Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE012490

[Submit comment/correction]

Sequence
AE012490
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE012490
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAACTTGGGCTGCTCGGTCCGGTCACCCCCATGGAAACTCCGCCCCACA
ACCCCATCTCGCCCCCCTCCCCGCCTCCGGCCGCCGATGGCTCCCCGGCA
GCCGACGCTGGGGCGGACGGAGAGGATGCGAACGGAGGATTCAGCGCGGG
GATGGAATCCCTGTGGTCGCTCCTCTTCGGCACCCCGGAGGAGCTGGAGC
CCATGTGGTCGCCGCCCAGGGGATTCGACGTCGGCGCCGAGTTCGCCGCA
GCTGTGGCGGACCCCGAGCCCCTGGGGGACGACGGAGGAGGCCCCTGGGA
CGGCGCCGCGTGGAGGTCAACGGGGCTCGTCGCAGGCGAGGGCTCGACGC
GGGCGCCATCACCACCCACCGCTGCGCCGGGCTTCGCGGAGTTTGAGCTC
CTCGCGTCTGATTCTTCGGAAGGCGCTCCAGAGGTGAGGCCGCTCGATGA
TTACTCACCTATGCCGGAATCCCCGTCTACTCCGGTTGCTGTAGACATGC
GGGAAAAGCTCGTATTCATCTCCGACTCCGTGCCGGTGCTGCCATCACCA
CAGGCGTCTTGTTTGGAAGCTAATTTAGAGGAGAGTGCACCGGCGTGCAT
GCTGAACACCATGCCATCTCCTCCTGTACCTTTCGAGGATGATGCCGATT
TGGAGGCAGAGGACGATCCCAAGTATTGCTCTCCTTCAGACAAAATTGCC
TCAGTAAGCATGTCTGCTGTTGATTTGAACGCTATTGCCCCAGCAAGCAT
GTCTGCTGTTGATTTGAATACAGAGTATGACCCCGAGTCCAATGCCTATG
GCTGCGGTACCTCAGGTGCCATCAGTGCAGATGCCACATCTCTTTGGGGT
TCACAGAGGATTGCGGCGACCACAGTGGCAGCATATGCTACACCTCTAGA
ATCGAATGAATACTTATTTAGAGCTTCCAAGACCGCAGTGGCAGCAAATG
CCGCACCTCCAGAATCGAATGAATACTCGTTTAGAGCTTCCAAGACCACA
GCGGCAGCAAATGTCACACCTCTAGAATCGAATGAATACTCATTTAGAGC
TTCCAAGCGGCGCTCTGTGGATTTAGGGTTGGCAAGAAGTAGTGCAACGA
ACAATCTTGCTATATCCATGATTAAGCCGATCAAAGAGACCACCACTACT
GCACCAGACACAGTTGGGAAGTTGGTCAAAGGGATCACTACTACTGCACC
AGACACTGTTAGTAAGCCGATCAAAGAGAACACCACTACTGCACCAGACA
CAGTTGGTAAGCTGATCAAAGAGTCTGCCACTACTGCACCAGAGACAGTT
GATAAGCCGATCAAAGAGACCACCACTACTGCACCAGACACAGTTGGTAA
GCCAATCAAAGAGTCCACCACTACAGCACCAGACACAGTGGGTAAGTCGA
TCAAAGAGACCACCACTACTGGACCAAACACAGTTGACTTACCCAACAGG
ATGAAGCGGCAAGGATCGCCAGATATTGTTAAGACGCAAAGCACCTCCAG
TGGCAATGAGAACAAAGGAGGTGGTCGCAGCTATCAGGTTGTGGTGGCTT
TACCAGCGGTGAATTATAGGTCCATAAAGCGGGGAGGAGTATCTGTTCGT
GCCCTAAAGAAAACTAGGACCACTTCAAAGGCGTCATCGGTGGATTCAGG
CAGATTACCACCTATTTCGCCAGTGGTAAACAGTGAACCTCCAATGCATA
AAGCAGAGTCTTATTCGCATGTACCACCTAACAAGTGTGATCTTGACACT
GGGAAAAACTTGCCATCAGAGAGAGTGGATAATACTGGTGTTGTACCGTG
CAATGCTGGGGAGTCGCAAGTTGCCAGTGAGATGCCCAAAGAGCCAGATG
GAAAACTTTCTAGGCCTCTAAAGGCAAAGAGGATGAGAGGCTCGACAGGT
AAATGCTTGCCAAATTTGAAGAGGACAAAGAAAAATAGTGGCTCAGTTTG
CAAATCCCCAAGTGTCACAATGATGCCAGATCCGAGCAATAGTCCAGAAG
TTATATTGGATAAAAACTTGGTTGATTCAGAGATGGTGGAAAGTAATGAT
GGATCCTGTTGTTTTGTGGGGGAGGCAGTGCCGGAGCAGGAGGCTAGGAA
GAGGTGGCCTCACCGCTACGAGAAGAATCATCACTTTGTGGAGAAGGTAG
GCATTTGGCTCCACTGTCTGCTCTTTGCATGGCTGCATCGTCATATAAAT
GATATAAGAATGACTGAATGCAATTATTTTTGAGAAACATAAGAACAAGA
TATTTGTTCGGTACTTGGGTAGATTGACTGAGAATACATAAATAGTTCTG
ATGGAATTTTAGGCCTATATTCATGTGCTCATTCAGCAGTACACAACCAC
AAATATAACAACACAGTGCTGCATGCCATGCATTACCTTCCTAGCAAAAA
TATACAAGCATGTAGGAAACATCAGAATTCAGAAGGCACACATGTCAGAT
GGGCATACATGTTAGAAGTACATGATGGGTAGTAGCAAGTGACAACATAT
AGTAAAGATAGGCATTAATGCTAGAGATTTATATAGTTTCCATATTAGCT
GTATAATATCCGTGTTTATGAGGTTTTTCCTGCATGTTTACCACACCTGT
ATGTGTATATACATTGGCCCAGGGCCTCATGAGAGTACAAATTGTGTCCC
TAAAAGTTAACACCCTGAAATCTCTGCTCCTTACATCAATATAATCATGT
AGTTATCTATCGATGTCAATCATTTTTTGTGCTCCACTTTACCTTATGAT
TATATCTGTAGATGATATTCCAGCTATTTAGTCCAATGTGCACTATGGAA
ATTGGAAGCCATCATGCCTTTGAAACAGAAAGTAGTTTTAATTTCAAACC
CAGAAGATGGACCCTTGATCACTCCTTTTGCAAGTCTTCATCTTTTATGC
AGCTAGGGACGCATGAGTTACATATAAGTTTGGACAATTGTTCGAACGAA
TGGACAGTGAATTTAATATGATAAGATAAGCAAACAAAGTTCTTAAATCA
GGATAGACATCACTAGTGAGGTTGATTAGATTTAGATGATGATTCAGCCC
AATTTTTACCTATTGAATATAACAAGAAACAATCTTTGCATTTTCCTGGG
AAAAAATTTGAATGGTTGACTTGTGTTAAAGGAAACACAGAATCACAGGA
GAAATTGTATGAAAAAACAGGAAGCAACTAACCATTTCTCTGTGTGCATA
ATAGTGACATGTTTGCTACATAGTTTACAGCTTCTTATATGATATCTGTA
GTTCATGTATTCTTATATGAAATTTATTATTCTTGTACTAGTACATACTA
CAAGTGTATTGAGTCTACCTTATGTTCGACTTGTAACAATTGAGTTGTAT
GCAAGTAACGTTTTGTGCCTGTGGTTTCTTTCTTTGAAGGATAAGAGGAG
CGATATCCAACCGCTTGCAAAGTGAGCAAAAATGCATTGTCCTTTTTTGC
TTTATGGATAATTGAGTTACTCCTGTTACTAGGCTAACAGCTGCATACCT
TGCATTACAGTGCTAGCAATGCTGTCTTGGAGGTTAAATGCCACTATTTG
CAAGCCAGCATATCTGGATCTACTTTTTGCATTGGAGATTGTGCATTTGT
GAAAGTGAGTTAAGATTTCTATGTTAATCTTTCTTCTATGCATCCTTATG
GCTCATTTCTCTTCATGTGTATGGCTTTTTAACTCAATAAATGTTCCAAA
CAAGTTATTATGGCTTTTTAACTCATTGAATGTTCCAAACAAGTTATTTT
GAAAAACTACTCATTGATCAATCTAATATATCCTTTTATCATTTTTGAGT
CTTGTATCTCAGTGATGAGCATTTTTTTACAGAATCTTTTTCTATGTTCA
TCTAGAACTGATGCCTGACTACGAAGTATAGTTAACATGAATTTGCTGTT
TAGGTTTATCAAAGTACTCCCTCCATCCTAAAAAGGATGTCTCAAGTTTG
TTTGAATTTGGATGTATCTATATACTAAATAGTGTCTAGATACATCCAAG
TTTAGATAAACTTGAGACATCCTTTTTGAGACGGAGGGAGTAATATTTAC
CATCCTATCAAACACTTTATTGTTGCACCACCCTAACAGGGTTAATTTTG
TGCAGGGTCCAGAAGGAAAACCAAATTACATAAGCAGGATACTAGAGCTC
TTTGAAACAGTTGCTGGTGAATGTTACTGCAGAGTGCAATGGTTTTTCAG
AGCTGAAGACACGGTAAGTTATGTTGTCCTTGCTGTTTGACTGAGAACTA
TGCATGTCTTAAGAACCATTTTCATCTATAACTATGAAACCTTGTAATGA
AGTTTATTTTAGGATCTCTAACCATGCTTTCGACTTCTTATTCGATCTCA
GATCATGGAAGACCAAGCACAGTCTCATGACCCAAGGCGGCTCTTTTACT
CAGATTTGAAGGATGATAATGCACTAGACTGTATTGTCTCCAAAATTTCA
ATTGTGCAAGTTTCTCCGTGTGTATGGCTTCATCTTGCAGCTTAGATACT
TCTTTTGTAATGACTGGTTTGCTGAGATTTGTTCAGTGAGAAGTCTAATT
TTTTATTTATGTTATAGGTTGATAAAAATTCAGAGTCAATTCCTTCATCC
CACTATTACTATGACATGAAGTACTCTCTGGACTACAGTACATTCTCTAC
CTTGGAAATGGGTCTGTGTTCTCAAACAACAGTGATACATATTTGGCTAT
ACTCCGAATGCAAGAGACCGGAAATGCTTTATACTGCCAACCAATCATGA
CTTAGATTTGAAAGCTGCTCTCAACATTTTGCATTTGTTCCAAGTTCAGA
TTTATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATCATGCTG
GATTGCTGGTCATAGTTTCTGAAATTTGAAAATATATGGTTTGTAATTTC
ATATTGTGTAGTTTTTGTTGTATCATCTGTTCTATTGTTGTTATGAGCTT
ATCTCAGTATTCTTACTTTGTTTCACGCAATGCAGGAGATATGCATGCCA
AATTGCAGTCGAGTCACGTAAGTAGTACCAGTATGAAAAAGGTAGACTTC
AGTAAGAAGCGAAACTCTCCTGTGCCGAATAAGAAGGATCTCTCTTTGTT
AGATCTTTACTGCGGCTGTGGTGGAATGTCAACTGGACTTTGTCTTGGGG
CTCATGGTGGTGGTGTGAATCTTGTGACGGTACTTCTCTTACACAGACAT
ATTATATGTGCTATAACTTAGTAAGAATGCATGCCCTTTAAATTTTATGC
TCATTGATTACAGAGGTGGGCTGTTGATAATGATGAAGTTGCATGTGAAA
GCTTCAGATTAAATCATCCAGAAACTCGGGTAATATGGCTTTCATCAGTT
CATGGCCCATGCTATATTTTCTTTCAAATGCTATTTCTGGCCCATTTATA
AACACTGACATGCTGCTAAATAGGTCCGGAACGAAGCTACCGATGATTTC
CTTGAATTGCTGAAAGAATGGCAAAAACTATGCAAACAATATGTGGGGCA
AAGTGAAGTAAAGGACCATGCTGACGCTTTAACAGACTCCAGTAATGGAA
TTCCAGATGATTCTACAGACCCTCCCGAAGAGCTTGAAGTATGGAAGCTA
GTTGATATTTGCTTTGGTGATCCCAATAATGTCAGAAAGCGGTGCCTATA
TTTTAAGGTTTGTAATAAAGTTTCCTCCTGTTTGTAAATTGTAGTAGAAG
CAACTGAATTACCTGTCAAATTTATCAGTGCAAGCAGAAATTCCAAATCC
CTAATTCCATTTGGATCGAATTAATAGGAGATTGCTCCTGCACAATTTTA
TTGTTGGAATAAACATGCCTCACTCGATTTAATCCAAACCAGGCTACATG
ATAACACTATAGGTCACTTTAGTCCCTATAAATAACACCCCACTATGGTT
ACTAGCTATTAAAGGAGGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GGCGTTGACTAGTTCTACTTCTGTAAAGGCCCATCAAATATTTGTGTTAA
TTCTCTTACCCATGACAGAACATATAAATGATTTCCTTGTGTGCATTCAG
GTTATCGAATAAGTTCACTCTTAACCCTGCAGCAAGCTCGTAGATCACAT
ACTTTTCTTCCTTTTGTTCATATATCGCTTTTATGCTGAACTAAATGTGT
TATTTTATTACGCAATATGCATGCAGGTCCGTTGGAAGGGTTATGGCCCT
AATGATGACACGTGGGAGCCAATTGAAGGATTAGGGTATGCAAAATTTAA
TCTTACCATGACGCGTTTCATGTGATATGAACAGTTCAATTTCTGAAATG
CAGGAACTGTGATGAGGCAATTAGGGATTTCGTTATTGAGGGTCATAAGC
AGAAGATACTACCACTTCCTGTGAGTACTATTCTTCAAAGTCAGCTTTGG
TGAATTGAGTACACTTAGTATATGACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCACCTCACAAACACACAGAAAGGAATCTGAATGTAGATAAAAATCAAG
TCCAGTAGATTATGAAATCCAAAACTTCCAAAGAGTCCATCATATTTTTT
TACCTTCAGAGTAAATTCTGTAAAACAAGGAGATGCAAACTTAGAGGGTG
AAAAGTGAACCGCTCTGGATGTCTTGGTTGGTGCGACAAACATGTTGCAT
CAATGTCAGTAACAACCCTATAATGAGTCGAGGGTGAAAAGTGAACGGAT
TTGATACTTCAAGGTTGCAATAGCGACAGCTTGTGTCCTCCCCATTCAAT
CTGGACCATTTTTTAGTTGATAAACAGACTTGTACCATAATTCAGGGTTA
CAAAGGAAAACATTAAGATAAATATGATATATTATTTCTTTTAAATTGCA
CTTATATGATCGTTGAAATATATTGCCTGCCTTTCTCCATTAGTTCGAAC
TGTTAGGGGAACTGGCCGGTGCATGCAATTCAATATGGTTTCATAGCCAA
GCGGTCTCGAGTTCAAGACTTGGCCAATGAAGTATTTAATTAAAACATTT
GCGACCAGCGACCTACATCGATTTCACGTCTAAGGCCTGATGGAGCCTAG
ATGTGAGGAGTGCTGAAATATATTGCCCGCCCTTCTCCATCAGTTCAAAC
TTTTTGGTGAAATGGCTGGTGCATCCAATTCAATAATCACATCACAATAT
TATAATTCTTGTGGTACTCAGGCCCAGTTAGTGAATCAAATGTATCTATG
AAAAATTCTTTCTTTCTCATAAATACCGAATAGTTAATGTTTCTTTTCAT
AATTTTTTTGTGTATTTTTAGGGTGATGTTGATGTCGTATGTGGCGGTCC
ACCATGCCAAGGCATTAGTGGCTACAACCGCAATAGAGAATTCGATGCAC
CGTTTAAGTGTGAGAAAAACAAGCAGATTATTGTCTTTATGGATGTCATG
CAATTTTTGAGGCCCAAATACGTCTACATGGAAAACGTCCTTGATATATT
GAAGTTTGCTGACGCAACACTTGCAAGATATGCTTTAAGTCGCCTAATTG
CTATGCATTACCAAGCCAAACTAGGGATCATGGCTGCTGGATGTTATGGC
CTTCCACAATTTCGGATGCGTGTATTTTTATTGGGCTGTCCTCCTGATGA
GGCAAGTACGACCTTTTCTTGTATTTTCTTAATTGGAAAACTACAAGAGT
GAGCCTTACTGGAAAAATCATCTTCTGATATTGGTGAATTCCTTTGATGT
TACCTTATTACCATTTTTACTCTGTAGAAACTGCCCCCATTTCCTCTGCC
TACACATGAAGCGATTGTCAAGAATGGTTGCCCGTTGGCTTTTGAGGTAA
ATGTTAACTGCCTGGATTTGGTTTCTGATTAAAAATACCGTATTCCCACA
TTAGACAAACATTTGTTTGGAAGGGTGGCAGTTCATTATTTCTATCTCAC
ATTATCATCCTGTCAAAAGTCAGAACATGCTTTCTCTTGCATTCTTGCTG
CATTGTATATTACACTCATTTTGGCTGTTTTGCTTATCCATCATCTGGGA
ATTTCCACCTGTTGATGCAGAGTATTCTTTGACCACTAGTGTAATCGTGA
CAATTTTTTTTTTATCTTGTAGCGTAATTTGGTTGGGTGGTCTGACAGCA
CGAGAGTGCAACTAGCGAAGCCAATTGTCCTTGAAGACATTCTTTCAGAT
CTTCCAAAAGTAATTGACAATCTTAGAGATCTTAAACCTCTATTTTGATA
ACCTCTTGGTTCATAAGCTGGTGTACACCTTTGTTAGGTGGGAAACGAGG
AAGGTCGTGATGAAATGCCATATGTAAAGGGCCCTCAAACAGAATACCAA
AGATACATTCGAACATTTAATTCTGGTGGGTCCTTAAACTTTAATGTTCT
TCTATGCTTTGTAGTTTTGTCATTCCCGACACCATATGGGGCCAGCACTT
TGTGTGCTCAGTGTTAGGACAGAAAACTGAGGGAAGGCAGCATTAGGTAG
CCTCGCGGTTTCCTTTCTTGAGTTTCAACTCGGTTATTTAGTTGCCAAAG
ATACGAGTTGTTAGGAAAGTCTGATGCGACTTGAGGGTCAAGTCGAGATC
CACTACCCCATGGTACACAGCCATCCCCGAACGACTACGCTCTCAGGAGC
TTAGGTCATGACCAGTTGGGGGAAAGCAGGTGGCAGGGGTGTATTGCATA
GAACAGAATGTTCAGTACTAATGATGGGGAAAAGTCGGGGAAGATAGATA
ATGTTCACTTGAAAAAATATTGATAATGGAAGGTGGTGGTGAGAAGGGGC
AGGGGCGTATTGCATATAACAGAATGTTCAGTACTAATGGTGGGGAAAAG
TCAGGGAAGATAAATAATGTTCAGTTGAAAAAATATTGATAACGGAAGGT
GGTGGTGAGAAGGGTATTGTTTGTACCAGTAGTCTAGGGTTTGGGTGTGT
CCCTTGGAGTCCTACTACTCCCTCTGTCCAGAAATAAGTGACTTGAATTT
GTTTAGATTCACATGTATCTATACACTAAAACACGTCCAGATACATGCGA
ATCTAGACAAATTTAAGTCACTTATTTCCGGACGGAGGGATTATATATTT
GCCCTCTGGTTTGTTGAGTCCAAACAATATCCATTTGTCTTTCTCCAATA
TTGACATGTGGGACGTAATAAGCTAATATTAGAAGAATCAGATAATTTAC
TTGTTTTACTTCCTCTGTACTTTCGGTAATTTTACTTGGTACCACATCTT
TGTTGACCAAGTCTTTTCATGGTGCTTCATCATAATTGTGCCTGAAATTC
TCGCATAAATCTCTTCCATGTGCAGAAGTGCAGGCTCCAAAATCTCATGC
TGCAAAAGCTAAGTCAAAAAAAGCTAAGCCAAAATTGTATGACCATCGGC
CGTTGGCACTTGGTAATGATAACTACTTAAGGGTGTTGCAAATTCCCAAG
AAAAAGGTTTGGCGAGACACTCATATGTTCAGATTTCCTCTTAGATATGA
CATTCCCTTCAATCTCACCAGTCCTATTCCAGGGGGCTAATTTTAGAGAC
CTTCCGGGAGTAGTAGTTGGTCCAGACAATGTAGCTAAATTAGATCCAAC
AAAGGAAAGGGTGCTTTTACCATCTGGTCGTCCTCTGGTAAGATGCTCAG
GATGCACCATACTTCGCCATATGTGCAATTTAAAACAAAAACCACCAGGT
TGTGACTTCTTATTTTCATTTTCAGGTGCTTGATTGTATACTAACGTATG
AGGATGGTAAATCATTAAGGTTGGTTCAAAGGACACTGCTCTTTCATAGA
TATGACTTGTTTCTCATTTGACTGTTTCTTGTATGATGTGTTTTAGACCT
TTCGGTCGATTATGGTGGGATGAGGTAGTTGGAACTGTGCTGACATGTCC
AAATGCTCGTATGCAGGTTACTTGAGATTCTATCTTCGTTATTACTTAGC
TCATGATTTGAAAATTATCTCCTAAGAGACTAATAGAAGTATGTTTCAGG
CCTTGATACACCCTGCGCAGGACAGACTGCTCACTATTCGTGAAAGTGCT
CGATTGCAAGGTTTTCCTGATAGCTACAGATTTCGTGGAACAGTGAAAGA
CAGGTAATCGTTCTCCTTTTATTTCATCAAGCTTTTTTCCAAGAACATGC
AGTAGAACTTCATGTACGAGTACTATATACTAAGAGAAGAGTTCAGCAGG
CCTAAGAAGGCCAACAAGAGCAGCACATCTGCAAGAAGCAAACAACCCCG
CAACAAAAAGAGAACACAGCCACACCATGACCTAAACCTACCGCTATCCC
TTTAGTTTTTAGCATCTGCTACGACCCAGGACCTGTACTCCTGCCTGCCT
AAACGTTTGAGTGCTTCAGTTTCTCACTGTATAGAAAAGTACATAATATT
AAGGTAGTGGTGATTGTGGAACCTGTAGCATAAATGTTTACATGTGACAA
ACCTGGCTGCAGGTATCGCCAGATTGGAAATGCTGTGGCTGTACCCGTTG
GCCGTGCACTTGGGTATTCTTTGGCCATGGCCTATCTGAACAAGACCGAA
AATGACCCCCTCATGGTGCTACCACCCAACTTTGCGTTCTCTCACAACAT
AGAAGACGCTCCATAGTCAGAATAGCAGAACTTACGGTTGGCTTGTTCAC
CCTCATTGGTTCGACTAAAGCTGTCATCTCCGTTCATTTTCTGCTGGAAA
AGCTGGGTCGTTGCCGCGACTCATGGCCGTTAATATCATTAGGGTTGTGA
ATATCGATAGGGCATGCCCATTTAAAGATAATTCTTGATTCGTTCTATTG
CCATGTTGTATCTTGTCACATTTTCACTAGTTTCTCCTGAGAGAACCTTG
TGTTGTACTGTAACATCTGTTTCTTAGAAGCTCACACAGGTAGGTGTAGA
TGGCACCAGTAAGGTTTCTGGCTGAGATTGGGGCCAGGAGATCCTTTGTT
GTTGCTGTTGTACTATGGAAGAATGAATGTATAGACATGTTAAGTAGTCA
GGGGAATACAATGTATGTACATCATCCGATGTGTTGGTGTTTGTATTTAT
GAGCAGCAAGTGAACATAGAAAAAATGTAAGAAGTTCAATAAATGTACTG
TGAGTTGTATTCTGAATGTAATACTAGCTTCGTTGAATAAATTAACTGTG
TGGCAACGTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.