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GrainGenes Sequence Report: AE033744

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Sequence
AE033744
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE033744
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCTCCCCCCTCGCCCCCTCGCGTGCACCAGCTGTAGCCGACGACGACGG
TGCCCTGCGGCTTCGCTTGCGGAGCCAGCGGCTGTCTATTGGTACCAGTA
GGAGGGATACGAGCCGATTCCAAGCTGAGGCGGTTCGTGGGCACCATGGC
GGCGGCGGCGCCGGCGTCCGGGCACCTCCGCCCGCGGTGCCAGTGCTCGT
CGCCGCTGTGGCTCTCTTCTCCCTTGCGCTGCCGTCCGCCGTTGCCTCGA
GTCTTCCCCGGCCGAAGAAGGTACCTGCCGTGCTGCCGAATTCTGATTTT
GTTCTTTTGACTTTATCGGTTGCTCTGGAGCCGTGGATAGGTAGTTGGCA
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GCCAATACATACTTGGCTAAGTGTAGTCTGACAAATCAGTTAGCCCATGC
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ATATGGCACCATCTTTTCCATATGGAAGTGCTTTGACCAGTGAGTCTAAA
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GAGTTATTCCCTTTTCTCTAAAATGATTATGATGTTTATCGCTATCAGCC
ACCATTAGATGCATAAAGTAAAATCTGCCAGCTGGGTGATAAGTTTGTTT
AGTGGAATAATGTCTCTTTGCAGTGACGTTTCCATGGATTACATATGTTT
TGTCCACTCTGCATATTTATGGTCCTCAAATGTCAGATGCCACAAACCAT
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GATGTGTTAGATGGTGGAAGGGATGTCTTGATGGAGTTTGCTCCATTCTT
TGAGGACCCATCTATCAAGAAGGTCCAGTTTTATCCCTCCTTATTTATCG
TGGAGTAATTCTCTTGCTATTGTTTTCCGTTTTATATGTTGGATGAAGCA
CGGAGTGTAATATCTCCTCATGCCTCTTGCTGTACTTGTAGTTCTGTTCT
TTTGGATTGTCTTACCTCGACAAACCTATAATTCCATTGCCACTGTCTAT
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GTATACTTGTGCATTTTACATGGCGCTCAGCCATTCAGTTAGACATAATT
GCTGGCTTTCTAACAGCAAAATACTGCCTTGACTGCACCTCAAAAGAACC
AATAACCAAGGCATATATTACTTGGCTGCCTTCCAAAACCCAAACCATTA
GTGGTTGTCACTAGACTACCTCAAGTGCATATTGTCTTGTTGCTTGTGGT
ATCACTATCATGCCATAATCTTTATATTCTAGCCTAATTGATTTGCTGCT
TTGTACTTTGCTACTAAGATGCCATTGTGGCCCAGAAGCTGCTATATTCG
AACTGCAAATCTAGAAAAAAATTACATATTACAGATTAATCATGTCATAT
CAATTATTGCAAGCTTTGCTTCTTCTTGAGTCGTTGGAAGTGATTATTTG
TTTTTCTCTTCATCATGTAGGTTTGGCATAACTACAGTTTTGACAGCCAT
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CACTTGAAGGACTTGCAAATGATCCTAGAGTCATGAAAGATGGTGGACAG
GATTTAACTAAAATCCGAAAGGCATCAATGAAAACAATCTTTGGTGCAAA
AAAGATTAGAAAGGATGGAGCCGAAGGGAAAATCATATGTATGGAACCAG
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TTGGATGCAGTGAATACACTGAAGCTTTATGAAAGCTTAAAAAGCAAGCT
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ATTTCTATGAAGAGTATTGGCGCCCCTTTGGGGCCCTTCTTGTGAAGATG
GAAACAGAGGGAATGCTTGTTGACCGTGCTTACCTTTCAGAGATCCAGAA
AACTGCTGTTGCTGAACGAAAATTGGCTGCAGACAAGTTTAGGAATTGGG
CATCTAAATATTGTCCAGATGCCAAGTACATGAATGTGAATAGTGATCTA
CAACTTCGCCAGCTTTTCTTTGCTGGCATTGAAAACAGGTATTGTCGCCA
TATTATGCTTATCTTTTGTTTGAAGTTTCAACATCTAATGTCGTTTTGAT
TTGCATACATTATTCTAGGATATCTTCAGTAGTTCGTGACATGTTTAGGA
TCTTAAGCATTGTTTCTATTTCTGATGATCGTCTGCGTTTGCACACATTA
ACCATTTGTGACACAGGCTATAAATTTGATGTTAACTACTATTATCACAC
ACACTGTGCTGCAAAGTGTTCCTGGACTAATTAGTCTCCATCCCCATCTC
TAAATGATGCCTTTTAATGAAACGATTTTAAGATGTGTCTAATCAAAACA
TCTCAAGTATTTGAGGACCAGTAGTTAGTATGCTAACTGGTTTTATCTGA
GCGATAGTATAATTATTGCGTCTGCTCGTCTTAATTGGATTCTTTATTAG
GAGTCGGTTTTAAAGTAAAGTGAGATTGTACTTTACTTAGTTTCTATCAT
TTGTAGTTCTTCTCAACAAGAGGGGAAATGGGAAAGTGGATTTTCCTTTT
CCTTTTGGATCTGCCAGTCATTTTGTGTATAATTCATGAGAAAGAGTAAA
CCAAATCCCTCTTACCTATGTACCTGCTTGCGAATAGCCATTGCCTGTGC
ATGATTCTTAGAAGTGTTAACTTCTCTAATCTTTGTAGCAGACATAAACC
TGGTGAGATCTGGCCACAAAGTAAAACATTTAAAGTGCAGAATGATGAAA
ATGTAGCTCCAGAGGGCAAGAAGGCTTCAAAGTTTCGCACAATCAAACTT
CATGGTATTGTGGAAGATCTGAAAATTGATATGTTCGCCCCGAATGGGTG
GCCTTCAGTCAGCATTGATGCATTGAAAACTTTGTCTGGTAAGATACCCA
TGGATCAGATTTACACAATGGACGACGACCAAGAACATGATGAATATAGC
AACAGTTCAGAACTTCCCGAGCAGGATATAGAAGATACATCATCATATGG
AACTGCATATAAAGCGTTTGGTGGAGGAAAGGAGGGAAAGGAAGCATGCC
ATGCCATTGCAGCTCTATGTGAAATCTCATCTATTGACAAGTTGATATCC
AGCTTTATTCTTCCCTTGCAGGTTAGCCAGCTGATCTTACTTATGTAGTC
TAGGGCTGTTGTTCCTGCCTTAAGACTGAACCTCTGGGGTGCATTTACAA
AATCAATATGTGCGACATGCTCAGTTCAAATATTCTCTACTTGGTGCTCT
GCGAACCATCATGTGCCCACCATGGGATATGCCAGGTTCTGTAGAGGAGG
CATGGACATAGATAAAGTCAGTGACATGTGCACCGGCGAGTATGAGTTTT
AAATGCTTTGAGTATTGTTGTTTGATACTTAGAAGAAAAACGGGTGGGTT
CATGTGGATTTCAAAAACTTCCTATGATCGTACTTTCCACTGTCCCCCAT
GGAGTATCTTTGAATGTTTATATGTGCTAGGCTGTATAGTGCTGACCTGT
GCTTGTGTGTTCTCTGAGAGAGACAACTGAACAACCATATACATTGGTTT
TTTCCTGGGCGTGGGGTTGTGTGTGCGTGAAGGACTTGTGGGGGTTCAAG
TTAACCTTGACTATGTGCACCACCCAGTATTTTAGCCTTAACGCTATTTT
GTACATCGTAGGGAGGTAATATATCATGTAAGGAGGGGCGCATTCACTGT
TCGCTAAATATCAATACTGAAACAGGGCGCTTATCAGCACGAATACCAAA
TTTGCAGGTATGTATTTTCACATTTCTATTGTAGTTTTAAACCATCATCT
CCCAGAAATGAGCAACAGCTCACTTCTCAGTTGTTAAGCACAAGGTTTAT
TAGTATACAAGAAAAAGAAAGTTAAATACAAGCAAGTAATAGGTATAAAT
TCAAGTACGTACAAAAATGCAATAAGCACTGCATACTTTTGTTCGCCAGT
GTGCTTGATTGAGAGGATAACAGAAGCTGCTGTTTTACAGATGCTCTTAC
CCAAGATGAACATGTTATGGATATGCATATTCTCCAGTTCTCCAGAGCAT
ATGCATTGTTTTTGTGCATATTCTCCAGTTCTCCAGAGCATATGCATTGT
TTTTGTGCACACATCTGCCACCATGAACTGCCATGCCATGTAAAGGAGAC
TTTGTGAAGTACTAAGGGACTAACATAAAGCACACGAGCTAATGAAAGAT
TCAAATTTAAGCATTCACCAGTGGCTTTAGTAGGAAAAAATAACTTGTAT
CTTATTCCTACTGAAAAAAACTATTTTAGACTCAATACATGAATAATCTC
CCTTGCAGGCTCAACCTGCACATGAAAAGGATAGATATAAGATCCGCCAA
GCTTTTGTTGCAGCTCCAGGGAACTCTCTTGTTGTTGCTGATTATGGCCA
GGTATGCTAAACACCAAATGATGCTCAGTAGTAATTCTTTTGTCTCTTGG
AATTGCCGAGTCTATTTTGACCTGATGAAAGGTTTGTTTTCATGTAGTTG
GAGCTGAGAATCTTAGCCCATCTTACTAGTTGTAAAAGCATGCTAGATGC
TTTCAAGGCTGGTGGTGACTTCCATTCTAGAACAGCCATGAATATGTACG
AGCATGTCCGAGACGCTGTTCACGAAAAAAAGGTCCTTCTTGAATGGGAT
CCTCTGCCAGGTCAAGAGAAGCCCCCAGTGCCATTGTTGAAGGTATTTGA
CTCACTGTCACTAATATTCTGAGCATAGTTTTAAAATATATTCTTAATTC
ATTTGAAGTGCTCAAGAATATTGGCCATATTTGTTGGATACACTTCCATG
CAATTAAATCATCAGCAGTTTTCTGGTGGGTGGTAGATTGTGCTTATTAG
CCGTGTATTATCCCCCTAGTACAAGGGGTTTTCTGCATATTTACCACTCT
TCTACGTGTATATATATCGGCCTATGTCCTCATGGGAATACAAGTTGCAT
ATTTTCTCACAGTTTCCGTGTATATATATCGGCCTATGTCCTCATGTAAA
CCTGGCATTGGATCAACGAAGTCCAATGGACTTTGGACTTTATTTTATTG
GATCTAATTGGACTGGACATCTCTTGGACATGGGTATCAATGGACGCTAG
GTCCAATAATATTGGACAGGCTTTGGACTTAAACGTAGGACCGTCCAATA
TCCAATGGACTCGTAGCGCCGCCGCTGAGTTTGCCGCCGCCACCGCCCTA
CCGACTACCGTAGCTTCGCGTCCATCGAAGTAGACGACGTGTGGATTTGC
CGTTTTGGTCCCGACCGCTCCAATCCTCCAAGTGCTCGTGAATCCCCCAC
CCTCATCTCGTCTGTTTGACCTCCAGTTCCAGATTGAAGGGAACACCGGT
CGGTCGGGCGGCGGACTCGGGACTGCTCTGGAAGGCGGCCGCTCTCTGGG
CAACAGGCGCGACACTGCCACACTTCTCCTGCGTGTGGCTGGCCAGCCGG
CAGTGGGACGTGGGCGGCTGGGCGACACCGCGATTGCGCAGCTGAACGGC
AGGAAGACCATGAAGAAGAGCTGCTGCGAGGGTGCCTCAGCTTTCCATGG
CCTGCTGCCCTGCTCCTCGGGCATTTGTTGCGCCCACGGCGGAGGCAGTC
AGCGGCTGTGTGCTCCGCCAGAGATTTCTCTAGGGATCTTTCTTCTAGTC
TAGTTTCAGTGGAAGGTCCAATTGGACCTTGGATATCCAATACTACGGCT
GGTTGGACTTGGACGGATTTGGATGTTGCATGGTAGAGTATGGATTGGAC
ATGGACCCCACCACGTAGAAATGGATATCAGAATGGACATATGGTTTTGG
ATTTGGACTCCGATCCAATTCCAGGTTTATCCTCATGGGAATACAAGTTG
CATATTTTCTCACAGTTTCCATCTCTCAAATGTTGGTTTGCTTCATTTTG
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GCTTCACGCACTGAGAGATTAATCGTCCCATTCGTGCAAACATAATCCCA
GCATTCCTGAGTGAAGGGTCACATCCAATAAGTGATGAAGTGTTTCCTCC
TGTTAATGGTTGATGATGATTGTGTACCTTTTGGATCTACGAAAAAACGC
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TTATACTGCACAAAGTGGTCCACTGTCACTGCTGCATGATTAATGCACTC
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TCTAAAGGGTATGAATTGATGCACTAGCCATCTAGACCAAAAGTCCGAAC
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ATACCATATTGAATTGATGCACTAGCCATCTAGACCAAAAGTCCGAACTG
ATGGAAAGGGCTAGGCGTGTATTATATTCTAAAGGGTATGAATTGACTGG
AGGAAGTCACCGAGCACACATGGTTTTGCCAGAACCGTATGTGCGGTCGT
AGGGGCATCACAATTGTGACGCCGGTTTGTTGATGCACTCATCGGTGTCG
TGGACGCGGCCATGCCGTCGTCAGGGTCGTGGACGCGGCCATGCCATCGC
CGTGCCTTGCAGTTGTATTTTCAGAGGGCGTCGTAGCTGTATGTCCATCA
TGTGGACGGGTATAGCGGCGGCAGCGATATGTCGACGAAGATGTTGATAA
GACCACGTTGACGTAGACCTTGGCGATGATGTGTCGGCGGTGTTGGAGTA
GGCGTGTCGACGATGATCGTCGCTCAAAGGCGTCCCTTGTGGCGGCGATG
ATGTCTGAAGCCTTGATGTCGGAGAAGTCGGTGTAGCAGTGTTCCACACC
GGCCTAACGTGTGGATGATGTTGATGTTGCTTCTTCGTGAATGTGCTCGG
CGATGATCTTGGTGTAGTCGTATAGCTTGACGAAGATGTTCGGGTCGATA
GTCCGGCTTGATGCAGTGCAGATCGGCACGAGGATGTAGACGGCGTACTG
GCACGTGGAAGGTCGATGGAGATCTTGGCTAGCCGGCAGGCAGATGTTGT
AGTAGATCGGCACGTGAGCGCGGCGAGGCAGCACTTGGTTCTGTGGCCAA
GGCATTGTGTCGTGGAAGCAGAAGCCTTGGCTGTTGCATGCAACAACTCG
GAGGAAGTGCACAGGACAGGTAAATTAATTTGCAACCTGGTTTGTCTTTG
CATGGCGTTGGTATGATCGTTGCGTGGGTTTGCCTTGGGACATGATCAAC
ATTACGTTGCTGCTAGTTGTGCCATGTGCGCCGCCTGCGGTGTGCAGTCT
CGCCTTGGACGGCGAGGGCAGCACCCGCGCGTGGCTGTGTCTGCGTGTGG
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TATTGAGCTAATTGGATCTAATCTATGAAAATCTGAAATTTTGAAATTGG
ATCTAATCTAGTCTAAAGAAATGATCCGATCTTTGATCGAAACCGGGTGC
CGCGCCCCCGAGGAGAAGATTAATCTCCCCGGGGGCGGCGCGATGCGGAA
GTGGTGGAAGAACCTAGGATCGGCGCCGTGAGGCTAAACCGCTCTGATAC
CATGTGGAAAGTATTGATCCCTAAATATTGCATTGTATTGATTTGACCCT
CGTGGGGGTTTATATGAGTACAAACTTGGAGGGCAAGAAGCCTATGACTT
GGAATACAAGATGATCTCTAAAGTCCTAGTCTATCTCTAGTTGTGTACGT
ATCCTAACATGGAAAATACTAGAAGGGGGCAGAGGGCGACCAAAATTGAC
ATGGATGGAGGCGGTAAAAAGGGACTTGAGGGATTAGAATGTTCCTAGAG
ATTTGGCTCTTGATAGGATTGCATGGAAATCAGCAAATCCATGTGCCAGA
ATCTTAGTTTACTTGTTCTTTGTTTACTTTTTTTCTCTCCTCCTTTTGCT
TTCCTTACGTTCCTGTTGAGTTTAATATCTAGCCTACCCAACTTGCTTGG
AAAAAAGGTTTTGTTGTTGTTACTGAGCACGAATCTTCACTATTTCAAAT
TTTGGTTTGCTAGATGCTTTTCACTCTGCAGATTATACGAAACTAAATCT
GCTACCCTAACTTTCAATTTTAGGATGCTTTTGGTGCTGAGAGGAGGAAG
GCTAAAATGCTTAACTTCTCCATTGCATATGGAAAGACCGCCCAGGGGCT
ATCCTGGGATTGGCAGGTATAAACTCTTACTGGCTACATCTGCATTTTGA
ACTAACTAGGATAATTGTGTCCACAACCCGGTTCAGGAAGACACAGCTTG
ATTAGCGGAAATAATTTTCTTGTACAGTTAACCCAAACACGTGTGGCATG
TACATCAGCTGTATGAGTGTTGCACTTCTCTCTCCCCATCCTGCTGCCTC
TTGCACGTAGGATGTACTCTCCTAGTCTCCTTTGACCCTCATCCTCCACA
TGCTTTACAAAAAATTGTCCTCGGGATCAGTACTTTAATGTCGTTGGTGT
TTGTTTGGTGATTACCACCAAAGAAAGTATGATCCAGGATGGATATATTG
TGCACAGCAACGCATACTCAGCAAGGCCGCAGCCGGTGGATCATTTAACA
CTATAGGCCCTACAATTGAGATTGATTTGCTGTCCTCGTGTTCTTACCAA
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CTTGAGAAAAGTCACTTGATAACACTCTACAGTTTCACAAATTCTGTATT
TTTAGAAAGTATAGTATGATCAATCAGTTCAGAGTTATATTTTACCAGGT
GTCTGTCAAGGAGGCAAGGGAAACACTCAAACTCTGGTATAGCGATCGAA
AAGAGGTTAAAGCTTGGCAACAGAGGCAGAAAGAGCTTGTACATGATAAA
TGTGAAGTCTACACATTGCTCGGACGTTCACGCCGCTTTCCTAACATGGC
CCATGCACTTCATGGTCAAAAAGGTCATGTTAATCGTGCTGCTATAAATG
CACCAGTTCAGGTACTTGCTACTACTGATCAAGGACAACGTCTGTGATGT
TCCACTTGTTTCTAGCTTAAGAAAATCTTGTAATAATGTATCTCTGATCT
GCAGGGCAGCGCAGCAGATGTTGCTATGTGTGCAATGCTCGAGATAGAAA
GAAATGCTTGCCTTAAGGAGCTTGGTTGGAGACTCCTGTTACAGGTTGAG
ATTACTTTTAGGGTTTCTTTTGTTAACAAGAAAGTACTGTTCCTCGCAAA
AATAGAAAAAAAAATTGCTGGTACTTGTACTGACTACTGAGAAATGCAGA
GTCGTATGGAATCCAATCCGTAGTTTTTCCTTAAAACGGAAACTACAAAT
GCAATTATTACATCATACTTTATAACTTTGTTTGCTTCCAAACTATCTAT
TCGTATCGTACCACAAATCCTCCATAGTATGCCATTTTGAACTTTTTTAT
TGTCATTTCTCAGGTGCACGATGAAGTGATACTGGAAGGGCCTACAGAAT
CTGCTGAAACTGCCAGGGCCATCGTGGTAGACTGCATGTCCAAGCCTTTC
TATGGAACCAACATCCTGAAGGTCGACCTGGCTGTCGATGCCAAGTGTGG
AAAAAGTTGGTATGATGCCAAGTAGAGAAGGATCTGTGCTTTTCCACGCT
AAGCGTGGAAAAAGTTGGTACAGGGGCAAGTATAACTGCCCCATCTCTCC
ATCCACACTGTCATAAGATGTCCATGTTTGTCAGCCACACCATGTCGGTC
TGTTCGATCAGACACACAGCGCAAGCTCATTGAAGAGCGGAAGACTCATG
GCAGTGGCGGTGGTTGCATCGAGTTGTGATGCACACTAGTAATCTGATAG
CACGTGGTTTGGGTTGTTCTGTAGTCCCAGTAGGATGTGATGAGTATCAG
GTGGATTAATCTTGAGGGCAGCATGCTCTTTTGTTCATAATAACACCTTG
GTGCTTGCTGCTGTTCTGAGGTTAACTACTTTGGTAACAATTTCTATTCA
CTGGCGAGGCCTAAGATTAAGATTACCGCTGGTAAAACTGTGTTTATGTT
GGCCCAAGGGATAACACAGTTCTGATAACCTGGTACCGTCCCTGTTAACT
CTGATGCTGCGATGTTTACTTACCGTCGACAAATGGCCATGGGAGTGTGC
TACGAGATAGTAATGGAAGGTGTTTGGCTGCAGCTAGTAGATTTTGAACA
GTCGCTCCTAAGTCAATCCACCGAGGATTTTGAAAACTGTGTATACAAGG
ATTCATTTACAAATAAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.