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GrainGenes Sequence Report: AE009693

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Sequence
AE009693
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE009693
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCCTTCGTCCCCTCCCCAACCGCGCGGTCGAGCAAACAGACGCCGTC
CTTCGTCCCCTCCTCAACCGTGCGACCGAACAACCACACGCTCTACTTCG
CCTCCCCGCGGGAGCTCCCTTTCCTGCCTCCATGGACGCCGTACTCTGCC
GCCTCTCTTCCTCGACGTGGTGCTGGTCCTAAGGCCCCGCTTCCTTTCCT
GTAATGGCTCCGCCTTCCCCCGCGGGCCCGACCTCCCGGACCCGGTCCCC
TCAGATGCGCGCGGCTTCGTGCGTCCGCGGTCACCGTCGGCCCGATGGAG
CCACGCGTATGAGCTGGCGGTGGACGACCACGACGGACGGGGCGACCTCC
CGGACCCGGTCCCCTCAGATGCGCGCGACGCCGTGCGTCCGCGGTCACCG
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GACCTCGTCGGTAGAGGTGGAGTCGGAGGTAGTCGGCATGGTGGTGTGGG
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AAGCAGTTATTACATGGTGCTGCGATGAAGAAATTTTACAAAGATTATTT
GGGACGCTACCACTATGTCATGTTGGGATTACCAGATATCTTGATGAGGG
CATTGTCTTGCATTTACTTAGAGTTCTGTTCTGATTGGGTGGTTTTGGGA
TTGGTGTCATTTATACGTTGCAGTGTTCTAGATTGCCTAAAAAAGAAAGC
ATACGGGCGCTGCTCATTGTGTTGTGAAGGTATTATTGAAACTCGTGAGG
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CAGATAATTGGCCTTAAAAAGGGCATCGGTTCTTCAGTAAAAGAAGCTTG
TTATTTCATTAATAGCTTGATGAATGTACTTTAAAAAAAAAAAATCTTTT
TCCTGCATGTTGATTGGATTGTTATTTCAGAGTCATCTATTTACGTTGCT
AGAATATGTTGCACACATGAAGAAGTTGCTCCATCATTTTGCCTTTATGA
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TCAACCGAGATATCAAAGGTCTGTGACCTTCACATTAGTCATGTTTTGTG
TGGTTGTAAAAATGTATGATAATTGATGTGCAATTTAAATTCAGGATTAT
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TTTTTGCGTTTGCAAGTTACTAGCAATATTAATATGCATTATGTGTACAT
ACGTTAAGGGGCAAGAAACTATAGACCCGTGGCAACGCACGGGCAATTCA
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CGGCTCCCTTCCACCCCGGGCGTGCGGAACCAGCTCGCATCCTCTTTCCA
GCTCGCGACCCAGGCCCCCTCCCACGACGTGACACACCGCCCGTCCCAAG
CTCCCGCGACCTAGGCCGCCGCCGCCCCTGCTCCCACCGACTCCTGAGCT
CCGTCACGCCCCCGACTCCGCCCCGTCGACCCGTATCGCCCCCTCCCTCG
ACGTGACCTACCCCGCCCATCCCAAGCTCCCGTGACCCAGGCCGACACCG
CCCCTGCTCCTACCGGCTGTCTGGTATCGTGGACGCATGATTATAATGCT
GCGGATCTTGATGGAATGTTCGGACATTTTCAGCACGCCGTGAGGATAGG
CTGGATGGACAGCCGAAGCCATATCGAAGCCGCGGGACGCAGCCCGGAGC
TCCCGGAGGCGACTTGGTCATCATTGGGATGGCTGCTCCGCCGGTCGTGC
CTCTGATGGTGGATGGCCTGGATCTGTCAGTTGCTGGTCCTCGTACTCGA
TCTCCGGGAGTATGATGTAGCTGGAATTGGTGGAAGCTATCCGTTCGGCA
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ACTAGGACCTTTCGCCTGCCGGAGGTCACCATCTGCAGCGCCGAATCACC
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GCGGGACCTAATGGCAGCAGCGGCTGGGGAGCCATGAGGAAATCGCCGGA
TTGAGCTGGGCAGGGACTAACTGAGTGAAGGGGTGTCAGTGTTGTACTGC
GGCACAGTCGCCTCAGTTCACGCGTTGGACTTGACAGAGCAAAAGCTGCT
TTTCTTTCTAAATTATTGTTCTTAGATTTATCTAGATTCGGATGTATTTA
ATTGACTAGGTACAACTGAATCTAGACAAATCTGAGAATAATAATTTGAA
TTGGTGGAAGTAGTAATTATCTAAAGGCTTAAGCCTGAGATAAAGCAAGC
CCTCTCAGGTCACTTGCCGCAATCGCAATCGAGCGTTGTCGCTGGTTGCG
GGCCTTTGCTGCTGGCAAACGCCGCTTGTGGGCCAGATGGGTGAACCTTT
GCGTGTGGGCTGCAGCTGGAGGGCGGTGCGTCCTCCTCAACACATCCGCA
CACCTCCCTTTCCTCTCTCTTTCCCGTCCCCACAGATCCTCTCCCATCCC
CGTCATGCTCGGCGCCGCCCCTCCGCTCTCTCTCCACAATAGAACTCACC
ACCGTCTATAATCACCGGCCACCCCAATGGATGGTTGTTGCCCTGCTCTC
CCAGATCCTACCTCGATCTATGGCAGCCGAATAGGAGGCACGACGAGCAG
AAGCTGGAGGCCCTCCGTCAGGAGAGACATCGGGTGGGCGCCAAGGAGAT
GCTACATGGCTCGCGGACGTTGCGGGGAACAAGGGCGCGAGTCCGCCCAG
CGCGGCCATGAGGACTGCCATATGTCAAGCGGTCACACTCATCTTCCTTT
CTTCATGTGTTCTAGGTTTTCATCCACCGACGCGGCGTGAGACTAAGAGT
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GTGGATTTGCAATGGTGACTCTCAACCCCTTAGTGAAAGATTCCCACGAT
TGTTTTCTTGTGTGATAGATGACAGTCCGTCGGCTGCTATTTTTTTTGCA
AACAATGTTCTGGCCTCTTCTTTCTATCTGCCTCTGTCTAGATTGGCATA
CAACGAGTTGCAAATGTAGAAATGTCTAGATTGGCTATCATGTGAGAGAA
CCCTCCCTTAGATCAAAGAGATATCTGGACCAACCGTTGGGGTGATAAGT
ATGCATCAGCTAAGTTCTATAGACTTATTCATGCCCATATCTTGGTTCCC
AAGGTTTTCCATTGGCTTTAGAAATCAAGTTGCATCATGGAGACTAAGGT
TTTTACCTGGCTACTTTTATGGGATCGGTTGAACACCAAGGATCTACTCA
AACGTATAAATTGGAATGTTTCAGAGGATTCACATTGTGTGCTTTGTCCG
TTGAGGGCTCATGAAGATAGGTTGCACCTCTTTACCTGCAACTTCAGTCA
ACGAGTTTGGAATTATCTGTAAATTGATTGGATACAGAATGATGATCTGC
AAACAGTGGTTGTGGTAGCCAAGAAGAGCACTACAAAACCTTTTTTTCAT
GGAAGTATTAGTTACAGCAGGTTGGAATATCTGGCTTCAGCCAAATGGCA
AAATTTCCAGACATGCGAGACCCTCTTTCTCAAAATGGAAGTTCAACTTT
ATTCACGACATGTCTTTGCTTAGGCATAGACTTAAAGCCAAGTATGTGGG
TAGTGTCTTGGTTTGGTTAGATTCCCTGACTTAGTCCGTAAATAGCTCTT
GCGTGCTAGCTGTTTTCTTTTTATAAGAGTGTACATATATGTACTCTCTT
TGGTTGAAATAAATTGTTGTGGGTTTTTTGCCTCATAGTCCATAGTAAAA
AAAGATCTGGCAAGGCAGGATGTGGCATGGCGCCGCACATGATCACTCGG
CAGCTCGCTGCCTACAGATAGGCCTGTAGACATGTGGGCGTGCAGTCATG
GAAGCGGACGAGTGAGAGTTCTCTTCCTTATGCACTAGCTTTTGGTACTA
GAAGGGAATCAACCATTGGATAATTTAGTTTCCACAATACAGTGTTTTAT
GCAAGAGTGGTGTAAGCTGTGGGGCTTTTGCCTCATAGTCCACAGTCAAT
TTTTTGGCAAGACCAGATGTGGCATGACGTTGCACAGGATCAGTTGGCAT
CTCGCTGCCTACAGACAGTCCCATAGGTATGCCGGCGTGTAGCATCCCAA
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ACCTTGCATTTGAGCATCATATAAAACCCTTTTGTTTTTGGTTCTTCTCT
CACATGCAATATTAATTGTATTTGCCTCTTGATATTGTATTTGGTTATTA
ATATATTGTCTAAATGCCCAAGTTGAGTTGGGGGCATATCTTTTATTTCC
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CTTCTTGGATATGCATAGGGTAATGCCATAATACTAATATTGTTCTCACA
AAATATATCATGGCATTATTATTTTGCATGGGCCATGCACAATTCTTCAC
CTCCTTTTTCCTCCATTGGTTTTTCTTTGGATTTGGTGAATCCTATCTTT
GTGAAAACATCTCCTACCACTCCACCATCCTCATGGGCTCATGTATAACT
TATCTTCTTAATTTATTCTCCATGTATGCACCATATGAGGCCTAGTCCCT
CATTTTCTTTCTTTTTCTTTTCTTGCTATTCTCTCCCACCTCATCTCTTG
TGACTTCTAGCTATCATCATACTCCACTTGGGGGTGATCTTTTGCTCAAG
CCTTAAAAATCTAAATCCTAAACAAACCTACACCTAGCTTTTTACTTCTA
ATTTCTTCCTAGCCCTAATTCTCTACACCCTAACCCTAATCCTCCTCCTC
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ATCTACCCTAGCCCGATCTACTCCCTCTTCTCTCTTTCTTTCTCTCCCGG
CTGAGCTAGCCCCACCTGGCTGTCCCTCCCTCTCGACCAAGCCCCACCTG
CAGCCCCAGGACCAGCCCCAGCCGGCCGAGCACGTGCTCGAGGAGAGAGG
AGGAAAAGGTGGCACCGAGGCCACCTTATCCCTGCCGTGCCCCGCCTTCC
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TCCCCCAGATCTGGCCGAGCCGTCCCCTTCTTCCCCTTCTTCCTCTCCGT
CCACCAGCAGCCGACGCCGGTCGCCGCCAGCACCACCTCGTCCCCGCCGT
TCCAGCCGTGCAGCTCGACCTGGAGGTGGCTGAGAAGATCGAGTACGCCC
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AACGCCGCCGATCGTTTCATCGAACACCCGCCGCGCGCCAGAGCTCGCCG
TCTTCTGCAGCCTTCCCGCGCCGCGCCACACCCCATCTAGCCCTCGCCCA
CCTCCCTGTCAGCTCCCCTAGCCCGCCGCACCGGTTAGCACCCTCCGCGC
GCATGCCCGCGTCCCGGGATCGATCCCCGCTCGCGCCGCGCGCCGGATTT
TCTCGCCAGACGAAGGAAAACGAAGAACAGTACGGGCCCGTGGTCATCTT
ACAAAAAGCCCCCCACCTTTTTGATTCCTGCAACCCGCGCTCCTAGCGAC
CCCACCAGTCAGCCGCGCTGGCACGTTTGCTGAAAACCCCTAGGCTTTTC
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CAGCGGGCTAGCCAGACCCGCGGTGGAAAAAGTGTTTTCCGCGCGCGTGG
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GATTTAAATTCAAATTCAATTCAGATTCAAATAATTTTTAAAATACAAAT
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TCAAATATGCCATTCAAAATAATATTTGGACACTTTAAAATTTCGAGATG
ATTAAAATTACAAGAAAATGCCCTTTTCCTTAATTATTTAATAACTTTTG
TTTTATAACTCCAAATTTGACAAATAATATGTCTAAATCGATCAGCGCAA
CGAGCCCGTTCTATTTATGCAGTCCTTGTTCTGAATTGAAGCATGCATCA
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GCTTGTTGCATTTCAATTCATATGCTTGTGCACTTTATTTATGTTGGCCC
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GAATCACAGGAGCATTATCCAGATCCATCTCTCGCTTCAACTGAGCTGCC
AGGCAAGCACTACCACATGCTTGCATACATACAGTACCTATTGCCTCTAT
CTTATTCTTGCATCATTGAGTCGCGATTGCATTAAATTGAATCCCAAGTA
CTGCATAGCCTTTACTTTTAAACCACACCAAGCTTGTTTCGGTCCCATGA
GCCATTACTACAGGAGTTGTTTGAGCCATGCGAGTCGTAGAAAAGCATGA
GTAGGGTATGTGAGTGTCTGATGAATAACGAGGTACTAAACAACGTAACC
TGAGTAGTAATGGGATAACTAATGAAAGAGGCACCGGTGGGCAATATCTG
CTATTTGGTTTTTCATGCTCACTTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTACTTG
ATTCCTGTTCCTTGACTATTCGCACTATCCACATCCGGGAGGCCTTATGG
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GCGGTATCGACAAGCCCAGTCACATTTTCGGGTTCCTAGTCGTTTACAGC
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TTGTCGTGAATGCCTCATTGGGTTTTGATTTGGTTTTTCCGAGGTTGATC
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GGTTGTTCGTCCGCTTCCTCGTTGGTAAGCGAGGAGGAGGATGGATCTGT
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GTTGGCAATGATCATTCGGTGTAGAGATTCCGGGAACGGGGATCCGTGTG
ATCTGTGGGCGGGATGTGTTTATTTATGGGGCATCTTATGCCAATTTGCT
TCTTATCCGTACTCGGATCTTGTTTTCCGCTTCCGCCTGATACTCTGATG
TGTGATGTATGAGGAGCTATCCTAAATTATTATCTCTATCTAGGACATTT
GGATCTTGCCGTATGGCGTTGCAATATTTCTATTTCTTTTAGATGGAATG
GCTCTGAGGACTGTTGTATGTGGCTTGCATACATACTCACTTGTGTATGT
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TGAAAGTGGTTAGGACGGCCGAAAGGTCTACCGTGAGTGGCCCTGGGCCC
CGCCGTACTATTTTAACCACTTTCGTTCATCCAGGCATTAACTAAGAACG
TAATTCACCGAGGTAGTTACACGGCGTGCAGCCATGGAAGCGGACGGGCG
AGAGTTCTCTTCCTTATGCACTAGCCTTTGGTATTACTCCCTCCGTTTAG
AAATATAAGACGTTTTAGCTTTGTGAATTGAATGCATCTAGACGTATTTT
AGTGTATAGATTCGTAGAGGTTTAGAGTGAATCTATGCACTAAAAGCGTC
TAGATACATTCATTTCACAAAGCTAAAATGTCTTATATTTCTGAACGGAG
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TTATCCTATTTACCACAACCTGATAACTAGTGGTTATCGCTTTCATATAT
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ATAGAAGCAAATATTGACATCCAACCAAAAGCTGGACTCTTACCTTCCCT
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TGCCTTCTGATATTAACAGTGTTTTTTATTTGACATGAAACAGGAGCTAG
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AAGTACATCTTGCTAAATATTTTTCATGTTCAATATCCATGTCTTGGTTC
ATGCAATTTCCATATGCATATGTTGTTTGGATTTGGGGCGCGGGACAAAT
TACTTATGAACTTCTACTGTAATAATTTGTAGTAATGTTTTTGTATCTAT
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GATATTCTTGGCAAAGGAATAAGTTTTTGCGTGCTGCTGTTGTAATAGCT
TACAACTAATGCTTCTGATTAGTACTGTAGTCATTCATTTTCGTAACAAG
ATGATCTGCCAGGAAGTTAGTGACAATAATATTCTTGGTGACGTCATTTC
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TGCCCATGAAGAAAAGTGCGCTAAATGTTGGATTTGTTCGTCTTCCCCTC
CATACCAGTAGGAGCATTCTTTCTTTTCACATAATCTGATTATATATATG
TCCATAGTTCTCTGAATATCCCCTTTTGTAGTATGGGTAAAAATAAATAG
GCTGTGGTGATTTTCTGGACGAGTGCCGACAGAAATTTGTGTGGTTATCA
TAGTGATTAGGAGCTTATGTCTTCTATCGACAAGTTCTGATATGTAAGCG
TGTCTTTTGAGCTTCCACACTGCATTTACACCTAAAATTAAACAAGGGAG
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GTTTCTTTTTGTCTCTAGCACTGATGGTGACACAAGCGCGGTTTAAAGTT
TCTTTGTAAGTTTAATTGTATTTCTTTAGAAGTCACTAGAACTAATGTAT
GTACCATAAATAATATTGATATACTTCCATGTCCATCCATTTCTATCATA
TTGTTTTGGAGTGAAAATAACCACCCTCTGCCGTTGGTGGCTTTAGTGAA
AATGTTCTAACAGCAATGAAATCACCTTGCATGGTTTCCATCACATCCCT
TTTACATGTACTTTGACATGGTATAGTGCATGCTCATCTACTTGATTATT
TACTTGCTTAATTTGCAGTCAAACATCTACCTATGTATGCATACCATGTT
CCTATGAGTGCTCATTTTCATGTACTTATGCATAGTTAGAGCATCTGTGA
ACCAAGATTATATGAGATGAAACGATATAATATTGCATATAACTCTATGG
CGAGATGGAGTGAGCAGATACAACTAGAACATACCGCCAACCAAACAATC
TGCAATAGTAGTCCACAGATTATAAATAAATATCCCACCAATTATTTGTA
CTGATATATAGATACTCCAACGACTATATAAAACACATGTGAGGTGTAAC
TACACCAAGTAGTAGCCCATCTTCGTCAAATACGACAATGGATATTATGT
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GGTGAACGGGTTGTATTAATCTACTAGGTCCTTGAGATTGGCCCTCCGGA
CCTCCCAGTAAATCTCCAAGTTTAGTTAACATGTTGCTCAGTCACTATAT
ACTCAATATAATTATATGTCCATTTGTGTAAATGTTTTTTGATTTGTGTC
CATTCTTTCTGGTTAGTTGACATTTTCTTTTTAGGTAGTGCGAAAATAAA
TCAACCTAAGCTTTCTATATGTTCACATCCCAACATATTGGATGTTGTAT
TACTTATGGGTGAGATTTTATTATTTTAACCATCTGTATGTTGTTCTGGT
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TTAAGCTACTTCTCATACCAGTGATGTTTCTACTTAGATGAGTAGCGACC
TCTCTGGTTCCTGGATGTTCGAGCTATTTCCCATCTTTAATCTATTGGGT
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TTCCATTGTTTCTTAATTGTATGTATAACATTTAGAACGAGAGTTAGTGC
CCCCTTCTGCTATGTAAACTTAGTACTAATGGATCTTCTGGTTCTAAGCA
CCTTAAAATTGTCGATATGAACGATTGTTTGCTCCTTAAATGACTACTTT
TTTCAGAAATTCAATGATAGTGCCTTTGACAGTTTGATCTTATCTCGAGA
ATAGCTACATATGTGAAGGAAAATTGTTAGGTTTGACCTCACTTCTCTTT
TTATCATCCAGTTCTGTATAATTTTGAGAGGATTAGCTGAGATCACACTT
TGTTTTCTGAGTTAAGGTTATTGCCAAAACTGCACTGGCTTGATGTTATG
GAGTGTCGTGGTTTTGTACTGGAAAGGGGCCAGTGAGCTGCAAGCATATA
ATAGAGGTATGTCACAGCAGAATCGTTTTGAATTTTGACTTAATAAATCA
TTGATGGCCTTGTTGCTTATAAGTCCTTATAAAGTCGGGCCTTGATATCT
TTTCAAGTTAGCCTAAGTGCTCAATGCATGTTGTAAGAGAGAAGGGGGGC
TCAGTTGCCTCTGTAAATTACTCTATTAATTAAGCATTTCTCCTTTGGTA
GCTTTCCCCCCTTGTATATCTTATCACCATAAATACGATGCAAATAACTC
AATGAGATTGAATTGAACTTTTCTCATGTTTTCATTTATGGTGGGCTATC
GGTGTATAGGGATGCAGGCAGACGCCCGCTATGACATCCCAACTTGTCCG
CTAGGAGGCAGGAGCTGGACCAATGTAGCACTAATTTTCTAGCACTAATC
TTCCATTCACTATTCTTTCATGCAATAATCAAACAGACTGGCTGCCTTGT
CCGCCGGCCCATCCACCGGCATGTATATCGGTGGAAGATCCATGAGATTA
CTACTATTTCGGTTCCTTTTTTGGAGCCCGAGAATGTACGTACGTCCAAG
TCCTCTCCATTGATTTTGCTAACTTACTAATGTTAAGGAATTTCCGCTGG
GCTCTGCAATCCAACAAGTTGCAAACACCAATTTAGTAGCTGTCAAACAA
GCCTACAATGTGGTCTTAGCAAGTTAGTTGTGACGACATCATGAGTAAGC
CAGTTGCTTCTGGATTTAGACCTGGTTTGTTGCTTGAAGTACTTTTGCAA
TTTGCTTGATGTACTATTTAGTGGATGAACCACTGGTTGCTGTATTGCTA
CGAGCTCAGATGAAAATAAAGGTATCCTTCGTGTGAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.