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GrainGenes Sequence Report: AA016800

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Sequence
AA016800
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016800
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
WHE07A04.s2
DNA
AAACCCTCCTCGTTCTCCGCGTCGCCTCATCCACTGCCGCCCCACCCCGT
CTAAACCCCAACCCTCCTCCCATTTTCCCCACCACAAGCAAGCACAGCGG
CAGCAACCCCAGACAAGCCCAACCAAAAGCGAGGTGGACACGACGTGAGC
TCGCCGCCGCCGCCAATGGCGCTCCTTCTCCGGCCGTCGCCTCCCCCGCC
CCACCTCCGCCTCCACCTCCGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCTCTCCACCG
CCCCTGCCCCTTCCCGTCTGCTCCCGGCCCCCTCCCCCTCCGCCCGACTC
CTCTTCAGACCCAGGTGCCTTCATGTCCGCTTCATCCTTCCTTCTACCCT
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CGAACGTCCAGGTGATTCTCATGCGCGGCTTCTGTTGCTAAGTCGGAGCC
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AGTGGTTAACTTTCAGTTAATGTAATCGTCTATTGAGTGTAGTATAAAGC
ATGTTATGTTTCGTCAGGAAGAAAGAAAAAAGAACATATGCATTTATGTG
TTTGACCTGCGCCACTGTTGACTGTTAACTATTGCTACCTCCGTTCGGGA
GTATTTGCAAAATGTGAACACATTGTTCGTTGGCTTGATATTTTTTTATA
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GTATATTGCAAAGGATTACACTTTTTTGTACATGTTACTATGTGTTCCAT
TTTATTTGTTGGCTGATCATCATTCGGTTTGGTGTATTATAGGTTTATGA
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TTAATGTAGTCCTTCATGAGGACAATTCAGTTAGTGTGACAGACAATGGC
CGTGGGGTATGCAGTTCCTATCCAAGGAAGACTTCCTGAATGCTTAATAC
TTCACAATTTTTCTGAATAATGTGATTATTATGATTTCAGTTTCGAGATT
CTGTACTAGTTACTGTTGTAGTAAGTGATCCTACCTGTAGGTGAATCATA
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TCCTAGTCCTACTCCTGCTGGATGATGCTTGCACCGACTAGCTCTCCCCG
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GCAATAACTGTTTCTATGGACTATAATTTGCTGCCACTGCTTGGAGTCAA
TTTCGTGCCACTTTTATCCTTGGCTGATACCTTGTCCCATACTCTTGGAT
AATCTTCCACATGCATGCTGCATACGCGGCACACTATTTTGTATGCCACT
GATAGTGCTTTAGCTGTATACCATGGAGGCGATAAAAAATACATCCATTC
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TTTGGTTGGACATGACTAGAATGAATGTTCTCTATAACTCTCGTCTTCTA
AACGTAGTTGGTTCAACATTCTTTGTCTGGAAAAGAGATATCGTAATATT
GCTATACAGATGGCAGAAAATGATGTGGGTTATCTTATCATTATGCAATA
TATGTCCTTTCTACATAGTATTGTTAATTAAACATCTCATTTACCATTAC
TTATAATTTGTATTTTTCTGTTTGCTTGCTTCTTAAAAGTTGAGATTTAC
AAAGCAGCAGTTTTTGAGTAATCAGCATGCAACATATATTCTGATTACTC
TATGATTATCTTGTTGTATGTTATATAAAATTACTACTAAATCATGGACA
TACTGCAGATCCCTACAGATATACACCCCCAGACCAAGAAATCATGCGTG
GAGACTGTCTTAACGGTATTGTTAACACTTTATTTGCTTGATAAGGCTGT
TTATTGCATTTTTCAGCAATCCTGACCCAATCCCAGTAAATCTTACTATA
AGTTCATATTCTGGGAATGAATTACTCTGACATATGGTACCTCTGTAGTT
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TAAGTGCATGCATGCATTCTATAGAATCTTTTTCAATACATTTTTATTGC
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TTGTAAAGTTTTTCTTTTGATCACACAGTTAATGCATGCTGGTGGCAAAT
TTGGAGGCTCAACAAGTAGCTACAGTGTTGCTGGAGGGCTGCATGGTGTT
GGCCTGTCAGTTGTTAATGCTTTATCAGAGGTTCTTGTTTTCACATCTAT
TCAGTATGAATCATAGATGCTTAAAAAAGAGATTATGAATTGTAAATCTT
CCAATAAAATTTCAATTCTCTCTACGGAAAATCATGATCCATTGGGTGGA
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TGATATATTATTTTTCTGTGAATACTAGCATTTCATGGACTAAGTTTAAT
AACGACCGTACCTCCTAAACCAGACTAAACATAATAGGTAATTTTCATAG
ATATGCTCTTTAGAAATTTCCTTAGGGATTGTTTGGGTTACAGCGTTATT
ATTCTAGGAAAGTAAAACCTTAGATAACAATCCACTACACTGATGATAGT
AGCAAGCATGCAGATGGGAAAAATTCTGAGAGTATTCGTCAATTAGCTTG
TCTGTGAAGTGGAGCGCGGTACATATTAACATAGTTGCTTGGTTACCATG
TTTTTTATTAGAAGTGCTAGTAGTATGAAGTACCTATATTTCATTTTGAG
AATAGAATGAGGGCATGAACTGGGAATCCACTATAAAAACCCTTAATGGT
GTAATATGAAAATAGAAATTTCCGGTGATAACATGTTTTGGGTATGCTGA
TCGTACGCATTCCTGCAATTCATGTGCAATTAATTGTCATTTTCATGATA
TTATGATGTCAGGCACTAGAAGTTACTGTGTGTCGTGATGGAAAGGAATA
CCGACAAAGCTATTCTCGTGGAAAACCACTGACAACGCTAAGTAGTACCA
GACTATCTGATGAATCAAGTTCTCGTCAGGGCTCGTGCATCAGATTTTGG
CCTGACAAAGAAAGTATGTTTCTATTTTCCCGTAAAGTTTTCTGGTTTAA
GCAGTACTAGTTATGTTATGGTGACCCAACGCTTAATTATTGTTTTGTAG
TATTTACCACAACAATTGACTTTGACTTCAATACAATTTCTAGTCGCATC
CGGGAACTTGCATTTTTAAATCCTGAGGTATGATTATTCTTCAACTAGAA
ACATGGTTTGTTCTGAACTGGTTTGCTAGTTCTCAAAGCTATCGCATGAC
TATGATTATTTCCTTAGTTTGTTTGTTGCCTAGCTGATTAATGAACCATG
CTTGCTCTGTCTGGCTAACACACCTTGGTTATCAGATTACTGACCTAACT
TACCTTGTTAGGTAGACTATTGTTGTCTTTACATGAGTACATATTTTTGT
ATCCTTTTTGTTAGCAAGATTAAAAATAAACATCTAATTTTTTCATTACC
AAGGATATGATTCACTTCCTATTTCTATTCAGAGTCAAGAAAATCTGTAT
ATATAGTTGGCCTCTGTGCTAAGGAAGCATTCTGCCTCGTAAATCTTTAG
TTCGAGACACGAGGTCATGAGGATATACTTTGTGAAGACAGCAGCAGCTA
ATTGTGGGTATCAGTGGAGCTATTCCACTACTGCTGATGAAAAACCCACC
ATGGAACAGAGATAAAAATGAGAAAATATTTGTTAAAAAGAAAATTTTGA
GTTAAATTTTTACCAGCTGCTAAAATCAAATGTCTTCCAACACCTCGGTG
CAAATTATGTTTGCCGTTCTGGCTACTTTTCTCACGTGCATTAAAGCTAA
TTTAAATTTCTGTTCACTTTCATCTCTATCATTCGTTGATTTTCTGTTAC
TAGGGAACATACCCGTGCGATTGCAACGGGAAAAATATATTTATAATAGA
GAAAAATATATTTATAATAGAGAAAAATATATCATTGGAAGGATTTTGGA
TTTGAACGTGCGTATGCACTATGGCCCCCCGGGTTGCGTCATCATGTGTG
CAACCAGCCAAGCAGGTGATGTCTGTTGGTGTTTTTCATACCCCTGGTTG
CGTGTGCCACCAATGTGGCGTGTCCACGCTTCAATTAAGCTCAATTCCAC
ATAATTTCTCCAATGTCGCCCGCTCGCCCGTTCAACTGGCTCAATCCCAC
ACAATTTCCTCTCATTTAGGAATCGTCTTTGTTAGCCCCGTTCAATTTTT
TCCCAACAGCCCAAGCAGTCCGACATACTCCCGTTTATTTCTTTGCCCAT
CGTCAGCACATGTGGAATTTTATTCCCAATCATTAGATTTCACTGCTTGA
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TCGAGGTGGGACTATTGAACCACAAAAAACAACCTATTTTCAAGTCTCGG
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CTTATCTCCTACCGAGAGGCCATCCAAGACCACGTATCCGCGCGTCTCAC
GTCCCTCGTCTCTCTCTATCTCGTCGCCACTTGCCACAGAGTCGCCAGGG
AAATCGGAGACAGCTCGTTGCCTCCCAGCGGCATGCACCCCCTCGCGCCT
CCATGCCTTCGCTCCCGAGTGGACTGGAGGAGAAGGACTTGGTCGACCAC
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TGGCCGGCTGGCGACGAGCGGAGCGAGGCCTCCTCATCACGTCATGCTCG
GCTGATAGGGTCCCTAGCACAAACACGCCTGCTTCCGTATCACGTCGTGA
TCAGCTGATGGGGTCCCTAGCACAACCTCGCCTTCTTGCACATCGCTGAC
GCTTGTCTCCTCGGCACACGCCTGGCTTGCAGGAGCCCTGCTACCGGCTG
CCCCTCTTCTCATTTGGCCTTTGTTCGATGTGAGGATGAGAAACAAGCAG
GCCTTCGTTCGCGGTGAGGATGAGAAATAAAACAGTGGAACCGGTACGGT
GGCATCCTAGGTGAGGATGAGAAATAAAACAGTGGAACCGGTACGGTGGC
ATCCTAAGATATTTTGTAATTTGGTGGAAGGGCAAATCCGTCCAAAAAAA
AAAGTTGGACCGGAAGAAACACTTCGTCCTTTATTATTAGGTATAGATAA
ATCGTTATGTGTGCTATGAAGGTTGCAAATTACAGTTGGGCAGTTTGGTT
TCGTATATCTTATCATTATCTGTGTGCATTTTAATTTCTTTGTTCTTAAT
GCTGGTTTGCGTGCACAACTTGCTTGTGACATGTGTTATGCTTAAAGGTA
GACCTCTGGTTAATTTCTCATTGTTCTGTACTTCTCTCAATGCCAGCTAA
GGATAACATTAACAAAGGAAGAAGATGATGCACAGGTTCAACACAATGAA
TACTGTTATGCTGGTGGCCTGGTCGAATATGTTTCCTGGCTGAACACCGA
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TACCCTTTAGTCATCGTGGTGCCTACTGCCTACAGTTTGCAATCAGCCTA
GCTAATTTTTTTCTGAGTGACTCATTAAAATATTAGGGGCCAGGTTTGTT
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AATAGTGGTCAAAGGTAAATCTTGAAGACTGTCAGTGCCCAAATCAACAT
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AACCTCTCCATGACCCAATAGCATTCAGGAAGGAGTTGGATGGTATAATT
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ATATCGAGGGGCTGAAAACTTCCTTGACAAGAACAATTAATAGCCTTGCA
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TTATTCTTCCCTGGTAAATGCCACCTTTTTTCATATTCGCAACTGTAGCC
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TTATTTGTTCCATAGAATTAAAATTCAAGTAAGCTGGATCTGTAATCCAG
TCAGGGATTTGTCTAAACAAATGATTCTTTTTGCAGGATAAAGATATTAG
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AGCTAACGTCCAGCCTACCATGTATATTTTGGAAGTTTCTGATTGGATGG
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TTGTTGCAGGCTGCATTGGCAGCCAAGCGGGCTAGAGAGTTAGTGAGGAC
CAAGAGTGTCTTAAAATCTTCTTCACTTCCTGGGAAACTGGCTGACTGTG
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TAATGCAATGTAGCTAGGTGCATATTAGCATCATAAATTTGACTGCTAAT
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CAGTTTCCATTCTTCTTTTGACAGGAAGTTACTGAATTCTGACAGTTCCA
GTTATATGCTTTTGTTATAAATTACTAGATTAATAACTAGCTTATTTCGA
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GGTGAGGATTTTAAGAAGGAAGCTCTTCGGTATCATAAGATAGTTATACT
AACAGATGCTGATGTAGATGGTGCGCACATCCGGACTCTTCTCCTCACGT
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GTGTGTTACCGTTAGGGGTATTGAAACAGGTACTTTTGTGGAGGCATGAG
AGCCTCATGTATGTTAGAGGCACACACTTCACCTCTTAACGTACATGCAT
GTGAGCATGTCTGTACTTTATTCAAGTATAGCACACCATGACCTGTGTAG
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CACTAGGCCGCGTGCCCATTTGCCAAATAAAAGCACTTGTTTTTCCACTT
TCAACTATTGCACAACTAGGCTTCGTAACTGGCTGGGCTGAATATAGTTG
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GAGGCTGAAATATGGTTGATATAAAATTCTGAAGCATTCAAACCTGATGG
TTGCGCTCCTGGAAAGACTAGGGTTGCTTCTCAGCCTAAAGACCCATTAG
ACCCTCATGTTTGATGGGGCTGACCCTCTATCCCACGGCTGACAGAAAAA
TTCGAGCTGAAGCAGCCCTCTGGGCAAGAGCAGGAGCTACTGGTCTTCGA
GTGATCCTACCGATGGCCTGGGATGTACACTAACAATGTTGTAATTTTGC
TGTTAATAACCTCCTAGGAGGCATGTACTCTTAAACCTTTCTATGTAATG
ATAAGAAACACAAAGTCTTCGCATTTTCTCGAAGAAAAAAAGACCCATTA
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GGTCTGTCACTATGGGCTTGTTTGTTGAGGGCTGAGATTTGGGTGACAAT
GGGGTAAGGAGTTAATTTTGCTATAAGGGTAGGATTTGCTTCTCAGATCA
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ATGGATCGGAGGGAGTATGATCAATTGCACTTGCTGTATGTTTATGTGTT
TATGATGATTATGCTGTAAGCAAAGCATCAACTACCAGTTCTATTTACAT
TCTTGTTTTAGTTGAACTACCATGTGAGTGCAACTGTCCATATCATATTA
CGATGGAAGTGCTTGTAAGCTGTGACATGATAACTAAAGGGCTTTGCTTT
CTCATACTATGATTGTAGAGAGCACTATTCGATGAAGGTTGCATCTATGT
TGGTGTGCCTCCTCTTTATAAGGTTTGATTGTGGCCATAACACCTACTTG
AAATTTGGAATGAACTGTCGATCTTAAGTTTGTATCTGATATTCATCTTT
TTGTGCTAGGTTGAGCGTGGGAAACAAGTGCACTACTGCTATGACGAGGC
TGACCTAAAAGAGCTAGTTAACACCTTTCCAACTAATGCTTCTTATAATA
CCCAAAGGTTCAAAGGTATAGCGTTTCAACCCATCCAACTAATGACCTAT
GAAGCTAAAAATCTGGTTGACTACAAATGGAGAAAATTATTTATACTACC
TCCATTCCCAAGGCTTAAGCCTTTAAAAAAAAAGTCAAACTATGCAAAGT
TTGACCAAGTTCGTAGAAAAATATATTAATATTTACAATATGGAATACAT
ACCCTTTGATACATCATGAAACATATGTTACATGGTATCTATAGAACATC
ATAGTTCTTGATAGTTTTTTCTAGAAGTTTGGTCAAACTTATCGTAGCTT
GACTTTTCAAAAAAAAAAAATCTTATATAATACACATATGCTTCTTTTCT
GTGTTATCTACTCCCTCAATGTCACAGATTTTTCTAGATTTGTATGTATC
TAGACACATTTTTAGATACATGCGAATATAGACAAATCCGCGGCATCTAA
TTCGGGACAGAGGGAGTATAAGAAGTCCATTTGTTTCTCTTATTTTGATG
GCAGATATTTACCCTATCCTCTTATCCTGGTTGTTAAATAGGTTTGGGCG
AGATGATGCCTCTGCAATTATGGGAAACGACAATGGATCCTGCAAGGAGA
CTGTTGAAGCAGCTAACGGTCGAAGATGCTGCAGAGGCCAATATTGTGTT
CTCATCTCTTATGGGTGCTAGGGTAAGCAACCAGTGAACTCTCTGGGTAC
TCTTCTACTTGCGAGTTCAGACGACGTTCCGCTTTGATGCCATACCTTTC
TATTCCAGGTTGAATATAGGAAGGAACTGATCCAGAAGGCAGCAAGCATG
GTCAATCTAGAGCACCTTGACATCTGAGAGCGTTAAACAAGGCTGACCAT
TGTTTATGATATAGAAGATCACACCTGGTTTCCCATTCGACATAGATCAA
GCTTAGTGAACTTCACTTCCATGCCAAACATGTCTTGGTGCTAGTATAGT
AGCAAATCTAGGCTAGAACGGAGAACTGAGTCAGCCCCTGGTACTTCTAA
CAAGAATGGTGGTGCCTTCGTTTGTGGACATGTTGTACCAACTCATTTTT
GTCATGCCCCAGTATCATGGGGAAGTAGCCCGGGCAGCTACCAATCTGCG
GTGCAATAGTTGATTTCGTGCTAACTTAGTAGCTCCTGCTGCTTTTCAGC
GTTGCTCTAGTTTCATGATACAGTTGATGCAGTTTTGGTTTGTCTAATAC
TCCCTCCGTCTCAAAATATAAGATGTTTTAGATTTGTAAAAAAAATGCAT
CTAGACTTTTTTAGTGTATAGATTCACCCCAAAGTTGAGTGAATCTATAT
ATTAAAACAAGTCTATATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATA
TTTTGAAACAGAGGAAGTAGCTGAGATATGTACTCTCTTCGTTCCTCTCC
AGATCCAGGGTGTAGCATCCCAGTTGTCTAACACATGTAATGCTGCTGGA
TCTAGTAATAAAAGGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.