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GrainGenes Sequence Report: AE006365

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Sequence
AE006365
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE006365
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGATCGGTGGTGGCGCAGGTAAGAGCCCCTCCCTCCCATATTCCCA
TGGCCACGAGCTCCCGACCAAGAAACCTGCGATGGTGGCGGCACAGGTCA
GCATCCCCTTCTCCCCATGCTTTCCCTCTTCCCTCCCCGCTCGTCCCTAG
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GCTGAAGCCCTAACCCCAGCATTGGCGTCATGCTCTCCTTCATAGATGCC
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GCCGAACGCCAAGGTCGCCGACACGGATACGCCAAGTTCTTCATCCCGGA
CGCCATGACCGTCTACACGGACCCGAAGACCACCGGTACCCGATCCATTC
AAGTTCGCCATCGATGACAAGGTCGACCGCTTGGCACCCAAGTTCTCCGT
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CAGATGTGTGCCCCTAAGCCCCTATTTTTATAATATGACATTATCAACTG
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TTCACCCTGTTAATACAACATTTAAATTGCGGGGTTGTTAAATAACTTGA
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GCACCGCATCTGTGCCATGCCATGCATCATATCATAAGCATGCCAGATCT
TCTGCCATAGTATTAAATATTGCATCCGGTGTTTCTGCTAGTGTTTGCTT
CTTCGCGGATTAGACCGATGAGTGGATGCGAGTATCGACAAGTTCTTCGG
ATATGAATCTCCGGCGGTGTTTCCCAGGCGAGCATCTCTTCCCCTTCTAC
CTATTTTGCATTTATAGTCTTTATTTCCTCTTGTTGATCTATTGCTATCC
GTGTCGCGATGCTTTAGTGTTCCGTACCAGATATATCCCGTGCAGCCTCT
ATATTGCCTTGGACACCTCCCATTACCTGTGTTTGGTAGATAGCTGGCCT
TGCGAGTCGTAGTTGCTTGCTCAGGTGCGATCTCGTGTTGTCAAGTACCA
CAGTTGTTGGAATGCTGGCAGATGTTTATTGGTAGAGATGCTTAATGGTG
GAGATGATCATGACCTTAAATACAACTATTAAAATGCTAGATATAACTAA
TGCAGAGGCATCGGTGGGCAATAGATGTTATCTGCTTCTTCCACGCTCAC
TTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTACTTGATACCTGTTCCTTGACTATTCG
CACTACTCACATCCGGGAGGCGTTATGGACCCCCCTGAGCCAGAGCTTGA
TTCATTTCTATTTCTTGGGGCCACAAAGTAGTTTGGGGCTTTATTACTAT
CCTGTACTTATGCCATGTTACTGCTTTATTTAAGATTGTGCGTGGAGCAC
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TTGTACCTGTTTAGTAAGTATTGCAACTCTAATGGAATGTGATAAAAGTG
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TAATGTTCCAACTAATACGGAATAGTGATTAAAACCGCCACTACTTATGC
TATCAGGACGTCCCACTCTATCTATATCTGACTAGTAAGTGCTTCAACTA
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CTCGTTTGGTCTCGAGGGGGAAATACCAGGATGGGTTTGTTTGGTGTTAG
CTTCAGGTTGGATCCGAATAGATCTTTCTTACCCCTCTCTAATAGCCGCC
AGTGATACCGAGTCTCTATAGGTTGTTAGTGCCGCTGCGCTGCCGCTTCA
GTCCACCATACCTATGTAGGCGAGAGCCGCCGAATTCTAGCCTCGCTGTG
TACTGGCCTCAGTACTGACGCTCCTCTTTTTCCTTTGCCCTTTGTCGGCA
CCCCTTTTGTTTTAGCAGGTTTGAGATCGACGCCGTTAGCAGGGTTACCC
TTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGGTTATGGACGCCATTGGTTATTCTTCAGG
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GTCGTTGTTGTATATATATGATCTGTGGGTCCCATCGAGGACTGATGTGT
AATGGTATTACTTCGTTTTCCACCCGCACGAAAGTGCCTGGTGGGCGTCC
TTGAATCGTTTTTATGCGGGTTTGGCGGGAAGCGCTAAAACTTGCATAGG
GCCGATTTGAGGGTGTTACAGAGTGGTATCAGAGCTCAGCAGTTGCGATA
CGCCACAAGTCTAGCCTGTAGGATAACCTAGCTAACGGCCGCAGTAGAGT
GTCCAAACTATTTTGCAAAATCGATTGGATAGATCTGATTAGGTCTGTTT
TACTCCTTACCCCTCTGCTAATCTCCTCTTACCTCTGCGTGTTTTGAATC
TGCTCTCTCCCCTTTCTTCGAGTCTAGGAATTCTCGTGGTTGGCTTTCCG
TCGTACCTTCAGGGTTTCGCTCCCTCCTTTGGTAACGGTGCTTCTACATC
CGGTCTTCGTGCTATCTGAGGAATCCTTCATCTGTTGAACTTCCCTTTGT
TCCTCCTTGTGCCTTCCGGTGGTTTCCGACGCGACGACATCCTCTACGCC
AGATCCGATGCAGAGTCTGCATCACCCCCTCTTGTTCCAAATCTCGTTTG
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TCTCTCTTTCTATCGAGGTTAGAGGTGGCTTTATTTGTTGATACCTCTGC
CTTCGCCTTTGTTTCCGGAGTGTTCTCTCGACGATCACGGACAAGGACCT
CTTGTTAGTGGTGTCGTGAGGATCTACGCGAAGCGAGAAGATTCATATCG
CCAACCTTCTTTCCGGTACCATGAGGCGGATCTCGAGGGCGAGATCCATT
GTTAGTGGTGTCGAATTGTGGCATCCCGCAAAACCACTACAAGAAAATAG
CGTTGTTTTTGTGCATTGCATCGCCATGACCGCTTGCTCATGTCATCATG
CCACCTTGCATTTGAGCATCGTCATGTCATCTTGCATTTGTTCGCATAAA
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TCAAATCTAAACTTTGGTCTTTTCCGGGTCTTTTATTTGACTAAAAACTA
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GGAGGCAGCCGGCCAGGCCCAAAGGCCTAGCCAGCTGGCCTACTACCCCA
AACCCTAATTTAACTAACCCTAATCCCTAACCACTCCCCCAACCTAACCC
TCCCAACTTCCTCCACCCCGCCGCCAAAAGCAGCCGCGCGCGCAGCTCCC
TCCCACTGACCCCGCCCTCCTACCCGACAACTCCCTGGCGCCTAGCCCCA
CCAGCGCGCTCTCCAACCCCACCTGGTCAACCCGGTCCACCCAGTGGACA
GCCGCCGCCGCCCCGCGTCACCACCTGCCCCACCCCCGACCCAACCACGA
GCCGCGCCCCGCTCCCCTCGCGACCCCCACCTATCGCCGGCCCTCCTTCC
ACCAACCGCGCCGGCCGCCGCCTTTTCCCCTCACGGGCCCCGCCGCCAGA
TCCCGTTGCCGCGCGGCCGTCTGTCGCCGGCCGTCAGCGACCAAGCGCGC
CCCGCGTCCCCGCCGTTTGCCGCCTTCGCGCAGGCCCCGTCTCGCCAGAG
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GACCCCGCCCGTGCCCCGCTTACTCCGGCGGCGCCGCTGCCACCAGCGAC
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CGTCGCTGCTCGTGCTACGCCGCCACCCCCAGCAACCTCGGCCTCACCCC
GCCGCCACCAAGCTCGACGTCGCCCACCGCCACCAAGCTCGACGTCGCCC
ACCGCCGAGGACTCTGCTTCCCGAGGCTCTATGTCTCGACCGTGCAGGCC
CGCGTCGCCTCACTCGACTTTCACCAACCCTGCCACAGTGGCGTGTGTCG
CCGTCCCTGCGTTCGCGACCCGAGGCTTCAGGCCATGTTTCTGTGTTGTT
TGTTCCAGTTACGTCTGCAGTCCGAGGCATTCTCTCAGGTTGTGTGGTTG
ATGTTGGAGTTGAGATTAGGGTGGTACTGCCAATTCCAAGAAGGAGAGCC
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TGGATACGCCAAGTTCTTCATCCCGGACGCCATGACCGTCTACACGGACC
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CGACCGCTTGGCACCCAAGTTCTCCGTCGCGACACGACAAGTTCTCCATC
TTGTATCCGAACCTCGCCGTCCCCGTCGAACCCTGAGACCGGACCCCGAA
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AATTCACGTAGCGAACCGATGCCATGTTTCACCCTGTTAATACAACATTT
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CCCGGTTCCGCTTAATATTGCCTAGTTGCACCGCATCTGTGCCATGCCAT
GCATCATATCATAAGCATGCCAGATCTTCTGCCATAGTATTAAATATTGC
ATCCGGTGTTTCTGCTAGTGTTTGCTTCTTCGCGGATTAGACCGATGAGT
GGATGCGAGTATCGACAAGTTCTTCGGATATGAATCTCCGGCGGTGTTTC
CCAGGCGAGCATCTCTTCCCCTTCTACCTATTTTGCATTTATAGTCTTTA
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GTACCAGATATATCCCGTGCAGCCTCTATATTGCCTTGGACACCTCCCAT
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GGTGCGATCTCGTGTTGTCAAGTACCACAGTTGTTGGAATGCTGGCAGAT
GTTTATTGGTAGAGATGCTTAATGGTGGAGATGATCATGACCTTAAATAC
AACTATTAAAATGCTAGATATAACTAATGCAGAGGCATCGGTGGGCAATA
GATGTTATCTGCTTCTTCCACGCTCACTTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGT
ACTTGATACCTGTTCCTTGACTATTCGCACTACCCACATTCGGGAGGCCT
TATGGACCCCCCTGAGCCAGAGCTTGATTCATTTCTATTTCTTGGGGCCA
CAAAGTAGTTTGGGGCTTTATTACTATCCTGTACTTATGCCATGTTACTG
CTTTATTTAAGATTGTGCGTGGAGCACCTGTACTGTTTTGGATCGCGCCA
CGTTTTCGCGGTATCGACAAGCCCAGTCACACTTTCGGGTTCCCAGTCGT
TTACAGCCGTCGTCGCAAACCCTGGGTCCGTTCCGGAGCCGGCCAACTTC
ATTGCGGGTAGCTTAGTGGGGTGGCCCCCTGAAATATTTCTGAATCCTGT
GATCGCTTTGTCGTGAATGCCTCGTTGGGTTTTGAGTTGGTTTTTCCGAG
GTTGATCGAGTGTGTGTTGCTATTTGTGCACCCCTGCAGGGTAAAACTTT
CTGAAAGCCGTGTCCGCGGTTATGGACGACTTGGAGCATAGTATGTCGAT
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CTAGTAATCAGATCAACTATCACGGAATGGATATTAAAATGCCAACAACT
GGTGTATCTGGGGTGGTTTTGTGACATGCTGTACCTGTTTAGTAAGTATT
GCAACTCCAATGGAATGTGATAAAAGTGCCAACAATTGCTGGGTTTTAGA
ATTCCTCAGGACAATTATATCTGACTAGTAATGTTCCAACTACAACGGAA
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TATATCTGACTAGTAAGTGCTTCAACTATAATCGAATGAATAAAACTGCC
AACGGTGTGAGTTCCTTGGTCCGACTTCCTCGTTTGGTCTCGAGGGGGAA
ATACCAGGATGGGTTTGTTTGGTGTTAGCTTCAGGTTGGATCCGAATAGA
TCTTTCTTACCCCTCTCTAATAGCCGCCAGTGATACCGAGTCTCTATAGG
TTGTTAGTGCCGCTGCGCTGCCGCTTCAGTCCACCATACCTATGTAGGCG
AGAGCCGCCGAATTCTAGCCTCGCCGTGTACTGGCCTCAGTACTGACGCT
CCTCTTTTTCCTTTGCCCTTTGTCGGCACCCCTTTTGTTTTAGCAGGTTT
GAGATCGACGCCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGG
TTATGGACGCCATTGGTTATTCTTCAGGGCTCTTAGCCCCATTTGCATCT
TGTCCGTAGTCGGACGCTCTATTGTTTTCAAGGTGATTTGGATCTTCGTA
TATTATATCTGTATTCTTGACTCATGGAGTCGTTGTTGTATATATATGAT
CTGTGGGTCCCATCGAGGACTGATGTGTAATGGTATTACTTCGTTTTCCA
CCCGCACGAAAGTGCCTGGTGGGCGTCCTTGAATCGTTTCTATGCGGGTT
TGGCGGGAAGCGCTAAAACTTGCATAGGGCCGATTTGAGGGTGTTACATT
TATTGAAGTCTTTCTAGCTCAGCAGCTGAAAGACCTACTCCAAGTCAGCT
CTTGAAGAACTTTGTCCTCTGTAAGGATGGGACTATCCCAATGTCTCCAA
TTTAGTCTCGCTGGTCAAGAGTCTGATTAAAGATGGATGGTAGTCTAACA
GTTACGTGCTATTGGAGGGTGAATTTCTGCTGAAAGGTGATATACATGTT
ACCGACCAAATCGAATTATTGCTAAGATTTTGTGATCCCAGTTGTGATTA
TAGCATTTCAATCTTCGTTAGTCAAATTTAAATATGTACTTTAGTTTGCA
CTTACAAATCATATTCTTTCAAATTGTTTTCAGAATGCTGATCAAGTTCC
CGATCGACGTAGATTGATATACCAACCTTGCTATGGCTCCGGAAATGGTT
GAAAGTTTTGAATTGTCGTAAGGGAACATACATATCATAGCGCAGCTGAT
TGAGATGTTCTTGCTCGCCCTTATCTCTTAATAGGTGCCATGTGTTGATG
TTTGCAAGTGTTTTTTAGCACATAGATACATCACTAAAAGAATCATGAAC
TGCAGGCAGTTAAAATTGCCGTTCCGACATAATTATGCTTTCCTAAGTTA
TGTATCATTTAGGTTTTTATTTTGTACAATGTAGATCCATGTAGGAGCAA
CGCAGCATGGGGCCACGTAGCTGACAACCATCACGGAGGCTGGTGGCATC
CCCATGATGCGTCCATCATGCTCATGCTATTGTTCCGGCGAGGTGTTTGT
CTTCGCAACAATAGCGCTCTTCCAAAATGCATTGTGTGATATCAGTTTAG
AGCCGAGCAAACCCTTCAACATATTTTTTTTATAAGTATACATACCTCTG
GCTCTAGAAAATGGATAATAGTTTAGATAGATAATTCTGAAAATGCTATT
TTTGCTAACTCTAAACCGGGATGTGCTAGCTTTTTTTGCTTTTACGAATC
AAGAATGTGTAATATTTTATCTATAGTAGGTTGTCCAGACCTCACTCCGC
TACTAGAGAATGGATAGAGTGTCATCTAGCATACTAAAACTAAAAACAAA
AATATATTTAATCGTTTAATCGAATCATAAAAAGTATGCCGCAACAGCCA
CATTGTGTGACAACACTATGCAGGCGTCTCGCCTGTTTGCTACCTGTTTG
GCTAGTAGTTGTTACTCTGGAACAACTTCTTGGATCGCTCCTTGCTCCTT
GGCTTCACGCATAGTGGTATGTGGATGGCTAATGAAAGACATCTTTCTAA
AACTCTTTTGCACGCTATGTGTATATAAATGAAGACTCAAATAAAAATGG
CCAGGAGACACATCTAGTTTTATTTTAACCTATGCTGCACACCATCGGTG
AAATGGAACAGCAGAGCAAATATACGTAGAAACGGCGCTGCTATAGGTAT
GAACAAATTCCTATCCGATATTGTAGTAGGTGAGCCAGGATCTGAATCGC
ACTGTTTTGTTTGGGTTTAGGCCGGGGCTGGGCCGATAAATCTGGATTGT
ATCGTTTCTTGATGGCCCCACCTCTTAAAATCAACATTTTTTTTTATTTT
TTTTGTATCCCCTTTTCTAGTGCTTGGATGGAGTGTTCGAGGATGCTTGA
GGTAGGATTCGTACGGCAGCACGATCGCTCCCCGATTGGCACCACGCCAC
GCGAGCATTGCCGCTCCTCGCCATCCTTGGCTCCATGGTTCTCCTCCTGT
CAAGGGATGGTGGTAAGCTATAATTGAAAAGAGGCTGCACTGGTGAGGGG
ATTAGAGGCTAGCTGCCTGACTACACTAAGAAGGGCGCGCCACTTGCTAG
TTCGATGATTGGAGATCGATGCAAGCTTCAATCGAATATGTGAGTTGACA
GCTCATTTTATTTACCATGTACAGTATCCCCGTGGCTTGATTTTGAATGA
ATTTTTTGTCTCTGTACTCCACTTGCAAAAATTGATATGCCTGGGCATAT
ACGGAAGTTTGAGTTTTAGGCAGAAGAAACATCTCCTTGTCATAGACATT
GAACAAAAGAACATATTACTACTTTGCACTAAACGAAGAGCAATTCAGAA
TTCTATCTCTGTAACCAAATCAAATTGTGGCATCCGGTGCTATTAGAAAA
TTGTCCAATCCTTTCAAAAGTACTCCATAATGTGCCCCTTTCATTCATTC
AGATTTACAGCTAGCAGGTCCATGCCATCGTTCTTTCCATTCGAAATTTA
TAAAGAACCCAATTAGCCATACACGAACACTTCCTAACAATAAGTAATTA
ATAGTTTAAGAATAAAATCTAGAGAATATCAACGTAGGACATCATATCAA
CTGTTGGAGCATGTACACTTGTTTGGGGTTCCTGGAACAGGTAATAATGC
TTGAGTAGTCGAGGCTCATACACACTAGTACATACTAACATATAGTACTG
TAATATTCAACTGCTAAAACCAAGTACCTGAAACTCATCTGAAAATTAAC
ATGCACTTCATGCCTCATATCCTTCGCAACATTGTAAGAATATTAAAAAT
CACACATAAGAGGATATATGGAAATTCAGATACCTCTGTTTGATCTATAT
TTTCTTCTTGGACAGACCATCCGCCTGAACTTTCAGTGACAGAAACCTAC
GCCTAAGAACGTTTTACATGAGACTTCAATCAGCATAGCACAAAACGAAA
CAGTACATATGACCGTTTCACCGTTGAGAACTGAAGCTACCTCTTGTTGA
TTTAAGTCGTGACTAGAGCAGGTGACGGATTTGGGTCATCAATCATAGCT
GAACCAAGCTGACATAGAAGGTAAGTAAACCTTAAGAAAAAGCAGGTCTA
GAATAAAAAAGCATGAGCACGCATGGGTAACATGCAGGTAGTCACCTCTT
CAGACCCAACCCGAGGGGGCAACTCCAACACCTCTTTAGACCCAACTTGA
GGAGACATTTCCTGGAGTAGGGCTATGTGGGCAGATGAACCAGTAACATC
TTTGACAGCACTGCACAAAGCGGTGGAAGAAATCAATACAAAGTCACATA
ATTTTCACATGTATATGGAATGGAATGTGAACTCCTGCATCAATGAATCT
ACTCATGCTTCAATATACCTCACTTTTGTCCCAAGCGCCAAAGTCTAGAC
TTAGGGAAAGCAAGCTCCAAGACTGTACCTTTCATATACTACATGCCCTT
TATTCAAATAATTGCTAGGTCAAAGATAATCCAGTTTTGCTGCATATATC
AATAACAATAGCATAAGCTTCTAGCATTTTCCCCATGTTCTAGTTGCAGA
AAGAAATTCATTCTTTAGTAAACCTAATAGGAACTTTTTTAGACGAATGT
GCAAAATATAAATGTAATATGCATGTAACTGGAAATATTAGCAACATTTG
GAGACAATCAACCAGGATTCAAACTAAATAATTTGCAGCATTCAAAAATC
TTCATCATAAATCTAACTGGAAATACACCTGCATATGCATGTTGCTTCCT
TTGTAGAAACATCCAATGTGCAAGGAATAACACCATTGCATGACATCATA
CAGTGTACATACAACTAAATATTTTGTGTACTATTCAATAAACAATTTCT
ATAAATTAGAAACTAGTATCAGGAGCTTTGTTGTCTAGAGCTAATTAAAA
AAAAACCTTGACCTAGTGTACAAACAGAAAACATAAACCTAACCAGAGTG
AAATTCATAAAGCAGAAAACTCTACTGCATCACTATGAAAACCACAATAT
ACCCACATGCCACTCATCATGTAGAGAGGCCAAGAGGAACGCAAACTAAT
TTTACCTTTTCTAGAACAGAAAACCGCAATCTCTATTTAAATTTTCTAGA
ACAGTAAACCACAATTGCGAAACTACGAAGTGGATATAGAAATCATAAAT
TGACATGACATATCGCCAAAATCCAAAGAGACATAAATTGACACGACATA
TCGCCGAAACCCAAAGAGACCACAAAGGAAAATTGGTAGGTCTTCCTACT
AAAGATAAATCATGAAACTGGGCTTTGTCTACTTGTAGTATCAAGCTGAA
GATTTAGTACCAATAGTTACGCCTAACACACGAGATCATCTCCCATGACA
CGAAACCCTAAATTATGGTCACATCGGCATAATCTTGGTTGGTCAGCAAC
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CTCAGTGCCCTTGAAGTACATAAAGATACAATCGAAAAAGGAAGACAATT
CAAAAAGAGCTTCATTTCTTGAATTTCGTTTAGTAGAATGCCATCTAGTA
TCCAGTAATTTGGAATGCAAAACGTGGTACAAGGAAGAGTAACCAGATGT
GCCAAGAGCTAGCAAGAACTGATCGATAGGTTCAGGCGCACAGTGAAATG
AGTATGTCCTCTAAACATATGAGTTAGTTCTTTGAACATGATAGAATACT
AACAAACAACAACATTTTCGAAGGAGATAAAATCTTTTGAAGGTAGTGTT
GTATTTTGAAATAGAAGAGCGATGTTCAACTAAGCCATTGTATTTTGAAG
ATAAACAACCTACATAAGCCTTCAAAGTCATATATCACACAATTTTCTAC
CGAAGAGAAGGACTCACCACATTGTCAACAAAATTAGCAAGCCTCGTGAA
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TAGATAAATATATGACACAGAGAGAAAAAACATCTGTAAATTTTGAGATC
AAACTATCCCAAATGAACCTGCAGGAATGAGAACGCACCAAAGAATCAGA
TCAGGCCATGTATAATGTTAAAGATGATCATTATCTATAGTTTGTAGAGG
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TTTACCACTGAGAATTAGGTGTAAAACATCCACCATTTTTTATTAGATTT
CAAAACCACAAATAATCAAAATAACAGTTTTTAAAACAAATCATGCATCT
AGACCTGCCATTTAGCTGAGAGAATTGACAACAAAATCAGATCTACACTT
TTAACAAATAAAAATGTTCTGCGGTAGGGTAAACAGTAATCAAACTTGCA
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TAAATATTTTTCTGTACTACATTTAGAGAATCAATAGTGAATCATAGGGT
AAAAAAGCCTCTCCCAAATGAAGAGAGTGGCAATGAAATGGGATGTATGA
TAATAGCCCTTCAACTGAATTGAATAATTGGGGAGATAATAGGATCAAAC
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GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.