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GrainGenes Sequence Report: AE018965

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Sequence
AE018965
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE018965
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCACCACCACCATAGCACACAAGTGGACTCCCCCCCAACCCAAACAAAC
TCTCCGCAGGCCGAGGAGAGAGGAGAGAGGAGAGAGGAGAGAGGAGAGAT
CGCGGCGGGCAGGCAGGCGGCTCGTGTGTGTGCGCGCGCGCGTGCGGTCG
CGTAATCGCTGTCGCATTCGCTCCTCCTCCGGCAGCGGACACCGCACCTG
CGCACCACCACCACCACCACCTCCAAAAAACCCAAGTACCACCAAATCCT
AACCACCTCCTAATCCCCATCCACCACCACCACCCCGCTCTCCCGCTAAC
GCGTTGCGGTGCTTCCACCGCACGCCAGATCGGTACCCGCGCTCCGCGGC
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ATGCCCTTGTGATCAGGTATTTAAGAGCGGCCCTCTATTCATATCATCCA
AAGGTAAAGCTATCTGCATTGCACATCATTTATGTTCTATCCTTTTTGGC
TTGGTGTTGCTTAACTTCTTTCTTTTGAGGTAAAGCAAAATTCCGTGTGT
GTCTAGTTCAAGTGTTCACATTTGCCTTTAATACTGTTGTTAAAGGTGAT
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GAGTTGCTTGTATTTTTCTCCCTCAAAAACGTGGAATTTTTGCCCTCGTT
TCATTGGTAGAATGAAGAGTTCATAATTACAAGCCTAACCCACATACAAC
ACTACACAATCCTGCTGCACCTGTTAGGATCTGCCGCAACCCTGTCACGC
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TCCACCACTCGGGAATGTCGAGTTGCGTTTGTTGACAACATGAATCCGGT
GCTTCAATTGGTTTGTAGGTTGGATCTGTAGATGGAAATGTATCAATACA
AAGGATTAATAACACTATGTTAGTTATAGTTCCTGTCCATGTCAGAAACT
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TAGTGTCTTCGACTCTCCGAAGCAGGGTGGCCCGGTTCTGCCCTTCTTTG
CAGAATTGGACTCCCCCTTCCCCTCGGGGCTTTGGTGGGTTTTGGCGCCC
CTATGCTTGTGGTTGGCTTCTAGGCTATGTTTAGTTTGGAGGTGCCGTTG
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GTATCGGCCTTTTCTTAGGCTTGTAAAAAAACTTCTTTTCTATCAATGAA
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ATGCATAAGCCTGCTTATAGATTCCAGTGTGGAGAAACTGCGGTGGGCAG
AAGCTTCTAAAAACTCTCGGGAGAGTTCTTTTGGGCTTATGATGTTTTGG
CTTATTTGCTGCGATGAGTTGTGAGATGTCTATTATGCCCCTGGATTTCA
TTTGTCCACTTAATAAAACGATACATAGTATAGGTATGCTAGTTTTAAGT
AGAAAAGAAGAAATAAAATTTAAAGAACATGGAGAGGCTTGCATGCGTGC
GTGGGTGGAGAACATGCGCGCGGGTGGATGGGGTCGGGGAATCCGGGTGT
TTTTTTTCCCTTGCCGAATCGTTTCTGCACTTGAGAGAAACTGGGGCTTG
CGGTGGCATTCTGGCTGTAATTTATGTGAACGATATGTCTATTTTCAGAA
AACGGTTTGCTAGTTGAGCTGAGAAGCCCGGGAAACTGGTTTCTCCCCAC
TGCATGTACGTGGGCTTCTGATGGGTTTCTCGGTGGGGGGAATCTGGACA
CTTCTTTTTTGCTTATGCGGTGGAGGACCTAGAAGCCATGTTAGAAGCCC
AAAGGAAGTCACCCTGAATCTTGTCAAGGGTAGTTCTTATAGTTTACGCC
TTGGTCTAGTAATCTAGTAGTTGTTCAATTTGTTTGATTTTGTGTTTGAT
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CTAGCAACCAAACGTCAGTTCTTAACTCTATTATTTTCTTTATATGTTGA
TATATTCAGCACAACCAATAGTATGCAAAAACTAATGCTATCATTTTGTT
TTTTGAAATGAACTGGCATTTTTCTTCCACAAAATCACAAGGGCTTTCTA
TATTGGAGCCAATGACTTGACGATCAATCCGACTGCACGTGCATGATTAT
TTCAAATATTTGACATTATTCAAGTATATTTTTAACTAAATTTATCGTGG
TTCTGTAGTAATGGAAGGGCTTCTAGCTAGTTCTTATGATTTTGTTTTGC
TTCTATCTGAAAAATATCCTTTGTTTTATATGATTTCCAGGAATTGGATG
GAAATCTTGGAAAAAGCGTTGGTTCATCCTCACTCGAACATCACTGGTTT
TCTTCAAGAGCGACCCAGTTAGTATTTTCATTCTTGTGTTCATAGTATAA
ATTACCGATTACAGGAAATCACACAAGTAGACTCCTCAGACCAGATATTG
TTTTTTGCTTCAGCTTGTTGACACTTTAATCATATCTCTTGCTCACTGCC
AATATATAATTATGTGTCGATGTTCTAACATTTTTCATATTTCATGACAT
TTATGGGTATATACTAGGATCAACATCGTATGTGAGTATACAGTGTTCTG
AATTTAGTGCTAATAGGCAGAATGGTTACTTAAACTTTGCTCTTTTCAAT
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TTTCTTCCGGCTTCTACCAATTTCATTGCTTGAACTTTAGCTGTATAAAC
TTGCTTATTCTTGTCCTTGCCCTATGGTATACTGTGAATGAGATTTTGTG
AAATACTTAATAATATTCTGTCTTCCATTCATGGTCCATATTACGACATA
GTTCTCAGTTCATTGACTAATGCTTGTTCTTGACATTGTAGAACACGTTA
CCACAGAGAGGTGGTGAAGTTAACCTTACTTTGGGGGGAATTGACTTGAA
TAATTCTGGGAGGTATGTGTTTTAACCACAATTCTGTGGTTAATCTTTTG
GTGCATTTTACACAAAGATTGCTGCATTAAATGCTATTCATGAGCAGTGA
CAAATGATTGTTGGTTCTTCCTTTTTAGTGTATTTTGCACGGTTTCATGC
TAACCATGTTTCTCGTTCTCAGTGTAGTGGTCAGGGAAGACAAGAAGCTG
TTGACTGTTCTATTTCCAGATGGCCGTGATGGTCGCGCTTTCACCTTGAA
GGTATATATTTTCCATTTGACTTAGTGGATCCACTTGGGCAAATGCAAGC
TTTATGCCTTTTAATGCTCCTTCAAGAGGTAAATAAAAGCACCTGCTATT
CTTAACACAGGCAGAAACATCTGAAGATTTATTTGAGTGGAAAACAGCAT
TGGAAGAAGCTCTTGCACAGGCTCCAAATGCAGCTCTCGTGATAGGGCAT
AATGGAATATTTCGTAATGACACAACAGATGCATATGAAGGAGCAGCTCC
AAACTGTTGGTTCCATACACTATGATATGCCTCAATGTTACTCATGACAA
ACTCAATATCTGATTATTCCTTTTTGATACATTTCCTTTGATGGCTGTAG
GGAGAGAGAAGAGGCCTACCAAATCCTTGGTTGTTGGAAGGCCAATTCTT
CTTGCACTAGAAGATATTGATGGCAGCCCCTCTTTTCTGGAAAAAGCTTT
GTGTTTTCTTGAGAAACATGGTAGGGCTAAACAGAGTTTATTAGCACCAA
AGTTCGGAACTGGCTGCATTTTACATTCGGTATGGCAGCATGCTGCCTCA
CCAACCAATCTATATATTTAACCACGAATATTAATATTTTCTTGCAGGTA
TAAAGGTAGAGGGAATTTTACGTCAGGCTGCAGATGTTGAGGAGGTTGAC
AGAAGGATGAGTGAATATGAGCAAGGTTTATGCGATTACGTAGTTTGTAT
TTAAGAGTGTGGGTTTTAATTGGTGGTGTTTCTGGTTTGGAAGTTTTCGT
GTCATTGTACCAACTTGTGCACATCTTTTGTTTTATCTCAGGAAGGACCG
AGTTTGCACTGGATGAGGATGCTCATGTTGTTGGTGACTGTGTAAAGGTA
CCTTACTGTGATTTCTATTTTGTCGTTTCTTCAAAGTATTCATTTTTGTC
ATAAGAGTTTCAATAGGTCATGCTTTGCTTGCGAACTGTATTCATGTGAA
CATACATCTGCAGCATGTTCTACGTGAGCTACCATCTTCTCCAGTGCCTG
CCTCCTGCTGCACAGCATTATTGGAAGCTTTCCGTAAGTGCTCTGTTCAG
GTTAACCTAAATATATATTGCAAGAAGTTGTCTGTTAGGATGGTCAGTGA
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TATTGGAATAAGCATCTGTAGTATGTTAGATACTGCATTTAACCATGGGT
ATATCAAATTTAAGAATACCTGTAGCATTTACTGCTTTGCACACCTATAG
GTTAATATACAATCATATCGTTGACTGAGTTGCCGAGTATATCTTCTGAA
TAAACATGGAAGGATGATCTTTCTTCTGTGCACCTTTCTATTTTATGAAA
GATATAGATCCATAGACTATTGGTATTGTAAGCTAAGAGGCAAACATAAA
GAGTACATCAGGGTTCCTAGGCTAGACAGAACCAGTGGTTCTCGACCTAA
GCTATTATAACATCTGACTACAATCTTGTAACATTTGGTACCTAGCATGT
AGCATGCTTGTATTATGGCCATTGATATATCAGAGGTTGCAGTTTATCAG
GTACAGTACTCCCTCCGATCCATATTAATTGTCACTGGATTGGATGCATC
TAGCACTAAAATATGTCTAGATACATCCATTTCTACGACAATTAATATGG
ATCGGAGGGAGTATAATATATGAAGCTTCATGTTGCTATTTTTTTAAATG
TCTGAAGAAACCTGACAATCAGTGTTAACACAGTTACCTAGCTGATTTTT
TGTGTGTCTGTAGGTCCTAAGTTTTGTTTGCTTTCATATTCTGTTTTTAA
CAGTTCTTTTCACTTCATCCATGTGTAGGTCTGGAAAGTAAGGAATCTCG
GATAAATTCTATGCGTGCAGCCATATCTGAGACATTTCCTGAGCCTAATA
GGCGGTTGCTGCAGAGGTTAGTTTTTTTGTAATGGGGAAATCTTGTGTCC
GAGTTAGCTTTTGAGCTGCTGAATAATGCATTCTAAATCTAGTTCTTTCT
GTGATTGAGCATATGGTTAGCTGTCTTGGTTAAAAGCATGCAGCTGGAAA
TCACAGAATATGTAAATTTCTATTAATAATTTGTTGTAGGCGATCACATT
TTCTTATCAGTTGGCAAGTAAATTCTTGATCTAGCTCAGAAATCTGATGT
TTGCAGAATTTTGAGAATGATGCATACTGTTGCTTCTCATACTGCCGAGA
ATCGAATGACTCCACCAGCAGTTGCTGCTTGTATGGCTCCTCTCTTGCTG
CGTCCACTTCTGGCTGGTGAATGTGAGATGGAAGATGACATTGACATGAA
TGGTGACAATTCTGCTCAGCTTATTGCTGCTGCAAATGCTGCTAACAGTG
CTCAAGGCATTGTCACCACTCTATTAGAGGAATATGAGGGCATCTTTGAT
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TTTTTTTTTTATCATTCTGTTTATTACTTTTACAGGATGAACACCCTAGG
TGTTCCCTGTCACCTGATTCTCGAATTCAAGACAGTGGAAGTGAAGAATC
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TTCTATTTATTTAAGAGTAAATTGCACTTACCACCTGGTAGAATGCCCCT
AGTTGCACAGTACACCACCTTTGCAAAAATAAGCAGTTTACACTAGACAA
ATAGCATTGCACATTGCACTGCCTCCCGTTACTCCCCATTCACTCTAACA
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CCCCACCTGTAAGGTGTCCGGCTCGTCCAACAAGGATGCCATGTCCTCCA
ATCCCTGGTGCTGACGAGTAGAGAGCGGTTTTGGCATGGAGAAATTTAGT
AGCGACCTTCACACTGACTGCTCCTGTTCTCTATACGGAAACAAACATTA
GTTCCCTCCCCTGCATCTGATCTGCTCCTCATCAGCAGATCCATTGACCT
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GAGTTTGCTGCTTTCCTATTCTTGATGGCTACTGCAGAGCTTGTTCCATG
TGCTGGTTTAGGATGGAGGGCATGTGGTGAGGGAGAGATAGAAAATAGAG
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TACAATACTGGTGAGACCAAATTTATTTTAGCAGAGCTGGCATAGGAGAG
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TGGCTGTAATATCACAATCTACCTCTGCTGTTTCCTGTAAAAAAATCCTC
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ATTCCGAGTAGTCCAATCAGAACCATTTGATTTTCATTTTCATTGGGTTA
GCAATCTTGTTTTTGTGACTATGTCATGATGTGTTTTTTCCTTTCTTACT
CACTGTAATGTGACACAGCAGGTAGATCATGGGGATTCAGATGACGAACT
TTCTGTCGAAGATAAGGCTATGGAAGCAAAGTTGAATTTAAAGGATGCTC
CACATAACCATTTAACTCAAAATGGAGCAATAAATGTCAAGAGACCACTA
AATGAAAAGGATCCAACAAATATGGTGTCCAGTCATGAGTCTCCATTATC
AATGGGAGAGATTCTTTCTTCTTTGGATGCAGGAGTTCCTTTACCTGTTC
CCGGAGCTGAATATTCTGTAGATAGGCACTCCATCAAATCTAATGAAACC
CAGCCTCACGTGAAGCGTTCTAACATTTGGGGACGGAATAATGTAAGCGA
GAAGTTACCTTTTGTTGTCTTCCCTTGTATATTCATGTTAGTTCAGTGAA
AGTCATTTTGACCATTGACTTCAAGTGTTTCGATTTTGAAAAGTAGTTAT
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GAAGCTTCTGTAACCATCTATTGTAGCTTTTGTTTTGACCTTGTGGATTT
AATCATGTGGTTTATGCAGGCAAGAAAGAGCCAACAGTCGGAGTCTGTTG
ACTCATCAGGTGAAGAAGAGTAAGTTCCTAGTCATTTGAAGTACTGTTTA
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CTGTTATTTGCTTAGCTGAAAATTCTGTTCCATCATAATATGGGCACCAG
TGTGTGTGATAGAATTGATGTAGAGTGTGCGTGTGAGAAGTTCCTTTTCT
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GTTCATGTGTGATGACATACTGGACATGCTTGTTGCATAATTTTTTACAT
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TTAACTTTTTAACTGTGCAAACAAACCTTTCAGGCTTGCTATCCAAAGAC
TTGAGATTGCAAAGAATGATCTGCAGATCAGGATTGCAAAAGAGGTATGA
AAGGAGTACATGTACTCTTTTAGGGCCTGTTATTTGTGAGGATCTTGCAA
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ATGATGTATGCCATATTCTCTTACTATATGAATCAACTACTTCATTTTAC
ATTTCCAAATAGGATGCGAGTCTACCCATATTATCCAACTTCATTCAATT
TACTTTTTCATGATTTTTTGTTCAACAGTTTTCATTTATAATACTCCCTC
TGATCCAAATTAATGGACTCAGATTTGTCTAAATTCGAATGTATCCAAAT
TAATGGACTTAGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGCACTAAAACATG
ACTAGATACATTCGAATCTAGACAAATCTGAGTCCATCAATTTGGATCGG
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ATTATCTGTCCCTGCAGGTATCAAGGTTGCAAGAGCAGCTGCAGGCTGAA
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TGTTGCAAGGTTAAAGCAGAAGGTTGCAGAGCTGCATCTCCAACTTAGTC
AACAGCGCCAACACCAGTACGGCTCTTTCGCAGATGAGAATGATCGTTAT
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TCATAATCAAAATTCAGTTTATCTTTCTTTTAAAAGGGAATTCAGCAGGG
CGTAATCGTGCAATACCCCCAGCTGTTTGTATATCAAATGAAGTCAACAT
ATCAGGCCAACCCCCTCTTATAGGTTGTAATTTTGTAACGTGGCTTCAGG
CATGCCGGGGCATTAAGCCAACATGAAAAGTTAAAAGAAATAAATAAATG
ATGGTGCAATCTAGAGACTTAGCGTGTTGTAGCACATTTTAGAATTTGAA
CTTCAAAGTGTATTAGAAGGGAGAAAATGTAATTTGTTAAATGTGACATG
TGTCAGTGTCTTTTCTGTTATCTTTTTTATTTTTACTCTTAACACAAAAC
GAGTTAAAATTGACGATGCTTGACTGAGAAGTTTGGGTATTTTCATATTG
ACTTTGGGCCTCAACTGGCCAGATTGGATGGATACACCTTAGAGTGGGAT
GTATTCACACCTGATACGTTGCCATTAAACTAGTATTTCAAAATTAACAT
ACTGGTTGGTACTAAATGTCCACTAAATTATGTGCTATGTGTTTTGCTAA
CAATTGTGTAAGGTATCATACCAGCTTAAAACACGTGATTTGCCAGTTGG
ACGTGTTTCATTCTCGAATTACCTTGTAATAAAAGTTGCAAATATTTTAT
TGCCAACAGGAACTTTGTTCAACCAGGGTTTGATATGAAACTTGCTTTCT
GTAATCAAGAGAAGAAGCAGAGGAACGAGGTAAGCTCCACCCTCCTCTTA
TCTACTACCTACCCTTTCAAAGTCTTCCAACCAATTAGCTCAATCAATTC
CATTATTGATTGCACTTTCATAATAATTTACAAATCTCAATCTGTTTTAG
TTGTAAAAGGGTAAGTCACTGATATGAAATAACTTATGTGTGATGTGAAA
CTGGTGTTCCATGAGGATGATACTAAGAGTTGAAGTCACCTAATGTTCTG
ACAGGAGAGCTTGTCGGGCACATCACACTGGAGAAGTATCAAGCAGCACG
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GCCTCTTCGAGCGATTCGAGGGAGGTATCGACAAGCTTGCCCGCAGAGAA
CGGTTCTATGCCTACGAACATCCCAAGAGCAGCAGAGGTAAGGGAAATCA
CTGCATTTTACGGTTGTAATCTTTTGAAGACGGCTGAAGTGTTCGAGTCT
CTTGTTGTAATGCAGGCTGTTGAGTACGGGATGCAACCGCCCGTGCCGTC
ATCCACTCTGGTTGAGCTGACGACCAGACTAGATTTCTTCAAGGAACGGA
GGTCACAGTTGATGGAACAGCTCCACAGTCTTGATTTAGGGCATGGATCT
GCGCCGCAAGGTTTTCCGTACAAGTCTTCGTCCCCTTGGAACAGTCCGAG
ATAGGAGGGTTTTCATTTCTTATAGCTTCATGTTTGTATATTCTTGGTAA
AGTATGTTTTCCCCTTCTTTCGTTAGTCGTAGCAGCTGCTAGCGAGAATG
TATATGCATTTTCTTGTTTTTTTTTGTCTTTTCTTGGTTTTTGTGGCTGC
CTGCAGCACCCTCATCCGAGTGTGTGATTTTGTAATACTTTTGTAATCTA
TTGTATGTAAGGAGTTAAAAGGGGTTGACACTTGTTTCCAGGGTCACCAA
GG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.