Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE016981

[Submit comment/correction]

Sequence	AE016981
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE016981
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTCCAACAGGGCAACGGTTTAACGCTACGCACGTGTTGACCTTGGCAAGA GAAAGAGGGAAAAACCCCACCCCGCGCCGCCTCACTCGCGCCCTCTCCGC CGTCGCAGGCCACGCCGCGGACTGCCCCCCGCTGTAACTGCTGCTGCTGC CCCGCCGCTCCTCCAACGCCGCCGTTCCATCGCCCTACCTAGTGTGTCCA GAAACCCGCCCCTCCTCGTCCGCTACCTCCCGCCACTAGCAAAACCCTAA ACCCAGGAAGCGGGAGCGAAGCTTCGAGGCCACGGCTCGAGCTCGCGGCG GCAATGGTGAAGGTCCCTGCCAGCGAATGGGTCCCCCACGTAGAGGCCTT CGTCGACGTCTCCCGATCCCCCTCCCATCACGTACGGCCTCCCCTCCCCA TCCTCCCTTGTTGTTTTCTCCCCTGTTAAGCTCTGAATGATTGCTTGCTC CTGGCTTTGTTTCACATTCAGTCTGTTTCTCTTATGATTCGCTTGGAATA TCTGTGTGACGAGCTCGCTTAGCTATTGATTGATGGGAAAATGCCTCGAG TCTTTCACTCTATATGTAATTACTGTGCAATTCGCTCATAGGAAAACAGC TAACAGGTACTAAATCTGTTCCATAAAACTAAAACGTTCTACCTTATGAA ACGGAGGTAGTAGCACCTAAGCCGTACACAGCTTTAATCTTACAGAGGCT TTCAGATTTTGTGTCGTTCTAACACAGTTTGGCAAAACCTGCTGCTTGGT TAATATATGGGGTGAATGTTGCCATTCGTTTGCATGCTTGATGGACTCTG TCCTTTGTTGTTGTACTAGTTTGTTGTGGATGCTAATTCTGTTATGCGTA TGCGCAACAGTCTGCAAGTGTGGATGCTCTTGCGGCCTTAGTGAACAAGG ACAAGCTGACGCTCTTCGATTTGGTATGGCCTGGTCTCTCAAAGATCGTA TCTTACTTTGCTCCATGATTTGGCTAAGGAGGTTAGTTCTTGATGTATCT TGTTGGTGATATCGTTTCAGGTGTCTAAGATGGACATGTATTTGACTACG ACAGACCACATTGTTAGATCAAGAGGTTTATTTTTCACCTCTTCGCATTT ATTCAGTTATTTCACATGCTATTTGCCTCTCCTTCTGAGAACATTTGCCA GTTTGCTAACTCAAGTAGAAGTTAAAACTTTGTCGTCTATGCCAAGTTTT AAGGTGCTATAGTCTTAGTTGTCTGCATTGTTAGCACAGTTCCAGAAGGT GCATAAGTCAAGCTCTATTTCTTCTGTGAAGATTATTGCGGATCACTTCT GCTAAAAAATTAAACTCCTACTGTGCAGTACGGAGACACATCCACATACG TGTGCACACTGGTAGCAAGGAGAAAGTGAAAAAGGGAAAAGCCCGCGGCA CTTAATTGGATGTGGATTTATGTTTGCAGTTTCTAAAAACGCGAACTTTT TCCAACCATCTTTTTTATTATGTGACCTGCAAACTCTGTCTCCCTCTTGG CATCTCATCCTGATAGATTTAAAGTCAGCGCCATAAGCTTTTGTTGGTAC ATGCATAATGCCCTGCTGTTTGATAAGGATTTGCTTTTCTTTGTTTTGCA GGAATCATGCTTCTGGGGGAGATCATGGCTCAGATTTCATTTAAATGGTT AGATGTCAATGCAATCACAACATTGTCAGAATTTTTTATATCAAGACTGG TAAGTTTCACTATGTGCATCATTCTTAGAACTTAGAAGTACATACAGTGT CTTGAACACTAACCTAATGAGTTCTCCTTTTGCACCTGAACTAAATTAGC AAGTATTGCCTTCTGGTTTTGTTCTTATTTTAAAATGTAGCGAGATAAAA GAACCTTGGTGTTGTGGCCTCAAGTTAGTTCAGATAGTAGATTCAGGTAA GGGGTTCAGGAATAGAGTTGCGGCCGGCCGGCCGGAGATGCAAGATCAAA AGCAGAGACCAACTCCGATTCAGCAAGGAGCAGTCGAGGCTTGAGGAGTC CAGCCGTACGGAATAGCTGTTAAGTTAGGAAGTACAATCTGCGTCCTTGT CAAGTTAAGAGTCCTAGTACTACTAGTTAATCAAGTCCCAGGCACTGCTA TAAAAGCAGGCCCATTGTATCATTCTAATCAAGCAATATACAGAAGTCTC TCTCTACCCTATATGCTCTCCCGATCCAATCTACTTCTCTAATTTCCTAA TCCCCTGCTTCCTGCCGCCTCAACCACGGCACCAACCCGACACCGCCGGC CACGGCCTCCAGTGAACCACCCGTACAACCCCAGGAGTAAAGGACACAAC ACTTGGGGATAGGAACATCAATCTAGGGTACTAATGTGTGTAGTCACCGA GCCTTATCATAGTTCTTGCACTGCATTTGTGCAAATTAAATAGGCCATTA TACCATTATTTTGCTAGGCTGACTTTGCCTTTACACTCTAGAGTGCAGAA ACTAGTTATTAAATATTGACAGTAGCCACATCTTCGACTCCAAGGTTTAT TTTCTAGCATGGCTAAGCTCCCTGTTACATGATGACTGAATATGGGTAGT TATTGGTTTCGGAGTTTATTTTTGTTCAATTTACATGCAACAGAACTATT ACATTTTGTCATAAATCACTGTATATAAGAGTGAACCCAGCTCTTTGGTG TTGTTAAGATTGGAGAGATGGTCATGAACTAGTTTTGACATAAGCAAGAC TTTATGAGGCTGCTTGGTTCAATTAAAAAAATTGGCTTGCCAATGTTTGG ACAGCCCAAAAAATCTTATCTCTAAAAAGTTAATTTTTGGCTGCAACCCA GATCTCAATGGATTGCAGCCCAAGTACGTCATCATGGTATCTAGCAGGCT GTGGATTATTGCGGTAACTTCTTCTGTTTGACATCTCCAAACAAGTGACA ACTACAGAATTCAAGTTGCAAATACGCACTTTACCTAGGTTTCCATCTAA TTGAAGAAGAAAGTTATCCTAGGTGTCTCAGTTTGGGCCCAGATTAGACA CAATCTTCATAATTTGGATTACCCCAAAATTAGACCTGAGTGATGCTTTG TAAAGAATACTCTCTACTTGCTGAGAAGTGCACTAGAATGTTAATATAAC CTTTTAGTTTGAATCATATATGACAAAGTTTTTGTCTCAAGAAAATTGTT CATTGAAGCAAATTGATCCGCTGAATATGCATAACTCCTATAAACTGGAC TTTGGTTTAACGCCATGCATTGGTGATCTTTACTCTATGATGGCCAACTG GCCACCCTTTAATTTATTACTCATGGATTTCTTTGGCATACCAGTCAGAT TGGCAGGCACTACGGGGAGCACTTGTTGGATGCTTGGCTCTATTGCAAAG AAAACCATCTGTTGGCACTATTATGATCGCTGATGTCAAAAGACTAGTTG AGTCTTTCATAGACAATGTTCTAGTACAGTCACTTGCATCTGCTGACCGC AAGGTTGATTTGAATCTCTAGTGCAAATATGCTTAAATAAGGTTATATGT ATCTATCTATTGATACCTTTTCACAACTCTATTTTCTCTCCAGCTGTGCT TTCAAATTATTTGCTTCATACTTGATCACTACCCAGAAGCTGTCAAGACA ATGGTATGATACATACTCTCAAAACCATCTCAGTTCCTAGCACAATGTTA CTCTTTATATGTTCGAACACGTTAGTAATGCTCACTATATCTAGGAGGCA CCATAGTTTAGTAATATTCATTTAATCAGACCAGACTCACTCCTATTAGA TAGAGTAGTAGTATGCCTATGTAATAGGGGTAACATGGTCCAATGCCATC AAGTAATACTTTCAAATTTGTACCTCTGAGACTTGTGAAATGGAAGGAGT AATTTTTGTAATGTCGTGATTATTCCTCCTTGATATGTTTGCATTCCCTT ATATGGCAAGAAAATAGAATAAGACTTGTTCCGGTATCTGATGCTGAGCA CTGTTGACCAAATCTTGCATGTCGTCGTTATCGTGCTTTGGATAAAATAT TAAAAGTGTGATGACCCTCCAATAATATTGGAAGAACAAATAACAGGGTA ATCAAGTGAGCTTAGAGGTAGAGTGGAGGAATCTTCATTTCTGAGCCTCT GCTGCGGAGACTATTTTTATATCTCTGTCTGTTTATTTTCACCCTCTCAT GGATTTATTCTATGATGAATACATACCATCACAAGTTTATTGGTATTTCT AGGATGATGAACTGCTATGCTGGATCTGTCAAGCAATTGATGAAGAAAAA GACCCAGAGTGCTTGAAGCTTTCCTTTCATTTGGTAGAAGTTGTCATGAA GCTATTTCCAGAGCCTTCTGGTTTGGCAGCCCAATTTGCAAGTGATCTTT TCGAGATTCTGAGCAAATATTTTCCTGTCTACTTCACACATGTAAGTTAA TAAACTACTATGACTTTCGAGACATTTTCGTGTGTATTGTCATCCTGTAA CTTAGTACTGCTTGACATTCCTTTTCCCAATATGGTGTCATGATTATCGG CGTCGTGCATATATGCAGGGAGCGGGCGATAATTTAGGTCTCACAAGGGA TGAACTTTCTATGGCATTGATGGTACGAACATGGCATTTTACCTTCAAAG AACGTTTGGCTTTTGAGCAAAAGATATGTCTTATTGTCTTGGCATTAGAG ATTATTTGTTGAAACAGCTATTGGAGTTATCTTTTACTTTATCAGCTTGC CATGCTTGTAAATGAAGGAAGCATTCCTGTTATTTTACTTTTGTGTCTAA TAACCTGTTTAAATCTTTCAGCATGCCTTTTGTGCAACTCCGTATTTTGA GCCCTTTGCCATTCCATTGCTTCTCGATAAACTTTCTTCCTCTCTTCCAT TAGCAAAGGTCAGCAGCTTACCTTACCTTATTGTTTCTGGCTCATCAATT CAACAAAGTGGAGACCATCTCTTTGATTTTCTGCTAAAAAATTCACTTTG ATATGATCTACAGCTTGATTCCTTAAAATATCTGGACAATTGCATTCTCT GCTATGGAGCTGATAGAATGGTTTCACACGCATCAGCTGTCTGGTTTAAG TTGAAAGAAGTGATTTTTAGCCTTTCTTCAGATCAACTTTTATCAACAGG GTCACCGAAAGATGCAGAGACGAATAAGAATCAAATAGTATCAGAAGCTG AAAATTGCTTGAAGACTGCTGTTACGTGTATACATTCTACAGATAGAGAT ATTTTCATCAATTTGATCTTGTTGGATGAGGATATTGTGAATAACATCCA TTCTGTAACAACTGAAGAGAGGTCCATTTGTAGGTCATCGCAAGACCTGA ATCAATTACAAGCCCTTGGACGTGTGATATCTATTCTTGCTGAATCATCT ACATATTTCTGCACTAGAGTTTTTCAAGCGCATTTCACCCGCTTGGTGGA TATTTTGGGAAGCTCAGCTGGCTTTAAATCTCGACACTTGAACACTTGCA ATGGATCATCTTCTGCTGCTATTAACTATGGAGCTCTCTATTTATCTGTT CGAATGCTTTCATCCTGTCGAGAATTGGCTGTGGCATCTAGAGGTGACTA CCCTCCTGTTACATCAGCTAAGGAGTCCTGGTGGCTTGTCTTAGAGGAAA AGCTGGATCTCTTCATCCATCTTCTTGGAAAATTGTTGACTATTGATCCT CAGCCTATCCAGTCAGCGGTCACACAAGAATATGTTTCATGTGCTGGTAT GTTGACGTCTTTAAGTATGACTTGCTACATGCCACATTTTGTAAGATAAC ATGCACCTATTTGGTGCTGTCACATTTATCCAGTTTCTCCTAATCCATGC TTGTCGACTTTGCTTCAGATAAATTCTTGCAAAAGTCATGCATCTAGTTT GCTACAGCATTGCTATTACAGTCTACATGTAGTTTCTCAATAAGCCCTTT TGCCATTTCTAGAGATTCTAGTATGTACGATCTGTACCTTGTACATCAAG GTTGTGTTTTACTTCAAAAAATCAATTAATGAACTCTTAATTTTCCTTTT TCTCTTGGTGAATCTCAGTGATTTTTAGTCAATAAAGATCAGGCTATCTA TGCTAATATGGTTGTTTCTTGTAAATGATTCTCAGTGAAGGGGCTACTGA TACTTGCAACAATCCCGGAACACTGTTCACTTCTACTGGCAAATGCTTAT GAGGATATTCTATTGATGCTCACCTCGGTAGTTGCAAGCAAGTATGAAAA TATACATTTGTGGAGATTATCGTTGAAAACATTGACTAGCATTGGTAAAT TTGTTGTGGAGTCCCATGCTTCTAAAAAAGAAACGATTTACAGCAGAATT GTTGTTGACAAGATTATTAGTTTGGCTAAATCTTGTGATACATCGATACC TCTCAACCTTAGACTTGAAGCATGTTTTGAAATTGGTACTGCTGGGGTGA ACTATATGTTAAGGGTCGCTAGATCACTTGAAGAAGCTGTCATCGCCAAT ATTTCTCAGGCCTGTATCAAATCCTGGTTGTTTTCTTATTTCATGTAATT TAAGCAGCTGAACAAAGATTTTATTGATCCTGCAGGTTAACGGAGGAATA GAATGTGCGGATGTAGTCTGTTTGATCGACTCTTACTGTAGTCAGCTCCT TCCTTGGTATGCCAACTTTGCCTTGCAATATGTCTTTCTATATCAAAAAA CATTGATTGCAAGATGTCTGTAATCCAGATACACCTTGCTCAGATTATCC AAACCTAACTGTAAAATATGTTGCAGATACTTGACCAATTAGATAGCTGA AGTATGCTACTTGATGGCATGCTTGATACCTGTGCCCTGCACTAATTCCC AAGCCTTTTGTTCAGGATATATCAATTATCATATTTTCCCTCAGTAACCA TCTCCATTATGGCAGGTTGTTTACTTCTGGTGGTGTCAACGAACTTGCTT TGAGCTTTGCTATGCGTCTCTGGGATGAGCTTAGGGACTTGGCTACTTTG GATAGAATTAGATCGCAGGTGAAGCTCTGTCAAACTGAATGTTTCTGCTA ATTTAATTGATTTATTGGTATTTAGGTGTCTATGTGGTATAATTATGTAC AAGTATTTAATGTGTAATCATGGCACACGTTCACGTTTTTCTCTCTCAGG GTCTTCTCGACTCACTAATGATGGGAATGAAGTTCTTAGTCACAGTCTGC ACAGAGGACCAACAGTCATTGATTGTCCAGAAAGCGTGCGGCGTAATATT ACCGATGCTGTCACTCCCAGTGAAGTCAGTGATGCACCATGTTTTGTCTG AAGATGAGTTAGTTCCTGGACACTCTGTTCAAGATACAGCTCTTGTGTGT TTGCTTTCATCAGTTATAATTGGTCTTTGTCCTCAAACACCTGTACCAGA TATGATCATGATGATTAACCTCTTTTCGGTCTTCCTACTGAACGGACAAA TACCAGCTGCTCATGCATTAGCTTCTATTTTCAATAAATATCTACAGAAT TCAGAATTCCCAGATGAGAATAAGCTGGATAAAATACTTGATGTGATTCT TGGGAGATGTTTCTCAATTGTATTAGCCAGCAGCACTTTGAAGACATCCC ACTCTTCTGCTGCCACTTCAGATAACGCTAATTGCTCAGGCAGCATATCT GCAAGCATAGGTTTGAGGATTGATATCATGTGTGGTTTGGCTTGGATTGG CAAAGGATTGCTTATGAGAGGAGATGAAAAGGTGAAGGACATTTCAATGT TTCTTCTTAAGTGCCTGGTCTTGGACCAGATTTCGGCGAACATTCCACCC CACCAGGAAGAATTCAGTGACAATGTTTCATTAGATGCTTCTCTTGCAAC ATCTGCAGCTGATGCATTCCATGTGATGATGAGTGATTCAGAAGTCTGCC TAAATAAAAAGTTTCATGCAAGAATAAAGCTGTTATATAAGCAGCGTTTC TTCTCAATACTGATGCCTATTTTTCTCTCAAAAATTAAGGACACCCCTGT GATCACAACAAAGTAGGTATCAACATTCCTATCACTTTGTTTTGTATCTT GTATGATTTGAACATTTGCTTTTATAGCCTACCAAAACATCTTATTTTTT GTAACAGAGGTAGTAACATGTTTCTGTTACTTTGTCTTACTCCCAGTATG TGTCAGTAGTATCTCCCTTTTTGTCATGTCTTTCCTCTTACTATTTCTCT GTAAGTTTGAGGTTATATGTGGATAAAATATGTTCTGTCGTTTCACTTGG AAGAATTGAAACACTGTAATTTTGTAACCTCAGGACTGTGTAGCTTCACT TAGTTCTGTATTATGCTTGAGTTTATATGTTAGAAGAAATTTACTTTGAT TAAAATTTATTGCTATTGGTAGGTGATGGCCTTACTCTTACGCTAGCCTT CGTTTACTAAAAACTGTTCCTGTATCTTTCGGTGCCTTCACTGTCGTCAA ATATCTTGAAGGGACTGAAAATAATTCATCCACTGCAGATTGGCATTATA TCGAGCATTTGGGCATATTATTTCAAATGCTCCAGTATCAGCAGTTATAA CAGAAGCCCGTCAGGTTTCTTACTTCCCAATTTGAGCATGCGCAACACTT TTCGGATCAGAGCATACTAATCGGCCCATTATTTCATCCTTTTTTTTCAG ATTTTGCTGGTGATGGTTGATATCTTAGCTAAATTGAGTGTGGATATTCA GGATAAAGATCTAGTGTATAGTTTGTTGCTTGTCTTATCTGGAATGTTGA TGGATGACAAAGGTGATATCATTTACTTTACTTTGTTACTCTATTAGTTC CTATCTAGTAGCCATTAATGCAATATTTGTGTTTAGTGTGCACTCATGGA TACAATCCGTTAGTTCAGACTGTTTATTTTCTTTTCTTTATTCTGCAAAC TTGGCTGTGATGTATGATGTGTTCTGATACTGAGCTCCTAATGTAACTTC TTTTTCCGTGAATCTCCTACTGTAACTTCTTTGATATAGTCGTTAACTGA TCATCTTATTCTTTGCAGGCAAAGAATGTGTTCTGGAAAATATCCACATT ATTGTTGGTGTTCTTACACAACTTGTTTCCTATCCTCACACAACGGTACA TTAAACGCTATTTATAATTTTAATATCCACTTTCACTCAGTTCCATTTGT AAGATTAGCATGTTCACAACCTTTTCCTTTTCTCCTGTAGGTTGTCCGGG AGACGGCCTTGCAATGTTTTGTTGCCATGTCTAGCTTTCCACACTCAAAA ATCTATCGAATGCGGCCACAGGTCAGTTTCTATTTATGCAGATGGTTCTT GAGAAATGTATGCATCTATGATGGCCCTGGAGTAACCATAGGTTGTTAAT TATTTGAATTATTATTTACCCATGGATAACAATCCTGTTACTAGTGGAGG TAACAGGGCCTCATGCTTCAGCTGCACACTTCAGCACATCTAGACAAATG AGATGACATATATATCTATCTTATGACTAAGTTCATGTTATTAGAAACTT ATTATAGTGTCTTAGAACCGCTAAAATTTTGAAATAAGCAAACTCCCTTG TGAAAAAAGAAAAGAGAACTCAGAGCAGAGTGGTACAATTCATGCAGGTT CTACGAGCAGCAGTCAAAGCCCTTGATGATAAGAAAAGGGCTGTCCGCCA AGAGGCTGTTCGATGTCGACAAACATGGTATGAAATCTATATCCTATTGG GAGTCAACAACCTTGCCTTATGAGCTGTTTCCTCTTGTTTTTCTGTAGGC AATCATCATTTGCTTAAGGAGCCATTCTATTGCCACAGCAACATGGTTTG GAAACCCACTTGATAAGCTGTCAACTCAATGCACGTACACGGGCTGTGCC GGAGCGTAAAGTGATAGAGGACAGTGTGGGTTATTCTGCCTTTGATATCC TTTTGGATTGCATGTCAAGTTGTGGATGGATGGCAGTTTTAAGATGAAAT CGAGTTGTGGATGGATGGCAGTTTTTAGATGAAACCGAGTGAACCGGAGA ATTACATGTCTGGGCATTGGGTTCAGTGTGGCCGACTGCTTTTCAGTAGG ATTATAGTTACATTTATAGGACTGCTTGGGTCTCTTTATGCATTGTATTT GTCTCTGTTTTGTACAGTAGCATTACCCAAGTAACTTGTCTGCGCATTGG GTTGCTTAGTTTCTTGTCTACAATGCATAGCTTTATTGCTATATTCGAAG TCTCTGTTGGTGAGCAAAACTTGTTGTGGTTCATCAAACTTGGTGAGTTT GGTTAACTATATCAGGAAAGTTTGATGATCGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.