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GrainGenes Sequence Report: AE034013

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Sequence
AE034013
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE034013
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCCGCGAAGAAATAAATTGGGAAGAGGAAATTGAATTTGATCCAGGCAA
AAGAAGATGTATAGATGAGTACCCTCCTAATTTGAAAGAAATGGTAAGAA
GAAAGTATTGGGCTAATGGGCCTTGTCAACCTTGTACTTGTGATTTTCTA
GCGATAGAGATGAGTGGTAAAGATAGAAGGTTTGTTTCTGAATGGTTTGA
TGAGTTTGGGAGTTGACTCGAGTACATCGAGTCTAAAGATAAAGCCTATT
GTCTCTGTTGTTTCTTATTTAGACCGCGAAAGAAGAAATAAGCTAGATAT
GATGCATTTGTTAAAGATGGTTGGTCAAGTTGGAACAAAAAATACAGATT
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ATTGTGAAGCTTTGCTGAAACAAGAAAAACACATTTATGTTGCTTTAAAT
AACCAAAGTAATGCTATGAAAAATGCTTATTATACTAGACTAAATTCCTC
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TGCTCCAGGTAATAATCAGTTGACTTCTCCAAAGATTCAAAAGGCCATAG
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AGATTGGGATTTGTCCATCCATATGACGGATAGATATGCTCTGGGTCCTC
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GGATGACATATCACGGAACGAGTAAAGAGTACTTATCAGTAACGAGGTAG
AACTAGGTATGGAGATGCTGACGATCAAACCTCGGATAAGTATAGTATCG
TGTGACAAAGGGAATTGCTTTCGTATGTAAATGGTTCAATCGATCACGAA
GTCATCGTTGAGTATGTGGGAGCCATTATGGATCTCCAGGTCCCGCTGAT
GGTTATTGATAGGAGATGTGTCTCTATCATGTCTACATATTCACGAACCG
TGGGGAGACACACTTAAGGTTCGAAGTTGTTTTAAGTAGATATGGAATGT
GCGTTGGAGATCGAATATTGTTCGGAGTCTCGGATTGGATTCGGGACATC
ACGAGGAGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATATAGGGGATC
ATTTTCTAAGTTAGGAAATGTTTCGGAGTGTTTGTATGAGGATTCTAGAA
GGTTTCAGAATGTTCCGGAAGGTTCTAGAAGATATCTTGGAGTTTGCTTT
AAAATCAAGATAGGGATCAAGGAGTCCTGGTGGGTCAAGATACGGAGTCG
TGGGGGAGGAGGACTCCTCCCCCCACCTCCAATCCGCCGGCCTACAAGGG
AGGGGAGTCCTACAAGGACTCCCCCTCCCTAGGCGCCTCCCTTCTTTAAA
TAGAGGGGCAGGGGCGCCCCCTCCTCCCCTGCTCTCATAACACCCAATCT
CTGCCGCCTCTCTCCTCCACTATCTTCTGCACAGGCATAGGTGAAGCCCT
GCAGAATTCTCTACTCCACCACCACCACGCCGTCGTGCTGCTGGGATTCC
GTGGAGAAGATCTACTACCTCCGCTGCTCGCTGGAACGGGGAGAGGAAGG
TCTACTTCGACTCCGCACGTGTGACCGACTGCGGAAGCGCTGCCGAATCG
CGGCGCTGGAAGGATTGTCCACTTGACCGACTGCGGAAGCGCTGCTGGAA
CGCGACGCCGGAAGGATCGTCCACACGATCTTGAGATCGGCAAGTGATCG
ACTACATCAACCACGAGATCTAATCTCGTTAACACTTTTGGATCTATGAG
GGTTAGTTCCTATCTATCTCGTTGCTCATGTCTAGTAGATTAGATCTTGG
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TTTGTTTTCCATGCTACGAACCCATCAGTGGTATCAGAGCCGTATCTATG
CGTAGATCTGTTGCACGAGTAGAACACAATGTTTTGTGGGCGTTGATGCT
TTTGTTGTCGGTGTCTTAGCGTGTATTTTGCATCTTGCGGCATGGTGGGA
TGAAGCGGCTCGGGCTAACATTACATGTCATCGCACATGAGACTTGCTCC
ACGCTTGACGTGCAACTTTCTTTGCACAAGTGGCTTTGCGGGTTTCTGTC
TCTCCCACCATAGTTAAGATTCAATTTACAATGAGCATCTTGATAACACT
TGTATCAACGTTGTGGTTCTTGTTCGTAGGTAAGATCGGTCTTATGCGAA
AGCCCCAAACCACGTAAAACTTGCAAAAAAATTTAGAGGCGTCTAACTTG
TTTTTGCAGGGGTTTTGTGATGTGATATGGCCAACATGTGATTGTGATTG
TATTTGATGTATGCAATGATCCTTGTTGTAATATGGCAACCGGCAGGAGC
CTAATGGTTGTCTTTAATTCTGTTAAGACCTGCGTGTCTATTCATCTTGT
AATAGCTTTATTCCAAGTAGTTGTAATAGTTGCTGGTGATGATGGACAAC
CATGAAGCGGTGCCACTGACCTTGACGCAATGCTGGTGATAATGGAGATC
ATGTTCGTGCTTTGGAGATGGAGATCAAAGGCGCAAGAAGAAAAGGCCAT
ATCATATCACACTAATTATGAATTGCCTGTGATGTTAATCCTTTATGAAT
CTTGTATTGCTTAGATCGCGACGGTAGCATTATAAGATGATCCCTCTCAC
TAAATATCAAGTAATAAAGTGTTCATCCTTAGTTGGCACCGTTGCTAAGA
CTCGTCGTTTCGAAGCATCTCGTGATGATCGGATGTGATAGATTCTATGT
GTGCATACAACGGGTGCAAGCCAGATTTGCACATGCGGAAACTAAGGTTG
TCTTGACGAGCCTAGCATGTACAGACATGGTCTCGGAACACGGAATACCG
AAAGGTAGAGCATGAGTTATATAAATGATATGATGAACATGAAGATTGTT
CGCCGATGAAACTACATCTTCTCTTGTGAAGATCGGACTTGGTGTAGTGG
ACTTGGTTCGTGTAATCACTAAGACAATGTGAGGGATGTTGTTTTGAGTG
GGAGTTCACCTAGTTAGTTTAATAATTAAATTTGAACTCAATTTGTCATA
AACTTAGTCTAAACTACTTGCAAATTGTTGTAGATTATGGCGACCCCCTC
CATCAATTTCAATGCGTTCCTAGAGAAAGAAAAGCTTAAGAACAATGGAA
GCAATTTCACGGACTGGTTCCGTGGACTGAAGATCGTCCTCAGGGCTGGT
CAGTTCACCTATGTGCTCGATGCACCGCTAGGTGACCCACCTGCAGATAA
TGCCACCGATGACGAAAAGAATGTTTTCGCCACTCGGAAAAATCATTACT
CCACAGTTCAGTGTGCCATCCTGTACGGTTTAGAAGCGGAGCTCCAACAG
CGTTTTGAGCACCACAACCCGTTCGAGATCATTAAGGAGCTCAGGCTAAT
TTTTGAGACTCGCGCGGCCATGGAGAGCTATGAGGCCTTCGAAAAGTTCT
TTAATTGTAAGATGGAAGAAGGAAGCTCCGTTAGCGAGCACGTGCTCACC
ATGTCTGGGTACGCTAAGAAGCTCCAAGAGTTGGGAATATCGATTCCTAA
TGAATTGGGGATTCACCGTCTCCTTCAATCACTGCCACCAAGTTACAAGA
ACTTTGTGATGAACTACAACATGCACTGCATGAACAAGACGTTGCCTGAA
CTGTCGTCCATGCTGAAAACTGCTGAAGTGGAGATCAAGAAGGAGCAACA
AGTGTTGATGGTCAATAAGACCACCAATTTCAAGAAACGGGGCAAGCCTA
AGAACAAGGGCAACTTCAAGAAGGACGGCAAGAAAGCTGCCGCACCTGCT
AAGAAGCCCAAGGCTGGTCCTAAGTCTGAAACTGAGTGCTTCTACTGCAA
GGGTGCTGGTCACTGGAAGCGTAACTGCCCCAAGTACCTGGCAGATCTGA
AGAACGGCAACATCAAGAAGAAAGGTATATTTGATACATGTGTTATAGAT
GTGTATCTTACTAGTAATCGTAGTAGTGCCTAGGTATTTGATACTGGTTC
GGTTGCTCATATTTGTAACTCGAAATAGGAGCTGCGGAATAAACGAAGAC
TGGCAAGAGACAAGGTGACGATGTGCGTTGGAAATGGCTCCAAGGTTGAT
GTGATCGCCGTCGGCACGCTCCCTCTACATCTACCTCCGGGATTAGTTTT
AAATTTAAATAATTGTTATTTGGTGCCTGCGTTAAGCATGAACATTATAT
CTGGATCCTGTTTATTGCGAGACGGTTACTCTTTTAAGTCAGAGAATAAA
GGTTGTTCGATTTATATGAGTAATATCTTTTATGGTAATGCACCTGAGAT
GAATGGTTTATTCTTACTGAATCTCGATAGTAGTAATACACATGTTCACA
ACATAGATGCTAAACGAATAAAATTGAATGATAATTCTACATACATGTGG
CACTGTCGTCTTGGTCACATTGGAGTGAAGCGTATGAAGAAACTCCACTC
TGATGGACTTCTTGAATCACTTGATTTTGAATCACTTGAAAGATGCGAAG
CATGTCTAATGGGAAAAATGACTAAGACTCCTTTCTCTGGTACAATGGAG
CGAGCTATAGACTTATTGGAAATAATACATACCGATGTGTGCGGTCCAAT
GAGTGTAGCATCGCGTGGTGGATATCGTTATGTTCTCACTTTCACGGATG
ACTTGAGTAGATATGGGTATGTCTACTTTATGAAACATAAGTCCGAAACT
TTCGAGAAGTTTAAGGAATTTCAGAGTGAAGTGGAAAATCATCGTAACAA
GAAGATTAAGTTTCTGCGTTCTGACCGTGGAGGTGAATATCTGAGTTATG
AGTTTGGCATACATTTAAAGAAATGTGGAATACTTTCGCAGTTGACACCG
CCGGGAACACCACAGCGTAATGGTGTGTCCGAACGTCGTAATCGAACTCT
CTTAGATATGGTTCGGTCTATGATGTCTCTTATAGATTTACCGTTATCAT
TTTGGGGCTATGCATTAGAGACAGCCGCATTCACTTTAAATAGGGCACCA
TCTAAATCCTTTGAAACAACACCGTATGAATTGTGGTTTGGTAAGAAACC
TAAGTTGTCGTTCCTTAAAGTTTGGGGTTGCGAGGCATATGTAAAGAAGT
TACAACCTGATAAGCTAGAACCCAAAGTGGAGAAACGCGTCTTCATAGGA
TACCCTAAAGAAACAATTGGGTATACCTTCTATCATAGATCCGAAGGCAA
AGTTTTCATTGCAAAGAATGGATCCTTTCTTGAGAAGGAGTTTCTCTCGA
AAGAGGTGACTGGAAGGAAAGTAGAACTCGATGAGGTTACTGAACCTTCT
CTCGGATTTGAGAGTAGCGTAGCACCGGAAGATGTTTTTGTGCCGCCTGC
ACCAATTGGAGAGGAAGCTAATGATATGATCATGAAACTTCAAATGAAGT
TACTGCTGAACCTCGCAGGTCAACGAGGGTTCGTACCACTCCTGATTGGT
ATGACTCTGCCTTGAACGTCATGTTGGTAGACAACGTTGATGACCCTGCG
ACGTATGAAGAAGCTATGGTGAGCCCAGATTCCGACAAATGGCTAGAAGC
CATGAAATCCGAAATGGGGTCCATGTATGAAAACCAAGTGTGGACTTTGG
TGGACTTACCGGATGGCCGTAAGGCTGTCGAGAACAAATGGATTTTCAAG
AGAAAAACAGATGCTGATAGTAATGTTACCGTCTATAAAGCTCGACTTGT
CGCGAAAGGGTTCCGACAAATTCAAGGAGTTAACTATGATGAGACTTTCT
CACCAGTAGCAAAGCTAAAGTCTGTGAGGATTTTGTTAGCAATTGCTGCA
AGTTTTGATTATGAGATTTGGCAGATGGATGTCAAAATGGCGTTCCTTAA
TGGTGACATTGAGGAAGAATTGTATATGGTACAACCCAAGGGTTTTGTCG
ATCCTAAAGATGCTGACAAGGTATGCAAACTTCAGCGCTCCATTTATGGA
CTGAAGCAAGCATCCCATAGTTGGAATCAACGTTTTGATAAAGTAATCAA
AAACTTTGGATTTATACAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAG
TGAGTGGGAGCTCTGTAGAATTCCTAGTACTATATGTAGATGACATATTG
TTGATTGGGAATGATATAGAACTTCTTAATAGCGTCAAAACCTATTTGAA
TAATAGTTTTTCAATGAAGGATCTTGGGGAAGCGGCATATATTCTAGGCA
TCAAGATTTATAGAGATAGATCAAGACGCCTAATAGCGCTTTCACAAAGT
ACATACTTAGACAAAGTTCTAAAGAAGTTTAGAATGGAAGATAGCAAGAA
AGGGTTCGTGCCCATGTTGTCAGGTAAGACCTTGAGTAAAACTCAAAGTC
CAGCTACGGCAGAAGATAGAGAGAAAATGAATAATATTCCCTATGCCTCA
ACCATAGGTTCTATCATGTATGCCATGCTGTGTACAAGACCGGATATTGC
ACATGCTGTTAGTTTGACTAGCAGATATCAAAGTGATCCTAGAATGGAGC
ACTGGACAGCGGTCAAGAATATCCAAAAGTACCTAAATAGGACTAAGGAT
ATGGTTCTTTCTTATGGAGGTGATGAACAGCTTGTTGTAAACGATTACAC
CGATGCTAGTTGGAACACCGATCCGGATGACTCGAAGTCACAGTCGGGAT
ACGTATTTATTTTTAATGGTGCTGCAGTGAGCTGGAGGAGTGCGAAGCAA
AGCGTTGTGGCGAAATCTTCAACTGAATCGGAATACATAGCTTCTTCGGA
GGCTGCACAAGAAGCCGTTTGGATGAAGGAATTCATTATTGAACTTGGCG
TGGTTCCCAGTGCGTTGGACCCGATGGCCATCTACTGTGACAACACAGGT
GCCATAGCAAATGCACAGGAGCCAAGGTCACATAGCAAGCTGAAGCACAT
CAAGCTACGTTTCCACGCTATTCGCGAGTATGTCCGAGATGGTGACATAA
AGATTTGCAAAGTACACACTGATCTGAATGTGGCAGATCCATTGACTAAA
CCTCTCCCTAGGGAAAAGTATGACCAACACTAGAACGCCATGGGTGTTTG
GTATATTACCATGTAATCTAGATTATTGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACT
GTTGGAGATATGCCCAAGAGGCAATAATAAAAGTGATTATTATTATATCT
TTGTGTTTATGTTGAATGTTTACATCCCATGCTATAATTGTATTATTAGG
AAACACTGATACATGTGTGTTTTGTAAACATGTAAGAGTCCCTAGTAAGC
CTCTTGTTGAACTAGCTTGTTGATTGATTGATGATCATGGTTTCCTGATC
ATGGACATAAGGATGTGATTAATAACAAGGTTATATCATTAGGAGAATGA
TGTGATGGACATACACCCATAGTAAGCGTAGCATAAGATCAAGTCATTAA
GTTCGTATTGCTGTAAGCTTTTAAATGCATAGTAACCTAATCCTTCGACC
ATGAGGTTGTGTTAATCACCATCACCGGACGAGTACTTTGATGATATCAA
ACACCGCTTCGTAACTGGGTGGTCATAAAGGTGTCATTGGGTATTCTGAA
AGTATGTGTTGAAGCGCATGGACCAAGATTGGGATTTGTCCATCCATATG
ACGGATAGATATGCTCTGGGCCCTCTCGGTGGAATGTCATCTAGTTAGCT
TGCAAGCATGTGACTGGATCACAAGGGATGACATATCACGGAACGAGTAA
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CAAACCTCGGATAAGTATAGTATCGTGTGACAAAGGGAATTGCTTTCGTA
TGTAAATGGTTCAATCGATCACGAAGTCATCGTTGAGTATGTGGGAGCCA
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ATCATGTCTACATATTCACGAACCGTGGGGAGACACACTTAAGGTTCGAA
GTTGTTTTAAGTAGATATGGAATGTGCGTTGGAGATCGAATATTGTTCGG
AGTCTCGGATTGGATTCGGGACATCACGAGGAGATCCGGAATGGTCCGGA
GAATAAGATTCATATATAGGGGATCATTTTCTAAGTTAGGAAATGTTCCG
GAGTGTTTGTATGAGGATTCTAGAAGGTTTCGGAATGTTCCGGAAGGTTC
TAGAAGATATCTTGGAGTTTGCTTGAAAATCAAGATAGGGATCAAGGAGT
CCTGGTGGGTCAAGATACGGAGTCGTGGGGGAGGAGGACTCCTCCCCCCA
CCTCCAATCCGCCGGCCTACAAGGGAGGGGAGTCCTACAAGGACTCCCCC
TCCATAGGCGCCTCCCTTCTTTAAATAGAGGGGCAGGGGCGCCCCCTCCT
CCTCTGCTCTCATAACACCCAATCTCCGCCGCCTCTCTCCTCCACTATCT
TCTGCATAGGCATAGGCGAAGCCCTGCAGAATTCTCTACTCCACCACCAC
CACCATGCCGTCGTGCTGCTGGGATTCCGTGGAGAAGATCTACTACCTCC
GCTGCTTGCTGGAACGGGGAGAGGAAGGTCTGCTTCGACTCCGCACATGT
GATCGACCGCGGAAGCGCAGCCGAATCGTGGCGCCGGAAGGATCGTCCAC
TTGACCGACTGCGGAAGCGCTGCTGGAACGCGACGCCGGAAGGATCGTCC
ACACGATCTTGAGATCGGCAAGTGATCGACTACATCAACCACTAGATCTA
ATCTCGTTAACACTTTCGGATCTACGAGGGTTAGTTCCTATCTATCTCGT
TGCTCATGTCTAGTAGATTAGATCTTGGATTTTATCTAGATTAGATCTAG
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CATCAGATATTGCATTCCGTTCTTGAAGAAATTGGACATGATGTATTTTG
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TGGTCTTACGGTATGTTGGTAAATGTGGAAATGTCAAAGAGAGATTCGTT
GGCCTTGTTCATGTGAAGGAGACAACTTCTAAGTACCTTAAGTCTGCCAT
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AAGGATACGATGGTGCGAGCAATATGCGAGGTGAGTTTAATGGCCTGCAT
TCTATGGTCATGAGAGAAAATAACACAACATATTATGTTAATTGTTTTGC
GCATCAGCTTCAGCTATTTGTTGTGGCTGTTGTATGGAAGCACACATGGA
TTGGTCAATTTTTTGATATGGTCCATGTTTTGTTGAATGTGGTTTGTGGC
TCCGCTAAGAGAAAGGACATAATTCATGAAAAATATAAAGAACAAGTAAC
TGAAGCTTTAGGTTTTGGGTTACTAAAAAGTGGGTTTGGATTAAATCAAG
AGCTAGCACTTCAAAGGCTTGGAGACCCTCGATGGAGTTCACACTATAAG
ACTCTTAAGAGTTTGATTGATTTGTTCCCTACGGTTGTCAAAGTGCTAGA
ATATGTGGAAGAAGAAGATAGGGATGACACAAACAGAAGGCAAGCATGTG
GTCTTCTTGTTTATTTCCAGTCATTTGATTTTGTCTTCTAATTACAGCTT
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AAAGGATCAGGATATTGTAAATGCCATCGGTTGTGTGACTTACACCAAAA
ACACCTTGACTGATCTAAGGATGAACGGATGGGAATCTATCCTAGGTGAA
GCATATTCCTTTTGTGACAAGCATTCCCTCTACAAGTTAGAATGGAAGAC
AAATATGTGAATCCTAAGAAGCCACGACAAAAAATAGGTATTACCAACAA
ACATCATTATTAAGTCGATTGTTTCAATGATGTTATTGATTTGTTGATTC
AAGAACTTGATGCCCGTTTCAATGAGAAGAATTTTGAGCTCATTATCTGC
TCAACCTCTTTGAGCCCAAAGTAATCGTTTCGTGACTTTAATTTTGATAA
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CATGACCGATTCTCTGGTATAAATAATATATGTGAGCTCTCTCAAAAAAT
GCTAGATACAAGGAAACATATTTGCTATCCTTGGGTATACCGACTATTGA
AGCTTGCATTAGTCCTGCCAGTCGCCACAACTACAATTGAGAGAAGTTTT
TCAGAATTGTCAAAACATATTTACACAATCGTCTCAGTGACGATGCATTG
AAATACAACCTCCTTTGTTATGTGGAGAAGGGAGAAATGAAGAAGGTTAC
CAATGAAGCTGTAATTAATCGCTTTGAGGCCACTAAAGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.