Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE022171

[Submit comment/correction]

Sequence	AE022171
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE022171
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCCGGCACACTCGAAAGTCGCAACCACCAGTCTACCGCCACCCCGAGCT CCGGCGACGGAGGAAATGGCCGCCATTCCGACATCGAGTGTCTCCATGCC TGCCCCACCTGACCACTCCGCATCCACTACCGCTGGCGATGACTCAACTG ATTCTACTGCCGCCGCCGCCGCTGCGGTCGGCGACGACGTGCACGACTCG AAGGAGGTCGTCCTGCGGAGGTACTTCCTTCAGGAATGGGAGCTGGTCTC CGCTATCCTGGGCCGCATCGTCGCTGCTGGCGGCGTCGCTGAGCCCGCCA ACGTCCACAGGATCCGCTCCATCGTAAGCTCTCTTTCCCCACCCCTTCTG AGGATGTTACCTGTTGCTAAACAATAGATCCCTATGAAATATGTCTAGCC CTTACATCAGATTTTGATTAGTTGGTGTGGGTTACGGAAGAGATTACTAA TCTGTTTTAGCGTCGACTCCTAATTAACACTAAAGTACAAAATATAATTT AAACTTTTTGATCAACTGGCTTGCAAATTTGCATTGAAATTGGTTGGTTT TGTTTTGTAGACAAATAGTTAGGTTTTTTCAATCTGTGTACTACCTTTAC CCGTCATGTTTAAAAGCTTCATGCAAATACATGTCATTTTCTTTGTGGCA AAATAGATGGACAAATATCAAGAAGAGGGTCAGCTTCTGGAGCCATACCT AGAGGAAATCATCTCACCACTTATGGCATTGGTTCGATTGAAGATAATGG AACTTGGTGCTGGCACCGATGAACTCCTTGAAATTATCAAGCCTCTGTGC ATTGTCATTTACACTCTGGTAACAGTCTGTGGGTATAAGAGCGTCATCAA GTTCTTCCCTCATCAGGTTTCAGATCTAGAGCTTGCGGTTGCTCTCCTTG AGAAGTGTCATACAATGAGCTCGGCGACGACTCTTAGGCAAGAGAGCACA GGAGAAATGGAGACGAAGTGTGTCGTTCTGTTGTGGCTTTATATACTAAT CTTAATTCCCTTTGATATCTCCTCCGTGGACACGAGCATTGCTGCCACTG ATCACATGGGTGGGTCTGAGGTCGTTCCGCTTGTGACAAGGATATTGGAC ATCTGTAAGGATTATCTCTCCAATTCCGGTCCAATGAGAAGGATGTCTGG GTTGCTGCTTGCAAGGCTCTTGACTCGTCCAGACATGCCTAAGGCATTCA GCAGGTCATCCTTGCAATTATTTTGTTAAAACTTACACCTAGCATGCATC TACATTTCAAATTGCTATATTACCTTCAAAAGTATCCATCACTGGAGAAC TGTCATATTTATTACTAGGAAGATTTATTGTCTGAAATGAATGAAAAAAT GTTAATCATTTCTATTTAGCTAACAATTTCTTTGTTATTTATGCCATATA TTAGAGGACAATGTATTGAGTTACGATTATTCTGTTTTCAGTTTTATGGA ATGGGCACACAAGATCTTGTTATCTGTCACAGATGACTTTGTGGATCAAT TTAGGTCCATCGGTATAGTGGAAGCTTTAGCAACAATATTTAAGGTTCGC CTTTGTCATTTTTGTTTATACTTTGTATGGCATACTACTCTTGTAGAGCT ATCTTTTCGGTTATTACCTAACAATTTTATAAACAATATAGTCCATCTCT ATTTTCTTGTAGGAATTAAGATATATTATTTTTACATCTGTTATTATTTT TTGCTGCTGTCAAAAGGGAATGAATCTGAATATGCCCTTCACACAAAGTT AACATCTCAATTGTGTTTGATGTCTTTCTCTGGTACCGCCTGTTGCAGAT TGGTAACAGGAGAGTGCTACATGATGCTGTTTCTGGTATTTGGAATGATT GTTCAGTGGTGATGAAGACTAATATTGCCATCAGGAGTCCCCTACTTAGG AAATACCTTGTCAAACTGGCACAGCGAGTTGCTCTCATTAACTTACCTCC ACGTTCCCCATCGTGGCGCTATCAGGTTGAAATCTTTCATTGTTAACCTT TTACCTTAAACCATTAGTTGTATGGGTTTTAGCAATGCTTTCTTGATTAG GCACATTCAGAATATATATAGATAGTTTCGTGCGTGTACTGGTTCTAGAA TGAAGTTGGTAGCACGATCAAATTGGTTCTTCTGGAGTACCTAAGTCCTA GTACTCTTATGTTTCAACATTCAGTTACCTGGTTCATTGTTAAATTTTAA TAAAACACCTGTCTAATATGGGCGTGCAAGCTGACAAACTATATGCACCA TGCAGAATTCCTGATCACATCTTTTTGGTATGGAAACAGTAAGGGACAGC CCTGCTGGGAATATATTTAAAAAAAGTAACTGGGGTTCCACAAGATAGAA ACAAAAGAAATATTACATCAAGGACCAGAAACTGCCAATCTGCATCCTCT AGCAATTTATTTGATATATCTGCCATCGTCGCAGAGATCACATCCTGCTC ATGAAACAAATATATATGTGTGAAACATTCATGTGGTAGCAATTGGGTAA GAACTTGTCTAACATATGATACTGTAACTCCAACATCTGCTCAGTTAAAA CATAGCTGGATACTACCTAAGCTCCCACTAACTTTCGTGGGGTTCTGTTA ACTCCGAATAGTTAACAGATTATGGTAGTCTGTGTTGATCTAATTTTTCA TTCAAAATATGGTTTATTTCTTGGGATTGAGTACGGAAGTTCTTTCTGGG ATGAAGACTGTCAAAACTAATGTGTGGTTCAACTAATGGCATATAGGTTG CTGCATCAAAAGAGCAACATGTACTACACTTTGATGCTGCATCTCCTTCC TGAAATTGCTGACACTGATTTAGTTTTTAGTTTCTGAGATGGCTAATGCA ATACGATCGTTTAATTTGTGAGAAAATGCTCTTATTTCATATCAGTTCGC CAGTCTATTCTTCTTTCCTTGTTCTACCATACTGCTTACTGGTTTTCCAT CGTGCAGTCAGTAAGTAGTTCACTAGGTGCAAACCTTTCAACTTCTACTT CTGGGTCTTCAAGTGGATCGACCCAACAAGTGAACATGGATCAAACAGAC AGATGCTTGTTAGAAGAAGATATGGATGTTCCAGAAACCGTGGAAGAGAT TATTGACTTACTGTTGACTGGCTTGAGGGATTCTGTATGTTCTCGTCTTG ATATTTTGCTGTAAAGTTTTGATTGTGTTCTCTGCATCTTAATATAATGA GTAACCATGTAGTCTCTGATGAAGTTTACATAAAAAAAAATCAAGAAATT TAAAAGACATTTGTGTTTCATTTCATTGAAAAGATGCACTTTGTGAACTA TTCATATCATGAATATTGTCACTCTCGTACTGAAAAGTGAATGTTATTCC TCTGCCCAGGATACGATTGTGAGATGGTCTGCTGCCAAAGGAGTTGGTAG GATAACTGCGCGTTTAACACCTGCACTGTCGGAAGAAGTTCTATCCTCAA TCCTTCAGCTTTTTTCTCCTGGTGAGGTCCGTTTGTAACATATGAACTTC AAATATCATTCATTTGTTAAATATGTTTGCAGTTTCATTTTTCAGCTTTC CAAAATGCAAGTTTTCTTAGTGAATTACACTAGTAAATAACTCATGCCTT TTGGATACTGAAGGGTGATGGTTCCTGGCATGGAGGCTGCTTGGCTTTGG CTGAACTTGCTCGGAGAGGGCTGTTGCTGCCTTCTAGCTTCCCTGATGTT ATTCCTGTTATAGTAAAGGTACATAACAGAATAAAGAATAACACCGATAT CACCTTTGTATACTCCATGATGTTCATTTTACTGGCATCAATTGCAATGT GGCCATCCTGTTGCATGCCCCACACAGCCTCACCCGTATTCTGATAAAGT ATTTGAGATACTTAAGTATTAGCACCCTTGTATGATTATAGTCCAGCTGC ACTAGTATCCCAGTTGACATCATGATGTATTTTTGCTTTGCAGGCTTTAC ATTATGATGTGCGAAGAGGTCCACATAGCATTGGCTCACATGTAAGAGAT GCTGCAGCATATGTTTGTTGGGCGTTTGGTCGAGCCTATACTAACTTTGA TATGAAGGCAGTCTTGGAGCAACTTGCTCCCCACCTTCTAACGGTTGCTT GTTATGATCGAGAGGCAAGGTTTATTGTGTGTGTTTTTCACTGGTGGAGT GATTTTTGGTACATGTATCTAATGTGTCATTTTGCCTATCTGTTTTCAGG TTAATTGTAGAAGAGCTGCTTCTGCTGCCTTTCAAGAGAATGTTGGAAGA CAGGGGACATATCCGCATGGCATTGATATTGTGAATACAACAGACTACTT CGCTCTGGCTTCCCGGTCAAACTCTTATCTGACTGTTGCTGTTTCTGTTG CTAAGTACAAGGGGTATCTTTATCCCTTTGCCGAAGAGCTGCTGTGCAAT AAAATATCTCATTGGGTACTGGTCTCTGCAAGTTTTTTTGTTTGAGTGAA ATTGTTGTTTGATTGTACCTATTGCCGCACTGTTTGCCTGAATCCTATTA GCTTCTGGTAGAATAATTTACTAGAGAGGTCTTATTTTCTTCTGAATATT ATTGTAACAGTAATACTCAGTTTTTAAATAATATTAGTTTGCTTATGATG TCAAATCTGTACCACTTTTCATTACTCATTTTTATATCTTCTTGTGCCAT GATTTTCCTCTTGTTTCCCTGTTAATTCACCACATGATTTGGCTGGGTTT TCTTTCTTCCTAGGAGAAAAGCTTGAGGGAGTTGGCGGCACAGGCCCTCG CGTTGCTTGTGCAATATGATATGGATTACTTCGCTGGGCATGCCCTTGAA AAGTTAGTTCCCTGCACCCTGTCATCAGATTTGTGTGCTAGACATGGGGC CACTTTAGCTGCCGGTGAAATTACTTTGAAGCTGCATCAGCTTGGTTTTA CTTTTACCACAGGTAAGTGTCCGTATCTGGATTATGTGGTGCAATATTTT TCATTGAACTGCTTGCCCTAAAGGTGGCTTTACATCTTGTGTATTTCTGT AGACATGCAGCGAGCTTTGTCAGGGATTGTCCCTGCAATTGAAAAGGTGC GCCTTTATCGAGGTAAAGGAGGAGAAATTATGCGCTCTGCTGTTTCCCGA TTCATTGCATGTATTTCTATTGCTGCAATATCCTTGAATGAGAAGACAAA GAGAAGTTTGGGGGAAACTCTTAATGAAAATTTGAGGCATCCCAATTCTC AAATACAGGTGAACTTTCCTTTTTCTTGTTTGATTGGCTAGTGTGCCTGT AATCCCAAATGCTGTATAAGCGTGACATTGGTGTCCTGCATATGGACTGA CTACTATTCACCATACTGTCCAGTGTGCTGCTGTTGACGCGTTGAAGCAT TTTATTCCAACCTATCTGGTTTCTGCTGGTGAAAAGACTGGTAATGATAT CATTTCAAAGTATGTGACGCTTCTAGATGACCCAAATGTAGCTGCAAGAC GAGGTGGAGCATTGGCCCTTGGAATATTACCATATGAGTTCTTGTTAATA AAATGGATGCCTGTCATGAGTAAGCTCTGTAGCTCATGCACAATAGAGGT AGTGAAATTTCCACTACATTTCAGCAGCAAAACATATATAGAGACCAATA GCTCGTGCTGTTGATGTACTTCTTAAACACTGGAACTGAAACTCGTATTT CATATAATATGCAGGATAAGGCTGATGATCCTGATGTTGAAGCACGTGTG AACTCTGTTAGGGGGCTAGTTTTGGTTTGTGAAACATTAACATCTAATGT TGACCAGAGCTCTAATATTGGAGAATCTATATATGCATTCATAAAAGTTA AGGTCATGCAAGCTTTATTTGGAGCACTTGATGATTATGCTGTAGATAAC AGAGGAGATGTGGGTTCTTGGGTACGTGAAGCAGCAATGGATGCGCTGCA ACGGTGCACGTTCATCCTCTGCAGGAGAGATGGTGCTGCAGTGAGAACAG CACCAGTTGCCAAGGATAAAACTGAGCCGAGCGACATGGATGCAAATGGA ATTAGTACCACTCACCAACTGTTTGATTCTGCTATTGCACAGGATCTGGT TGCAGGCATTGCAAAACAGGCAGTTGAGAAAATTGATAAGATAAGAGAAA TAGCAGTCAGGACTCTGCATAGGATTCTGTACAACCAGGAGCAGTTCATC CCATTTATACCTTACAGGGAGCTGTTGGAAGAAGTTATTCCCAGCAATGC AGATTTGGAGTGGGCAGTAAGTGATGGCTCACCAATTTCTCTACTGTTAA TTGTAAACCAACTAGGCACTACCATATCTAATTCTTGTGATGTGATATGC TGTGCAACTAGCTGTGCTGCCCTCAACTCTTATCTTGTAATGCTCAGTTG CTCAACAACTTTCTTTCTCCTGAGATCCTTATCATCTTGGAAATAAGTTT GTAGGAGTTAGGTTTCGTAATGACCGATCCATAAATCTGTATGCGTCGTC AGTAATTGATGCAACACATTTAGTGTCATTTTGACAATAGTGCCTCACTA ATAGTTTGTACAATCATTTAATTTGATACCAATGTATGCATCATATTTGG CTATGTGATAGTACTGTCATTCAAGCCACAACTGATAGCTCTTTGCCTTG ATTAGGTTCCTGCAGTATCCTATCCACGATTGGTGAAGATTCTTCAGGCC ACCTGTTACAGTAAGCCTGTGCTTTCAGGGCTTGTGATTTCTACCGGTGG GTTGCAGGAATCTTTGAGGAAAGTTTCAACATCAGCTTTAGTAGGATACT TGCAAAATCCAAATATCAATACAATTGATGAAGGAAAAAGCAGAGAGTAT CTACTGAGTCATGACATTTTGTGGGTTCTCCAGCGTTACCAGAAGTGTGA CCGTGTAATTACACCGACATTGAAGGTAACTTAGTATGTGTGAAGCCTGA ATGCATCATTCTTGTATGTCCAACAGTCTAAGATATGTGGTCTGGTTATC CTCCATAACATATGATTGGGCTTATATGAACTTTGTATAGTTTTTGTTCA CTGATGATGTTTTTACTTGTTTAGTTATTTATCATCATCGTTTTCTTGTA GTTGTCGTGTTAGTCTACATACTAGATGTGATTTCCGTCAGCAACATTTG ATGCAGAAGAATTCTATAGTTAATAAAGTCTCTTCAATTTAGGCTGATAT TATTATCATCAGTTGCAGTAATTTAGTTTTGATTTGACTATTTTAATCTA TGAATATTCGCATGTTTCTACATTCTTGTTCTGCCATTTTTCCCTACTCA TTTCAGTAAATCTAACGAGGTCCCTGTATTGCAGACTATTGAGACTCTAC TCAGTAAAAAGGTTTTCTTGAACAAGGAGGTGAGTTAATTTTAGCATTGT ACTTGAGCATTATGAGAGGCTGAGGTCGAATACTAATTTTTTTGTGATGT TGACTTCCATGTGTAAAGTGCAGAAAACATGCACATTTTTTAGGCATTAA GATTGAGGGACATAGTAAGAATTGGAACTTGGTGATCAGAGAAAATATAA AACTACCATTATACACATGCAAGTCAACATCTTGAAAGCTTATAAAGTAG GAAATGAATTTACAAACTCTACACTCCAGAGTACATGATGTTCATTTAGT TATTTTGCCATCTTAGGTATGTTGACTAGTTATGTATCTCTGGTCTTGTA ACAACAGGGGCATGGTGATTTCTACTATGAACTGATAAATTTACTAGGCT CTGAACTGAAGGGATCGAAGGACTTCACAAAGTTATGTGCAGGCCTCTCG ATCCTCGGATATATTTCTTCACAACTAGATAGAACTGGCACCAAGGCATT CTCTCAACTACTCACGTTCCTAGGCCATAGATACCCCAAGGTAACATTTG CTATTTCTTTCCCAGGAAGTACAGGGCGCCACGCAGTGATAAACTGAGCT AAAATATTTTCTGCCAAATTACAGATCCGAAAGGCTGCAGCTGATCAGGT CTACCTTGTACTGCTGCAAAATGATAGTTTGATCTCAGAAGAAAATATGG ATAAAGCCCAGGATGTTCTCGCAGAGACATGCTGGGAAGGAGATGTTGAG GAAGCAAGGCACAAGAGGTCAGAGCTGAATGAGATGGCAGGGTTTGGTGT CACTAATTCGCAGAAATCTGAGAATCAAAAACAAACGAGAACTCCTGATG TTCAGAATGCAACTGATGAGAACACATCTTATTCTTCACTGGTTGAATTC AGTGGGTACTAGGAAGCAGAAGCTGTTTGTCTACTTGTACACATTAGACC TTTTATTTCATTTTTGGACATTAGGCTGTGAGATATTTTGTTTTGAATGA ACCGCCGCATGGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.