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GrainGenes Sequence Report: AE023149

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Sequence
AE023149
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE023149
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTACAACCCCTCGCTTTCTCTCCGCCTACCCAAAATCTCTCCCAAACCCC
ACTCCACCGTCTCGTCCCACGCCGCCGCCGGCCGAAAGGAGGTAGAGCGG
AGGGCCGCGATCGACCTGGCGGCCATGATGGAGGTATTGCGCGTCGCCGG
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CGGAGCGCGCGGTATGCCGAAAAGAAGAGGTACCGCGACGACGCGGAAAC
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GGGTTAGTCTTCTGGTTTTTATTTGGTTGTTTCCTAACCTGTGTTACACA
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CATTTCAGTTTGTTTCTAACATTTTGTACACGTCAATCTGAATATATTAG
TAATAGTAGCTGTTGTGCATGTGAGGAATAATTGGGTGCATTTTGATCTT
ATTGCTGTGTTGTTTATTTATTTTCTTTGTTGCTTACTTCTGTATACTTT
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TTGCCATATGTTTGATTTCCTTCCTAATTTGCAAGTTGACTTATTTTGTC
TATGGAATGTTCGGTTCATTTTCATAAATTTCTTTGCCTATTCTGACATG
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TTATCAGAATTTTATACTGTATATATTGCAAAATTATGTGAACCTGGAAA
ATAAAACAGATGCAAGCGACTAATGCTGTACTTTATCCAGAGAAGAGGAT
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AGGCTAGTGGAATGGATATTTAAAATTATCTAATATTTCCTTCGTTCTTA
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CGTCACTCAACTCGATGAATCTGTTAAAGGCCTTAACAAAATGTGAACAA
TTTATTGGGTGCAGAGCAGGCTATATAACGATAGCCTGCAAAAATTCATC
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ACGACTTGGCGATTAGTCGACGATTAGTCGGCGACTATTCAGCTATTCAG
CGACTCAAAAACCATGCAAGAATGACAAGAGAAATTCACTTATCTCTTGT
GTTTGTACGGTACAAACATTATCATATTGATTGATGAATTTTTATGGTTC
CCACTTCGTATGTTTCCCCACACCCATGATTGATTTTTTAGATTTGTGGA
ACCCTGGGAGAAAACAATGTTGAAGTATATGTGGATTGCAGAACCTTCTC
CATCAATTTGGACTTTTGGTTCTACTAATTGGTGCATGAAACCTTATAGC
CAGAAGTCTTAGGTTTAAGTATCGGATTTCACAATAGAACAACAACAACC
AAGCCTTATATCCCATGCAAGTTGGGGTAGGCTAGATTTTTTTTTCCGAA
ATGGAGGATGCGACCCCCGGCCTCTGCATCGAAAAGATGCATACGGCCTT
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CCACCAGCTAGGGACCAGGAACAATCGCATACCCCGAGGCGCCCTCTAGG
CGAGACGAGAGCGTACATCCGGATTAGCTGACTCTTAGCGAGCACCCTGT
GTGCACGCCACAGAAGCCGTCGCCGCCATCGAGCCTCTGAACAATCTTCA
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ATGAGACCCCGCTACACCACGCCGCCGAGACCTGCCCCCATCGGCGCAGA
AGATGGAACACCGCTCCACCAGCTGATCCCCTCCAGGCATCCCGGGCTCC
AAAACGATGCCCTCAAGAGGGTGAACGACACCGATGTGCCGCCATCTTCC
GATCCGGAAAAATCACAGATCTAGAGTTTCCCCCAGAGCCTTAGGCATGA
CGCGGGGTTCGCAGCAACGACACCTTCAACAAGGGAACGACATCCGAGGA
TGCCGCCATCGTCGGCTCCGACCGACATCGGAGCCCGGCTCTTGCCGGCC
AACCGCCTCGCCTCACCTGCACCGAAGCCAAGGGCCAGCGCAGGAGAGGG
AGCAGTTTCCACGTCGTCCTGCCACCGATCTGCCCGGAGAAGGACCTCCA
TGTCGTGCGCCGTGCCGCCGCAGCTCCAACGCGCCACCACCACCGGAGAC
CAGTGGCCGCACCACGCTGGAGAGCCACCATGCCGAGGTTCCCAGCGGGA
GCACCACACCCAAGCAGGGAGAAGACGGCCCGCGCCGATTTCCTTCCGCG
AGGGGACGAGGAGGCCTCCCTCGCCGCCGGCAGCGGCCAGGCTTTGCCCG
GCTGCGCCCTAGGGCAGCGGGGGAGGAGGGGGTAAAGGTGGGGAGGGGCG
GCGGCTGGGGTTTCCCCCTCCCGTCGCCTCGCGGGGGGGGGGGGGGGGCG
AGAGGAGGAGGACGTTGGTTGCTCACGCTCCACACCGGTAGGCTAGATAT
GAAACCCAAGCAGAAACTAGTGGAAAATGCAAGTGCGGCAGAAACTAGTG
AAAAGTGCAAGTCAAGCAGAAAATAGTGGAAAGTGCAAGTAAAACAAAAG
AGAAAAAGAGTAAATCAAGGTTCGGACGCATGGATCGCTGATTTCCATGC
AGCCCTATCAAAAGCCAATCTCTAGGTACATTCCAGTCCTTCAGGTCCCT
TCTAATTGCCTCCTCCCATGTCTACTTTGGTCGACCTCTCTACCCCTCCT
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ATGCCTTCTCGGCTTCCACAATATTGATGAAAAATTGCTTGCCCTCCTTT
TGTTCACATTTAGGCCTTATTAAGCCACATGTGAAAAAGCGTGTTGAAGT
GTACATGGGTTGCCCAACCTTCTCCATCAGTTCTGACTTTTGGTCCTACT
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AACATCCATAAACATAGGGAACGATAGTATGCTACATAACGAGAACCTCA
AAGATTCATCAAAATGTATGAGAGTGTGTGTTCTATACAAAAAAGACAAG
AGGAATCTATTACCCATTATAAATTTTATTAAGGACACGGATAGTCATAT
TTGTGTATGAGTTTTTCCTGGTTATGATTTCATACCATTTCTTACATCAT
TCAATTCATTCACATTTTCTGGAAACTCCGAAACGCAAAACCAAACTAGG
GTACAAGTTGAACGATTCTAGACATTTCAAGGTTGAACGTAGATGGTTTC
ATAGTTCAAGGTTTAAGTCAAACAAGCACCCCATATAGGGTTAAGGATGG
ACTTTTTTCTGTTTGTTTCGATGGTCCCAGAAAATAGATGTCAAACTGAA
ACTTTGGTTTGACATTGCTACATATAAGACCTCGTTCGGATGCTTTTTTC
GAACCAGGCCTGATTTGGATGTGAAGTACTCGGTATTTTTATTATTCTTG
GAATATTGTGATTCTAAACTGTGCTCTTACATACTTTGATGTGGTTGGGT
AAAAGAAAACATGTAGTTTTTTTACCGTTGGATTGTCAATATTGTGGTAT
TTCTGGAATATAAAAAAATCCACTCCTCCCCTCTTTTTTTTAACCAAGAG
ATGGGTCTTTCTCTCGGTATATTTATTTCCTCTTGTGCAAGCTGGTTTTC
TGAGTTTTCTTCATCATGTGTGTCTTGATAACCATACCGATTTTTTTTCA
CCATTCTTGGTCATATGTGATTACAGCCAGTCTATTTTTTGTGGAGAGCT
AAGGGCTGATAGTCAACCATTTACATGTATACGTTATGAGTGGAAATGGC
TCAATGGGAAATTTTCATCGACCTATTATATCGGATCAAATCTTCTAGAC
TAGAAAAACAAAATTGCTAACACCAAAATAGCCAAAGTGTCTTTAGTTCT
GATAATAATGCAAAATACTGTAGTGTGTAAATGTGATTTTTAAGTACTTT
GCATGCAGAGTTAAAATACAAGTAAATTAAGCACCAACATAACTGCATTA
TGAAATTAACATGATATTTTTTTCCGTGTTAGGATATAGATGACTAATGT
CACTAGTACAAAACCGACCTTTAGAGCCGGGTTCTTGTACATAGGACAGA
GCTGGTTCTACAATCTGGCCCAAGCTCATAGTCTCTAATATTCGCATAAT
CTCAGCCAGTTCCAGAAAATGGCTCAAGACTTAACCCTCAGACGGCCAAG
AAAATAAACCGCCTCCAATACTACGATTCTCAGAGACGGTTGTTATTCCT
AGCCGTCTCCAGTATTACCATTCTCAGCGTGAGATGCCTTTTTAAAACGC
CTGTCTCCAACTATAATTTCATCAGAGACGGCCTTTTATAATGGCCGCCT
CCAACATTACGATTCTCAGAGACGGCCTTTTATAATCGTCGTCTCCAGCT
GGGTTCTCTCAGAGACGGCTTTTTAAACTAGCCGTCTCAAGTTAAATCTT
ATCAGAGGCGGCCGTAATTTTTGATACTCTCCATTGGGACTCTGAGACGG
CTAGTTTTAAAACCGGCTCTAAACTCGGAAGGTCCGGAAAAGTTCGGTAC
TCCAGTTGTATGCGTTATTTGCATTATTTGCTTCTGCATATATTATTTTC
TGTTGTCACAGAAGTATAAAAGCAGGCCACAAGTCACAGATTACATTATA
TATATGTTGACCACAAATTTTAACCTGCTCAGGCAATGCTGTAGCCGGCT
GCGTTTTCTGTCCGTCTCCAGTTGGAGAGGCGGCCTTTATTCAGAACCGG
CTCTAAGAGTATTAGAGACGGCTTTCAAATTTCGGCCGTCTGAGGGCAAT
CAGCAGAGTCGGTTTTATTTTTTTTGGTGGTAAACCGGCTCTAGTTGCAT
TCTCTAAAGGCTGGTTTTGTACTAGTGTGTACCACCAAGTGAAAGTGAAA
CACAAGTCAAATTAAGTACCCCTCCATATCACAAATAAATGTGATTCTGG
ACGTCGTCACGGTTCTTCAAGATTTACCTTTAGCCACTATTTTTACTATA
ATATATGTTGTACTCCCTCCGACCCAAATTAGTTGACTTAGATTTGTCTA
GATTCGACTGTATCTATGCATGATTTAGCATTAGATACATCCGTATCTTG
ACAAATTTGAGTCAACTATTTTGGGTCGGAGGGAGTATTATGAATATACT
TTTTGAGACAAATCTAAATATAAGATTATACAAGTTCTCAATCTAAATAT
TTGAAAAAATATACTCCCTCGGTCCCATAGTATAAGATTGTATTACAACA
AATATACTCATATATTGCTTTTAATAACATCTTATATTATAGGGCAGCTG
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CATCTATTTGTGATATGGAAGGGGTAGTAAAGTAACCTACAAGTAGAAAT
TTACTCACTGTTTACAGGCTTTTGCAGTTGTTTCAAAAAAAAGGTGAAGT
TAAAATATGATGCGCTTTAAGGCAATGACAATTATTAGAGGAAAATGTCA
TATTGTTGGCTTTTCAAAACTGAAATCATGATATCTACCATATACTATAC
TTTTTGCATATTTATGTAAATTCAGTTCGATATTGTAGGATTTGGGGGGA
ATTTCTGGGATGGGCTTGGCTGGTCCCTTGGACCTCCACACCCATATATA
TAGCACAATCTAGCCTTACATCTTCACTCATACACTGGAATGATCTAGAC
TCTAGTAGAACACTACTACTATACTAACACTCCCTGGAATACTCTAGACT
CTACCAAAGTACTACCACTACACTAACTCAAACTCCAACACTCACTCCCT
AGAATACTCTACCAACACTACTACTATGCTAACACTCCCTAGAATACTCT
AGACTCTATTTTGGTTTCATGGAATTTTTAACATTCTTATATTACTAGTT
GATGCTATAGTTCATTTTATTTAAGAGATGGACAGTATGAAGTATGAAAT
ATGTCTAAGCTATTTTGACTCTTAAGTTTCACGCACCAACCAGTAGAACA
AAAAGTCTGAACTGATGGAACAAAGGTGGGCAATCCACATATACTGTAAC
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TATGTGTGTATATATAAACAAAAAAAAAGTTTATATATATACACATAAGA
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TGATGTGGCTGAAACATGTGATACAGTGGAAAAAGTGCAGTTGAAACACA
CGACACAGTTGAAAAAAGTGCAGAAGAAACAACTAGTACATGGTTATCAG
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TTCATAAGACTTTGGCTAGATGTTCATATCTTGTTGTAATTTTTTCTCAG
TACTTCATTTGTGATATACAAAGCTCTAATGATGTTTATGTTTGTTTGTA
TATATTGTCCATAAGAAAAGTTGATTTACATGTATTTTCACTTGATTAAG
CAGACAGGGTATCAGGGTTTAACTTTCCCTCTTGCCACCTCCATTGTAAT
GTCGGGGGTATGCGAAGATGATTTTGACAAAGCTGATGAAATTATTTACA
CTGGCGAAGGAGGGAACAATTTTCTTGGGAACAGTCACCAGAAAACTAAT
CAAACATTGGTTGGGGGAAACTTGGCACTGAAGGTTAGCTCATGTGGTTC
CCTTGATGTTTTATTTTGTGCAAACCCACTTGTTTAGAGATATCATTGGC
AAAGTTAGTTCATTTAGGTAAAGGGTACCCTCATGTTGACCCACTTGCAT
CTCTAATCTTGTTATTGCAGACTTGATCTTTTTTCCTTTCTTTTTTGTTT
GTTATACAGTCACACTTCAGTTACAATGTTCTCGCCTTATTCTTTTTTCT
TATTATGTAAAATGTTTCTCTTTTACAATCTCATGAATATGATGATTCTT
ATTCAATCTGGTGAGCTTTTGCTAAGTTAAGAAGTAGCTCATCTTCTTCC
TTTTCCATCTCAAGAATTAGTTCTCTTGATTTGAATAGTTGTCTCCTACT
TCTAGTCTTCTACGAAATATTTAATAGCATACACTGCAGTTACCAGTTCT
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TGACCAAGATTTACTCTAAATATATAAAGAATGTTGGTACAAAATTAGCA
TCATTGGAAAGTGTTTTCAATACGAATCCAACGATACTAATTTTACACAA
TATAATCAAATTGTAGTTGTTCTATTTATTCGGTCAAACATTGGTCTGGA
ATGCACGTGCGCCTTATTCCTTGAAACGGAGGTAGTATTTTTTATCTTCT
GAAATGCCGTTTAGTGTGATCTTATTATCAAGTATATGCATATTCATTGA
CAGATTTCTTCCATTAACTCAACACTCTAGTTTGTAGCAAACTGAAGTAA
TTTATCACCAAATTGTCGAAGTAGATCTTGCCTCTTGTCATATGTCTTAA
CCTTTACTGCTTTTGAAACTGAGCACAGCTCATAGTTGCATCTCGAGTAA
CTTGTTTTATGACTACCAATGCTGCATAGGTAGTGGATTGCTTGTCAGAG
AAACTAGTGTGTGGGCATTTTGTTTTTAAATTCAAACTGAAGCGTCTTGA
AGGCCAACTACCTTTGACAACTTCCCAGGTAAATTTACTAGTTGAAGCTA
ATTTCAGCCCCTTATCTTCTTGTTTTTATTATCTCTCTATTCTTATTTTT
ACAAGTCAACTGTAGTACTATGTATTGACTGGACTAGGTTCTGAGACCCT
GGTTGTATCAGATGTCAGTTGTGGCTGGATTTTGGTTGATTCTCTTCAGA
TATTTGGTTCATAGAGTTGCGAAATGCGTATGAAGCAAAAAATGATGCAA
AAAAAAGTAAAGAAAACCGGAAAAACCCGAGTTGACTAGGAAACGTTCTG
AACTTGGGAACTGTCTAGTTTCTTGGAAACAGGAGGATATCCGTTTTTTA
CTGCTATTGTTCTTTGAATTCTGGATTGCACGTTTGGTTTTGTGTTGTTT
CACTACTGTATGTATTTTTCTCAGATAAGAATTTATTGCTGCGCACGGAT
GTTTCAGTTCACTTATTCAGCAAGTTTCCTAGTACTTGATGCTGTTTGTA
GTCTGTAAATAAGAAGAAGCCCCCTCCAGGAAATAATCTTACCCACTATA
ATTACTCCCTCCGTTCACTAATGTAAGACCTTCTAGATATTTCAAAGTAG
ACTAGATTCAGGCTAAAATGGATGAACCTAAACAATAAAACATGTCTAGA
TGCATGCATTTTCACAAAAATCTAGAAGGCCTTACATTAGTGAACGGAAG
GAGTACATAATATCAACCCTATTGGCTGGCTGCTTGTTTGTACTTATGTT
TTGAAACCTATCTGTAAAGAGTTATCTGTGTTCCAGTTAGTTTCTTTGAT
CCTCGTGCTTTTCGTTAATATTTCTACACCTTTTAGATTCTTATACACAC
ATATATGTGCAGGTGCTATTTAAACGTGGAGATGTTCACATGCCAATTTC
TGAATTGCCTGGGTGTGTTACTCGAGAACTGGCCATAATCTGTTTCAGTA
TCCTAAATATTCATACTTTTTTTTTGTTGAGTTTTTTAGGTTGTCACCTT
TCTCTCCGAGTCTTACTCTTTGTCTTTGAGTTTGCTCCATAGGTTGGTTT
GTCGGGACATCTCCTATGGGCAGGAGAACCTTCCAATTCCTGCTACAAAT
TTAATCGATAATCCACCTGTTCCTCCATTTGGTACGCACAAACTTCTGTT
TACCCACTTCATAGTTCACTCCTGTCCATTGTTTTTACCTTCACATGTGA
TTTTGGCTCCTATTCTGCTGTTTATACGATGATTGCTTGCTGTTTTAAAT
GTTTCACATTATCTGATCTTTTTTCCCTCTATTCCTCATCTTACTTTTAG
TTTCGAGTTTTACAAAATATTGTGTACATACACTTTAATGGTTTATTTTA
TCTGCTTCATGCCTTTCGCACTTTGTAGGCTTTGTATACTCTAAGACACT
GCAAATTCCAGAATATATCAAGATACCAGCTGACAGTATTGGTTGTAATT
GCAAAGGAGATTGTTCTACCTCTAAACACTGCTTATGCGCTGACCGCAAT
GGTTCTGATCTACCTTATGTGTCCAGACAAAGGAAAGTGAGTGCTAAGCA
TGCTACATGTAAGAAGATTGGAAGGTAACACTTCATTGAAGATCACTGTT
TTTTAGCATACTTTAACATCAAGAAACTCGCTCGCGCTAATATTTACCTA
AAACGGGAGGTGGTAGTGGCGCTTTAAGTTATCAAGGAACAAAAAAGAAT
GTCTATTATGTACTCTTTGATATTCTTTAATCAGTTGTTCAATCCTCAGA
TTGTGGAGCCCAAAGCAGTTGTGTTTGAGTGTGGTGCTAATTGTAGCTGC
TACTGCAACTGTGTAAACAGAACCTCCCAGCAAGGATTGCAATACCGCCT
AGAGGTTAGTACTTTTCTTAGGCTCCTGTTTTGTTTTATGTGCTATATTT
ATATTGCATTGCCATATAGATTAAGAACTCGTACTGTAAATTCAGGTGTT
CAAGACTGAATTAAAAGGTTGGGGTGTGAGGACGTGGGATACTATTCTTC
CTGGGGCACTTATCTGTGAATACACTGGTGTATTGAGGAGGACGAGGAAG
TTGAATGTTTGATGGACAACAAGTACATATTTGATATAGACTGTCTTCAG
ACCATCAAAGGCCTGGATGGGAGGAAGGTATTAGAAATTTCTCTTCTGTT
TGCTGGTTCAACTTTGGAGGTGGATTGTTGCATTACTGTAATACAGTACT
TCCAATGGCAAGACAATCGTTCTATGTTAAAATGGCGAAGTGAAATCGAT
GTCATGACTAAGAGCTGTTCTCCTATGCGAAAGCACAAACACACCTCTGA
CTAGCAAAATCTGTTTTACTATGTTGATATTGTTATTTACCTTCTTGCTT
GAAGATTTGTTTTGGTTTTGTCAAGAAGAAGCTTTTATTTGTCCTAATAA
TATCTAGATTGGGACTGGCTTTTAGAAATATGAATGAAGCTTTCATTTAT
TCATCTTTCTAGAAGGCAGTACCTAATCTATATTTATTTGGGCAAATGAA
GCAGCATATGCTTTAATATCTAGTACATTGTCCTCTACCTGAAGCTGTTA
TTTTCTTCCATTGCTACAATGTTATGTATACACTATTAATCACATGATAT
TTACTTGTTTTTCGACAGCAAAGGCCTGGCTCAGAACTGCACATGACATC
TCTTCAGGACGAGCATGACTCAGAGGCTTGTCAAGCCCCAGAGTATTGCA
TTGATGCTGGTTCGGTTGGCAACATTGCAAGGTTCATAAATCATAGCTGC
CAACCTAACCTTTTCATCCAGTGCGTATTGAGCTCACATAGAGATATCAA
GCTAGCAAAAATCATGCTTTTTGCAGCTGATACTATACCCCCTCTTCAGG
TGAATCTTCGTGATGAAAAATCGAAATTTTCTTTCTTAATGAGAAGTTAA
CTCTGTAAATGTTAACCATGAAATTCGACGAGATAGTTGAATCATAACTA
TTGAAAGCTTTTTTGTTCAGTTATTTGACCTGTTAGAAGTTTTAATTAGT
TAGTACTCCTGCCATTCCATAATTCTTCTCGTGGTTTTAGTTGTTCAAGA
ACTAAAACCACAACTAGAATTATGGAATGGAGGGAGTAATTATTACCTTC
CCTTGGCCACTCAAGTAAATAAAGCTGCTGTTCCCCATAATCTATAGATG
CAACTCATTCTATTAGTAAACTGGTATCTGTTAAAAATTAGATGGTTCAG
AGTGGCACCAACTCAGTGAGATAGTTATCATAATCATTAAAGCATTATCA
TTCAGTTATTTCTGTTAGTTTTATTTGTTATTTAGTAATTCATCCGTTCA
TTTTCCATGTTACATTTTATCATGTTTTGCCCGATCATCTTAAGAAAACT
TTACTGCTTTTTCCCATGTTTGGTAGTTGCAGCTTATTTTACTAATGAGC
TGTTACCCCTGATTAAAAAGATACTGTACATGTTTTAGGAATAGCACTGA
AAAGGTGAATATAGATCCATAAAGGATAATACTCTAATTAAGATAGCCAG
ACAACATGGCTGCTGAGGGATTGGGTAGACATAGGTTTAGATGAGAGACT
AACTTAGACCCAGATTTTTTAGAGTAATTTGGATCATACACATATAAAGG
CGATATATATTTTATGAAAAAACTTATGAATTGGTTTCTCAAACTCAAAG
GAATATTAGCAGATACTGAAACACAACTTATTACCCCAATTGTACAAGTG
AGGCCGAACTATACATCTTGTTTTCATGCTGTTTCACCTGCCTATGGATT
GCTGACTTGACTGCACTTGTTGCAGGAACTCTCCTATGACTATGGGTATT
GCCTGGACAGTATCATTGGTGCAGATGGCAATGCTGTCAAGTTAGCTTGC
CACTGTGGTGCCTCTAACTGCCGAAAGTGGCTCTACTAGGCTCTTTGACC
TTGCCATGGCGCTTCTTTGGAAACTCCAAGTTAGCAATGCCATTGTGGCA
CCTCTGACTGCTGAAAGCGACCGTGTTAGGTTTTTTGACTTGTCATCGTG
TTTCTAAGGAAACTCTTAACATACTCTTCACAGCATAGATGACATGCTCG
TGACCCTGGTGAAGCACTTCATTATGTGCAGATGACAATGCTTGCTGGGA
TATTTAGCTGACACTCAGCCCATAGCATGACTATATATTTATACATTTAT
AGAGTTTCATTTTCCCATGATTTATTTACTTTTGAAAACTGAATCCTTTG
TATTTCCTATTTGCATTGTCAATATTTGCATGAGAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.