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GrainGenes Sequence Report: AE015068

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Sequence
AE015068
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE015068
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTAGTGGACTCGGGTCTTCTCTTAGTCTTCTTCGTCTCCTCTAGTAGA
TCCCCAAATTCCGAAATCCCAATTTCCGAAATGTAGATTTCTGCCCCAAG
ATCGACATTCCATATGGCCACCGCCGGCGCGGCCGTTGATCGGCTCCTAC
GCCGGCTGGCCACAGAGGCTCGCCAGTTGGAGCTGCCTTCAAGCATAGAT
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GGTACGTGTAGAGGAGCAGTACTTTATGATGGCCCCTGAGGTGCAGGACT
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TCTTCTTGACTCTCATAGTCAACTGGTCCTTGGTTACACGGTAGACATAA
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GTCACATGATAAGAGCTCCCTCAATCGAACACCCACACTTCATCAAACAA
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AGATAATAGTGCGGTTAGAACCTCGCTTGCGGTGATACTTGTCTTGCGGT
ACATCAGAGTAACAACTAATCCTTGTAGGACTTAGGCAACAAAGTAAGCA
TAAGTATGGCCCTGTCCTCCTCCACCTTGACCTAAATATGTGCCAGGTCT
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GGAATTGTGCTTCCAACGTCTTCGAGATTTCGCTTGGCGACTCCTCGTCC
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CTAGAAGTCTTAACCGAGTAGGACTTCGACCACAAACCAAAACGTATCCT
GATTCGAGATAGTTCAGATCGATCTCCACCTTCAATCCGACCCCACGTGA
TTATCCTGAGCTCCACGTCATGCCTTGCGTCATCCAACTCGGACTTCCTT
TGTGCCATTGTCCGCACAAAGTTATCTGAGTTGGTCCACACCTTTGTCAA
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AGCATGTAGCAGTGCATTAGTGACCCAGCCATGACCTATTCAAGACTAGT
CGGGTCCTTGTCTCTTCTCGTCGAGCTAGCCTCTCCGGTTGAACCAACCA
GACCGACAACTCGAACCTCTTGCGTTGCTTGCATGCCAAGCCATCCATGC
GATGGTGCTTGCCGATCGGATCTGCTTCAACGACATTGTCGCCTTGCGTC
GTCACACTCGTGATCTATGTCGTCCTTTGTTGATGGTGATCCACCGCCAT
CAATGACACGTACCATAGTGTGGCTCAGCTCGGACCTTCGTAAGCTTCAA
GCCATTGCTCCGCTTTGACAGAAGCCTACCTCTCTTAGAACTACCATCAC
CTCGTCTTCATTTGGATCACCTGCATCATGAATCCAATCTGCAACCTTGC
TCTGACACCACTTGTTAGCATATAGCACTATTAGATCATTGCAGAAAGTA
GACGGAATACGATGTTTGATAACGCGGTTCAATGATAAACGTCTACATCC
ACGGGGCATGCTTAACGGGCGCTCCTCCCCATGTACTATGACATAGTACT
ATGGAAAATATTGATCCCTAGAATATTGTGTTGTATTGATTTGACCCTCG
TGGGGGTTTTATATAGGAGTACAAACTTGGGAGGGCAAGAAGCCTATGAC
TTGAAATACAATATGATCTCTAAAGTTCTAGTCTATCTCTAGTTGTGTAC
GTATCCTAACATCTCCCCTCAGTCGTAGCGGGAGTGAAGCGGACGCTTGC
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TCACCCGCGTGGACATGATCATGGCTGGCACCTAGGGGCGGTGACTGCGT
CCCCTTCTGGTGGCCGCATCACCAGGTGTGTGCAGGTCATCCACTTCATG
CATGCTCACATGAATCAGGGGCATGCAGTCATGTCCTATGGAATATGCTG
CCCCAAGTGCAAAATCCCAATTTGCATCAACAGAAGCAGATATGCTGGGC
AGCCAAGATCGACTCGGCATCAACCACGGGAGGGACTCTCGCACCTAGCG
TCAACGTTATAAGGTCATCGCCACCAATCACCGCCGATCAACACGACTTT
ATCAAGCTTTTCTACATCAAGCCAGACTACATCGACCCAAATCATGACAT
CAAGTTGTACGACTACACCAAGATCTTCGTCGAGTTCTACATCGCCAACA
AAAATCATCGCTAAGGTCTACATCACGCGGTCTAAAACCGCCGCCGCTGC
CGCCACAGCCCGGCGCTCTGCTAGGGCGGTCACACAATTGCCTCGCCCGT
CTGGTCAAAAACCTGCCGCCACTGCACAAAAACCTGCCGCTGCTGTAGAT
TCCTGCAGCCGCCGCACTATGACCAAGAAACCCGCCGTCGCTACAGATTC
CTGCCGCCGCCGCACTATGACCAAGAAACCCGCCGCCGCAGATTCCTGCC
GCCGCAAATTCCTGCCGCCGCACAAAAACCTAAAACCCTATGACACAAAC
CGCGCATTTTTGCGCCGCCGGCGCTATCGGCTACAATAACCACGACAACC
TTGACCACGACTACATCATGACCGGCTACCTTGACATCGACATCAAGAAC
AACGTCTACAACAACTCAAGAACTCTAGTCAACATCGTCCACGTCGTCAC
TTGCGTCCACGCCATTCCCGCTGTGACTGTGGGAGGGAAGAGAGGCACTA
GAAGGGGATACAGTCACCACCCTAGGTGCCAGCCATGATCATGTCCACGC
AGGTGATGATGGCAAGGAGGAGAAGACAACGCAAGCGCAAGACTTCAAAT
CCAGTCGCAAGCGTCCGCTTCACTCCTGCTACGACTGAGGGGGGATGTTA
GAATACGTATATGTGTATGGGCTAGAGATAGATTAGGACTCTACATCTTG
TATTCCAAGTCTCCACCTACCCCATGTAATTCTATATAAACTCCACAAGG
GTTAATGCAATACAACACACACAATATTCTAGGGATTCAATATTTTCCAC
AAGTACCATCGACGACAAACCCACCAAGCTCCACATACACATCAGATATA
CAACACCACGCTGGTCCGGTAGCCCCTGCTACGGGCACCAGACCGTCCCA
GAAATCAATCTCGTGTATAACCTACAACTTGCGTCTAGTCTCTTTTGGCT
ACTCCCGTTGCCTTTATATATTTAGCCAAGTTACAAGTGTTCGACTCCAA
GTCTCCAACACCTAACCTACCGTGTAATCCAAATCCAACTGTAGCCTATA
CACATATTCGACACAATTCCAACAATTAGCGTGGGATTTTTTTTTGCAAG
GGTCATGTGTAGGTTATTTTCTTGTAACAATGATACATCCATGCAACACA
TTAGCTAAATGTGCATAATCTAATTTATATTGAGCTTAGTGGTTCTGTTT
GCTTAGCAAAAGTGTTATAAGTTAGTAGTTATTGTAAGTTGTAAACTTAG
TAGTTCTGTTTGTTTAGCAGCTATGATGAAGTATTGACATGTAACTGTTA
ATGGGTGCCTTGATTGATCAAGTCTCAACAAAATTTGCAGGTACCAACAT
TTTGTTCATCAAGTCCATTTCACTTGTTTAGTTCTAGAGTGATTAGAATG
AAGACACTCAGAAGAAGGTTTGACCTCTTAGCAAAAGATTCTGTCATTTT
CAGTTTTATGCAGCACTCAAGCTGTGATCTTGAGCAATCTGGTAATCAAG
ACGAGCTTGATAGAGCTGCAATCCTTGGAAGAGATAACGACAGAGCAAAA
ATAAAGGACTTAATCTTGCAAAATGATGCAGATACGCTGCTAATCATTCC
TATAGTTGGCCTTGTGGGTTTAGGGAAAACAACTCTTGCCAGATTAATTT
TCCATGACCACGGACAAGGGTGGAACTTTGATCTTCGTATTTGGATAAAC
TTAAATAGGAAATTGGACCTGAAAAAGATTGCTAGGGATATTATCTCACA
AGCTAATAGAGCGATGGAAGAAAGAAGTTCAGAAGTTATACCAACACCGA
GAATCATGAAAATCTGCAACTGCTAAAGAATCGTCTGCAACACCTACTTC
GTGACAAACAGTGTCTAATTATCTTGAATGACCTTTCTAGCATTGATAAA
AGCAAGTTGGATGAGTTGAAGGAAATGCTGAGTGGTTCAAACAATTGCAT
CAAGATTTTAGTGACCACCTCCAGTGAAATAACTGCAGAGCTAATGAGCA
CAGTTCCACCATACAAGTTGCCTCCATTATCTGAAGATGACTGTTGGACA
ATATTTTCAGACAAGGCTTTTGGGGATGGAAATGATGTGAATGCATGCCT
AAAGGAAATTGGGAGGCAAATTGTGAAAAGATGTGAAGGACTACCAGCAT
TAGCTCATTCTCTTGGTTCAATAGTGCACAATCAAGTCATGGATGTCTGG
TTAGCAGTAAGAGATGAAGCATTATGGAAATTACAGAAAACATATTCCAC
TAAAATGCAACTCTTTTCACCATTCTATCATATATACTATGATATGCCAT
CAGCGCTAAAATTATGCTTTCTATATTTATCAGTATTTCCTAAAGGATCG
CTTCTTGATAAGGAAAAACTTATTCAACAGTGGATTGCACTAGATATGAT
TGGATCAAAACATGAGACCTTGCCTTCTTATGTTCATGGGGAGATGTACA
TTGAGGACCTTCTGTCCATACATTTCCTCCAAGTTCAAAAAGCACATTCA
GTAAGTCACTAAATACTTGTTAGGTTGACAGTCTTTCTTTTCATGTTATA
ACTATCCCTTTAAGCCTTCTACTAGACTTGTGTCAAAAAAAAAATTATAA
TTTATACTCAGAATTATCCTTCTGTTATAAATGCCTGAATATATAGATCT
GTTATACATGTTGAATTTTCTGTTCCCTTTTTCAGGTTAACGAAATTGAA
AACAAAACAGCTCCTACAATGCTCTGCATGCACAACGTTGTCCATGACTT
TGCAAGACATATTGCCTCTAATGATAATATAATTTTCGATGACGGAGAAT
TGAACAGTAATGCAAAAAAGCTCACCTTCCAATATATACTGTTGACCTAC
TACAGAGGGAACTCAACACTTTGCAGTCCACTGATTACCAGGGCAAGGGC
ATTACATTTCCGGAACACTAAGGCTATAAAGCTGCATAAAGAAGCATTTA
AATTACTGGACCATTTGCGTGTTTTGGATCTTAGTGGAAGCTGCATTGGA
GATATACCTGCTTCTATCGGTCATTTGAAGCATCTAAGATACCTTGATAT
TTCCGGCCTGAAGATCCAAACATTACCTTCTTCAATGAGTACTCTGATGA
ATCTTGAGGCATTGGTTCTATCAAATACTTCTCTGAAGCAATTACCCTCT
TCCATTGGTACATTACCAAAGCTAAAATATTTGAACTTGCAAGGCTGTGA
CAAGCTTCAAACGCTGCCTCCAACCCTTGGCCATCTCCAAAGACTCGAAC
ATCTTAGTCTATCATGTTGTTATGATGTCAGTGAGCTATCTGTGTCCCTT
TGCAATCTCCACGACCTCCGAATTTTGGATTTATCAAGCTGCACTGAGAT
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ATTTGTCTGGTTGCTTCAGTCTCAAGCAGCTACCAGAATCTTTTGGTAAT
CTTTATTTTCTTAGATTTCTGAATATATCGAGTTGCTATGAGCTCCAGCA
ATTGCCTGGATCGCTTACTGATCTCAGGAAATTGGAAGTTCTTATACTTC
GCAGATGTTCTAGACTTCAAAATCTCCCTCCCTGCTTTCAAAACATTCAG
TGTCTCCGAATTTTGGATCTAGCTGGCTGCGAGGCACTCCATATAAGTAC
TGAGGTACTGACAACCAACCTGGAATATCTGAATCTACAACGATGTCGAA
AGCTACAAACTCAGCCTAACTGCTTTGAGAACTTCACTAAACTGAAGTTT
CTGAATCTTTCGCAGTGCCACCCCAACATTCATAATCTTCTGAATCTCTC
ACAGGGCCTCCCTAACATTTATTATCTCCAGTCTCTTGGTTACCTGTCCA
AATTAGAATATTTGGACCTGTCACAAACTGTCCTTGACATACCTGTGTCC
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AATACATCCATCATCTGGTGTACCACAGATATTGACAGATATGATAGGAA
AAATGAGAGGACTCAAATTTGTGTTGACAAAAGATCCAACAATAGTAGCC
TCTCTACCACAACACATTCGGTGCTCTGTTGACATCGATGAACAGTGGCA
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GCTTAGGTATTGCGGAGAAAGTGAATCTGCAGAATCGGTCGGAGCTTCGT
TTCATCAAGCTGGAGTGGATGCCAACTTCTCAGTCAGCTGCAGGTGACGT
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ATTCCTTAGAGCATTTCGAGCTAGTTGGATATGCAGGATCTGTATTTCCT
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CTTGACATGGGTCTTTCTGGTGGGACACATCCCTTCAAAAAACTAACACA
CCTCAATTTGGAGTCCTTGTTCAACTTAGAAGAATTCTCTATATTGTTAC
CAATAAGCAGTGAGGAGCAATTCATATTTCCTGCTCTTGAAGAATTGTCT
GTGGTATCTTGCTGTAAGCTCATGTTCAAGCCATCTTTACCAAAATGTTT
GAAATATGAAATAAAAGAGAGTAACAATGTTCTGTTATGTGGAGAACCTG
TTGGACCAGCATCTTCTTCATCACCAGTGCAAATAGAGATAACTGGGTGC
ATGGTACCATCCAGTTTGTTGCAGTGGATTAGATCCTTGAGAACCCTTGA
AAAAGCAGTAATTGATGCCTGTGTAGGAGAGGATGGTCGAGTGTTAACCT
CTGTTGAGTTCCTGGAGACAATGAGCAACGAAGAACAGTCCAGCAGCTAT
GCTGCACATGAAACTACAGCTGTCAGTCCATTGGAAACAATCATTCCACC
TCAGTTTACTATTCAGGTAACGAACAATGTTTTTTACTTTTTGAGTTACT
TCTGCTATATTTCCAGCATAATACCTATATTTTCACTCTCCTGTCTTCTA
AGCTAAAGCATACGAAACTTGCCATTTCCAGATGTCCATGATGTTTGATC
ATGTTCCCTATGTCGAAAGAGAATACATACACATTTATAGTCATTGTTCC
GGAATTCGGTAACTGGTAACTGCTCGCTCGGCTTGTGAGAATCGGCCATT
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ACAATATATTCCAACATATATATAGTTTTTTATGTATTATACCATACTCC
ACATGCTCCCAGCTATATAATATACTAAAATATCCTATTGTACGCATGTA
AAAAGCTTAGACAAGAGGTAGAATTGTAACCTGGACGTTCTGGTCTTATA
CCACTCTCCCAGCAAGGGGCGGGAGGAGCCCCAACCCTAGCAATTTGGCA
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CCTTTCAGTTACTTGATCGATGACAGTTAATCGGGCTGACAGCCGATTAA
TCTCCGACAACTGATTGTATGCCATTTAATCGCCCTGGCCAGTTGACACA
CCATATATGTGGTATTCGCTTCAGCTACCCTCCGAGTAGCGATTGAATGG
CCATTTAACTGATTAATCGGCTGAATTCTTGAACAATGTTATAGTATAAC
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AAGGCTAACCATAGTGGGGAGTATCATGTAGTAGTATCATGCATATGATA
TTACTACATGATATATCTCTATAGTGCATTGTATCATGTGGTAGTATATT
TATTGATTTGTAGAATCTCAATGTAAAATTGTGTACTAAATTTAGTTGCC
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TCTAACCATCTCTTTCTTCATTAATTGTTGTGCCACATCAGATTTTTGCC
AACATGACATGCATGATACTAGCTATGATACTCCCACTATGGCTAGCCTA
ATAACTAGGGCACATTATGAAGAATCTTCTTGATCGAACTGGCAACCCAT
ATTATTTTGATCTTCTTCTTGCTTAAAAAAACATCTTCCTCGCCCCCCGC
GCACCCACACAGAAAAAGAAAGATCAAATAGTTTCTGCATTCGTTTTTTG
CTGACATGGCGCAAATCTAGGGTGGGTTTAGTCACATATGCAGCTGGTTA
AGGACTATGATCCGCCAGTCCATGCGATAAATATTTTGAAGTGGTCTTCC
TAGAGGAAGAGAATGATACATAAAAAGAAGCAGCAGCCATTGCATCTGGT
GGACGTGGCCAGTTGCAAAAGTGAGGTGGTGTTTCCTCAGGAACAGGCAA
AAACCAAGGCTCTCGAAGCAAGAAGCTAACATCAGTGGTGGTTCTGGGTA
AAAAAAAGTGTCCAGATACTTGCCAGCAGAGAGTGGATGTCACGATGACT
GTTTGGTGGAAGCTGGTGACGATGCATTGGCGATCTGCAACTAAATACGA
GCATGCCAAAAATGTACACCACTCCTCAAGACTTCTCTGTTAGGAAATCG
GAAGTAATCCAAAGAAGAAAGACTCCAGAGCCAGAGAACGTAATTGACAT
TTAACTCAGTGGATGAATGAGGAATAGGTAGTGCACAATATGATGTGGAT
ACAAAGACGAGAGTTCATCGAGGTGCAGAGTTTGATTTTTGTGTTGTCGG
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GGGAGAGAAATTTCTGCTTGGTTTCACTGCACTGGGTTTTCCACCATTAA
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAGAAAGCCTTATTACCATTTATTATCAAT
AAGAAGTAATTATGAATGAATGATTCCTCCAAATTGGTGATGTTTAATTC
AAATATTCAGTTTCACAACTGAGCCTACAACTCCCAGCGTTAAAGTAGGA
AACACATAAGTATATGTGAACACAACATACACTACACAGCTTACATTCTA
CTAATTTGATTCAAAATCTCACTCTTCTTAATCCCTCTGTAGAACGGTTG
GCATCAATGAGCATCAATAGCTCTACAATCTCAGAAGATCTGTCCACGAT
TAGTAGCAACACCTCCTTTGCTGAGTCATCAAATCTTAGTATCTTCACCT
TTGCAAAATTGAGGTTTGCCACGAGAAATTTCAGATCTGACTATCTTCTA
GGGGAGGGTTGGTGTGGCATGGTTTACAAGGGCCAACTCCAGGAAATAAT
GAACACATCAGGGAGTGGCACTGGTATGGTGGTTGCCATTAAGAGGTTCA
ACCGTGACAGCTACGAATGGATGAATGAACATAACTGGAAGGTAACTCCT
CTGGGGTTGCCTAATCTTTAACAGTCACTATACTCTTTTTCTGTTTATTG
ATGATGTTGATCCCCAACATTGTTAGCTTTCAATGTATTCTGAATTTGTA
TTTTCAATAATCAAGCTGTCATGGTGTGTTTTGTAGATGAGTGGATATGG
ATGCTTATATTACTAAATATTGTAGTGACCAACTTTATACCAACGTGAAC
TACCTAATAAGAATGATACAGTATTTAGATAGAAGCCAATCATATTGATG
TGACCAGAAGGTTTAAAGTATACTGAATACGATATTGGTGTATGATTCTG
AAGGAAATATATGGGTATCTGTTGTAATATGACTAAATAAAATCGCTTTT
GGTGGATCATCATATACACATTTACAAGACTAGAGATGATAGTTATTCAA
CCTACTACCCTTTAATTTGCCAACAGCTGTTGTCGACATCAATTTAAGCA
AGGACTATCATAATTTTGACTGATTGAACCAATATCAGATATTCGGGTGT
TCAGTTAGCTGATCTCTTCTTAAACAAGTTGAATTGCATATCAAAACATA
CCGGATGAATTTTGGAAGGAATTCGATAGCAGAATTTCTCTAGCCTCGGT
TTAAATGTACCAAGCCGGATGATTGACTTGTCGCGACTTGTTTTGAGATG
ATTTTTTTACTTCCTCTGTCTAGAAATATGTGACTCGGATTTTTCTAGAT
TCACATGTATCTAGACACGTTTTAGTGTCTAGATTCACATGTATCTAGAC
ACGTTTTAGTGTCTAGATTCACATGTATCTAGTGCGAATCTAAACAAATC
CAAGTCACTTATTTCCGGATGGAGGGAGTAACAAATTTACACACACTGAG
GCTATTCTAGCATTTAGTAGTTCAAGCGCTTTAGAGCCTTAGACTGGCAT
CTTGTCATTGAAGTAATGTTGCATGAAATCTTCAGGTATTTTACCTTTTC
TGCTACTGAGCGAGTATTATTCCTTTTTTGTACTATTTGTGGTGAATCAT
ATTTACAGCTTATGCCGCACGGACGTGCATTACTGTCTCAGACTGAACCT
TTTGTTTTCAATATAGGACAAAATGAATCTCCTTGGAAGGATTTCGCACC
CCAACCTTGTTAAACTCATAGGTTACTGCTTGGATGAAAGCATATTCCTT
GTCTATGAGTTCATGGAAAAGGGAAGCTTGGAGAGCCACCTCTTCAGAAG
TGAGTCTTTCGTCAAATGAACATCTACGATAATTACACCTTAACTGGTTC
TCTTTGTCACGATGTTCTACCTCTGTAAATTCTGATTAACTACATGTTTT
GAGTCTTGTTCATATGTCATTGTTTAGGAGGAGCAAATCTATTATCTTGG
AGTCTCAGGGTCAAGATTCTTATTGGGGCAGCCCGTGGCCTTGCCTTTCT
TCACTCGTTAGAAACACCATTCATCCACAGAAACTTTAAGACTTCAAAAG
TCCTATTAGATTCGGTAGATTTTCTTCTGGCAACTGACGCAAAAAATACT
TACTGGCTCTTTCATTTTCTCTGTCTGATCTTTTTTCTTTAACGATGTAT
CATTTTTGGTTGTTGAACATTAACGTATCTTTCTGGTTGGACATTGTCTT
TTCAGAACTACAATGCAAAGCTCTCGGATCTCAGACTCGCCAGGGATGCC
CCGGATGTGGATATGGATCGATCACATGTATCAACAGAAATCATGGGCAC
ATGTGGCTACGCAGCTCCAGAATATGTGGCTACTGGTATAATTATTGATG
AATCTCTTATGCTTTGGATGCAACTTACAATCAGCAACAACATGTCATTT
GTATTCTTTGTGCTAACAAAGCTTTTTATATGAACTAGGTCACCTGTATG
TGAAGAGTGATGTCTATAGCTTTGGCGTTGTGCTGCTGGAGGTGCTTACT
GGCCGGAGAGCAATCGACCCAAATCGCCCCAGGGGGGAGATTAACTTGGT
GGATTGGGCGAGACGATACCTGGTTACCAGGAGAAGGAGCCTAAATAGGG
TGATGGATCCTCGTCTTGGGGGGCAGTATCCTTCCAAAGGAGCCTTTAAG
GCATCGCAGCTCGCACTCACGTGCCTTTCATACGATCCTAGGACACGCCC
TTCCATGGTTGAAGTCCTGAAGGCTCTCGAGGATATCGACTTGAAGGATC
AACAACAGCTCACTGCAAGTGCAACCCTCAGGGACAGTCATTGATAGGGT
GCGCTCCAGAGGCTGAAGTCCCATAAACTCAGATGCGGCAGCTCTGTTTT
CTTAATGATTTTTTCATGTCTGCACAAGTGCGCATAATTAAGTAATATAA
ATAATAATAGGCTATGTCTCTTGTGTCATTAGTGCAATAATATTCTCCAT
TTGTGTGTAATACATATAAGCTTGTTTCAGCTCATGGCTATGACGGTTCG
GTGCACTAGAATATCTTTTTCCCAAAAGGAGTGTTCGATAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.