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GrainGenes Sequence Report: AE011884

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Sequence
AE011884
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE011884
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGACAAGAGCAAGATGCTCGTCAAGGCGGAGCCGCCGCAGCAGCCACG
TCACGGCGGCAGCAGTTCCGGCGACGGCGCCGCCGATGCGGCGATCGCCG
TCACCGTCGACCCGGACACGCTGGACTGCCCCATCTGCTACCACCCGCTC
CAGCCTCCGGTGTACCAGTGCGCGGCCGGGCACGTGGTCTGCTCCTCATG
CCGCGACAGGCTCCAGGACAGAAGCAAGTGCCAGGTCTGCGCCGCCTCCA
CGGAGTACGGCCGCTGCTACGCCGTCGAGCGCATCCTCCGGTCCGTCCAC
GTCCCTTGCCCCAACGTCGCGCGCGGCTGCGGTGTCCAGATGTTGCTCCA
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TTGTCTTCCAACTTCTATTGTTTATTGGCGCGACAAAGCAAGTGTTCCAA
CTCCGATTTATCCGATATCTCCATCTTCTTGACGAGTACTCCCTCTATTC
AAAAATACAAGACGTTTTAGCTTTGTCAATCGAATATATTTAGACGTCTT
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ATCTAGATACGTTCATTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTCTGAACG
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TGAATTTCTTAAAATATGTACTCCCTCCGTCTCAAAATTCATGATTGTCA
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TTGTATTCATTTTTTTTGAAAAGAGTATATATTAATATCATGAGATACCA
ATTACACCAAGCATCTGCAACAACATATGCCCTAGTGGCCTTATGGATGC
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GCGGAAGGAACCCTAGGACCGACACCATTATTCAGGCTGATCCAGCAGTC
CCCACACCGCCGGCCGGCTTCCAACGAACGGTACGAGCGGGTCAGCCATC
AACCCTTTCGAAGCCATGGCTAAACCCCAAATCGGTTAGAGAGAGACCAA
GATGCAGCGTCGCCGCCTAAGGCAATCCACGCTGCTTCCAAGTCCACACC
ATCGCTCCCATCTTCTTATCCGCGTCTCCCTTTCAAGCCGCTGGCAAACG
CTGCTCGGGCGAGTGTCGCCGCCCGCCGCTTGGATCCACCGACGCCGCCC
CTTGGTGTCCACCCCTGGCGCGAAGAGGATTGACGGGGCCGCGCAGATCG
CCCGTCGTCTTTGTATATATATAATATATTTTTCTTAACACTGATAATGA
AAAATTTGGTGGCAAACAAGGTAGTACTCCCTCCATCGAGGTTTATTAGT
CTTTCACGTATCTCTAGGTTGTCAATTTGGCAAATCTAATATGCAATATA
TATGATGAAAAATACATTATTGGAAACTTCAAATGTTATACTTTCTAATG
GTATAGTTTATTTTCACATACTTTATATGCTTAGGTCTCTAAGTTGGTAC
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TCTATAAACTAAAAGTTGTCTAGATACAAGCGTATCTAGATACACTAAAA
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TATTAGGTCTTCAAGTCTCGTGTCGATTTTCTGGGTTCCGAATTAGCGGA
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CATCTCTCTCCCTCAATTTTTCGGCAATCAGTACGTGACAGAGATAAAAA
AAACTGTCTCCAACAATTACAAAATAAACTCTAAAAAAGAAACGAGCTTT
GAGGTCTCAAGACTCATTCTATGACCCAATCTTTATTTTCCTAAAGTCAG
ACGAACAAAAGTGAGATTGATAACAAACTACATACCTGCAAATATTAAGA
GAGTTCTCCCATAATTTCGACTTGAGACATAATACCAAGGCTACGTGCAT
GGGTGCAGCCATTGAAATTTTTAACCAACATCCACAAGAGTACCAATACC
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AATCCTGTAATTCCCAATGTATTCATCAAGTTATTATTTTTTTCTTGAGT
GAACATTTGATATTGACTCGGTTCCACTTATCATCAGCATGGCGATGCTA
TTCTGACTTACATGGATTGAATAAAGAGTTTAGCGAGTCGGACTGGCCTA
CATTAAGATACAACGAGTAAGTCATCATGTATATGTCTCAATCAATGTAA
TTCTTAGGCCCGAGGTTGTCACACAATCCGTAGTTGTGGATCAACCGACT
TAGGTTCTGTCAAACGTTATTCTGTCATAGGGCAGTTATAAAGGCAGAGT
TTGGGATGGATGAGAATCAAGTTGCGCAATGTGGATAACTGAGATGGGAT
TTTGCCCCTTCGACTAGAAAGATATTATTTGGGTCCTCTCGGATGATATG
TTTCATAAAAGCATGGCCATGCACGACTCGATTAAGTGCTAACCGGGGCC
ATCGACTAAGAGTTAGTCGAATGAATCACATATCACGGATCAAGAAGAGA
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ATCGTGAGGCAAAAGAGACTCAAACGTAAGTTGCATTGATAAGGCATGCC
ATCGTGACTCTATGACACTTCGGAGTCGGCATATTCTTTTAGGAGCCACT
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AGTATGCGGGTTCACACACTTAATAGCGGGAGATAGTTGAATGTGAATCC
GACTGAGAAGTATGTCGATCGGGTTGGACCTAAACAAGACACGGATTGGG
TTAGTGAGTTGGACTCATGGTGACAAGAATAGGCGTTTAGTGGATGGGAA
ACAACTGTTGTGTAGCCCACTGCCACTCCATATATAGAGTGGAGCACATG
ATGCCCAAGTGCATGGTTATCCACTTCTAGGTGTTGCAAAGCCTATCCCC
ATTCAGTCCAGCCGTCGTACCAGACTTAGCAGTCCACCTTCGGTGCTCCT
CCTCGTACGTGTGGATACCAGAAGAGGTGATGTACGTTCAGCACTTCGAC
GATCATGGGATTGGATCAGATCATGGGACTGCACTACTTCACGCGCTTAA
TAGATTCCGCACAAGCGCATATAGTGGTAATCCTCGTGGCCTTCTACCTC
GATCAGCTAGATCTTGGGATCACCACGTTGAAGGTTTTTATTTATCTTCC
CATGGCCCAATAGTTGTATCAGAGTGATAGCTTATGGTTTTATCCCCTTG
ATCGCGCATATGTGATATGGGGTAGGCATTAGATTGGATCTATTTTCCAT
TTTGGTGGTAATTTGATGACCCACAAGTATAGAGGGTGTATCGTAGTATT
TTCGATAAGTAAGAGTGTCGAACCCAACGAGGAGCAGAAGGTGCTGGCTA
GTGGTATGGATCGGGAATTCTCTGCAAATACTTAGAAAATAGATTTTTAG
GGGGTTTCGATAAAGCAAGTAAACAAAGTACGAGTAAATAAAAGACAGTA
GGAATAAATGCAGCAAGTGGCCCAATCCTTTATGCAGCAAAGGACAAGCC
CGTTGTATTACTTAAGATGACCAAACGTTCTCGAGGACACATGGGAAGAC
TGTCAAGTGCTTTCGCTTCATATAGTTGATTAATCTTCTCTAGCTTGCTA
AGTGTTGTATGGGTGAACCTGTGCTAATGTACCGCCCCATCCAAGACTAA
TACATACTTGTGATAATACCCCTTGCAAACATCCGTAAGTACAAGAAAGT
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CCTTGTGCAATAGTTTCCTAACGGGGGTTCAGGTTTCTGTCACTCCGGCA
ACCCCTACGATTAGTAGCCAAATACACATTCCCCTAGGCCCATATAGGTG
AAATGTCATGTAGTCGACGTTCACATGACACCACTAGAAGAAGTACACCA
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TAATCAACACCGGGAAAGTTTCCCCTATGAACTAATGCAAGATTCAACTC
AATTGTTACAGCAATATGGAGATGGTGATGAGGGTGCTGATGGTGGTGAT
GATGGTGGTGATGATGATGATGATGATCCCGATGAAGTCTAGCTTGATGG
TGGTGTTGATGGCGACGATATCCCCTCTCCGGGAAGGAATTCCCCCAGCA
GAAATCTGTCTGCCGGAGAGATCTTTCTCTCTCGGTGTTTTCCGCCCCGC
AGAGGCGACGGAATCTTTCTGTGGTCGCTCCCCGGGTCTTAGGGTTTCGG
GAGGATGATATACGCTAGAGGGGAGAGCCAGAGGTGGGCCAAGACGGCCA
CACCACCTCCTGACGTGGCCTAGGGCTGCCCGCGCCATGGGGTGGTGTGG
GCCCCCTGTGGCCCATCTCCACTCCGTCTTCTGGCATCCTTAGTCTTCTG
GAAAAATAGGATTTTCCATATATTTTTCCAGATTTTCTGAACTTCGTGAA
TTTTGCCTCCAAACAGCACCTTTTCCATCAGAATCCTGACTGCAGCGGTC
CATGCTCTAAAAGTCATCAACCATGCAAAAACAGATGAAATAACATAAGT
ATCACCTCTCAATATGAAATATATCAATGAATAATAGTGAATTAAGACAT
AGAATAGTGATGCAAAATGGACGTATCATAATTCTATGAGATATATCGGT
TTTATACTAGGTCAATTGGGTCAACTGTACTCGGGGAAATGGATGATCTA
GTTTCCTTGATCATATTGCTGAGGTCTTGGAACAACATACCCCTATCAGT
CAGCTTCTTCCATCAGGGTAGACTATGACACGTTAATCCATATGTGGTGA
TCGAAGATCAAAGTAGTTTGATCGAATCACAGAATTGATCAGATTTGGGT
TAAAAATCAAGGGCTGGATTGGGTTAGTCAGCAATGGTTGGAGGCCTCCA
GTGAAGGATTTTTTTGGCCATGCACCTTCAACTCGGTTTGGAGCCAGATT
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AAACTATTGGACCATTCATCAATCATACCTTCTAGTGTACTAGTGGGTGG
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AAAGAAGCCAGGCACAAGCTGGAGGGGATCTCGGTACGATCCGGGGCAGA
GTAGCCATGCACACACTAGAGGTGGTGGTTATGAATCAGAGCATAGCAGT
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AGATGGTTATATGCAAGAGTAGATGGAAAGGAAGATACAGACGATGAGAT
TGATATTGCAGATGATTCTGATGAGTCGGATGAAGAAAAGGAGGTAACGA
CTTCTGCCTCATGGAATCAAGACTTCTCAACAGCGACAAATGTGAACGAT
GGACACGATTCTGCCTGGCAATATCACCAGAACACCATCGCCAAGGGTGC
CTTGAATCCGAGTAAGAAACATCTGCAGGAAGCATTCATAGCAAAAGGGT
TTCAGAACTAAGGTGTCATCGCATAAGTACTTGACGATGGAATGTGAGAA
TAAACGGTTGTACCTCAAGGGTACATGGCTATTTCCTTTAAATATGACAC
AAATTGGAAGGTGAGCGACTTTGTGCCGTGCACATGTCTACTTCCCAGTA
TCCTTCAGGATCATTGATACCTAATGTCTATGCTCCTGCCTAGATTGTTA
TACACGGAGATTGTGGAGAGAAAATCAATGGAAGTTAAAGCTATCATGAA
TAAAGTCATGATCATATTTAACTACAGAATCTCTTATGGCAAGCCTTGGA
GGGCTAAGAAGAAGGCATTAGAAGAAAGATTTGTTTCGTTTGTAGATGGA
TATGGCTGCGTTGTTCGATTCCTCCACACACTGCAAGAAAGGAATCTAGG
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GGGTGTTGCATCATGTGTTTTTCTATTTTCTATATGCATCCAAGCCTTCA
CTCACTGTCGACCAGTTATATGTGTAGATGTGACATTTCTCACTAGCAAG
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ACTAACGCAACCTAGTCCTGATGAACCTACCACATTACTATACCTGCAGA
GACGGTGGTGCATGTGCCATCTTGGGGCCAATTTTTACTCGCAGTTTAGG
AATAAGGCCCTCATGGATCTTTTAAAAAAAACTCTACAAGCAGACCTAGC
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TAAGTGCAAGAGAGGAAAATGGCGCAAGATGCAACAATAGCATCTCATCT
ACTAGTAGTCGCTTCACAGGCAGCGTCATGAGCAGCATCAAGATTTGACC
CAACGGGTACTAGGAGAAGGCCTGGGAGACACATTTAAAAATTTCAGCAA
TGGATACAACACGAGTATGTTGACCAATGGTCTTTTCTGCATGACACACA
TGGATCTAGGTTCGATGTCATGACTACTAATCTCGCAGAAACATATAACT
TTGTCCTCATAGGAAACATGGTATTGCTTCTTACGGCCATTATGGAGGGT
ATATTCCATGTAACTCTAAATTATTTCAGAGGGAGACGCAATAGGGATGA
GATGCATATCATGAACAACCAAAAAACACGGTACTATGAATAGATTATGA
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ATTCTTAATCAAGAAAGGATATTCGAGGTGCGGTTACCAACCGACAATTT
CGAATGCGGAAATGTGCTAAGGATGCAAAAGGTTACCAACCAACATTTTC
TTTTTTTAATCATGAGATACCTTAGATTTTCATTCTAGAAGGTAAGACTA
GCTCCTCATGTGTTGTCGACCCCACAAACAGTCGCTACTGCAAGTCACAT
ATCACGTAGCCAGTTCCTTGTCGCCACAAAGACTCAAATCACCATCGCTT
TCCTGATGTTTCAGTTTTCCTGACATTCTCCGTATCTAACTTTACCATGG
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ACGAGGATGAAGAGGTCGAGGAGGAAACTAGTAATATGTGTGGAACCATG
TCTTAAAATAGTAATATTTGTGGAACTATGTCTTAAATTTGTATGTCTTG
AACTATGTCTTAAATTTGTAATATGTCTAGAACTATGTCTTAATTTTTGT
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AATCCTAAAATGATAAGAAGCATTGTTCGATGATAGTAGAGAATGCACCA
GGAAGTCTCGATACGCTTATCACTTGGACTCCTAAAGGGAATTGTATGAT
ACACCCCAGTTGGCAGCAAAAGGTACATGTTTTATTAATTCATCTGTTGG
TTATATATCTACTACACACACCAATTGAATTGTCATGCTTTTACTAATTC
TTGTGTGTTTTATTAATTCCTCCATACATGTTGAAGTGGGATCGGCTATT
ACCTTTCGCACGTCTGGTTGAGGCAACTTGTGCAGTATTGGTAGATTGCA
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ACATGCTTGGTGGACCCGTGGAGGCCCGATACACACACATTTCACTTCCA
ATAGGGAGAGATGGCTCCTACTCTACATGATGTGTCTTACTTGCCGGGAC
TCCCATTGGCTGGTCAGCCCATAGGACCGTTGCAGTCACCGGAGAATTGG
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CTTCAGTTCCAACGATCACGACCTAAAATATGATTGTGATTGGTTGCTTG
ATTTTTAGGTTAGTTCATATCTTCTATGTTTATCTCCATTATACCATGCA
TCCTATCATAACATTGTTATACTGACACATTTTCCTTTGATCAATGTAGA
TCCAAAAGTTCGGATATCCAGCAACCGAGTTGTACGAACCACATATCATA
TGAAGACTTGAGATATTTATAATGTGGCTTCTCGGAAAGGTGATGTTCAC
TGAGAACCATGGTTCCACGTTAACAGATCAAAGCAGCAGCGGACACACCC
CTTGCTCCTGCAGTGCAAGACCCTGCCATTTTGAACCCATCGCACGCTAC
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CCCGAGGAGTTAGGGTTCAGCTGTCTTAGCGGCTATGTACTGAGGTATAT
GCAATAGTTGCGATCTGAACTCTCCTAGGCTAGCCTTTTTTGGGATGCCC
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ACATATTTCCTAACAATATTGGAGATTTTATCTTTGTTTTTAACGGGTTG
TGATGATGCTGACCTCATAGAAAATCCCATTAGACCGCGATGGTGTAGTC
ACTTTGTGGTCATTAGACCGACTGGGTCCAGTCGACGTGGCCAAAACCTA
ATGGTCTAGTCAGTTTGGGTCAAACAGACTGGATCGTCGCACGTAGAACG
CTGCCAGTCGGCGTGGTCAATAGGTGTGGCCGACACTACTAAAAATGGAC
GCTAAGCCGTCAGCGTAGCCCCGTTTGTCATCGGCATAGGGCTATGCCGA
TGGCAGCCATCAGCGTAGGTCCATTTGTCGTCGGCGTAGCTCGTGGGCCG
ACGGCCAAAACGAGCCGTCGGCATAGCCCCGATGGTCCCCACTTAGACAG
CTAACGGCCGTTTGGCGCTGATAGTAGGTACGCTGATGTCTTAGCCTTGG
ACCTATGCTGATGGCTCGGCATAGTGCTAGAATTTATTTTTCAATGTTTC
TATAATTTGTTTTTCAAAATTTTAAAAATATTTGAATTGTTTGACCGGTT
AATCGCATTGGGGACATATTCATCTCTAAGCACAATTAATTTCATGTCAA
ATCACTCACTTCTAATCACAATTGATGGTCTGTCACCCATCTGTAGACTA
CTCCAGTCGCATCACACTTAACTTTTTCATTCCTCCGATAAAAAAGTTAT
ACTTTGCTTATAATAGTATCCTATCAATCCTATTAACCCTTAGGACATGA
GGTCACACGCCTTTAGTTTTTAAATTTCAAAAAATAATTTAAGTAAATAA
AAATGAATACGTAATAATAATCTTGAGTTCAAATAACAATAAAATTATTA
TTTTTGACTTTTTCCAATTAATATTAAATAATTCATATCTACAAATCCAT
ATATCGGAATTTGAAAAATAATATATCTAAATCAATCAGAAAAATGAGAG
GAATCAAAATATTACATCATTATCATCTTTTTAATCATGCATCGTGTCTT
TTTAATACTATACCAACCGAACTTATTACATGATTCTAGCCATAACATTG
GTCGTTGGCCTCAAAGCCATGAAAGCTCGAACATGATAGCTTATTTATGA
AAAGGTTTTTGAGATATTTGTAATATTCTAAGTTTGATATTTTTCCTTGC
AACTATATCACAAAATATGACACCACGAGAAGGTTCTACATTGTTTGGAT
CTTTTTAAATTTCTTATACCTGTTTCAAATTAGGGTCAAAACGACGGGCA
CGAAGATACATAGCTTGGGGCAGGATATCTCATAAAATATCATATTGTGA
ACCTAAAAAATGTTTTTTCCAAAGAATCATGAGTATTAGATCATATACAT
GTAGAAATCTGACATACTTCCTACTGATTCGGCAGGACTTTGTCTTTTTC
ACGAAGGGTGGACATAAAGGTTTAAGATATTTCTGTTGGAATATTTTCCA
TGGAAGGTGGTCTAGTATTTGTGAAAAATAAAGTGGTACCATTCAAAACT
ATCATTTTGTGATTGCTTCACAAAACACGCATTTTTGGCACTCGGAAAAT
GAAAAATGGTTTTTTTGTTGCGAAGAAAAGGAAAACATCCTCCTGTGACA
TTGTTCGCCAATCCTAATATGCATATGTTATGCATAATATGGACATATTA
TCATAAACTATGCCGCGATTCTAGCCATAACATTAGTAGTCTAGTCTAAT
AGTCATGAAACCTTGAACATAATAGCTCATTTCTGATAAGTTTTTTTTTG
AGATATCTGCAATATTTCAAGTTTGATATTTTTACTTGCAACTATTTCAC
ATAATATGGCACCACATGAATATTTTACATTGTTTGGATTATTTTTGAAT
TTCTTATGCTCGTTTCAAACTATGGTCAAAACGGCAGGCATGAAGATACT
TATCTTGGGCTTAGCCTCGCTAAACTTGCAATGGATCTATAATAAAATAG
CATATTGTGAATCTAAAATTGATTTTTAGAAAAAATCATGACCATTAGAT
CATATACCTGTATTTCAAATCTGACCAACTTCCTGCCAATTTAACAGGAA
TTTGTCTTTTTCACGAGTGGTGGACGAAAAAGTTTCAAATATCCCAGTTG
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CCATTTTGAACTTTTATTAGGTGATTGCTGCACAAAACAACCCATTCTTG
GCACTTGGAAAATAAAAAATGGCTTTTTGGTGCCATGAAAAAGGAAAACT
TCCTCTTACAACATTGTTCACCATTCCAAGACGCACATGTGTGCATAATA
TGGGAACATTATCAAAAACTATGCCACGATTCTAGCCATAACATTGATCG
TTTGGCCTCAAAGCCCTGAAACCTCGAACACGATAGCTCATTTCTGAGAT
TTTTTAAAGATATTTGCAATATTTCAAGTTTCATGTTTTCCTTGCAAGTA
CGTCATATAATATGACACCACACGAAGATTTTACATTGTTTGGATTGTTT
TGAATTTCTTATGCCTGCTTCAAACTATGGTCAAAACGGCGGTCATGAAG
ATTCTTAGGTCGGGGATGAGTATCACTAAACTTGCAGTGGATCTCTAATG
AAATAGCATATGGTGAACCTAAAAAGGATTTTTACAAAAAATCATAAGCA
TTAGATCATGTAGATGTAGTTCAGATCTCTCAGTCTAGAAGTTTACTAAC
TGCTACCATGTGTATGTGAACATGGTCACATCCGGAAGCTATATATTGCC
TCTATAAACATTGAACCACACTTGTACACATATGTTAGAGTCACATGTAA
GTTTTTAAGGTATACCACGCTCCGGTGGTCGGTCTCCGTCGAAACCCTAG
ACATGGCCCTGTAGATCTAGCCCTTTGACCAACCTCCAACGACGATTGAC
CAATGGACTTATTCTTCATTTTTTTTGTTTAGTCCGTGGAAAACAAAGGA
TGTGGCCATTTTATCACAAGATTCACTCTGGTTGCCCCATAGCAGAAGTT
TTTGATGTATTCCACCACCTTTTCTATTTGAATATCATTTAAAATGTGTT
ATACAAAGTATATGTAATATTTTATATTTTACTTAATATTTATTCAAAAA
AGATGTGTAATATTTGTGAGTAGATAGATACAACATATTTTTATGCAAAT
TTTGATATATTATTTATATTTTTCTAAATTAGAATAATTTAGTTATGGTA
TTTTTAGGATTAATGTGGTAAAAGTGAAAAGAGCTAATACCGTCGGTCAA
GGTGTGAAACCTAGACAGGAGGCTAAGTCGTCGGCGTACGTATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.