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GrainGenes Sequence Report: AE031461

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Sequence
AE031461
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE031461
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCAAGACCGGCTCGGCGCAGTCGTCCTGTCATCGCCGCGCATCACACTCA
GACGCCGGTCCCGGTGCCGGAGAAGATTTTGCCGCCACCGCCCGCACCAG
GATTCAATCGCTCAGTTTCCATTTCCCACATCCCCACCCTACAGAACGGA
CGCGGAGCGCGTGGCTGACGGTCTCACCTCCCCACCACCCCTCCACCGGC
CACCCTCCCACCGCGCGCCCGAATGCGCTGCCGCCACTTCCTAAACCCCA
TCCTCTCCCCTCTCTCCTTCGCGAAACCCCCTTCCCGCCCCCTCGCCTGC
CGCGCCCACGCCTGCGCCGGAGCCCAGCCGCCCGCGCCGCGCCGCGCCGC
CCTCGCCGAGCCCGACGTAGGCATTTCTCGCTTCGCCTCCTCGCTCCCCG
GCTTCCGCGGCGTCCTCAAGCAGCGCTACTCCGACTTCATCGTCCACGAG
GTGGCCCGCGACGGCGCCCTCGTCCGCCTCACCTCCTTCGATCTCCCCGA
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TCCCGCATTCGCTGGAGTCATTCCGGTTGCTCTGCGGCGATGCTGATTGT
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TTTTAATCTACCATATTTTAGTATTTAGGCATAAGGATGCAGAGGACTGC
ACATTTAGGTTGTAATTTATGCTAGTACAGGTTTCATCTCTACAAGGAGA
ACAAGGACACCCAGGAGGCACTAAGAGTGATAGGAAAAATGTTGGGGCTT
CAGGTACATGTTCGGCATTATTTCATCAAAATATTAGCTAATTCATAGAC
ATGTTCGGCATTATTTCATCAAAATATTAGCTAATTCATAGACATGTTCG
CTAATTACTTGTGACTACATTATCCACAGCCACGATCATTTGGGTTTGCA
GGGACAAAGGATAAACGTGCCATTACAACCCAACAGGTCCTCTATTTCTA
CATTGATTTACATTGTGCAACTCGCGTAACATACTAACCAATTGCATTTC
TTTCCATTATTATGTTTGGACAATGTTGGCCATGATTCAACATACAAACA
TGATTCAAAATAGAAATTGTAATGAACTTTCTCAGAAAAAGCTGATGGTA
CAAGAATGAATGGATGCTATAGTTCGAGAAGACACATATTTTCATATTTT
CTCGGATTCATGATTTTTAATTCTCTTCTCATCAGGTAACGCTTTTCAGG
GTACATGCCAGTAGGTTGGCTGCTCTAAATAATAAACTCATTGGCATTAA
AGTTGGAGACTTTAAGTAAGTGTTTATGTGTATCATTTCCTATGTAAAAC
ATCGATTTAATGTCATTGACCAAAAGTAATTGAAAATTAAGTAATTGATT
AACCTTTTTTTCTAGTTATGTGAAGGAGGGCCTTGTTCTTGGTCAACTCA
TGGGAAACCGATTCACGATTACCTTAAGGTGCATGTTCTCCTTGCTCTAT
ATTGATGGCACTATACAGCAATATTATTATGATTTTTTTTGGTCTTCTGC
AATATAAATGGTGAACAAAGGTTGTCATATATGCTACAACATAAATTTGG
TGGCTATGCCGTGACACAATGTTATGCTAATTCACGATGGTTACAACTTA
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TTACATTCTTGTCATGACTTTGTTTTTATTTTCAATTACATAGTGATTGG
AGAATTCACACTTCCCGTTTCTGTTATTTGTCAGGCGTGTTGTGGCAGAA
TCAGAAGATGTGATTAAGGCAGCTGTTGATGGATTATTAAATAGTGGTTT
TATTAATTACTACGGCCTACAGGTACAAAAACATGCCCTGTTTTTTATTT
TCCCTATGCTTCAAACTTTTTGTCACTGTTCTCTGACTTGTAAAACATTA
TTGTATCATTGTTTGCAAGCGTTTTGGTAGTGCTTCAGTACCAAATCATC
TCATTGGTGCTGCTTTGCTTAGAGGAGAGTGGAGAAATGCAGTTAGCTTG
ATTCTTGATCCAAGAGAAGGAGATATCCTTGAGTATTTTTTGCTGTTCTA
CAGCCAGAAATTTGAATATTTTGTGGTTTTAATTTTCGGGGTTAAAATTG
TTCAACTTAACTTAGCTGCGTACAGTGTGATGACATGAATGGGGTGAGGG
AACATTATAAGGAGCATGGTGATATTGACGCGGCAATTAGAAATTTCCCT
CGGCGTCTCATAGCAGAGAGGGCTATTGTAAGTGTATTCAGTCTTCCTTT
TCTTGGGTTATATTGTAAGTGTATAAGGAGCATCTGATCACTTTTATTGT
CCTGTCACAGCTATTGGTTATCTTTGTAATGATCTAGCTGGTTTTGGTGC
AACGCCTTTTATTTCATATCAACAGAGATTGATGTGTCCCACACAATCTT
GAATTAGTGATGATAAATACTTGTGATGTTATGGACCAACCGAAAGCAAG
ATGATGTCACAGATTTGTCTATGTCCGCAAGTTGACATTGACTCGAGTTT
AGTAGATGTTGTATGAAGTTTACTGTAATGGAGAAAACTTACCAACTTGT
GCTGGATGAGGTTGTAAACAAGAAATTCTTATGTTGATGTCTTGATTCAA
ATATATTAATTATTAACTAAGTTATACTAAGGCAGCTTCCTTATCCTCCA
TTTTATCATCTAGTTTGACAGTCGAACCTTTAAATCTGTGCTTTGTGTCT
TTTTCAGCTTCAGCGTTTGAAGAAGTATCCTGGCAACTATCTACAAGCAC
TAATGGCTATACCTAGAACACTGAGACTGATGTATGTTCTATTGCTTGAT
TAAGTTTTCAGTGTGGCTCAGTGGTGTTAATTTGGAATGCAGCATCTGTG
ATGACTGTAGTGTTTTTCTAGAATCCATCATGCCTGCAAAGTAGTCACTT
TCTTCTTATTTACCACAAAGTTTTAAGTTCTACACATGTACATCTACCTA
TTAAGCGGTGTTGAAAATTTTATACAGGTATGTACATAGTTACCAGAGCT
ATCTATGGAACCATGCTGCGAGTATGAGAGTTGGAAATTACGGTCAGTAT
GCTTTCTGCTTCTGTTGATTTTGATCTGATTAGGTTCATTATTTTGAGAC
AAGTACTGGAGACTTTCCACGGTTACTTCAAGTATTATACTCCCTCCGAT
CCATAATAAGTGTCGCTCACTTAGTACAAAGTTTGTACTAGCTTTGTACA
AAATGAGTGACACTTATTATGGATCAGAGGGAGTAGTACATATTGTCGAG
TAGCATACTAGTGTAGGAGTTCTACTGAATGAAAATCCGCTCACACTTAG
AAAGAGATTAAATTAGTCCTAAATTGCAGAATTGTCTTGACACCCTTGGC
CATGTTTAGAGCATGTTTGTACCAATGCTGATTCGGATGGGTGTGACTAG
TTGACTCTTGTTTATGTTCATTCTCACCTTTGGCTTCTTCCAAGGTAGTA
TCGGCATTGCAGTATGTTTGAAAGACTTCATTCGCAAGTGTACTGTTGTG
CAAAGTGGAGGTGTCAGTGCTGTAATCTGGAAAAGAAAAAGTCAGGCGTG
TTTAACTCAATCACAAAAAAAAATCATTCACATGAACAAAATATTGAGGT
GAAACTCACATGCTTTATATTCCCATTAATTTGCAACTGTTGGTTGTCTC
CGTTGTTAGTTCTTGCTCATGTTTCACGATTTTCTTGAGTATGCCTCCTT
GACTGGGACCACAAGTGTATGTTGCAAAAATATGGTTGCATTGGCTGAAG
AATTTCACAAATATGCTTTGGATAGGCTTGAGAGAGGTGAAATGTTTCAC
AAATATGCTTTAGCACATTGTATTAGTATGTTCAATGATCTCGAATGTGA
ATATGTTTTATCTTTTCATGAACATAATTGCTAATCCTTGTGCTTTCCTT
TTATCTTCTAAAGTCTCTTTTGGGTGTGTGATTTAGAAGCTAAATATTTA
GACTTTCGTTGGTGACTTTTACTATTTACTATTGGTTGTCATAACTCGTA
TCTCATTTTATTTTCTGTCCATAAACATCTATAAGTGTTCTGCGTCAGTT
GTTTGACTACAAAACTATTTGTGGATTTGTGGTTCTCAAATTTAGTTGTA
GTTATACGGTGTGTAGCCGACTATCTGATTTCAGTTCTCAAATGTTTTCC
TCAGTTTGCGGCCTGTCCATGCTTCACATTTTTCCTAGCTCCGCCACCAG
ATGCAACCATTCATCCCAAAACTGATTAGCACACAAGCCACTTCATCCAC
AAGCCCACATTGGATCTTTTTGGCGTGTTCAATGACCCATTTGTGCATTT
TGTTGCACTATACTTATTCAAGGTGTTGAAAGTCTGCTTTCGTTTTTCAA
GGGTAACATTTACTCTTCTATCTGTTGTCTTTATATGCTAATGGGTATAC
ATCACAGGTTTTTTAGGAGTCATTGAAGGTGACTTGGTTTACAAAAAAGA
ATGCTCTTTTGGAGAAGGACCTGTAACAAATGCTTCAAAAGATGATGATG
GCCGCACTAACGCATCTGAAATGGACATATCAGCTGAAACACTCCTGGAA
GAAACGATCCAGTCAGTCAAGGTTTACTACAGACAATCAATATAAAGCGT
ATTTACACACAAACGGTGTGAAACTTGTGCATGAGATCTGCTGTTTGCCG
AATTCCCTTTCACACACTCTTCTTGTAGATAGCTGATTCTGAAGATTTAT
TGAAGGCGGTGTACACGCTTGAGGATGTTGTCCTTCCTTTGCCTGGGTGA
TGAGCACTTGTATGTCCTTTGTTATACAATTGATTGCTGAAGTTTTATGC
TTACTTTTTTTCTGTGCAGTTCAGAAACATTGTTTCCTGGGAATGAAGTT
TCTGGGATTTACCATGAAATAGCTAACAAGGTAATGCTATCTTTTTAGCA
TGAATTCGATTGAATGACCATGCTTGTAAGCTTCTAGTTTTTTTCTACCT
AACAGTAGGTGTATTTGGATTTCCTTCTTTTTCATAGTATTTTTAATAGC
TACCCATGTGCTATGTATACCTTACCTACTCCCTCTGTTTCAGATTAGTA
GGTGATAGTTTCTGATTTGGTTTTCCATTTTATAAGGCGCATGCTTCTAC
CAGAGCATCTACTAATTTATGTCCTCCCATTATACCCTCCTTTGCTTTTC
TTGAAAACCTGCAGAGTCAGTGGCGGTGCTACATGCTAAGTGTTGGGTCA
AGTGACATCAGTCACAGCTTTGGCAAGAGCCTTTTCCTTTTTTGGATCTT
ATACAGTATCTCTATATGTTTAAGACATTATGATACATTGACATCACAGC
TCAGCGCTGAGGTCCTAGCACCGCTACTGTGCAGAGTGTCAGAGTGAAGT
TGCCCATGAATCACGCTATTAGCTACTTGCGTCCACCCTTTATACCTTCC
TTTACTACTAGCGATGATCTCAAAGATAAACGGTTTATCGAGAGATGATT
TAGCAGAGGAAGCATGTGGGCAAGGTCCTGACTAATATCCAGCCTAACAT
TGATCGAAAGCCAGCAGCGCTTGCTAAAAGAGCAATTACAGAAAAGGTGA
CCTCTGGTTTCGAGGCAATTATCAGAGGCGCAGCGACCATCGTCATCAGT
CCAGAAAATTTTCCTTTTAGTATATTACCATCACGGTCTTTGTTAGTTTG
GACCCATATTCTTTATGTCCAACACAAATATGCCGAAATGGAAGTAATAT
TATCTAATTGGTTTCGTGGATACTCTTTGTATATATACTAGAAGTAGCGG
AGTCTAGCATTTTCTTATGTTCGGATTTATGAAGTTGGTTTTGCTTAAAC
GAGACATGAATATCTCCATTTTTATATACTTGTGGAGCACAAACCTATTT
TAGTCAGACTGGAAAAGAGATAGAGCTTAATGCCTTAAAATAGTTACTTA
TTGGATGTGTACTTAATGTCTATTTGGTTTTTGTCTCAGGATGGTATCAG
TTTGACGGAGAGCATCCATGGGGTCGAGTAAGTTAATTTGTTTCTATATA
TGCATATTGCTTTCTGAAGCAAATTTAAAGCTTTGTATGGATATTATCAC
CATAACAGGCCTTTAAAAAACCAGCACTCGTAACACATCCAATGAAAAGA
AGGGGTTTAAAAACTGCATTTGGTCACATAAATGCATACTTGGGAGTTGG
GATAACTATACAATATTCATATTCATGCAATTATTGATCTGTTTATTTTA
ATATTCAATTCTGCATACTAACTATTGCGCTGGGTGACACAATTGCCATT
TCTAAGGGAATTCTCCATTACAAGCATAAGAGGAGGTTACCGTCGTGTAA
TACAACGACCCATTGATTGTGAATGGTATGTGCAACTTAAACAAAATTGT
ACTGTTCTGTTCAACCAATTGCTTTGTTTATGTTTTGGTTTGTTTAAATT
TTAACTATATTTGTTGTACAGAGACTGCTATTTGTCCAACGCCGTTTCCT
AATGAATGCAGGGACCTCATAACTTACACGGATAACAAAATACAATTAGT
GAAAACCGATTTAGATGTTCTATCCAAAGCCAAGCCATCGGAATCAAACG
AACTATTATCTACTGGGACATCATATGAAAATTCATTGGAAACCTCTGGA
GCAACCATCCTGGAAGAGACCAAATCTATTGGCAGCTCAGATGTTTTACC
AGAGCTTGCCGTAAAACTAACTTTTACTCTACCGGCATCATCTTATGCTA
CAATGGCTATCAGGGAGTTGACAAAGACTTCAACTTCGGTATTCCACTAA
TTCCCAGATCATCTTATGTGGTTTCGAACTTTCGATTTAAGATAGTTTTA
TTTCGCTTTGCTTCTGCAAGATTATATCTTTTGGTTCTTTAATTGGCATT
TAGGATATTATAGGGCATTTCATCCAAATGCATCACTTTGCTGGGCCATT
GATGTCACCGAGCTAGCATGTACTTCCTCCGTTTCAAATTATAAGATGTT
TTAGCCTTTTTACGAAACACATGTATCTAGACGCCTTCTAATGTGTAGGT
TGGGAGCAAAATGAGTGAACCTACGCACTAAAAAACGTCTAGATACATGT
GTTTTAGGAAAAAGCTAAAACATAATATATTTTGGAATGGAGGGAGTATA
TTCAAATGCCGTTCTAATCTTGAATTCATCTGCAGCCAGTCTAATTGAGG
GTCTTTGACCATCAAATCTTTCTTATCATTATGCCAGTGCTGTTATTGAT
TTACAAATAGTGTCTGCTTAAGTTAGCGCTTGTATATGCGTGAGTGGACC
AATGGAAAACCTAGCAGAGTTGTCGAAGTTGTTAGCGTTGTTTGCCAAGT
TCCCCACTCATTATCATCTGTAGAGATGCAAGTTTGGAACCGTTAGGGTA
CCCTCTTATTTAGTCTAGTTCAAAGAAATGAACTAGTTTTCTCAAAAAGT
TATGATATGTAAAAATTTAGTTCATTTTATTGTAAGGGTAGATGGTACCC
TAAAGATTACCACTTGCATCCTTAATCATCTGGCGTTTCTGTTGTTAATT
TTATGGGTTTGCACTCAGGTTGATTGTCAGAAATCATTGAGCTCCTGAAC
CTACAGCAACGTGCATCAGTTGCGAAAACTGATCTCTTATGTTGAACACG
TGGAAGCTACGTGTGTTGCATCAGTAAACATTGCCCTGCAATGTAAGTAT
TTTTCTTCAGGCCATTATATTTTCTACAGCATTTGGACTGTATAGCAATG
TGCTTTTTTGGCAAATAGACTGTAGTATTTCTGCATGTCACCTAACCAGA
AAAACCGACCATTGTACAGGATGCCTCACTGAGTAGCTCTAGCCAGTAGG
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GGGATGTTTGTACGGAACTACGGATTAGCATGCATTGCACACGGAACGGC
ACAGTACAATGTCTACTAAGGTAAACTTAAAGCAGGCATCGCTGAAAATG
GCTAATTATGCCCTTTTCAACTCGTGTAGGAGCAAACTAAAATATAGCTT
CAGGCCAAAATCTTTACAACTTACTTCCTGCTATAATGAGGGACATGTGC
ATGTTAGTGGTTGTCATAATTGTAAATTATTCAAAGTTCAATTCCAAGTC
CCAGAGGTAATTGCAGTTTCCTCCAGCTTCATTGGAAGTTTTGCAAAGAT
TACCAGTTCTACAAAACTTTTTGCAGTTTTCACTAAAGGTAGATTTTCCT
AGTATAATCTCTTATTTTTTCAGTGTAGTAGTATATGCAAATAGGACAGT
TTTATCCCTGTCATGTAATGTGGTTTGAGCCTTTGAGGATAATGTAGTGC
TGATTTGCAACAAGAAGAACTCTGGCTGCCCAGAGAGTGGAGCTGCCGCG
TCGTGTCCTGCGACGAGACACAGACTCATGCCGCGTATTCTACTGAACCG
CCGCATTTCAGGTCATGTTGGGAGGTGTCGGAGCACCACCCGCCGGCGCC
GGGCGGCCGCGCGCTCACGCACGTACGTGAAAGACGTGAGGCGGTTATAC
AGCGACACGTATGGCTCCACCAACCTGCGTGGGGTGCTTGAAGCGACGCC
ACGTGAGAGCCCCCTCGGAGCTTTCCCGACCACCGCCCCAGCGCGCGTGA
CGTACGTGCCGCAGTCGGAGACCTCTTGCCAGAACCTTTGCAGGCAGCAG
GCCCATGCCGGCCACGCTCTTAAAAACTCATCCATAGCCGTGATCCCGGC
GAACCACACCGCCGAAGACGACTTGTTCCGGCTTTGATATTCTGCTCCTG
TTATACGATCGAGCTCCGCGTGTGTAGTGTTCTAGTCGATCGAGCTCCGC
GTGTGTAGTGTTCTAGCCTGCTAGTGCAAGGTGCGTTGAACGATATCGAC
CGGGTGGAGGAGGCCTGGCAATGGGGCGTGGCGACGGATACGTGGACGGC
GCGGCTGGTGAGCTCCGGCGGTGGGTGCGGGAAGCGGGCGGGTGCTTGGT
GGTGGACGGCGCCATGGGCACGGAGCTGGAGGCGCACGGCGCGGACCTGC
AGGACGAGCTGTGGAGCGCCAGGTGCCTCGTCTACGCCCCTCACCTCATC
CGCAAGGTCCATCTCGACTACCTCGAGGCCGGCGCCAACATCATAACCAC
GGCGTCCTACCAGGTGATATGACCGGCCTATATCTGCTCACTCATGCCTC
CCGCAGTTCCTAGCCAGTTTGTTGGCTTGTTGTACCGTGACTGACCGCAA
CCCTGTGCCGTGCGCGTTGTAGGCCACGCTGCAGGGTTTCCAGTCTCGCG
GGCTGTTGAGGGAGCAGAGCGAGGCGCTGCTGCGGCGGAGCGTCGAGATC
GCGCAGGAGGCGCGCGCCATCTTCCTGGAAGGCCGGTCCAAAGGCCCCTA
CGCGGCGCGCGAGAACGAGGCACGCTCCACGGAACGCCGCCCCGTGCTCG
TGGCGGCCTCCGTCGGGAGCTACGGCGCCTACCTCGCGGACGGCTCCGAG
TACACGTACGGAAATACTACCTTGATCTGCTTGCTCTACTTAATATAATC
GACGTTTCCACGTGTATGTACGCAGCGGGGACTACGGCAGATCGGTGACC
AAGGAGTCGCTGAAGAAGTTCCACAGGAGGCGGCTCCAGGTGCTGGCGGA
GGCGGGGCCTGATCTCATCGCCTTCGAGACCATCCCGAACAAGCTGGAGG
CGCAGGCCTACTGCGAGCTCCTGGAGGAGAACGACATCCGGATCCCCGCC
TGGTTCTCCTTCACCTCCAAGGACGGAGCCAACGCGGCGAGCGGGGACCC
CATCACCGACTGCGCCGCCGTCGCCGACTCCTGCAGGAGGGTCGCCGCCG
TCGGGGTCAACTGCACCGCTCCCAGGCTGATCCACGGCCTGATCCTCGCC
ATCACGAAGGTACGTACACGCATACTAGTTCACGTGCTGCGCTTGTTTGT
TCCAACATTTTTGGACACTACTCCCTCCGTTTCAAAATCCCTCCCTTTCT
TTAGCTTTGTGAAAGGTGTGTATCTAGATCCCTTTTAGTGTGTTTTTAGT
GTGTAGGTTTGGAGTAAAACTAGACACTACATCTTTCACAAAACTAGAAC
ATCTTATATTTTGGAACGGAGGGAATACCTGACCTGACAGGGAGTACCTG
CTGCTGCTGGTTGCTGCAGGTGACGAGCAAACCGGTGGTGGTGTACCCCA
ACACAGGGGAGACGTACGTGGCCGAGACGAAAGAGTGGGTGGTGAGTGAT
GCGCTCTCAATTCCTTCTACGTGTTGGGTTTACTTAATTTGCATCACTGT
GATGAGTCTGTGACCACCTGTGCGTTCCGATCTGGCGTTGCAGGACTCGG
CCGGTGGTGGCGGCGCGTCGGCGACGGACTTCGTGTCGTTCGTGGGGAAG
TGGAGGCAGGCGGGCGCGTCCCTCGTGGGAGGGTGCTGCAGGACGAGCCC
CGCGACGGTGAGGGCCATCGGGCGGGCGCTGCGAGAGGCGGATGCTGCCG
TCGCCGACATCGACGATTTCCCAGCCGTGGCCGTGCTCTAGATAGTGTTC
TCGTGTCAAATCCATTTTCCATCGACCGAGTAGTAGTATATATGTACACA
GAGTAGCCACGTAGGTGCAGCTACGGGAAGCACCGTGATCGATGGAGTGG
AGGTACGGTACGTCGCGTCCTCGTGATCCATATGCATCGCGCTGAATAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.