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GrainGenes Sequence Report: AE018292

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Sequence
AE018292
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE018292
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAAGGGGGAGGAAGGGGAAAAAATTAAAGTAGAGTTTAAACAGCGAGAG
GAGAAGAGGCAGCGGCAGTAGTAGAGGAAGAGGAGTCCCAATCCCACGGC
GCCTCGACCGGCTCCCACCCCCCACCGCCGAGCGCGCGCTCGCTCGCTCG
CTGACGCCGCGGAACCCTAGGGGCCGCGCTCGAGATCTCTCGCTCGGGGC
GCGGCGGCGACGCCCACTGCCCCCAGCTCGCCGGCGGGGCGGGGCGGGCG
CCCCCCATGCCTTTGGCGCCCCGATCGGAGCCGATCGGTGGCCGCTTGAG
GCGTCAGAGCAGCTCGCAGGCCGCGCAGGGCGCCGGAGAAGCGGAGGCGG
CGACCAAGGGGGAGGGAGAACAAGAAGAAGAGGAGGAAGATGGCGCTCTT
CCGCAAGTTCTTCCTGAAGAAGACGCCGGATCGGCTGCTCGAGATCTCCG
AGCGAGTCTACGGTATAATGCCCGCGTCCCTGGGTCGAGCTGGGCCGGTC
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TTGGCAAATTTTCAAGTTAGATGTTGGCTCCTGTAGTTTTGGGTTCTGAG
TGCGTGCACGAGCACTTAGATATATAGCTGCATTTGACTTAAATCGGCTT
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TGCAGTGTAGAAACTAGGAGCCTGTCATGTCAGCATGGATGTGTGTTCTC
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TGGTCTGGGGACAAAAGGAGTCCGATTTCAGATATATTGTCTGAGTATGA
CATGACAGTCATGGACTACCCACAGCAATACGAAGGGTGCCCACTCCTTC
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GTGGAAGGGCAGCAGAACATGCTTCTAATGCACTGTGAAAGAGGGGGCTG
GCCAGTGCTTGCATTCATGTTGGCCGGACTGCTTCTATATCGGAAAACAT
ACACCGGCGAGCAGAAGACCCTAGAGATGGTCTACAAGCAGGCTCGCAGG
GACTTTATACAGCAATTCCTTAAGTTGAATCCTCAGCCTTCACATCTTAG
ATATTTACACTATGTAACAAGACACGGAAGTGGTTCAGAATGGCCTCCTA
TTAGCCGGACTCTTGTCTTGGATTCAGTTGTTCTACACACTGCTCCTAGA
TTTGATTCTGAAGGGGGCTGTAGACCGTATTTGCGTGTACACGGGCAAGA
CTCAAATCCTGGTAACAAGAGTGCAAATGTTCTTTTTGAGATGCCAAAGA
CCAAGAAACATCTGAGGCGTTATGGGCAGGTAATGATTACTTCTAAGCTG
TTGAAATATTTATCACCATCCAAACTCTACTCTGACCGATGGTTACAATG
CAGGCCGAAGTTCCGGTGAAAATTAGTGCTTCCTGCCGTGTTCAGGGAGA
TGTGGTTCTTGAATGCATCCACATTGGTGATAACTTAGATCATGAGGAAA
CAATGTTCCGTGTCATGTTCAACACTGCATTCATTCAGTCAAATGTCCTT
GGACTGAATCGTGATGATATTGACGCTGCTTGGAATGTGAGTAATCAGTT
CCCAAGGGACTTCCGAGCAGAGGTACTGAATTCACCCGTCTGCCCTTCTT
CTACTTTCTTTTCCATCTGTCTCGTGTGCATCATGAAATCTAAGAATAGA
GCTGCAATTCTGATCCAGGTACTCTTTTCGGACCCTGATTCCTTCAAGCC
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GATGCTAGGAAGGACCCAGAATCTCAATCAACTGACGGAAGAATTTCATT
AGAAGTTGTCAACACAGAATTGGATGGTGACGCAAGTGAGGAGAACAGTG
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AATTCAGGTAGCATGACTAACAAAGGGCCAACTGCACCTCCTCCAAGTTT
GGAAAATTCGGGAGGTTTACAGAAGTCATGCAAGGTTCTTGAGAAGTCTA
AGTTCAGCAACAGAAGTGACCAAGAGGAGCATGCGGTGCAGGACATACAG
GTGGTTGCTGCTTCTATAGCTTCAGAAGGGCGCAAGTTTGGATCTAACTG
TCAGGAGGATACAAAAGGTGTAATTGCACAAACCTTAGTTACTGCAACAG
ATCCAAGTTGCAGTGATGAAGTTCAGTGTCACCCAGGTGAATCCACAAAA
ATATCGAGATACAGTGATTTGGACTATACTGCTTTCAGTCCTCCTAGAAC
ATTATCAAGTATGGTTGAGGATACCCACTTGAGGACATTGCCAAATGAAG
GACACCAGAATGGTGACATCAAGATTATTACTGAAAACACAGTAACTGTG
GACAGTGAGCTACTGATCTATGAAGAGAAAACAGTAGTTGATAATGGAAA
CGTAATGCAGGAGGTAAAAAATGTTGTCAAGGAAGAGAGTGTTATTTCAA
AGGTAGAAAGAACTGATATGGACTCCCGAGATGACAACAATTACAAAGTA
GAAGTGGTCAAGACTGCTGATACAGCTGACAGAAGATTGGATCAAAGTAA
ATTAAAATCTGGTCTTGGAGATACCATACCTGCAAAGAAAATCAGTCTGC
AGGATAATATTGTTGTGTTACCAGCTAATGAAATAGCGACACAAATGAAA
GCCAAGCGGGAAGAGCGTGGTGGCAGATGGGATTTTGGCATAGCTCTTCC
TCAAAGTAAAATAGATGCTAGGGATAATAGCCCAAAGACTAGTGAAGTCC
AAAAGCAAGCACCAGATAAATCTTTTTCCTCAGTATCAAAGAAGATACCA
ATAGGTAATGCACCCGAACCAGTGTTATTGGAAGCAGTACTTGGGCATAA
CGGACAGCTGGAAGAACAATCAAAGCTTGCCAAACCAAAAACAATACGCA
GATGGGTCTCACCCAAAAAAGAATCTGAAACTGCCTCTGTGCGTAGGCCA
TCTCACCCTCCATCCAGATATGACAGTTCTCCAGCTGCACTAGCTATCCG
TTCCACGCCTACAGATAACAAAGTCAATGGTGTGAAAGGTGCACCCCTAT
TACTACCTGGAACATTGTATGGCAATCACTTAACACAAGATGCAACACTG
TCTCCTCGATTGCCTTCACGACGACCCTTGGTATCAGGTGCACAATCTAC
GCCAAGAATCCAAGCTCCTGCTCCACCTCCACCACCGCCACCTCCATTCT
ATGCTTCTTCAAGTTCACCTATGAAGCACCTACCACCACCGGCTTCAGTA
GGCTTGTCGAACATACCTCCACCTCCGCCTCCGCCTCCACCTCCACCTAT
GTCTTTTGGAGCACAAACACGGAACTTTGCACCTCCCCCTCCCCCCCCCA
CCTCCGCCACCAGGGTTAGGTGCCCGTGGAAACATTTCACCACCACCTCC
ACCTCCACCTCCTTCAAGGTTAGATGGAAGTGTCATCGCTCCACCTGCGC
CTCCACCCCCGCCCCCACCTCCTCCAGTTCAATCCTTCATAACACGTTCA
GGTGCTCCTCCTCCTCCACCACCTCCACCACCAATGTCCTGCTCTACTGC
TCCTCCTCCACCACCTCCTCCACCAATGGCCCGCTCTACTGCTCCTCCAC
CACCTCCACCACCTCCACCACCTCCACCACCAATGACACGCTCTACTGCT
GCTCCTCCACCACCTCCCCCACTTCCAGCAACACATTCTGGCGCTCCACC
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CTCCAGGTGGCCGTGCACCACCTCCTCCTAGAGCACCTGGTGCGCCACCA
CCACCAGGGGGTAATCCTAGTAGTTTACCTTCAAACTCCTTAGGTAGAGG
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AATCAACATTAAAGCCGCTGCATTGGGTCAAAGTGACAAGGGCTGTGCAA
GGTAGTCTCTGGGAGGAATTACAGCGAAATGATGACTCACAGAGGTAAAT
TTTTCTGTCCTCTTGATTAAATATATTATTTCATCTCGAGTATGCTTTCT
ATAATGTTTACCATTTCAATGATGAAAATCGTTATGAGGTTGATCTAGTG
TTATTAGTTTTAGTGCTTATGACATCCACTGTACAGTTTATGATGGTAGC
ATCAACTTAGAAAAACAATTGTTCGATAACTTTTACAGCTCTACGCCATG
AGCACATCATGTTTATATGGTTGGCACCTTTTGATATTTTTACCTTAATG
TTGGGGAGCTGTTTTCTGCAGTGTATCAGAGTTCGATTTATCAGAACTGG
AAAGCCTTTTTCCAGCAGTCGTACCAAAGTCTGATAACACCTCCAAGACT
GACCGGAGAAAATCTCTTGGATCAAAGCCAGAGAAAGTTCACCTGGTAAG
TAAAATGCTAATACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTT
TGAAAGGAGCGTATCTGGACCTCTTTTAGTGTGTAGGTTCATTTAGGTTT
GGAGTGAACCTACACACTCAAATGGGTCTAGATACACTTCCTTCACAAAG
CTAAAGCATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATTTTGGAATGAAGTTT
GTATCATTAAATTTAACTCATTTTAGCATTTGCGGCTTGTTAGTACTAGC
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CCTATATGAATAGATTGAGTTGAGGAGGGCAAACAACACAGAGATCATGC
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TGGATGTTGATCAAGTGGAGAATCTCATAAAGTTCTGTCCAACAAAAGAG
GAAATGGAACTTCTTAAGGTGCATATTAGTGAAATGTTGCTTTGCCTCCT
TTGTGATGTCATATTAACACGGCATCACCTTCCTTTTTCTTGTCAGAACT
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TGCGATCTATGATGTTTTAATTTTGTGTGCTACTTAATACTAGCATTAGA
AAGTTTACTGATGTTGCATTTGCTGAATTTGGATGTTCCACTTCTTGAAA
AATGAAAGCATAACAACCCCATACTATTTGATTTGTCTTAATTGATAGTT
GCGATAATTTAACATCAAAGCACAGCAACAATATTCAAGGACTCTAGGGT
TGAGACACCCACTTATGTATGTGAGCCCTTGTTTGACTCAAAGCCAAAAA
CTCAAGACTGTTACATCTATTCGTCATCGTTACCCCGGGAATTTAAAATA
GCCATGTTGGATATGTATATGAGCCTGTTAAATATGAGAGTTAGGCCCAA
TTTTGCATAAAATGTCATTAGGAGTTATACACGACAGTTCATGCTTACCG
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GATCCGAAATTGTACCAAGTTGAAGGATATAATGAAGAAAATACTCCTCC
TTGGAAATACATTGAACCAGGGAACTGCTAGAGGTAATAAGAACTCTTCT
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TTCGGATGTATCTAGAACTAAAACAAGTCTAGATACATTCGAATCTAGAC
AAATCTGAGTCAACTAATTTGAATCGGAGGGAGTAGCATTCTATCCTACT
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TAATTTTGTACCAACATTCTTCATATATTTAGAGTAAATCTTGGTCGAAG
AAAAAACACGCAAAACGAGGGCGCCTTATTCCTTGGAACGGAGGTAGTAT
TAAGGTTCTATTTCTTATTCATCAACTTCCTTAAGAGTAGAAATTAGCAC
AATACAATGCATGATGTATTGCCAATATGATGCAAAGAGAGTTACACCAG
TCGGAATATGTGTGCATATTGTCTTGAGCTTCTAAGTGCAACGGTGGCGA
ATCAGAAAGTTAGTTTCTTGTCTTTATTACCATTATGTTGAAGATTTTGA
TAACTCGATACATTCCTCCAGAATGGGCAGTTTGAATCAGAGATCATTAA
TATTAAGTCATTCTTGCTGACTAGTTGAAGTCATTAATCGGGGATAGAAT
TACATGTGGAGGAAAAGTACCAGTCATTGGCAGGTTCACATCTGTCTATT
TTTTTACAGGTGCTGCAGTTGGCTTCCGGTTGGATAGTCTGCTAAAACTT
ACAGATACCCGGGCAACAAATAATAAGATGACATTAATGCACTACCTCTG
CAAGGTATGCATTTATCTGTCCTGTACTGTTGAGTTCTCATTTGTGTGTT
AGTACCCTTCACCAATAGGCAACTTGTATTTGGAAATTATAATCCATGTC
TGCGTTGAATTATTTATTCGTTCAGGACCATATGAAGTGTCAAATTCGAT
TTCGTGGTGGAACTTAAGGTTCACATGATGTATTTAATCAGCGGAATGTC
AAATGGCAATTGCCTGGACTGGCAACTGGCATATGTTCCGAGTAGCTTCT
GGATTTTTGTGGCATCTTCGCTGTAAAGTGGATGTAGAGATTAGATAAAT
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TTTATAAGTTTGTCAGTAATCAGTTTAGGTTTATCTAATAGTTAGAGCAA
TCGCAGAAATCGAACAACTTTGACAACTTCAGGCTACCTTGAAGTAATAA
ACCAGTAATAGATTATAATAGTCTCCAGACACCTGCAAGTTTCTGAATGT
ATGTGTTATTGATTTTAATTTACTGTACATGACAGTAAATACAAACTCCA
TTTACTTTGCACAATGTATTAGTTCTGTATCGTAGAGCAATCTAAACATT
GAGTGTCTGAATATGGTGGCTTTTAATCCTGTCTCTGATTGATTTAACTA
TAATTAACTTAAAATGATTTGCACATTGCCACATTGGTATCTATCCCCTA
TATTTGTGCTAACAGAAAAATATCTTACTATCAGGTGCTTGCTGTAAAAT
CACCAAATCTTTTGAACTTCTATGTGGATCTTATTAGTTTAGAAGCTACA
TCAAAGGTTCGGGTTTTTTCAGATGCACTTGTACATACTTTCTTCTTATT
GATGCTTTTGAACAGAGTTCGGTTAGGATGTACATGCTTTCTTCTAATTG
ATGCTTTTGAACAGATACAACTGAAAATGTTAGCAGAAGAAATGCAAGCA
GTCAGTAAAGGGCTGGAAAAAGTTGAGCATGAATTTAAAGCTTCAGAAAG
TGACGGCCCAGTGTCAGAAGTTTTCCATGAGGTAATACACTGTCTCATTT
GAATTTCAGGTTTTAAAGTGGTGCGCATATAATATGGACAAACCTGTCAT
TTGAAGCAACCCTCTTTCGGACAAAATTTCATGATTATGCAACGCCGTGT
ACATAGCTGCCTGGATAAAATATGCTAGAAGCCTAGATCTTCTGCTTCTT
TTCATCTGCTTGTTTAATGCCTGCCCTCTAGATGGAGGGCTCAGAAAGAC
CTCTTGCATTAAACTAAATTTAGCAGAACAAGTCCAAAGCAAAAAAATAA
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CAACTCTGTTCAAAAAATTATATATTTTTTTTGAAAGATAATATATATTA
AAAGCTAGCAAGCCGCCTCATTAAAAACCTTCCAGCCCCCTTAGGTACCC
TGGTAAGGAAAAGAGTGCGTCAGAAACTTGCAGCCCACAAATCACACCAA
GTTACAATCAGCCCCAAGGCTGTGAACTAGAAAAGCAGGTGGCTCAGCAT
CCCAGGAAAACGACCCATCCTGTAGGCTTATATATTTTGCACAAGAATGA
GCCGCCTGGTTAGCCTCGCGACGAGCATGAACTAAGCTAAAATTTGTAAA
CAACAAACTCAGCTCACTAATCTCATCTAAGACCTGCTTGACTACTGAAA
GATCATTAGCTCTATTTTGCCAAAGTTGGACCAAATCTTCAGAGTCAACT
TCAAAAACAACATTAGTGAAACCCCTGCTTCTTGCATACACAACAGCATC
TCTAAAAGCAAGGGACTCCACCGTCAAAGGATCAGACACACCTCGGTAAG
TCTTACCCGTAGCACCACGGAAGACCACCCCCTGACGTGCAACAGCACCA
GTAGCTGCCAGATTGTCATTGACATTAACAGCACCATCGGAATTAATTTT
AACAACTCCATCAGGTGGTCTCTGCCACTTACATTCTGGCCTAGCAGATT
TAGGAACACCCTTGTCCCTTGGTAACTCAAGAGTCTGCAAGGTTTCCTTC
ACCATCTCCATAGTTTTAGTAGGACTAAAACCACTCTCACCATGAGTCAG
ATTATTTCTCGATGACCAGATCGAGTACATGACTGAAGTTATAATAGCTT
TCTCATGTTGGTTGAAAAAAGACTCGCACAGGATATCTTTTGCCCATGTC
ACTGGATGTAGCTTCGGCAATTTGACTAAAAGAATTTCCTTTGCGGCTTC
CCAAAACAATTTCGCATGACTGCATTCAATTAAGGCATGCATCACACTCT
CAGATTCTGCTTTACACAGAGCACAGGTGCTGTTATCCATTATATGTCGT
CGTGACAAAGTCCTATAGTCAGGAAGAATTCCTCAAAAAATTATATTTGC
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ATCTATCTTATATGCCTGTGTTCATTTGAATGTGATTCGTTCTAAACTGG
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AGATGTGCAGTCATTGTCTTCATTGTTCTCTGAAGTGGTATGTTTCTGTT
GTTTGGTTCTACGCAGATCAGTTGACATACATTCTTCTTGTATTTGACTT
TCTTGTTTCTTTCTTTTTGCAGGGGAAAAAGGCTGATCAGCTGATCAAAT
ATTTTGGTGAGGACCCTGTCCGTTGCCCATTTGAACAAGGTAAGGAGATC
AGATTTATTGATTACTCTTAATGATCAAGGTGACTTATTAATGAGGTTGT
GTGCTCGTTATATATTCTTGGAATACCTTTCAAGATATTTCTCTTATGGA
ATTTCTATACTCGCTTGTATATAGTGCTCGGGCATGCTCCAACACACTTG
CCATGACATGATTTATTTTGTGAGGATGCAACTGATTGAAGCATATCTGA
TCCGTGATTTTTTAAGCATTAAACACGCATGTTCTGTTTATTTGCTTGCC
CCCCTACGGTCCTACCTCACCTTTACTGTATGGTGATCATCATCTTGCAG
TTATGTCTACCCTGTTGACATTTGTAACAATGTTTCGGAAAGCACACGAG
GAGAATGTCAAGCAAGCTGAGCTTGAGAAGAAAAAAACTCAAAAAGAGGC
AGCAGAAGCAGAAAAGTCTAAAAGTGCACAGTTGGCCAGTAAAAATGTAT
TGATCCTTTATTTTACACGTTTCACAGGTTTACTCATTCCCAAGAGTTCC
TTTATGTATGTGTTTTAATCTGCTCGTAGGACTCAAAAGCTTCAAATCCA
AGCCGACAAGCAAAGCAAACGTTAGAGAAAACAAGATCTACAAGTAGACG
AGGAAAAGATACTGGATGATCTGAGATGACCAACTCCAATTTTGTGTTGA
TCTGCTCGTGGGGCAAATGCATGCCCTGCTCGATGCATGGGAAGGACCAA
CGATTCACACTGTGTCTTTGATGGCAAGAGATGGTGTGAGAATGGATGCA
GTCATGAGCGAAAGTAGCACACGTCGAAGGAACTGCACAGTACTCCCTCT
ACGGTAGTGTACACAGAACCTCATCTTAAAACAATATTCTGAACTGTGCT
AGTCTAACTAATTTCTTGTTTGCAGGTCTCAGTGGCAATGGTCGACTATT
TTTTCCCTTCGGCCAGCAGGGTTTTGGTACCAACATCTGACTGCTGTAAA
GAACTAACTGTGAAGCTAATTTCATTCTTTGCTATGTTAGTTGTTCTTTC
TAACACCGGTGGCCGTACAGCCGTAGCTTTAGGAAAGTACAAGCAGGCAG
ACAGTACAACAAGGCACAAAGGTACGAATTGTACAAATAGGAGTAGGGGA
AAGAGTAGAGAAACAGTGGGACAAAAGAGTATGTGACTGGCAGAGTAAAT
ATGAGATGTAAATGCACTTGTAGTGCGGTCAATCATATTTTTTGTAGCTA
GTGTACCACATTTTTCCATGATTGGTTTGTATGATTACTCTTACCAGGAG
AGCTGGAGTTGCTGCCACATTTGATGGAGTAATCGCTCTGTATATGTGGG
GAAGATAGAGCGATAACCTTTTCTTACCAAGATGAGGCGCTCTATGTCAG
TGATAGGGCGATCTGGGTATCTTTTCTGAGTGACTCCAAAATTACTGTTA
GCTTTGTTTCATGGAGTTACTTATTTGCAAGCTACTCAATGAAATGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.