Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE007138

[Submit comment/correction]

Sequence	AE007138
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE007138
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGTCACCTCCCCCGCATTCCCATTTGTTCCACCCCTCTTCCCTCTCCCTC TCTCAGATCTCTCTGCCTCCAATGACCACGGCCACGACGACGAGAAGCGC GTAGCGGCCTCTCCCCCGGACCCGCCATGGCGTCCCCCACGGCGCCGCTA GGCGGCTCGACCCCGTCGGGCCGCGTGCTCGGCCCGGCGCTGGACCGCAT CATAAAAAACGCCGCGTGGCGGAAGCACTCGGGGCTCGTCGCCGCGGCCA AGTCGGCGCTCGACCTCCTCTCTTCCTCCTCCTACCCTCCGCCCGACCCG ACCTCGCCGCACCCCTCCGCACTCCTCGGCCTGCCCGTCGCCACCGCCGC CGCCTCGCTCCACGCGCTGATCCTCGCCCTCGAGTCCGCGTCCCCCAAGG TCGTCGACCCGGCCCTCGACTGCGTCGCCAAGCTCCTCTACCACCGCCTC CTCCTCGGCGACATCGGCGCGGCCACCGACGACTCCCCTGCCTCCAAGCT CCTCGCCGCGGTCCTCTCCTGCGGCGCCCTCAACGACGACGCCATGGAGC TCTCTACCCTCCGCGTGCTCATCGCCGCGGCGCGGTGTCCCTCCATTGCT ATCCGCGGGGACGGCCTCGGCCAAATGCTCAAAACCTGCTACAACATTTA CCTTAGCAGCAGCAGCAGCACCAACCAGCTCTGCGCCAAGCTGGCGCTCG CGCAGGTGCTGGTGATCGTCTTTGCGCGCGTGGAGGTGGACTCGATGGAC GTGCGCGTGCAGACGGTGTCGATCAGCGACTTGATGGATGTGTCTGATCG CAGCCTCAACGACTCCAGCATTGTGCTGGTGGCGCAGGGGTTTATAAACG ACGCGATGGAGGGGAGCGATGTCCCGGAGCCAGGGACTCCCGTCGTGACG GCTGAGGTTGATGAGACGGAGGAGGGGGGAATGAGCAAGATCAGGGAGGA TGGGTTGGCATTGTTCAAGAATCTGTGCAAGCTGTCCATGAAGTTCTCAA CACCAGATAACCCTGAGGACCAGGTGCTGCTGCGGGGGAAGGTGTTGTCT CTCGAGTTGCTCAAGATGGTTGTGGACAATGCTGGGCCATTCTGGAGAAC AAATGATAAGTATGTTCGTAGTTGCTCTTGTTTCACCTCATTTGCATTTA ACAGTTCAACTTATTGCATTTTCTATCTATGCAAATATTGTTATTGCAGT GAATTAGAAGAATGTGATATGATTGGACACAAGAGAGAGGCATATCGAAT GCCATTTTATTCATATTATGAATGACTAGAACTTATTAGTATTCTGTTAA ACTAGTTGAATGTCCGTACTTTGCTATGGAAAACATATGCCCCAACTCAT CACTCCATGCCCCCTGCTCTGCGGTGATACCTGGCTGATGTCCCGGCTCG TGTCACTGCTCATCCTACACCACATTCTCGGTTTTGCCACCAACAGTCGT GCTTCGTTCTGACCCGCACCATGATATGCGAGTATTTGCTTACCAGGAGG TGTTTTTGCTTCAATTTCCTGTAGAGATATTTAAGGAAGGTTGAAGTGGG GTGGGAGAAGTGAATGCAGCAACCACCACAGCTGCTGCTCTCACCAACTC CCATGTTTTATTTCGTAGTTGTATTAATGGAAGATTTTCACCATTGATCA GATGGTAGAAATGATAGTGGTGAAGATATGCTCTTTGTTCTGCGAACTTG TTGGAAGTGCATACACGAAACTTTTAGCCTTTATGATTGTGCATCCATAG AAATGGAAAACATTACTTCCAACAGAACAGTGGAGCCCCCAAGTGGTTGT ACCTGCACTTGGAGGATATGAAATCTTGCTATGCACTCTGATTCTGGTCG ATAGTAAGATTATGTAGATGTAGTAGATATTACTAGATGTTTTTTTAGGT ACACTGAAGATTTGTTTTTGCTGCAGGTACCTTGGAGCAATCAAGCAGTA TCTTTGTCTGTCATTGTTAAAAAACAGTGCCTTGTCAGCAATGAGTATTT TCCAGCTTCTTTGCTCCATATTTGTGGGTTTGCTGTCAAGGTTTAGATCT GGGCTGAAAGAGGAAATTGGAATATTTTTTCCCATGCTTGTCCTAAGGGT TCTTGAGAATGTCCATCAGCCTAGTTTTCTGCAGAAAATGACAGTTCTAA ATCTGCTGGAGAAGATCTGTAAAGAATCTCAGGTTCTTATTGATATATTT GTGAACTATGATTGTGATGTTGATGCACCAAATATTTTTGAAAGGTATAT AAAACTCTTCCTGATGAATAGTAAATTTCTGGTATGTTGTAAGTTCAAAA GATGAAATGCAACTGAGGGTCAGTGTCGCCTGTAATCCACTAGAGGTCCT CAAGTCAATTATGGTGCAAGTAGTGATACATATTGAGCTGAGAGCACAGT TCTATGAAGATTGTAATTCTCTCTCTTTCCATCGTATATTAAAGCACTTC TAATTCCAGCAGATATTTGCAGGACTGTCAATGGCCTACTAAAGACTGCT CTAGGGGTTCCTCCTGGAGCTACAACAACATTAACCCCAGCCCAAGACCA AACATTTCGGATTGAGTCAGTCAAGTGCCTTGCAACCATACTCAGATCTA TGGGTTCATGGATGGACCAACAGTTGAGAATTGGTGATTTTTCACCCAAA ATTTCTGAAGTTTCTTTAAGTTCGATAGACCGTCCTAACATCCTTACTGG AGAAGATGGGATCGGAATTGATTATGAACTGCAATCCCCCGACTCTTATA GCCCAGACACATCTGATGCTTCCTCACTTGAACAACGCCGTGCTTATAAA ATAGAACTTCAGGTATGTAATGTTTGTGAGCTTGGATTCTCTCTCTCCAA TGTTATGCATTTTGAGGGCGATTCACATTTTAGTTACTGAAGTACACATT TTGTTCTGCAGAAAGGAATTTCCTTGTTTAACAGAAAACCTTCTAAGGGT ATTGAGTTCCTCACTAAATGCCAGAAGATAGGTCAATCCCCAGAAGATGT TGCTTCTTTCTTGAGAAACACTGGTGGTTTAAATGCAACAATGATAGGGG ACTATTTAGGCGAAAGAGATGAATTCCCTCTGAAAGTTATGCATGCATAT GTCGATGCACTAAATTTCGAAGGCATGGACTTTGGTGAATCCATTAGGTA TTACTTGCGAGGTTTCAGATTGCCTGGGGAAGCACAAAAAATTGACCGGG TCATGGAAAAGTTTGCTGAACGATACTGTAAATGCAACCCAAATTCTTTT ACTAGTGCAGACACTGCATATGTTCTTGCTTATTCTGTAATCATGCTCAA TACTGATGCTCATAATATGATGGTCAAGGATAAGGTTAGTCAAATGATTA GTTGCTTCTGTTGTCAGTAAAAGAATGCATACTCATTAATGGAAGTATCC TTGTGCAGATGTCTAAATCTGACTTCATTCGAAACAACCGAGGAATTGAT GATGGGAAGGATTTGCCTGAAGTTTATCTGAGTACATTGTATGACCAAAT TGTCAAAAATGAGATCAAAATGAGTGCTGATTCATCAGTTCCACAAAACA AGCAACCTAGTAGTGTAATGAAGCTCTTGGGCTTAGACAATATTATAAGC CTAGTTAACTGGAAACAGGCGGAAGACAAGGCACTTGGAGCAAATGACTT GCTCATCAAAAATATACAGGAGAAGTTCAAAGCAAAGAGTGGGAAATCAG AGTAAGGCCCAAACAACTATTCATAGCCAATAAATTTGCATCTGCTGCTA TATAATGAATTCAACCTTGTGATACATGCAGATCTATATTTTATGTTATT ACCGAGACAACCATTTTACGATTCATGATGGAGGTTTGTTGGGCCCCTAT GATGGCTGCATTCAGCATGACGCTTGATCAATGTAATGATAAGGCTGCCA CGTCACAGTGTTTGCAGGGGTTCAGATCCGCAGTGCATGTCACCTCTGTA ATGTCCATGCAGACACAGAGAGATGCCTTTGTGACATCTGTAGCCAAATT CACATATCTTCATTGTGTTGCGGACATGAAACAAAAGAATGTGGATGCTG TGAAGGTAGGAACTTGGAAGGCAGACAGTATATTCATGTTCTTTTTCAAA TTCCTATCAATGCATACCTTGATTAAATGGATCTTATAGTGCAAGGCATC GCAGATGCACCTTCCGTTGATCAATTTAGCATTATTTGAGTTTGCACAAA GCTGAATGAGGTGGTTAGAATTTGTAGAACACTGAGAGACCGTGACCTAG GTTTCTTTTTGAGAGGTGATAATACTTTGTGTGGGTAGTAAGCTGGTAAC AAATAAATAAGTCTACGTGCATTTGTGAGTAGCTTTAAAACTGTTTTCTA TACATTTTCAGTTGAAGTAATGACGCTATAATTTTTGCAAAAAAATAAAA AAAATGACGCGATACATTAGGAGTTTATCTTCAACCAGTGTGGCTGGCGG TTTGACAACCTGATATCATGTTGATGCACATGCGCTACATGTTATTTTCT CTTTTTTCGATGGTTGATCCATGTGTTGACCGTATGTGACCCTTGAGCTG TAACCTTTTGTGAACTATCTCCAATAATGAAATTAAAGGCCATATGCATC AATCGATGCGGACGACAGGGCTTTCACCTTTTCTAAAAAAAGGACTCTAT ATTCAAACTTTTTTCTCGCAGAGGCTTTTCCTCCCATTCTTCGGTCCTTT TTTCACTACTTTGTTCTTTGTTTTCCATATCTTGAACTATAATTTTGAAA TTCTCGAGAACAAATGCTTATGCCTATTTAGTCTCTTAGTTTATTTTTAT AAGCACACTTAGATGACTAGCAGTACTTGGGAGCTTTAATTTATCCAAGC CTGTTGAAATTCCCGTGAACAAATTGTTTATGCCTATTTGTTTACCAAAT GTTTTATACAGGCTATAATTTCCATCGCAATCGAGGATGGTGATTATTTG CAGGAAGCTTGGGAACATGTGCTAACATGTCTTTCACGGTTTGAGCACTT ACATCTTCTTGGAGAAGGGGCACCTACTGATGCTTCGTTTTTGACGGTAC CTCTGGTTGAGTCAGAAGAAAAAACACAGAAATCAAGTACAGCTACAGCT TCAAAACGAACTAATGCTCTTCAGAATCCAGCTGTAATGGCTGCTGTTAG AGGCGGTTCTTATGACAGCACAACAGCAAAAAACAATGCCTCGCCGTTAG TTACTTCTGATCAGATTAATAATTTTATATCAAACATAAATCTATTAGAC CAGATTGGCATTTTTGAGTTGAATCACATATTTGCTCATAGCCAAAGATT GAATAGTAACGCGATTGTTGCTTTTGTGGAAGCTCTTTGCAAGGTCGCAA TAACAGAGCTACAGTCACCTACAGATCCTCGTATCTTCTGCCTAACAAAG ATAGTGGAGATTGCGTAAGTCTTCTGCAACATCTAGTTTAAGAACCTATT TCCAGACGCAAAGTATAGTCATAGCACGCAGCTATGATCAACCATTTTTA GTCTAATTTAGAGCTTCATTTGTGCAGGCATTACAATATGAACCGCATAC GTCTGGTTTGGTCTCGTATTTGGAAAGTTCTATCAGACTTCTTTGTGTCT GTTGGATTGTCAGAAAATCTTTCTGTTGCAATATTTGTTATGGACTCTTT GAGGCAGCTAGCTATGAAATTTCTCGAAAGAGAGGAACTGGCCAACTATA ATTTCCAGAATGAATTCCTGCGACCATTTGCGGTTGTTATGCAGAAGAGC AATGCTTCAGAAGTACGAGAACTTGTAGTTCGATGTGTCTCCCAAATGGT TTTGAGCCGTGTTAGCAATATTAAATCTGGATGGAAAAGTGTTTTCACGG TATGTATGGTATTCTATGGTTTGTCTAGCCTGATTATTTGCACTCCCTCC ATCTGGAAAAAGATGTCGCAGATTTGTCTAGATTCGCATGTATCTATATA CTAAAACGAGTCTAGATACATGCAAATCTAGACAAATCTGCGACATCCTT TTCCGGAAGGAGTAGTATAACTTTGTATAGAAGCTAAGTTCTTGAGAAAC GAACTAGTGGAACATTCCTACATTACCACTCAATATTTACGGCATTTCAT CTTACAGGTTTTTACTGCTGCTGCTGCTGATGATCGAAAAAGTATTGTTC TATTAGCATTTGAAACTATGGAAAAGATTGTTCGGGACTATTTTCCGTAC ATAACTGAGACTGAAACCACAACATTTACAGATTGTGTTAAATGTCTTAT TACATTCACAAGTAGTAAATTTAGCAGCGATGCTAGTCTGAATGCTATTG CGTTTCTTCGGTTCTGTGCTGTGAAACTTGCCGAGGAAGGATTTGTTTGT CACGACAAGGATAGCGACCAGCAACCAAATAATATAGATTCTTCAGACGG GAACACAGTAGCGCAGAAGGATGATCATGTTTACTTCTGGGTTCCTTTGC TTGCTGGTAGGTTACATTTTCTTTTGCAGATACCGGTGAATAAGTTTGGA AAAGCATCACATTTGTAATATATATCTTGTTTGAATTTTTCTCCTTTTCA GGTCTAGCTAAATTGACAGCTGACACACGGCCAACTATCAGAAAAGGTGC AGTAGAAGTACTCTTTGACATTTTGAAGGATCATGGGCAACTCTTCTCAC AGTTCTTCTGGACCAATATCTTTGGGTCTGTTATTTATCCTCTATTTAGC AGTGAAATCCGTATACCCAATGGCGAGAGTAATAGCACTGAGGAAGACTC TTGGAATTTTGAAACTAAAACAGTGGCTGTGAATTGTCTAGCGGATTTGT ATGTTACATTTTTTGATGTGATGCGGCCAGAACTCACTAGAGTCACTTCT GTTGTTACCAGTTTTATCAGAAGCCCTTATAGACAATCTGCTAGCATGGG TATGTCTGTTTTTCAGCGTTTAACAGAAGGACTCGCGAGCAAACTCACCA AGGACGAATGGAAAGAGATCTTGTTATGCTTTAAAGAATCAGCAGCACAT ACATTTGTTGTTTTCGAGAAAATAGTTAAGATGATGCAAGATATTGAAAT TCCAGAGAAAAATGAGTCTCACTCTGAAGCAGAGCAGTATTCAGAGCTTG ACATATTATACAATGAGGATGAAGAGGAAGCTAATATGGAGACATCATCT TATGCTATTGTCAAGATGAGGAATCATATGTCTCTGCAACTCCTAATTGT TCAGGTACTTCAAACTTTTTGCCAGTTAAATTTGGTGACCGCCCCTTTTG TATGGCATCTCTTGCTTTATAGATTTAATTTAATACTCTGATTTGTTTTG CACGTCTAACTGAAATAGGAATTAGAACAAATAAACTAGAACAAGAAGTT TTCCTTCATGTTCATCATGCCAACAATTAAATCAAAACCGCACTCACCAT TTCCTGGCTTCTCTCCAGGGAATTGTTAAATTGTATGAGATGCACAGGAG ATCCTTTTGTGCTGAGCATATGGGCATAATTTTGGAGATGCTATCAGCTA TTACGTCCCATGCCAGTGAAGTGAGCTCTGAATCTGCTTTACACACCAAA TTCCAGAAAGCATGCTCCCTCCTGGAGGTATCTGCGCCTGCAGTTATACA TTTCGAGAATGAGTCTTACCAGAGTTACCTCAAACTTCTGCAAGCTTTGC TTCACGACAACCCATCTTTGTCTCGAGACATGAACATTGAGTCACGAATT ATGCTCGTTTCTGAGAAAATACTACGGACTTATCTGAACTGTGCAGGTCA TGAAACATCTAAGGATGCTTCTCGTAGAGATTTTGTTGGACAGTGGGGGC TGCCTCTGGGTGCTGCTAAGAAAGAGGAACTGTCTGCTAGAACCTCGTTG ATCCTCCATGTAATGCGGTTACTGGGTGGCCTAGAGAGGGAGTGCTTTAG GAAAAATTTGCCCCTTCTTTTCCCCTTACTAGCTAATCTCATTCGCTGCG AGCATAGCTCTGGAGAGGTTCAAGTTGCGCTGTATGGTATCTTCCAGTCA TTGATAGGCCCTATAATATCAGTATAGCATATAATAATTGTTCACCAACT GTACAATTTTGTCAGTCCACCGTGGTAGGGTAGCTTGATTGATGGTGGAG ATACAGTAACAGTATTTATCGAGAGATGGGATAAAGAAAAAATACAGCTT TGACACTGCCGTGAATGATTGAAACCTGTTCGTCCAGAATTCTGGTGTGG AAGGTAAAAACCTCTTTCTGTTTCTTGGCAACTTATTTTTCAACATAGAG CAGGATACTAATCTGCTTGTGTTAGTTTTGCAGTATCATCTAACATCGGT TCAGATACCTGGAGGCAGGAGGCATTTTGAAGGGCATTTGCCCTCCTTTC CTAACATTAATTTCGATTCATGGGTTATCGTCGACACCGCTGGCTTTGAA GGAAGATGAATATTGGAACAAAGTGTTTCTGACTCCCTGGTCCTGCATCA ACAGCTATGGAGTTCCACAAGGGAGTGGTCCGCTCACCAGTGAACAATTT TTTTGCGATGTAACCTTTTTTCCCCCGTTGTAACAATAGCCTCGTATAGT GTTCTCTTTTCAGCGGAGACTGCAATAAAAAGTCGTCTATCAAGTTATCC CTTCCCCCAATCTCTCCTCTTTTGAAAATACTATTACTGTATCTACATAG CAATAAATATGAGGTTTTAATTCTCAATAGAATAGATGGATAATGTGGTG TTGACTCCTAAGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.