Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA003244

[Submit comment/correction]

Sequence	AA003244
External Databases	Data at GenBank Data at EMBL Data at DDBJ
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA003244
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA Homology	WHE07A04.s2
DNA	ATTTTCCGCGTCTCGGCAGCTCTTGGTTCTCGCTGAGAAAAAGAGAAAAT AGGAAAGAAAATCGATGCGTCGCTCCGCCGTGGCCTGCCACTCCCTTCCT CCGGCGGCGGCGGCGGCTGCTCTCGGATTCGGGGTCGCACCTCCTCGCGC CCTCCAGGCCCTAACCATGGCTGCCGCCGCCACCACTTTCCCTCCTCCAG GCACCTGCTTGCCGCCATGTCACCGCCGCCGCCGCAGCAGCCTGTGCTCC TCCGTCTCCTCGGCAGCGTCGTCGGCATCAGCGGCTACGACAGCGCTGGC GGTGGAGGAGGCTCGGCGCGGGCGGAAACAGCTGGCCATGGAGCCGCCGC TCTACGACTACCTCCTCGCTAACGTCCGCGAGCATCCCGTGCGTCCCTCC TCCCCCTTTCCACTCCGAGCGAATTTCGCTGCTGTTCAGTTTAGGGTCTC ACCCAGTGTGTGCTTCTTTATCTTACTCTGGTTGATGGTTAGCTTCTCCG GGACCTTCGGGAAGAGACGGCGGCCATGAGAGGGAGCCAGATGCAGGTAC ATAGCAGTCATGAACTGAAAAATTGAGGCCACACCGCCACGGATTTGTCA GTGCGTTCATGCATGATGCAATCTATTCCTGGCACCACCTGCATTGCATT GACACCAGAAGGTCCATTCTTGTGACAAATGTATCCTCCTTTCATGTGTT AAGACCCAAACACCGGATGTGTCAGTTAACCGCAGCTTTGGTATGCCATT TTTCATGTGCATTATCAACATTGCATGTTTTGTTTCTTTGAAGTGCCTAC TATGGTTTTGCAAATGTTAGCAAATAGCAAGTGTAAACTGGTATGCTTTT TGGCTATACATGGAAGTGATAGAATGCATGTGTGTACTACCGTCTCTTAT CTTCTTGTCACCCAAATTTTGTATAATGCTAAGTCACTTTCAACTGGTTG CTTTGTCTTGGTAGGTTTCTCCCGCACAGGCTCAGCTTCTGGCGATGCTT GTGCAAATTCTTGGGGCGCAGAGATGCATTGAAGTCGGCATATTTACTGT ATGTGAACTAACTGTTCTGTTATCTTGAATTTCATGCCTTCCACCGTCTA GAAATAAACACTTTCAATACTTGTACCTGAAGCATGGATGTTATACTAAT TGCCTTTGTGTTATCCTAGCACAAATTGTAAAATCCACACCTGTATGTGT GAACAACTGAACATGAACTAGTAGTCTAGTATAAATTGGTGGGTTAACTA AAATCATGAACATCTCTGGTATCAATCATTTTGCTTGAAAATAACCAACA TGCATATGTATGAACATGAACTAGTATACCTTCATGGATCATCTTGAAGA TCTCTGGTAATCCCTCATTTTACCTGAAAATAATTCGCTTGTGTATGTGT GAACAAGAAATAGTGTACTATATCTTTCCATAGCATATGTTTTTCTTAAT GCTAAAGCCTGGACCCTGCATATATTCTCTTTTCTTGAAACAGTATTTTA ACAATAATATGAGAGTTAATTGGATAAACTACCACAATTGAGGCTGTCGG GACCGGTCAGTACCACTTTTGGTAATTTTAGCATGTCAGTACCAATTTTG GGGTACAAGCGTTGCGAATCGGGCTAATTCACGACTAAGAGCACTTTGAT ATGCTTTCTGACGGCTCGGGCCCAGCTGTAAGTGCCGAGATGGCGCCACG TGTCTATGAGAAGCTGAGGTGGAAGTGGGGCCCACATGTCAGACATATCT TATATCATTTTTCATTTTTTCTCTCCTATTTTTCTATTCACTGCCAGTGA GTCCCACCTGTCAGCCTCCCTTCTTTTTCCCACACACAAACCGGATGGCG GCGACGTCGGCCTTGGCATGGGCGGTGCTGCTGCTGCTGCTTTCCGCGGC GGCGGCGGGTGCGCGGGGCAGACGCTGGTGCCGTGCGCTGATCTGCTGTG TGCAGTCGAGAACCTGGGGCTCACCTCGTACCCGCCGGCGTACCTGGGCG AGGAGGCGCAGACCAACAACAGGAGCCTCCTCCACCGCGCCAACTTCGCC TCCGGCTCCGCCGGGTACCTCGACACCACCGCCGCCCTCTATGTACGTCC CTCACTCTCTCACTCACACTCGCTCGCTCATCAATTCCGTCGGTCAAGCT AGCATCCTAGGACACACACGCGCCATGCATCCGGCCCATGCACGCGCTAG CTAGTTATAACTAAAGACATAGGGCGGGTACTAATGAAACACACTGACTG CAGGGCGCGATCTCGCTGGGCCGGCAGCTGGACTACTTCAAGGAGTACCA GTCCAAGGTGGCCGCGGTGGCCGGTAACTCCCACGCGGTGGCGCTGACGT CGGGGTCCATCTACGTCGTGAGTGCTGGCACCAGCGACTACGTGCAAAAC TACTACGTCAACGCCATGCTCGTCGCCGCCTACACGCCCGACCAGTTCGG CGACGCGCTCATGACGCCCTACACCGCCTTCGTCGAGGTAACCGAGAGCA AGAACGCCGAGGCCGCCTGCATGCTCCTGCTGGAGCTCTACGTGCGTGCG GGTTGCCCCTGTCGCCGGCCCGAGGGGGAGGCAGAGCTGCGGGCAGAGGC GCGCGTGGCGGCGCTGTCCTGGCGTGGTCAGTGCAAACGAGCTTCATCCG GCGGCGACACGGGTGCACGGAGAGGGAGTAGGCGAAGGGCAGGAGGATTG AGGGCGTGGCGGTGGCGCCGTGGCCGGCTCCGACGAGCTGCGTAGCTCTC CAGGCACGACCTGCCGGTGTGAGTCCACTCCGTGGCCTCCGTCGATCCTG TCCCGGAGCCTCGTGCGCCGCCGCCGTTCCGAGCCTTCCGCCGGAACCTC TCCCCGTCGGCCTACTCCAGCGCACTAGGCTTCGAGCCGGCGGCCAGGTC CTCCCCTCCGCCTCTCTGGATGCGCCTGCAACCTCGCACATCGCCGCCCT CAGCTTCCATCGTCTACTCAGGGATTGATTGGATTGGAGGAAGGAGGTGG ATGGGGAAAATAGGAAGGCTGACCGGTGGGACCCACTGGCAGTGAATAGG AAAATAGGAGAGAAAAATGAAAAATGATATAAGATATGTGTGACAGGTGG GCCCCACTTCCACCTCAGCTCCTTCTAAACACGTGGCGCCAACTCAACAC TTACAGTTGGGCCCGAGCCGTCAGAAAACGTGTCAAAGTGCTCTTAGTCG TGAATTAGTTCAATTCGCAACGCTTGTACCCTAAAATTGGTACTGACGTG CCAAAATTACCAAAAGTGGTACTGACTCGTCCTGACAGCCTCAATTGTGG TAGTTTTATCCAATTAACTCATAATACGATGTATGATTAATTGTGTATGT TGACTTTTCACGTGTTGCAATGTTCAACAATCATTCTATACCTTGTGAAG GAGCTACTTCTGTACAAAAGCAACAAAATCGTTAGACATCTAGTAACCTT ATTTTAGCATTCCTTTAATCTTTTTACAGGGATATTCTTCATTGGCTGTC GCACTAGCACTTCCTGAATCAGGTCGTTTGGTTGCTTGTGAAAGGGATGA CAGATGTCTAGAAGTTGCGAAGCGATACTATCGACTTGCTGGTGTTGCAC ACAAGGTGATTATTTTCAGCCTCTTGCTTTATGAGATTAGTTAATCAAAC AAATTAATTACATGATTTCCTATGTTTGTAGTTTACTTCTTGATCCTTGC TTATAATTTTTCAACTAACTGTATGTGATGTTTCAGTAATTTGGAGAACT TATCTTCGGGGTAATGTTAAAATTCTCAAGCATTTAGGAATAACTTCAGA GTTGGAGCTAAAAGTTACAATCTAACTTTTTTGAGTTTAACTTATTCCTA CTTTATGTACTATTTAGTTTACATTTATGTTCTTTGATTTGTTTAAACTT GTACTGACTTATGTTGCCCACTATAGTTTACCTGATACAGGATCTAATTG GTGTAGGATTAACCAATAAGTATTAACTTCTTAATGATTTTGAATCACCT ACCTAACATAATTCTCCCTTCTTTGGAATCCCCTAGAATGTATAGCACAC TATATGCTAGTACCAATCTGTATCCTTGTTTACCGGATTTTCAATACTTG TTTGTCTAAAAATGCTTAGGTTGATGTCAAGCACGCTTTAGCTGTGGATT CCCTGAAGTCATTGCTTGAATCTGGTGAAGCTTCCAGGTATAATAATTAT CGTATGGTATAATCCAGCATTAAATTACTTGATCTATTGCATGTTCTAAC TAATCATTTCTTTTCATTTTTTTCTAGTTATGACTTTGCGTTTGTTGATG CAGACAAGAAAATGTACGAGGAATATTTTGAACTTCTACTTAAGCTAGTA AGATTATTAACTTGCAGTTTACTTTGAGTTCGCTTCTACTCATCTATAAT GCATGTGGTCTTTCAGCTTATACCATAGCGTTCTCTCAAATATTGTGGAA GCTTCCCCATAGCTGGACAGCTATTATGATTGTAGTTATAATTCTGTACA TAGTGATTGTTAAATTTATTGTGCCTATTGGATAAGTTTTATTGTTTCTT GTGTTCCAGGTAAGAGTTGGTGGTTTAATTGTAATGGACAATGTTCTGTG GTACGGAAGGGTTGCTGACCCTCTAGTAAGTTATTTTTCCCTTTTTTTTG TTTGCTTTGACATGATAAACATGTTAGGGCAGATATTAGACTAGATAGCA TGGCTGTCATTTTTACATAGGTGAATGACTCAAAGACAGTCAGCATAAGG AACTTCAATAAGAAGCTTTTGGAGGATGAACGTGTCAATATCAGCATGGT ACCTTCCTTTCTCCACCTCTCATGTGTGTGTTTATTAGTCACTGCTTGCA AATGGTGATTGGAAGCCTTGAAGTACCTTTTAAGTCTGCACTTTGATCTG TTGTTTAGAACAAGTGAGTACCTGCAAGCATGTGTGCCAGTAGTGCAGTG TCAGCACAGTACATAACAAAACATAAGAAATTTATTTGCCTAGGCATATT TGAATCAGCAGTCATACCTTGAGGACCTTAGGATTTAGTTTAAAGTTGAG GTAAATCTCAATTTTTCACAAAGAAATCCCTCATCTAAACACCCCCTTAA TTGTGTTGGGTTCTGGAGTTGTCTTCAGTTTTCACTATATTTATATTTAT TCGGCTGCTTCAAAATCTAATTTTATATTCTTATACCATGATTCAGTGCA TCATATCCTAGCCGTGCATTCTAGTATTGATCTTAGTTAACACTAATATT GGATTATTGAGGGGTTTGCAGGTGCCAATTGGGGATGGAATGACAATTTG TCGGAAGCTAGAAGAGGATTGACTTTGCTTTTGCGAAGCTCAAGTTCTCC AAACTGGTTAGAGGCATTCAGGTAGCGATGGCAGCTTGGATGACTGTCTT GAAGAGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAG CAAATGTATCTGGGTTCACTTGGGTTTGGAGTGAATCTACACACTAAAAA GTCTAGATACATTATCTTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACG GAGGGAGTACTAACCACCTTGGACGCAAGGAGGAAACAGAAACTTCGTCA GGTCGTCCATTTCCACATGGCGGAAATAAAACATTGACACACCAGAGCTG ATAGTGTCGCTCAGCAGCTACTAACATGAACATGAAGCAGACACAGGAGT GCTGTGGTCTTGGATTGACGGATTCACATCTGTTTTCGCTCTGTGGCTTT GATTTTGTTTCTTTAACAGCAGGCCCTGTACACGCAAGCAGATAGTATCA TGTTATCACTAGATATTCACGCTTTGACGATGGGCATGTTAGATTTTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.