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GrainGenes Sequence Report: AE036226

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Sequence
AE036226
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE036226
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGCACGAGCTCGGACTAGCAACATCAATCTCAAACCGGGAGACTCAAAC
CCCTCTTGCCTCGACTGCCCGCCCCAGCTCGAAGGCTCACCCAAATTTCC
CTGCCGTTGCCTTTCCCTTCTTCCCACTTGTAGGGTTGCATGATCTGGCC
GGGATTTGGATGAAGGAACGAAAGCCGGCGGCCTCCTCCACGTTGTCCCG
GATCCTCGCGACGTGCGCGTCCCAGGTGCTGATCCGCCCCCTCTCTTTCT
GCTACATGTGGGGATCGGATTGCCCCTGTTGAACTTTTCCTTTTTTGTTA
GCTGCTAGTCGCTGACAGGTCTGATGATATATTTCGTGGATTTGTGACTT
GTGAGGCCTTGTTTGGTACTCGAGTATTTGTAGGGATTAGAGGGGATAAT
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AATCTATCTTCTACCTGCTATTCCTTACCCTTCTGAATTCTGTCGACCTA
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CGAACTTGTCCTCATGTGATTCACCCCTACTACCTTCGCAGCCCCAAGCA
GCCACAACAGCTTGGGACCCTGATAAGTCGCTATGTTGCTTAACTGAAAA
ACATTGGTTTCATGCCATTGCCTATACATGCACAATGAGGCCTTGCCATC
GGCACTCTATGAATTGTAAATAGGTAGGAGTATGCTGAAATTGACTATTC
GTACACATTCCCCGTGAAAAATGACTTGCTATACTAGTGGTACCATATGT
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TCTATTTATCGGCTATGCTATGCAGGCAAAAGATTACGGGAGATGTGTAG
CAGCAAAGGTCCCTGAGATTGAACATAATATGTGTTCTAAGGAGTTCCTA
GCACTCAGAGCATGCATGCAGACTGCGGTAATCTTTTCTATCATTAAGAA
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TATCATCCAAATTCAAATGGAAGTGGCATTTTGATAAAAAAGTTTACCAT
AATACCGTAGGGGAATACCTATGGCCTTTTAATAAATTAACTCAAACTGT
TTTGTTCTTGGCCAACAATCAAAATGTGTACCGATTATTTGTCCGCCTCT
TCTTGCTTCTTCCTGTTCCTATCTTCCACCGCTTCACTTCTGCTGTGTGC
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GGCTGTCAATAGATAGTCTCTCAGATAATTTCCTTTTGCCGATTCATAGG
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CCTGGTTGAACTTTCATAATTTCGTAACCATGTTTTTGTCTGTCCTGAAA
GGTCAAGAATAAGGCTTGAAGTGTGAGTTGCTGCGGCTCTCTGGTAAGTA
TGTATATATTTATAACTCAAAGAAAAATATGTATATACAACTCAAAGAAA
ATATGTAATGGTGTGATGCATTATTACCATGTAATAAGAAAAGATAACTA
TGCATCATGCTGACAGCAGCTCCCTTTCCATCATGTGATTAAATATAGGC
TTACTAGCTTAGCCGCTTGAGTAACAACAGAATTCTGCACAATCAGATGC
AAGGAGGTTTGGGCAGCCCTGGTGCGCTCTCTCATGTTTATGTACAACAT
CCTCCCCTACGATGTGACATTCCAGATATTAGGGGCCTATTCTATGATGA
TGCAAATAAGTTTCTTGTAGCTCCAACAACTGATCGGGTATATGAACATC
CAGTTGATTTACTTCTCCATTTTCCCAATGAACCTGGTTGTTATAAAGTA
AACTGGTTGCGTGATTGCAGATATTATACTGGAAGATAGCTCCATCTACT
CCATCTGGACCTCCAAACTCTGATCCAGTTAATGAAGGCCCTGTCTTATC
AGTTCGATTTTCGCTGGATCAGAAAGCAATAGGGATTCAACGATCCAGTC
ATGAGGTTGAGTTTAGAAATAGAGAAACAGGGGAAGCCTGTAGCAAGAAG
TGCAGAGCAGATTCTGAAACCATACTAGGCTTTTTCTGGACTGACTGCCC
CACTTGTGATGTCATAATAATAAAAACAAGGTATGTATTGTGTTGTTGCT
ACAGTATAAAATTATATACGTTCTACATCGATTATATCCGATTAGCCTAC
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TTCATGTTTTAGTTCTATGTAGAAGGAGATTATCCTGTTCATTGGTTCAT
TTTTTTCTGTGAAATGTATCTCTATTGCAGTGGCCTAGATCTGCTTGTAT
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TGGCATGCAATGTACACTGTTCACTGGATATCAGGTAATGCATTATGCAC
ACATCAAAGACAACATATCCCTTAAAAAAACTCTAATAAAGTTTTTTTCA
TAAATGTTGGTTGGTTAGAAATATTGGTTGATGTAATGGTATTTACCTGC
TTTTACTGTTTTGAACCATTCTCACTTCCATTCTGGTGTGATAATGCTGT
CGTTGCACTTCAAAGCAGACTCTGTATTGAGATATTCAACTTTTCTGTGT
AGTAACACAGTAAGCTTGGATCTATATTAAACTTACTCCCTCTGATCCAT
AATAAGTGTCGCTGATTTAGTGTTGTACTAAATCAGCGACACTTATTTTG
GTTCGGAGGGAGTACTTTCTATTTATACTAAATTGTTGTTTGGTATTTCC
TTTAGAGATACTTAATTACTTCAGAATTTTACTTTCAGTAAAATAATTGT
GTGTATGGTTGTGTTTATTTGGCGTGCATATTTTTGGATGGCGTATAGGA
GAAAGCAAGGGTAAATAAGACAGTAAATTTGTAGCATATTATCCCAATTC
CCCAATTCTGGAGAGGATACAGTTCACTCCCGGTATTAGGGGTGGAGGGT
CATAGAGATAATTCTGCTATATATATCTTTTGGTAAGTTAGCCTACCTGG
CTTGCTAGGTGTGTACATTATTTGGTCAATGCTGCATATTTATTAGAACC
AGGTCTCTTCACTAGGTGTACATTGTTTAGTTGGTACTCTTCTTCCCCTA
ATGTACTAGTAGCATCGCCAAACTATCCAGTATTAAGTTTCAAGCCGGGA
ACACCCCAATATTTTCATCCTCCTCTTGACTCCTGGTCAAATTGTGAACT
TGAGTTCTTTAGCACTTGCAAACTGCCGAAGTGTAATGGTGTTATGAAAT
TGGCACTCTCTTGATTCTAGTTCACGCTCCACCACTGAGGGTGTTATTGA
TTCATTTTCCCAGGCCCTGTGTTCTGAACGTCAGTTTTTAGTTGAGCTGT
TTCTAACATCTATGCATATGAAACCTTTCTTATCAATTTAGAGAATTTTT
CTATGTCATCTCATGTCTACTTTGAATGCAAATGAAAATTGATTGAACCG
AGCAAAACTAACTGATTAACTATTTTCTTCAGATAACATGATTTAACATC
CAATATGTATGCTAACTTTCATCCATGTTTCTAACAGTTCTCTGCTGGTG
GGATTGTCAAATTACCTAAGTTTGAGATGATGATGTCTAAATGCGAAGCA
AATAACAAGCCTGTCCTAGCTGCTGCTGATGTTCACATTGTAACTGTGTA
TGCTTTTCTGTCCCTTTATCTGTTTTGTCCTCGTTTTTTTTTTTTGGAAA
TTCCACATATAATCCCAATAATATTTTTTTGAATGTGACAGCTATGGTAG
GATTTACTGCTTGCAACTCGATAGAGTTAACATGGCATTGAACTTCTACC
GTTTCTACCGTGATGCTGTTGTGCAACAGGTCTGAACTATAAACTGATTT
CCCTTGTAGTTCCTTTTCTCAAGAACATGTTATCTTTTAGACATTTTCCC
CATTATACCTCTAGCTAGGTGGCTGTTTCAGCTGAGTCGCATTTGTTTGA
TATTTATGAAAGTTATCACCCTCGGTCATGTCGCATCATTAATAGCATCC
TATTTTGCCATGGCATTAATTTAAGAGAAAACATGTAGAGAGTTAGTAAA
GATTAAGGTGTTGGTAGCAGATTTGGTTATGTGCCTTGAATAAGGATTTA
TCTTGAAAAGGTAGTGTGCTTGCATTCACAAGGAACAGTTTGAATTCATA
GTAATTAAACTAGATGAACTGGTGCTTCGACCCATAGTTACTGGATTCAC
TCAAACCTTCGTCCGATCTGTATCAATCGACCCAGACAGGGTTCTAATTC
GCAACCTCCGTGAATCACTATGAGGAGGAGCGCACAATTACGTTCATTGT
CACCATTGCATCTCCATCATCAACCTCTATCTCCATAAAGAAAGATTGCA
AGCAGCTCTGTTGCTGTTGACCATGGCACCCACATTGCACTCGAATTGTA
GAAGGTCACAAATTGTGAATGATGGATCTGGTAACTGTGAGGTCGACCGA
AGAATGAATAATAGTCTGGTCTGGCTGACCTATTGTGTCGGTTTAGGAAA
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ACATTGTTTGATAGGTTACACCATCGTTCGCTTACTGACCCTGTTCTAAT
AAACACCATCTACTGAGTTGATATGAGATATGACCTGTAACAGTATGTAG
GTTGTGATGATTAAGTGTGTCTGATAAATAAATGGTCAAATATTATGATA
AGCACTCCATTCACGCATCTGGGTTTCTAGAAGATGTTCTGATAGATCAT
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GGCATGAGGCCTAGCCTGAATGTTTTAAGCCTTTTGCTTTCTAATCTAGT
GTGTTGTTTCCTTTCCTAGAAGGCAGCAAGCGGTTGGAGCTAAAGTTGGT
ACAAGTTTTCTGATTCCTGGCTGAATTGGACATCTTGGCCTTGTTAGTTT
GTCGGAAAACCTCATAGTTAACAGATTAAACTACACCTGTTACATCTTTA
CTATTAAAAGGCTTACGGTATTGATGGTCGGTACGTCGGTCAGAATTTAC
CCTACATTGTCTATCTATTTACGAGCAGACTGCCCTCCCGCTGAAAAAAC
GATTGGACCAAAAAGATCCCCACGTTACAAACCTTCGGGTATTCCAATGG
GAAAGAAAAACAAATCTGCCTGTTGCACATCTCCGACCTCCCAATAGAAA
CCGCTTCGTGCACATCTCCGAGCCCGACCTCCCCACTCCGTGCGCCCGTC
GCTGCACGGCTCCGAGCGCAGTTTTTTCACCCGCCCGACTCGATCCTCTC
TCGAGACGGCGACTGAGCCAGCCGGAGGGCTCTCATCTATGCTGATTCCC
TCTATCCTGCTGGAGCTAGATCCGGTCCCTCCTAGGCAGCCTTCTTCCTG
CGGTATGCTCCTCGCCACCACCATCGGGTAACTCCAATCCAGCGTAGGGG
CAGGTGCCGTGGCGGCGGAACCTCGATCTGATTCGCTTCCGATCTCGATC
TCCGCTGACCTGCCACCGCCGCGCTGCTCCCATCTGGAATGCTCGATCTG
AATTGCTTATGAACCCAATGACATAGCGTTTTTTATTTTTATTTTTTTTT
GCGAGAAAATTTTGGATCTATTCCATGAGTTCACAAGAAGTACAAGACAC
ACCAGACATGATAAACATTACATTGAAGTACTTGAACCACCTAACGACCA
CTACTGCTGCCAGAGCGAGCCGCCGACGCGCCGCTGTCGCCGCTCCCTCA
CCAGAGCCAGCTTGTCGTTGTTGATGACAGTCGGGAAGTCTTCGTGCACG
TGCCCCTAAGGACCAGCGCCCCAGAGCCGAGTCGTCGCCATTGAACCCTT
GAATTGATCCGAATCTTCAAACACCAAACCTAGAACACACGTAGACTGGA
CAAGATCGACCACTCCATGGAGGCAGCGACCAGACGAATCCCTGCCTTCC
TCGGCACCACCGACGAGATCGCCGACGGCGAGGTGGAAGAGGAGGCGGGT
ATACCTTATTCTTATCCCGCACAACACCGCCATAGCCACCATAGCGTCGA
TGTCGGTTGACCAAACTCTAACTTTAGGGACCCTTCAACCGCGCCGAGCG
CAGGTCCGAGGTCCCCACCCCCTCCGACCGCCGGAGCGACAACTGGAGGA
GGCGGGGACCCATCAATTTCCGATCGTAGACGGCGGAGACGAGGCACGGA
CGGCGGGCGGCAGGCTAGGGAGGAACCCTAGCCGCCGCCTCCTTTTCTTT
GCGGGAGAGAGACACCCGTACGTGTTTCTTCCGATTGTTTCTGTTAACGT
TTGTTGGTGTGCTCACTGCTCACTACTGGCATAGTGGCCTCGGATGTCAT
GATTTTGGGTTGCACTACTAGGTGTCTGTCAAATGCATAAGTAATGATTT
AGAAGCGAGGCATGTTTTGCAGAAGTTATGTGGCTGCCTTGTGTTGATCT
TAGGCGTTAATGCTGCGGCTGGCAAATGAGGATATGATTTAGAAGCGAGG
CATGTTTTGCACAAGCAGTGCATCATCAAGAAATTGTCGGGACCATTTAG
TTTGATGCAATAGGTTTGAGTTTTTTTGCACAAAGCTCTAATCGTTTCTT
GATATAATTGAGCACACTATATCTTGGGTGGTGGATGAATTGGTTTCTGG
TTGTTTAGGTTGCGCTTACGCACATCAGGCCATTTTGAATGCAGACTTGT
TTTTATCTGACTGTAGGCTTATTATTCAGTATTTTCTTAAAACAGTATTG
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GATATTTGTAATGTTGCAGTTTTTTGCACTCAGTTTATAGAAAAAAAATA
CAGCATCATGTTCGTCCTCTTATTGTTGCTTCAGCCTTAGTTTTGAAGTT
GTCTGCTGAAGCATTGCTCATTATTTTTTAGGACTTTTGGAAGTTACCTT
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TCATGTAACCATTTGCTCCTTTGTAATAGATGCACTGAATAATATGTTCA
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GTTTACGGAAATGGTTGATAGGAAAATGCTTATCATCTAAAAATTAGAGT
AGCTCTTTGATTTTAATCGAGAACACGGATATGCATCCGGTTCATAAGCC
TGAGAAAAGGGGGACCGTCGAGCCATAGGCCACACAAGGGAGAAAAACTA
GAGAAAATGCGGTTCGTTGAGGTGTAAGCGACAGAGGGAGAAGAACTAAA
GTGATACATATGGTTTAATAGGGAGGTCCGGCTTAATATTTCCGTACATT
TTATGCTTGCACACTCAACATGCACAACAATAATTTTTTAAGACCCGTGG
CAACGCACGGGCATTTAGCTAGTAAGTCATTATTTGAACCGAGCTGTTCA
TTTCTTTTCGTAAATTAACACTTAATTTGTTTCTGAGTTCATAAACTGCT
CAAAGTTTGTGTGAAGATGGCCATTGCTGTTTTTTTGCCAGTCCTGGCCA
CTGAGATACTGACAAATATTTTTTCCCAAAAAGAGACCCAAGAAATAGTG
CCTTGGTCATTAGTCTTGTCTAGGTTCTGGAATCCCTGTTTGGTAATGTC
TTTCTATTACTGCATTCAAGAAGTAGCGGTAGTTCACTAACTCATAGTTT
GTTATTCCAGGATACTCTGCCAACTTATTCAAGCAGAATTGCAGTTAGTG
CAGTTGACAATATAATCATGGTCCATCAGATAGATGCTAAAGTTGTCATA
CTATATGATGTATTTATGGATTCTTACACACCAATATCTGCACCACTTCC
GCTCCTAGTGAGAGGACTGCCCAGCAATAGTAGGCAAGCACCTCAAACCT
CAGATCACCAATCAAGTGCATATGGCGGGACTTTATATGGAGAAGGCTGG
AACTTTCTCATTCCTGACCTTATCTGTGATGCTGATAATGGGCTACTGTG
GAAACTTCATTTAGACTTGGAGGTAAGGAATCGGCAATGGATTATTTATA
GATTATATCATCCTTAACGCAAGTACATCTTTTTCCTGACATGCATACCT
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ATTTTCATACCATTTCTTACTTAAATTTATGAAGCAGGTCAAGACACTTA
GCCTTGCTATAATTCGAACAATCATCCTGGAAAGGAGGCCAATAACTTTG
GTTGCCAAGGCAATGGATGTCATTCTTGATTCATACTCCCGGTTGATGAA
AATCGGAGGCAGTGCTGCTGGGGGTAGGGCAACATCTGAGCAAAACGAAC
AGTCAAGTGGCCAGCCTGTTGAGGAATCCAGTGTGATTTATCAAGAGCCA
CCTTCTGGAACCATCAATAGACCTGTTGTCCACACAGATTCAGCAATTGG
AGTCGAGAGTAGACCGTTGCAGTCAAATTCTGGAGCTGAGCTTGGAATTG
CTAACCTGGCAGCAGCTGTAGATAGGACATCTTTAATTACATCTTCTGAT
TCTGAAGATATTGCCAATACATCGAGAGCACTAAGTCAGGCAACATCTGG
TGCCACCAGCAAAAGACCGCAGGTTGTAGGTGAGGATAGCAGACCATTGG
CTTCTGGTGCATCAATGCAGCATGTCACTACTGTGGCAATTTCACCAAAT
GATATATTCCAGTCTGTCTTTCTTCTTGTTGAAGATGAAATGATGGGTGA
CCCTGCATATCTTATTGCTGTCACCATGGAGTTTCTACGAAGGTACTTCT
TAGTGTTCTTGAAAAGTAGTTTAGAAGCTACAAATACATGATAGTAAGAA
CACAAATTACTGTCTTGTTTTGTATTCAGTATGTCGAAGGCTGGGGTGAA
GGCTCCTCCCAACCTTTATGTGATGATGACTACTTTGCTGGCCCGCAGCA
ACCGTTATGCTGAAATAGCACTGTTTGTATCAAACAAGGTTAGTATGTTG
TTCTAACATGTTCAACACCATACTGATGATTAGTGTGGCAATTACCATTA
AATACACTGCAATCATGTAGTGTGTACTGATGAGTACATATATTATGTTT
CGCCTCTATTAATTGCCCCAAATAATATCTCCTGCGCACAATATTGTGCA
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CTCTTACATGCATATGCTCCCTTTATTTGAATATAATTTAAAATTTTACC
TGCACATACATCTCCACGTTCTAGGTGCGCACAAAGTCGTTTCACGTAAA
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ACATGAAATTTATTTCAGAATTTTTTTAACAATTTGAAATGTGTGTTTTT
TGGTAAAGGGAACATATGCACCATGGTTCAAAAATGAATTTCCCGTATTT
GCTTGTCCATCTCCTTGCCCTGTTAAAAAGTACTGTTTCATTTTGGTCAT
CGGCCAATTCCTGCAGATCCTAGAGCCCTCCAGGGAACTTGCAATGCAGC
TCATTGAACTGGGTCGACAACATTCACTGACAAGGAAGTTGGGCGTGGAC
ATGCTGCGGGAGAGGTTCCTGCACCATGATTATGTGGCTGTATTACTCCA
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ACAATAGGTGCATTAGTATTATTGATGCTTGCATTACTATTTAGTCCCTT
CAACTGCCTTTTCCATATATCTGAGCATGCTATGCTGCCAGAGCTAAGCA
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GCATATCTGTATCGAATGGTTAAGAATAAATGGAATAAACCCAGTATAAA
AACACAAGCCGAATCCTGAGGCTACGTGGCTAAGCTCAGGTGACTAAAAC
TTGAGAGAGTCTCAGTCGACTAAGTATTAGCGATTACGTCAAGTTAAATA
CTTTCCTGCAAGCCTGCTTGCTGGTTATTGGTATCCTGTGTACTGAAATT
CGCTGCTCAAGTGCTCATAGTAATCCAAGGCAGCACCTTGGTTTTTTGTT
CCAATACTTTGTTGCATCCCCTTGTTACTGACATGAAGATATTGATTCAG
GTTATCACCGTGCAGCCTGTCCTGTTCTTGGAGAAAGCCGTAGCCAGCGA
CAGCCCGCGGAATGTTGCTGCTGTGCTGAGCTTCTTCACCGAGTTCATGC
CGAGCTTCAAGACGACATCCGACTATGGCAGATATCAGCACATACTGTCT
GAAATGGTTTGAAGTGCCCCAAGCGATTAGCACGCTGTATGAACGCGTCG
GTCGTTCGTTCGTTCTTCTCTCCTGCTAGAATTCTGAAGCTTTTTTTATC
TGATAACTTAATTCTTCACTGTTTGACATTCATATTTTATTGCGAATGAA
AATAAGCTGGTATGAGGCCACGCTTGATTCAGTGTCAAACATGGCTAAGA
AAAAACATGGTATGAGGCCACGCATGCACAACATGAAAAGGAGAATTAGG
AGTACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.