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GrainGenes Sequence Report: AE034683

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Sequence
AE034683
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE034683
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTGGACCGAATCGGAGGCACAACGCGCCCGGTGCAGCCTTCATCTTCCT
CCACGCCGTGCGTCCCTTCTCCCGTTCCCGCGCCTCCCTCTTCCAAGTTA
TCGACGCCCGTTTCATCCTCATCCCAGCGCTCCCCGTGGGCGCCGGGCTT
GTGGGCGCCTCCTGCAACTGCCCCCGCGGCTGGTGGCGCCCTCTGTTCTC
GACCGGGGGTTGCCTGGGCCGCGCGCTGTGGGTGTTCGACGTAATGCCCA
GCCGATCCACAGATGTATCGGTGTAAGTATAGACGCGCACAAGCTCTTGC
TTCCTGGCTTCACGGTGATCCGAATTCTTCTTGTGCGTGGTCTAAGTTGT
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GATATATTTATATGTTTACCAACAGAACCAATTACATTCTGTCATGCCTT
TGTCATGAAAACTTGTATCCCTTTACCTGTATGCATTTTATTCACAGGGT
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TGTCAATTGTCCCTTTCTGCAACTCATCCGTAAACAGTTCAAGTTTGATT
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TGCACCGAGAAGGGACACAGCTGAGTGAATTTACTTTATCCAGCACAATC
TGTGCATGTGCTGCAAAATATGCTATCAATGAATGTAGACAATTACACAC
TATTGCACTCAAACTCGCACTGGACTCCAATAGCTTTGTCGGAACAGCAA
TTCTAGATGTTTATGCAAAATGTAATATGATTAAGGATGCCTGCTGGGTT
TTTGAGAAGATGCCTGATAAAACTGGAGTTACATGGAGTTCATTGTTCGC
AGGATATGTGCAGAATGGCCTTCACGAAGAAGCATTGTGTTTATTTCGGA
GTGCCCAAAGGGAAGGAGTAGAATTGACTGAATTCACTCTTTCTTCTATC
ATTAGCGCATGTTCAAGCTTAGCATTAAAAATTGAAGGGTCACAAATGCA
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CTCTTGTGGATTTATATGCAAGGTGCGGTCAGATTGAAAACGCTTATGCA
TTATTCGCTTACATGGAACATAAGAATGTTGTCATATGGAATGCAATGAT
TGCTGGTTTTTCGAGACATGCCCATTCTTGGGAAGCTATGATTCTGTTTG
AGAAAATGCACCAGTTAGAGCTTTTCCCGAATGAGGTGACTTATCTCTCC
GTTTTGTCAGTGTGCAGTCATGCAGGTTTAGTTGAAGAGGGTCGTCACTA
CTTTAACCTGTTAATGTCTGATCAGACTGTTGAACCTAACGTCCTTCACT
ATTCTTGCATGGTTGATGTTCTGGGACGATCTGGGAAGACTGATGAGGCC
TGGGAATTGCTTCACAAAATGCCATTTGAACCAACTGCTTCTATGTGGGG
ATCTTTGCTTGGGTCATGCAGGAACTACACTAATAGTAGACTAGCCAGAA
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GATGACAAGAAGACATTTGAAGGATAGTGGTGCAAAGAAAGAACCTGGCA
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AGAAAGCACCCAGAAATCAAAGATATCTATAATAAGTTGGAGGAAATTTA
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TATAATACACAAGAACCTTAGGATCTGCGGAGACTGTCATTCGTTCATGA
AGGTTTCAGCCCATATTACCCAACGCCTAGTCATTGTCAGAGATACCAAC
AGATTTCACCATTTTAAGAATGGCTCATGTTCTTGTGGGGACTTTTGGTG
ATGTAGGACGGAATGCAGAATGGCAGCCATCTCCAATGGTACTCTCTTCA
TGTAGCAAATTATTGCCTGTCAGTAGTGGCACAGGTGCGCTAAAGATCTA
TGTCAGGAATGATTCTTGGTAGCTTTGTCATTCAAGTCAATAATGTCATG
CTACTGGCCCCAGTGGATGTAATATAAACACTCGTCTGATCGGCACATAA
GAAATGGAAGCAGATGCAAAGTCCGTGATTAACTGAATAAACTGCGTTAC
CTATCTTGTAGTACACTGTATTTTTTTCATACATGACAAGCCACATTTGT
TGGTGCTCCAGTAAAGATATACGTGGGGAGTGGATGAAAGATACGTTCTT
ACAGAAATAAACATAGGAAGTGGATTTCTCTCACATCAACACTTGCTGAT
TTCAGTGCCTGAAGAAGTCTGCTACGCCACTTACTTGGTACTACCAGTGT
AATTATTGAGAACTGAACCAACTGATGCACACTGTGGTTCCAACTCCTTA
TGGTCGAATCTTTCTCATCATTCTTTCCACTCCAGAATGATGAACTCTGG
AAAGCGGTATATCTTGGCCTCCTTTTCCAGCACTGCTCCTGTCATATTCA
ATTTCCGAATCCTAATACTATATTAAATATCTTGTGTTTGCACATAATTC
GTACTGGAAGTTCGTGGCATTAAGAAATTGAGTGAAACATACTCTTGTCC
TCCCTCCGTTCAGAAATATAAGACATTTTAGCTTTGTGAAACAAATGTAT
CTAGATGTATTTTAGTGTATAGGTTCACTCCGAATCTATACACAAAAGTC
ATCTAGATACATTCGTTTTACAAAGCTAAAACATCTTATATTTCTAGACG
GAGAGAGTAGTCTTTAAACCCAATCATCCATATTTGTTGCAGTTAACCAT
AGCAAAATTTCTTTATTACTTTAAATTGACATGGAGCTTTGATCATATGT
TGGGGGCAATTACACCTTTTTCCAAGCTTTTACCTCACAAGTTATAGTAA
TCTGCCATTCTAGGGTCTGCGCATGACAAGGGGGAAAGTATTGGATAGTT
CAGAATTAACTCCAAAACACAATGACCCATTTTTTTACACAAGCTCCTGA
GGTTTCTTCTGTGCAGCACTGGAAAAACTTGTGCTGTCTGATACTTCCTC
TTTCTTTTGACAGATCCTGTTGCTTCCATTTCTGTTAATCTAATTTTCTT
ACTCACATTCTCTTGGTCGTTTTTCTTAGTTAGTCTAGAATGTTGCCATT
TTGAGGCATACCCCATCAATAATCTGTACATCTTTTCATCTCTCATCTCT
TTGTACTTCGGTATAACATAGCAGAAGGTATCGACAGTTCAATACAGTGA
AGATGTTTGTCCTTGTTCTTGGAAAAAAGATGTATGTCCTTGTCATTTGT
CATCCTGCCGAACTTACTAGCTGTGCACAGTTTTCACATCGTGGTGCAAC
CAGACATAGCTTTGGTTCTTGCAGAGTCCCCACTAACTATCTGCGCATTT
TACATCTGTTTCTCAAGGAAAGTACTGTTTGTGTACAAAAGCTGGCGTCT
AGAACCACTAGCAGGCCCCATGAAAGGGAAAACAATGCATATGAGAGAGG
ACCATTCATCAGGTTGTCCATTCTTTGTGGACCATACACCATGAACTTCA
TGAAGGCTGCAGCTACTTGTAAGGGAAAAGAGATCTTGTGGTTGATGCCT
GATGGGTATATCATAGCATTCCATACGTCCAGTTTGAGTTGCCCCCCTAC
ACGCTAAGTTTTTACATCAGGCCTTTGGTAGTCGAGCATATGGCTGTCTA
ATCCGGTGGTGGTTTCCGTGGCTTGCCTTCCAATTTACTATCGTTGCTTG
TCATATGTATTGTTGCTTATAGCTATCTGGTCTCATGCTTTTGGGAGCCA
GGGTTTGTCTTGCCAAACTATGAAACTTCGATTAGAATTGGCCCATTCTT
AATTCGATGCCAAAATTTTGGTAAGATTATGTTTTCTTATGCCATTTGAT
TTTGTTATTGAACGAAACTGGACAGCCAATCTGGGCACCTGGATTTTGGC
AATGCCACAATTTGGCTTGGTTTCGTTGCTCTGTTTGGGTACAAAACCGT
ACTGACCAAACCTTCCTATCTGATTTAGCCCTGACATTCACATTGAAATG
AAACTTCAGATTTAGCTCTATAATTTTACATGGGTGACGTGATTAGTTTG
TACTTAGTGGTTGCAGCCTTTGACAATTCCTTTCTTTTCCATTAAAAAGA
CGATCTCTTTTTCTTGGTATGTGTTAAGTAGACCAGGCGAGGGTCTACTT
TACCATAATGGCACTCACATGACTCTTTTGTACTACTGTTTATATAAGCT
ATTTGGTGTTCAAAGGCGTTAATCATGCAGCCCCGGGGTGCCCCGGATAA
GGCTCATTGCCATTAGGGAAAGTCCCGCTGCACATGGCTCCTGTTCTTGC
TAGCAGACAGGAAATCTTGCTGTTGATACGGTCATTAGCCTATAAGTTTA
ATCATCACAACCACGATTGCTGCGGGTTCCATTCAGATGACTCTGAAGCC
TGCATCGTTCTTTCACTGAACCAGGTCAGTCCTCTAGTACCGTGTTCAAT
ACTCTATAACTCTAACCGTACTGACTTTAGCAACTAGATCCTTCAGCTAC
TTTGTTTTTTAGCTTCGGTGTGTGTTCCACAAGTGGACACGAGTGCAAAA
ATTTGTTCTACAGCTAGCTACTGTTTGACTCTTATTATGAGGCTGATAGC
GCCACGTCAGTTTAGTTAGGCCATGTTTCTCCAGGCATCTACTACTTTCA
ATAATTGACCGGCCGGCCAGAACAATAACCTGTAGGCCTCGTACAAGCCT
TTCTAACATAGGCAACAAAAGCAGGAGGCAGATCTCCAATTTTCCTTTTG
ATACTTGCTGCTGGGAATCTTGTTGATTATTGGAGCCTAGTGGCTTTTTG
TGTCTGATACTTGCCTCTTAGATCATCAACTTAGCCAGGCTTTTTCTTGC
ATCCTATGAGGGCAAATTGAGCCCACTTGCACACTTAAAATTTCTGCCGA
GCCTTTCCTTCCCGAGGGAACAAAAAGGTGGAGACCGGCTATTAATAGAA
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TACATCGATTCTTTAATGGTCCTTTGGCATCTAGGAGTATCAATCTTAGC
TACTGATTGTTTAGAGAGAGGGCGAGAAATGCACTGCATTGTACATTGTA
TTTCACGTACAATCACTCATTGCTTATGTTAGGTGAATGAATGCATTGAA
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CCAATTTGATTGCATGAGGTGTAGAGCCACAGTAGTACTAGAAGAGGTGA
GACTGTAGACAAGCCAGAGAACAAAATCCCCATGGGGGATATTACTTTGT
TTCTTCAGGAGGCAGGAGATGATACATACATCACCTTCATAGTTTGTTCT
TGGACCCACTACATACAGATGACACATACATACATGCTTGCAAAGCATGT
CCTTTTGTTTTTCATGTTTGTCACCATCCCTCCATCTCTCTCACCCCCTC
TCCTTTTCAAGCTGATGTTTCCTGAAACCTGCCACCTGCTAAGGGCCCCG
TACTGTGATCCAGTAGGGTTTCTGGAAGACAAGAAGAAAGAAAACATAGA
AAAAAAAGGGCACTCTGGGAGGAAGATTGCCCGGGAAACAAGGGATCTCC
CCACTTCGTCTTCCTTTTGCTTCCAATGGTCAATTCAAGCCTGTCACTTA
GTCCAGAGTCGTAGCAGCCTAGTTGGCTGATAGTAGTAACTAATTGCACT
ACTGGTTGTTAGGATCCTGCAAGCATGGCTTCAGATCTCCTCATCACCTT
ATGAACTGCCCCTGTTGTGAAAATAATGCATTTATAGTTAATTTTGAGGA
ATTCTTAAGGTGTAGAACAACCTTACTAAAACATGAATGCAATTGAGCTT
GGTGATGTTTGCAGTACTGACCAGTAAGTTGGCACTGTGGCCACTGCAGC
GTAGGGGCTCTGGTGGGTGTAGCCGTACATTGGCGTCTTTGCTTCTGCGT
CCTCTGGCTCTGGTCCGCAGTCGAGGTTGACGCCGAACAGACGGAGATGT
CTCGACGGTGGTGCTGATGCCATGCTGCTCCTCTTGGCCTCTGCCTCTCT
GGGCGACTCACCTGCAAGAATTCACCAGAGGATCATGTAAGAGGTGTGTA
GTTTTGTTGCAAGTTATTACAGTGGTTTGTTCTTGCGTGTTGTATATACC
TGCATGCAGCATGTCGCTGTGATCTTGCTCCACCGAGCGGCGATAGGCGT
AGGAGTTGGCAGGGCTGGTAGGGTATGATCCCGACGTGCTGTAACACATG
GGGCTCCAAGGCTGCTGCTCCCCGGCGCTCAGAGCAGGTGGAGGTATGCG
CACAGGTGGCGGCGGCGCGCTCTCGCCGCGGCGCCTGCAGCCGATGAAGA
GCCTGTCGCCCACACCAAGGCCGCGCACCCTCTCGAAGTGCACGACGTCG
CCAGCTTCGAGCTGCTTCTCCTTGACGTAGCGGCTCCAGCCCTTGGTGAG
CACGTAGCTCTGGCTGCTCGTCCAGTACGAGTACCGGAATCGCCAGGGCT
TGCCGGCCTCATCCTCGAAGGACAGGAGCAGGTCCTTCTCGCCGGGGGAG
TCACCGCCGTTGAGAGGGAAGTACCTCTCCGCGTGCTGCTTGGGGATCAC
CAGCCTGTTGAGCTTGCCCACGTCACTGGGCGTCAAGGGCTTCTCGAACA
GATGCTCCCTCTCGTACTGGTGGTGATAGTGTAGGTTAGTGTACATGGCT
ACCCCCCATGGCCAGGCCTGTGGGTGCCCCTGGGAGAGAGGGTGCATGGC
CATTGTTGCTCTGGAGGAAAGCTACCTAGAGGTTCTTGTCTATGCAAAAG
TTGGACAGTGGAGAGAAGAAGAGAGGAGAGGAGAGGCAGGACGATGGTGT
GGTGTGTTGTGTAGAGAACCATGCATATGTCATAGCTGGGCATTTATAGC
CTCCCAAACTTTACACGGCTTGGAGGTGTCTACATATAATAAGCAGTACT
AGTACATATTGGTATTTACGCAAGGAGGACTTGGTGCATTTGATCTTGAA
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GAAGGGGCTTCAAAGAGCTAAGGTTAGAATATATAGTTCCAGTGTAGCTG
ATGAGGAATGATCAGGTGGTGGTACTAAAAGTTGGTGCCTGGCCATTGTG
GCCTAATCACAGCCATCCAGGAGGTGAAGCTGGGTGGCCCCACCATGGCT
TTCCATGTGCCTGGTTTTGTTGGGGCCTATGCAATGTGATGTAGTAGTAT
GACCATTGCTGTCCTTAACTCCTCATTTTAACCTGTAGAGGTCCAGGTTT
CTGGTGCGGCAGTGCATACGCTGGACATCTAATTTCTATCTGCCCTCGGG
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GTCCACCCCATTTGTAACTTTTGTGTAGACATGGAGGTTCCCTAGGGACC
GATAGATTGCTAGTACTTCTTAAACCTGTTGTCCACTTGGGGTAGCTGGT
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CGCCAGCCAATTTTTTGATATCAGATTCAACACAATCAAGGGTTTTGTCA
GGCCTGTCTCATTCAATGGCATGGCTGACCACCTCTTAAGAGGACAAGGC
CTCCAAGCAAAATGACCAAGCTGGTTTTGGTTGGACTCACACACAACGAA
TTGAATTGAGCTGTGGCTGCTGTAGGATATTATTTCTATTAAAACCTTTG
GCGTAGGACAACCTGCCCTGGTCTGGTCAGGGGCTCAGGGCACGGCACAG
TGGGCAGCTTGCGTGGGGGTAAAGCGACTGTCCGTTACTCTGCTCCTTCT
TTGTTAGATAGATGATGCCGTTTGGAGATTAGTGCTTCTTTATCATGCAT
TAGGCATATGGGAGGCACCTCTTGCTGTTGGAGGAGTGGAGCACATAGCA
TTAAGATGATCTGTTTTGTTACAACTTTAGTGGGAGATCTGTATCAGATT
CCGTAAATTATTAGGGATAAAACGATCAATGTCGCTTTGCTTGCTCCTTT
GGAGACAGCCATTCGATCACATGGGTTTGAACGTCATTACATGTCTAGAT
CCATTGTGTGTGTGTGTGCTCACTAATCTATGTGATTATGTTAATTGACG
TTGTTATTCGGTCTGTCAGCCTTGGAGAAACCGGAGGGGCCAAGAGGGGG
GCGTCTGCTATGTCAGCAGGTCCTGTTCAGAATCAAATCATAACGGTGAT
TTAACGGATCTCATTATTAATTGCTCCATTCATTGCATCAGTTGCTTCTT
GATTTCTTACATTAGACCTCTTGTTATATCACTTCTTATATCATTAGACC
TGGTTGTAATCTCAGACATTTTTTTGACTTGCCTATTGTTCTATGCAGCT
AGAGAGCTCCAAGTCCCCAAACGCCAAAATATTCTAACAGTGAAGTTGGA
AATGGGATCAAGATTAGACCTGCGCACAGATCCTCTCTTCTCCAATTTCC
AACAAGTTCGTGAATGAGATGATACACTTTATTGTCCCCCGTTCCTTCCT
CACTACTACTAGTATGTGTAAGATCCCTTGGACCTTGCAGTTCCTCCTGT
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CGCATGCACATAAAGATACGCAATAAAGACAGAGAATACAATGTAAGTAT
ACTTATTCATGATCACGTTAGGGGACAGTTGACCTATGAGTATGAGTTGG
ATTGAGTTGAGTACTACTAGTTATCCCTATATACCTTCGGAAATGCACTT
CTAAACCTGACTTGAATAATGCACTAGATGTATCAAAACGTAGTGTATAC
TTTGTTTTATAATATAAACTAACACATTATTATGAAAATGGATGGTCAAA
ATGATCTTGGAGGCCATGTCAATATCTAACGTTCTACATTATGGTTGGGA
GGCAATAACATACTTTTAGTTAGGTAGGAGTATACTACTAGTATTGTTTG
TGTCCTTATTAGTAGTTGTAATAAAATGGCAAAACGCATTGGATCACAAT
AACTACTGCGCTACTACTACTACTAGATGGTACCCATCGGCCGGCATGCA
TGCACTGGTTGGTTGGTTGGTTGTGAGTTGTGCCCAAGTGTGGCATATTT
AAACCCGGCCACGAGGAGGAGGAGGGAGCCACGCAGCTTAGGTAAACTTA
ATTTCCCATGGCTCAATCATGCATGCAGCTCACCTGCCCAATCTCTTTCT
GATAATGCAAGCAGCTGGTTTGGTTCTCTCAAGAGTCCAGGCACATGAGC
GAGCCGGTATCCCGTGGAATTGAATATGGGATCACTCGAGATAAGGGGAC
ACACATGCTAATGCCCCTCATTATGCTATTCGATCCCGTGGAGCGATCTC
TTCCTTTTCCATGAGGCCACGTATGTTTTGCCAGGTTCATGCAGGTGTAG
CTGGGACTGCGAGCCCTCATGGACGTGGACGTGGGGAGCATATGCTACAG
CGCCTCTTCAGGATGATGGTGAGTACAGTGTTATTTTAATATCGTAGTAC
GATCTTTGGTATATATTTGTACGGTGGCTTGTACGTACATCTCTGGTTGT
TGTCTATGAGCTCTGTACAACGTATATTCCTACCTTCCTTTTTGGAAAAA
ATATACTCACACATGTCATGAACTACTGGGGGCTCCGTAAGATTTTTTTT
ATAAGAATTCCGTAGGACTTTAATTTCATAGAATTATTTGATATAGACAC
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AGGCCCCCCACTATTTCTAGAGACTTTCGTACAGCTCAAATTTCATAAAA
TTCCTAGCAAACAGTTAGACCAACCCAATCACTTTTTCTCTCAAATTACT
GTGGAGCATCTAAAGAGTGATGCTTGAAAATTTGTTGTTGTTTCTGTTTC
ATGCAAGCTTCAGGAAGTCATTCCAACAGACTACAATTCAAGTCTTTTTT
CTAGCTTTGCTCCGTTTAATTAGGGGAAACTCTTACTAAGGGGTCAAGTG
GATCCCGACAAAGTCCCACTTCTAGTTTATTTGCCAAAACCTAGTTCAAA
ATCTGAGCTAAAATTTAAACTAGATTTTGGAAAGTGTGACTTTAAAGGTG
TCAAGTGTAACTCTTGCCATTATTTGGATTTATTCTAGACTTGTTGCATG
ATATTCACGGGCTAACTTGAATACCCTGATGGTTTTGGCTGGGACCATGT
GTAAAGGCCCTAGACGCTAGTATTATCCTGCAATTGTTTATGTAGCGCTG
CCTAAATTTCTGTACCAGCTGCGAACTAAATTCGATATCTTTTGGGCAGA
TCCGTGTGTATGCCGTGGGAATGCGTAAAGGAGAGGTGCAGGCTGCAGAC
AATCTGTAGATTGAAGCTTTTCTTCCCTGCGCACTGATGACTGACTTGAT
AGAGAAGGTCTGGCCGGCCAGGCCAGGAGGAGAGGTGGTGAGATGATGGG
GAGAGAGAAGCAAAAAAAAACTGGTATGTTATCAGATGCCTTTTCACCGT
CGCAGGGCCTGCATGGTGTCATGTTAGTACTCGCTTTCGGTCAGCATAAA
GTTGGTCTTTAGCGAAGGGAGACAAAGTGGAAGCAACGGCTCCTCATTAC
CACGAGCCTCCACAAAAGGGTCAACATACTACTCCTACTGAATAGTTAAC
ATGCACATTTACACTTAGGGTAGTGAAGAATATGGCTATAGTAACGAAAT
TGCAACAAAATTACAGTGCGTCTACTCGACACCGATGATCAAGGGGGAAA
ACCACCCACTTATGTATGCTGACACCAGCTTACAGTAATTCAATAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.