Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE030989

[Submit comment/correction]

Sequence	AE030989
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE030989
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCAAAGCCCACGCCGCTGCTCCCTCCTTCCAAAACAGGAAACAAGCAAGC TAAACGGCGGCGAGAGCACGGGCGAACGGCGACGAGAGAGCTGGAGCTCG ACGGTTACCAATTCCCACCCCGCCGCCCCGTCCCTCCTCTCCGCATTCAC ACTCCGCGTCCTCCCCGATCGAATCCGACGGCCTTCCCGGCTTCTCGCCT CCTCACTCCTCCCCAGCCAAAACCGTGGGCGTTCTCGTTCCCTCGCCCCC TTCCAATCCGTAACCCAGCCCTCCAAAACCCTAGCCACCGCGCCTCGATC TGATGCTGTGACCGTTACCACCCCGATTCTCCCCCTCATCGCTTCTCCAT GGAAGACCCCACGGCTATTCCCTCCTCTTCCGCCGCGGCCGCCGCGCCCT CTGCGGTCCCGTCCCCTCCTCCCGCGCCGCAGCAGGCGCCTGCCCACGCG GTTGTGATAGCGGCGGCGGCGGCCCCGGCCCCGGAAGCCGTGGCTGGGTC CCGCAGGCAGTTGTTCTCCGTGGAGCTCCGGCCCGGGGAGACCACCATCG TGTCGTGGAAGAAGCTGCAGAAGGAGGCTGGACAAGCGGCGGCCACATCG CCGCAGCCGCTAGCAGTTGTACCAGCAGAGCCTGCAGTCGCTGCACAACT GCCCCCGTCCGGTGTGGTAAGCAGTACTCTTTGCTGATGTCGTTGTCTGT CGATTGATTGAGTACCACAGTTTGTGCTGCTCAGGTTTGCTCTGCGGCTA GATGCAAAATTGCGACTACAACGATCCGTCAAGGCCTTTATGTTTGATAT GAGTAGAGAAGTGTCCGCGTTGAGCTTCTTTACAGGAAATTATCCTTGTA GGGTGAGGGTACAGGGACAATATGTGTACCTCTCTCTGACCAAATAGTCT GCCCTAGAAGTTAATAGTGCCATACTTCAGTGTCTTCTCATGCTGTCTTT GTAATTCATGGTATTTTTTTATGGCATGACCTTATCATCCCTCAGATACT CCTCTTCATCAAGCATTTTGTTTCCACACAGTATATGCTGGATTGTTCAG AAGTCCTGTATGTATTTTACACTGAGCTTATTATATTTGTTCAAATCAGG CACCCACTGCAGAAAACAACCCAGAGGATCCAGCACAGCCAAATCGGTTT AATGCAGTTATTGAGAAAATCGAGCGCCTTTACATGGTAACAAATGGATA ACATTATTTGACTCCATATTTGCCATTCACTGGGTTTTGACTTTGTATTT GAATTGCCAGGGTAAACATAGCAGCGATGAAGAAGATCTTGATGATGTGC CGGATGATGACCAATATGACACTGATGATTCTTTTATTGATGATGCTGAA TTGGTTGGTTGTTCAATTCTTGTTAGTCCTGTGTCATAGATGTGCACCTC ACTGGCAAACTTCTACCATTTGACTTGCTGTGTATATTTGCAGACTTTAT ATGATATATAATATAATATTGCTAATGCAACAAAGTTTTTGTTTACTGGT GAAGTCCATATCTATACTGTAGTGTGCACTCAGTTTTTGCTATCCGTTCT ATCTGCCCAAACTCTTGGTTTAGTGCTAGGATGAAAATTTATTTTTGTTA GTTTCATATGACATTGACATGGCCCCTCAACATTACAGTAATAGTTCATT CTTTGTATAGTGTATGCACATAATATATGTCTGGAAACGATTGCACTGAA TATTCACAGCATATTTAAAACCCTGTGTCTAATTACTTACTTACACTGAA CTTGTAGAATTTATCCTTTTAAGGTGAAATTGTGAAACATTTTTCTTTGT ATTTATTATATGCACTGAGAAACAATTTTTACTTCTTAGGGATTGCTTTC ATGTTTCTTACCTTTTCAGGATGAGTATTTTGAAGTCGATAATTTGAAGA CTAAGCACAGTGGGTTTTTTGTTAACAAAGGGACATTGGAACAGATGTAA GATTCCTCAAAATTCTTTGGATTTAATAGAAAATTCATGATGTTGCTTAT TCTGTTAATGCTGGTAGATTACATCCATACCGACATTATATGTTTAGTTT TTATTTAGTATGACATCTTACTGATGGCACAGCGGTCACCTGTTTGATTG CAACAACCTTTCACCATGAGTCTAGTAGACCATGTCCATTTAGCATACTA TTTGTTTTATCACAGACACCATATCTGCGAATCACTTGTGACTACTTTTT TACCTTTTTAGCATAAACTGTACAACTTCGCGCTGTCTGAAATAAAAATA CTGCATGTCACAACAGTGGCATGTAATGACCAGCTTATAATAAACAAAGC TACTGATCAAACTGGAAGCAAAGCATGATTGTGCCGGTTACAGCACTAGA TGGAACAACACAAACAACAGATGAAAGCACAAGGAAAATAATATGCACAG TTTTTATATGGCAGCATGGATGCTGTGCCAATTTAATCGAATCAGCAGAT CAAAATTGGCAGCAACACATTTTTATGTATGCCCGTGTGCTACATATATG TTAGCATGGATACATAAACCTTCTTTTGCAGTGAACCTGGTACATCGGCA GATGTCGCGCCAAAGAAAAGGAGAAGCAAAGACCCATCTGGTGATCATAT TGAAATTAATCAGGGTGCTACAGGTGATTATTTGAACATCAACAACATGC CCGGGAAAGCTAGCAGTGCTGCACATGCTGGGAAGAAATCTGCTACTGGT GGAAGTGGAGTCCCAAAAAAGAGATCGACTGACTTTGCCACAGGTGTTGA TGCTGCAAAACGTACAAAGATATCTTGTAAGGACATTTCATATTCCCCTT AAAAAAAGCTAAAAGACTTAGAAAAACATAAAGCTGTAGCATTCCAGCCT ACTGATTTTGTTATGACTATGCTTCAGCATACAGGGATAAAGATCCTTCA GCACAACTTGACTTTAAACAAGAAAAGACTTATAGTGGCGAAAATCAAGA TTTGACCAATAAAATATATCACAAAGAGAAACATGGAATAAGTGACTTTT CTGGCATCACACTGCCTGGTGCTACTTGTCCTACACAAGCAATGGTAAGA TTTTTATCCTGTTTGCCATACTAGCTAACACATTTGCATAAAAAAATAAC CATCAAACTGAGGCATGCATGCTAAGTTACATTTTGTTTTGATTTTTCAG TACCCCATCACTGGCAGAGAGAGTGCAGGTACCAAACCTAAAGGCACCAG GCTCGAGCGAGCCATTCGGGATTTCGAAAAGTTTGTTGCTCAATGTCAGT ATTATATCACATTCCCCTTGAGTATCGCGGTAGGCCATGGATTAGTGCTG AAAGTAAATTCAGATGCTTGAAATTTTCCTTGCAGACAAACCACCAGCTA TCGATAGTAATGAGGTTGACCCAAATGGTCAGGCATCAGTTAAACGGCGG TTGCCTCCAGAAGTAAAGGCAAAGCTTTCCAAGGTTGCAAGACTATCGGT ATGTAGTAGTACCACACAATCCACTATATTTACTTGTGATTCAAGTTTAT CTGAAACTATGAATGTTTCTGCTCCATGCAGTTACTAAATACTGATGTAC TTGAGTTTTGACAAGCAAAGTTCAGGAAATTTTCAATCCAATATAGCTTA GAAAAATAATGTCATAGACAGAAGACACATACACATGCCCCAGTTTTTCG TTCTCTGAAGTTATATTTTACAAGGTGCCCTACGATAATGGTACTTATTT AAATTTCTTGTGGTAACCCAGTTAGTTTTATCAGCATACGAATTAGTGTG ACAGTAGGTCATTTGGTAAATAAAATATTATATTAAAATAAATTGAACTT ATTAAACTATGGAAAACCCTTTGATCTGAACTTTAAATCGGTGCTGACTG AATTTGAATGGCACAGTATTGCCGGCTGTTAACACTACCGTTTTGCAGAC AAATCATGGAAAAAGCCAAGAACATGAATTGATAAATCGTCTCATGGGCA TAGTTGGACACCTTGTGCAGCGTAGGACATTGAAGGTGAGTTGTGGTTTG CTGGAAGTAAACAAGCATGTCCTTGGTACATGAATTTTAGGTAGATATGT TGCTTTGTTCAGAAACTAAATTGTATTTTGTTTTGAACACTGTCATATTG TATAGCAATTTTTTTGAAGATATTATGTAGTGGAAGTGCTTTTCATGAGG GGTCTATTGTTAATTTTCACATGATCATGTAAACAGTTTTGTATGTGTTA GTCTTTAGTAGTCAAAGTTACAAAGTTTGTAGTTACTCCCTCCGATCCAA ATTAATGGACTCAGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGTCATGTTTTA GTGCTAGATACATCCGAATCTACTCCCTCCGGTTCATATTAATGTTCTCA ATTTTTTCTAGATTCGTATGTATCTAGTTAAGTATTTAGACTAGATGCAT TCGTATCTAGACAAAGTTGAGAACACTAATATGGACCGGAGGGAGTAGAA AAACCTGAGTCCATTAATTTGGATCGGAGGGAGTAATAAAAGTTAAAACA TCATGTATTTTAGATTATAGGCAGTAATTGCCAATTAAATTTGCTAGTAC GTTTCAGTTTGACATTTCTCATAAAATTAGTGTATGGTTAAGATTGAACA TAGCCTTTTCAAGCACAGCTGCAATGAATCCTTACTATGTTTACCTTTAA TACTTATTTAGCCTTGTGGAAGTTTGTGCTAATCAGAGAAATGAACCATA TCTTAGCTCAGAAGATCCTTTCGAACACTACAACTACCACTTATATGAGT AATAAATCTACTGTTTGGATGCATCTGCGGTCTAAAAACTGACATGTTGC TAGCAGGAATATCTTTTTTTCCATTACTCTGTAGTTTCTAAATCATGCTT ATGTTGGTATACTGACTGATCCTGTAGAGTGATAAAATGACCCATTCAAA CTACATGCCCATGGCATTACCACCCTTTGTGCATCGCTTGTTCCCGTCTC TAACTCATGTACTTGCGAATAGAGAAACATGAAAGACCTGGTAGAATCAG GACTCTCTGCTACACAAGAAAAGACCGATATGTTGCAGCGTGTAAAAATG GAGATCAATGAAATGGTCAAAGAACGCCTTGTTGCCAAGGCCAAGGTAAA GATATATTGTTGTGTAATAAGTATGAGGCTTCCATTATCTTATTGATGTT CGCAAATTCATGTTTGTGACTTTTGATGTTAGATCTTAGATGTTCTGTTG CTTATGTGCTACCAGGTCAATGAACAACAGGATGGTTCAGCTGACGATTT TCAGGCTGCTACTGACGAAGGAAGAGATTTAAAAGGAAAGTTTGCAATGG ATAGTGCACTGGAGGACAGGATATGTGATCTGTATGATCTGTATGTTGAG GTATAAATCTGTAATCATATGATCGTTTTGGTGTTTGAACAAATTGCACT CTTGATGATCATTTTTTGTGTGTATTTACAAGGATGCCTGTGGGGATTTA GTACCGAGGTTGCCTTGCTAGAGCTTGTTAGATTTACCATTTGGATGCTA TTTAAAGTATACAAGAGTAAATTGGTTTTATAACGATGATGATGATTAAA AATAATACAGATACTTTTGATTTTGTTTACCCTGTACCATTTTAATAGCG AAACCCATAAAAGAGTTGCTTTAAACATAATCGACTTCAGTTAGATCCTA GCTTCCTTCGTCCTTGTTTGGTTTAGCTCACAAATGTCTGCCTACGCGCT TGTCAGGATATGGAGGAAGACAAGGGTCCTCAAAGCAGGAAACTATATGT AGAGGTATTAGCTCTGACCCCCTGGACCTTTTTTTTTTAATTTTGTATGT ACTATGTAGAGATGCCCTGACCCGCAATTTTGTGATGAGTTTTTCATTTT TTTGTAGCACAATATTCAAAGAATTTAGCGTTACGATTTTACATGCTTGT ACATCATTGACTACATCCAGAATTGTTTTCAGATTTTTTTGAAACCTGCA AATATTATTTTTGAGCTTAAAAAAATAAAGGAATCACTGGAACTTGCGAG CAAAAAAAAAAAGTCCTTCCACTGCTTATCAGCATTTGTGAATTTTCTTC TACTGCTTTCATTTGGGAAGAGCAAGACCAAGTTGGTTTTATATTTAATG TAGCAAACAAATTTAACTTAGCTACATGTGATGCCCCCTCTGCTTGTTGT TTCAGTTCGCATTGCGGGATGGTATGGTCTAACATTAATCCAAATATGTC GAATAATGCATGTAACTGCTTTTAGAATAGGCAGTTTTCAGGTGTATGCA CTGTCAATATTTTTGTGGATTTTCGCAACTCCATTTGCTAAGTGGATTTC CAATTATTGTGGTGTGTTTTCAGTAGCAGAGTGAGGTTCTTCTTCTGATG GCGCTATTATTCTAGCGGGTGCCGCTTTAACTCATGCACACCTGGATTTA TCTTCAGTATGCTTATACAATTTCATTTTCTGGGCACTAGCTTGCAGAGC TATGGCCACAAGGTTGCATGGATAAATTTGGAATCAAAGATGCCATATCT AGATCGAAGGAGCGCAAGAGAATATTACAGAACCAGCAGAAGGTAATCAT TAGTATTTGCTTTAAACTAGCAGGGTCTATATTACTTTATATGCTTTCTA TGTTATAAATAGTTTTGTAATAAACATAGTAGGTTTCTGAATTTTATTTA ATGCCACACTGTATTAAATTTGATTCATTGATAAGATCTGTTGGAAATTT AATATACTTAAGTGAAAAATCTTCTGCAATTATGGCATAAGGTACAAGGA TTTCTATATTGTGCAATCCACTTAGTTTGAAGAATTTACATAGAGTTGAG TCCAGCTTGAGATGAAATAACCGTTTACTCTATCCTTTTATGTCCCGTCA ATATTGTTTTCGCTATCCCTATATTCTCGGTTTCTTTTATTCCCTACAGG CAAACAAGTAAATCATGCCAATTCAACCATGCGAGGGCACTACTATTTGT ACTCTCTCTTTTCACGGTAGTCCCAGAAATTAATTGTCACTCAGACATGG TGCATGGCTATGCCGCTGCATAACTGTCGCCTGCTTGTGCCATGGTGCTG ACAATATACACATGCCAGAGATGAGATTTTTGTACTATGTTTCTTCTAGC CGCTGTGATATCAAGCTGTTTGGGTCTCGTGTCAACTTAAGTTTGGTCTT TCAACACCAAGTTAAATTATAGCTTGCTGTAGATGTTGATGCTTGTGTTA TTTCTTAACAAAATGTTTGTGTGAATCATGTTCCTAGAGAAAACACAATA AATTATGTTATCATATGTGAACTTTAAACTACTACTACTCCCTCAATTCC TAAAAAAAAGGGCGTGAATTTTTGGAAAGACCAAGGCAACTGCACACTTA CCCTCTTGTCCCTGGTAAATCCCATGTTGAGCAGTTATTCACAGTTCCAC GAATGCCATTATTCTGAAGTGACGTGTTGTGCATATTCAAGCATTAGCCA TTCTGAGCAAGCATGGCCAATCTGAGCAAAGGCAACTCTACACGGATTGG CGCTGGCTATTTCCATCTCCATGCACGCATGCGTGAGGGTATAATGGCGA GACGAGGTGAGCGGTTCAGAATGCAATTAAGGCTAGCGCGTCATTAAAGG AGCGGGTGCTATGCGGAGGGTTATATTTGGAAGATTAGAGGGGGAAATAG GGGTGTGCTCTGTTTTATGGAAATTTTAGAGAAGTTTCGTGCCCTTTTTT TAGGAACGGAGGGAGTGGTGGGAGTAATATTTTGGGAATAGCACACCCTC ACACTGGGTAAGCAATTGCTGGACCTCCATGGCTAGCTATTGTATCCAGT GTTACAGATCAACTTATCATGAACAGGAGGCTGAACCTAGCTATGGTAAA AGATATCACAGATGGATTGCCATATTAACCTGTCAGCGACGACTGATCAT CACATACGGGGTTATGCCTATCCATCAGCGATAAGTCATACTGACGGTTG TATTTTTTTGCCTGCTTTGATAAGCTTCCCTGGTGGGATAACCGTCAGAG ATGATGCTTTTTACCCATCCGAGTCTACCTGGTCCGTGGCAGTGATCGAT CATTCATGATTGTGCCATGCAGATCGATCCGTGTGTTCGGACTATAAATA GACCATTGGATTTTGACGAAGATTACATCACGTGAATCATTTATATCTAT ATATATCACAATTTAATTCTTGAGTCTTTCAGATTGTACATCTTAAATGC AAAATATAAAGATGATATACGTCCAACTTCCCTAAAAAAAAGATGATATA CGTCCAAGATATAGCTTTTTTTGTGAACCCCAAACACATAGCACTTCAAA CACATTACCTGGTTGTTTGCACTGATGGAGCATTAACTTCTCAAAAGCTT TGGAAATGTTCGCAAATATTCCTTACAAGTATTCTAAACAAAATACTAAC TGAACTGAGACATGTCTGTGTGTGTGTAAGTCATCACATAAATTACTGCA TGTTGCTTACATATGGTTCCATCCTGTTTGATTTGATCCTATCTCTGTGT GCTGCTTTCACTTGATGAATCACCATCTTTTCTTTTCTATGTATTACTTT TAATATAATGGATATACATGGTTAGAATGGCAAACTTATTTGTGTGTTGT AGCTAGCCTCATTTGTTATTACTCTTCAAAATAAAGTACTCCCTCCGTCT TAAAATAGATGTCTCAAGTTTGTCAAAATTTGGATGAATCTAGATGCTAA ATAGTGTCTAGACACATCTAAATTTAAACAAATTTCCGACATCTATTTGG ATACAGAGGGAGTAAAATACACAAGGTGTCGATCTAGCCTGCTAATTTAT GTTGCTGTTTCCAAATAAACCAGGTTCACAACGAGCAGACATTGAAGAGG AAAAGGCTAGCTGTGGCAGAGAAACTGCCAGATAGCTACCCTGTTGTAAC GCAAAGAACAATGACCCTGCAAGCTGCACATCCATCCATTATGAATCCTG TTACATCATACCCTCCGACTGACTATGTACAGAATCAGGCATCAACAAGT CTTGAAAGGGTTCGTGATGCAAGCGTAGGCGCAGTCCCTGACGATAACAT CAAAAGGGTTGCCGAGATGAAGAAGAAAAAAAGGAAGCCAGAATCTGATC TCGTAGATACACAAGCTAATCCAATGAAGGTTCCCTCGCTGCATGGTAGC GAGAAGCAAAAGGTTCCGAGGCATTCAGATGAGGCGAACACTATCACCAT ATCAACCGTGCTTGGTCTCCCATTCTATGATCAACAACAAAGCTGATTAT CTTGGTGTAACAACAGGCATTTATTTCTCCTTATAGGCTCTTGTGGGGTG GTGCAACAAAATATTCTTGTAGAGAGCATGTCATTATGTAATCTCTTATG TTTTATGCAGTTTGTTTCCACCCCCTTTATATTGGTTGCAACCTGTTAAG TATGGGTTTTGTCTGTTACCGTTCGGACGTACTTCCTTTGTTCCAAAATA TAAGATGTTTTAGCTTTTGTGAAGCGAGTGTATCTAGACATCTTTTAGTT GTTGGTTCACTCCGAATCTACACACTAAAAGATGTCTAAATACATTCGTT TCACAAAAGCTAAAACACCTGGAACGGAGGGAGTATATTCATACCAGGGA TGTGCTAAAATTGACCTTGTTTGAGCACACCTGTGAACAGTGTTCAGTCC AAGAAAGTCTTTACAGTGCAAGGATCTGAAATCCAATCCCCTATGGTGGG AAAACTGGAGGGCTAATGTGAGCTGTTTCGTTCAGCAGGACTACTTAGAA ACTGAATGAGGAAGGGTAGTGTAGCCGGGATGCTGAAAGTGGTTCCAAAG TGTACAAGCATGGGGATATCACAACAGGTACCTTGGATATTGTTGTACCG TCTCTCAGTTATACTCTCTATGTTCTAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTT TT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.