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GrainGenes Sequence Report: AE026137

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Sequence
AE026137
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE026137
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTCATCCCCACCAATCCCGTACCTATCTTTCCTCTTCCTCTCGGCTCTTC
CTGACCTACCCAAGCTCCCAAATGCGGCTGTAAAATCTGTTCTAGTACAG
TCCACCGCCGCTGTGCCCTAGAGCTGCCGTTGTGCCGTAGCTTAGAGTCA
CCGCCGGCGCCTCAGCCCCGCTCCCTACGCCGCACCCGCCCCCTCCAGCC
GCACCCGCCCCCTCCGCCGCCGCTCACGCGCGTCGCCGGCGCCGTCCCCG
TTCTACCTCGCGAGGGCGTCGCCTCCCCACTAGCTCGATCCCACCGCCCG
CAGTGCTGGCCACTGATTTTTGAGGTATGCGCCTTTTGTTATCCTGGGAT
TAGCCAAACCCACCACTGACCTCCACAAATTGTGGGCGTGCCGCAGCACG
CCATCTAGATCCGCCCCTGGATTTGGTAGCTGCACCAGCAGCTGCTAAGG
TCACAGGGCTCGTTCCTTTCGTGGTTTTAATTTCGCAACCTGTTTCTATT
TCTGCTTGTTTTGAGTTCTAATTAAGTTTCCCGTCTTAAGGTTTAGTATA
ACGCCCCCGCATATTTTGCTTCTGCCCAAGTACCGCACGCCGGAATGATG
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CGGTAGTTTTATTCTTACTGAAGTATCTAGCGTTTTATCTGCCTTCGTAG
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ATTGGGAGAATTTCGAGCACATCTGAAGACAACTCCTCATTCATATGCAA
TGTCACTGCTTAGTAGATTTTTCTACAAGAGGCCTCCCGATGGATTACTG
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TTTTGCCGCATGGAATGTACCCAGTCTATTTGAATGGGATTATAACAGAG
TTACATGAAGAACACGCGGAGTCTTCATTTCTAGCGATTAATTTCAGAGA
CGGGGATAAGAGAAGCCTGCTTGCTGATATCCTACATGATTACGATATTC
CAGTAATTGACTACCCACGTCATTTCGAAGGCTGCCCGGTGCTTCCTCTA
TCTCTTATCCAGCATTTTCTTCGTGTCTGTGAACACTGGCTATCTACAGG
GAACAGCCAAAATATTATACTACTCCATTGTGAGAGAGGAGGCTGGCCAT
CATTGGCATTTCTGTTATCTTGTTTCCTTATTTTCAAGAAGTTGCACAGT
GCAGAACATAAAACTCTGGACATTGTTCATCGTGAGGCACCTAAAGGATT
CCTGCAGCTTTTTTCTGCACTCAACCCAATGCCCTCTCAGCTCCGATATA
TGCAATATGTAGCCAGAAGAAATATTTCTCCAGAGTGGCCTCCAATGGAG
CGGGCACTCTCTTTGGATTGTCTGATTCTCCGAGCCATTCCAAATTTCGA
TTCCGATAATGGATGCAGGCCACTGGTCCGAATTTTTGGTCGAAATCTTC
TTGGCAAGAATGCTAGCATGACCGAGATGATTTTTTCAATGCCCAAGAAG
AAGTCCTTGCGCCACTATCGGCAGGTAGGTGATAAATTCAATTGCATGCA
GTTCTTGATATCTTTTATTGATCTTGCATCAATCTGCGTTGTTTTCATGC
AGGAAGACTGTGACGTGATAAAAATTGATATCCAATGTCCGGTCCAGGGA
GATGTTGTTCTGGAGTGTGTACATCTCGATCTTGATCCAGAAAAGGAAGT
TATGATGTTCCGGATAATGTTCAATACTGCTTTTATTCGTTCAAATGTAC
TAATGCTGAATAGTGATGATGTTGATATACTATGGGGTTCAAAAGATCGG
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AATTTTCGAAGGCAAGAAATCAATTACTGATTCATATTTGGAAGTACAGG
TGCTGTTTTGTGAAATTGGGGGCATATCTCCTCCAAGGGCTCCAACAGCA
ACATTGAACGGTGATATGAAAGGTGGTTTACCAATTGAAGCCTTTTCAGC
TGTTCAAGAACTCTTCAATGGTGTTGAATGGATGGAAAGCAGTGACAATG
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TTCCAAAAACTAATACTCAATGACATGAAAGAGCTTTCAAAGTTCCAAGC
TAAAGTTGGCCTGCAGATGCCACTAATGTCTCCACTAGATTCTGATGAAG
AAAAATATTCCGTGGCTTCTGATTCTGTTTCTTCAGCCGATTATGAGAAG
GTTCAACATGGCGGGAACTCATCTGACTCAGAGAACATTGATCGTGCTCT
AATTAATGAAGATTCTGAATCTATTGGTACATCTATTACACAAGTCATTT
TCCTTGTTAACCTTCATTGTGTATGTTGAATAATTTATGTAATAAGCCTT
CAGAAGAACACTTGCTTCTGTTGCCGGGCTTGATGATGCCCCCCATTATC
TTTGTTCTTCATTCTCTTCTTTTCACCATCTTTATTAAAGTCTGATTCAT
AACCATCACAATTTGTGCAGCTACTTCCTCAGGGAACGCTTCATCTCCAC
CTCCTCGACATGGTAGATCTTCTAGCCTTTCCACTGAACAGAGTCTGCTG
CCAGCAGAATTACAGCAGGAGTTCCCAAGTACAAGGCAGCTGCCACCATC
ATCAGCAGAAAATGGAGACAACCATGTTATGTCGGCACTGGTGCCACCAG
CAGCCACCACAAATGAAAGCAAACCTCTTCTCTCGGCACCGCCACCACCA
CCACCACCACCACCAAGTGGCAGCAAACCTGCTTTTTCGCCGCCGCCACC
GCCGCCACCGCCGCCACCACCACCACCAGGTGGCAGCAAACCTGCTTTCT
CGCCACCGCCGCCGCCACCACCACCACCACCACCTCAGCGTGGCAATTTA
TCTTCTCCACAGCCTCCACCTCCGCCACCCCTACCAAATTCTCGAACAGG
AACACCTCTATCTGCACCAACACCACAGCCACAGCAAAATGTTCCATTTC
ATCCAGTACCACCACCTCCACCACCCCCTCCACCTTCATCCCAAGCTAAC
GGAATAGCTAACAAATGCCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCCCCACCCCGCCC
CCCTCCCTCTTCTAACAGAGCACCTACAACTGGTGCTGCCACTCTGTCAA
AAGGACCACCTCCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCTCCACCTGGTGCT
CAGTGCCCACCGCCACCTCCACCGTTGCCAGCAGGCGGCATTCAAAGAAC
TCCTCCAGCGCCACCACCTCCTCCCCTGATGACAGGGAAGAAAGCTCCTG
CACCGCCCCCTGCACCACCTCAAGCACCAAAACCTCCTGGAGCTGTACCC
CCTCCAAGCTCAAAGATCTCGAATGCACCTGCACCACCTCCGTTATTAGG
AAAGGGAAGAGCAGCAACTGGATCAGGAAAAGGTCGTGGCATTGGGTTGG
CACATCAAAGTAACCCCCCAAAGAAAGCTTCTTTAAAGCCTTTGCACTGG
GTGAAAGTTACACGCGCAATGCAAGGAAGTCTCTGGGCGGATGCCCAAAA
TCAAGGGAGTCAGGCTAGGTAACTGATATTCTATTAATTTTTATGATTTA
ATCAGCTGTTGATTTTTTCACATCATGATTTCACTAGGTGATACAATATG
GCATTCATTGTTTATGGACTATTATCGGGCTGATTTGTTCCTGACTATGT
GAAATTTATCTCATGCTGCATTTTTTGTTATTTCGACATGGGTTTGGAAT
TCCTTTTCCTTGTTTAACATGTGGACAATCTCTGCATTGAAACTGTATTT
ACCCTCATACACTATTTTGCAGGGCTCCTGATATTGATTTATCCGAGTTG
GAGACCTTGTTCTCCACTGCTGTTGCAACCAATGCAAGTGAGAAAGGAGG
AACAAAGCGTGCCTCAACTGTTAGCAAGCCAGAAATTGTTCACCTGGTAT
GGAAACTTTCACTTTCTTAATGTACTGATTTTCTGTGGAGCACTCAAAAA
TTCTTGGCCTTTCATTCTTGTGCTTCTACCTTAAGCACTTAAATCCTCCC
AAACTTGTTTCAATAATCTTGTTATTTTTTTCATGATATGTTGAATTATC
GAGCCCTGAATCTTGGATTTGTCAAACCATTCTTCTTAATTAGAACCATT
GTATGATAATCAAGGATTATGAGTCGATGAGTCGAGCCGAGTCGTTGGGG
TACCGACTCATAGACTAGTCAAGACTAGTCTAGACTACTGCTCGACTAGT
CGACATGTAGTTCAGCATCAGCTAGTACAAATTACTATCATGTATGGCAA
CCAGATAGGAGATTTGATAACTAAAACTGACATAAGTTCAACACAAGTTA
CACTGGAACTTCATGTCGCGAGTCTAGAATAGTTAGGGTTCCCAATTTTC
TTCCCAAGCACCTCACTTATCCGGCTAAAATTGAGTCGATGGACTCAAAC
AACAGGACTAGTCTAGACTAGTCCAGGACTAGTCGTTCGACCCAATTGAC
TTGAGGAAATAGTCGAGTCGACCAACCGAGTCGACAGTCAGTTTAGGACT
TATAGACTAGTCGTTGGACTAGTCTAGAATAGTCGTTGGACTCATAATCC
TTGATGATAATATGGTATACATGATTACTGCTCTTTTTAAGTCAATCTAT
ATATTTATTTTTTCCTTGCAAGTGCTCAACTTATTGACATTGAAAGCTAT
GCGGTGTATTATCCATTTAAAGTAGGAAACTATGGCCTGTCATATGTACA
GCACTCCCTACTGCAAACAATTTCCTTTTAAAGTGATTTTTGAATATTTT
TTCTTTCATATTCTTGCCACTTGCCAGTATACTGGTTTCATGTAACTTCA
GTTTTCTCGACATCTTTAGTGATTTGCAGTCAACATAATTCTGTTCTAGC
ACACAGAGTTAGAGAAATTATGGTAATTATTCCATCAGGTCATGAACTAA
TTATTCCTGCTAGTTGTGTTACAGGTTGATATGAGAAGAGCAAATAATTG
TGAGATCATGCTTACCAAAATCAAAATGCCTCTTCCTGATATGATTGTGA
GTATCCTTTGTGAGTTAACTACTCTACTCTGTGACAAAAAAGGAGGCACA
TTGATTTCCTCCTTTGGAATAGTGTTTACCTGTGTCATTCTGAGTATCTA
AAGCTTGTATCCATATTATTTTGCATTTTCTCGTTCTGCTCTCTTACTAT
GCTGACTATCATTTTTTTTACGGAACTATGCTGACTCATTGTTTGTAAAG
GTTGTTGTTATATGTTAATAGATTTTGTGATGTACACAAGTTTTACTAAC
ATGTTCCACACACTATGCATGAAAATTTCTTTCATCGAAAAGTCAGAATG
CTATAACTCCTAGGCTTTTCTTCTGCAATATGCACTCATACGGTGGTATA
ACCTTTGGCTGCCTAAGCCTACATAATCCTTCTATACTCTCTGTATGTAA
AGTAAAACCACTGTATATGATTGACGTACATGCAAGTGAGCTGTGTTGGA
TTCCTCGATCCATTTTTTAATCGTCTAGGCAATTTATCATGTTGATGACA
TTATTATTCTGCTCAAATGATGCTGTTAACAATTGTCTGTCAGCCTGATA
CTTTGTTATGTGCTCATATGTAATTTTCTTCTGTATATGGTTGTCTTGCA
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AGAATCTCATTAAGTTTTGCCCTACAAACGAAGAAATCGAGATGTTGAAG
GTGCATCTGCTAGCTATTTTTTGCATTCATGATATGTAACTTGACTTTGA
CTTAGTATCTGATGCTGTTTTGTTCTAAATTGTTGTCGTTTTTGTCTGTT
TACTCAGAACTACAACGGCAACAAAGAAATGCTTGGAAAATGCGAACAGG
TTTGTTTAATATTTTGGTTGCATATAGTCCTCCATTTTGAATATTGATGG
AAGCATAAACTCTGCTGCAGTTTTTCCTGGAGCTAATGAAAGTTCCTCGT
GTGGAGTCCAAACTAAGAGTTTTTGCTTTCAGAATTGCATTCTCAACACA
GGTCTGCTTTCCTCCTTCACCAGTTAATTTACTGGGATTGTCTGACTTTC
TCTGTAACATGCAGTTTGTAATTGTGATGTCTTACTTTTTGTCAGACAGA
TGAGCTAAGAACTAACTTAACCACCATAAATGATGCAACAAAAGAGGTAC
AATGTCGTATTATCTCTTCTTGTGTAAATTTTGAACATATATATTCTCAT
ACATTGACTGTTAATTTTTCACTTCATGCAGGTGAAAGAGTCTCTGAAGT
TACGGCAGATAATGCAGACCATTCTCACGTTAGGGAATGCATTGAATCAA
GGAACAGCTCGAGGTATCAAATGATTGTAGTAAATTAGCGTTTGTCTGGT
AGTTTATCTGATATGGTGATGGGTTGAACAGGTTCTGCTGTTGGCTTCAG
ATTAGACAGCCTTCTTAAACTATCGGATACTCGAGCAAGGAACAATAAGA
TGACACTGATGCACTATTTATGCAAGGTATGCGCTTGGTGTAAAGTGGTT
ATTAACTATATTTATTTTGATAAAATCTCTCGATCGATCTTCACTGCTGG
CCATACCTCGCAGTGATTCAATACTGGTTAGATTTATTAATATAACTTAC
TGCAGTCAGTTGAACCGTGCCACTTCTGATGGACTTATGGTACACGATCG
TGTTGTGCTAGTACAGAACTGTAATTTACCTGAGCCTTTAGAGTTGAGAA
TCATGTATTCTGACTTAAGAGTGCATACTTTGTTATATATAAGAAGAGCG
ACCACTTTTCCGTCCTGAACTGTACCAGAAAGTCATTTTCAACCCTGAAC
TCTTAAACCAAAGAACTGCAACCTAGAACCATTGCAATACACACTGGCTT
TTGGTGCCAATTGCTGTACACAACTATGTGTGGCAGATATCTATATGTTG
CATAGTCTGCTCGAAATTATTTTCCACGGGTCAGCTCTGAATTTGTCAAT
TGCTAAGATCAAGCAAACAGTTATAGGGTGCTCCAAAGACCAATTATCAG
TCTGCCACCAGGATGTGTTTCAGCCTGATGGCTTGCCTTCTTCAATGTTG
GTAATTTTACTGGTTATTAGTTGAGGGAGCATGAGCAATTTGATTTCAAT
TAGTATTGCATCTCATTGGACCATTTTTTCTCAAAAGCAGACCCATCTGG
TACTTGATCCGAGCTCTTCAGGCACCTCAATACGTTTCCTGGATCTTTAA
TCTTGAGCTGCCTTCATTTGAGAATATACCCTATATAAATTATAATCCAG
GTTAGGTAGGTGAGAGGTCACTAGTGTAGATGTTAATGATAGTTTTCACA
GGAGATGTTAGTTGTACGTGAACTACTAGTATTGCATAGACGCAATTAGT
GGTACATTTGCAGATTGGTAAGCATGTGAATGATATTATTAACTATTGAT
GCATGTGCCACCTGGGTTCAGTGACATGTTTTGAGGCGCTCTTGTGCACT
ATTCTTAAAGTCGGCTGTGTACATGGAATAGATGCACTACTTGAGTCTTT
GTTTGCATATAATCAGTTTGGTATTCCTCATAATAAGATGCTTGGGCTGT
TTAATTGCTAATAATAGGATTTGGTGGTCATTCATTTCACACAAAGATTT
TCTGAGTTAATGAAAAAAATTCTATTTTTGATTCAGTTTCCAACTATATG
CATTTTAAGAAGTCCTTCAGTTGCGTTTGCAAGCTTGTTGAACTTCGCTT
ATCTTTCTTTATTACATGCTAGCTTCTCGCTGAAAAGTTGCCTGAGCTTC
TTGATTTCGACAAAGACTTGATTCATCTGGAAGCAGCTTCTAAGGTAATG
TAATGATTTGTTAATAGCAATTCTGGATGGTCATGGAGTTACTCACCAAA
TACATTTCTCTGTGATTGCATTTCTTCCCCCCCTCCCTCCAGATCCAATT
GAAGTTGGTTGCTGAAGAAATGCAAGCCATAAACAAAGGTCTTGAGAAGG
TTGAGCAAGAGTTGGCTGCTTCAGTGAATGATGGTGCAATATCTGTTAGC
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TGTTCTGTTTACAATTTTTCCACTACTTAAGGAGCTTATATTTTACTCAT
TAAAGGCAAGAAATGACATATAATTTAAACAACATTATTATTACCAAATT
TTGAATTAGCTGACCCCAAGTTGAGCACGTACTCTTTTGTAACTTTACAT
GTAGCAAACAGCATAATAAGTGCATACTACCTCTATCCCAAAGCTTAAAG
TTTATTTTGACCAAGTTTTTAGAAAAAATATTAATATTTACAATATGAAA
TCCATACCCTTTGATACATCATGAAACATATTTTCACATGGTATCTATAT
AATATCATAGTTGTTGACAGTTTTTTCTAAAAGTTTGGTCAAACTTTCCG
TAGCTTGACTTTTCAAAAAAAAAAAGCCTTAAGCTTTGGGATGGAGGTAG
TACATACTTTAGTACCATCCATTCATTGATCACTTCTATATTGGAATGTA
AATAAGGTCACAGCCTGACATGCGTTTTGCACCTTCCAAGCTGAAAGGAA
TTCCTACCAGGCTCTTTGTCTTTCACAAATGTATTGCTCAGAACAATCAT
GAATGTACAAGAGTAAATTGACTCACCAAAATATTCTGGTAGCCACCGAA
CACAATTCTCAAACCATTTGGGGAATTGTTGGCGTGCACTTTCATGCATC
CAGAACAGCAATAGCTCTGTGTACTGTCTGAATTGTGGATTCAGTAGAAG
TACTGACGTTCGGGGACTCTAACTCTAAAGTAAGCATGTCCGACGAAACT
GTATGTAAGTGTGCAAAAGAAATGATGATTCTTTACGAGTGAACTGACAT
CAGTTGCTTTTACAGGCATTGAAATCCTTTCTTGACTCAGCAGAAGCTGT
GGTTAGGTCCCTCATTTCCTTGTATGCGGAAGTGGTGAGGCCCTGCTCTG
AAGTTATTTTTTGTGCACGCCTTGTGTTTGTGATTTGTTTTTGATTGCAT
CCGTTTTGCAGGGAAGAAATGCTGATTCCCTAGCTCAGTATTTTGGTGAA
GATCCAGCCCGCTGCCCTTTTGAGCAAGGTTTGTGTGGCCTTTATAAATT
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ATCCTATGACGAAGGTTGTTTGATTGCATTAGCACAGTTAAATTTTTTTT
TTAAAAGTTCTGTCTTGCCCCTTGAGGAAGTTCTGCTCGTACACGAACAT
TTTTCTTGCCCAAACAGTCATTAACCAGAGTAGCTATTTATCGGGAATGG
TCTATCAGTGGTATTTTCTGTCATTTTAGTGGGGGCAACTTGGGTAGGAT
CAAAATTTAGATAGGATCTATGATATCAATTTTTTTGAAAATACAAAATA
TGTTCAAATATTCTATAAAAAATGACAACAAACATCTGTGTTATATATGC
AACCCCCCAAAATTGCAGCTTCAAATTCGACCTACACTTAGATAGCCAAA
AAAGATAAAATTAGGATGTGAATAGCGTGAAATACTATTCACCTACAACT
GACACTATTCACAATAGAGTTTATCTTTTTTGTTTCTCTACATGCAGATG
AAATTTAGAGCTGAAATTACTTGGAGTTGTTGATACAACCCAGATGTGTT
GTATATAATTTTCATAATTTTTTGCAATTTTTGAAACATGATTTTTATGA
CCTGATCCCAAGATCTCACCTAATGTAGAGATCCTATACAAGTCTTGCCC
TCATTTTAGTTCGATTATGAGTTTAAATTGTTTGATTGATATGAACTTAG
TTTTTTTAGCATAGCTGTATTTACTTGTGGATCTTTCCTTGATGATTTCT
TGCTCTTATATTTTCAGTTACATCGATTTTGGTTATTTTTGTGAATATGT
TCAAGAAATCACGTGATGAAAATGCTCGAAATGCCGAAGCTGAAAAAAGG
AAAATGGAGAAGGCTGCTCTAAAATGACTGGAGTGAGGATATATCTACAC
CAATCTTCCATCTTGAGAGATGGGACCAAGTTGTCCTGCTGAGCAGCTGC
CGCAGAATGTTAGTACAACGCTGCCTGCTTCTGCCTTTTGATGCTCTACA
CAGTATATGGAGAGGTGTAATGTCAGAAGGCTCGCTGGGTGAGCGTCATC
CACCAAAATGGTAATATCTGTATAACCATATTCCCTGTTTGAGCTATTAT
TAGATTGCTTCTTCACCACTAATCAAGTATTAATGTTATATGTCAATATA
TGTACTGATTCGATGATTGCGGTCTCCATGAAGTTCGTGTTTCGGTTTAT
CCTGTATATAAATAGCTACTCAGATAAATAACTACTGGTTTCAATTTTCA
TGCTTATTTTTTTAAAATAATGCAGGTTGTTCGCAGATAACAAGATATGG
AACTTTTTGTGATTGTCACTAGCGGGGATGTGAGGTCTTGATGCCCCTGT
GTTGTTGTTGTACATATAGGAGTTGCTGATATATTTACCTGTACATAAAG
TTGAGTTAGCGCAAGTGGAAACAAAGCTGAAAGCTGTTGTAAAATATTCT
TGTACTATCAACAAAGACGCAGGGCCATTTTTTGCCTGGTGCTTCTGTGC
ATCCCTCAAATTAGGGTTCAGTTTAGCATATCCAGAAATTGGTAATGGCG
ACATGGAACCAGATACCTCCTCTGTAACCAATACTTGATTTCACTCACCG
CTGAACGCTGTAAGGCGTCTGAGTTACAACTGGAATGGTTTCTCAAGCAA
ACACGCAAAAAAGGTAACTTGGAGGGCAGACTGGATGCAAGCAAAACGTT
ATAGTGTTCGTACACTAGTATCGAGTGCAAACCTGGTACGTATTCCTTAG
GAATACTAACATTATAGTACTCCCTTTGGTCCAAATTAATTGATTTCGAT
TTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGACATGTTTTAGTGCTAGATACATCCG
AATCTAGACAAATCCGAGTCAATTAATTTGGATCGGAGGGAGTATGTTTA
TTCGATTATCTGTCCAATTCATTCACCAAATAACAAATTTCTTCACCTGA
GTCGGACTCCATAGCCAAATTCAGGCGTTCCCCTATTCATGTCCTGGATA
GGCCGAGGAAGGTGAAGATGAACCGGACGTAGGCGTAGCGGTAGAGGTGC
CGCATCATGGCGATCTTCTGCTCGTCCCAGGGTGGGTACCTGAGCATGGC
CTCCACGAGGAAGCCTCTCTTGAGCACCGCCTTCTTGTGGCTGAACATCT
CGAAGGAGTACTTGCCGTGGTACTGCCCGAACCCGCTCTGCCCGATGCCG
CCGAACGGCAGCGTGTCGATCCCGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.