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GrainGenes Sequence Report: AE017753

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Sequence
AE017753
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017753
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCAACATCTCTCTCCTCCCCGAGTCCTCCTCTCCTCTCCCCTTTCGAT
TCGCTCGTCTCCTTCCCCGCCTCCCAATCCTGCGCCAAAACCCTAACCCT
AGCTGGTCATGGCGACGCAGCCGCCTTCCTCGGCTGCGGCCGCAGACCTC
TACGAGACGGCCTCACAGCCGGACCCCTCCGCCTCCGCCGCCGGGGACGT
ATACACCTTCCTGGAGTTCAACACGCAGGGCGACGACTTCGACTACCCAG
ACTTCCCGGAGCTCTCCCAGCCCGCCCGATCCGCGCCGCCGCCTCCGGCC
CCCGTCACTTCCTCACCATCCTCGTCCTGGCCGGCTCCGCCCCCGCCGCC
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TCAGCGGCGGTAGCGGACGGGCTCGCCACAGGGGTCGCGGCGCTCAGCTT
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TATGCAATATCATCACAGATTGCCTAGGATTTAGGAAAATGGTTTAACAT
TTTTAGTGATATATTTTGTATCCAAATATTGTCTGATTATTAACTTATGT
ACACCACCTGTCAGTCAGTGCGAAGTTCTAAGAAATGACGGTAAATTTTA
TGTTCTTCCCGTACATCTAGCTACCATTGTTTATTATGACCCCTTTGGCG
ATACCTTTATGGCTGTATAGAGCGCACATGATTCTGTACGAAGCATATTT
GTTGCATTTCCGTTATTTGCATTACACCTTTCTCCTGTCATATACGTGGA
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AATTGCTTATTTGTGTTTGAGAAATGGCTACACTAATCATAACAATTAAC
CTTGTTTTATCCACCAATGAGCATTTGAGGGTAAGCAATATTTGTCAGTC
ATAAGCGTTCCACAAGAACATGCATGCTTCCACCTACTTATATTAAGTGT
TATGGATTTTTGGCTATCTTAATACAGTTATATATTGTACCTAAATGTGT
ATATGTTTTTTTTCACAGGTTAGAGCAAAACATAAGGAAGTTTGCCTTCA
CAAGGATAGCCCTCTGGGTGAAACAATTCTTGAATGCTACAATTGTGGCT
GTCGTAATGTCTTCCTTCTTGGTTTTATCTCAGCAAAGGCAGAGAATGTT
GTTGTTCTTCTGTGCAGAGAGCCCTGCTTGAATGTTAATGCATTGAAGGA
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GGTAGTGTGTGTGTCTGCACATGCTTGCCGGTCACCTTTCCTTCTTTTCC
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GCTGAGAGCCCGTCAAATTAGTGCCCAGCAAATTAACAAAGTGGAAGAGC
TCTGGAAAACAAATCCTGATGCTTCTCTTGAAGATCTTGAAAAGCCTGGT
GTAGACGATGAACCCCAGCCAGTGGTTTTGAAGTATGAAGATGCTTACCA
GGTTTTGAAATTGTCCACAGGCATTTGTTCCTTGAGTTTACTTCAGCTAT
GTTGTATCTTATCTTAGTGTGTCAGTAATTACTTTAAATCTTCTTGTGTA
CACTGGCACTGTAACTAAAATGCCTTTATTGTTTCTGCCAGTATCAAAAT
GTTTTTGCTCCGCTGATAAAGCTTGAGGCTGACTATGACAAGGTACTGTA
TTTCACGAATATTTTCTGTATGTGCTTGTGTTTCTTTAGCAGGACCTGTG
CCACACACACACCAAGAGAACAGATTTATTTCGTTTCATTTCCTCTTATT
TTACTGTAGATGATGAAAGAGTCACAGAGCAAGGACAGTCTAACTGTGCG
GTGGGACGTTGGATTAAACAAGAAGCGTGTTGCCTATTTTGTCTTTCCAA
AGGTTTGATTGAGAAGGAAATGCATATGGTTGTGAATACAGAGCCTCCTT
GATTGTTAGCTTTTTGTAGTTTTATAATTTTCATGACTGTTTTTTACTGC
ACTTGTTACCAAACGACACCAGTTAATCTTGGGATATCAATTTTAAATAA
TAGGAAGATAATGAATTGAGACTTGTCCCTGGAGATGAGCTGCGTCTGAG
ATATTCTGGTGGGACTTCACACCCTGCATGGCAATCTGTGGGGCATGTGG
TATGTCTACTATAAACATGATGATTGGTATCTATACCCTAACCTTGGTAG
GGTTGTTTCTATGCTGGCACCCATGCTAAGTATTTTCCCCACAGATTAAA
CTCACCGCACAAGAGGAGGTAGCTCTTGAGCTTCGTGCTAGTCAGGTATA
GTCTGTTCACTATTGTTCTTTTAAACACACTCAGTTTTGTGTAGTTTCCA
CCTTAAGCCTTTCTGGATTGCAGGGTGTTCCTGTTGAATTGAACCATGGA
TTCAGTGTGGATTTTGTTTGGAAGAGTACTAGCTTTGATAGGATGCAAGG
GGCAATGAAGACTTTCGCTGTAGATGAGACAAGTGTCAGTGGGTAAGTTC
TATGATTACTAATGTATTTTTTGTTTCGTGGGCATTGATACATGCTTATT
TTGTGTCTGTCGTGAGTTCGAGTTGAAGGGAAATCAATATGAAATCCAAC
AATTACTTCAGTTATCCTTGAAGTTATTTCATAAGTTAGGAAGTTGCAAT
TAATGCGGAAGTAGGTAATGAGAAAGCATTAGTCATATTTTGAATCCTCT
AAGGCTCCAAACTACCTTGAAATAAGACTGACTACACATTTATCCTCGCT
TAACCAGCATTGTGAAAGACAAGGAGGTGTTTAATTGTGCTTCCATTGGT
TCTCTTTAAGTAAAACTTATTGCTCACCTTACTTGGATATGGTGTTGAAA
GCAGGGAATAGTCCTTAGGATGTTTTCATTTATAAGTTTGTATTTGGATT
CTTGGTTAATTTGCAGTATATGTCGTAGTCACACGACTATAATCTTCAGC
AAATTCTTAACTTCTTTTACATTCCTTCTACACAGATACATATACCATCA
CCTTTTGGGGCACGAAGTTGAGCATCAGATAATACGCAATACACTACCGA
AACGCTTTGGTGCACCCGGACTCCCAGAACTAAATGCTTCCCAGGTACTC
TGATGTTTGGCGTGTTTATAACTTGATATAGAGTTCTTATTAGTTGAATA
ATATGTGACCTCTGTCATGCTAACTAGTACTTCTTATAGCAACATGCCTT
CATGGCTTAGATTGGTAAACTGCTCTCCTTGTTGTAGGACGTTTCATGGG
GTTCTTATGGACTACATCTGTTCCAAAATAGATGATGCCCTAGGAACTTT
GAAGCGTGCAGTGGAACTTTTCTATCTTTGATCACTATAAAAATGTAGTT
TTGTTGATTAAGTGTACTGATTTTTCATGAAGAAGTGGTTCACAATAATC
TTTTATAATATTTGTTTCTCGGAATCCATGCAAAATGTAAATATCATATA
GTTTGGATTGGAGGTTTTAATTATGTAATTTAAACTTGGGGTGGAGGCAC
ACAGCTGTTGCTATAGCTTTATTGAAGTTAAAATACTTCGAACAAACATA
TGTTTTGTTGTTGATCTGGTGTTCTCTTTTGGGGCCGTGTCATGTGTATT
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AGGTCCACCTGGCACTGGGAAAACTGTTACATCAGCTGCAATTGTGTACC
ACATGGCAAAACAAGGTCAAGGACAGGTAAAAGAAGGCATGGTGTACATT
TGATGTGCTGGTATAGCTTGGAAATATTATTTGATCTCCCGTATCTGTTT
TGAAATCTTAGGTCCTTGTATGTGCACCAAGTAATGTTGCTGTTGATCAG
TTGGCAGAGAAGATAAGCTCAACAGGTCTCAAGGTGAATGATGCATTTTA
CTGTTGAAGTTGATTATATGTTGTTTCCCATCTGGGCCTTTCAACTCGGC
TTATCAAGAGACCGAGTATGGCGTCTACAGAGCACTGCAACTATTATACT
GTTTAGTTAGCTCTCATATGCTTCACCTGAGTGCAATAATAATTGAAAAG
AGCATATCAACAGTTGGATAGAGTACACACTACACAAGTGCTCTCATAAT
GTGTAGTAGATTACACAGTGCAATTGATGATGCATTAGTTGAGTTTTTTT
TTCCAATGAGTAACTGTGGTTGAATACTCAACTCCAGGTTGTTAGGCTCT
GTGCAAAATCTAGAGAAGCAGTTTCATCACCTGTTGAGCATCTGACACTT
CATTATCAGGTACTCTCTTGATTCTTATCTAGTTCTTGCATCCAAATTAA
CCTTTTTTTGGGTGTTAATCTTGTGCTTTTGCAATGCAATTATATAGGTT
CGGCATCTCGATAATTCTGAAAAGAGCGAAATGCATAAGCTACAGCAACT
GAAAGATGAGCAAGGTGTTTTATCCGCTCTCGACAAGCATGATCCATGAT
TTAATATTTTCCACAAAGAGACTTGATATATATGCAATTTGTTAACTGAG
AGCTGTTTGTGCTTATGTTCTATTTCCACAGGGGAATTGTCGAGCAGTGA
TGAGAAAAAGTACAAGGCACTAAAGCGAGCCACTGAAAGAGAGATATTAC
AAAGTGCTGATGTGATTTGCTGCACTTGTGTTGGTGCTGGAGACCCTCGT
TTGTCAAACTTCCGTTTTCGCCAAGTACTGATTTGTCTACTTCTTGCACT
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ATGGTTACTGGCAGGTTCTTATCGATGAGTCTACACAGGCAACAGAGCCC
GAATGTCTTATTCCGCTGGTTCTTGGTGTCAAGCAGGTAAGGACATAATT
AACGAGTTCATTTAGGTTAACTTGATTATGTTTATTCATACCTTTTTTTA
TCCATTTAGGTTGTTCTTGTTGGAGATCATTGCCAATTGGGCCCAGTCAT
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GTCTTGTTATCCTTGGAGTCAAGCCATTCAGGCTACAGGTACTGGTTGCT
TTTTTTTGGTCTTAGTAGTATTATCATGTTGTTACTATTTTAGTATTTTT
TTTTGTCTTAGTATTATTATCATGTTGGTACTACACTTTCTGTGCCTTCT
CAGTTGTCCTGCATTGCTTGTCAAAATTGTATATGCTTTGTGATTGATAT
TGCTGTAACAATGTTGGTATACTTCTCAAGATATGCTCTTTCGTAAGGAT
ATATATTTACTCTTGTAGCTTGTATATCCTACATATTATCTTATGTGCAG
TAATTTATTATGTATATCACATCCATTTAAGACTCCTATGCTGCTTTCTT
TTACATTACATTATTTTAATATAAAATATTTATGTTGTTTGATGCAGAAG
AAAATGACATTTACTTTTTGTGAAAGAACCTCCATATAACATATTACTTC
ATGTACTCTTATTTGCTTGAAGTGTATAATTCCCCCCACTCCTGTTATTT
TGGATGTATTGAATTTGGTGGAAATAAGTTTCATGAGGAACATAGAAGTT
TGTGCCTGATTTGCTGCAGGATGAGTTGTCAAATCCACCAAGTTATATCT
GAGTTTTAAATCATGATATTGCAATGATTAATTGTTAACATTCTTTGGTA
AGAGTTTTTTCTAGTTAGCGGAAGAATACACCCCCCAGCCTCTACATCCT
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ATATTTCAGTTCAGAGATAATATTCTTAACTTTATCATCCTGATTTACAG
GTCCAATATAGAATGCACCCTTGTCTTTCAGAATTTCCGTCCAACTGTTT
CTACGAAGGCACACTGCAAAATGGAGTAACTGTAAATGAAAGACAGACAT
CTGGAATTGATTTTCCTTGGCCTGTTCCAAATCGACCCATGTTCTTCTAT
GTGCAGGTGTACCTTCTTGGGCAATTGGTTGCTTTTTTCATAAGCACAGA
AGCTTCTCCTGTTTATATATACTGACTCGTACTGGTTTTCTATAGATGGG
AGTAGAAGAGATAAGTGCTAGTGGGACATCTTACCTCAATAGAACTGAAG
CTGCAAATGTTGAGAAAATTGTAACTACATTCTTAAGAAGCGGTGTTGTG
CCAAGCCAGGTGTGTACTGAGTAAATATGATTACTTGTCATCTTTTTTTT
TTGCACTAGCCTTTTTGAGAAGACATAGTAAATTCTTTTGGAACTGGATG
TGTACCCATGGATCTTTTAATGCGCAGATTGGAGTTATCACACCTTATGA
AGGGCAAAGGGCGTATATTGTAAATTATATGTCAAGGAACGGCTCTCTCC
GCCAACAGCTTTATAAGGAAATCGAGGTTAACCATAAAACATGTAACTAT
ACTGTTTGCCCCTCATGATGGAAGTTTTTTGCTATATTATCTGTATTTGT
TTCAGGTGGCAAGTGTCGACTCCTTTCAGGGAAGAGAGAAAGATTACATT
ATTCTGTCTTGTGTTAGAAGCAACGAACACCAGGTGTGTTTCCCGTTCTA
TCATCTCCGCACCATAATTTTCTTGTGACTATTGTCTGACATGTTGATAA
TTATAAGTAAAGCACATCATACATATGTACCATTCATTCTTGAGTTCGTC
ATTATAAAATGTTTTTTCTATGTCGATATCAGATGCTTTTTAATGCTGAG
TTGTTTAATTGTCTGGTTGTATCAATTTGTAAATTGGCAGTTGCTTTCTA
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TCTTGTGTATAGTGCATTTGATATACTGAGCTTTGATGTTTGTTAATTTG
TGTCGTGTTCCTTAGCTAGTCCTTGATGAGCAACTGTTGTACACCGGTTC
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TGGTATAGTCGTTCTTGGGAATCCTAAAGTTCTAAGCAAGCAGCCTCTTT
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TCGATGTTGTAGTTTGGGAATCTGAAAGTTCTAAGCAAGCAGCCCTCATA
TTTCGTGATCAAACTTTGACCATCAGTTTGACCTTTAATATATGGGTTAT
GTGTCATACAGAACTGTTGGAAAGTGATTGTGAGTATGAATTCAGTGATG
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TATACCATTATAAGTTTATAACATCTGTGTTTTTAGGAGCACGAATGCTT
GGTAGAAGGGCCTTTGAACAACCTGAAGCAGAGTATGGTGCAGTTTCAAA
AACCAAAAAAGGTGAATGCCCGCATTGCCTCTTGAAGATAACTATTGGAA
AACATTCTGTCTTCTTTACCTTTAATTTGTTTCTCAATTTTATTTTTGTG
GGTAGATCTACAATGATAGAAGACTGTTCCTGGGTGGTGGTCAAGGTGTG
ATGCACGGATCAACCTTTGGCACAGTAGGCTCAGTAGATAAGAGAAGTGG
TAGGGGAAAAGGTTGGTACAGTTATATTTTTTCTTATTATTAACAACGGT
TCTATATTATCTCTTTTCTCTCTTAACACACTCATCCTCCCGCCCAAAAT
TCAGGACACCCGTTTGTTCCATTTGGGCCGCCAAATGGTGCTCATAAACC
TGGCGTGCACCCATCAGGCTATCCTTTACCCCGGATGCCTTTTCCTCCAT
TTCCTGGGTCTCCTCATTCTCAACCCTACGCTATTCCTACCCGGGGAGCC
CTTCATGGAGCCATTGGAGCTGTTCCAGCGGTGCCCCAACCTGGCAACAG
AAACTTTGGGGCTCCTCGTGCAAATACTGGTGGCCCTATTGGTGGGCACC
TTGCTCCTCATCAACAGAACTCTCAGCAAGCAATGGGAAGTGTGGGGCCG
ACTTACAACTATGCTGGCTTGGAGAATCCGAGCAGTCAACCTTCTGGTGG
AGGCCCGATGTCCCAACCCGGACTGATGACACAGGTTTGTTCGTTTCTCC
ACTGTACTATTCCATGAAGTAACAGTAGATCAATATTAACATTTTGCCTT
TCCAAAATAGATGCCTGTCCAAGGTCTCAGTCAGACATTCCGCGATGGAT
TTGCCGTTGGTGGGATGTCTCAGGTATAGTCAATTAAAGCCGCATCATTA
CTACTCCCTCCGTCTCAATAGATCTCGCAAGTTTATCAAAATTTGGATGA
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CCGACTGAATATTTTTTCTTGGTCACTAGGACTTCTTTGGAGATGATTTT
AAGAGTCAAGGATCTCACGTGGCATACAACATTGCAGATTTTTCTACTCA
GGTTTGTTTCCCATCTGTCTAAGAACGTTCTTTACTGTTTTTGGATTGAC
AGATGGCTCTGTAATTTTTATAAACCGATGCATTGTAATGCAGAAGTTTA
AGCTCACTATTACTCTGAAAGTGGCTTCTGAAAAGAATGTAACTGTCATT
GCAGGCTTCTCAAGGAGGTTATGGTGTTGAATATACACAAGGGCCCCAAT
CTGGATATCCTGGGAATTATATGAACCAAAGTGCACATCCAGGATACCCT
CATATGGGTGCAACAAATGACATTGTATCTCAGGTACATTCTTTGCAGTT
CATAACCATTACATTGCATGTACTCCCTCTGACCCAAATTAGTTGACTCA
AATCTGTCAAGATACGGATGTATCTAATACTAAATCATGTCTAGATACAA
TCGAATCTAGATAAATCTAAGTCGAACTAATTTGGGTCGGAGGGAGTACT
AAATTTACTTTTGATGCCTTTCCCTGAACATGTTTATATTCTCTGGACTA
AGCATGTTTGTATGATCCAGGATCACATGGCCCATGGCTCACATGGAATG
TTTACACAAGCTGGATACAATGACCCAACTCAAGATGAGTCTTCTCATAT
GCATTATGGGATGGGTGCTCCTGGCCATCTTCAGTCGCAGGTTGTTCATC
TATTTTCAGGTGTTCTATGTTTTCTTTTTCTGAACAACTGTTACAACTGG
AGCTAATGTAATGATTTTTCAGAGCATGATGAATCCTATGTACTCTCAGT
CTTATGCTCACTATAACACACAACCCCAGTCCCTTCAACCTCCTCCGCAG
TGATCAGGAAATCTTGTGACATATGGCTGAAGCAGTGTTAAATTTTGGAA
GTTTCATGAATTGTGCATCCCTTTGGCCCATGGCAGCTTGGTTATGCCTT
TGTGCAGTACCATGCAGAAGTGTTGGTGCATAGATATCAGTTGCAAGCAA
AGAGGACAGGCATATTTTGGCGCACTACATATCGAATGTTACTGGGTCAG
GCTTGTACGAGATGGCTATGGCTATCGACCATACACCATTGGTAAGGAGC
ACGAGGATTGCAAGATATCTCCTTGTCGTGGTAGTTGGCAATGGGGCTTG
ACAACAACAGGTCTCCACTCGTGCATTGAGAGAAAAGGGTGTCGTTACCT
CTAGACCATTCACCTGTATAGAAGGCAAAGCAGGGCTTGTAGTGGTACAA
TGTGAATATGTGCTGCCATCCAAGTCAAAGGTGCAGCAGCTATGTCTACC
TCCATGGTACCACGAAGACGGCCTGCTGATTGGTTTTGTATAGAGGTGCT
ATAGGTGGGGTGGCTAACCTTCAGATCTCGCACATGGCCAAGATACTTGT
CTGAACAATTATGTATGATTTCTATATAGTTTCAATTTTATCACAAAAAT
GATGTAGGTAATGTTGCTTGCAACAACGGGTGCAATAGCTTGCGGTTATT
GGTGCAAAGTGAGGTTTTATTGAATCTATTGGTCATCTGGTGTAACTCTG
GTTTGGTTTTGTTACTGAAAGCCGATCAGTGCAGGGCTGATATTTAATCT
GAGTGATATTCCGTGGCGTGTCTTGCTATATCTGAATTCGACCCCATTGT
CTTTCATTTTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.