Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE011308

[Submit comment/correction]

Sequence
AE011308
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE011308
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAGCAGAACCCCCCCGTTGCCACCGTGATCCCGCGACCGCGATGTCGTC
GTGGCTGCGGAGCGCGGTCAGCAAGGCCGTCGAGGCGGGCGGCCGCAGCG
GCGTCACCCGCGCCGTGCTGGGCTACGCCGACGCCGTCGCCCACCACGCC
GGCCAGGCCGTCGCCGAGGGCACCAAGATCCTCAACGATCGCATGGTGAG
CGCCCCCTTCCCTTCCGCTTTGCTGCTGCCCCTGCTCCCCCACCCCCTCC
CGGAAGCCCCCTTCGGTTTCGTCGAAATCCTTGCTGCCTGTCGGGGAGGC
GCGATGCGAACTGAGAAATTAGCCAGTCAAACGCGCGATTCCTGTGCTGA
ATACCTAACTTAAACGCCATTTGAGTTGTCATGGTACTAGTTTAATCTGT
ACGGATTGCGGAGATCTCTGAACAATGGGATGATTTAATGTCCCACATGC
GTTGCCACAAAGGGGGAGAAAGGTTAACACGTTTGGGGATTTGGGCTTTT
ATCAGGCTTTTTGACTTTACGGCTCTGGGAACAGTGCGTACGTACTTGCA
ATCAAGATATCAAATGCCCTGGCCTTGAATCCTGACGATGGTCATGTGGA
ATTTGTCCTAAGCTGTTCAAGTGTGTTAATGTGATCTGCAGAGCATGCAG
AACTACAAAAGTGTGAAGAAGACAGTGAAGCGCCTGGAAGAGGCGGCGGT
TTCGGCGCGTGGGGACGAGAGGGTTCAGGTGCTAAGGCGCTGGCTCAGGG
CGCTCCAAGAGATCGAGGCTGCACTCGGAGGTTTGGATGGGAGCACCACG
CAGAGTGCCTCTTCAAATGAACCGCCGACCATCTCGAAATCACCATTAGC
AAGAGTATGCACCTGCGCGTCACATTGCCTTTTGTGTGTCCGTTTATCCT
GCTCTATGTCTGCTATGCTTCATGTCTTCTGACGTCGATTCTCGTGCACA
GGTTCTGTTTTATGATGCTGACATAGGAGGAGCTCCTATGAACTTCCGAG
ATGTATTCCTCTATAGCCAAGCACTCGAGGGTATTGCATTGTCCATGGTG
AGTTGGTTCAGCCATGCTATCCTGGCTGTGAAGATAACATCTAGTACTTC
ATCTGACTAAGTAATTCATTTTTTAACTGACCAGCTTGAATTTACCATTA
TGTTCATCTGACTAAGTAATTCATCTAGCATTTTTCATGCTCAGGTTCTT
GAAGCTCCGAATGAAGAAGAGGTCTCCCTGCTTTTGGAAATTTTCGGGTG
AGCTTATTGTGTACATGATCTACCTTTATATTTAGTGGTTAGTGTTGCTA
ATTTTATGATATATTGATCTAATAGGTTTTAAATGTCTTTAAAACCTCAT
TTCCGTTTCTGCTTAGTTGGCATAATATGAATATATGGTTATTTGCTTAA
ATACTGTAGTACAGGAAAAAGAGCATCAGAATTGTATTGATTATGCTAGT
AGTTTCGTGGTCCAGATGAATTATACAGTATATGATCTTCTGAAAAAACC
GAGTAACTTACTGCTTTGAAATTTTATGGATTGTTTGTATACTTTAGTGT
TTAACTGTGAATTTCATGGTTATTTACGAGATAGCATCTGCAAAGTGTGG
ATATAAGATTCTTATTTTATTATTATATGTTTATTTGGTCTAAATACTGT
ATATTCTTCCTGAAAATGCACAATTAAGATAACACTTTCTTATGGTTTTT
ATGTGGTGTTACTATCCCTGAGAAAATATGCTTGCTCGATAATTCATGTA
ATGAAATCATGGAACAATATAAGCTAGTTATTATAGGTTTCCCACATATT
CTGAACAACCGCAGCGGTTGTGAAGGCCTTGCATGCAGTGGCGAATCTAG
GATAAAATCACTGGGGGTGCTAAGCTCAAAAAATTCCCCATTGAGCTTTG
CATTCAGTCACGAGTAGTCCAAATATACTACTAGCTAAAAGAATTTCTAT
ATTTTTGGAGGGGGTGCCATGGCACCCATGGCACCCCCACTAGATACGCA
CTGCTTGCATGATTGAGTTTACTGCTCCCATTTTACTGAGTGTTTTTTTA
TCTCAATAACCTTTCCATTTTAACTATTTGTCATTTCCTCTAGTCTATGT
CTTACAGGAGGGAAAGAAATCAATAATGCAATTATGAGCAGTATACAAGA
CTTAGCAAAATCATTCTCAATTTACCATGATGAAGTCTTGGTACGTTTTG
TTGGATGTCTTATACTCTTATTATGCCATCTATTTAAATTACTAAATCGG
CGTGAAGCTAAAGTTACAAAGTAATACTTTGTACAGATGAAATGTGGTTA
TTCAGAGTATGTAATGTATCTGACAACAAACTTGCAGTCTACAACTATCA
TTCACACATATATATACTTGATCTCTTCTTCCCCGCTGTATTGAGTTTCA
TTGTCTATTTTATCTCCATTTCTTGCTTACTGTTGAAATGGTAGAATAAT
ATATCATAGCTTCCCCCTTCTCTTTGTAAGTACTCTTGAAATGGTAGAAT
AATATATCATAGCTTCCCCCTTCTCTTTGTAAGTACTCCTTCATCCTTTT
TTTTTCCACAATATCCTTTTTGGGTGATCTGTGTTCTACACCACACATGA
TTTGTATCACCTTTTTTATTTTCATAACCGTACAAGACCCCTAACACAAG
GGGTAAGTGATGTGTTATGACTTTGTTATTTGATTAGACCTTTTTGGTTT
CTTACGAAATAACAATGAAAATGGACCAATGGCCATAGATGATGAAGCCA
GTCATTTGATATGTCAGACTGTGAGGCTGTGACTTATTGCTTGAAGAACT
AGAGCGATAATGTGATGATGCATTTCTGTTCCACTGTCGCTGGACTAGGG
CTATTCTCTTCTATGGAGAGAGGACATAAATTGTTCACTATTACCCATTT
TGTATGTCTCTCCGTTAGGAGAAATTTGATGTGATGCACAAGTTAGTTTT
GAGAAATTTGACTTATTGTAACATATTATGCTCCTTCACATATATAGGTG
AAACGTGAAGAGCTGCTTCAGTTTACCCAGAGTGCTATTTCAGGACTAAA
GAGGAGTGCTGATATTGTGAGGTGAGCATTTATGTACTAACCAGCTGTCA
AACTCTGATTTTCTTGCTGATTTTTTGCGTCTTCTGAATATTGTTTGCTA
TAATGAATGTACACCATGTATTTTTGCAGTAATTGTTTCATAAATGTCAA
CTAAACTGCCAATGATGTGAATCATAAATCTGGACACTCGTTTTCCTTTT
TTCTGTTCCTATGGTGCTTTTCCCTCTACTTTTGCAGGCAATGGGTAGCA
CTTCTTTTGTTGTTACTCTAATATGTTAATTTCGCTTCAGGATAGATGCT
GAAGCCATAGAATTGTGGAAGAAACTAGGTGAGAAGGAGGCATTGCGAGT
TCAATCAACTCAAGGTCCAGAAAAAGTATCGGAAAATACTGCTGTTGCAA
TCGTTGAGGTGTTACATATTCACAGAAGTTTTCTTGATTTACCTGAGTTG
TCACTCGCCAGATTTGCACAGTGCACATGTTTAGCCTGAGAACTTGAACT
ATTTCATTAGAGTTTCTTATTTCATCCTACCCTATTGAGCGAATTCTGGT
CAGGGAAGCACACCTGGCAGATAGATTCTCCCTGAAAACAAATACAAATG
ACTAATTGACTATACAGAACGGAAGTGCCAACCATGGTTTCACTGATCAT
GTTAAATATGCTGACTGCATCTGTAGGCAATAGTTCTCTTCTAAACAAAG
TCAGTAGTTAGTGTTACATGTTCAGTTTGTTTTGACATGTTACATGTTCT
CCCCTCTGGCCAGTCTTTCAAGGAAGCACTCACTGAAGTCCGGTTCTGCT
CTAGAATGGAAGACCTTCTACTGAAGAAAAGATCATTTAATGCTGGGGAT
TCCCCAGAGGTCCATTTCCAAAAGGCATGTATTTATGTGATCTATATATC
AATGTTAAGCTAGACATTTTTGTGTTTTGAAATTAACTATCCTGTTTTGG
ACAATGAAAACAAATGTAGTTCACATGAATGAAAACACGCATGCATTTTT
TTGGAGAAAGTAGTACTCCCTCCGATCCATAATAAGTGTCACTCATCTAG
TACAAAGTTTGTACTAGCTTAGTACAAAATGAGCGACACTTATTATGGAT
CGGAGGGAGTACTTAAGATCTCCAGTAGGGATATCTTTTAATGTTATGCG
CTGCAAAGTGCATACTTCTACTTTTTTTGTTCCTAGAACTTCATCTGTGA
ACTTAATTAGTACTAAAATAATCGATCTGATGAGTCATGGGACTATGTTA
TATTTTATTCCTTCTTATATATATATATATATATATATATATATTTACCA
ATGAATAGTTGTATACTATGCACTATTACCCATATCTGTTGGACGCTTGG
ACGTGACGACTGTAAAAGTTGATTCTTCTGCTAAAGTTTCACACATGTTT
TGTGTGGTTCCAAAGGACCAATTACCAATGTGCATTGTTGCCACTGCAAT
GGTGTCATCTTTCGTGTTACATTTTAATTAATTTAGACTTCTGATATTGA
CTTGGTACTCAGCATCAACATTGTTTATATATGCACACTTGGTGAAGCAT
GGATTGCAATAACAATACCATTGGGTAAACTTTGCAGGTTGACAAACTGA
AGGTCTTAGCATCTTCCCTTGCTAATTCATCCTCCAAAGCAGAGAAGCGT
ATTGTGGATCACAGGTGGAACTTCCATACAATTTTTTCTATATGATTCTT
TTGATGCATACTTTGTAAATTCATGTTCCTTTATCGATGATCCATTAAAG
TTTATGTTTTTTCTGGGTGAATTCATAAACTCATAGACCATGAAATATCT
GTCATGTTGCTCCCTATTATGGTTGTGTGTTCTTCTCGATTTTGCTGGTG
CATTTTTGTTTCGAACTATTCCATTCATTGTACAAAAAACTTTGAGGTGA
ACTTCAAATTTTATTTTGCATGCTGCCAGACGCCAGAAAGAGGAGGCTCT
TAACTTTCGTGCCAAAAAGGAGATTGAAGTGAGTGCAGTTGAAAAAGTAA
GAATCCTAGCTCATATGGTGGTATATAATATGTTTGTACTCCTATATGAA
CTCATATATTAGAACATTGGACTTTTGTTGTGACTAGTAAAAGTGCCTGT
GCGTTGCACTGGGAAGACCGATCCAATTCACATGGAGAATTTTTTTGTCT
TGCCTCATGACACCGGTCTCGAGCTAGACGTTTTTCTTATCTTGGCCGAA
CCTATTCACACCGGTTACGGAGCTATGCCGCAACTTAGAAATTATTTCTA
CTACCTATATTGACATGATTTGTAGATTTTCAGATAAATCATATTCCAAA
ATATAGTATCCTAACACTCGTACTGACTTACGTAAAAGAAGACAGACGTA
TTCACTTTGCAGACGCCTAATGCGGAGGGCGCATGCAGATTTTTTCTTTT
TCCAAACCCCTTTTTCTTTTTCTGCAAAATAAAAAATAGAAAAAAGCAAA
GAAAAGAAAGAAAAAACGCATATGAGCTCTCACCTAAGAGTCCAAGTAGT
TTACTACTCCTAACTTGCAGGTTGCAGCCCCTAATTTTGTCCTTCGGAGA
GCCATGCGCAGTACTAAGTTGTGCTTACATATGCTGCTTAAAAAAAGATA
CTAAGAAAATAACTGATACGTGATACCACGTGAAAGTCCATGTAAAAGGT
AATAGATAATGCATGAGCCCAGCCGGCCATAAGAATCCGATTAGCTTACT
ATCCTAACGAGCATCCTATATTGATTTGGTACGTGTTCTCCTAGGCATGC
CCCTGCTCCTTCGACCCACTGAGGTGGCCCGACGAAAGAAAAAAAAGAAC
GAACCGTTACCTGACTTATGGGTGGCATTGGTGGGTAATATTTCCAGAAT
TGCAGGGGTAAAACCGTCCAAAAAAGTGTAGGGACGAGGAGAAACACTCC
GTACTTTATTATTATAGGTATAGATATAGATTTCCCTTTAGCACCTAGTT
TCAGCTATGCACTTTTTGGACACTTCTCTTATTTCATGACAACTGCATTT
AACACCTTCTGTAAGGAAGCCATTATGCATGTGCACAGTATCCTTGGGAT
AAAATGCTTCCAACAAGTCAAGCTCGAACCAGCCAACGGTGGAGTTTGAG
GCTAGAGTTAGGCTCGAGCTCAGCTGGAGCAAATGGAATGAGGTTGAGCT
CATCTCTTAAAAGCTCAGCAAGGAGATCACGTATATAATAAATGAAGAAA
ACGACTTCCACTCTGAGCTCAGCTTGTTCCAGTCCTTTAATTTCCACAAT
TTCATGGAGAAAGTTCACTCCGAACCAATGGACAGAGGAAAAAAAAGGTT
TCTCAAGAAATCATCAGCTCTTGGACAAATGCCTTAAAAGGATATTCAGA
AATCCACATATCCTATGAACTGTGTTGTGTGCAATTTGGTGCTGTGGCCT
GTGCTGCTACAGTTCGATGTGGGTTTAGCTCCAACTCTGTTGTACCTCAA
GAGACACATCAACTGGAGAAGACAATGAGAAGGATAAGGAGGGAATTAAA
GATGGACTCATGGGGTCCCGTGGCTGCTAGGGCTAAAGTTTGCTCACTTG
TTGTGACTGGGTTTGAGCTGCTGACTGCTGAGTCAGGCGATGAGCCAGAA
GAAATGAAATTTGCACATAAGATGGACTATTGGAGTGAGGTAGCATCAAG
CCACCAATGACCATTCAAGTAACAGAAAATTAAACTTGAGCATGCACACA
AGCTCTATGGAATAGCTTGTTAATTTTGAGCTTGGGCCAAGCTTGAACCG
AGCCTAGTTCTAGCTGTGGACTTGAATAGTTTGTTGAGCCTACATTTTTT
TTACAAGGCTATTAGGATGTCTACCTATGTTGTGGAGAATAAGCACTTCT
TGTGCCAATGCATACATGGCACACTTTTTGAGAAAACGCAAAGAAAGCTT
TGCGTTTCATTTCATTGAGAACATAGAGAAAACACAAAGAAAGCTTAGGA
TGTCTACCTATGTTCGCTCACTTGGAGAATAAGCACTTCTCGTGCCATTT
ATGTACAACATGCAGCCATACATGGCACACATACATCATAAAAATGAATA
CACGGATAATTTTTGCTTGTTGCATATTCTGCTGATGCTCCAATCGAGAA
ACATATGTTTATTGTGTCACTGATATAGGACTTGACTGCTGAGATTTCTG
AATTGGAGAAACAAAGGGATGAACTCGAGGCTCAGTTGAAGAAGGTACCT
TACTTTTTCCTCAATCAAGATGTTTATTATTATCTTCATGTTGACTTTGT
CCAGTCCTAGGTTTGACATGGACACAGATGTACCATCCATTGTTCATTAG
TTGCCTTTAACCCATAGTGGCAAAGGCCTGATACAGGTTATCTTAGAATT
GCAACGTTGTAATAAAGGTGTTTACCAGTTATCTTTACCGGTTTGATAAT
TTAAAAGTATCCCCATGAACTTTTCTTTCGTCTTATGGATAAAAGAGTTT
CAGAAGAGTATGCATCAACGAGGATTTCCGAAAACATGAATACTTTCCCA
CACAATGGAAGATCCTTTTGTTCATTATAAACTCCTTCTGGGCCTTATCA
ATCTCATTATTTACATCTCTATAGAGTAGATTGTAAATGCCAGGTGTCCC
CCTGATGGAGTCCTGTTATTAATTTGCCACTGGAAGACTTTAATTTTAAT
TTTGAGGTCCTTTCTCTGTTTCTCCAATAGGTCAATATTTCACTAAATGC
TGCTGTTGGACGGCTGAAGCTAACGAGAGAAGAGAGGGATCAATTTGATG
AAGCAAACAACCAGATGATCTTTAGCCTAAAAGCAAAGGTGCTGTCACTT
TTCTGATTGACCCATTTTTTGTTTTCTTCCTGTAATATTTCACGAGATCA
ATTTTCGTTGTTTTTGTTAAGTATTGATGAGCTTGTTGTTTTCTTCTCTC
GCATTAAATCAGGAGAATGAACTTTCAAAAACTATTGCCTCATGTAATGT
GGAGGCTGGTGTAGTCAAGACTTGGATCAATTTCCTTGAGGATACCTGGC
AGCTTCAGTCATCATATGATGAACAGAATGAAAAGAAAGCAAAGTATGTA
GTGATTATCACATACTGACCTCGAACTGCAACCATTTTGTAAATCTGTAA
TTAAAACTGGTACTGCATTTCTTAATCAATCCAGCTTTATTTTTTGGTTT
ATGACTGTAGTGATGAATTAGAGAGGTGCACAAACAATTTTATGAAGTTG
ACGAAATACCACCTTTCTACATTCAAGGTACTTGGTTGGACATAAATGTT
GAAAGCCCTTGCTGCATCTAGCAAACACACTAAACAATTATAGTATGTCT
TTGATTCGCTGTCTTGTATGCATCTTCTGCCTTGGACAGGAAGTTCTGAG
CCCATCGATTGAGCGGATCCACACATACGTGGATAATTTGGCGGTCTTAA
ATTCAAGGTTGTTCAGTTGTTTTTCTTGAGACTTCTCATATACTCATGGA
GCATCTTTTTTTATACAATTATTATACGTCCTAATGACTTTGCCATTGTG
TGATTTGGACCAAATGTTGTAGGGATGAGTCAACAGAACTTGAAGATGAA
GAGGTGTCGGAAAAGACAAGCCCACAGAAATCCCTTGAGGAGGAATATTT
GGAAACTGAAAAAAAGGTTCCTAACGAGTATCCACTGTTGCTTACCTGGT
TTTATAATTGGACTGCTAAATAATAATTCCTTAAAAATATCAACCTCTTT
AAATAAACATCCCTACGTATCTGTATTTATTCCCTAGAATTGTAGTTGTG
CAGTAAAAATCACATCATGAACAAATATGGTTTTGAATAAGTTCAACTTT
GCTTTTAAAATAAGTACATTGGGTAGTTGGGTTGCTGTTGATGTTGCAAT
GTTTTCAGATCGTAATTGCCTTCAGCATCACTGATCACATGAAGAGGCTG
TTTTATTCCGAACAAGGGGCCAGTTCTAGGTACTATTAAATTTTGCATAC
TTTTTTTGTCTTTCTCGTGATCTCGTCCCTATGATTCGTTTTGTGGCATT
GCTGATCCCTGCAGCTGGACGTATCTCGTTTGTTTTCTTTTCAGGCGAGA
TGATCCAGAGGTCAGGAGCTTATTTTCTGAGATTGAGAAACTGAGAAAGG
CATTCGATTCTATAGAAAGGCCAACACTAGATATCGAAGTCCGCAGAGCA
AAGGTGCCAACGAAGGAGCGACCCGAAACGAGCTCTTTGCCTGTGCAGGC
ACCCTCTACGTCCGAAGCTGCACATGTGGACTCGCCAAAATCTCCAGTGA
AATCCGAGCAGACGCCGCATCCTGATTCGGAGCTTGCAGAGTTGGAGTTA
GAATTTGGCAAGTCCAATAGGTACTCCCCTGAAGATATAAGTGGGTGGGA
GTTTGATGAGCTCGAAGAGGAGCTGAGAGCAGACATATCCCAGTCGAGCA
ATACAAAATAACCACATGAAATCCTACACCATTGAGATGTATACTATGTT
GGGCAATGCATGCCGCGGAATACCTGAATGTACATAGTGCTATTTTATTG
TGTCAATTGTTTTATTCTCACTGCATGAGATGCAAATATGTAACACTACC
TTGACCATTTGTTATTTGTTTGTTCTTGACATGGACATGTATACGTCATA
TGTGCAAGGAAACGTTGAAATCCCACTAATATGTTCTTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.