Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE033777

[Submit comment/correction]

Sequence	AE033777
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE033777
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCCGCTTTGCAAACCCTGTTTGACATACAGAAGCACTCCCGGCCGAGAG AAACCCCGCCGAGACCTTGAAAAAAAAAATGGCGCCGCCCGCCGCCGCCA CCACCGCTGATGGCGGCGTCGAGGAGAACGCGATGGCCATCCTCGACACC TTTGGCATCAAGGATTCCCGCGATCTCCACGACGACCGTACCCAACTACA TCTCCCTCCTCCTTCTCCCCCCGCCCCCAATACTTCCTAGGTCTCTTTAT CGTCTCATTTGCCTGCTGATTCCGGCGCTAATTTGCCTCCATCTACGCAG GAACCGCCTTCTTCGAGGCCGTGCGCTCCGCCTGCCTGGCCGGCGACAGC CCCTCGCCCCCCTCTTGGTATGGACCCCATCGTCTGCCTGGCCACTGACT GAATATTGTGTTAAATATCTAGCCGAGAAGTATATTCTGAGTTTATAAGT TAACTTTGTTCATTCTGAACATGGCATGGGCATCTACTTGTTTCTGGAAG GAGAATGCACAATGCTGTCTTTCAGATTCTTCAAAGTAGCAGCTCTTTGG AGCTTACCATCGCAAGTTTCCATCTCTTAATGGAGCTGGGCAAGGTGAAA TTTCTCCACCCCTTCTCTCTTCGTGCTACTTTTGTTCAAGTTGAGATGTC TCTTGTCCCTCGATTTACTGCTATGCTTCCTTTGGCAATGTGGAGATAAA TGCTGGCCGCTGTATTACCCCATTGATATCATAGCCACTCAATTTGGCAA TATTTCTTTCTGTGCAGTACCATGACTGATATTCAATTACCAACTCAAGC ATTTTTTTTCAGTAGAATGACAATTATTCACTTAACAACTTAAGCATTCC TACACCGGTGGTGGTGCTATGTTGTGTTTGTGATATCAAGGGACATCACA GGATTTGGGTTAGCTGCACTAATACACTCGCCTTTAACTGTAGTTTTTCT ACATATATGCACATGTGTATAGCGTTGACATCACTTGTTTCGATTCCTAG CACCAACTGCCCTACACTGAAGCTACATCGTTTTGAGATCTATAGGCTAT TAAGTATATTATGATTTCATGATTCATCTCACTTCATTTGCTTTTGATGT TAACTTTCAGCAATATCCAAGAGTTTATCTGACAAATTCTTGTCCTCACC AAGCTTTAGTTGTTGTTAAAGAGGTAAAAAGACGTTATAATTTCAGCAGA TGCTTTTTCAACAATTTGTGTACTGCTATCAGTTTTACACTTCCATTCTA TTTTATGATATGACATGCATAACTACTTCCCCATTTTCCAGTCATGGTCA CCGTTTCTCCTTGGCAATAATGGTGCTTCTGGCGAGATTGGGGGAAACAC TGGTTGCACAGATCACCTCTTTGATCCTTTGGTAAGCTGGTGTTAATGTG TTACATATTATTTACTTATGCTGTTATTCTTATCTTGTAATATTTACCAG CACATGCCACACAGTAAAACATGATATTTGAGGAACTCAAGTAATCAAGC GTCTAGAAAATGCAGAAGTAAGAGAACACATGTAAAGGCTTACAGGCTAA CCAACCCTGTCCCCAAAGTGAGGATGTATTTAATTAGCTTGAAAAACATC AAGATGATTATTTGATCAAAACAGGAAAATAGAAATGCTAATTAGGAATT AAGAAGCAGAGTTGCCAACTTGCTATTTGGGCTGATTTATTTTAGATTAC TACTCCGTCTGGTCCTATAAAAAATATCCAAGGATAGAGTTCATTTTTTG AAATATTACCACTGATATCATTACACATATTTTGATTGGACTCTTGAAAG TCGTACGTGTGAATGTCTCAACCAGTACTTTCACAATATACAGTTTGGAT TATACAAAAAATTATATTATAAATTGATGATCATAGTTGTATTTTGAAAA CTGTGTCAATATCCAAAGTAATAGCATTTAAAGGACTTGATGGAGCATCT TTTTGATGTTAAAGACTAATTGGCAATATTTATCGTAATATTGTCTTCCT GATTTTTGTGTGTCGTGAAGTATCTAATACAGTTTTACCCTTCTGAAGAG ATTTGGGTTACTGATCGAGCACATGGTTGAAGCAGCTAATGATACAAGTA CTAGTAATCGACTTAAGGTAATTGCTGACGGTTTCTAACTTCTGAGAACA GTAAGAACTCCTTAAGTATCTTGAATGTGGTCCGTTATCTCTCTTTGATT GTTAATATCACGTTATTTGGTTTATTTATTGTCTTATCGAAGTAATTAGT CAATTCAAGAAATGATATTGTGGACATACGAGTGTGCAGAACATCCAGCC GTGCACATAAAGTTGGTGGTTGATCATCTCCTCTGCTCTAGATATTTTAC TGGTCCGTGATTCTTCAGATGATGGGAGTAATTTTGCTGGAAGTATCTGT CTACAGGACAATGGAAATGAGTGGCATTTAAGAGTAAACGGTCTACCACT AAAAATATGCTACATAAGAAACAATGAAACGTAATAGGTATATGCCTGAA GGAGGTAACCTTGTGTGATGATGAAGTAATTAATTTTACCACTAAATCAT GGCAACTACTCCATCCGTCCTAAAAAGGATGTCGCAGATTTGTCTAAATT CAAATGTATCTAGACACTATTTAGTATATAGATTCATCTAAATTTTAACA AATTTGCAACATCCTTTTTAGGATGGAGGGAGTATATTTTATATTGTTAT GTTCATGACAAGTAAGGAAGTATGTTATGCCATTGTTTATACTCCCTCTG TTGATATTCCATAAAATGTTCAAGCATTTCAAGATCCAAACTTTGTAACT CAACAAGGCAAGTGTATATATATTTTTTAGTGCCACCAAAATATTACCAT TAAATTTATATTTGAACGCATATTCATATGATCATGATTTTGTAGTTATT ACCAACATGTAGTGAGAGAAATGAACTGTCAAAGTCCATTTTTCAAGACT GCCAAGTCAAACCACATCTTATAAAGATGAACTGAGGGAATACCTTGAAT TTGGAAGAATCACACACAGGGTTCTTGTGTTCTATTATCACATTCCCTGG CAGTACCACAGAAAGAAAATATATGCATTTACAGTATTTTTTGGTCTGTT GAGGTTTGAAGTTTGTTCTGCTCTGTATTTTAGCGTATAGAGAAGATGGT GCTGTTCCAATATCTCGTTAGCACACTCGAGGCTGATTTTGTACCTCGTA ATATTGCATATAAAGGTAAAGTACTCCTGAACTCAACTAATTTAGTATGC CTTTGTAGAAGATAAGATAATTATTATTATATTCTTCTGATTTTGTTGCA GAGTCATTAGACTGGGTGATTATCAGGGAATCTCTTTTAAACGTGCTTCT GGTATGAATCACATGCATAATGTACCAAAAATATCTTAGTTATGCGGTCC AAATCTTTGCATGGTGTTTTTTTTGTCTTGCCATATTTTGTTGAAGAAAA GGTTTTACCTGGGACATGGTTGCAGTTATGTGAAAGTAATGCAAATTTTT GTGTTGTTTTATGACATTCTTTGACATTGTTGAAATCCCTGCTTATATTC ATTAACAGGGATCTCGAAAACTGGTATTCAAAACATTTGTCAAGAACTGC ATATCCCTTCTGAACAAACATCAAAGGAAAGTTGAAGACAACATATCTTT TAAATCAGCATCCGATCTGGATTCTTCCTTAACCTTTTCATTGCTTGAGT TCGAAAGAGAAGCACTTTTGTCTGTTAAAAAACTTTTCATTATGGTGAGT TATATGATAGAGTACTTCTATGATACGCATTACTTGTATAAGGAATAGGT TCTAACAGTTACAATTTTTTGCAGGTTATAAACCTTGACTTGATTAGAAA AGAAGCAGACAAATTAGGCTTGACTTCAAGAGCTGATGGTTCCAGGTCAG CTCCGAGTTTCATTTCCTTGAAAGACATGACCTCCATTATTGTCTGACCT TCCATTCTCTCTTTGTAGGAATCCTATCTTGGAAGTTATTTTAGATGAGC TACCTTACAACACAATCAATTTATCCCCATTTCTTTTGGTAACGGCAAAC CATTGCACCCTTTTGGCATCTTACTCATTTTTCATCAGTACCTTATAATG CCGAGCTTCCACGAGAAACTGAACCGGTTGTTCTCTAAAGCTTACAAGTT CTCATTTTATTGCATGTTATTTGTTTCATGCCAATTAATGATAGAAAAAT GATACTAAATTGGAATAGATGATTCAACTGTAAATGTAATCTGTTGGTTC CTGCCTTTCGAAACAATAACAAAAATTAAGAATTATGCCTGTTAATCTCC TAGAGAAAAATAAAATCTCCCTGTTAAGTCATCCAAAGGAGGTTAGAATA AGGCAATCATCCTTGCTGTAGGCCACTGCCACTGTGATTCCCGTTACAGA CTAGTTTGATTCAATTGCTTTCCATGCACTCCAAACTTCTACAAAAATGT AGCAGTGCATATATAACTATACTTTTTATGTTCTTGAACCTGTTTTGTTC CTTGGCAACATGTTCTCGTTTTGTGTGATTCTTGGCTTCATGGGGAGGTC CTAAATAGTTACATCAGCTATCAGTATTACTGCTGGAGCTATTCCGCCTC ACGTTTTAACATTAGAAAATAGGAAAGCTGTATTATATATGTACATAAAA TAAGTCACATTAGGACAAATCTGAACATCGCAATGAGTCCAAGCTCGGTT TGATGGTTTAGGGCCTGTTTGTTTGGGCTGGGGCTGGAGCTTCTACTGTT TTTGGGTCCTTAGAAGTACAAGCTCAACCAAGCACCTAACTTCTAGGCCC TAGCTTTTAGAAGCGCTTAACCGATTTACACTGGAAGCCCAGAAGTACGT CCGGGAGGTACTTCCCGCTGCTTCCCACAGCTTCTCACTTAAAAATCTAA TCGGTACAGGACACTGCCCCTACAGTCTATCATATTTCCCATCTTTTTCT GACTACATGTTTAGGATTTGATGTGTGTGTGAATTTGTATGATGTAGGAC TGCCTATTTTCATTACATGAATGTGTGATTCAGATCGGAGATGTTTAGCT AGTTTGATCACTAGGACTTGGCTTGTATTTTGCTATTAACTTAATGTAAT GTAATTTGAGGAGCTTTAATTTTATGGTCGTGTGTGTTTCTTGTAAACTA TTTGGACGTCTTGTGTATGTGTTGTGTTAACCATTAAAGTTTAATCTGAA AATTCTATGTGTTGAATCTACCATTCAGTGATTCATACAGATTTATGCAT TTATTTATTTTATTGTAAACATTTATGAGCACATAGAAAGATATTTTTTT ACCATATTATTTAAGCTAGTAGAAGGCATAATCAGCCCAATCATGTCAGG TCAGTATTTAAACATTATCCTCAGCATACATGGGTATATCGGACTTTCAG CAGCAGCTACATGCACCAGCCTTCCTAAAGGCAGGTTGCCAAACAACATT TTTGCTTTTCACCAGCTGTCCAGCTCCAGCTGCTCTCAGACTCTTACCAG CTCCAGCTGCTTGTCATTCAGCTGCAGCTCAAACAAACAGGCACTTAGTT GTTGAGTGTGCTACAACTATTAGGTAGTGCTTATCTGCCCTGACGTGCCT ATAACTATAAGCAAGAAAATAAATAAATGTGAAGAGCTAACAAGTCAATA ACTGAACACAAATCAATGTGAGATGCTGAGAACTGGAAAGAAAAGATGCA TAGGTTAGAGGTGTTAATGTATTGCCTGGCTCTCTAAGTTGATAGTAAAG CAGCCACCAAAGTTGATGGTTAAGCAGCTACCTCTGTTAGTGTTTATGGT CTTCACATCTTTCCGCAGGTAAAAGGGTGTTCGTTGGTTTTATTTTATAT TAGAGGAAGAAGTGAAGAACACAGAGAAGGTTTTCAAGTTCGAAAAGCCG AAACCGAGCAAAACTCGAGAAATTCTATCCTAGCAAAAGCAAAATTTCAG CAAAACAGAAACCTGAATTATCTACAAAATGGAAGAAAACAAAAAAGAGA ACAGAACCTAAGCTACGCTATGCAATAATCGGAAGGTCTGTGGGTCTTAA ATGCTGTGGCAGTCTCCTAAGGGCCTTCGCTCCTGCCAGTATCCATTGCT CGATAGCTGTGCCTTGTTTTGGCTCATTGTCATTTATATGGAATAGCTGT GCTGTATCTAGCTACAAGTTAGGTGAAACAGCACTGCTACTTGGCGCAAT AGCTGCCATAGCTGCGTTAGCGGGAACTCCATGCATAGCTGCGATAGAGC TAACTATTTCGAACATTGCTTTGCAACTGAACTGTTTGGCAATGATAGCT AGTGAATTAATGATTTATTTACCAACTGCGTCAGGCCTTCACGGAATGGA AGTGGAAACTGGAGATTATTTTGCAGTACTTTTCAAGATATTATGTCAAG GTATGCTAAATTTATTTCTACAATCACTTGAATTGCTACAAAAACCTTGT TGTGCAACTTCAGAAATACCCCTTTACGAGACAATGGTTGTTGTTTAGCA TACAGCATGCCCATGAAAATTGTGGAATCAAGCAAATGTTGGTACCAAAT GTCACTCTCCAGCTGATACAGTTTTACCTGTCTCTTAGATAGGCTCTCCA ATATAGAACGTTCCCACCCACATCATCTCTTGATCAGCATTATCTGGATT CTAGACTGCTTTCTTCTATTCATTACATAGGACTCAAAGATGTACTGTAA TTTCAAATTGAGTTCTCACATAAATAGAATATTATTTTTAAAATTCTACA ACAGTTACCTTGATTCTGGTCACAACCAAAATAAATTGCAATGCTGAACC AGCATTTTTGTTTCTCACAGCTAGGTAGTAAGGCTAAGATTTGCAGAGTT GTCCGCAACACTTGTAAGACATGTATTTAGAGAAATACTATCGCAAACAA ACTTGATTTCAAAATGAACTACATAACCTAGTTCCCTAGCTTCATGCATG TTTGCTCCAACCTCAACAATTCCTGTAGTACCATTTTTCATTTTGTTTTT ACTCTTTGCGATTTTTTTTTTTGCGAATTTGCGATGTTATTGTGAAGTCT ACATGATTGAATTATCAGTCCTCTAAATAAGAAACTCAGGAGTTACTTAA CATACAATAATGATAGTTTTAAACATGTTGATAGTAGTTAGGCTAAGATT TGCAGAGTTGTCCGCAACACTTGTAAGACATGTATTTAGAGAAATACTAT CGCAAACAAACTTGATTTCAAAATGAACTACATAACCTAGTTCCCTAGCT TCATGCATGTTTGCTCCAACCTCAACAATTCCTGTAGTACCATTTTTCAT TTTGTTTTTACTCTTTGCGATTTTTTTTTTTGCGAATTTGCGATGTTATT GTGAAGTCTACATGATTGAATTATCAGTCCTCTAAATAAGAAACTCAGGA GTTACTTAACATACAATAATGATAGTTTTAAACATGTTGATAGTAGTTAC AAGTACAACCCAGTTTAGATGCCAATTAAAAAGGATGTCATTTGGTAAGA TTAACATTTTGAAAGACATTTATCAAGTATCAACTAATAGGGCTCTTCTT TATGTGCGCATGGAGTTAGAATGACATTTGTACTAGAAATAATTGTGAAA TGTTAATATTGGAGATGTGGAATGCTAATTTGTTGATTCTCATTATATCG TACACGTGAATGGTTTTACATATTTTAGTTTCGTGATCAGATATTGCTGC CTTTTTTTGTTTATAGCCTACAGTCCGTACTCGGAGCTCAGATGATTCCC AACAAGATCTGACAGTGGAAAATGTTCTGAGTTTATTTTCAACGGCCGCA AGTGCAAAAGCTATTGCCAAGAAGATGTTTCCAGAAGTTGCCCAGCTTCT CCTAGCACATGCATATCAGGCTAGTGAATTAATGCTGCTCCTGAATTTCT ACAAAAGAAAGTTTGCTTCTGGTTCCTTGCTAGGTTACTTATTAATATGT TATCATGATGATGGACTTTTTTGTTCTATGCCCTAACACATTTTCTTTCT CTATATGGACAGAGGTGACTAGCTATCTTATTTTTTACATGAGAATATAG TTTCTTGGGCAATATTTGGATACTAGACGGGCAGTAAGCATAAATGTGTG TTGAAGCCTAGAATGTAGTTTGCTTGTGGTGTGGAGGCGTTAGGGTGTGC GTAATCATAAATAGTCGCACAAAGGTATATGTTCATCTTTGTAGAGTGTA ATCCCCTGGTTATTTTTGAGCCAGAGGTTGAGAGCAATGTAATTGCATCA TTTCATTCATCAATCCATCCACTATAATTGTTTAAATCCAGCCAGATATG GGTTGCTGTTTTAACTTGACAACAATAGCTAGAGCATATTCTTTGTTCTT TGTTTAATTAACTGAAGAGCATAATAGTTTTGTTATTAAGAAACTTGAAC AAGAAGAGATCTCCATGTTCCATGTTCCTGCCCCTGTTGTTCTTTTATAT TCTTCTAGTTATAGCAATCTACCTCTTGGGTTGTAATTTAGTCAACTTTC ATATTTGCTTCAGGCCTGCTTGTCTGTTCAAGTTGATTCTAACAAAGCTG ATGATGCAACAAAGATGATCGGAGCGAGTCTCCTTGATGTATCTTGCAAG TTTGTGTCTGCTTTCCAGAATCTGAGAACATGCGACATGTGAGTATATTT TGTTCTTTTAACATGGCAGTGGCCGAACGCTGGGAGCCAGTGTGAATCAG TATGAAGCTTCCTAAAAATTTAGGTGAAGTTCCTTTTGTATATCCTAATT CTTGTACCTTCTTTTCAGGCACGTTGAGATTTCGCAGTTTGAGAAAGAAG CTTTGTTTACTGCAGCAACGCTGACCAGGAAACTGCAGAACGAGTAAGAG GATAAGGGACTTTGAAGTGATACACATGAGATCAGATGGTTTATCTTAAG CGAACGATGATAGCATTTTTTGGTGTTTGGAGTCCCATCTGCCTCTGTAC ATATTTTGGTTATCTATCTCCTCCCCAGTAGTATATGTATCTGAACCTAA TGTAATGAAGTGAAGCATCTGGGTTGCATATATCTTGGAGCAGATTTTAG TTGAACCTTTTCCATTGATAATGAGCTCACAGAGTATCTTGTTTTAGAGA AAGGAAGCTCCATTACCTTTGCCTTGTGCACCAACTAAGTTGCATGTAGC CAAATTGCTACAAATGTGATAAAATCATTTTCAATGCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.