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GrainGenes Sequence Report: AE019397

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Sequence
AE019397
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE019397
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTGAACCAGCCCTCAGCCCGAACTGACGCAGATTCCGAACTTGAACAGC
AGAGCGAGTAGTGTTTTGCTCATTAAAAAAAAAGCAGATCAAGTAGTGAG
CGCCGGCGGCGTCTCTCCGGCGGCGGGCTTTCCCGGCAGCAGCGGCGCAC
CTCTCGGCGGCTCGTTTCGTCGTCGGCAGCGGCGATTCCATCTGCTTCAG
AGCGAGGAGGGAGCGCATAGACTACCTGCACCGGCGACGTACCTCCCGGC
GGCGCGCTTCCCCGGCTGCAGCGGTGTACCTCTCGGCCACGCGTTTCCTC
TGCGGCAGCGGCGATTCCATCGGCTTCTCCTCCATGGTGCGCTCTCCCTG
CACCCTCTCTTCTCTCGTTCCCACTTCTTCTCTTGCTGTTCCATTGTCTA
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GTGGACGTTTAAAAGTACCTTTGAAATGTTGCATAGATCATTTTGTTAGG
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CTTCTCCTTTTTCTTTTTCTCCTTTTTCTTCTCCTTCGTCTTGGCTTCCT
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GCTCTAGAAAGCGCGACATAGAGTTGACCATGTGAGAAAACCGGGTCAGG
TAGGTAGACCCCTACATTTGGTATTGTCTGACCTTGTGATTTGTTTATTG
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GGGAACATGTCATCGTCTGAGGGGCATAATGGTATTCTAGGCAAGAAAAC
TCGATTTCCAGAATGTTGTCCTAGCACAATTTCTGCATCGATTGCATTTT
TGACCAGCCTTGTGCCGTTGCATAGGCCATTAGCGGGGTCAATGTTCCTG
AGTAGTATTATCGGGCAATTAATCTTTAGCTTTAGTATATGTGGAGGCAA
TCCGTTTGGGGTCAGGGTGTTCAGGAATTCTGGTGGATAGTAGCCATGTG
GGTCTTCTTCTACAGAATCGAAGCTGTGGTACACCATCTCCTCCCCTTTG
AAGCGATCAATCATTTTTAGGTTGATTCTGTCTACACAGTCGTTTTTTGT
CGCTAAAATTGCTCTTGAGGTGATGTATTTTGTATCATCTAGGGCAGCGC
CAGCCGTTCTGTAGATATGGCCAATGAGTCTATCCAGGCCATTATCCTCC
GTCTTATTTGGCACGCATATATTTTTTGGTAGAAGTATTTCGTCATCCTC
GTTTGTTCTCAGTTCCGTTTCCAATGCGTAGTAGATATTCTGCGAACCCC
GGGTCGTTCTGAGCCCTCATGTTGCGTATAAGCTTCATTTGTCTCATGCA
TTTCCATAGATCTGACCTGCTTAGTGACACGTCCACTATTTGTGCTCTTG
TACCCTTTCGGACAACTGGCAGCGCTTGTCTAAAATCTCCTCCAAATACG
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GCTTATGTCTAGCGCCTCAACTGCCTGCCTCTTAGTCATAGATGCTTCAT
CCCAGATTATTAACGATGCTGCTTGGAGTACTTGAACCTTGAGTGTGCGG
TTCTCCCTCCAGGCATTATTGATGCGGCAACACCGGATGTGGCTGTCGCT
AGAGCGATCTTTCCCTGTTCGCGTACCGAGGCCAGGAGCGCTCTGTAAAG
ATAAGTTTTCCCTGTGCCTCCCGGTCCATCGACGAAGAATATGCCTCCTC
TTGGGCTGTCTATTGTTTGTAGGATTTCATCGTAGACTGCCCTTTGCTCT
TTGTTTAGGTTTTCATGTAAAGATTTGTCCTCAGGGTTTACCTCTATTGA
CGACTCCTCGGTTATCTCTCGAGGTACGCCGTCCGTCGTGTCATGTTGTT
CGTCGATCTCTGGCAGAGGAAACGATTTGATGTCTTTTCCCATTGATTGT
AGCATGTCCCTGATATTTTTGAGTACCAATTGTTCGACCGTATGCTTGCA
TTTGCAATTTCTGCTGTAGTCTTCAGACATTGCCTCTAGGTGATTGTTCC
ATAGGCCACGGACGTCGCTGGGCTCGCAAAACACCAAGATTGTTGCGAAT
AGCCTTCGTAGCGATGATGGCATCCGAAACAACTCCGCTTCTGTCATGCA
GTCATCTAGTGTGTTGTCTGCCTCAATGAGTCCCCTTTTTTCTGCAGCTT
CACGGAAGTTTGGCATGAGTTGCTCATCAACTGTCCTTAGGTCTTCGAAG
CTTGTGGCGCCTGACACATGGTTTAGGAGAACTCGGAGATAGTATCGTTC
GCCTTCAGCGGGATGTGCTGCGACGATCCTCCCTACTTGGAATATAGATT
TCCGTTTCCTCTCTTGCCAAAATTTATCACCTGTTTGCCAGGTATAATGT
TCTGGAAAGTCCCTGTATAGTATGCCTCGTGCTTTCTCATGTAAGCTGTT
TGCTTCAAAGTATGCTGTCAACATTGACCTATCTGTTCCATTACGTGTGA
TAACATCGTTGATATTTTCGTTGGCACTATACGCGACCATGTGCATATTT
GGGAGATGTAGTTGCAGTTGCAGGACAGCTGGGTGTATTTTACTTAGTTC
GAAGTCATATATTCTCCACAGTGCTTCTGGAGGTGTCACCCACCGTGCAT
CTCTATACTGTCTAATCTCATCGATTTCGGCTTCGTTTATATTCTCAGTC
ACGCTTACTGATGCCCGGTCATGTCCCTTGTAGATGTACTTGAACAGGTA
TTTAACGGCTATAATGCTTGAGCATATCTCAACATTAATATGGCAGTCGA
ACATCCTCAATAGATATGGGTTGTAAGGGACTACCCATCTGTTGTCTAGC
ATGCACTTTCGAACCGTTTCTGTCCGGCCGTCATTACGCCTCCTATACAC
TTGGTAGGAGTCCTTGCCTTGAATTGTATTTTCGTTGAACGTCCTTGGAT
AATTGTTCTTGCATGTCTTGCGATTCTTTGTGCATGGACAGTTTCTATTC
AGTGCACCGCAAGGACCATGCATCATATGCTTGATTACCATTTTATATAG
CTCTGGGTATTTTTTCTTGTTAGGTAGCTCAGTGGAGATGATTTTGTCAT
ATTGCTCTGGACACGTGTACTTGTATTTTCCGGTCATGATCAGCAGGAAG
TGAGCATGTGGCAGTCCCCTCTTCTGGAACTCTACAACATAGGTATATGC
CGTCACCGTTCCAAGGATGCCCTTCTCAAATAGCTGCTTCTTCATTTCTT
CTAGCTTTGCCCTGAAAACACGGACGACAATATCTGGGCGATCTTGTGGA
GTTTGTCCACGCTCTAGTTCACGTGTAATCTCTTCCCAGTTGGGGTTGCA
TGTCATCGTGAGGAATATGTCCAGCTTTCCATATTTTCTAACTAAAGCCA
TTGCATCTAGATACCTGCGTATTTTATCTCGTGGACCTCCAATAAATGAT
GACGCAAGAATTGTTCTTTTTCCTACCGCATTTCCGTCTTGTTCTCCCGC
TCGAGTGCTATCCAGAAGGCCTTTGTATAGATCTGCCCTTAATTCTTTCT
GATGATGAAACATGTAGTCCAGTCTGGAGCTCTCAATCTTGATGTATGTA
TCTACCACGAACTGTTGTAGTAGCCTTCCTCCATACAATACTGGGTTGAA
TATGTTTGGTCGTGTATGTAGTTTATAGCAATAGTATTCTTTCATGGTTA
CCCACAACCTGCTGGTTGCATCTGTTCCAAGCATTGCGACATAAAAAGTT
TGTGTCATGGTTATTAGTGTACCATATAATAATACTGGATTTTGAAAACA
TTAAAAAGTTAACTTTTTACCTGGGTTATCGTTATGATCATCATCGTTAG
CTTCTGCTGCAGCCCTTCTCACATCTGCCTCTTTTGTTTTTTCTTTTGGT
ATCTTCCTATGCCAACCTAGTTCACCTCTTGGAAAGAACAGAGGATACGA
TAGCGGATCATAGCACCCATAATATGGTTTAATGCTCTGTATTTCGATGC
TGTTTCCATGTAGTATCACATTCTTTTCAAAAGACTTTTTTATTTCATTT
CCTTCGACCCACACCGCAGCTACCTCCGAAGTGATTGGCACGTTGTAGGT
TCTCTGGTCCAATCTTTGATCAAGGTTCAAGATCAGCCTGTAGTCATCAA
GGTTTTCAGCTTGTCCCAAACTCCTAAATTGTTTAGAATATGGGTTATCG
CGTAGAATGCCTGTTATTGTCCCGACTACTTGTTTGTCTTGCTCATATGT
TTCTTTGCGGCAGCGGCGGTACCGATGTTCTAAGCTTGGATCATCGTCAT
AGAAGTATAGCTCCAGATGCTTCGGTTCTGAGCGACTATTGAAAAATGAA
TGTACATTGTGATATATCTGACCATGAGCCCGAAAGGTGTAAATACCAGC
CGTTCGTATGTCAGTTGTGTATCTGTCAAGGTGGCAGTATAGAGTAGTAA
ATGAGAAGTGCCCGTTGAAAAATCTTATATTGTCCCGAAAATATCTTGCA
TCAGAGTCATTGCTTGTCCAAAGTCTCATGAGTTCAGGTGGTGTCTCTGG
ATTGGCAAGTTTGACCTTTCCTTTCTTGCAGCATAACCCCTCCGATTCAT
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ATGTGTGTGCTTTTTGGCATATTTTTGTAGACGTCATCATACGGATCAGG
CTTGTTATGATCCTCGTCCTCGTTGATTTCGATTTCCACTTCTGTTTCCC
ATTCTGGTGTTATTTGCATCATCAAAAGTATAGTAAATTAGTAATACTCA
TGCAAATATATCTAAAATTGTATTGAGCATACCTTGTCTGGTGAACATGT
ACTCATCCTCGCTTGTGTCTTGTTCATATACGACTTCATCATTACCTGTG
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ATATGAAATTGATAATCTTACCGTGATCATCATCATTGCAGAATGATTGT
GCCGGTGCATCTGTGTCTATGTGTGTTGGACATGCCGAAGAGGATACGTC
TGTCCATGAAAGATGGTTAGTTGTTCATTCATTTTACTTCTTCAGGGAAT
ATATGAGTATATTGTATAGATAAGAGTATTACCGTTAATTATGATTTCTT
GCTGCTTTATAGTTATTATTTCACCGTTGCCTTTTTCCATCCTTGCTAAT
ATGAGATCGATGGCCTTACCATGTTCATCATCATTGCTGAATGGTTTTTC
CGGTGCATCTACGTCTTTATTGGGTGGACATAATGGTTTGCGGATTCCTG
TAGAGGAAAGTAGTTTTACAAACTGTTCTTTTTGTAATGTTTGTACTGTA
TGAAATGTAATGAAAAGTATTACCGTCAATCAAGACTAATGGATTCTTTA
TAGGTTTGACTTCATCGTTTCCGTTGTTTAACTCAGATGTGTCTTCTTGT
GATGATACCGATTTAGTTTTCCTCTGTTTCTTCGAAAACTCCTCGTTACG
ACGATGTAGCAATGTTTGTTTTTCTCCTGGTGTCACGGGATTTCTTTGTC
TTACATTGAAGGTATATTTATGAACTTCCTCTTCTGTTGCTACATATGCA
GGGTTTATCATCGCATTAGATTCTTTGCACGGCGTGTTGCGTCTCAATTC
ACGGGTAGCCGCACCTTGTTCTATTTTAGCCTTCTTTTGCTCTGTCTGCA
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GGTTCTTTTGTTTTCTTTTGCTGATATGCTTCACGACGTTTTTTAAGCAT
TTCTTGTTTTTTTTCGTCGTTTATCTGTGCATGCCGCTCTCTCTCTCTCT
CTCTTTTTCTTTTTTCTTCTTTTATATCCATGATGACTTGATACTGCGAC
TCAATGTCTTGCCTGCATCAGAGTTTGTATACTGTAAGTATGAAACATGA
TAATATAAATGATTATATTAGTTTATGCTCGTTGTAGACATGGTTACTGA
GTTTGTACCTTTACTAACAGATTGGAAAGCTCAGGCCGATGTTGTGAATC
TCCTGAAGGACTTAAAGAGATACTGCACAATACTTGTTGTTAGTCATGAC
CTAAGGTAATTTAGAAAACTCACTGAGTACCAGCTAAGTTCTTCTCTGGG
GATGCATGCTCAGTATATGCTATTGATTGTGCACCAAACATTGCATATAT
TAAAGAATTGGTGATTATAAATTAGAATTGCAGGTCTGTGCACAGTTGCA
GATCAGTTTGAAAAATAATATCTGCTTGTAATTGTACATCAAACATGTAT
AGGTATTAAGAATTAATTATACTCCCTCGTCTGAAAATAGATGTCACCAA
ATTTTTCAAAATTTAGATGTATCTAGTACTAAATTGTGTCTTTATGTAAG
TAAGTACAGGCAATCGTTAATCAGAAGATAGCTCGTCTGCATGTATTTTA
GTAGGATTAGGAGTCTTTATGTAAGTAGTACTCGGACTCCCTAACTTTGT
AGGACACGGATTCTCTTATTTAAGTTGTATTTACTCGGCAGGCAATCTTG
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GTTTAACTAAGTAGTACTCTAGACTCTGGCTTTCTATAGGAAACGTAAAG
CAGTACTTTGTAAACAACAGAGTTCGTATATGATTCGGTTCAGACAATGA
CTGGACTGGAAACTTTGACTGTCCGGCACCCAATGGGCATGGGCGCCACA
GATCCATCATGTTCATCCGTCGGACCAAGATCGGCATGCCGCTTTGTATG
TCTGGCACGATGGACATGAAATGCTGCCGGAGACTACTGTTGGCGGACAT
CCATCTTTCTGCTGTCAGCGCTGGCATGGTGCCGGCTACTGGCCTGAAGA
TGGCTGTGACGGCGCTGACGCAGAAACCTGGACCGGAGCCCCTTTGACAG
CTATTGTCGAACCTAGATTTAGGTGATTTAGGTTTAAATCAAGTTTTGTT
AAAAAAATCTTCACAAATTGTAGTGAGTCTGTCCAAATTTTAGCAATTTT
AAAATTTTGTTGCAGCTTCCTCTAAATGTTTTGTTTAATTTTTTTGGAAA
TTCACATCATTATTTTCGATTCCCTTGCTAAGTAGGATGAGGACTCAGAC
TGTCTGGATATTTTCTTTATGTGTATTTCAGTTAGACCGCACAAGCTCGG
TCAGACATGACCGCACAGCCTCGCACAACAATGTGGACTCGTGCTCTGTT
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GGAGGCAGTGAACAATAACATCAAGGGCATCTTGATACAAAATATTAGAC
AAATTGAATATTGCAACAGAGAAACTAAGAGGAGGAAGGGCGGCAGCTGC
TAGCTAGCTGTGAGCATGAGGGGCATGGCATCGGGCACCAGATTCCCACT
CACATATGGACAGGGCTTTGAGAAAGAAATTCCCAAAGTGAGGAAGGCAA
CAGGTAGAAGCGGCGAACTAACAAACTGTAGTGTAAATCAGCAGAAGTTT
AATGTAGCCAGCCTTGATCAAGTAATCAGCAGGCAGGTCAAGAGCAAATA
TCCCAATTCCCAGAAAAAGATAATATATGCCAAACTCGTATTTATAGAAT
CATAGAAAATTGAAGTATCTTTGACAGGAAACTAATATAATGGTAAATAG
AACTTGGTGCCACAATAACCCACTGGAGGCCAGCAACAGGTTTGGACATG
AAGCAAAACAACACTACTTTGCTAAACCTATGTAGTTTCTAAAAGCCGAG
CATAATAAATTTTAGGAGTGCTCTGGGAGCGTGGTGAAGATTGAGGGGCA
GCAGCTTGAGATGGACTGTGAGGTGTAGTTTCTTGGTCTTGGTTGGCTTT
TGACCTTCATGTCTTCAAATTCATATTGTCTTGGATTTTGTTGATACAAC
TGATGAAATCCCGGACACCGGTAGGCATATTGTCTTCACCTTCATTCTCC
TTGAATGTTAGCAGCTGTCCCAAAATTTGTTTTCTGAATTCGTATCCGTC
CTGTACATTTATCATTTTTTATAAGCAACTAAGAAAAGAACCACATGTTT
TAGAAATGTAATAACTAAAATGCTGGTGGTATTGACCTTTAAATATGGCA
AATGCAGTCTTTCGTCTTTCCATGTTGACATGAAGAGTGTAACAAGATAT
CCAGACAATTCCCTGGTATGACATATAAATAGTAATCAAAACCAATAAAT
ATAATATAGTACATATTCAGCAAATCAAATACTCTGTATGCATTATCTCT
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TTGCCTGTGGGTTGAGTTGGTACTTGGGCTCAACAGGAGTAGGGTCCAAA
ATATAGACAGTTCTGGTATCTTTGTCTAGTGTGAACAGAATAAAATCACT
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ATGTAGAAAAAAATAATAGTTATAGCGACACGTAAAGTGAAGTGGTCTTA
CCGATTTGCATGATGAAACACTATATTTCATACCAGGCCAGCTACTAACA
GAATGTGCTAGTTGTTCAACATCTAACTTTTTCCGGAAGTCTTGATGTCG
CCCAAAATCAGTAATCATCTAGCATATTATAAAATAAGTATTTAGAAAGG
TGATATAAAAGAAATAGTATATATATGTAGACAATAATATATATAGCAAA
TGTAAGAACATACCCAAAATCGCATGTCAAGATAATGCTTTGATATCAAC
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ACCAAATTGAAACAACCGCGGTCCATTGCCAACTTGTCATTTAGTATTTC
TTGCAGGTTTTTGAGAGTTAAGCTAATGGGATAGGGAATAGAGCTTTTTA
CCCACACTTTCCTACAAATCATTATCATAAGGAAAATAAGATAATATATG
TCGTCAATTGTATTCTATTAATAAAATAAAACAATATGCAATAGATTGCT
TACTCTAAAGTTTCTGCAGAATTGATTGATTTGATGTAGTTATAAAGTCC
ACCTACTAACTCATGTAGACTCAAGTTAGAAAGCACACATATCAGCGATT
GGTATTTGTTTTCAACAGATAACGAGTTAAGTTCTTTTGACTGAATTTGA
TCAAATGGAATGTCCGACATTATAAGATCATTTGGATTTTCCTGACGTTG
ATGATCACTTTCTTCAATCATTGTGGTCGCTGGAGCGGTGTTTGTTTTCC
AACACAATAATACTGCGGCTAACTTATATCGAAAGGAAGTAATAATTTCC
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AATCGGATGAGTTAGTGTATATCCAGTCCAATACTCCATGAATTTAAGCA
CAAATAGACCGCAAGAAGAACTGCAGAATTTTTTAAAAAAACTGAGTACT
CCACATGAACAACAAAATTTCTTATATGGTTATCATCAAACATACGTGCT
CTATGCCTGTCTTTCTGAATTGGCGTATGTAGTTGTTCCGTAATTGTCCA
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TTTTAAGAATGTCCAAATGATATTGTAGTCCTCGTAGCTGTAAAATTATT
AGTGTAGAAATGATATACGTGATCAAAGGATAAATATTCAACATTTACAT
GCAGTGAGTTCAAATTATATATTATAGTAACTTACCGTAGTAGAACTCCC
AACACAAAGAATCGAGTACTTGTATTTCGGTCTTTTCAATATTTATGATA
GCTAAATACCAATGTGAGTTCTTGATATTTATTGGAAGATAAATCTACAA
TCAAGTAAACAGTTACTTACTAGTTACTTACTTGTACTGTTGTACATATG
TAAAAAAATCAATAAACCAATGTAGAAATTGGGTATGCATGTTACCATGT
CATGCTTCAGATAGTTTCGGACAATCTCTGTCATATAAGTAGCCCCATGT
ATTTCAATGTCACCATCCCGTTTTAATAGTCCGGTATAAAAAGGATTCTC
AAAATATACTTCAGCATTATTCTTATTTTGGTCTTTTATACAACATATAT
ATGCGCCGAATACCTATAACAAAGAGAAAAAAATACATTATTAATGGATA
CTGATAATCAGAAACTATTTTAGTTGTAATTAGTAAGGGTACTTACATCA
TGGTCTAGCCATTTGCTATGATCTAGTAGGCACGCCAATTCACGTTGATG
GACATATATATCATCTATCCTGACCAACAATTCTTTTTCTGAAGCCTCTT
CTATTACTAAGTGAGCACAGTCATCTAGTTCTGTCAATGTGTAATCTGCA
AGAGGTTTTAACAAGCAAATATATATTTTTGAATAAATTTTATAATGACA
ATCATAAGTATATAAGTACACACAATAACTAAAACGATTAGTGAAAAATA
TACCTTGTGGGAGATAGTCATATATTACATCATTTTTTTTATATTTAGAT
TCATCTAGCTTCTTATCATCATCTGCTGAAACTTTTTGCTTATCATCACC
TGGTAAATATTTTTCTTCATCATTCATCAATATAGAAATTGGAGGTTCAT
CTGGCTTATTATTATCATCTGCTACTTTTTGCTTATGATCACCCGCTGAA
ACTGTTTCTTCATCATTAATCAATTCAGAAACTGGAGATACCGTCGACAT
GGTTGGTGATAGAAGTGATGGCAATTGATCGCCATTCCTTTCTTCATCAT
TAATCAATTCAGAAACTGGAGATACCGTCGACATGGTTGGTGATAGAAGT
GATGGCAATTGATCGCCATTCCTCTGATTGTCAGTTTTTGAACCAATTGA
TTCAAAACATTCAGAAAGCATAGATGATGTTGAGATGGTAGGTGATGGGA
ATTGATCATCCAAAACACTTGATTCTGAACTTTTTGCTTTCTTTGAAGGT
CGAATATCAAAATCCTCAATAGTGGTTGTGTCAATGCTGTGATCCATTTT
CTGCTGTCAGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.