Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA012742

[Submit comment/correction]

Sequence
AA012742
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012742
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
WHE07D07.s2
DNA
GTTCTTTCTTCTTCTTCTTCCCCAAGTTGATCCTCTCTCCCCAACCCCGA
ACACAGATCACCTCTCCATCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCGCGCG
TCCCGATGGGCGCCCTGTTGAGCAGCCTATGGAGCAAGGAGCCTCCGCCG
CCGCCTCCGCCGATGGTGCTGGTGCCGCCGATCTTCGACTACCCGCCCAT
CGCCGCCCGCACCAGGTCACCTCCTCCCCTCCCTAACCCCTCCCCTTCGT
TCTCCCGCAAACGAAATTTGCTCCAGACCCTCTCGCTCCAGTCCGCAGCA
AGGACCGAGGGCGCGCCGCGCTTCGCACAATGCGATTCAGTGGCGAGGGT
TTCTTAATCTTCGACTAATTGCTCGATTAGATTAGATGATCGTGATTAGC
GATTTCTCTGCTCTTAAGCGATTTCTTACCGTGTAACAAGCACCTGTTGG
TTAACTGTAGCCAGTGTTCAGAAACAAAGTAACTGTAGCCCTTGGGTGTA
CTGTCCTGATTTTCAGCTTCAGATAGCTTTCTGTGTCGATGCCCATCCGT
CAGAAACAGGGAACCGTAAAGCAAACTGGCCCTACACTGTGATTTTCTAC
TGAAGAGGTTTTTTGTCTTGACCACGCAGGATGTCGGTGCCGGCATACGA
GATGATGTTCGGAAAGCTCCCGCTGCGCAGTCTGTTTGAGGACTACTTCG
ATCAGGCAGGGAGCATGACCTCAAGGATTATGCTGAAGCCGCTGGAAGAT
CCTCACGTTGATTTGATCGCCAATGTATCCTCTGAAACATGAATCATTGT
TGCCGCATTTTTTTATTCTGCTGCTGTATCAGGTTCTTTCGGTAGTACTG
TTACTGTCTTAGTTCGGTGAGGATATCAGCGAGGATCGGTGAATCTTCAA
CTGTTACATCTTGTAGCTGTTCTTTTATGTTACTTCATAGTAATAGCATT
TTTTTTCTCGGTCTGTCAGTTTCGATAATTTTTGGGAGTTACCTTTTGAT
GCAAACCAATCTCCACTGGGTAGCCTCATCTACACAGTGCACAAGTAACA
AATTTAAGATTGCCTACAGTGGTTGATATCACCTTGGTGCTAGAAAATTA
TTTCAGTGATGCACATGTTTATATGCCAACCCTTGTAGTTTTGACTTGTG
TCAAGTGGTTTGATTCATACGCAGTACATTTTGTGTGTTGACATCTAGCT
TTTGCAAGAGAAGTATTTGCATACCTTAATATCACTAGGTATCTGCAGCT
GCCGAAAAGGATAGTGGAACAGAAGTAAAAGGAGATGCTCTATTTCGCTG
GCAAAAGTAATTATTTCCATAATTTACCAGTGCTTTGTATTTATGCAGAC
TTTGTTATATTCTAACATAAGAAATGCTTTACTGTTCTTTAGAGATTTGT
ACGATCCCCATACCTTTGTGGACCTTCTTGCGTCGACTTCAGACCCGTAC
GTATTTTCTTGCTGGAGGGATAATAAAATTACTGCATTAATTATTGCTTA
TTTTGATAATTGCATACATGCTGATATTTTTGGTCGTACTTTTATCCAGC
ATGTTGAAGCTGAGGTCATGTGCTTACTATGCTCCGTATCACGTTGGTGC
ATTTGGGATACTCCCTTTGCTAATGGGAAACAGGTAAATTATATATCTGT
TGCACTTGCAAATCATGGAAGCCATTGTTACATAGCTTTCCACTAGTTCG
TTTGGTTGACCTTTGGAGAAATGTCCTAAATAGTATGTTAGATGTTTTCA
CCATCAATTTCAGTTGATATAGTTAGAAACCATCAGTGAGGAAGTTATGT
TTTTCAGGGTGTCCTCTGAGGACAATGGTCTCCTGGGTCTAAGGTATGGT
TCAGATAATCTATCATTTGGGGCGTCCTTTGTGCCAATGCCTGGTATGTC
TCATTTGTACTTCTCATGTATTTTGTTGGGTTGTGTTTGAAGATTATACG
TAACAAAATGCACTACCCATTTTAATCTGAATCCATATAGAGGACCAGCA
TTATTGCCAACTAATATGCTTTGAATTCAATCTTTGTAATGTTATTTTCA
GTTCACTTTTACTTATAATATCTGCTGATATATTCTAATAAAAACAATAA
TACTTTCTGACATTACTTTTGTTTGCAGCATCTGGTGAGGTGCCATATGG
AGCATGGTTGGTTGGGAGAAAAGGAAGTTTGACTGCAGGAGCACAATATA
AGCCACTTAGTGAGTGTTAATCTCTGAAATTTAAACTTACTATCAGCGAA
AAAACCTCAACAAATAAAGGTGGAGCAGTTCATCATCCTGTAATATTCCA
ACAACTTAGTAGAAGATAGAAGCTGGAACACAAAAGCAAAATAATGTATC
TTCATAATATGTTGTTGAGTTAAATTAAATTTGTTTGTGGTTTTGGGATT
CTATTTCAAGTGGAACATAGGAGCATGGTAAACACTTGCAGCGCTAGGTT
CTCATCTGGAGCACTCTTGTGTACAGATGCATCTATATTCCCTTTTAGGT
TGTCAAAAATTCTGATGATTTGCATTCGCTTCCTTTTGTTCACCACCAAA
GGAAGCATGGGCCTTTTAGATCATGCTGTGTAGCATGTAGCTTATTTTGT
CACGAAATCACAAGAATTTTAGTACCTCACAATTCTGAAAATTTTCTGTT
CATACTATTTTCTAACATTATTATCCTCTTATTCTAAATTTGACTGAAAT
GTAATTCGGTAATGGTACAATATGTATCTTCTTTTCTATCATTATTATCC
TCTTCATGCATCTAGATAAGCAGACGTGGATATTCAGTTGTTTATTTGCA
CTTTTACGAGCTTTTTTTCATTGAGTTATAGTTAGTGCTCTTATGCTCAT
TATGCACATAGGTGGAAACAAAAATCCTATGCCATATACGGACCCAAAGA
ACTGGAATTATGCAATCAGTTATGGTGTTGGCTCAACAAGCCCTCTCAGC
CCTTCATTCATTTGTTCCCTAGAGCTTGCCAGAAATACACAGGTTTGTAG
TTTTTGCTGCTTTGTTTGGAAAGTTAGCTTCAATTGCTAGGATAATTTTG
TTAAGGTTATAAACAGAACTGTATGATCGAATGATGGATCCTTGCAATGG
ATGTGAATTTTAGAACTATTTACGTGTCTCTTTTTTAAATAATATCTCGA
TCACTGGAAACATTATCTGTTGATATGTTCATCTGAATATGTGTAGGCAA
CTGTGTGTTTACAAACAGGAGTGCATACATGCATGAGTATCTCTCCATGA
CACATCACCAAGTGGACAATGTTCACTTATTATAGTTACGAGTTTCACAC
AAGATATTTAGAGTTGGACTAGTATTTAAAAATGGAGGGAGTGCAACAGA
TGCTGCCTGAAAATACATGTTTATTTGTGAAAATAACTATTCTCACCAAG
ATATAAGAAAAATCATCAGTCGCATAGATATGTGTATGAAACAGTTGGTT
TTATGCATATGTTTGTCTTCATTTCTTTATGGTAGGGAGAAGTGGCGTAC
TTCTACCAAAAAACACTAATACATTAAATAGCTATTGATTATGATAGTTC
AAGACAGCCTTAATATCTTCAACTATGTTTGCCTTCAATGAGCTGCATGG
GTAATGAAATTTTGTTTTCCTCAATGTGCAGCTTACCGCGTCGTTCTATC
AGCACCTGGTTGTGCAAAGAAGGGTAAGGACAGTTCTCGTAGTTTTATTA
TCTGTCTCTGACGAGATGGAAACTAATTTGATCATTAAGCCTTTTATGCT
TTCTGTGGATCCTGGTAGCTTTCTGTGTTCTTTTGTACTATCTCAGTGCT
GTGATAGCCAAAGATCAGACATATGCATATTAGTAAAACAAAAAACTGAG
AATACTCTAAGAGTGCTTATGTTTTTAGTAAGAAGGTACAATTACAAGCT
CATAAGAAAAATATCCGTCCATGGTGCTTCTCTGCTGTTGCCAACACCAA
TGTTTCTTAGGTACACAACATGCATACAGTTATCAACAAATAAAGCAGCA
TCCCACACTAATGTCGATATTATCAGTCTAATAATTTCTGTTAGGGATAA
AAATATGTCCAAGATTTCGTCTTAGCCATGAATTTAAACGCCAACATGCT
TTGACTGAAACTGAAGTTGTGTCAGTATGTCACGATGTATACCAATGACT
CGTTATTGCTTCACTCGAGGGAACTGTATATTTTGCACTCTTTTTTCCTA
TAGTTGTGTGCTTCTTATTTCCTGGTTTACTGTACCATGTTTTGGTGTTA
ATTTAATCATGGTATCTAAGCCTGTTGAGAGTCTATTCTACTCGCATCTA
TCAGGTGAAAAATCCCTTTGAAGATGATCAGGTTGTTGGTATCACAAACT
ACATAGATTTGGGTCTTGAGTTGTCTGGAGGGTAAGCCTTACTACCTAAG
AGGAAGAAACATTACTTTATTTCTTCATGAAATCAGCTGACCAACTCCAT
TTTCACACTATTAGGATTGATAAAGATAAACCAACAGAGGGCGCCAGCAA
CTCTCCGTTTCAGTTAGCTGCAAGCTGGCAAGCCAATAAGAACTTCATGT
TGAAGGTTAAGTAGATCCATTCATCAGTTCGGCGTCCTTTAAGCGAGTCT
TATATTAGCTTCATCTGTTTCTGACGGTGATTGCTCCGTTCTTCTCAATA
GGGAAAGCTGGGTCCTTCCAAGTCATCCGTGGCTTTGGCATTCAAGTCAT
GGTGGAGACCATCCTTTGCACTTAGCGTCACAGGTATGTACTGTGCAAGC
CTGTCTTAATATACTTTGCATAAAAGCATAGCTAATAACTCATCTTTTCT
AAAGCAAAACACTCAACAGCCAAATCTTCACCACTGTTATATCTCGTGCT
AATGTGTTCTGATGAACCAGATAAACTGAATCCATAATAAAACATCAAAA
AGGGAAAGTAGTTCTAGGACTGCTGCAAATTACCGACAGGTCGACTTTAT
AGAACTTTGAGTTGACGCTTGCTGTGGTTGCATTGATTTCCGTTTGCAGC
TGTGAACGACCATTTGAAGGGGACAACGTCGTACGGTTTTGGAATCCGCG
TCGATGATCTCAGGAGGGCCAGGTACCGTCTCTCTGCTGGATTTACGTTA
CTAACTGTTCGATCCTTTGGGTCGGCTAGTTATTTACTACTAGCAATGTT
GTGTCGGCTGCTGAAAATTCTCTGCTTGATGAACTTGCAGTTACGAGAAG
GCTGACGCGAACTACGTGATGCTGACGCCAAATAAGCAGCACCTGGCACC
GGCCGTCATGTTCAAGTACAGGGAGCGGCCCATGTTCCAGGAGGACGTGG
ATTCTGGCAACTTTGATCATCTGCCTGCGGAGTTGAAGCCCATTGGCAAG
ATAATCTAGCCGGTGCCCCTCAGGGCTCAGACCTGTCAGCCGTCGAAGGA
CATTTAAATCGTGGAAGTACATGTAGCATTTAGCAAGTTCGTCTGAAAAG
CCTTGTAGATTTCATACCGGTTTGAGATCTGCGAGAGCATAGTATTTCTC
TTTAGTCGTTCCCTTTAGTGTAGAAATTTTGTCTCTGAGAATGTTTGAGC
AATTGCACTGGAGCTCGGTGAGTAGGGCAGTTTCATGGACTAGGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.