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GrainGenes Sequence Report: AE015134

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Sequence
AE015134
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE015134
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAGGACGCGGTGCTCCAGCTTGGCGTGCTCGCTGACGCTGAGGCGCGGCT
GGGCGTCTCCTTGGTCGTCGCTGCCATGGATGGATGCGTGGGGCGTGCTC
GCGCTGGTTCTCTGTTCGGGAGTGAGGTGATGATGTGTCCCGCCATGGAC
GCATGGGTGACTGCAGCCTGCCGCGTCGTCCCATATCTGGCGCCGGCATG
CAAGGAAGGAGCTGGTGGGCATGCTCCACAGGCGTGGTGAGCCCGCTCTG
CGGCCGTAACCTGTACGTACGTGTTTCTTCCGGTCCAACACTTTTCTTAA
TCGGTGCGTGTTTATGGGCCGTTCTTTGTGGGATGTATGCCAGGTTTTAA
AATAGCACCGAGTAGGCAAATATTTCTAACGGAATTTCCTTGTGTAGATA
GTCCCACCTTGCTCTCTTAAGTACCGTTATAGCAATTTATATACGTCTGT
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CAACCTACTGGTGCATCATGCGAGTGTCTAAGCTGGCATCGTTTCAGACC
CAAGAGGAACAAAGAGGGGGAGATGTATTCGTACTACACCTCCATCCAAA
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ATTTCCCATCCAAAGGCATCTAGAGAGACTAAGTTAAAAAAAGACATCTA
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AGCATTAGTCACGCTTCTCCTCCTTCATCACGAAATAGATTGTCAGTCAC
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AAAGGCACCTACGAGGATGACGTCCAGCGGGGCGGCGGACGGCGCCGAGG
CCGCGGCCGGGCGACGCTGAGCGGGTGGCGGGGGGACAGAAGCGAGGGCG
ATGGCTACTAGAAGAGGGAGAGAGGGATGGCACGGCGCTGGGCCAAGCTT
GTTGGTGGAACGGAGAGGCTGGTGATGCAGCGGAGGGCGGGGAAAACGGC
GACGGAGAGCGCAACGAGGAGGCGCTGCGGTGGGGGAATCGGGTCTCAGG
AAGGGGGCGGTAGGTGGGGAAGACGAGGATGGAGGCGGGGTGAGAGCGAG
AGAGGGGAGAGATGCATGCAGCGTGTATGCGCGGTTTGCTGGTGGGGCCG
GGTGAGCGAGGTGGCCGTGTCGGCGGGTGGGGTTCCCGTGGCGTGAGTGG
GTGGGTGGGTTGCGGCCGGGAATACGTGTACAGGTCGGTCGGGTCAGGGT
GTGTGTGGCGGTCGGGTGTCTACTTGGGAGATACGTGCACGAGCACGACG
ACACAGAGCGGACTACCTCAGAAAAATACCGGTTCAACAACCGACTATGT
GGGTCAATTCTTCGGGCAACAACACGTGTGATGATATCAATGCATGCATC
ATATGAAAAAACAAGTTACAAAAATTCTAGCATCTTTTTAGGACACTAAA
CCTAACCCTAAAATTGAATTATCCTTGCAACTTAGGTCAATTTTAGACCA
AATCCACATCCCAACTCCTCCCCGACATACGCAAATATATTTTCCTTCTT
TGCGGATCTTTCTCATATGTGTCATCTAATTAGAACAATCAGTTGATTGA
AGAGCGGATGTCACCGAGCAAGTTAAAAAAGCTGTCTATGCTACGACGTG
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CCGCCGCAACGCGCGGGCATTTTGCTAGTAAAAGTAAAGGAGACAGAAAA
TAAACAGAAAAAGGACAGAAAGGAAAACAAAAACACAGCGAGAAAAAATC
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TTTAAGCGTCAAACAGGAGCACCCCTGAAGGAGCTCCCTAGATTGCTGCA
TTTGGCCTGGCCCATTACAAGGTAGCCACCTTGCTGTGTGCGTATGATCA
AGTGGGACTATTTAAAGTCGGGCTGTACTGGGCCTTCTTCTATCTATTCC
ATCGATTCCCCACCGGCCAAACGCCCCCGATACCTCCGCCGCTCCTTCGT
CGGCGACACCGGCGAGCGTACGGATTCCGTGGCATCCGCCCGCGCCCCTG
AAAGAAAATTTCCGCCATCTGCGGAGGCCACCTGTCATCACCATCCGGGT
TCCGGTGAGCTCCTTATTGCTGTCCCGCTAGACTATGTCCGTCTCGTTCT
GTTCTTATATGCGCTTGTTGGGGTTCCCGATCCATTAGTAATACACACAC
GATTGACCGATATTTTTGCGGTTTTACTTGTCCTGCTCCCGCGGTCAAGT
CTACTGTTCGTAGCTGCTTCGTAGATGGAGGTGGTTCTAGGACCACTCTC
GGACCTTATCCGGAGGTAAAGGCTGTCATAGATCACAGCGTGCTAGCAAG
CTGTTACCTGGTCGAATCTGTAGATCTATATTTGCTTGAATGGTTGAAGA
GAATCGACCACTCTAGGTCCAGGGTTTGTTGAAGCTAGGGCAATATGTTG
TGTAATGTGGGTTTATGACCTTGTAGACTGTAAGTAGTTTGCCATTCTTT
TTTAAGAAACTAGGGATAGATTTATAATTTTGAATTTGCGGGAACAATGA
TTAGCATTTTGACAAACGAACATGTATCCATATTCCGCTGATATCCTTAT
ATGTGCATTTAGATACACGGGGCTGTTATTTCAAATTACGATGTTACTTA
TAGATTTGTCACATAATCTAGGTTGACAGTGTGGTTCTTGTTTAGCTTGC
TTCCTTCGTAGTTTACAAAGACCATATTCTTTGGCTAATACCTAGCTAGG
GCCCTCTATTTATTTTGGGTGAACTCATTGTTTTAGCTTATAGGTGCTAC
CTTTGCTAACGTTTGTGTTGTTCATCCAGTGGTGGCTTAAATTGGTGAAA
CTGATACAAGGTTACTGGAAGCTTTAGAGTCTACTCTCACCATGGCTCAT
CAGAAGCGTGAAGCCAGCTCCACCGATGAAGATTGGGCATCAAAGCGCCC
GAAAAGTACTGCCACTTCTACTGAAAAGGATTACAATGTAGACACTGCCA
CTTCTCAGGAAACAAATGGTGAAAAGGGCGACACCTCTCAAAAGGAAAGC
AAGGTGCCTATGGACCTGTGTATGTTGGATGAGAAGTCCACAGCTCTCTC
GAAAGTTCCAATTCAGCAGGAGATGATATTAACTAGTGTTGAAGCCGATG
CTGCAGAAGACAAGGGCTGCAGACATGCAATGGAGGATGCCTGGGTGGTG
CTTCCTGATGCTAGCATGGAATCTCCAGGAAATCTGAGGTTGCCCCTCTT
TCTTTTCATATTAGGTACTGCAGGATGCCTGATGCTAGCATGTAGCTAAT
ATAAGTAGCCTGATGCAGATGTGCACATTTCGCAATATATGATGGGCATG
GTGGCCGCTTGGCTGCGGAGTATGCACGGAAACATTTACACCAGCAAGTT
ATCGCTGCAGGATTACCACGTGAGTTGGTCTGTCTACATTGTCGGCTTCT
GTTCATTGTTTTCATTAATTATTACTACATTCTGATGTATTTCTTTCTTC
AGTTGGCTCATACCAATGTTTTCTTATCATCACATATTTTTCCATTCCTT
AATCCTATATTCAGATGGTTTATCTGCATCTTCCATGGAATATTTCTTTA
GTGGTTTCTATCCTCATTTTCTTCTTCTGTTTCTATGCCTATTCAGCTAA
TGTCTCCTTAGAATATTGTTCTAGTATTTTATATGCAAAATCAGCACAAA
AAAGTGCTACCTCCATTTATGATTATGCACTTTGCATCTTCTCTTTTGCC
TGGCGATAGAGGAATTAACAGTTCTACTAGATCACTTGACCATTTACTGC
TTCTTGTTATTGACTTCCTCGCTAAGAGTGCTACTTTAAACATTAGGTTT
TATGAAATTTGGTTTTTACCTTCCGTTTCTGGTTTAATTCAATTGGGTGA
CCATTTCATGACTAGATTCATAAGATTAGCTTTCATGATTCATACATTTC
AAAGTGTTTATTCTTCTGTTGGCCATTTAGCTAATATTGATATATTGGTT
TGCAGATGAATGTTAAAGTGGCAAAGAAGGCCATTATTGAAGGTATTGAA
TACATGAAATTCTTTGCTTGTCTAGACCCTAGACTATAACCAGGCTAATA
GTAATTAGAAGAGCCCCTTCTACTATTTTCATCATTGTACTTTACAGTTA
TATATTATGAATACAATAAAAAAAATCATTGTTGCCTTACCCTAGCTTGA
TTTTATTTTTTTATTAAACTTATACTCTTCCATTGACAAGTCCTTTATCG
GCCTGAAAGGCAGCCTTGACCCTGAACCCTTGAGTATGTTACATGCTTCT
ATCATCAGGAGCTGATGGTAGAATTGTTAAATTATTTTCTGATTCTCTAC
CTCTGTCATTCTAAAATCTATAATGAATGTATCGTTTCTGGAAATGTCTG
GAGCTGCCATCATGTGGGGTTTTCATCTTTTAGTGAAAATGATTTTAATT
CGAAATATTCCATTTGTATACTTGTTTGCTTGTCCACTGGCATTTTGACA
CTGTTGCATATTCTTTTCTTGTGTGCCTCTTATGGTGCCTTTTACTTGTC
ATCTTCTTAGTGGTCTTCTGTTGGAACGTTGTCAGGTTATACCGCTGATT
TAAGTTTTTCCTAATGTTACCGTCTGCAGGTTTTCATAGAACTGATGAGT
CATTGCTACAGGAAAGTACTAAAGGTAAGCAAATATGGTATCAACTTTCT
TCATCTGCTTTTTGAAATGACCAGTCAGACCTATGACCATGTTTGGGAAG
TTGTTAAGCAAGCTGGTGTAATATCTGATATATTAGGTATCAGTTAGACT
AACTTTTAAAATGTTGCAAATTGTATCCTGTGTTATGTATTTATCTTTGG
TCATAAGCCGCCCCTCTTAGTGGTAAAAAAAGTTGAAGCTGGTACATTCT
AGTGTATTCTTAGCTGGTGGCAAGGTTCAAAAAGGCTCTAGTGGGAGTTA
CCTTGGCGCCGGCAAGGATGCCTAGGTGCTTTACTGTGGCCTAGCCCGGT
GCTTCGACCCTACGTGGTAGTCTAGGAGACCAACAATATTCTCAGGCTAG
GAATCAACCTCTCTGGTGAGGTGCTTTGGGGGAGAGAGGTGTCAGCACTG
TCAGGGAGGAGAGGAAAGGCGCGGCGCTGCGAGGAAGTAGAGTCAGTGAC
AGGGTTGTTTGGTTAGGCTTATTTCCGGCTTTTAGACTTTGGCTTACAAT
CCAAAAAAGCACCTTAAGCCAAAGTCAAAAGCCAAAATTAAGCCTAACCA
CACACGCCCTGAATACAAGCAGCTAGTCTAGGCAAGGGAGAGATACTGTA
AACTTTTATAGCATTCCACTGCTGCTCCAGTTGGATGGGCCAGCTCAACG
AGCTCCGCAGCCAATCTCCACTCTTATCTTTTTTCTTTTTACCTATACCT
CTTTCTTCTCCCTTGGCGTTGGTGGTTTTCTATACGATGCCACCTCCGCA
ACTACACGTCTGCCCTAGCAGCTAACGCTTCTCTGAACCTTGGTTGGTGC
AACAACACAATGACATAGGGTGGAGCCTTACTTATAGTGACAAGGACCAA
CCTCTTAGCTACGATGGATTGATGATGGTAAAAGGACAGCAGTAGACATT
TTGTTGTACCAAGTACTCAAAACCTATAAATATGGTAGTGTTGGAGAAGT
TGTAAGTTACTTTTTCACTGGCTGCTTATTTCATGATAGTACTCACATGT
ATTATGTATAGGAAACTGGCAAGATGGCGCAACAGCTGTATGTGTTTGGG
TCTTGGGACAAACGGTCAGTTTATAGTACCTGGGCTTCTCTTCTTCATAT
TTTTCATACCCTGGAATTCTTTTTGGTTATCGGATTAAAAATCCTTATGG
AATCAAGATATATGAGTTCATTTGTTTCTTTAGTAAATACATAGGGCTTA
TTTTCCATTCCCTGAATTAATGACACGATTCTTCATTTTTTATGATGGAA
CTCATTTTATACCCACATCCCTACATTTAAGTCAGCAACTCAGAGTAGTA
TGGTATGGTATAATTTACTGTGGTTAATATACAAACATAATAATCCAATT
TTTTTGTTTCTATTCTCATGCATAAGTAACTCATTACGTGGTGTTATCTT
TTTGGTACCGAATACTAATGCTTTTATTTGAGATGAATACCTCGTGCATT
TCACACATTCTACATGCCAAATCAAATCCTAGTTTATATGCAAATCAAAT
TAGTCAATCTATTTTGCATAAGCCGTTCTTTATTGACACGTTCCAGGTTG
TGGTTGCGAATGCTGGGGATGCTAAAGCAGTATTAGCTCGTTCTACTTCA
ACTGATGGCGAAGGTGCAGTGTCTGACACGAAAAGTGTACCGAAGGCTAT
TGTTTTGACAAGAGAACATAAAGCCATCTTTCCACAAGAGCGCTCGAGAA
TCCAGAAGGTTAATAGCTTTATATAGCTCCAACATTTAGTTCAGTTATCC
CTCCAAACTTAAGTTTTGCTTAGTTACATGCCAAATGAATAAACTCCCTG
GTTATTCTATGGTTGTAACTTTTTCTTCGCATCGGTATCCGTCAAATAAA
ATTTGATTATGATAATGAGTAAATAAAAGAAAATCTGATTTTGGTAATTG
TATAAAATTTATGCCTGATTTATTCCAGTTTGTTTAAAGGACTTTCTTGA
GCCTTAGAATATTACCTTTTCCATTGTGCGTCCAAACTATGCCTACTTCT
TACCCTAATTGCTGCCAGTTGTTAGCGATGAAAATTAGCTGACTTGTGAT
GAAGTCACTGTTCAAAAAATCGTCCGAATCAGCGATTAATAGGCCGATTA
ATCGCTACTAGGGACCTAACCGTGTCGATTACCACTAATCGGTCGTGTTA
ATCCCTTAACCCGACTAATAGCTCTGATAGACCGATTACTAGGTGTATTC
CCGATTAACTACCAAACATGGTCAAAAAAGTTGCAAAATGTTCAACGCAT
ATTGCTCATCCAGCCGCTAGCCCGCCCCAATCGTACATGTTTTAATGGGC
TTTTTAGCTCAACATAAGTAGGGTCCAGCATATAGAGGCCCATATACTAT
TTCTTTCTTATATACACGTGTTTTAGGTGCTAATTTGCGTAGATTGCACC
GATTAATAGTCGACCGATTAAATCAGTTAATCGTCCGAATTCTGATTAGT
CGCTACTCCTAAGCCGGCCGAGCAGTTAACGATTACCGATTTCCTTACCC
GTACAAAATTGTTGTCCTTCTGTCTATTCAATTTTTATGTTGTCTCATTT
GCTCCTTTCATTATCGGTGCGCTGTTTGAATGCAGTATTAGATGAGCATC
TCACCGCTGCACATATTAAACTTCTTTTTTTTTATGTCTTGGCTCACAAT
TCATTTAACCTTGTGCTACAAAGGCTGGAGGTTCTGTTGGTCCTAATGGG
AGACTACAAGGACGCATTGAAGTATCTAGGGCTCTTGGAGATCGCCACTT
TAAGAAGGTTTAACTGGTGCAATTTTGTTTGCTGATAAGATTAACCTGTT
GTTCTGTTTGTGTATATCGAAAATATGTACGGTTCAAGTATCACTAGTGT
TATGATGAATGGTTGAGATGTTCTCTACAAAACGGTTCCCTCCCGATTCC
TGTCTCCCTCATTTTTGTTAAAATGGTACTCCCTCTGTTCACTAATATAA
GACATTTTGTTAAACTAATTTAGCTTGCCAAAACATCTTATATTAGTGAA
CAGAGGGAGTAGGAATTAGACCCGCCTCAACTTCCATGCCCTATTCCTCC
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TTTCCACCAACCGAACTCTTTGTAATTCCGTGGGATCTATTAGGAGCTCA
GGGTAACTGATAATGACCATAGGGATGTATCTTCTTGCTTAGAGATAATG
ATTAATTTATGCTTATGGTTATGCACGTTTCGTGCTACTTCTGGATATAG
TCGTTCATGAAAACACAGCTCTTTTTTTGTATAGACTGCACATCAATTAT
ATGTACTTTAACATTTCTAGTTTATCTCACCTACTCAGTTCTTACATTGT
GTTGCTTACATCCAAAACTGCTGAAATCTCAAGGTTGCATTAGCGTGAGG
TATCTGTAGTGGTGCGTGGTAGATAAGGCCCTAAGGGCCATACGAGGTGA
CCCTGGACCACAAGAAGCACGGCTATGGCAGCCGCACCTCAAGGGCAGGG
AAGAAGGGGACTAGGACTTAGATTTATTTCTCTTCTTGCTTGATTATGAA
TAATAACTAGTCCGGGGCATTATATATCCTGCCGAATTACAATCTGACTT
GAAGGACAAGTAGAACTCTTAACCGTCTCCTAACAAATCTCTGACCTAAA
TAACTAAATGAACAGATAAAACAATTTATCTCAGGGGGTTAAGTGCTTTT
ACTCTACGTACATCACACCCCACCCGGACATGCAACTTGTCCTCAAGTTG
CTAGGCGGGGGCCATGGTTGTCGACCAAGGAAGCCCCAAGATGATGCCCG
GACATGGTGGCAGCTCTCCTGGTAGACTGGAGCATCCCAAATTCAGAAGG
CCTGAATTGTGGACCCGCCCAACTGCTAGTTGATGAAGCGGGTTGAGGCT
GCGCTGATGCAGCCCCAGGTTGCAACAATTTTGGCTTGCAACCAGGGAAT
GACACGGCTGGTCTTGGTGGTGATGCCAGCAGTGATGCCAGGGGTGCCGC
TGTTGTTGGTGAAGTTGCCGCTGCATCAGCAGCAAGCGCCATTGCTTCTA
CAGTGGCCTCGTCCTTTCTGTAGTGAGACTCCTCTCCTGGAGTTTTGTTT
TGAGATTGGCTGCAAAGTTGGTCGTGATATTGGACAGTATGTTGCCACGA
GCAACTGTTATGGTCTCCAACAATGAAGTCCTCAAAGTGATCCTGAACTC
CTTGATATGGACTAGGCATTGCTCAGAGGACACCAACACCTTGTCATTGT
AGGCCTGCAAGTTGGCATTGCAAGACTTCAACTCATCAGTAAGAGAGATT
CTTGTGGCTGGCGAGGACGGAGCCAAGGCAGAACTCGGTGGTGGCGCCCA
TGGGGGATGGCGACGGCGAGTCCTGCAGCGTCACCGATGACCTAGGATCG
GAACCACCGCTGCGAGCCATTAGAGGCGGATCAGCAGATTGAATCTGATA
CCAGATGTAGTGGTGCGTGGTAGATAGGCCCTAAGGGCTATACGAGGTGA
CCCTGGACCACAAGAGGCGCGGCTATGGCAGCTGCACCTCAAGGGCAGGG
AAGAAGGGGACTAGGACTTAGATTTATTTCTCTTCTTGCTTGATTATGAA
TAACTAGTCCAGGGCATTATATATCCTGCCAAATTATAATCTGACTTGAA
GGATAAGTAGAACTCTTAACCGACTCCTAACAAATTCTTTGATCCTAACA
AATCTCTGATCTAAATAACTAATGAACAGATAAAACAATTTATCTCAGGG
GGTTAAGTGCTTGTACTCTACGTACATAACAGTATCCCATCGCAGAGATG
ATTTTACCACTGCTTTCAAATGTTCTATCCAATTTTTAGAAAGACATAGA
CTATCTTGTTTTGCAGATGTAGCTGTGTCAAGCCAAATTAAACAATAAAT
CTAATTTATCGCAAAAAAAATAGAGAAAAAAGTGTGTTTCACTTCATGTG
TAATACATGCTCCTCCAGCAGGCTTATTTAAAGCCAGTGTTCAGTATATA
CTGATGCTATCCATAAAAACAATACCTTCATGGAGCATCCACATTTATCA
ATCAACTACCGTGCAGGTCGGGTTAATTGCAACACCAGATGTACATTCTT
TTGAACTTACAAAGAAGGATCATTTCATCATTCTTGGCTGTGATGGCTTA
TGGGGAGTATGTTCATTTACCTTTCTTTGTTATGTCAGTGTTTGCCTCAT
TTGATTCCTTCAATCATATATATGTTAAGTTTAACTTGTTATGTATACCC
AGGTATTTGGACCAAGTGATGCTGTTGAATTCGTCCAGAAGCAACTGAAG
GTACAATCTTCTCTTAAGAAATTTGTATCTCTAGATACATTTGTTTCTTC
TACCCACTATGTGCTAGTATTAGTTATCTCTTCTGAGGTAAAACTGATTA
GGCTTTGATCAGATGATGCTGAAACAAAACTATTTTCTGTAGTGAAACCG
TTTCTCACATGGGTTAGATTTTCCCACGTGTACATGGTAGAACTCCGGTT
TCTTAAGTAGTAGCCATAACCTGGGGGGAGCACTTGCCCGAAGGCAGGCA
AGCAGGAGCCCGCACAGTCTTGATAACTAGGATTTGGGAGTGATAATAAC
TAGGGAAAAATGCTTTATTGTTTTGCTTGTCTTTCATGAGTACTGACTAG
TCTCTATATATGACAACCATGACTAACTGAATCCTTATTTAATTCGAACT
CGGTGGCATATCCTTTCCCACCTTGAGTCTTTGCTAAATAGAAACCTGGG
CAACTAGTAAAAGATGCATCTCCTCTCGTAATCTGCTGTCTGCATTGTGG
CTGGCCTGGCTTTCTAATGTTGGGAGTTTCCCACATAGCAGTATTATGTA
CTATCTCCGTTTCAGAATACAAGACGTTTTAGGTAAGCCTAATTTGCCTT
TCTAAAACGATATTATGAAGCAGTGGTAGTATTTGATTCTGATACTTAAC
CCTCCCAAGTGAATATATTTTTCATACCTTGAGCAAAGTAAATTTCATTT
TACCCTAGCATCTCACTGTACCTTGCTGTACCACTCAGGAGACGTCTTCA
GCCACGCTCGCAGTGCGGCGCCTGGTGAAGGAGGCTGTTCGCGAGAGGCG
ATGCAAGGACAACTGCACTGCTGTTCTGATAGTCTTCAAGCACTAGAAAT
TTCTTTGCTGTTGTAACCTTTTTTCACTGAACCGAACTGAGGAAGAGAAA
TCGGCGGACAGAGATCACTCTCTAATTCAAGCCTACATGATTCTTGTGTG
TTGGGTCTGACCTCCGAGCAGGTCTATTGATGAGTCGTGAGGGCAGTGTT
GGTACAACTATCTGACTGTATTTCATTTGGATTTTCGTTTTCATTCGGAC
CATGATTTCGTGGCAAAGAAAAATTGCGTAACTGGTCTCATCTTTTTACA
CTGTTCGTGTATAATGTATGCAGCTATTTCCAAGATCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.