Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE020893

[Submit comment/correction]

Sequence	AE020893
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE020893
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAAAAAGAGAACACAAGCACACTGCGAAATAAACAAATCACTAAAAATA TTTCGAGCTCGCGACAGCGAGGAGCGATAGTGGAGGCGAGGGCCGCGCGG TTTGGGGCGTTACTACCATGGAGACCCAGACGGCGGCGCGCGGTGGAAGG GGCGACCCGCTGGCGGAGGAGGTGCCGTCGAGCCGAACCATGGAGCGCGT GGCCGCCGCGAAGAGGATCATCGAGAACGGCTACCGCGAGCGCACGAAGA ACCTCCGGGAGCGCAACGAGAGGTACCATCACCAGTCCTGCCGTTCTGCC TCCCAGTCCCGAAATTCGTACCCGAACTTCCCAGTTTCAGATTTCGCCGC GTGCGATCTGCGATGTATCTAGATCTCGCGTGGGCTGGGATGATCGAGAG GGGGGACTGGGGCTATCTCAGCGATTGGTTTCCTCGGTAGAGTTTGCGCT GCATGTTTAGCTGGATTACTGGTGATTCGGCAAGTTCTATGGTGGTTTGT TGTAGACTGTGGCTGTAAGTTCTACTGCGAGCTATTCCTAAGATTTTGGG ATGTGCAATTGGAGCGAGCCGATCCGCTAAGGAATTTAGGATGCTTGGTA GTACTTATCTGTTAATTGAATTGAGTTGTTGCTCATTGCATCAGTTATGC TGAGCAGCCTTTGGCAGTGCGTTTCTAGTTGTTGGAGGACCCAAAAAAAC TGGGTTTGTGTTTTCTGGTTGCTTATGTGGGTGTTGAGTGCATGGTTTTA AATAGCACGCTATATCACCTTTACGGCGGTGCTGTAGCGTTTTGAGCAAG GCGCCACCAAATGAAATATATGTACAATTGCACGCTATAGCACCGAAACA GCGGATTTTGAGGGCTGCCGCTATTTGCTATAGCACGCTATTCTTTTCTT TGGTTGAGTGTTGATACTATAAGTTCATAATAGTAGCACTGCAAGCTGTT ATAAAAGTATGTGTTTTCTTGTAAGGAAGTTCCTTATGTAACATGATAAT TGGATGTAAAGCAACAAAATAGAATGCGGGGTGGGACATAGCCCACATTT GCGCTATAACCGAGGTTGGCGCATACTTACAGGTTATTTACCCAACCAAT GTCAGGACAAAAACTAGATAGAGGTGCTTGACCAAACCATAAACGTATAA AAGAGATAATTGTGCACCTTTTTGGGAGTTCAGAAAAAAGCTGTGTGCTT GCACATTTATCATTAAAGTAAATGTGATGTTGAAGTGTTCATTAAAAAGT AAATGTTGGTGCCTTTTTTAGCTTAACCTAAACACACACTTAATCACTTC AAGGTTATTTTGCTGGTATTAAATGCTAATACGGGTGGTGGAAATCATAG GGGATCCAGGCCCTGCCTGGACCTGGACCTGGACCTGGACCTGGACCTGG ACCTGGACCCTCTATCCTCCGCCACTGGTCACCGTTAAATTGGATCACAA TGGAGCTGTTACATTCCATTGGCTTAGTAAGTAATTTCAAGTAAAGGAGT TGAGTCATCATGGAAAAACAAATAAGTAAAAGCATTGGGAGCAATCCATG TGTTAAAATTACTTTACATATTTGCTTTTTTTTCCCCATACGCCTCCCTC ATTTGGAGCCGGGTTACATGATCAGGGGATAACAAAACAGCAACACACCA AAGTATCCCAGCATCCTTGTGCAAAAGGACAAAAGAAAAGACCAAGAGAT GTTTCGCCGGCCACCTGCACAGCTATCAGCTAGCAACCAGCTAAGTACAA GAGGAAGTGCCAAAAACAAAGTAGGGGCATCACAAGACCTCCCAGGGGTT TGTGATCTTCCACATGGCCATGCTAACAGAAACGAACGCAGCAATCAGAG ATAGTTTATCATTCCTTCTTCATGTGTTCGCTACTGAGTTGAAGTGCTGG GGCTTAGGACCTACTGGGGCTGCCGGTGATCTTGCTGCTCATTCACCCTC CTCAGTGCCGTCTAATGTAGTTGTGTAGCTCCAGCCAACAGAGCACCCCC ATCGGGGCAGATTGTTAACCTGCCCAATATTGAAGGAAGGAGGACATGTA ACAAACCAATTCCAGAGGTGTTTTGATGAATTTTTCTTCAAAACATGCCC TATTCTTGTTTTCGAGATTGCCCAGCATAAGGCAGCAACCACAACTGTAT ACAGATTAGTGTTTATGAGACAATCCGCCAGAAATATCAAGCGAAATGTA TGGGTCTAGTGTGCACCCTAAGGACTTAAAAACCTACTAAACATTACTCT TCTGTGTCACTCTTATCTCCTGCTCTAAGACCACACTCTCATGTCCATTT GTCCACTCTCTACTAGAGTTGAAAGTTAACATGCAGCTTGATAACACTCT CTTCAAAGACAAAAGCAAAACAATCACGAACCATAATATTTGGAATGTAA TTGTGCACATGAAGCTGAAAAACCATTATGTCACCATAAAGTCACATGCA AAAACAGTCATACCTACTTTCCTAATTGCAAATCTCCTTCACCCAATCAA AGGAAACCAGCAGCTAGCTAGAAAAGTGGACCAGTCCATGCATCACAGAA CCACACACTGCTGAACACAAACACTAGCTCAATCAACTCAATAGGCACCA CACATCCCAAATATCTCCTGAAATTAGATCACTCAGTCTAGTTTCAGCAC ATTTATTTCAGTTTTTCTTCATCATTATTTCTATTACCAAAGACCTTGAA AATAGTAATTTTTTGTAGTAAACAGGATTGGAAGCTTTTTCTCTCCTGTC AACCTTTTGCACTCTTATCTGTAGGGATTGCATATCTATTCTTTGACCCA TTGCTTCTTTTGGTAATCTTGTCTTTTTTATTACATATCAGTTATCAGCT TATCTCTCAACACCGTTTGCTTCCATTTCTATTGATACTAGAGACTTGTC TATTGTACAATTGCAGACGCTTAATTTTGGAACAACAACTAGCTTCTTCA CAAGTTCCTAGGGAGGAGCAAATAAAATTAATAGAGGAGTTGCAGAGGAA GGAGACTGAATACATGAGACTTAAAAGACATAGAATTTGTGTAGATGACT TTGAGCTGCTCACCCTCATTGGAAGAGGCGCTTATGGGGAGGTTCGCACC TCCAATATCTACAAGAATGTTTCTAAGTCATTTTTTTTGGCATTTCAGAT TTATAATTTTTATTCATTCTATGATATGTGCTCAGTAAGCAGTTCACATT TAGCAAATAAACATAGTAGGTATGCCAATATATTTTAGACTGGTAGTGCC AGTCGGTTGCATGTAACATTTGCGAGATCCGTCGACTCTCTGGAGTTCCT ATTTTTTGGGGTACAATTGTTTGCCATGCTTGAGCTTTGATCTCGGTGAT AACTAATTTTTATTTGACAGGTTCAACTTTGCCGGGATAAATCCTCTGGA AACATTTACGCAATGAAAAAGCTAAAGAAGTCTGAAATGGTTGTCAAGGG TCAGGTAGGATGAGAGCATTGTACTCTTTACCTATTTGGTTAAGTTTGGC TCAGTGTATCAGATTGGATTGCAGAATAGGGATGTCTGTCTTGGATTCTC TGTTTATAATTTTGACAGAGATGTTATGTGCTCCCTCCAACCCAAATTAG TTGACTCAAATTTGCCAAGATACGGATGTATCTAATACTAAATTATGTCT AGATACAATCGAATCTAGACAAATCTAAGTCAACTAATTTGGATCGGAGG GAGTAGTAAATCTGGATCAGATTGTAGAGTAGGAATGTCTGTCATGGATT CTGTATTGTTTTTGTACTCTACAAAGAAAATTACCTTACACATTTTTTGA GGTAGGTTGCTTACATGATATTTTTCTTAATTGCGAGATGCTTGATATGT TAAGTTTCCCAGATTTATTTCTTGGTTTTGATTAAAAAATCGAACTATTT ATTAGGGGAATATTTAGTAACTTTAGTTGCTCTATTCTTAATTTCTCGAA CTAATATTTTCATCATATCTATTAGGTGGAGCATGTTAGAGCTGAGAGAA ACTTGCTGGCTGAAGTTGGTAGCCACTGCATTGTGAAGCTATACTATTCT TTCCAAGATGCTGAGTACCTTTACCTTATCATGGAATACCTTCCTGGAGG TGATATGATGACCCTCCTCATGAGAGAGGACACCTTAACTGAAAATGTGG CTCGTTTCTATATTGCTGAGACAGTTCTTGCAATTGAGTCGATTCATAAA CATAATTACATACACAGGTCATATTCTTGTGAATCAGATTTGGATATGGT CTAGTATGTTCTATTTGTTTATTCAGTTCTTTTTTATTATCCTTACAGAG ATATTAAGCCTGATAATTTGCTTCTCGATAAGAATGGTCACATGAAGTTG TCAGATTTTGGCTTGTGCAAGCCAATTGATTGCTCGAAATTGTCAACCTT GAATGAAGATGAACCTATGACCGATGAAAATCTTAGGGAGTCTATGGACA TTGATCATTCTCTCCATGATACAACAAATGGTAGAAGGTGGAGAAGTCCA AATGAACAGCTTCAACACTGGCAGAAGAATAGGAGAAAATTGGTGTGTGC TTACATAGTTAGCATCAAACTAGTTGCACACAACATCATATTTTTTTGCA ATTCTCGGCATCTTTTCTCGAAAAGGAAAAACTTTCACTGAATATTTTTT ACATCCATTTTAAACGAATTTACAGGCATTTTCAACAGTTGGTACGCCTG ATTATATTGCTCCAGAGGTTCTACTAAAAAAGGGATATGGAATTGAGTGT GACTGGTATGCTAAGAATTACACGTGCACATACATAGTTATTTCTTGTTT TGGTCTTCAAACGAAAATATCAAACTTGTCTCCTTCCAATAACTGCAATA TGATTGCTTATATCTTACTTACACGCAGGTGGTCCCTGGGTGCTATCATG TATGAGATGCTTGTTGGGTATCCACCGTTTTATTCTGATGATCCAATAAC TACATGTCGAAAGGTTTGGCTGTTGAATACTTTATCTACAACTGGATTAT TAAGCACCCCCCCCCCCCTCTCCTCCCCTCCCCACCCACCCACACACACA CCTACACACACCCCACCCAGTTGTTTGTATACTTGTAAATTTTCGAGACG TCATTGCAAAGTGTGCAGTTTTAAAATACACAATTGGGTGTCTCAATGAC ACGTCAAACCTTGTTTACCACTGGCGTTTTTCAAATTACAACTGGGTAAT GGCATTGGTCCGATCTTCCCTTGTAGCTTGTCTTATGAGAGTTGTCTTTG CAGGTTATGTTGGAATTAATCCAAACATACCAAGATAGGCATAATTAGGT AGGTCTAGTATGTATCCCAGTCGAGTTAGTACTGTACGTTAGTGTTTGCT GGTTTGCTTAGAAATACGAGTAGGTATATGAGTCCTAGTTTGAGTTGGTT TCCTAGTAGTACTGTAGTAGCTAGTTAACTTCATGAGTTCCAATCCGTGT AGGACATGGTGTGGTTGGTTGTGGCTGCGTATATAAATATGCAGCGTTGT ATGCAAGATTATAAACGTGCCCTCGTATGTGTGCATTTGTCTACTTTCAT GTGATCGATTCGTGGGTGAAATCTAACAGGTTAGAATTGTACACTATGTT GCAGATAATATCTAAGGGTATCAAACCCCGTAGATAAAATGTGATGGAGA AATGGATGTTGATTAGCCACAATTAAGACCTTGCCAAACTGTGGGATATA ATTTTTTTCCTTTTTTCTCTGTGGGAGTCTCTACTATACTTCTCTTATTT TCCCTGAGGGTGTTTAACACACACACTATCAGTAGCCCCACCAAAAGGAG GGTACATCTTTTACTTTTTTGAATGGACTCCTAACCATACATTATCATTT TTTATTATAATATGTCTACTTGGAGGGTAATAGCAATTTTACATTTTTCA CAATGGTTACACTAATAGTGCAGTGATTTAACCTGATTATTTGGCTTCTA TTACAGTTTAGTATGGAGCTATGTTTAAGTGCAAGTTAAATTTACTAAAA TGGTAATAGTGTGCTGCCAAGGGGGATATTTACCCACCTTCCATCCACTA TACATCTGAATGTTTTGTAGTATTTGCTGTATTTAATTGGTTTTGTGTCC TTTCCACACATACATAGTAAGTAGTAATTACATGCTAATAAAGTTGGTCA AGTCTAGTCCATTTTCATGTATTTGTTTACCTTAAAAAACCTATAAAACA ACTTGCCCTAGATTGCTAAGGTCCAAATCAGTAAAGCGAAGTGAGTAGTT GACCGTCTCGTGCTCATCGAGTCTGTTTGGTACTGCACTGACTCTGCTTT ACTATTTCATAGATTGTATATTGGAGAAGCTATTTGAAATTTCCAGAAAA ATCAAGGCTGTCTTCTGAAGCTAAGGATCTCATTTGTCGGTTCTTGTGTG ATGTTGATCACAGGATTGGGAGTGAAGGGGCAGATCAAATAAAGGTATTT GTCTCTTAGTATTATCTGCGGTCTCCAATTGCACATAGTACCCAAAGTGG CTGCATGAAATTGTGATTACTATACTCCTATTTATCATGAAATATAGTTG CATGCATCCTTATAACTTTGTCTTCTGCAGTAACAAAACTGAGCAATCCA AGTGGAATCTTGTTGTCCAAACTGACTTCTTATACTCCCTCCGCCCCGAA TTAGATGTCGCAGATTTGTCTAGATACGCATGTTAGTGTATACAGTAGAT ACATGCGTATCTAGACAAATACTATGTGACATCTAATTTGGGACAGGAGT ATTTGGATTCCAAGAGAGTATTACTTGCATATGCTTATTTTGGTTGACAT ATATCTCTTTTTCTTAGGCTCATCCTTGGTTTCATGGAGTTGAATGGGAC AAGCTTTATGAATTGGAGGCAGCATTTAAGCCTCAAGTAAATGATGAACT GGATACACAGAATTTTCAGAAGTTCGACGAAGTAAGAAAATCGATTTCCA TTATTTTGCTACATCTTTAAACAAAGTTTGAAGAAATTCGATTTCGTATT CAGTATGCCAATATTTTAGCTCCATATGTTCTATTGTATTGTGTGTAAAC TATATTGACCATTTCCGTTCTGTCTCTGCAGGCAGATCCTGCTCCCCCAA GAACAGGTTCTGGGTCCTCAAGGAAGGTATGAATAAAATTATGAACCATC AGTCTGGTGTGTAGGTCTGAGATTCAACAAAGCCAGCGTAAAAGCATGTT CAGCCTTGCATTCCCTTTTTCATAAATGTGTTGAAACTTTGCATGACATT TTCCCTGAAAGAAGAAGAGTTTTTAACCTGTCTAATAATTGCATCTATCT AGCAAAACAGGATCTAACCATATGGGATGAAGGAGCGTTATTTTTCTTTT ACTTATAATTTTGTAAATGTCCATGCCTGGGCATCAATTCCGGTCACTGC AATAACCTGCACCTTATTTTTTTATTCACTCCAAAGTTTCTGAATCATCT TAATTACTTGTCACTTTTAGATCTCCATAGATAGGGATAAACTCTGCCTC TGTAATAATGATCTTAGCTTGCCATTGTTTATGCCATTATTTCGTTATAC TCCAAAGTTGTTTGCCATTGTTTTGAAATATTATTGCAGATGATTCCCAG TTCTAAAGATCTTAGCTTTGTGGGCTATACATACAAGAACTTTGATGCTG TGAAAGGTTCACATCTGTCTGCAGGTTTGTTTCCTTGTCATCATTAGTCT GTTCAAATGATAGCTAAGATTGTTTTAACTGGCTGGTACCGTTTGTCTGT TACTAGCAGTTTTCATTTTACTCCCCTCCCTGAAAAACACATTTCTCCTT TTAGCCATTATTTTTCTATTTGCTCCCAGATGTTGTGGTAAGGTCCCTGT TACATTTTTTTAATAAGCGAAGTGTAAGTGGTAAATCTTTACACCAGATA ATTCATTGAAAAAAGGTCTCTGCTCTTACTTAGTTGTACTTGGTGCTTAG AATTGCCAAGCCCCTTTTAGATCAATGGTAAAAATGTTAAAATGGTCCTA TATTTCCGCAATGGTGAAAAGTAGAAACTGCTCAGGTCTTAATTTTGCTC CTTTAAGCTCGGTAGTCATTGCTGTTTTTCATTCCTTACATGCAAACAGA TTTACTCTATTAGTTTCATTCCTTACATGCAAACAGAAACATATGCAGAT CCTAAACGGAGCTCCTCTTTTACAAGCCAGCCTAGTGGTGGCAACACATC TGGTAGAGTATTTCCTCTTACTGGCTTTGTGTGTGAACATCTTACTAGAT ATATCTCTTGGCTCCTGGTTCTGGTCTTTATCTATTTTCAACCCTTGCAA TCACAGATACAGCAGACATGGATTCATCAGCAGAACCCAACGGAAGCTAC ACAGACATGCAAACTGATTCTTCTGTCGACCATATGATGCAATAAGCAGC ACTGCTGCTACCCTAAAAAAAGGTGCCACACCAGCAGGATTTTCCTTGGC GATGTGGCTCATGCAAAACGATCTGCTTGCCTTTAGTCAGGTCTGCTTGC CTTTAGTCAGGTCTCGTGCTCTGCTGGATATTTTGTTGTAATTGTACAAT ATTAGGCAGTTATGCCGAGGGCTTGACAACAGTGCATGTTCTGGGATTGG TCAGATATGGTGTTACTATAGCATATAGTGTTCTGGGTGAGCCAAGGAGA CCAAGGTAGACTGGTATTCGCTTCTTGGCTCTCGTTCCCCAGGTTGGCAG GTTAATGTTGCCTCCCTTGCGGCAGCTTGTAGCCCTCCAACATATGATTA GCATGGGATAGGAAAGAAGGACAAACATGACAACTAGAAAACTTGGGGCT AGCCAATTTTGCTTGTTATTGGATATTTTTTTAGACTGATAATTTGGAAT GCTGTTGGAACTTTTGCACATGAATGGTCCCGTTCTCGTTCAGTCTCTAG CTTTGTTTTACTCTACCTGTTATTCATACCAGGTTCCATAGGCTTTGCAT GCTGGCGCGGGTGGCCAAAGCTAGCGGCAACCTGGAGCGCCCCCCAGCTG TGCCGCGGCGGGAAAAGAGACGTTGTGCATGCCGTATATTATCTACCGAA GTCTACCGCAGCGGGAACAGAGTAAGTATAACAGAATAACACTGCAATTT GAACAAGTTCTTTTGATAAACCAGTTGTGCATTGGACTATTTATTAGTAT AACTTTCAAATGAGCGGCCACGGCATAACAACCGATCAGCAGCTAGCCAA CGACGGGGACGGCGGCAACAAGGCCAGCCTTGTCACGGGGATCGAGGTAG ACGCAGACGCGCGTCGAGTCGAACTCCGGCGGGCTCGGGCTGATGCCCAC GAAGAGCACCTCCGTCGTCAGATCGGGCCTCTCGCTGTTGATCCTGTTGA CAGCCTCCGTCGCCGGCACGAACACCAGCTCCGGCCACGACGTCTTCTGG GAGGTCATCTCGTACGTGTGTGTTGCTGCTGCAGATACCGTGGCTCGACC TGCGGGTGGAGTGCACAAGCGTTTCGTTTCGCACCGAATATATAAGCTTG ATACACCGGCCGGCATGGCGGTGCATGCTTTGGTGTTAACGGACTAGTTC CTGGATAGATCGCTTGCTCACAAAACAGCCGGGCTAGTTACCCGAGACGT GATGCTGCGTGGATATAATATGTTGGAAAGAATCTATGCAAAACGCGAGA TGCTTTATTAGAAAAAGAGAGAGATGGTTGTTGACTAATTCAACTGTTTT TTGGCAAAACTTCTAGGGCTAGCCGGACGGCTTTGTCGGCAACGCATGGG GGAGCTCCAGCGAGAATCGTCCGGCCATGATCCCATCACATGCTTGAGCT GATCAGCTGCACCGCTCGATCGTCATGCGCAATTTGCTAGCCTACTATGG TGGTCACGGGCGGACATACGACAACGATTTAAACGAAAACTCAATGTATC GCGCCAGTGTTTGTAGTCGTCGCTAGGTGGTCCATTGATCTATTTATAAT TTTTATTACTTTTAGAACTCTTTGTAATGTTGTTGATGATTTTTAATAGA TCAGTGAAATTTCGCAAAAAAAAAAACAAGGAAAGACATGTGGTACCGTG GAGAAAATAGTCTTCTCTTATATATTATCTAAGAGACCAAACTCCTCTTT CTCAATCCTCTCTCTTCCAACTAAACAAAAATCCTTTGTGACAACTCTAA GGGAAAGGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.