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GrainGenes Sequence Report: AE034986

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Sequence
AE034986
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE034986
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGTCGTCCAGTCCCGTGCTCTGACCTACCCAAGTTCCAATCCGGCTGAAT
AAAAATCTTCGCTCTGCCCTGGAGCTGCCGCCGCGCGCCGTAGTTGAGCG
TCGCAGCCGTCGCCTCACCGCACAAACCCTACCGAGCCTCCCCGTCACCA
TCGCCGCTCCCGTTCTACCTCGTCGCGTCCTGCTGTCTTCAACCCCGTCC
GAATTCCTGGACATTGGTTTCTCAAGGTACGAGCTTTTGGGTCCTCAGGC
GATTACTTAAACCCGCGTCCAACAAATTTCCATCTAGATCCGCACCTGGT
TTGGTGGTAGTGGTCAATTTAAATAGCTCGATGTTGTTTTGTTATGCTGC
GTTCAGGCCACAAGGACACCAAGCATCATCATGTCAGGAAGAGATCGCCT
GCCCCGCCGTTTTATCGAGGATGGTAGGGGCTGTGCTGACGCCCGTGTGG
TCGAGGATCGTAGGGGTCATCATCCTGGTATCCGTGTGGTCGATGATCGT
AGGGGCCATCCTGAGATCCGTGTAGTCGATGATCGCAGAGGCTATCCTGC
AGTTCGTGTGGTCGAGGATCGTAGGGGCTATCCTGCAATTCACGAAAGGC
CGCTCATGAGGGTGGATCCTCGCCCTCACCCGGCTGTTCTGGAGGAAGAA
ATTGAGTTGCACGAGGTTGAGTTCCGGAGGCTTATGGCTGATCGTCACGC
TCTAGCTGAGGAGCGGCTGGAGTTACACAGGGAGTTGCAAGCTGGCAAAG
AGGAGGTCCGTCACTTGAACATGATCATTGCAGAGATTAATGGCAAGAAA
GAAGCTTATATCACCGAGCTTGTGGACAAGAGAAGGAAGCTTGAAGCTGA
ACTTAGAGCAAATGAGCCTTTGAGAGATGAAGTTGTGCATCTTCGTGGTG
AGATCGAGAAGCTCCTTGCTGACAGGAAAGAACTCTCTGCAAAGGCTGCA
TCTCTCATGAAGGAACTGAGCAGGGATAGATCTGATAAACAACAGTTGCC
CATGCTGAAAGCAGGGATTGATGGCCTTCAGCAGGAACTTACTCATACAA
GGTACACGAACAATCTCTTTTGCTGCACCTGATTCTCAGGTATCCTACTA
AGTCTTTGGGGATTGGAACTTTAGATATCATTGGTTTATATTCTTTGTAG
GAATGCATGTGAATCAGAGCAGAAGGTGAATTTTGAGCTGGTAGAACAAA
GGAAAGCAATGGAAAAGAGTATGATTTCAATGGCACAGGAAATTCAGCAA
ATGCGGTCTGAGTTGGCTAATTTTGATGCGAGACCATGGGGCACAGGTAT
GTAATTTGGATTGACTACAGCATTTGGAAATTTCACTTATCGCTTCCACA
TGTATTTTCATTCTATTTGACTGTAATTACTTTTTTTGGATTGGAACTGT
ATATGTGCAATATGGCAGGGTTGTGTATTATCAGCAATCCTGATCTAGGA
ATTTGGTGAACTCATGTGTATTACTGCATTTCTTTTGAGAATATGCAATC
TGCCAGCAGTTTGCATTGGTTTCTAAGAAACAGGACATCAGTCAATTACT
GCTTTTGTTTGTTACCATTACGCAGATATTTCTATTAATTTTATTATCAG
GTATGTTAAAGATCAAGAGAGCAGTGAACACCAGGCTTCTTATTGTATGG
CAGTTGCATCCATTGTCTTATCTTACGCCATTTTCTGGTTATAAAAGCTG
CAACCATTTACATATCCTTTTCTGGCAAGGGTGGATGTTTTGGGCTAGTC
CACTTTCTTTGGCTCATCTTTCTTCAAAAGGAAATTAGGTTATGTGGAGA
GCTGATTTAACTTTAATAGTTCCCTCCATTTCTATATGCTCATTTCTACA
ATGGTGCCGGAGTTAGGACATGCAAAATTTGGCTTTGTGCTACATGGCAT
CCTAACAGCATTGCTCATTTAACCTACATATCTATTTGACTACAAGTGTT
GCGGAAGTAGTAAGTTGCTAGACTTACTATTTATTCCATGTGTGGAATCT
TATACACAGTTTATAGTACACCTATATGCAAAGCCATTCGAAGCATGGAA
GTTATAAAAACCTCGTTGTTTTGACAAACTAGACTAAACATGCCCAGCTG
CCATGTGTTTGCCATTTATGGCATAATGAGATTTACGGGCAATTTTGGAA
GATGCTGTCACTATATGCACCACAAACATAATTTTACACTAAAGCTAAGC
TGACAGCTTCCCTTTCCGTGCCCTGCAACTGCCATTGTTATCTGCCTGTG
TGTGGCGTGATAAATGATACGATGAAGCTGGGATGACAAGGGCGATGCTT
GAATGCCATTGTTGCACATGGCTACACGAGAGGGAGGGAGGACAAAACTC
CGTTCTATTTTCTTCCTTCTCCTTTGTTGACAGATTAGCTGCTTACAACT
AGAGATAGATTGCAATAAGAGAGATAATATATATTGTTTAATATGTCGTC
TACTTTTAATCCTTTTCTGATTCGCACCTTTACTTATATCCTAATTTAGA
CTCACATTCATATGAAAATCTAAAGACCTAACATGATGGGGAAGGTTAGG
GAAGTTCTTCCCATCCCGATCATGACATGCCTCCCAGTTTATAATGAATG
TTGAGTTTGAAAGTCTTTGAGTATGAGAAGAAACCTCCTGAATTTTGTTG
GTAATTTTTAGTTTGATCCTGCATACACACTTTTAAATAGACATTTTGTT
TTTGCTATATCTGACAAAATGACACTTACGTTATAAGTACATGGGCAAAT
TATATGTTTTAAATCTGTATACGTGGAGGGGCTTCAGTTCAATATGACCC
TTCTTGAGGTCCAGTCTTTCTGGGTATGCAAATTCAAAGGAAGAAGTAAA
AACCATGCTAAATTATACCTAGTGTGCGTCCAAAATGCATATTTATAGTT
TCTCTTTGCTGCAGGTATGAATAGAAATCATGTTTTTTTTTCTGTTAGTA
GGGATATCAGTTAATCCTGCATTTCATTTATTACATGCTTTAAAAAGATG
AGACCCAAGGGACTAGCACCCTCAACACATGAAGACGACAATGGGATACG
CTGGTTTATTAGCCCCAGGAAATGAATCAGCAAGAATTAATCTGACATGT
AGCCCAATCTTTTTCACAGTTGACCTTCTACCTGCCTCAGCAGTACCTTT
GTTTAACAGACCAATAAAAATCATAAAACGTATTAGCAGGCTTTCCACAA
TGGTAAACACAGGAGTGTTATTGTCAACAATGAGAGCATAAATCATCATA
ACAGACTTATCCTAGATGAGGATTTTCTCAAAGCTAGACTACCTGAATAT
TCGCTCCTTATCAGCATCACTGGATGAGTTGCTGTTAGCAACTGACAATT
TATGGAAAAAATAAAGTCACTCTCATGGTACTATGTTTACCTGCTCTTGA
AGGTGGAGCATATGGGATGAAGCTGGGCAGTCCTGAAGCGACCTTCCCTA
CTCAATATGGAGATAAATACAATATCCATTCGGTATAATCTTTTGAAAGA
TGACATCTTCAAAGAATCTCATTCTTTCCTTATCATCCTATGATGATTTT
TTCATCTAATCCGAAATGTACTATTTTGTTACCAGGGAGTTTCTGACAAA
GGTCCATCGCATCCTCCTGAATCTTCGTGGGGCACATATGACAAAAATCG
TTTCCAGTACCGCTAATATCCCAGCTGCTACATTCCTGGGAGAAAGAATC
ACCTTCTAGGTGTTAATGCTCATATCACATGGTTTAGAATGTCTTATCTA
CCTACTTGTTTGTGTTAGACTCCAGACTTCTTTAAATGCTTCTTATAATT
TTGCTTTCTGTGTTAGTTGATAAAAATTGTCACAGAAGTATCCTATTACT
ATTTACATTTTGGCTCCAGTCTATGCATGTTACTAGGATATCCAGGTATC
CTGGTTATATGGATCTATGACTGACAGATATTTTTACATGGCTTCGACTT
TGGACATATATGATAATACATTAGTCGGGATGACTTAGTCGTGCCACATA
TAGAACACACATTCTGAATTTAATATGAAGCCATGGAGGTCTTAACTGAT
GAACTTTTAATGTATGTATTTACATTAGCTTCCACCATGCAGCTACACAA
GGAATTAATGAGCTTGCGATGGTAGGGAGTGGGAGAGCAGGGGAGAGGCG
GCGGTGGTGGCAAGCCACCGGCGGCCAGGTGAGAGAAATCGCCAAGGGAG
GGGCGCCAGAGGAGAGGCAGCTGTGGGAGGGGGCTCACGATCTATTTCTG
GGGGCGTAGGGTTTTTCACGGGCAACATTATATCCCATCCTCAAAAAAAA
TACCAGCCTCAACTTGTCGCTCGACTAGTTGACATAGACAAGTCGTGGTT
TGTCGCCGACAAGTCAACTTGTCGATCGATAAGTTCAAGTTGCGTGTCGC
TTCAGCGTGTCGTAAGTCGATTTGCGACAAGTAGACTTGTCGTGCGACAA
GTCGCGACTTGTCGAGCGACACTTAATCCATGGTGCATATGTATGTGCGT
AAAGTTTATTCCGGTGATAACCAAGTGTATGGTTTCTCTCATGTTACTTA
AATAACGATAAGCTATGGTGGGGGTGTTAGTCACTTAATGCTAGGTGATT
TTAAGAGTTTATACTTTATAATTATTACCAAAATTTTCCGAGGTGTGAAG
CATATTTTCTGTAAAAACTGAAGCCTTCTGGTTATGTGACACCGTCTCCT
CACTGACCATATTCTCTACATCTAGGTTTATGTAGGCCGAAGTTGTCCCA
TGTAGCGATCATATGTTTGCTAGATTTACGTCAAGTGCTGCATATTTGAA
TGTGTAGTGGATCCAAGACTGATATCAACAGATAGAGATGACTAGGTGAT
ATTCTTATATGAGAACTAAACTTACCTCCTTCAATCTATAAGACAATAAC
AGTGTGGACAAGTCTATATTATGTAGGTCCATTGTTGTATTTTTTTTGAA
CTTCTAGGCAGTAAGTTGTACTGCTAAACTTGATGGCAGTTTTAGCGCAT
AAGTTGTTTCATCTGAATTGGTTTGCATCTGATACTTGCATCATCAGCTT
TCTCAATTTGTAGTTTTCTTGTGCTTTATGAATTTTAACTTCCACACCTT
GTGCGAGCATGGTTATAAATTCTTGCTCTGGCACTTTGTGTAGATTTTAG
TCAGGCTTTTACGGTATTAGTCTGACTACTTGTAGCATATTTTGGATTCT
GTGTCTGGTCTCTGGTGTCTGAAGCCTTAGGAGGCTCCTATTGCTACATG
TTAGAGAAGAGCGAGGCTATTCAGAGACTTGTTGCTTGTTAGATACTAGA
TGGTCAACATCAGACAATTCTACGCATGCAAAGATTGATCGAGGAGCTCT
TTTAAGGAAGTTGCAGCTACCATTAGTCTTAGAACTACTGTCGGACCTCC
ATTGTTGGACCTCCACTATTGCACAGTGGCGTACCACGGCCTCTCTTGCT
CCCTGAAACTAGTAGAGTGTGCATCTACATGCCACTTCTCCCATTCTTTT
TCCTGGCTTGATGCTGTATGCATAAAGCTGTGGCATGATAACTATTTTTT
TGCCTATTACCCACTTGGCTAGCCTATACCTATGTGGCTGATGTATTACC
TGTTAAGTTAGTCATGTTCTGTATTGGACTTTTACTGGTAGCTCCATATC
CAAATTTCAGTCAGTAGTTCAGTTTAGTATACTGGACACGATGCCGACAA
CTCGCGATTTAGCAACATCTGTTGGATCATGGATGTTATTTAGAGTTCTG
TGCCTGAACTTTCTTAGCTTTGGAAGATTTTGCTCATGTCGAGAACATGA
AACCATACAGTCTTTGTCGTGGAAGACCGAGAGCAACTTCCAGTACCAAC
CAGCAGCAGTTGTAGATGCATCACCCTTGCAACCTCCTGGAAGCTTATGC
CGCTTCATGATCTGAGCCATATTTGATGAAGGCCATGACCCTTGGATCTC
CCTGGAACAGATTTTAATGGTCTCCACAACTCCATGAGAACCAAAGACTT
GAAGAAGAGCACTCTCTGTGATAGGCTAGAGTACCTACCGGATTTTAACA
CGGAGGATTATTCTTGGTTGAAAGCCATTGTGATTGGCTCTGACACAAGA
TGTTGCTGTGCATAACAGTGTTCTTGCGAATGGAAGCTTGATGCATCCTT
CAGTTCAATGCTCAAAAGAAGCGAAGATTCTGAATAGAAGTTGGCTTAAG
GGTGCAGTGCCTGAGCCCCTTGTACAGGAGAACTGTGCTTGCGACTGGAA
GCTTGATGCATCCTTCACTTTAATGCTCAAAAGAAGTGAAGATTCTGAAT
AGAAGCTGGCTGTGCAGTGTCTGAGCCCCTTGTACAGGAGAACTGTGCTC
AATTTGTGAGGAGGGGAAAGCATTCCAAGTTTTTATGTGAAAGCAGCAGA
TGAAAGGTTGATGCGTTCTTTCATCGGATGCTTAAAAGCATAGTGCAGAT
TTGAATAGAAGTTTGTTGAAGAGTTAAGCTGATGATCTGACTATGGATAA
TCTTTACCTCTATTAGGTGTTCCAACAGGCTGGACTTAGTTATCCCTTGT
AGAGTTCGGAATTTGGGTGCTCTATGGGATTCAATTGCTTTTATAGCGTG
TCAGGTTATGGAGAATCTTGGGTGGAGCTTATTGACTGAAGTTGGCCCAG
AGAGTATGGTGCCTGAATTGCTGAGCTCTTAGTGCTGGAAAGTGGAAATG
TTTGCTCAGGTTGTGAGAAGGGCAAAGAATTGTTGTGCTTTTTCACGACA
GCAGACGGATGGAAGTTTGCTCTTTGATGTCATTGAATGCTTAAGCAGAC
TGGCAGACTATTCTTGAGCAGAAGTGGGTTGGAAAGATAGTTGATCTTTG
GACTATGTGGATTTGTTTGGATTTAACCTTGTCTGTTATAAGTCCATCTG
TGCATATTGAGTCCGAAAGGGCTTTGAGCTTACTTAGTCCATGTATAGAG
CTTGTAGATAGTTGTTACGTTGGTGTTCTATGGAAGATGGTTGCTCTGCT
AGTCTGTGTATCACTCCGGGAAGGGTCAAAGAGAGATCATTTTGAAGCTC
TCCAAATGACAAAAGCAATCTGGTGATGGCTTACCAACCATGAGGCAAGT
AGTTTCTTATCAACGCCACAAGTTATGCTGGGTCTCTTTCTATTATTTTA
AACGATAATACTTGATAGTGCGCATTCATTAACCTCTAGTAGTATGTTAA
TTTTCAGTTTTATGTTTGGATATTCAAAAACATCCGGTGGAACCCTATTA
GTTTTACTGTAGGATAGACCTGAGATTTTGTTGTCAGTATGCCATGTGTT
GGAGAAGCCTGGCTAGGCCAGTGTTCTAAAAGTTAGCCAAGTTCAATGTG
AGCTCGGGACAGCCGTGTCTGGATGTGTGTTGAGGTGCAGTAGAGGCCGC
ATTGGAGCACGCTGGTAAGGGCGGCGGCCCATCTGTGACTGGAGGAAGAC
ACGGCCATGAGAAGATTTGAGCCTAAGTGGTGGCGTGGGACAGTCTGATG
GGCTGTATGGGATTATCAGAAGTTTTTATCCACTTTAATGTCCTGGTTGA
GTTTGTAACCATATAAAGATGAAGCAACCCTAACAAAGTGAATGGTTCAA
GGGTCAGCTTGTTGTCATTGTTGAGTTTCATGCCCTCAACCTTCCACCCC
CTTTCTTTGCCCCCCTCCCAGTCTCTGCTCTTTGCCTCCTCGTCATCCTC
CTTTGCAGACAGTCAACATATGTTGCATAGGGTGGACTAGGCGCTAGTTC
ACCCCCCTGTCACTCAACCGGTGCATGCCAATTTCCTTTTTCTCGAACAT
ACATCTAAATGCGTGTCATTGTGTATTAGAATGCTGCCGGTGCAAAGTAG
AACGACAAAGACCAAAACAAAGGCTAAGACTGAAGCTAGAAACGAAAGCC
TACACACACACATTATCCCCACATCAATAGACCTAGTATAAAGCTGGAGC
CTGCATTCACCTTTGCACTGCCATCTTCCACGGCTCAACCTCGGCCAAAA
TTGCCTTGACCAATGACCACTGCCTGACAGTCCAGCCCTGCATCTGGCGC
CCAATTTAATGAACACTGGTTGTGTTCATTTTCTGGTGAAGAGCCTGGAT
CTGGTGATTAATTGCCATGCATTAGCTTATCCGAATGTGACTTTTAACAT
GTCATGAAGTTAGGACTTACTGTTAGCATTTTGGTAAGTGATAACCGATA
GCAGTTTGTTAGATACGGTTACAAGGCATATTTACTTGGGTACTTGGAGC
GGCAATCTGATCTGAATTGTATTCAAGGTGACTTCTGCCATTCTACAGTT
CAGCAAGGATCTGATGAGACCATGTATGGTCTCTTCTCTGTAGGTGCAAA
TTGATGCACTTGGGAGTTAATTGAGTAATTGAGGCCTATGAGGTTTCTAG
ACCCCCTCCTGGACTCTGCACACAAACATTTGACTTTCAGGAGGGATACA
GAAGTCGTATCTTGGGAGGGGTGTTAGTTTTCACTCATAGTTGAACTTGT
GGGGTACATGTACAGTTATTGGATCTGCAAGAGGAGTTACTGACAGTAGG
CCATGATCTCAACAACTTTATGTGTTATGGGCTGGGTTTGGCATTGTAGA
TGATAGCCGGCGGTGATGGGAGGCTGGCACCATGACAGGAACGTTAGATG
GGGAGAGGTAGAGAAAGTACTTCTTGCCTGCCTAATTGAAACCTACGACA
CCTCATATAGCCCTCCTTACAGCTGATTCTAGCTCGACCATTACATCCAT
GATAGTGAAGTTTCCATGGAGTGTACTATTTTTATCGTATTAATATTCAA
TGTTTGATTGTTTACAGTTTTGCATATTGAGTGTTATTTATTAACTGTTC
TGTACAACTCTTCTGATGATATTGTAATTCGTATAAAAATGTCTAACACA
ACTGTTGTTCATCTTACAGGTTGAAATCCTCAGCTGGTCCTTTTCCTTTG
GCAGAAGGTATAATTCATTCATGAGGAGGCACTACAAGAAAACAGTAAAT
ATGGTATCGGGATAACTGTTGCCTTTCTGATGCTGAAGGTTCTCTTGCAG
TTATTGAAACTACACCAGCAGATTTTCTAGAAATTCCTGGTTGGAGATAT
GAGAAATGGTCTATCAACCAGCAGGGTCATTAGCATCTGCTCTAGCAACC
CTTGGAAGGTCTTGAATGTCAGGCCGTGGGTGATTGTGTTCATCTGCAGG
CATTATGTCTTGTTGTGGTTTTGAGGGAAATGCAAACTTGTGCTTTTCTG
GAAGCCTCTGCTTTGAGTCAGTGCCATGATAAATTTGGAAGTTCAAAAGA
GATTCTGCTGCAAATTATCTAGGTTACGGCTTACCCAGTTGGTGGGTTGA
GTTGTGCCAGCCCATGATATTTCCAGTTGTTCTATTTGGATGCAGTCACC
AGTTTGGCCAGCAGTGGAGCTTAAGGTGAGTACACCGGTCTGATGCTTAA
GATGTCAGGACTACAGTAAGTTGCTCCATTGATATGCGCCAGGACGTGAA
GCCACGTCGGCAGAATCTTGCAAGGGCTTGTGTTATGCTGTTTTATTGAA
GCTGGTGATGATCATTATGGTCATGGTATAGCAGTGGTGCCATACCCCAG
CACCTGCATATAGACCAAGTTACCATCAAAGCCCATCTGAGTGTTTGACA
TGATTTTAAGGCAGTGGCAATCCCGCAGGACCTACGCATACTTGCTGTCA
CAGCCCTGCTCACGAGTTTAACTGGAACTGAAGATCTTGCAGGTAGAGCA
TTTCTTGGTTGTCCTGGAAGCATGTAATTGATCTTCTTGGGAGTGATGTA
GCACAGAATTGCTAGCAGTACAGAATAAGTTTTGCTCCATCACCTCTATC
TGCATGGTGATTGGTGAAGGAGGAGACCTTTTGATATCACAGCTGGATCA
TGGCTCAGAAGGCTGTCTATAAGAACAGAAACCGGATATCGCTGGCCTAG
GAATTCCTGCTGAACAAATGGATGCCTTGTTGCTCCATGCCATGCATCCT
CATCGAAACACCAGCGCCTGGCTTTGTGAGGCATGCCACCATCACTATAT
CAAGTGTCATGATTATTATCCATTGCCCTGAACTGCTTGCGTCCTGAAGG
CCACTGAACAACAGTGCCATGAAGAAGCTTTCAGATACTACTGGCAAGGC
ATAATAAGAAAGTAAAGTGTCAATTGCATCTTGCGAAATGAAAGTTGGAC
GGCTCAAGTCCATTCGACTGGATATCAATAATATCCTTTTATATACGGTT
GCTCCTTATAGTCAAGGCCACGGAGTCTCCAGTTTGCCACGCCCATTGTC
CCGGCAAAGCATGATAAAGCGAATACAGAGCTGTTTCAGGGAATAAACAG
CCGCGCCGACAATGCATTTCACATAACTACATAAGCACTAGGTAGTTCAG
CAAATGCATTTTACATAAGCGCTAGGTAGCCCAGCGATTGGTATTTAGCA
CAATTGAACAGCGAACAAAATTGTGCTGTGTGATACTTTAAGGAAATAGT
GGGGTCATGATAATAATACTGATGGGATAGGTAGGTTGCCAAATTCCTAA
TTTGAATGTAGTTAGAGTAACGTTGGTGTTTTACTTGCTTCATGAAACCT
GTGTTTACCGTACCGTTTGCAGCTATATGCACGACTAGGTGTTCAACGGC
AGCATAGCAATCAGCCGTTTGAAATATGGTGATTTTGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.