCTGTTTAGTACTATCTCAATTTCAATGGGCAAGCCTTATA TACTTACTCAAAAGTCAAACCTTGATAGGTTTCACTAAACATATGGAGTA GAAAAATGTCAACATCCACGCTGTGAAATAAATACATCACGAAAATGTAT TTTATGTTCAATCCATTGACGTTGATTTGGTATTGTAATTGTCACAGTTT TGTCTAAAACATTGGTCAAACTTAAAAGTTAAGTCTAACTAAATTTATAA GACTTATTCATTGGAGTGGAGGGAATACGTGTGCAGTAGTGTTTCTTTGT CATAGCAAAAACAAACAAAGCAGAGCAGTGCGTTGGGCTGCGCATGGCCA GCCATCCAGGCTACAGTTCGGTGCCTCCTGCATGTTTGCTACTACTACCT CCGTTTCAAATTATAAAACCTTTTGGTAGGCTAAAATAGGCTATCGGAAC ATCTTATAATTTGGGACAGACGCAAAAACATGCATTAGATGGTATGCAAG GTAGACCGAGTTTTACTTGACTTGTTCAATGAAAATGACAACCGCGGAAT GCACACCCTTCCACTTTAACCTACTACTTCCTCCAATCCATATTAGTTGT CAATGGATTGGATATATCTAGCACTAAAACATGTCTAGATACATCCAATT CCGCGACAAGTAATTTGGATCGGAGAGAGTATTAATAACCTATATATCAG GAAAAGAAAAGAAGACAAATTATCTTCCTCTTTTTTTTTAAGAATGACAC AGTATGATCTCAAACTGCCAGACCTACTTTCACATGATAACAAAAACAAT GCCTCAACAGTTCAATACTAATTTTATTTGACACTTGCTTTCTCCAGGAT GTTATGTACTACATCTATTTGGGAATTGGGTCGGCGGTAGCTTCATTCCT TCGTAAGTGCAATTTTACTCTTGGACTAAATGTTTCGACAGATGATAGGT GAGACGTCAAGTCCAATTCAGTTCCAAATTGAAACTTCTGGCATTCAGCT TATCAGGTCACGACGCATGATAAACAATCAAACACTCAAAATCGAACCGA GACAAATATCAACATTCACCATTTTAATCCACGTGTGGAGGGTATAAATT GGCACAAATAGTTGAACTATTTGCTACAAATACTCCCTCCGGTCATATTA ATGGTCTCAAATTTGTCTAGATTCATATATATCTAGTTAAGTATTTAGAC TAGATACTTCCGTATCTAGACAAAGTTGATGCCATTAATATGGACCAGAG GGAGTTTATAAGATTCATGTGTTTTTACACTGGTAACACAACTTTGATGT TTCCAAGCGCCAGCCCATGCGTTCATACCCCTGTAGCCCAGCAATAGCAA CACTTATCAGAAAATCCATAACTTAATGAAACAGTACTGATTCTCAACAT AAAACTATATGAACAGTGCAACAAGTTTACCCCCACAATTAAATTTAAAC TCACTATTATCATATACAATTTGTAAAGCACAGAAAATATAATTGATATA GGGGCACATTATCACTCTCATTATGAAGTTTTCTTCGCAAAGTAGGAAAT GCAACATCACAACTGACGATTCTACAAAGTGCAGTATTCTTCCATCTCAA ATCAGGACCAGCCACTAATGGTAATGGCGGTTAGCAGAGAATTTGAAGCT GACGGAAGGAGTGCAATCAGTCTGTAGATTAATCTTGCTCTAGGATATGG AACATATTTGTACCAATGAAATGAGTGCATTCTCGTAGAGAGGCAGAACA TAGTTGTCGGACGGAAAGACGCAGAGCGACACAGCTGATCATCACCGCCG CTGTCAAGTATATCTGGAGTATTAAGTGTTATCTGTCGACACGAACTGTA GAAAGAAAAAGTCACTGACTTTAGGAGTACTAGCTATGTCCAACGCTTCC GTGCGTAAAATCGAACGACAATGTCATCAATATAGAATGGTGAATTGTCC TGCAGCAATGCATGGGCCCTTAGCAAGTTAGCACTAGTTTTCTAGTTTTA GCTTGAACCAAGTTAGCAAAGTAGTTAGCAGCATGCATAATCTGTGTTTT CAGTTGGATTACATTCACATGCAGCAGAATTTCAAATGAGTGGCTGAAAG CCTTTAGCATTAACCTGTTATCTGTGCCAGAGGTGTTATGCTGGACACTG GCTGGAGAAAGGCAGGCAATACGCATCCGATCTCTATACCTCGAAGCTGT TCTAAAGCAGGATGTTTCCTTCTTTGATGTGGAGATGACAACCGGGGAAG CAATTTCTAGAATGTCCGTGGACACTGTACTGGTCCAAGATGCCCTTGGA GAGAAGGTAACAAATGCATTTGGAACATACAAAAATACTCAAATAAATAT ATTTTCATTAATGCATCATTTGATTTCAAGTAACATGATTTCCTCGTGTT CAGGTAGGCAAGTATGCACAGCTTTTGACAACCTGTGTTGGATGTTTTGC CATCGGATTCATAAGAGGCTGGATGTTGGCTCTTGTTATGCTGGCATGCA TACCACCAAATATTCTGTCTTTTGCAATTGTCGCTCGATTCCGTGCTCAG ATATCTGCCAGGAGGCAGGCATCATATGGTGAGGCGGGCAATGTCGTCGA GCAGACCATTGGAGCTATAAGAACGGTGAGTTCTGATGGTTTTAAACTAT AAATAACTATTCTAAGACTTGAGAGACCGAGCGTCTGCTCAGGTGGCTAG CTGGAGCAGGTGTGCTCACAGGCCCACCCACCCATGTTCGAGGTACAACC TCAGCAGGGTGGGTGCTCATGCTTCCTTTTCTTATTTATAAAAACAATGG CACAAAGGGCTGGTCCCTGGTTCTGGTCAGTCAAGTTTTTCAATTTGATA ACATTTCAAAGCAGGTTGTCTCCTTCAATGGTGAGAAGAGAGCAATTGCA TTGTACAAAACCCTCACAAAAAGAGCATACAAGGCCACGGTCTTGGAAGG GGCTGTCACTGGTCTAGGAACAGGGGGTATCTTTTCTGTTTTCTTCTGCA GTTACTCTCTAGCCTTTTGGTATGGTGCTAAGTTAATCATCGACAAAGGA TATACTGGAGGGCAGGTCATCAATGTCGTATTTGCAATTTTAATGGGTTC GATGTAAGCTTTCCAATTTCCAATTATATATTATAAAAAAATGACAATAT GATATGTTAGAGTGAAGTAGCACTTAAGTCTTGCACACATAAAGTCAAAA CTCTTCTAATCTAAAAACAAGAATACTCCACTTACATATTTGTTAAAAAG CAGAGAAACTTTTAGAGCTCAACAACTTACAAATTACTTTTTTCATGTTA CTTGACATTTTTCTGATATAAAAATAGTTAGTTACATAGTTATTATTGTT TAGGTAGCGGGATGATATACAACTTTTCCAACTCCACAGGTGGGCCTAAC ATTCTTGTGCATCACATAAGGAATAATGCTCCAAAACTGAATCAAATTAT TACGAAAATAATGAGGATAACCATAGTATTTGCCTCAAATGGTATTTATA GTTTATTCTGACAATCAGATCTTAACAATTTGCAACAGGGCTATAGGTAC TGCATCACCCTCCATTTCTGCTATTGCAGAAGGACAATCCGCAGCACACA GGTTGTTCGAAACAATCAACAGAAAATCAAAGATTGACATCACCAACACT TCTGGAATAGTATTGGACGATATCAACGGCAATGTCGAACTCAACAATGT GTTCTTCAGATATCCTGCAAGGCCTGAGCAGTTGATACTTAATGGGTTGT CTCTACAAGTAGCTAGTGGTACTACAATGGCTATAGTTGGAGAGAGTGGA AGTGGTAAATCAACAATAATTAGTCTGGTAGAGAGATTCTACGACCCAGA GGCTGGTGATGTGCTGATTGATGGAATCAACATCAAGACTATGAAACTCC AATGGATAAGAGGAATGATCAGTCTTGTTAGCCAAGAACCATTACTTTTT ATGACCTCCATCAAAGACAACATAACCTATGGTAAAGAGGATGCTACACT TGAAGAGATCAAGAGAGCAGCTGAGCTTGCAAATGCAGCAAATTTCATCG AGAAGCTGCCGAATGTAACAAAAACATTACTTATTTATGAAAGTATCTTA CTCAAGTTTCTGCAATTAATGCTTACCTGATTTCTACATAATACAGGCAT ACGAGACAATGGTTGGTCAGAATGGTGCCCAGCTTTCTGGAGGGCAGAAA CAAAGGATTGCCATTGCAAGAGCGATCCTTAAAAATCCAAGAGTCCTTCT GTTGGATGAAGCTACTAGTGCTTTGGATGTGGAGTCTGAGCGAGTAGTTC AAGAAGCACTAAATCGGATCATGGTAGGGATAACTACACTCATCGTTGCT CACCGTCTGAGTACTGTCAGGAATGCAGATTGCATAGCAGTGGTTCATCA AGGAAAGGTAGTTGAACGAGGTAAGAGATAGTTCCACATCTTTTACATTG TTCTGTTCTTCTTTGAATCAACTAACCAGTGTGAACTGGAGGTGATTCAA TTCTTTTTGTTCACAAATTCATTTCATACAGGTGTCCATGATGAGTTGAT AAAGGATCCTGATGGAGCTTACTCTCAGCTTATTCAGCTACAACAGGCTC ATACTGAAGAAACACACGAGGTGCCATATGTGTCAGGTTCAAGGCTGGAA ATTGAAAGTTCATCTTTGGAAGAATCAATCAGAGATTCTCCCAGAAATAG AACACAGCATTCTCTAAAATCCCTTGGGCTGTCTAGATCCAACAGTTCGC ATGGGCATGTTGGAAGCACACAGGAACACGAAGAAATTGGTGATAATGAG GCTCCTAAGAAAACAACAATTGGACGTCTTCTTTATCTTAGTAAGCCAGA AGCATCAATTCTGTTGTTAGCTGTAATAGCTGCCTTTGTGCACGGACTTC TTTTCCCGTCATTCAGTATTATGATGACTGGTGGCATAAGAAGTTTCTAC TATCCAGAACACCGACTTCGAAAAGATTCTACGTTTTGGGCATTGATGTG CCTTCTTATGGCAATCATTTGTCTGGTTTCAATCCAACTGGAATTTTTCT TATTCGGAGTAGCCGGTGGGAAACTTATAGAACGTGTCCGTGCTTTATCT TTCCAAAGCATTATTCATCAAGAGGTTGCTTGGTTTGACGATCCTTCAAA TTCCAGGTTTGGTAATCATTTTTCTATGTGCGAGTTTATCTTTATCTTCA ACAGAGTGGACATCAAGTTTTCCTTCTAACTTTTACAGTGGTGCACTTGG TGCAAGGCTGTTTATTGATGCTTTGAACATCCGAGGCCTTGTAGGAGATA ACTTGGCCATACTAGTGCAGTGTACAGTAACACTTGTTGCTGGCTTTGCC ATAGCATTTGCTTCTGACTGGAAGCTTACACTGAGCATCATATGTGTGAT ACCTTTTCTGGGGTTGCAGAATTATATTCAGTTGAGGTTCTTGAAAGGGT TCGGTGAAGATGCTAAGGTGAAATCAGAGTTAACCATGTTTTGCAATTGT TTTTTATTTAGAAAAAATATAAGCAAACAATTCCTGATAAATTTCGCATT AGTAAAGGTTTCCAGACATGGTGCAATTTTTTTACTAATCACATATTGGA AGCTTACTATCAAAATAATGTATTACTTAGAAGTATAAGTGATAAAATAC TACCTCCCAACTACAGGTGACGTGTGAAGATGCAATTCAAGTTGTGGCTG AAGCAATTGGCAGTATACGAACTGTAGCATCCTTTGGTGCAGAGAAGAGA GTGATTAACAAGTACAGCCAAAAATGCCAAGCTTCAATGAAACAGGGAAT TAGAAGTGGAATGGTTGGAGGTCTAGGTTTCAGCTTCTCAAACTTAATGA TGTATCTCACATATGCTCTTTGTTTCTATGTTGGTGCACAGTTTGTACAT GATGGAAAATCAACCTTTAAAGATGTTTTCAGAGTAAGATATACACATTT ACATGTGAGGTCGTTTTATTCAATGACTTGATAAATGAATCTGGTATTTG CAGGTATACTTTGCTTTGGTTTTCACATCTTTTGCAATTACCCAAACAAG TGCAATGGCATCAGATTCAACAAAAGGTCAAGAATCCGCAATATCCATAC TAGCATTCATAGACAGGAGGTCCAAAATTGACTCAACTAATGATGAAGGT ATAAAGCTAGAAAAAGTTGATGGCAATATAGATTTCAACCATGTAAGCTT CAAGTACCCATCCCGACCAGATGTCCAGATACTGAGAGACTTTACTTTGG GTATTCCCTCCAGAAAGGTACAGCTGACATGAATCTTGTCATGATTCTTG TAGTAATAAAAGTTTAATGTTTATCATTACAAAAATGGGAGAAATTCTTA CTGTACCTAGTTTCCTGCCTAGCATGGAGATAAGATCACGCTGCTACAAG CATTGATGTACTATTGTGCCATATGTTCCACCAAAGGGTTGTAGCAGCCT TGGACTACTTTATTTGAACATCACCGGGAAGAACATGAAGTGCTACAAAT ACTTTGCAAATATACTCCAAATCTTGAATGCGCACCCTATACCTAAGTTT CACAAAATTCTAGATAGGTGATACCAATTTCATCTGGCATTGTACAAACT TTAGACTTTAAAAGGCTAACCCTGTTTGGTTAGCCTACCATTTGTTTCTT GCTTTGCAGTTTCTTTTGGTGTTGAGTTGTAAGGGTTTGGTTGTCTAGAT ATTTCTTATAATACAAAAAAACATACATTTGGATGCATCCTCAGGAGAAA ACAAGAAAATCAAGAAAGCTTATGCACTAAGATTTAATGATCTTAGAGAC TTAGAGTTCTCTAGTCCCTGCCTATTCAATGTCAGTAAAACTGGAGCACT GGATCTTTTATGGAAATGAAAATTACAAAGAACAAATTTGGAATTTCTTT CAGTTTATATTTTCCCTCCACGTTAGCGATGGCTGATGGTTTTAAAATTA TTTTTCACATGCAGACTATTGCGCTTGTTGGAGAGAGTGGCAGTGGCAAG TCCACAGTAATTGCTTTGCTGGAGCGATTCTATGATCCGGATTCTGGCAC AATCTCACTAGATGGTATAGAACTCAAAACCTTAACACTGAGTTGGTTAA GAGACCAAATGGGACTGGTAAGCCAAGAACCAGTACTTTTCAATGACACG ATCCGGGCCAACATAGCATATGGAAAGCGAGGAGAAGCAACTGAAGAAGA GATTATCAGTGTCGCCAAGGCAGCCAACGCCCATGAGTTCATATCGAGCC TGCCTCAGGGATACAACACGAACGTTGGTGAGAGAGGAACACAACTTTCT GGTGGGCAAAAACAACGAGTAGCTATTGCAAGGGCAATCTTGAAGGACCC AAGAATATTTCTGCTCGACGAGGCAACAAGTGCCCTGGACGCTGAATCAG AGCGCATTGTTCAAGATGCATTGGACCATGTAATGGTCAGCAGGACCACC ATTGTGGTAGCACACCGTCTGTCCACGATCAAAGGGGCAGATATGATAGC CGTCATTAAAGATGGTTCAGTTGCTGAGAAGGGAAAACATGAGTCCCTCA TAGGCATCAGCGGTGGAGTCTATGCATCACTGGTCGAACTACACTCAAAG GCATCCTAAAGAGATGCGCCGATATTAACTGTTCATCTCTTCCCTTGTAA CTAAAAATGAAAAGCTCGTGTGGCATTTGCATTGTAATTTGCAAGTCGAG TGGTGTAACTTCTAAACAAATGTTAAGGCTAATTGCCTAGGATTATAGTT TCCGCTACGCGTAAGACATCAGAGATAAAAGATAGCCTTGGCATGGGGGT ATGCATTTTTTCGGTTGCTTTCTGGGGGTATGCAGTGATAGTACAGAAGA GCACATCACTACATCAGTGTAGTCCCTGAACAATTATCTCTATACATTGA AAAAAAGAATCTCGGACCACACTATGTATACTTAAACAATTGATGTACCG CAACTATCTACGACTACACTAGCCCAAAAAAATCAACCATGCGGATTCGG GGTATGTGAAGTGTAGGACGGTGTACCTTTGGTACTGCGAGGTCTCCCAC CTGTAGGTCCTGGATGCCAAGCTAGCCGCGGCGCTCGAGTTAGTGCCCAC CGGCGATCCAGTCTTCCTACCTCGTGGAGCCGCCGAAGACGGATTTGCCA CCGCCGCCGCGCCGCCGTCCCACAGAAACTACCGTTCGTCAGCCGTCTCA AAAGCTGAATCAAGGGCTCCGATTGCTTTTCTTCTTTTCATTTTTCTTTG AGGGAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.