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GrainGenes Sequence Report: AE023280

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Sequence
AE023280
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE023280
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAACCCAAGGCCAAGACCCTAACCCCAAGCCGCCACGCAGCCTCCAC
CCATCTCTCGTCGGCCGCGCCAGTTCAGGCGCGCCTCCGCCGTTGCCTGT
TGGCCGTCTCTGCCGTGCCCCCCGCCACCCCCGCCTCCAAATTATTCTCG
TAAACTCCCCTCGGCACGACCCCAGTACTACGCCGCGGCGGCCATGGGGA
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TCTTCCGCCCCCACCGCCGCCCCCTCCATCCGCTTCGCCCCCAAGGGCAA
GGGCAAGCCGAAGGCGAAGCCTAAGCCGAAACCGAAACCAAAACCGGAGC
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TCTCCCTTTTCACCATTAATCTCTGGTAGTTGACAGCATATTAGTTTGTT
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ACTGTCACATAATTTATTACAGAATTTACTCTTTGAAGTATTCATCAAGC
TTCTCAATGATATTTAACTATCTATCATTCCTTGGTAGAGCTGTGTAATT
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ATGTATACTTGCTTGACTATCACTGTTTTTAGTGCACCATAGGTTTCTCC
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CTTACCTACTTGTGCTGTCAAAAGTGCATTGGGCGCGGCTTGGCACATGG
GCGAGGTTCTGCTAATCAAAAGCCCTGCAAGCTACCCCAAGTGCTTTGTC
GAGCTGCACCAATTTCTAGTCTAGGCCCGTCAACTTGTGAATACTATTAA
TATAGAGGACATAAACTTTTTTTTAGAGAACCTTGATATGCTAAAATCAA
CGCAATAATCCACTGGAGTCATCCTAAGTGTCAAGATGCATCTCTCTTTC
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CGGCAGTCTGCACTCTTTTTATGTTGTGCTCATGTCTAGAGTTTGCCTTG
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TGTGCTGCAGAATCTAGTTCTGTGTTTGGGGTTGGGTAGGGGTGCTACAG
TAGTACAGTTTCTTCTAAACTTTTTCTATTATGCCAGCAATGGTTTTACT
ATATTTTTTGTTACATTTAAATGATAATTTGGAAGTTCTGCCAGAATGTA
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TAATAGTACAGAGTAACTTCAGCTAATAGTGGAACAGGAAAAAATACTCG
TATCTTCCTGTCGTGTCCCATCTTGGTTTCTGCTACGCTATGTGCATGCT
TGGTTTGCCTGAAAAAATTGGCTAGCCAATATTTGGCAATGACCAAATTC
GCCAAAAAAGGACAACTTTCTCTTCTGGAGATCAGTGCAATTTGGTAACC
AACCAATTGATAACCATTTTTTTCTGGCCTCACCAAAACATTGGCAAGCC
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ACAATATAGCACTGAAGCTAGCATATGTTTATATTCCATTTCTAGCTCTT
ATGCTGGTTCTTCGTTGGGCACTAGTCCAGTTTTCATGTAAACAATTTTT
TCTTCCCGAGTTGGGATGTTCTAATAATTTCATTGATATTTTGGTCTATG
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AACATTGAACTAAATGATTCGTTTCACTTTGTTTTGGCCAACTGTGCCAT
GAACATTAACTAAACCTTTAACCTGCAATGATGTAAAGACTAGAGGCTTG
TTCCTTATGGTTCTAGTGATTTATTAGATTGAGAGGTTAACTCTTTGATC
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AAAAGTTTGATTTGGTACTCTATATATTTGATCGTTCTGTTGGAAAATGA
TATACATGCAGTCAGATTAGGCTAGTACTGTTTCCTACACTGGTGACATT
GAAACAATTGCACCCGAATTAGTGATACTGAGTTTCTTAACTTTTTTTGT
CCCTAATTAGCTTCTTGTCCTTGTTAGTAACTGTAGTTCATAGGCAACCC
AATTCAAGAAAACTTTTACCTCCTGAAAGAACTCTGAGATGCTAGGCAAC
TGATTAACGTGCGATATTTAGTCATGTCATGGAAATGAACAGAATTGATC
CATTGCTTTGTTTCGCAGGTTCATTTAAATCATATTGATGCAGTGATGCA
ATTGCGACCATCGACATCACATCTAAATTCTGGTGGATCGCATACTAGGC
AGCCTTTACAACAGGTGCAAGCAAATGTTGTTACTGGCGGCTCAACGGTT
CCATCAGCTAAGGTGCAGCACTGGTTCTGCGTCAGCATTGCTACTATTTT
GTCCCTTGTTCATAATAAGTTTGATGAACATTGATTTGCCTTGACCAACT
AAGTTCATAATGGGTGTTGGTGACCAAAAAAAACGAGACCAGCAGGAGGG
AGGAGCCTCTGCGGTATTGTACTATGAAAGGACGAGCTCTAGGCGCTAAA
CCGAGGAGCCGGGGGCTTGAACTCTGGTCGTGGGTGCACGCGCAGAAAAT
ATTGCGTGTTGGTGACAGTGAACTGGCTTTGCCAACATAACAATCTCTGC
TTCCCATGTTACTCCACATCCATGGAGCAGCAATAAGAATAGCACTCAGA
TGATTTCTGTATGTTTTAAAATTATTATTTCCATTGGAGTTAACCCTTTC
AATATCAACTTCTGCAAGAAAAGTTGCATGTATGCTTGTATGGTCTTCGC
TCTCTGATGCCCAGTTGAGCATGTGCACCATCTGAAGTGTGTACTTTCCT
GCAATTACGAGAAAAAATGCTCTGTTTTCAATATGTAAGATTTGCTTAGT
GCGCATTTAATTTATAGCACTGAGGAGAACATATGTGGTCCTGAAATATG
GTACAACATGATCTGCCCCCCTATTGGTGTATATAGTGTTTTCCCTGACT
GATGTGTTTGAGCATCGTATTCTTTGAACTGCCCTGCTTACTTATGTAGA
GAAGGACTGCAGTAATGTTAAGACTGTTGCCTTTTTGCTGCTAGCTCTGA
GCATCTACTCATGCCCCCTTTTCTTGTGCTCCCAGGGAAACGAGCGCTCA
GATGGTTCCAAGGACTGTGCTGAAGAAACTGAGGTTTGTAATAAGAATAT
TAGTTTTGCATTAAACTTTATCTGCCTTTGTTACATTCTAGGCTTTCTGT
TGGTCCAGTTTATTTTTTGTTCTATCTTCTATGTAATTCGGGCCTTGTAG
TCTTGGTTCTTTCCAAAGTAAGCCTTTACCGGGTTTGCTTCCCTCACTGT
TTTGTTTTGACATTATGCTATTTAATTTTCGAACATATTCAGGCTTCCTA
GTTTCCAAGGTTGAACTTTTTCCCGGGTGTAAACAATGTGCGGCCCTAGA
TACTCAAACATCGGCTAGAATGACTTAAGCTTTGTTTGGCATTTGAGGTG
GAATATGGTAATACTGTTAAGTGGAATCACTTTGAGATACCTCAACATTT
GTCTACCTGGTTTTGTTAAAATTCAAACGTTTTTAACAAGTGTTACTATT
AGATACATGATCAGGTAAGAGCACAGCAGTAAATTTTGCTACAGTGTCCA
ATGCTTTTGGGAGAGGTAATTAACGTATAATCGAATTTGCGAAACAGGAC
ACTAAATTTCCCACAACAGCCATAAACAAGTGCGGCATATCTTATGTTGC
AACTGTGTCCATTGCTTTTGGGAGAGGTAATTAACTTGTAATCGAATTCG
CCAAACAACATGTCATAGTTCAGCAACAAACTGGCCCTTGACATATCTTG
TAGGAGGGTTTGCAACATTACTGGCAGTGTCAATGCCAACTCTTGGTTCT
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CTTGCCTCCTACGGTCCTACCTGGTTGTTGTGACACGTTTTTGTGTGAGG
TCGGATTGATACACTGTAAGGCCCATCCTCTCCGGTAAGATCGTCTAGGG
GTAGAGGAGCCAGTCTTCGACTATGTCTGGAGTTGGGTTCTGTCTGGATA
GGGTAGTTGGACAGATATGCATGCATAATGTATACATTTGGAAAACACAC
ATCGTACAAAAAACACACAAGACACGAGGTGAACTAAATATAAGGCGTAT
TTTGTCCGTTTAAATTCATTCTTTGACAACAAATTACTTATACAATATTA
GTCAATAGTTATAGAATCACGATAAAATGAAGTGCTTTTGAATATGAATC
TAATGGTTTCTATTTTGATATTTTCTGTAACATAAGCAACATATTATTGG
ACTAGTTGTTGGTCAAAGAATGGATTTGGACAGTGAAATTATGCCTTATA
CCCACAATTAGTAGTGATCATTTCAGTGTCTTCTTTGTTCTTACCATACA
CCATTTTGTTGTTTAAACTTCAGAAATAATTGATATGCTTTTTTCGTTTG
TCATTTCAGCCATGGATCTCACTCACTTATGAACCAGATGGGAGTGACGT
TGCAAGCAAGTACCATACTGAGATGATAACAAATGACGGCAGGCCTATAG
ATTTCACAATGAGCACGTAAGTGTTGTGTTAGTTGTTCATGATGTTTTGT
GAGTAACATTGTGTGATTTTGCAAAATATATTCATAGTTAGCACATACAT
AAGAGAAGTATATAGACTTGGCCTTGGCATGTGGGAGAAGAGTGCCTGAA
CATATGGCCATGTAAGCTGAGGCACCGAGAATATAATATACCACAGATCG
TTCTGCTTGTGTTGTTTGAGCCTGATTTTCCCACTGGCCGTCGAATTCAG
CTGTACAAAAGTTGGCAAATATGGGTTGCCCGATTTTCACGGATTGTTGA
AAAGAGATTCAATGTTGTTAGGTTAGGGTTAGCAATTACCGTTTTGAAGC
ACTGCTGGCAAAATCTGGTCAAAATCTCAATTATTTGTTTTTTTGAGTTA
TTGAGGAATCAAACTGAGAGTAGGAAAACATCTAGCCACATCATTTACAT
TGTTTTTGTTACTTTCTGTTTTGTCTTTTTGCAAAGTTGGCTCTAGGACA
CTGTTGTTTTGTGTCAAGACATTTCAAAATATAAAGTTGACTACAAAATC
CATTTACCAGAATACACCATTGATTATGATGACTATTATCGAAAACATAC
ATGTGATACTCTCCTCTTTCTCCCTTGTCCCACTGCTATGCGGAACCCAA
ACGGCATGAATTGTTTTCGCTGCCTCTGCCTTCTCATGTTCCAATAAAAT
CTGAGCACGAAAAATTCTCAATAAAATTCATAGATCGGAATTTATTGGAT
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CGAGGTTGAGTTCTCCACACTAGCACCATGCAGTGCATCTCCCATCGGCT
GGCAGGAGCTCATGCATCTCTTTGCTGCCAAGCCATGAACATCTTTCCTA
CGATGACACTGGTGCTCATCCATGGCGCACCAAAGTATTCATCCCAGGCT
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GCTGATATTTCCTGTGATATTCACACATTAATATTACAGGAACAATATTT
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CCACGTTTTACAGTGTGTCTGAGCAATTGGCACAAAATAACAGTGTCCTC
GAGCCAATTTTGTGCTTAATATCCATTTCTTGTGTTATTATTGTTGTCAG
TGTGCTTGCTGTTATGTGTTGGTTCAGCACTGAGAATCATTAAAATGGTA
CATTTAATTGTCAAATATGTACAACAATTATCCTTTTCTTTTACAATGCG
AGTGCAACTGACTTTTTCTCTTGTAACTTTCAAATTTATTCTTCAGATCC
GATTATGCAATGTCATTGTGTCCTGGAGGGCCGACAGGCAGCAAGAATAT
TAACAGATGCCACGCGATAAGGTGCAGTGCACATAATTTCCTCTACCAGT
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CACAGTCAAGGAGGAACAAATGAATTTGTCACAATAGGTAGAGTTTTGCA
GAGATCGATGGGCACTCTGATTAAGTGGTAGTCAAACTCATTGTGAAACT
TGTGAGTCAGTACTTTGCTTCAAACTGAATCCTTGATTGACTATTTGTGA
CTATTCTGTGAGTTGGTATCCCAAGGACTATCTCGACTCCAAATAATTGG
TGAGTAGGGATACAAATACATTAGTTATATAGTAGGAGTGACATTGATAT
GGCATGGATTACATTACAGCAGGCATGCATGTGCACAACAAAAAATAATA
ATGATAATGCAGTATTAATGTGCTAATATCTGGTTAAGGTTAAAAAGTAC
TTTCTCCATTCCTCAATACAAGATATTTTGGCAAGCTAAAACAGCATACC
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TACTTTTTGTTGGTCAATTTCTATTTTTTTTAGTTCATTCAGTGTTTGAA
CATTTCTTCATGAAATGGCTTCTCTCTTTGCTGTTCAACTTAACAGGTAG
TCTTGTTGAGAAAATATTGTGCCGATGAAATGATTCTTTTTTCTCTGATA
CTAAGTAGCATCCAGTGAGCTGTATAATTACTCAGCAGTATTTTATATGC
AAATAATCAAAGTCATTTAAGGATTTGTTTTGTGTTGTCATTAAAAATAG
TTAAGCCCTAGATCCAGCGAGAGAGGGAGGGAGAAAGACGAGTTATGCTG
TGATTCTTCCGTACCCTTTATTGGTAGATTCGACACCCTTATATAGTCAT
AATTCATAAAGGGGTGACAACTAAAGATATATCACAATTTGATATAGAGT
CTGTCGAAGCTAAACTATATTTTCCCACCCTAACTAGTCACACAATGTCT
TTTTTATCTTGAACTCAAAAGTCCTAACTTGATGGGCACGGGGTTCAACT
AGAATCTTGAAAGGCCTATTTGGAACGTGTATACTACATAGTTCCATATC
ATTCATTTTCTTCCCCATACTGTTTAACTTAACTAAGATGTATTGTTCAA
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CACTGACATGCTCCCGTTTTAATGGATGCTTCCAGTTCTGAGATAGGATA
GAAGAACAAAATGAAAAAAAAAAACGTAATTGTTTTCTGACTTCTGTTTT
TCTCACTCACTTAATTGAATCAGGTGTCCCAAGTGAATCGATTTGATGCT
CTAATCCATCTTGCTCCAACCTATTCAGAGGAAGACGTTTTGAAAATTCT
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AAAAGCTTAAAGACTATAAATTTATAGTAGCGGCAGATTCATCCTTCATA
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CCAGTTATGGGAAAGGCCAGGGATGGCCTTGTTCAAGGAAGTGAAAACCA
TGTGCGCTCTGTCTTGGATAGTGTCTTTGCTGCCAATAAAGTTCGCAGGT
AATTGTTGAGAAATTAGCTGGTTATCTTAATTTTATCCTGTCTGTTTCAC
TTTTAGATTATCTCAGTTTCCAGTTTGTTTATACCTTATAAATTTCATTT
ATTCATATTTGTATGACAATAGAAGGAAATTATGCATCTATCTAGTGCTA
GTTGAACTGTACTCTTCATTGTCACGGTCAAGATTATTTAATTTAATGTC
ATATTAGCATGTATCTAGCCATCTAGTTGTTTGCTGCCATCAAGAAAATG
TGAGTATTGTCTATTCTTGTAACTAATGGTTTATGTAGAGCACTCAGTGT
TGCGGTCATTGCTTATGCATATTAGTTTGCATTGAGTTATACCTATTTTA
GGCAGGGGAGAATGCTGTCGCGGCGCAATAATGGCAATAATGGCAGGGAT
GCTCAGGGTGTAGGACTAAATTTAAATACCAAGCCCTTTGCATGTTTAAT
AGAATTCACAGTAATGCTACATATTTTTGTATATAATGATGATTAGACAC
CTAGGTGCTAAAAGCGAGAACCTTCAGTTGCATGAAGATATTCTAGCCCA
TGTGAAGTTAACTTGTTGCCAGAGAGCAAACCAGCATTAGAGCTGTCAAA
TTAATGGTGTCTTGTATATGCGCTGTTATATCTATTGGCTGTTATTACAA
GCTTTAATACCTCATGATTAAGTATATATGTTTCCAATCTGTGTTTTCAG
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TGGGTGCTGTGATCACTGCAGCTTTCAGGCAGTAGTTAGAGACTTGAGGC
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AGAAGACTGAGGAGAAGGCTACTATGCGGTACTGCAAATTTGGAAACTGC
ACTGAGTACCGTGTTGACAATGACAAAGCTCCATACTTATTTACTTTTTA
TTTGCAGAAATGTGCTCATTAGGCTCTTCATTGATAAAGGACCCAATGGA
ATGTTAAAGAAGCAGGAAATTCTTGACTATGCTACGGCGAAGTTTAAGAG
AACAATTAGCGACAAAGAGTACCATCAGGTGTGGTCTTAAGTTAACTATT
CCTAATTTTGCACTACTGCTGCATAATTCTTCTCTGTGTTAGCACTTACT
ACCTCCGTTCCACAATGTAAGCCTTTTTAGCAAGCTGTTTTAGCTTTCTA
AAAAGGCTTATATTGTGGAACAGAGGGAGTATTAGTTACTGGGCAAGCAA
GAAATTGCAAGAAACACCTGACCTTCAGAAAGCTTTTTTACTAAAGAATG
CTTATTTTGTATAAGAACCATTATTAGCAAGTCTCAAAGACCCCCCACTC
TTTTTTGTACTGGAAACAAGAAACAATGAGTTAAATGTATAATGTGCTAG
TTGTTAAAGTGTGTAAGTGGATTGCACTAGCACTTTCCATCAGTTCGGAC
TTTTGGTTGTGTTGGCTAGTGCATGAAGCTTGACATGGTATTAGAGCCCA
GGGTCTTGAGTTTGAGTCCTGGCTTTCACAATTTATTCTAAAATTGTTGC
TGCCCCCTCGGTGTCCACGTATAGGCTTCTTGGGCCATACCTCTGAGTCT
ACACGTGTTGACTTGTCTTCCCGTCACACGTGAGAGGTGGTGTTAGTGTA
TAAGTGGATTGCACTAGCCCTTTCCATCAGTTCGGACTTTTGGTTGCGTT
GGCTAGTGCATGAAGCTTGAAACTAGTAAAGGTACCAATATCACAAATGT
TACTATGAAGAGTCATTTGGCAAGCTCCATTGATGTGGTTGGAGATAGGT
GAGGGGTTCCAGTTGGTAGTTGGTGAGTGCTTGTGACTAGTTGGTGAAGT
GGGGCAAGGTTAATTATAGGGTAGTGCCTGCCGTGGGTGGTGTCATGGTG
GATAAGGTGTGTTGGCAGTAACTAATAAATTAGCATTAGCAGTGTACAAG
TTATGTACTCCCTCTGTCGCAATATATAAGACGTTTTAGCAAGCTATAAC
TAGCATTAGCATTACAAGTTATGTACTCCCTCTGTTGCAATATTAGTTCT
CTAGGAGATCTCCAATCGTGGAAGTTCCTATGAATATTTGGTAGGTCTTT
TTAGGGTTTTAGAACTGAATTCGTAGGTGTGAATAAACGTTTCCCATTTA
CTGTTATAGGTATCATACACCCTTTTTACCCAAAAAGTTGCACTTAACTA
CAGAAAGCAATCCAATTGGTTTTAGAGAACACAATTTGCGATGCTGCTGG
ATCATGTTTATGTCCTTGTAATCCAAAACTGTGAGCCTGATCCTTCCTAC
CAAACGATTCTAGTCGTCGCCCCCCCCCCCCCCTTCCCCCGGAGTTCTCA
GTCCCATTTTTGCATAGAAACAGTGTCACCTGTCAGGTCTACTAGTTGTA
TGCTGTAGCTGTTTAGCTTACCTATCGTGTAGGATGTTCTGGCATACAAG
AAGGATTACTACAAGTGTAATTCTGTGGTGAATTTCCTAATTGCAACAGT
AGTAATAGTTGAAAATCACATTCCTTCTTATTTCTGGCCAGAAAATCACA
TTCCTTCTTATTTCAGTGAAACTTTACCTGCCAACGTTTTTCGCAACATG
AAATTAGGTGTAATTCTCCCAAACTAATCGGCATTACTGTACTTAATCGT
TATTCTGAATCCTGTTTGGATGGCATATTCTTGCGTAAGCCTGGATCCAA
TGTAGGCATGCAGGCGGACTGTCCAACGGACAATGCGGACAGTCTGCTGG
AGTGCAAGCAAAGGTAGAGAACGAACCAATTTAGAAAGGAATTGATTTAG
TGATTAAGTGTAAACAAATTAGGTGGACAGGCCCGCAAGGTTTGCCAGGA
TGTCCGCCTGCATGCATATTCCAATGATCATCGCAGGCAAACCACAAATA
AACTGGATGAACTATGGATTCCAATTTTTCGGAAACTCCAAACATAGATA
AATTTGGTTTTCTTGAGAAATAGTTTTTTTTTCTTGGTAACCTGAATTTA
AGCCTCATGGGCTACCCCTAGTCTATTCACAATCTTTTCTGCAATTCAAC
AGTAGAGTTAGAGTTCAACACATGGTAGTTATGGGGCTACTGGGCCAAAC
CTGGACCATCGGGCTAGTTTTCCTATATTTTCATCCTGGCTGGGATTTCT
TGGAATGTCTGTTTATGGACCATTTTTACAACATCTTGTTACCTGTAGGC
GGTGACTGAGATCTGCATCACAAATGATGAAGGACATCTGGTATTGAAGA
ATGGTGATAAGCCCTGAGTTTGTTATGACAACGATCCTTGTAAAATGTCC
AAAAGTGTTTCCTGTTTCTTGAAATGGCAGGTATGATTTGCTGCTCCACT
TTGACAAATTTATGTCAAAAGTTAACCTTCATAAAAGGGAGCCAAGATAT
TACCAAACATCTTTGTAGATTGTTGTGCTTTAGTCGCCACTTTCCCTGTT
ACCAGATAGTGATTTGCCACAGTTTTAAACTCCATTGATTATTTTAAACA
GAACCTACATTGATGAGTGAATTGTTATTTTAAACCAGCATTCTCTTAAC
TGGCTTCAGTAGTCAGCTGTCATCTTACCCTTTATTTATATATTAGTTTG
TATGTTATGCTCCTCTTTGATCACTTATTACTGAAATGTTTATGTCAAAA
TAGAACCAGAAATTGCTACCCCCCCTCCCTGCGTCTGGACTGTCGACATA
GTCATGTAAATAGTCATCTTACCCTTTATTTATACTCCCTCCGTCCCAAA
ATAAGTGATGTGGGTTTATCTAGATTTAGATGTATCTAGACACGTTTTAG
TATATAGGTACATGTGAATCTAGACAAATTCAAGTCACTTATTTTGAGAC
GGAGGGAGTATGTTAGTTTGTATGTTATGCTCCTCTTTGATCACTTATTA
CTGAAATGTTTATGTCAAAATAGAACCAGAAATTGCTACCCCCTCCCTGC
GTCTGGACTGTCGAGATAGTCATGTAAATACTTAGGAAATGTATACCAGG
ATTTGTTGTTTCTGGTTGATTTTTATTTTGGAATATCATTTTCATTTGAT
TCTATAATAATATACTGATTCCTTTTTTTAACAGTTCTTGAAGGTCACCG
TAGTCATGGAAGTTTGTAAATAAACATTCGAGCAAGATACATTCTAGTCT
TAGGTCCTGGTGTGACTAAACTCTTATGCTTTTGATGGACCATTGTTCTC
ACTCTGGTTTCCAGATCATCCTTCTCTAGGAAATTTGGTTTTAATATATA
CAATTTTATATTTCATTAAATGTCTGGAGAATTGGTGAGAAGGGTTGTTG
ATGACGTTTTCACTTTCGTACTTGTAAAGTGGATGTCTATTGCCATTATT
CTAGTATTTAATTTGGAGTAATGAAGATTCTGTATATTCGGCGTATTTAA
TTTGGAGGATACGCATAGAAACGACAATTACTCAACGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.