Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE023990

[Submit comment/correction]

Sequence
AE023990
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE023990
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAACGAACGAACCACGACCCATTCCTGTCACCTCCCCAATCAAATCGCGA
ACCACACAAAAAATTTCCCACGGAGAAATCGCGACCTCTCCGCTCCGATC
CGGCGCGATGGATCGCTCGTCGTCGCGGCCGGCGAGCCCGGGGTACGGGC
GGCGGGGCGTGTACGCGCAGCAGCACAGCCACGGCGCCAGCAGCGCGCAG
ACGTCGCCGGGCGGGTCCCCGACGTCGTCGCCCGTGCACCGCCACTCGCG
CTCGGGGTCTCTCGGCGGAACCGGGTCCAACTCACGCCGGGGGGCGGCGG
CGGCCGCCGCCGCGCGGAACAGCTCCTCGCGCGTCGCCGCGCAGCGCCTC
GCGCGCGTCATGGGCGGCGGCGGGGGAGGGGACGCAGGGAGCGGCAGCGA
AGACGAAGAGTACGAGCTCTCCGGCCCGCCCATCGAGCTCTCCACCACCC
CGCGCCGCCCCGCCAACCGCTCCCCTTCCCCCTCGGTAACATCACGATTC
CCCCACATTCACACATGGATTCAATTAATGCCACTTCCTAATTGGCATTT
TTCGTCGAATCAAATGGCTGTCAATGTGTGATTTCCTGGATCAATTTCCA
CTTGCTAGTCATATACTAATAAAAAAATTGGATGAATTTCGATTTTCCAT
TGTTACTCTTCAAAATTTTGGATGAATTGCGGATTATTTGCTACTGCTAC
TTCTTAAAATTTTGTCACCCTGTTGATGTACTAAGGGGTTGCATGCAAAC
GTGTGCATTTTAGATAGGTCGTTACCTTGCGGATCAGACGTCGGTGAGCC
GGCCGCCCTCGTTGACAAACCGGTATGTGCCTGGGAAGTCGGTTCCGATG
ATCCCGTCCATCAAGCAATCGAATCGGCCAGGGACGAGCGGGCCAGGGTC
TGAATCGTCCGCCCCAAGCCGAAGGGAGCAAAGGTCAGTATTTCCATGCT
TTGTAATTTGAGGAGGGGTCGCACACGGAAGATTCCCTACAAATTAACAG
CAGTGAATTACTTATGGTGTTGGCCCGTAGTTCGATAAGGGCTCACCGGC
ATAAAAGTTATGTTAAGTAAAATTGGATGAATTAATTAATTAATCAATAT
CAGGACTCATGCTTGTTACTTTATTAGTTTTATTGGTGGGTATACTTTAT
GTGTTAAGAGCATCTCCTCATCTCCCATACGGCGATCCGGCGCGGCCTGA
TTTTTGGGCCGTATGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGCCAGCGCCGT
CCCCCCATACAAAAAAATCATTTTTTTATCAAATCAACAACTAATTTAAA
CATGTTCTGTTCCCTCCGTCCGGAAATATAAGCCGTTTTAGCTTTGTGAA
TCGAATGTATATAGACATCTTTTAGTGTATAGGTTCATAGAGGTTCAGTG
TGAACCTATACACTAAAAAGTGTCTAGATATACTCATTTCACAAAGCTAA
AATGCAAATAAATAATTGAACATTCAGATTTATTACAAATTCATGAAATT
GAACAAACAATTCAAAATGTTCATCAAACAAAGGCAAGAAAATAAACAAA
CTAGCTGGCTCCTTTGAGCCTCCACAGATGCTCCACCAGATCATTCTGCA
GTTGGCTATGAGTATTTGTGTCTCGAACTTCCTGACGCCTAGCAAGAAAA
GTAGCAAATGCAGGTGGCACTTGGTGGTCAATATCTGCAAGAGGACCTCG
GCAAAAATATGGTTCAGTGTCAAACACTGGAGCCTCTCGCTCGCTCTCGA
TGATCATGTTGTGCAAGATCACATAGGCAGTCATGACCTCCCACATCTGA
TCTTTTGACCAGGTAAGGGCAGGGTACCTGACAATGGCAAATCGATCTTG
CAGCACACCGAATGCCCTCTCCACATCTTTCCTGCAAGCCTCCTCCAGGC
ACAAGCTTTGAGATTGTCTTCACAAATGTTGACCATCTTGGATAGATGCC
ATCTGCCAAGTAGTAGCCCTTGTCATTCTGGTGGCCACTCTCGAAGTGCA
CTGGAGGAGCTCTTCCTTCAACAAGCTTGGCAAACACATTTGAACACTGC
AGCACGTTGATGTCATTGTGTGATCCTGCCATACCGAAGAAAGCATGCCA
AATCCATAAATCCCGATCTGCCACAGCCTCAAGCACCACACTGCATGATC
CTTTGTGACTTTTGTACATGCCCCGGTGCGCGAATGGATAGTTCTTCCAA
GCCCAATGCATATAGTCAATGCTTCCAAACATTCCTGGAAAATCTCTTGC
AGCATTCTGTTCCAAGATTCGAGTTGTGTCTTCTGCATTGGGTGTTCTTA
GGTATTTCTTCCCATACACTGCCACAATGGCCCTGCAAAATCTGTACATG
CAGTCGGTGGCTGTTGACTCTGCCATGCGGAGGTAGTCGTCCTGTGTGTC
TCTAGCAACTCCATATGCAAGCATCCGGAGAGCAATTGTGCATTTTTGGA
TTGTGGAGAAACCAAGCGTGCCGACAGCATCTCTCTTCAGTTTGAAGTAG
TCGTCGAACTCTCTTAATTCCTCGACAATCTTCAGGAAAAGCTTCCAGCA
CATTCTGAAGTGGCACCGAAATGTGACGTCGTCGTGCAATGGGTCGTCGG
CGAAGTAGTCGGCGTAGAGCATGCAGTAGCCTTCCATCCTCTGTCTTGGT
TTGCTCTTGCGCCGCCCAGGCTATGAACCCCCAGCAGGCGGCTTCTCATC
GGCGCCGACGATCATGCTCAGGAGGGACGTGACGATCAGGAGATGATCGT
CGTCACCAACACTGTCTCGGACGGCAGCAGCAACGGCGACTTCATCGTCC
AACAGAGCGGCCAACATCTCTTCCTCGTCCGAATCCATGCCTTCGGCAAA
CCGCCGAACACCTCGTGGGCAGGGCGGTTGTGCGGCGAGCTCGGGGCTAC
CGGCGGCCGTCGAGCCGGGCAGATAGTGAGTGCGAGCGGACAGGAGGGTT
GGGGGGAGTATTCTTGGTGGTTGCGGCGGCGACACTAGCGGGCTGAACGG
CGGATGGCGGCGAGGGGTATCGAGTGGTGGCAGCGGGCGGAAGGGAGGGT
GGGTGGGTGAGAACGCGGCATGTGGGTGGCTTTCGCAGGTGTGTCTCACT
GCCAGGGCTGGCCCACGTCGTTTTTAGCTCCATCCGGCGCCCCCGGTAGC
CCCCCCGTGGGTTGGGTTCGGCCTGGGGGCGCCGGATGTCAAACCGGGCC
GCCCTGGCGCGAAAATAAATTTGGGGGGCTGGGCTGAGCGTGATTTTGGG
TGCCGGCACCCCCCATAGCCCTTTAGGGGGGGGGGGGGCTTTAGGGGCCC
CGAGTGGAGATGCTCTAACTACTATCTTGCATCTCCTATGATATGTAATT
ATTGAAAGGATTGATTTTTTTTGGAGATTTTTGCTATATCACCAAGACCT
TGGGAATACATAGCACATGTCACAATTTCTGCATTGAGGGTTATCGGAAG
GGCCACCTCCTAGATTGTGTAAAAGCTTAAACATTGCTTGATATGGAGAT
GGTCTACCAAATTCACAAACATGCTATGCTTGGGGGCTAAATCCAATGGA
ATAAAGGTAGAATATAATCAAAAACGAAGTGGAGTTTTTGTTTTTTTAAA
ACATAATTTGTATAGACTTTAGAAAGAACAGCCAGGAGAATGTTTTAATG
CACAAATGTCACAGGAACAATATATGAAAATAATCGACTAAATTACACTT
AATTTACGAAAACAAAGAAAAGATTCTACAAAAATGGAGACAAGGGTTAA
ATAAGGGATACAGTCCAGTTACATACAAGTGTGCTCATTATACTTTTGTG
ACATCCATTTCTGAAGTTACTTTTCTACCTCATTAACTACTTGTTACCTT
TCATATATCATTTCTTGTATCCCACCACCAATCAGCTGTCTTGTAAAACT
GAACTCTTCTTTGCAATGAAATGAAACGCAATGTCATTGCGTTTTCCCGA
AAAAAATATTATTTCTTTATAATCACATGGTAAGTAATATAGGCTACATC
ATCCTTAGGAGATCAGTTGATCTTGGAAGCTCGTTGAGAGGACGTCGCTC
TTCTTCTTCACTTAATGATGAGGTAATTCATGTCATGAAAAACACTTCTG
TTAGAAATAATAATGATTGTATGTCCAGGACGTTATATGTTTTTTCCCAA
GAAAGAGCAAAAATTGAGCATCTTGGTGCATTGTTAAAAATATAAATATG
TATATAATATTTTCTACTCTAGGTTGCCCAACATTTTTTTTTGCTCTACT
GTATGCTAAAAATCATCGTCCAACCAATATGATATGGATGCTGTATGTAC
ATTCCTTCACCTTAAGATCAATTTCTATATTATTATATGGAACACTCCTG
TGATTCTTGGATGCCACCCTTGCAGCTTAACACACTTCAAATGGAAAATG
ATAGCATGTACGACAAGGTGAGATAAAATTACGATTTTGAATTTTACTTC
TTGCTGGAAGCACTCAACATCCCTGTTATGCTGAATGCATCTTCCCAGCT
TCAGCTTGAAGACGATAGATATGATGAAGCAGATGTCAAGTCCATGAACC
TGGAGAGACAGGTTAATGTCTGTCATTAATAAATGCTGAATTTATTATAC
TGAGTTCTTTTCTAGTTGAGTAGCTGGTTTAATCCTACTGTACTTTTATT
TTAGTTTTTGCCATAGAGGCTAGTACTACGTCTTCATAATCTATTTGGAG
ATTTTTGCATGCCTCTGTCACATTTGAGTTTATCTTTTACATTCGAGCAG
AATTAAGATCTAAAGACAAAACTTCCAGATTTGCCTTCTACTGCTCAAGA
GTAACTATACTATTTGTCCCTTTAACTTAATTGTGCTCTAATAAGTAAAT
AAAATAACTTAAAAAACCAGATGCTTCAAATGGAGAGGAGGGATTTTTTT
TTCCCTATTCAACAGACCTATCAGGCCAATATCTGTACAACGACTGAAGA
CCAAGTTTCAGTCCTACTCCTTGATCCACTAAAAACCAAATATGCAGACT
CATTGGCTCAGTTTCTAAATTCTAGAAGCCGTTTGCGTCAGTATGTTGGC
ACTCATTTTGTGTTATATCCATGTTTTGTGCCAATCGATCTTTGCTATTT
GAATTTCAGGGTTCTGTTATTGGTGATGCTGTAGAACCAGAGTTCGCTTT
GATTAGCAGGTATGTGATTTACTAAAAAGCACCTTTTCCTTTTAACTATT
TTTTTTCATATTTTAAACCATGTTTCCGTCTTGACTTTCAGAAGGGCTAT
ATCACTAGAACAGAGAAAGGTATTTTTCTATACCAAGCTTCTCCTGCTCA
ACGTTGCGCAGATACTAAAAGTGAAAGTTTATTTTGGTTTTAGTCCCATT
TTGTGCTTCGATGTGGTGCTTTAGGTGCATATAATGATCCTCCAAAGCTC
TTGTTTCTTGATGGTCAATATTTTGATCTTTTTAAGGAATAAATATATTC
TCCCCACAACTGGCTGCTTGCTTCTTGGGAAAATTTCAGAACTGTAGCTC
TGTATGCCAATCAATGGCTGACTGGGGCAATCAGCCAAGGGGGAGTTGTA
TGAAGGAGACATAGCTAGGATTATGGGAGGCCGGGAGATTGCCGCCAGAC
AGCACTATCCACTCAACTCCCGCACTCCACGTGCCACACGGGTCTGTCGA
CTACTGGAGGCAGAGTCAGTCCCCATCGGTTCATTTTCCCCATGATTAAC
CCTTTGATAGGCCGACTGCATCCCCACAGTCAGCCCTTGGTTGTTGGCCT
ACAGGAATTTTCTTCATCTCATAAAACCAAGTTAGAAATTATGAGCGAAA
ATAACTAAAAAATACTAAGATTTTTCTTTCTAACTCTTTCTGAACTTGAG
ATTTGTTTTCTCTTAGGCTTCAATGAGAATGGTTGGAAGAAGGGGTAACA
GTGCAAGCTGTGATGAGATTACAGCCCTTCGATCAGAAGCAAAGGTGAAT
AGTTTACCAAATGTGGTTACTGGTTCCTGAATGAGTTTTCCAGAGTCATG
CTTTGCAAGCCTAAAATTTTATTTACACTGTTGGTAGGTTGCTAACGAGT
TGGTGACATCTGTATCTCGACGTGTAAAAGGTGCTGGATCAGAACTGAGA
TCTCTTCATGCAACATCCAACAGAATGATGCTGTCACAAGAAGAAATGGT
GTGTAGCCTATTCATATTCTGGCACTTAGTTGTTTTTAGATCTATTGCAT
TTCATGAAAATCCTTTATCAGGAGGAGGTGGTGCTAAAGAGATGTTGGCT
CGCGCGCTACTGGAAATTATCTGTTAGACTTGGTACTGAGATATTCTTCC
TGTAATGTACAGTCTAATTAATTTCTTGAATTTCTCTAGTTGTTCTATTG
TAGCACAAAAAGTATCAGGGAAGCAATCTGTCAAACCATAAACAGGAAAT
CTCCTCCGTTGTAATTGTTGACATTAAGAAACTAAGGCCTCAGGGATGCA
TTGTTTACCTTGCTTGTTCTTTTCATTCAAATTCACAAGCTAATGTTGCC
ATAAACATTTCACGTAGTTTGTCTTTTAAAGAGTGTGTCCTCTAGCACTA
TCTTCTGTTTTCAAGTGAATTTTGTTTAGTTATTCATGGCCATATTTGTT
CAGTACTTGTCTGTAGTAACTCTTTATGAGAGAAAGTGTCTCATCCATAA
ATGTGCAGTAGAGTGTTCAAAAACATATGATGCTAAAAGTGTTAGAATGG
TTGGCTAATGCAAAAGTGTCTATCTTAGGGATACATTCTGATATCGCTGA
GCAAAAACTAGAACACTGGTCCTCAGTTGCACCACTTGCACTTGAAGTTG
TCCTATCAATTGGACAAAAGGCTAGAGATGGAAGTTTATCAGGTCAGAAT
CCCTTTCAAAATCCATCTTTTGGTCTCTTTTATGATTATTTTATTACCAT
GAAGCTGTTTATACAAGCTTCTAACGTTTAGATTACTCTACATTATGCCG
TGACACATGGAGGTGAAGGCCAGATTGTCATGGCATGATATAACATGTAT
AATATGAAAGTCCCTGTAAGGATTCTGATGCGCAGATAAAAATGAAACTG
GAAAGGACATAATAAATCAGTGTGGCTTAAAGTTTGACATTATCTATTTT
GTTGCCACAGAAGATATGGATTTTCCCTTAGCATTTTGTACATGCAACTA
AAAAATGAGTTCTAAATAGTACAATTTTCCTTAGGGAAGTAAGTTACTCC
TACTTACATTTTCCCCATAGGTGCAAAAGATCTCATCTGGAGGGTTTAAT
ATATTTCTGACCTTTTTAAAGTGACGTCGAAGGAGATCATCTTTTACTTG
TACCAGAGAGGTTAATATATCACAATTTCAATCACATCACTTCTGTTCTT
GTTTTGGTCATGTGGTAGCAGATAATGACGTAAATGATACGGCTGGAGAT
GGAAATATTGAGAGCATGCTTCTAGTTGAGAAAGGACTGCGTGAATTAGC
TTCCCTCAAGGTGTTTCTCAATACTTTCTCAGTTTGATGCTGGTCGCAAT
CTATAAGTTTCTTTCAGAGGCATGTCCCAACTGATCAAGTTTGATGAGAT
TCATAGCAGTTAATAAACAAAATTATGTTTGATAGTGTATAGGTTGCTGT
TGCAACTTCTAAGATGAAAGTTATCTTCTGTCAATTCATGTTGATCTAGT
TCATCGTTTTGACTATTTTCTTAATCACTTCAGTGAAACAGAAAGTAATT
GATGCATCATATCGAATCTACTTGGTTACAACAGAAAGTGGAGTGTCAAA
CTTCAGAGTCCTGTAACTATTAGAGTTACTACTTTGTGTCATTGTGAAGT
ACTTAGTACATCCAGTATGTGTCACTGAATTTGCTTTCACATATTCTCAT
AAAATAAGAAATCTGTATTATGTCTCTAATTTCTGTTGCGGAAGCAATAA
TCTAATGTTTCCTTTGAAGGTAGAAGATGCAATCATGCTTGCTTTAGCAG
AACATCGACGTGTCAGACCTCTCTCAGGTGGCTTCTCCAAAATGTACTCA
TTTCTTATACTTTTATCTTCAATATTTTATTGTATGAAGTGTCTACTAAG
ATAAACTCATAAGAGTTCCAAAAAGACTCCAAGACTCTAGGTGGTGGTGT
TAACAATTTGGCAATACATTGCATCTGTTGGGCACCCAAGCACCAATTTT
GTCAGATTCCTAATGGTACAGCAAGCTGACAAGTGACAATGCATATAACA
CGAGGGTAAAAACACGCAGTTACAGTCTCCTGATATAATTGATGCATCTG
AAAATTATTTCAGGAAAAATACTGGAAAAAACTATGTAGTTGTTTAGTTC
AATAATATTTGTTTGTATTCGAGAATTGCAGGAATTTGTCACTTCGTTGG
GGTGGTTAGAGCTGGTTCCTAGAATCAACCTTGCCAAGTCACCTGTCCTT
CTGCAAATTCATGCTGCTAAATGGACTTGATGGCATTGGACAAATATGTT
TAACCATTTTTATGATGACTAAGCTTCCTTTTGCAGGCCCAGTTTATCCT
GCTGAAAGTCATAGCTCTTCAGAGTCACTCGGTTAGTTCATGCCTTCACT
AATTTTCATGTGGCACCTATGACCTGCGAAAAACACTACTCCTATATCAA
TTGCCTTTCCTAACACCTGTCATTTTTCCTAGAGTTAAGTGAGGAAGAGC
GAGAAGATGTACGCTTCAAGCAGGTAAAAACACAATCTGTCATCCATGCA
ATGTGTTCAGATAATTTTCTAGAGATTAACCGGAATTAGTATTACTCCCT
CCGTCTCAAAATAGATGTCGCAGATTTGTCGAAATTTTGATGAATCTAGA
CACTATTTAGTAATATAGATACATCCATTTTTTTACAAATTTCCGACATC
GATTTTGAGACGGAGGGAGTATCTGGTTTTATGCGTGTCAAAGTTAAAAC
ATGATCAATTAAGCTTGTCATAGGAAAATGTGAGCTAAGCATTATATGGA
AACTCATACTTCCTCCGGTCCTAATTAATGTTCTCAGATTTGTCTAGATT
CGGATGTATCTAGCACTAAAACATGACTAGATACGTCCGAATCTAGACAA
ATCTAAGAATATTAATTAGGATAGGAGGGAGTATATGTATTCATGTTCCT
CTGGTGCGTGTCTTGGTGCTCGTCAGTGTTCCATTTGTTTTGACTTCGAG
TAAATGTTATGTCGAAGAACTAACGATTATGCGACAGGCATGGTTGACAT
ACTTTTGGAGGCGGGCCAAAAATCATGATGTAGAGGAAGATATAGCTGAC
GATCGGCTACAGTTTTGGATAGAGCAAGGCAATCATCCAATTACTGCAAG
TGATGTCATTGAAGGTAACCTCCTTTCCTTTACAATTAAGATCAGGGTAA
TCTTCTGCACAATCGACAATTTTACAGCTTTCATGACATGTTCTACACAA
AGAAAACATGACTATTTTGTTTTGTTCTGAAACCATGATAAGAAGTACCA
TGACCTTGCAATCTTTTTTCCTTTATCTTAGTCCATCACCTTGCTAAACA
CTAGTAGTTGTACTAATGTGTTGTTGAAAACCATAATCATGTTTTTTTTT
CTTATTTTGGTAAACTATGTAAAAAAGTTGATAGAGGACTTCATGAGCTG
AAGAAGCTGGGGGTTGAGTCTCAGCTGTGGGAAGCGACGAGGAGATCTCT
TGACGATGATTTCAGTAATCATGGGAGTCCATTTGGATCTGAAGTGTAGT
CAGCAAATAATCGGAAGGAGGCCTAGTGCCAATTTTGCGCTGTCACAGGC
CCTAGAGCTCCTCTTCATTTTGTTTTGCAGTTTACGGTTTCTCTTCCAGC
ACTTCATGTAGATTTTCTGATCAGCACAAGAGATGATTCTGTCTTCTAGG
CCCTTTTTCTTTACCTTAATGTATTGTGTCAAAGCAGAAGTGATTAATTC
TGGAACCTTCGAGAGATTAATTCAAGACGTTGTGTTGTCCAATTGTGTGT
TGTGCACCAACAAGATATATACGTACATGCCACTTATTGTGTCGATAACA
CATAGGCCCGGATCCACCTTGTCGTGGACACAAGGCGATTTGGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.