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GrainGenes Sequence Report: AA008178

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Sequence
AA008178
External Databases
Data at GenBank
Data at EMBL
Data at DDBJ
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008178
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology
WHE07E12.s2
DNA
AAAGAGAAGACGGGCGGTGGAAAAAGATAGGGTTTTTTCCCCTACTACCA
TTTCCCCAAATTTCTCCCATCCCCTCCGCTTTCCCCATTGCCCGCCTCGC
TCCTTCTCCCCCCGGCCCGCCTCGTCGGCTTTGACGCAGAGGTCCAAGAA
AACCCTAGCCCGGAGAGACCCCCCCCTCCCCCCGCCCCCCCGTGTGCGTG
GTTCCGAGGTAATCTTCGCCACCTCTCTTGTCCTCCGCGCGCTTGGCTTG
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TTGTAAGTCTGGTCATATTATATCGAGTCATAATGTTTGAAAGCAATTTG
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GAAATACCAGGTCAAATGAATTGGCCCGTGCAGTGCTGTAGCTAAGAGCA
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TTGTGTGTACATTGAGTACACCTGCCAGAGTTTTCTGGCTATTTCAATGA
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AGATGATGTGCATGTGTGCAGACGTGTTTTAGTGTATAGGTACATGCAAA
TCTAGATAAATCTCCGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTATATTGATG
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TGTTCATACACATTGTTATTTCAGGCTCATATAAGTTCTAGAAAGAAAAT
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TCTTCTTCAGTTCTAGTAATGAGAAAAGTTTTGTTTGATTTTCCTATCTT
TATTATTCTTTTGAGTAACTGGCCTACCTCATTATACTGATAATTTTGAT
AAAGACAGTTTATCATCTAAGACTTCCACCTACTTAATATGTTTTGTCCA
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GCAGAAGTCGAGGGTGCCGTTGACGACATAAAAGGCGTTGATGAAATAGA
GCTTTCTGAAGAACAGAGGAAAAAATACAGAAAGGTCAGTCAAAACCATT
TTTACAGTAATACATAATTAGCTAGCAGTGCAATCGTACCACCCTTCTTT
GTGCTGATGTTTCTATCCTTAAGTATCTCCTTTAAGATTTTTGTAATCAT
TTTAGTGCATGATGTGCTCGTTTACATTTTATTGTGTACTCTAACACCTA
GTTTCTCCTAGTATCATAAGGTTGTTTGGTATGTTCATGATAGACACATA
ATTTGTGAAATCCCTAATAATGTTTGTAGTTATAGGTCTACTCTGGTAAA
ATTTTGTTTGTAATGCATCCCAGCGACTTGGCTGCAATGCTTTTAATGTT
TGTATTTATCCACCAATCCTGATGTTTTGTAGTACCTATGTTGTTTTTCT
AAAGCACTACTCGGTACCTACGTGGTCATGACTATTCGCTGATTGATTTG
CAATACATGTGACATGATGGCTTGTTTAACAGCTGAGGCATGCTGTTATG
TTTCACCACATGTTACTCAAATGCCTTGTGTAGGTAAGAGAAGAAGATGA
TGCAAAGACAATAAAACGTCTGCGGCGTCATATGCAAAGAAGGACAAGAG
ACTTGTGTAAGGTAACTACTGTTCGTGTTAGTATTTGGTGCAAGATCAGC
TTTTTCTTACTCAGCTTGATTGGTTTTCTTTTTCTTTGGTGCTCTGCTTT
ACATTCATGCAGGAAAAATTTGGCTTGGCCTCATCATCAAATGTATGCTC
CGAGTTGCCTCTGTTATCTGATGATGGTGTTCTGGGTCCCAACAGTGGAT
TTTCTTTATCTGAAAAGCACAAAACTGATAAAAATGAAGTTTCTGGTGAG
CTGCTAAAGCGCACACGTGAAGATGATGTTGAGCTTGACCACAAGAGGTC
GAAAACTGTAGTAATAGAGAGTGATGATCACATGCAGATAGACAGGAAGC
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GGGGTTGACATTATTGATCTTGATCTCTTCCCGCCACAAAGTCCTAAGCT
TATTGATATAGATTTACCTAAGGCTTTCAAGTGTACAATTTGCACCGAAA
TGTTGAATTCCCCTGATGTGCACCGTCACCCAGTACTGGATGTTATTGTT
TGCGGGTCTTGTAGATTTCTGGTGATAGAGAAGAACCGTCTTCAGGTGAA
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AAACTGACTGTCGACTCGGTTGGTCGACTCGTATTTCCTCGACTTGATTA
AGTCGAATGACTAGTCCTGGACTAGTCTAGACTAGTCCTGCTGTTTGAGT
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AGAACCCTAGCTATTCTAGACTCGCTACATGAAGTTCTAGATTCTAGCAT
TATTATGTTATATGTAACTTGTGTTGAACTTATCTCAGTTTTAGTTATTT
AATCTCCCATCTGTTTGCCATACATGATAGTATTTTGTACTAGCTACTAT
GGAAGTACATGTCGACTAGTGGAGCAGTAGTCTAGACTAGTCTATGAGTC
GGTACCCCAATGACTCGGCTCGACTTATTGACTCGTAATCATCTATGCTG
TCTGTTTTTACTTCAGGGTCCTGTATCTGGTGGTTATTGCACCTGGTGTG
TTCAGTGTGAGCAACTTCAAAGTTGCAGTTCCTGTAAGATGCTATTCTGT
ACAAAATGCTTATCAAAGAATTTTGGCGAGGAATGCTTATCAGAAGCTAG
AGTCACTAGTTGGCAGTGTTGCTGCTGCCAACCCAGTCAACTGGAAAACT
TAATATCTGAATGTGATAAGGCCATGAGCGGTGATGTTGAATCTTCTGAT
CCTGAGATTGACAACACTTCTGGAACCGAAAGCACTGATCCTGTTAGGTA
TGTTCTGTTGTGCTTTTACCATTATAGAATAATACTACTCGCCATTATAT
TATACATCACACAATATGGACAAAATGCTAAGATTTTTCCAATCTAATTG
ATTGTGTAAAATGTGGTCAGCAAACACAAAAGGGTAAAGAAGATAAGAAG
AATCATGGATGATACAGAACTTGGGGAGGAAACAAAGCGCAAAATAGCAA
TGGAGAAGGTGTGTAGTCTTTTATGTCTCTTGCACCTTTATTTTTAAATA
TCATACAATGTTTTTGTTTGAAGCTATCCAGGTTGTATTTTGTACATTCT
CTTGTAGGCTAGACAAGAACATGTGAAGTCCATGCATGAGCAGTCTGCCA
GCAAATTAAGGGGTAGCAACATTGGAACTTCCTCTGGAGCTCTATCAGAA
GTCTTTCTACAGGATGCTGGGGATGGTCATATAGTCAACGTTGCCAGGGA
GGAAGACGAGGAACCTGTTAGAATTCCAAGCAGCATATCTGCTAAACTAA
AGCCTCATCAGGTTTGTTTGTGAAATTTTCCCAGTAAACCATGCGGTGCA
CATTCATCCTTCCAATTAAATATGATATGTGAAACCCTGTGTCAAAAAGG
ATGTGCTGACTTATAATGTGTTCAAATGGTGGAAGTTGTAAATAGAAATC
CTGGTCACATACGGAGAGGATGTATTCCCTACCTTTGTTAACTTATTTTT
GTTTTAAATGGTTAATATTCCTCAATTATAATTGCTTCTTAAGTGGCACC
ATATCACTTGACTACCGCATGGCCTCTTATCTGACTCATGGCATTTTCAT
ATTTCAGGTATCAGGAATAAGATTTATGTGGGAAAATGTTATCCAGTCTG
TTAGAACAGTCAAATCTGGGGATAAAGGTTTTGGGTGCATTTTGGCACAT
AACATGGGGCTTGGGAAAACTTTTCAGGTCCGTGTGATATTCTATCTTGT
TATTTTCATTATAATTCAGTTAGATTAAAATATTTGAATGCGATCAACAT
ATGTGCTGGGAGCTATTCTACAGTATGCTATTTGGTCTTTCAACCATTTT
GGTGTATTTGCTAATTGCTATTAATCGTGTAGCAAGTGTTGCCATTTTTC
AAGGCGGCCTTTGTTTGGCCTGATTCCGCCCCCATTACATGAAATATAGT
GGGAGTTACATACATATATTTATGCACTTTGCAGGTTATTACATTCCTAT
ACGCAGTTATGAGATGTACCCAGTTGGGATTTCACACGGCCCTTATAGTT
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TCCGGCAGAACTAAAGCCTCTTCGTGTGTATATGCTGGAAGATGTGGCAA
GGTACGAGATAATTTTTTTGTGATAATGTTTTCCTTTGTTTCAAAGACCC
CACAATGTGTGGGAGTTTTCAGCACTGGGTACGCCTTTTCAATGTTTTCC
TTTGTTTCACTGTTACATGTGGTTAACTTGTTTATCCAGTGTAATCTAGA
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TTGGTATAAAAATTTAGCTTGTGCTAGCTTTAGAAGGAATCTTGCCTTGT
GAGGGCCTAAACAGAACTCTTAACAGGGCAATCTGTTATGTTAACATTAG
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ATGTTTCTATAGTAAATAATTATCTACTTAGCATGGAACAGCACATTTCC
TCTCTAACGTTTGTTTTTGCAGGGTAAAAAGACTATATTTACTTAACAAG
TGGCAAACAAAAGGTGGAGTGCTTCTCATTGGTTATTCATCATTTAGAAG
TTTATCTCTTGGAAGACATGCGAAGGAAAAAGATACCGCAGATGAGATTT
CTAATGCTTTGCAGGTGATATTCCATGTGCCGTGTTATTTTATTGCAAGC
TTTTATGTTATGTCAGCTCATAAGCTTTTCCAGGTTCATCGAGCAAATGT
GATATTCTTTCTTTCTTTTTGTGGCTATGTAGTGAGGTTTTGACACCATC
CTTTGTGGATGTAATAGCTTGTCGATATTCATGTCTTGCATGAATTATGG
ATACAATCATTTTTTAGCTGTGGGTTTTGATACAGTTCATTTACTTATGT
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AAAGAATAGGAGGGCTGACATTACGCACGCTCTAAAACAAGTAAGGACAC
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CAGTTACTGGCAGTATTTGATGTGTAATAGCACTAGTGCTAATTGCTTGG
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AACAACTTTGAACCAGAAATTTGTTAGACAAATACAAGATGGAATGCTGT
CTAGTCTTTATTTTTTGGGGCTAATAAGGTGTTATTTGTGTTGTAGCATA
ATCATATTTCCTTATGTTGTTTTTCATACTTGACTATATGTTGAAGTGTA
GATCTGGAACCATCCTGGTCTTCTCCAGATGGCTAAAGAGCAGAGAGGAA
GTGTGCGCCGAGAAGATGCTGTTGAGAACTTCCTGACGGACGAGAGTTCT
AGTGATGATAATCATAACACTGAAAGTCAATTGCCAAATGGAGGTAATAT
GTTATCTAGCGACCTATCCTTGATGATGATACACTTCAACTTTGGCAACA
ACAACCAAGCCTTTTGTCCCAATCAAATTGGGGTAGGCTAGATATTAAAC
CCAAACGGAAACTAGAGAAAATGCAAGTCAAGCGGAAAACAGCGAAAAGG
GCAATTCAAACAAGAACTAGTGAAAAAAAGCAAGAAAAAAGAACAAAAGA
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CAAAAACCAAATCTCTAGGGACATTCCAGTCCTTCATATCCTTTTAACTG
CCTCCTCCCATGTCAGCTTTGGTCGTCCTCTACCCCTCTTTGCATTATCG
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GTGCCACCCCTACTCTCTCGCGTATCACTTCATTCCTAATCCGGTTTTTT
CTTGTGTGGCCACACATCCACCTTAGCATAGCATCTCGTCGACACTCATT
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GGCAGGTCTGATTGCCGTCCTATAAATCTTACCTTTTAGCTTTTGTGGGA
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GCCATGATCGTGTGGCTAACATCCTCATCGATACCACCATTGCTTTGTAG
CATTGATCCCAAGTATCGAAAAGTGTCCCTCTTGGGCACCTCTATCCCTC
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ATGTCCTTAGTGACCTCATCCATCACCAAGTCAAAAATGTATGGGCTTAA
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TATCTCCTGCACGAACAGTTGTCACAACATTAGTGTACATATCTTTGATG
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TATGTAGGTCCTTCTTCTGCTCCCTATATCTCTCCATAAGCTGCCGAAGC
AAGAAAATCGCCTCTGTAGTTGATCTCCCAGGCATAAAGCCAAATTGATT
TTTAGTGACATTCGTCACTCTCCTCAAGCGATGCTCAATCTCTCTCTTCC
AAAGCTTCATAGTATGGCTCATAAGCTTAATTCCCCTGTAATTAGTACAC
TTTTGGATATCTCCCTTATTCTTGATGATGGGTACTAATTTACTTTTCCT
CCACTCATTCGGCATCTTGTTTGGCCGAAAAATGTGGTTGAAAAGTTTAG
TTAGACATACTATCGCCATGTTTCCAAGACATTTCCACGCTTCAATGGGA
ACATCGTCGGGACCCATGGCCTTCCCTCCTATCATTCTTTTCAGGGCTTC
CTTAACCTCAGTCTCTTGGATCCTCCGGATGAACCGCCTATTGGTGTCGT
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AGCCCATCAAAGTAGTTTCTCCAACGCTTCTTGATCTCCTCGTCTTTCAC
TAGAACTCGATTGACCTCGTCCTTAATGCACTTCATTTGGCTGAGGTCCC
TTGTTTTCCTCTCGCGAATTTTTGCCATCTTGTAGACACCCATTTTGCCC
TCCTTTGTTCCTAATTTCTCATATAGCTCATCATAGGCCTTCCCTCTAGC
TCCACTCACCGCTCGCTTTGTGTTCTTCTTGGCTTCTTTGTACTTCTCCA
TGTTGCTTGTGCTTCTATCTTGATACCAAGTCTTGTAGCACTCCTTCTCC
TTGATAGCCTTTTGGACCTCCTCATTCCACCACCATGAGTCCTTAGGCTC
CTTTTTCTTGCTTCTCGCCACCCCAAGCACCTCCCCAGCTACCTTTTGAA
TTTGTGTCGCCATCTTCACCCACATGCTCTCCGCATCTCCATCTTCATTA
CAGGGCCCTTCTGCTTCCATCTTCTCCTTAAAGGTTTGCTAGGCTTCCCC
TTTAAGTTTCCACTATTTTGTTCTTGTGATTTGGGCACATTTGTTCCGCA
CAACACGTGTGTGGAATCTAAAAACGGCCACCATAAGCTTATGCTGCGCC
ACCACACACTCTCCAGGTATCACCCTGCAGTCCAAACAAGCTCGCCTATC
CATCCTCCTAGCAAGGACAAAGTCAATTTGGCTAGTGTGTTGGGCGCTAC
TAAAGGTTACTAGATGAGATAGCCTCCTCCTGAAGAGGGTGTTGGCCACC
AACAGGTCTTAAGCTACTGCAAAATCTAAAATGTCCTTATCCTCCTGCCC
CTCAAAACCCGTGTTAAATGTACCCACATGGCCATTGAGATCTCCTATGA
AGAGCTTCTCATTTGTGGGTATGCTACTAACCAAGCCCTCAAGGTCCTCC
CAGAATTGCCTCTTAATGCCCATGTCGAGCCCAATTTGTGGGGCATAAGC
ACTGATGACATTCAAGACAAGATCCCCTATGACTACCTTGACTAGGATTA
ACCTGTCTCCCTCCTAACGTACACCACTCCATCCTTGAGGCTCTTATCTA
ACAAGATGCCAACGCCATTCCTATTACTAACTGAACCAGAATACCAAAGC
TTGAAGCCGGTGTTCTCTACTTCTTTTGCCTTCTGACCCGCCCATTTAGT
CTCTTGGACACGAAGGATATTTACACGCCTCCTAATCGCTGCATCCACCA
ACTCTCTTAGCTTCCTTGTTAGGGATCCTACGTTCCAACTACCCACCCGA
AACTTGTTTACCTCGGCTAGCTTCCATGCCCTTCGCATCCGTCGAGTGGA
ATGGGAAGACCCTTGCTCACTTGTCACTACACCCAGGCAAAGATGTAGCG
CGCCACTAAGGGAGTGACGACCCGACCCTTGCTCATTTAACACCACACCC
AGGTTCCGATGAGGCGCGCCACTAAGGGAGTGGCGACACAGCCCTTGCTC
ATTTAACACCACACCCGGGTTCCAGTTTGGCGCGTCGCTAAGAGGGTTAC
GCCCCAACGAGTTTCTAGTAGGTTTCATATCCATATGAACGGCTAGTTTT
TACGTTGGCTCGCCAAGCCTATCACAACCCTCCTCCTTTACCCAGGCTTG
GGACCGGCTATGCCTAGGGAGACATGGCGGAGTTACACTTCAACTTTGGC
AAACAAAATTATTTTTCTGTTTGGAGAGACTATTGTTTTGTCTTCAAACC
AGAAGCTCCTCTGATATATTTCTCCTGTTGTTCTTTTGTGTGAAATTTAC
ACCTGGTTTGAACCGTTTTGTTAATTTCACAGAGAAACAGAAGAGAACTG
ATCAGCAGTCAAAGAAAATTGACTTTGTGAGTGAGGTACTTGATTATTGA
CTATTTGTTTCAAATTTCCAATTTACAGAATCGCAAAAATTAAATTGACG
CAATACTTTGTATTGCGCATACAATGCCATGCTGGGTTTTTGTTTACTTA
TATGGTCTATATGCATCTCAATGGCAGATTAATTGGAACATACTCAATGA
ATGAACCTGTGTTGCAATATTCTCCACCCACATATTGATGTCCTTGATTA
TGAAAATTGAACGTTTTAATGTGCTTCCATTTCTTGCAGGAAAGTAACTG
GTGGGAGAACCTTATAGATGAAGATACTTATAAGGAAGCAGATTACAGTG
GTAAAATGGTCTTGCTCCTTGATATACTGGCAAGTTGTTATGAATTAGGC
GACAAGGCATTAGTGTTCAGCCAGAGCTTGACCACTCTGGATTTGGTGGA
ATTTTATCTATCTAAGTTGCAAATTAAAGGAAAGGAGGGCAAATATTGGA
AGCAGGGCAAGGACTGGTACAGGTATACTTTCACCTTTTTACTGCGTTGT
GCCCAAATGAACCGTACAACTATTAGTGTGGATTTGGTTGTTCCATAGTT
TTTTTGTGGCTTTACTTCGTGTTTTTGACATGCACGTGAGATAAAAAAGT
GGAATCAGTTGTGTTATCAGTTTGTCTACATTTTTTGGTCATAGCTTTGT
CTTCTTGGTAATTAAAATATTTTTGTTGTGGTCAATTGAAGATACTGGAC
CTGTCTGCAAGTATGTACCATGATAAATGCACCTCTATTCCAGTGAACCA
ATAATTAAAATAAATGCACCGTGTATTCTAGTGACCTGCATGGCATTATC
ACGGTGGCAAATACTACCTCTGTTTTATATATAAGACGTTTTAGATAGGC
TAATGTCTTATATTCTGATCCGGAGGTAGTACATCTTTGTGCCTTCTGTT
CTTTTTGCCGCAAACGCGCTTTGTTATTCTATGAAATTTCTCACTTTAAA
ATATCTTTAGCAATTCTGCAAGAAGAGTGGGTGGTGTTTTGAGCTGTTGG
CCAGAATTGAGATGAACTAATAATTGCCTGCTTGACTCTTTGTCCGTACT
ATATATAGATATGAAGATATTTCAGTTCTGAAAATTTACTTGAGAAGACT
CGTCCGAATGCGCCAGGCTTGCTGCTGGTGCCCATACAAGCTGGCTTAAC
TAGTTCAGCCGCAGCTTGCAACTGATCATGATATACTGTGCTGAAACAAG
TTTTTGACCATTTTGGTTCACTATGACAGCATTTTTTATGCTATTTCTGC
AAAGACGACAGCTTTATTTCCAGCATGTTGTTCACAAAGCTAGCGTATAT
AATCATCTAATTATGCAAAAATGATGGCGTTACTTTGAGCATCTTGTTAA
TCCAAGATTTGTGTATCATCAGTATCCAGTTCTCCAAATACCATGTATTT
TTACTGTGCCATACAGGCTTGATGGAAGCACTCCATCTTCCGAGCGGCAG
AATCTTGTAGAGAGATTTAATGACCCTGCGAACACAAGAGTGAAGTGCAC
ATTGATATCTACTCGAGCTGGATCTCTGGGTATCAACCTTCACGCAGCAA
ACCGTGTGGTCCTTCTGGATGGTTCATGGAATCCAACACACGATCTGCAA
GCTATTTATCGGGTTTGGAGGTCAGAACTGGTAGCCTCATTTGTACAGTC
GTTACATTTTTTATGCCATTCTGTTTTTATTTGCTGTGTATTTTATATCC
AGGTATGGCCAGGCTAAACCTGTGTATGCTTACCGCCTAATGGCACATGG
AACAATGGAAGAGAAAATATATAAGCGGCAGGTAATGTGACATTTGCCTT
TCTGGTTTGGGGTCATGAGTTTGAACTAAATTGTGACTTTTACATAGCAC
AAATCAAGTTCTTGTTTGGAATCTTATCAATATGAATTTCTCTGTTGGTA
GGTGACAAAAGAAGGGCTTGCAGCAAGGGTGGTGGATAGACAGCAAGTGT
CTAGAACAATCTCCAAAGAAGAGATGTTGCATCTTTTTGAATTTGGTGAT
GAGGAATTACTAGACCAGAGTGGAAACAATTATACCATAATTGACCACAC
TAATGTTGGAACGGAGAAGCTATCCCTGCCCATCAGCAGTGAAACCACTG
AACTACCAGTAGACGGGATCATGCTGAACCTGCTTAGTGATCACCCTCGG
TAATGCCTAACCTATTAATGTTGAAACTATAAGTATCACGTTATAAATCT
ATAATGCATAATGTTTCGAATTTATAAACTAATTTCAAACATGTAGCCTT
TATTAATTTCCTTACGTTTCACTGCCTGTAGCCTTATTTTAAAACATTAA
TTCATGTAGTAATTTGCTTGCTATGAATGTATAGAAGTGCAAAGCAGCTG
CTGGAAGAGTAATATCTGTTTGAAATTTGCAGGTGGATTGCAGGCTATCA
CGAACATGAAGTTCTTCTGCAAGAAAATGAAGAGGAGAGACTCACCAAGG
AAGAGCAGGATATGGCCTGGTCAAGTTTCAAACAATCACAGCAGTTGGAG
GCCGTGCCAAGGAAGGGTGCACATGATCCCGAGAGGAAGCCAACAGAGAC
CATCGTCCCGCTGCCTAAAGTTACATCAAGAAGCCGGCAACCACAGCAAT
CAAAGTCTAATTCGAACAACCAGAAGAAATGCACCAACTTAAACCACTTG
CTGACTCTAAGAAGCCACGGCACCAAAGCTGGATGCATGACAAGCTGTAG
CGAATGTGGCCAGGACATTAGCTGGGAGACTCTAAACAGATCAGATGGTA
GATTGAGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.