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GrainGenes Sequence Report: AE001961

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Sequence
AE001961
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE001961
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCGTCCCCTATTTGAGACCGCCCTACATCGAGGACGTCGCGGCCAGCCG
GCCACCCCTGCAGCCACCCGCCCAGGCCGATGCTCCTCTGCGTGGAGTCG
GCGGACCTCCCCATGGACGAATCCGACATGGAGCTACTTGCACGAGATCG
GTTCCGGGAGCTGCTTGCCAACGGCGGCGAGGAGCAAGATCTCAGCTCCG
GCGATGCAGCCACCCGCCCCGGTGCTCGTCCGCACGGAGGCGAAGGGAGT
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AACATCAAACTATCCGATCAATGTAACCCGATTTGGGGATGACCGTTGCT
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GAGTACCAGTACATGTGTAAAACATACTCACTTCCTCACGTTATGAATAG
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TCTAAAGATGTTGCGGTTACATTTGGTTGCCGTGCATTTGAGGGAAATTA
GCAGGGGGAGTGAGAATTTTACTGACTACTACTCACTGGTTTTTACTTTA
ACCTGCTCGCTGAATTTTACTACAACCTGCTCACTGAATTTGAGAGAGAT
GTTTTGGGATTCTGTACATCATCTTTAGTTCATACATCATCACCTGGCGC
ACACGATTGTCGTCCACCAACCTATTGAAGTGCATGTCCCCATTGTGTAT
GCGTTCATCATCACTAATATTGTTTCGGTAGCAATGCACGGGTTTCTTCT
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AACATATTCGACATCTGTCATTTGGAGTATGTCATTTATCTAGCGTTAAT
TTATTTTCATGGTAAATGTGTGTATTAGTGGATCATTGTGGTGAACTTTT
TTTCTGGGTAGCTTTTATTGTTATAGTTGATCAGGGAGATTTTGAGTTGC
GAGAAAGATGGGATGAGACCAGATGTGATTATTCAGTACTTCTCTCTATA
GTCTGTTGGTACTGTTTGCCCGTACCTGTTAGATGCCAACCTCATGGATG
GATTTTTCTGTGACTTGTAACTGTTAATTATTTATGTGGATTCATGGAAA
CTCTGTTTACAATTTTTAGTTAATCTTATGTTTGGGAATCTCTGCATTTA
TCTTTGGTCAGCGACATAGTAACCATAAAGCATTAACAGTCTTCGTTACC
TTTTGATTCTGACATTTTTGCTTGTGATTGCTGCCTCGGAGTTCAAGGCC
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ATGCCATGAAAGTGCAGTCCGGGAGAGGATTTGGATTGGGTGGATACTGT
TGGCTAGAGTAGAAGGTGGCGTGATTCATGCTGGTGAAGTGGTTTGCAAT
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ATAATTAGGTATACTATCAGTGATCATTTACCATGGGAAATCGTGTTAGA
TAGTACGTATTTGCAGATATTGAAAATAAGTAAAGGGAGATTCCACAAAG
GGGAACTTTCTTTCTGTCTTGATTTTGACTACTCCTACAGGTGTCTATTA
GAGACCTTTTTTGTATGTGGCTTGCATACATACTCATTTGTGTATGTAGT
TAATCCCTTCGCCTGCCGATTACGCCGCTCGTTCTTGTCCCGATGTCTGA
AAGTGGTTAGGATGGCCGAAAGGTCTACCGTGAGTGGCCCCTGGCCCCAC
CGTACTATTTTAACCACTTTCGTTCATCCAGGCATTAACTAAGAGCGTAA
TTCACCGAGGTGGTTACAATTGGTATCTGAGCAATCCCGCCCTTCAGGGT
CTCAGCCAAAATGATCGTTGTCTGTCTAGCAAATATTTTGGTAGTTATGT
ATACTAGGGAAAACAAACGTGAGAGTAGGACTGCTTCCATTTTACTTCTT
ACCCACCCACCCACCCTTTTTCTGGTAAGGAAGTGTAACGTTTTCAATCC
TCTTCTTAAATTCAAACTAGGATTCACGTGTTCTGGGTTCCGTAGTACCA
TAGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATTCCTTGTCTATCTGTTGCATCCAA
ATGTTATCCCTATCTGCCTTTTGGTTATCAACTGTTGGTACATTTCATAC
CGACAGGCCTTTGTAAACCGACGCGATCTATTCTGATTCGTTGTACACCG
ATGCGATCTATCTTACTCTTTGTTATCCGATGTTATCTTGTTGGGGTGTT
CTTTTCCGTAGTTAACAATCTTTAGGTTCATCTTAAGAAGAAGCTGTTGG
GATATGTGTTTTACTGATTTATGTGCGGAGTAATGATTTGAGTGCGGGAT
GGAGTCGCGAACATACCACTACTTTTGTCATTTGCTTTTGTATATTGAAC
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TATTTTAATGCCGAAATTTGCGGAAAATTTTTCTTTGTTAGTTTGTATAC
CACACTCCTTGTTCAGTCGTGTGTGTTATGCTTAATATCTTCTAGTTGCC
TTGAACTTTGTTGATATTTTAATATCACCTTAGTGTATTGCATTCTTTAA
TATTGATTAACTCCATTTTGGTACTATTTTGGATTATTATCATTCTCCAT
TATAGTACTGACTTGTGTTTTATATCAATCACAGGATGGCACCACCACGC
CGTTCTGAGGAGGATATACCACCTGAACTCGGGGCTGCTTTGGCAAGTAT
TGCAAATGCTTTGGGCACTATGCAGCAGAATCAGCAGCGCTTTGAGGAAA
GTGTGAGGAGGAATGAGTTTGCTCCGCTACCTCCACCTCCCAAGCGAGGA
GACATCAAGAGTTTTCTCAAGTTCAACCCACGTCAATTCGAAGTGTCTGA
TCAACCACTTGATGCGGATGATTGGCTTCGTGAGGTGTCAAGGTTGCTGA
TGACTACGGATGTTCCCGAGCAAGAATGGGTCAAGTGTGCTACTCACCTT
CTGAAGGGAGATGCAGCTCTCTGGTGGGAAAATTATCTCAAGGCAGATCT
TTCTGGTTTTCAGCCTACTTGGGAGCGGTTCACTACTGCTTTCAAAGAGC
AATATCTGTCAGAAATTGTCATGGAAAGGATGAAGGAAGTGTTTCTCAAC
CTCAAGCAGGGCACTGACAATGTCAACACCTACATCAGGAACTTCATGAA
CCTGTCTCGTTATGGTGGCGATGAGATCTCTGATGACAAGAAGAAGCAAA
AGAGGTTTCGGCAAGGCCTCAATGCTTCCATCAAATATGCAATCACTCAT
GCAAGGCCAGCATCTTTCCTAGAACTTCAACACACAGCTCTGCAGGAAGA
AGCAAGTAGGCAAGTGTTTGAGGAGTCAAAGAAACACAGCCGTGATACAG
CAAGCTCTTCTGCTATGACAGCTCCTTCTAAGCGTCGTGTCTGGGTTCCT
AACACCCCACCGTCGCTCCCTGCTCCACCAAGACCTTCAAGCTACGCACC
AAGGCCACCAAACTCCTTCACTGCGGCTCCCAGGGGCTACAACCACAACT
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GGTGCTTGCTATACTTGTGGAAACACTGGGCATCAGCACTGGAATTGTCC
AATGAACAACAAAGCTCTTCCACCACCACCTCCAAGACCTGCGGCAAGTG
CTCCTTTGATTCGTGCACCTCCACCTCGGGCTCTCAACATCAACACTAAG
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CATGAGTTTTGTTTGATTCTGGGGCTTCACATTCTTTTGTTTCTCACAAG
TTTGCTCATGAGCAAGATATGGCTATGGTTCCTTTATTACACCGTCTTGT
GGTACAATCTCCTGGGTCAAACATGAGGGCTGCTCATATCAGCCATGGCA
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GGCAATTCTGATATTGATGTTATCTTGGGCATGGATTGGTTGACAGCAAA
TGCAGCTGTGATTGATTGTGCTGAACGTTCGGTTTCTCTGAAAATTCCTG
AAGGCCATATAGTCTATTCTCCAAGTCTGACTCCTGCAATTCAGCTTTAT
TCTTTGGCGGCTCTGAATGATGATGCTATGGAAGGTATTCAGAGTGTTCC
TGTAGTTTGTGAGTTTCCAGATGCCTTTCCTGAAGAGTTACCAGGTATGC
CTCCGGACGTGAGGTTGAGTTTGTCATTGAACTTGAACCTGGTACCGCTC
CTATTTCCAAGCGGCCTTATAAAATGGGTCCTGCTGAGTTGGCTGAACTT
AAGCGTCAGTTGGATGAACAAGAGAAGTTGGGCTTCATTCAGCACAGTAC
TTCTTCTTGGGGTAGCCCAACCAGCTTTGTGAAGAAGAGGGACAAGACTG
ATAGACTTTGTGTTGACCATCGGGCACTCAATGCTAAAACAATCAAGAAT
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CGTGGTATTCTCTAAGCTTGATTTGAGAAGTGGTTACCATCAAATCAAGA
TTCGCAAGGAAGATGTTCCCAAAACAGCTTTCACCACCCGCTATGGCCTG
TATGAGTACACGGTCATGTCTTTCGGTCTCACCAATGCACCTGCCACCTT
CTCGAGGCTGATGAACTCAGTTTTCATGGGGTATCTTGATAAGTTCGTTG
TGGTCTACCTGGATGACATTCTAGTCTATTCTAAGTCGAAGGAAGAACAT
GAAGAACACCTTCGTTGTGTCCTAAACAAGCTTCGTGAGAACCGCCTGTA
TGCAAAGTTCTCCAAGTGTGAGTTTTGGCTGCCTCAAGTCACCTACCTTG
GTCACGTCATCTCTGCCAAGGGCATTGCCGTCAACCCAAAAACTATTAAG
ACAATTATGGACTGGCTTCCACCCATAAATGTCAAAGAAGTCCGGAGTTT
CCTTGGTTTGGCCAGTTACTATCGGCGATTCGTTCAAAATTTCTCAAAGA
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GTGATGCTTCATTGCAAGGATTGGGTGCGGTCCTTATGCAAGAAAAGCAA
GTTGTTGCTTACGCATCTCGTCAGTTGAAGACGCATGAGATCAACTATCC
TACACATGACCTCGAACTCGCAGCAGTTGTCTTTGCGTTGAAAGTATGGA
GGCATTACTTGCTGGGCAACCGTTGTGAGATCTTTTCTGATCACAAGAGT
CTGAAGTATATCTTCACACAGCCTGATCTCAACCTTCGTCAGAGGAGGTG
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TCTATCCACCCTGGCAGCACTAAGATGTACATGGACTTGAAAACACAATA
TTGGTGGCCTGGTTTGAAACGATATTGTGCTAAGTATGTCTCAGAGTGTG
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GGGAAGAATGTCTTCCTTATGCTGAATTCTCTTACAACAACAGCTTCCAG
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ACATTGTAACTCAAGCGGAGGAGAAAGTTCACATCATTCTTGAAAACCTG
AAGATTGCTCAAAGTCGCCAGAAGAGCAATTATGACAGAAAGCACACAGA
CATGGAGTATGTCCCTGGTGATCTCGTTTACCTTCGTGTCACTCCCATGA
GAGGCACGCACCGCTTTGGTATCAAAGGAAAGCTGGCTCCTAGATACATC
GGTCCTTTCAAAATTCGTGGAAGAAGAGGAGAAGTTGCTTATGCTCTTGA
GCTCCCTAAACAACTCAAAGTCCATGATGTTTTTCACATCTCCCAACTCA
AGAAGTGCTTCAAGGATCCCGGCAGGACCGTGGACCATGAACTCATTAAT
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CGCAGAAAGAAGGACTCGCAACAAGTCCATCAAGTTCTGCAAGGTGCAGT
GGTCGCACCATTCCGTTGATGAAGCCACCTGGGAACGTGAAGATGAGCTC
CGTGCCAAGTATCCTAACCTCTTTGAGTCTTCTTCTTCCTAGAATCTCGG
GGCGAGATTCCTGTTTAGTGGGGGAGAGTTGTAGCACCCCAATTGTCTAA
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TCTAAATGCCCAAGTTGAGTTGGGGGCATATCTTTTATTTCCATTCCACC
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GCATAGAGTAATGCCATAAGATTCATATTGTTTTCACAAATAATCAATGG
CATTATTATTTTTGCATGTGTCATGCACTAGTCCTCACTACCTTCCTCTC
TTTTGGTTTTCTTTGGTTTTGTTGGTTCCTATCTTTGTGGAAAACATCTC
CTACCACTACACCATTCTCATATCCTCTCCCACATTCTTTTCTTTTAATT
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GTGGTGCGGATACACTCCGCATAGGCCCTGAGAGAGAGGCTTCTCTCCTC
ATGGAGGGCTTCAAGGAGAAATGTCTCGCGAAGGCACTTCGCATGTGACA
TCCCTTGGATCCAGTTGAAAATGTCCCTTGAGGCTTCATCGCCACCTATC
TGCAAAGGACCAGCAATGGATGGGACATGGCACCTTGGTTGCCAATGGCC
CAATAGTAGCCCCTGGGTGCCTGAGCCGCGTGCGTTTCTCAATACACTAA
GGGCCAGGGGCCTAAGAAATGCTAGGCCACTGTGGCAGCACGTGACAGTT
GCGCGAGCGGCAACTCATCACCACCGTGAAGATCGAACGGCGGGGGTACC
ACAACTGTTGGATGAGCGGCATTGTACCAATGGCTCTCCTTGGCAACTGC
TCTGAAGTTCCAAAAGCAGGGTTTGTTCTCACCAAGTTATCTCATCTCCT
CCTAAACGTGCATGATCCTTTCCGAGTTTCCTCCTTGAGTGATGGTGCCC
CAGAAGGGAAAAGCTTCCCGAGATACCGGGGGCAAGGATGAGGTATCAGC
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CTTTCCGTCCTTCACCATACTCTTCACGCCAGGTTGATTCCTCCTTTCTT
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TGCAACCCAACTCCATCACTACCATCACCATGTTCGCCTACTTCTATGAG
GCATTTCTTGGCATTAAACCCTCCGTGCAACTGTTCCGTCATTTCTTTAG
CTTGTGCATCACCGCGAGGAGCCAGTGCCACCGGGTGTGTCTCTCTCCGC
ATTGAGCTTTTAGAGTCTTCCCAGCGAGTGGTCGAATAAAGTGGAAAGCT
TTCATTCACATTGGGTCTAGATGGATGCCCATGTACTAAACTCGTGGTTC
ACGATCCCGCAGAAACCAACAGTGAAGTCCCACAGGTGGAGTCGAAGGCG
CTTCCCTAACGAGGAGTGGGCGTTCATCACTACACGCATATCGAACCTAC
GAGTTGGTGGTCTGACGGAGATGATGGTCGCGGAAGACTTCCTCTGACGG
CGAATTTCTCCTCTCCAAGCCAATACAGAGATATGTGGGCTTACTCTAGA
AGGACCCACAATATGAAGCTTTAGGAGGGTGATACGTCCATTTTGCATCA
CTATTCTATGTCTTAATTCACTATTATTCATTGATATATTTCGTATTGAG
AGGTGATACTTATGTTATTTCATCTATTTTTGCATGGTTGATGACTTTTG
GAGCATGGACCGCTGTAGTCAGGATTCTGATGGAAAAGGTGCTGTTTGGA
GGCAAAATTCACGAAGATCAGAAAATCCGGGAAAATATACGGAAAATCCT
ATTTTTCCAGAAGACTCAGGATGCCAGAAGATGGAGTGGAGGTGGGCCAC
AGGGGCCCCACACCACCCCATGGCGCGGGCAGGCCTAGGCCGCGCCTGGA
GGTGGTGTGGCCGCCATGGCCCACTATAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.