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GrainGenes Sequence Report: AE022106

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Sequence
AE022106
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE022106
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTCCTCCCGTGCCTGAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGCGTGGCGTCTCG
CTTTTAAAACTCACGACGCAGCGGCCTCTCTTCTCTTTTGGAATGGAGCA
GGCCATGTGAAGCCTCTGACCTTCGGATACCTTCCCTCCTCTACCTCGCC
CCCCCGTTCCGTGCCGCGCCGCGCCCCACCGCCGCGTACGCGCGTCGCCT
TGCGGCCGCTAGGGGGGAAGAGCTTGGGGCGAGATCCGCCATGTCGTCGC
GGCCGTCTTCTTCGTCCTCGTCGAGGCGGAGCAGCTCGCCGTTCTCCGCA
GGGAACCGTCGCCCGCCGACCTCCTCCTCCTCCTCTAGCTCGTATATGTC
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TGGACGCGGTCGCCAGTGTCCCGACTGATTTGAGCTGGATTTGGTATGGT
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TGTTTGTAAGCTTGTTCAAGCTATAGGCACCGAATTATATAGGAAGGAAT
TATTGTTGTTGGCGAAGAATGGGCACAGCCAAATGCCTTGACTAGTTAAG
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AACTACATTATATACCAGAGAAACATTCCGATTCCCAGAGTACCATCCAC
CAGTGTACTGTACTACATCATATATCCTTATGGACATTTTAATCTTATCC
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GCTTTGTGGCTACTTTCTTTAATAGTTTTAGAATTTAGACAGTTACCCTG
ATTGTTTCTGCTCACTGTGATAAACACTACTGGTCACAGTAAAACAATCT
CACTGAATTAAAGGCACACCTTTAATGTTTATTATATCAGCTTCATTTCT
ACTTCACATTTAATCAGTTTATCTCCCTTTTGTTTATTTCTTCAGATAGA
GTTTTTGGGCCTTCAACAGCTACAGAGGCTGTCTATGATGTTGCTGCCCG
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ATATTGTTGGATATAAAGCTCACTTGTGTGAAGACAATAATGTTTATACG
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GAATAATCCCGTTAGCCATCAAGGATGTCTTCAGCTTAATACAAGAGGTA
TGCCAGCAAGTGCTTTAGTTACATAGCATTTATATGTTGCATTTGTAAAT
ATGTTGAACTGCCACAACAGATTTATTTTATGTTTCCTTAATAAAGAAAT
GCCTTACTCGGGTGACTAGTTAATCACCTGGTAAATCTTCTCTGAAGTCT
TCTTGGTCATTGCTAGCACAAAGAATTGTTTAGATAACTGTGAATGTCAT
TTTGACCATTGTATCACCAAAGCAGCCCATGTTTATGCATGTGATGCAAA
TTTGTTTTGTTATATATAAAGTCAGGTGATCACAATAATCTGGATTTCCA
AATGACAGCTTCATAAGATTTAAGACCGAGTCTGTATAACTGAGTGGTAG
CCCTTTCTTGAAGATAAACTGCCTGGAAAGTGGAAACATTATGGGTTTGG
AGAGTTATCTAGTTGGTTTATACACAAGGGGCTCCCCACTCACTTCTTAG
TCAACAAAATACTCCCTCCGGTCCAAATTAATGGACTCAGATTTGTCTAG
ATTCGGATATATCTGGATCGGAGGGAGTATGAAAACTCCTATTCATTTGG
TTGACTAAAGTACAGTGCGAGGCCGAGGCTGGTCATAGTGCTAAGTAACT
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AGACTCATATGGTCTTGGTATGTGTGATGTTATGGTAACTAGCTAAGTTA
CTACCTCACTCTGTTTCTTCATTAATTATCATGCCATGTCACCGATTTGC
TTAGTTGGCATTGCATCATGTTACTAGCTAAGTTACTCCCACTATAAATA
GCCTGACAGCTCCATAAACTGTGGCCATAATGACATACTCAAACCTTCGT
GCAGAACTTGCATGTTCCATTTTGTTGCAGATCTTACTGTTTGTCAACCG
TACTGTTTACTCTTTGCTGCTCAGGTTTAGTATTTTACCATTTTTCTGTT
TATACTGAACTTCAAACCTTGATTTTTATATCTCAACTAACAGACTCCTG
GAAGAGAATTTTTGCTCCGTGTGTCATATCTGGAAATCTATAATGAGGTA
TGCTACCTGATTGAGAAATACCATTTTCACAAATTATCCACAGGCACTGC
ATCTACTAGTTTTGTTATCACTTTCTTCATTTGTTGACAACTGCTTTGCT
TGAGTAATTCTTGATACTTGTATGTTAATTTGACTAGTTCCTTTTCTTTC
TGAAAAGTAAATACAAGTAGACTTGTCTGACCCTCACAAAATATTTCCCA
GTTGATATTCTTACATAGAGCATGCTCCTATTTATTATCCTCATTTTGCT
TTGCTCTGTGCTGGCAGCACTGCTGTCACTGGTCGTGTTATTCACACTAT
CACTTTCAGTTGTACTGCGCGTTCCTGGCAGATAAATAGATGTACTTGAC
TCTTTATACAGTGATGGCCCTTTTTGAACTGGATACGTAGCCATCTAGGA
CCAATCCTAACAACCAAATCGAAAGGTCTATAGAGATGAATCCCACTAAA
GATACCAACTGAGCCATTGTTCTGTTGGTTGGTTCCTGCAAGTGGCATGC
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TGGGTGAGAAAGTCTTGTCCTTAGAAAAAATTGCAACTAATCACAGATAG
TAATTAGTAACTAACGATTGTAGTATCTTATTAGGGGCTTATCTGATCTC
AAGTCTTAACTATTATTGGTGTGGGCTCTTGGCTTAGTTAGCTTGTATGA
GCCACACCCATGCCAGTCCAAGTTTTGCAGTAATACAGTTGGATGACCGT
TCCATCCTTCCAATCTTGTGCTGTACTAATAGTCTAATACTAATACTGTG
ATTTGCAAATACTGACTACTGAATCTCTTTGCCTTTTGTAAAGTGTTAGG
AGTAATCTTGTCAATGTAGTTGGCTTAGTCATGAAGTATCCAGGGTATGT
AGGGAGAACTCTAGAATTAAGAACGTTCTAGACTAAGATATTTAGTAGTA
TGCAATATCTAGAGTTTGTAGAGTATTCTAGAAGTATGGTGTAGGGTTTG
GATTGTGCCACATGGCAACAATCTAAAGGGTCATGTACAAGTATAAATAG
GGGTACCACCCCTCCCATGTAACAAGCTTCCTACTAGTAGAAGCCCTGTG
TACTGTGTGTGAAGCACATCAAGACAGAGAGCTGTGAGTGTGAAGCTCAT
ATCTTTAGGAAGAGGGAGATTCCTGGGTGGGAGCTAGTAGCCTAGTTCCA
ACATAAAGATCCAGTCCAGTCAAAAATTAGAAGTCACGCTCCATTGTAAA
TTATCTGTATTCAGAATGTACTTACATCTAGTACTATCTGGATGGCTTAA
ATCTGCTATCTCCTTGCAGGTGATAAATGATCTGCTTGATCCTACTGGAC
AAAATCTGCGTGTGAGGGAGGATGCACAGGTTTAAACTCTACAAACGTTG
GACTATCTTTATTGTTTTGCTTTTGTATGTGTAGTAATTTTGTGTTTAAC
TGTTTTGCATCTCTTCCTGAAACCTATTTTGAATACTTTTTGTGTACCTA
TTTTCTTAGATTTTTAGTTATTGCCTTAGTGCCAGTCTGCTTTGACTTCT
GCAAGTCCTTCGCGCTAATAAGTTTCATACACCAAACAGTAGAACCAAAA
GTCTAAACTGATGAAGTGAAGGTGGCCAATCCACATATGCTTTAACACCC
CCTCTCATCTGTGACTCAGTGAGGCCTACACGTGATAGAAAGAGGGCATG
AGCAAATTTTAATTAATAATTAAATTGTGAAAGCCGCGACTTGAACCCCA
GACTTCTGCTCTGAAACCATATTAAGTTTCATGCACCAACCAGTAGGACC
AAAAGTCCGAACTGATGAAGAGAAGGTGGGAAATCCACATATACTTCAAC
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GACAAAATTTCCAGATCTGAGGTAGTGAACAGTGCAGAATTCAAAAACCT
CCAAATTTGTAAGGATTTGTCATTTTTTTGCGGGCCGGAATACGAACTAT
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GCTCCATGGAGCTCGTCCTACAAAGTGATTTTCCGCATTTCCGCTCCTCT
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AACAAACTGTGGAGATGTTGTAATATTATTAGTTTAGCATTCTTACGTTT
GATATGAATATCTTTCTTACATGTTACCCTTTATTTTTCTTTAAACCGTG
TTGGTTTCTCATGGCATAGTGGCTTGATTAATGGAACACTTCGTAAGTTC
CTATTTGAATTGCATGCTATCGAAATGGAATGCAGTTTGTGGCATCCTCT
TTTGGTAATGAGATTGCTAAATGTCAAATGAGCGTGTAAACTTTGTTTGT
GGACTGACATTTGGTTCTATGTGATTGACGAGTAAATCTTATTTGTATAA
CCGTTAGTTTCTAACTTGTTCATTTATGGCGTAAGCTGTAGTATATTCAG
TAATGCACTGGTGTAGCTTTATGCCTCTATCTACTGCAGTGACACCTCTA
TTTGTGAGCTTATGCTGATCTGGTTTCTTTTGCTATAGGGAACATATGTA
GAAGGAATAAAAGAAGAAGTTGTACTATCTCCAGGACATGCTCTTTCTTT
TATAGCTGCTGGTGAAGGTGATTACAATATATTGCTTTCCTCGACACTAA
TATGTTGTTGTCAAGATGGTAGTGGCAACCAATTTGTATGGATATAAACC
ATAAATGTGTTGTTTCTGTGAGTCACGTACTGTTAGCCATCCAGCATCTC
TCTAAATGCTGTTAGTCAGGTTGTGAAATGAACGTATGATTTTCTTCTCT
CGTAGAGCCAATAATTAGTCATTGATTTTGTGTGATTACTTTTGTTCAAT
GGATTTGCAATTTCTCAGTTGCCTGGTAAATTATTATCTCTCAGTCGACG
ACCAAATTCTTCTTTATCAAGACTACAATCGTGCAACTTCAGTTTTAGAC
ATCTCTAGACATAAAGTTCCACATAATTTCCGAAATGTGCGATTGCTCGA
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CAAACTACCGCTACTCCCTGGTTTACAAAATAGTCGATGTTTTAGCCATT
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TTGCAGGGTAAATACTCTCTGTTAACTCACTTAGTAACTCCTCTCTCTTA
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CCATCCGCCATTAACTGACTCACATTTGTCTAGATTTGCATGTATCTAGA
CGCGTTTTAGTGTGTATATACATGTGAATCTAGAAAATTGCGAGTCAATT
AATTCCGGACGGAGGGAGTATCATTGGTATATGATATGTTATGAAAGAAG
ATATATATATTTTTACTTTGGTAACCTGACACATTATTTAATCTGTACAA
AAATGTTTAGGCTTAAGAATCAGCTAATACTTTTCTAGTACTGTATTCTT
GAATTATTAAATCTTATTCACGAAATTGCCAACTTACAGTTTTACTCACA
ATTTTATTTAGCATGCTAACTCAGTTATTGTATTAGCTCTGAAAAATTAT
CTGAAATATCTTGTACTGCTAAGTAGTTGGCCTGGTTTTTGAAATTCATG
CTCTATAATTTTAGTCTTACCAGAGTGAGCCACAGCCTTATTTATTTTTG
TGATATTGAAACTAATCCTACTTAACATAACAGAGCATCGGCATGTTGGT
TCAAACAACTTCAACTTATTTAGCAGCCGAAGTCATACTATTTTCACCAT
GGTGAGCTCACAAGTTCCTTTCAGTATTTAAGGCATTTAACCAATTTATG
AATATTGCCTTACATTGTTCCTGTATGAAAGATGCAATGTTTTTCTTGAT
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TTTCTTTATTTGGGCTCATAATATTTGTGCGCTCTTCTGCAGATGATCGA
AAGTAGTGATCGTGGTGATGAGTACGACGGAGCAATGTACTCACAGCTTG
TATGTTGTTTTACCCATAAGTAACATTTTATTTTTCAACCGCTACTGCTT
TCTAGTCATACATTTTAATTCTTTCTAGTATTACTTTGTAATGCTGTTTC
CCCCTCCTAGAATCTGATTGATCTGGCTGGCTCAGAGAGCTCTAAGACAG
AGACTACAGGGTTAAGAAGAAGGGAAGGATCCTTCATTAACAAGAGTCTG
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GTTGTTGAATATGCGGGAACAAATTTTGCTGATTCATTGCAACGTGCCTT
AGATTAATACAAGGCCCACTTGTGTTTCTGTTTTTTAAGTGTAATGATTG
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GAAGGGAGAGCAACACATATACCCTATCGAGATTCTAAGTTGACTCGTCT
GCTGCAGTCATCACTGAGCGGCCATGGTCATGTCTCAGTAAGTATCTACC
TGTTATTTGGAGTTTCCTTCTTCAGAACTCACTACATGTTCTGCTGGAGA
CCATCCATGCAGTGTGGAGTGAAACTCGACTATCAATTAGCCTACTGATA
TACTGACTTCTTTATGCAGTTAATTTGCACAATTACCCCAGCATCGAGTA
ACATGGAAGAAACCCATAATACATTGAAATTTGCAAGCAGAGCAAAACGT
GTTGAAATTTATGCCTCCCGCAACCGGGTAATTAACGAACATTTCATTAT
TTGCATGCCTCCCACAGCATGCAAAACTAACTTCCCATAGCACCATTATC
TGAATATAATTAACGAACATTTCATTATTTTGTCTGTCCAGTTAGTTGAT
GAGAAGTCTCTGATCAAGAAGTATCAGAGAGAAATATCATCTCTAAAGCA
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TTTGGCTATGTTATTTATAAATATTAAGTGATTTAAATTTTGACCTTTTT
TTACTCTACTTTTGCCTTGTTTAGTTGGAGGCGGGCCAGGTAAAAATGCA
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AGCTTTTCTGATTCTATATAGTTGTCATTATGCTTCTTAACTAGGAAATT
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TTGGATGAGATCAATGAATTAAGGTCTGCTAGCGGTGATCATTCTTCAGT
AACTGGCTCAGGACCAGATTCAACACAGGTATTTGCAGCTTACACTTTTG
AACTGAACAATGACATGTGGCCATGGCTGATGTTCTCTAATTGTTTGTAT
TCTTACCACCAAAAATATTTTTCTCTTGAGCTCTGTTCATCTCTTTCCCA
GAATACAAGGCACCTGTAATACATGTACTGCCATATGGTGATACTACATT
TCTGCAAAGCAAAGAGTAGATTGATTAATCTGTATTTTCATTGCATAATG
GAAGATAGATTTTATCCGTAAGAAAAATAAAATATTTGTGACACTTATTA
TGGATCGGAGGGAGTACTCATTTCCAATCTAATTTAACTGTATGAACAGT
TGGACACATATGTTTTCCATATATATACAAAATTTATTCTTCACAGTTTA
TATTAGAAGTTGGTCCTGGCTTCAGTAGCTCTGATGCCAGACATTGAGTA
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ATGGATGATTATTGGTTATAGATTATTGTACTTTATATATCAGGAGGGAT
TCACGGAGTCAGATCATTTGGATCTACTAATTGAGCAAGTTAAGATGCTT
GCTGGGGAGATCGCGTTTGGTACCAGTTCGTTGAAAAGACTAATCGAACA
ATCTATAGAAGACCCTGAAGGGACAAAGAATCAAGTAGGTTTCTCTTTCC
GTTTTTTAGCAATTTCTACTTTAAACCTTTTGCTCAATATTCAATCTTGC
TCCACTAAATCAGCAGTCATCATCAATGACACATTATTGTCTACTGCTGG
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TGATATCTTGAGAATTAGGACTTACTAGTATGACATGTAATATCATACTC
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AATTGGATTGCATAATTTGCAAGATATTTTATTTCTAATCAACAAAGTTG
TCTTATTTCTCAAGGATAAATAAGCATGTCTTTGTATTACTGAGGCACAG
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ATGTATGGCTCATGTTTGATATCTTATCTTGCTTCACTTCCTTTACTATA
CCATTTCAAAACTGCCACTTGTGATAGATGGCCCCTCACATCCCATTTTG
ATAGATATATACCACCTTTGAAAATCATGAGCCTATTGTAATTATTTTTG
ATAATTGTATCAATTTTTTTTGATGTTCCAATACCCCACTCTGTAACTAA
TACTTATGCATGTATCTTTTGATAACAGATAGAAAATTTAGAGCATGAAA
TCCAGCAAAAGAGGAGGCACCTGCGAGCCCTGGAACAAAAAATCATGGAA
AGTGGTGAGGCATCAGTTGCCAATGCTTCTATGGTGGATATGCAGCAGGT
AATATTGTCTAGTATAATGATAAGCCTCATAATTATGTGTGTAACCCCTC
TTCCTGCGTAGTAACATGCTGGTTTTGTGAAACAGACTATCACGAAGCTG
ACAACTCAATGCAATGAGAAGGCTTTTGAGTTGGAGGTGATCTTACTAAA
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TACAGTTTAAAATAACTCTTAGCACCTTCTTATTTGATGTAACAGTTAAA
ATCAGCGGATAATCGTGTCCTTCAGGAGCAGCTACAACAGAAGGTTTTCT
TTCCTTCTTCTTTCCCTTTTTTGTGCTTAGTTTCAGTTTAGAATGTTTGA
ATGAGAAATATTTAATTTTGGTGTACAAAAAAATTGTGCTACTTGCAGAG
TATGGAAATGAATGATTTACAAGAAAAAGTTCTCGGCCTTGAGGCGCAGC
TGATACCAAAAACCAACATATCTCCTGAGCAATGCACACAACAGGAGATT
TTTGATTTAAAATCTAAACTTCAGACCAAGGTTAGATCCGTTTTGTGTTC
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TGGTGGACATGCAATACTATATTTAGATGTTCTTTATGGTTGCAGAAAAC
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TTTTTACAGGAAATTGAAAGTGAGAAGCTTAAATACGAGCATCTAGAAAT
CATTGAAGAAAATCGGGATCTAATCAAGCAGAACCGCAAATTAAGTGAGG
AAGCTGCTTATGCTAAAGAATTGGCATCTTCTGCAGCTGTTGAGCTTAAG
AATCTGGCTGAAGAAGTTACAAAGTTATCCATACAAAATGCAAGGCAGGC
AAAGGAGTTATTAATTGCTCAGGAGATGGCACATTCTAGGGTCCCTGTTA
GAAAGGGCCGCCCAGCAGGTAGGGGTAGGGATGAGGTTGGAACTTGGAGT
CTTGATTTGGAGGATATGAAGATGGAGCTACTGGCACGAAAACAGAGGGA
AGCTGCTCTAGAAGCAGCTTTAGCAGAGAAGGAGCTTCTTGAAGAGGAGT
ACAAGAAGAAATTTGATGAAGCAAAGAGAAAAGAGCTTTCTTTAGAAAAT
GATCTGGCAGGCATGTGGGTTCTTGTTGCTAAGTTAAAGAGAGGGGCTTT
CAGTATATCTGATTTAAATGTTGATGATCGGTCTATCAATCTAGCTGACA
TAACTAATGATACAAAAGAAAACAAAGGTGACACGAATGTAGCTCTAGTT
GAGAAACAAGCTTCAGATGATACAGTGAAGTCATTGGCTGCAGAAGAATA
TAGAAGTCCAGAATTTGAACCTCTTCTTGTTCGTCTCAAGGTATATTTAT
ATTTTCCATCTATTAATGCTATGGTGTGTCTTCATGAAGGGGTAGATAAT
ATGTCTATTACTGTGTGTACCGTTTCTCATCGTCACGCACAGCTGGCTGA
AGTCTCCAAACTCTGAGAATAGATTATGGGATCAGTGTGATGCCTTTGTG
TATTGGTAAAACTTGGTGTAGAATACTCCCTCTGATTCACAATATAAGTA
GTATAGGACATTGGCATGGTCTTCAAAGTATTACTTTGACCACAAATTGT
TTAAAAGTATTATTCATTTTTTTGGTATATTCATGACAATTCTAGTAGTA
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GAGGAAGTAGTTGTAAGCCTGCATGTTCCAAGCTGTTGATTGATCCCTGT
ATGAACCTGTGAGGTACGCCCTGCAACAATTAGTTTGGTTACATAAACAA
CTTCTAATTCATATGCAAGGTGGATGCAATTAGCTCGTCAATTAGGTGAT
CTAGTCCAACATAACAGCTATCTTAATTTCCCTTTACATTTTAGAAGTAA
ATTTATAACTCCATTTCATCATGGAAAGCCGCGTCGTCGGCTGGAGTGGT
CTCCAGGACTAGTTTAGCTAGGCCTGGGCAGGTTGATTCTGCTGTATGGG
CTTTAGGCCAGTTTCCTATATTAACTCGCCAATTGTTTTTATCTCCTGCT
GGTTGCTCCAAAAAAAAATCCATTGTGGAAAGCTGCTGGATTACTTATGT
TTCGCTGCATGTAGGCTAAAATTCAAGAGATGAAGGAGAAGGAAACTGAT
CCCTTGGGTGATAAAGATGGCAATTCCCATGTCTGCAAAGTATGTTTTGA
ATCCGCAACTGCTGCAGTTTTGCTTCCTTGTCGGCATTTTTGCTGTAAGT
AATGTTAGGAAACTGTGTTCATGTGCTAAACATTCTTATCGTCTATGTTT
GCTAACGCTATGCCTTTTCTTCAGTGTGCAAGCCTTGCGCCCTTGCATGT
TCGGAATGCCCTCTGTGCCGCACACGAATTGTAGACAGGATAATTACCTT
TACATAGGTTACTTGTTAGCCAAGGTACCAAATACTTCACCACTTGCATG
CTGGTATCTATTTATTCTATCTCAATTCCTAACCTCTGAAACCTTCTGAC
GAAAATGTTTGCCAGGAAACTTTTGACATACCCAATCTCCCTGTAAAATC
ACCATCCGTATATGTTTCTTTTTCTCTGTAGCAAAGAAGGTGACTTCGAT
GTTCCTTCGATGTTGTATTGCCATTCTTTTGGTTCCCCTATAGCTTCACT
TTTATTTCCTTGTTGCATCGAGAGGTTCGACCACTTCTTGACAATTGTGT
ATAGATATGTGACTCAACATTGTCCTGAGAAGTAAAGCAAATTGACGTGG
CAATGCATTCTGCTTTCCCCCCCTAAAAGAACACGATATCTTGAAACTGA
TGCAGTTTGTTGCTTAACGCTTTTGAACGTGGAAATTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.