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GrainGenes Sequence Report: AE017415

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Sequence
AE017415
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017415
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCGTTCTTGTAGCATTCTCCGGTGGGTTAGCTACAAAATTGGATTT
GTGTTGTTTGATTATTCCAGGTTCACATGCTCCATCCGCTTGAGCAGCAT
GTACTTTGGCGCTAACTCAATCTACAGTTTTCTAGCTGCGTTTTGTTTAC
TGCTTGTCCCTGTACTCAAATGGATAGCAAATCTAGAGTCTATATTCTTT
TTCTAAAAACAAATCTGCAGCAGTATTGTAAGTTCGGCTTCAGCTTTATT
ACACAGTTCAGTGTTCGTCTGTTTTGTGTAGTCAGCTTAGATATAATTCT
AGTCTTTCTTCAATCATAATTTCGTGGTACTCCCTGAATAAGAGTTGTAG
ATTATGTTTCAGACCTTCCTTAGTGTACCTTATCGCGCATTTTGGTTGGA
TGGGTTGCAAGCAACGTTTGATTTAGTGATCTGTATAGTATTTAGTTTTT
CTACACGTAGTGGTCTTCCCAAGGTAACTTGGGATTGCTTAACATTTGGA
TAAATTATGAGCTAAGCTTGGAAGTAGGGGACAACGTTTTTCTCATGTTA
GAACCCTTATATTCTGCTAGACTCCATGTAGAAATTAATTCTTATGTCTT
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GTTGTTTTGGTTTTATAAACTATATATATGGTTGAGTTTAGTTATATGTT
GTGAGGTCACTTTTGTTGTGAGGGCTGGGCATTTGTTTCTTTAGGGGTTC
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ATGTGTACTGAGTGTTATATATGTTGCATTACAGGAGCCGGTACTTCTAG
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TGATGGATAGTAAAATTTGCATATTTCTTTACATTCAATTTATCTTATGA
TTATGATATGTCGATGATGGCAATGATAAAAATGATGATGGCATTGCATA
TTATGCGTATTTTTTGCATACCATGATGATAGTGATGATAAATGTGAACT
ACTTCGATGGGCACAATGCGACCTTCATTGATGGGTTGCGACCCACTTTG
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GAGCGATACCGGTATTCGCAATGAGATGAGATGAGCATATAGGTATTTAG
GACATTATATTAAGTTTTAAAGGATGAATGATGTCTTAGTGTTTTGATTT
ATGTAAAGTTACTATTCGTTCGTGAACTCGTTGAGTCTTTGTACTCACTC
TTTGTTGCTTTCATGATTTTAGGTAAACCTTGACGACGTCATGCATGGGA
AATATGGGGGTAGACCACCACCTACTACACATCACGACCTCACATTTATC
TTGGAATGATTCCTTTCTAAATAATAAGATTACCTTGTCTGGTCGGGTTT
GGAGTACTGTTTAATAATACATAATAGCATTGGTTATCTTCTTGCGTGTG
GTTGATCAATTCTCTATTTCCTAGTAGTTTAGAGATTTGGCATATTATTG
TGGTGATGAAGTTGTACTATCTGGTAGTATATTCTTGCTTTCTGGTATTG
CTACAACCTGTCTATCGTGGATGCCCTTAAATACAGAGGAGACTCTGCCG
AAATTTTCTAAAAGGTATTTTTTATATGTGTAATTTATGTGGTAACACCT
CGAGTGCCTGTTGACTTGGGGTGTTATAGTTGGTATCAGAGCGGGCTTTA
GGTCTGTCTATGAAAAGAAAATTACAAAATAACTTTAAAATTTGACACAT
TGGTGCACAGTAGAATGGGTTGGGTCATGCATTGCATTTATGCTTCCGCT
ATCTTATTATGGATCACTTTTATCGTTATTATGTTGGTATACCTATGGGA
AAGGCCATTACCATGGTAGGATTCAGGCCATTTTACATCTTTTGTTGTCC
CTATGTTCTTGGTAGTAAATAGTTGACTAGAGTCGAAGAAAGAGAGAGAG
GGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTCCTCATGGTTTATGAATTCAATATTGGAA
GGCAGATACTTGATAATTTATGATGGTTCAGTAAACGTGTGAAGCGTGTG
ATGAAGAGATTTGTATTGATAGATCTAGATGTTCATGTTGCTTTGATGGA
CTCATGAGCGGACAATTGAGAGGTTTGGTGTTGGCATTAATGTTTGATGA
TGTTAATGTGGAAGATTAAAGGTGACTTGGTCGGATGCTATCTGAAATTT
TGATATGTGTCCATTATCAGTAAGGAATTTGAGGGAATAATTTGCCTATG
TTGACAAGACGAGGTGGACAAGGTGATTGGTTATTGAACGGATAAAGCTA
CATTGGCTAACCTAGATAGTGTCGTTTTCAAGTAGATAAATTATTGTTTT
GAAGACTTCGTTGGATCCAAATCACTACAAGATGATCTTTACTCTATCCA
TGTCCCCTTAGAAAACCTTCTACTTATCCTCCTTTTTCCCATTCACCTAT
TCTTTCTAGTGCTTCACCTACACTTGTGGTTTGACGACCATCATCTAGTA
GAGAAATTATCAATGGTGGCTTATCGTCCAATGATTATGACGTATTTCCA
ATCATGTACTTCAAATGTCCTTCTCACTAACCATCTTGTTCTCAATCTGG
TGTATTCTTATTTGACATTCATTGGTATCCTTTATTCCACCATGGAGTAT
ATAGAATGGTGACTGTGCTATTCTATTTGGAGGCAACTTAGACTCTCTTT
TAGAAAGGAAAGTTTTGTTTATAAAATCCTTGTACTTGGTTTCTATACTA
GGTGATAAGCTTATCATTCCTTTAGCCTCAAGTGTTAGTTTTTAGATCAA
GTCAATAATCCATGACGTGACGCTTTGTTCTTTTAAAATGCGTATCTAGT
ACATGCAACCCTGTGTGTTCTTGAAAGGTTGATAGGTTAGACTTTTGTAG
TGGGTTTGCAGTACCAATAGATAGGATTCGACCTCAAACCTTTGGTTCGT
CAAGATGGAATATGTTTGGTATTTGAGTGAGGATGCCTGAGTGTTAGCGC
TACATGATTCACTATTTCAGCTACAGAGTTAATAGTTTGGGTGCGGTGTG
GATTGTCCCCCATACCAATTACCCTTATTATTTGCTCTTGTTATGTTGAA
GCGGTGAATCATTTTCATGTTCTTTAGTTAGTTGAGAGACGATGTTGTGC
ATCCTAAACCATAGAATTCTATGATGTTCTACTTGTAGTAGGGGAAATTT
TTGCCAAGCATAGGATATGCGGTGAGGATACCTTTTTAATTTCTAGACCA
CCATGAGAGTTTCAGATAGATTTTGTAGTGTTTGCTTGTTGTGCTCCAAA
GTTGAATGTTGAGCATTCAATGGTCGTGGACCATTGACAATCTCCATAAG
CTTTTCGAATCACCTAGGGACAAGGACAATCGCTCATGACCAAGATATGA
TCCTTTTTTCCAATTTCTTTACACTCGAGTTTTGATTTGATCTTATTCCT
TACACTCGACCTACCTTTGTGTTTCCTTATCATTTTGATATGACCAATTC
AATAAGAATGGAAGAAACAGTTGGATTATTTGTTATCCAAAGGTTTAATC
GATAGTGTCTCACTTAGGGGAGAGCCTCTTATGTTTACATCAAAGGGAGA
TGGTAGTTGACGGAATATTGTGGATTATCATACTCTTAACATGGTAACCA
TCAAGAACAAATATCATTTGCCCCATGTCGAGGACTTGGTCTGATCTGAT
GAATGGAGTGATGGTACCCTCGAAGATTAACCTGTCTATAATCAAATTCA
TATGCGAGATCATGATGAGACTGCCTTTCCCATTAAGTATGGGCATTATG
AATATAGAGTTATGTCCTTTGGACTAAACATTACCCTTAAATCCTTATTG
ATGGATTGAATAGTATGCTGAATAGATTCCTTGCTAACTTTCTGGTAGTG
TTTGACTGATGATATTTGCATATGTTTCAAAACATAAGGAGGGCATGAAC
GCAATTTGAAGCTTGTGCTTGAGACTTAGAGGAAGAATAAAATTTTATGC
AAAGCTAAACAAATGCGAGTTCTAGCTTTCGGAAGCGGTTTCTCTAGGCT
AGGTTATTAACCAGCAGGTGTCTTGTTAGACCCTAATAAGGTTTATATAA
TTATTGGCTAGCGGCAGCCATCCAATGTCAAGAAAGTAAGAAATTTATTG
GGCTTGGTGGGTTATTATTGGAAGTTTGTGAAGGATGTCTCTTACCGCCA
AGTTGATGACCAAGCTAACCCAAAAGGAAGGAGGGGCACACCAATGTGTT
TAGTTGTTAGATCAACTAGGAGAGTGCATTCTATAAGGAAAAACCAGAGA
GTTTACTATAGATTGGAGAGGGGATGTTTAGTTTCATGGCTGCTTATGTG
TGCCATAGAAGTCTCAGGTGAAGGAGGAGATTCTTATGGAGGCACATCAT
AATCCTACACTATTCACCCCAGGCAGACAAAGATTTAACCTGAAACAAAC
TTATTGGTGGAAAAGAGTGAAAGTTGTTGTGGCCAAGTATGTGTCCTCTT
ATGGGGTTTGTCAGCGAGTAAAGTCCGGGCGTAAGCGGCTAGTAGAACAA
TACTATAGTCCTTAGAGGTTCCAGAATGGCCATGGGATGACATTGCCTTG
GAGTTTTTGGTTGGTCTACCTTGTACGCGAAGGAGGAAAGAGGTTGCTTG
GTTGCTTGTGGATCGACTCAGAAAAGTTGCTCATTTTATTCCTATCAACA
CCACTTACTACAAGCAATTTGGCATTGATATATGTATGGGAGATCGTAAG
GTTGCATGGGCTCCTAAAACCATCACTTCTATTAGGGATCCTAGGTTTGT
GTCAAAGATCTCGGAGACCTTGCAGAGTGCCTTGGGGACGCAGATGAGTC
TTAGTGTGGTGTTTCATCCCAAGACAAATGGCCAGCTAGAGTGTACAATC
CAAACACTCAAAAATCTGTTGAGGTGTTGCATCCTACATTGTCAAAGGAG
TTGGGAGGATCACTTGCCACTTGTGGAGTTTGCTTATAAAACAGTTATCA
AGCTAGCAGATGGATGTGACCCTATGAGGATCTATATGGAAGAAAGTGTA
GATCTCTACTATGCGTGTATGTCGTGGGTGAGAAGGTATTTTTAGTACCA
TATTGGGTTCAACAAGCTAATGAGAGGGTAGTTGAGATTAGACAACATAT
GTTGACAACACAAAGTAGGCAAAAGAGTTATGCTGATTCTAAGAGGTCAA
ATGTGGAATTTCAAGTTAGGAAAAGGTACTCTTAAGGGTAGCGCCCACTT
AGAGTGTTATAAGATTTAACATCAAACGAAAGCTTAGTCTTCAATATATT
GGATTTTTTACATGTTTTGTTGTCCCTATGTTCTTGGTAGTAAATAGTTG
ACTAGAGTCGAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGTTTCCTCATGGTTTATGAATTCAATATTGGAAGGCAGATACTTGATA
ATTTATGATGGTTCAGTAGACGTGTGAAGCGTGTGATGAAGAGATTTGTA
TTGATAGATCTAGATGTTCATGTTGCTTTGATGGACTCATGAGCAGACAA
TTGAGAGGTTTGGTGTTGGCATTAATGTTTGATGATGTTAGCGTGGAAGA
TTAAAGGTGGCTTTATCGGATGCTATCTGAAATTTTGATATGTGTCCATT
ATTAGTAAGGAATTTGAGGGAATAATTTGCCTATGTTGACAAGACGAGGT
GGACTAGGTGAATGGTTATTGAACGGATAAAGCTACATTGGCTAACCTAG
ATAGTATCGTTTTCAAGTAGATAAATTATTGTTTTGAAGACTTCGTTGGA
TCCAAATCACTACAAGATGATCTTTACTCTATCCTTGTCCCCTTAGAAAA
CCTTCTACTTATCCTCCTTTTTCCCATTCACCTATTCTTTCTAGTGCTTC
ACCTACACTTGTGGTTTGACGACCATCATCTAGTAGAGAAATTATCAATG
GTGGCTTATCGTCCAATGATTATGACGTATTTCCAATCATGTACTTCAAA
TGTCCTTCTCACTAACCATCTTGTTCTCAATCTGGTGTATTCTTATTTGA
CATTCATTGGTATCCTTTATTCCACCATGGAGTATATAGAATGGTGACTG
TGCTATTCTATTTGGAGGCAACTTAGACTCTCTTTTAGAAAGGAATGTTT
TGTTTATAAAATCCTTGTACTTGGTTTCTATACTAGGTGATAAGCTTATC
ATTCCTTTAGCCTCAAGTGTTAGTTTTTAGATCAAGTCAATAATCCATGA
CGTGACGCTTTGTTCTTTTAAAATGTGTATCTAGTACATGCAACCATGTG
TGTTCTTGAAAGGTTGATAGGTTAGACTTTTGTAGTGGGTTTGCAGTACC
AATAGATAGGAGTCGACCTCAAACCTTTGGTTCGTCAAGATGGAATATGT
TTGGTATTTGAGTGAGGATGCCTGAGTGTTAGCGCTACATGATTCACTAT
TTCAGCTACAGAGTTAATAGTTTGGGTGCGGTGTGGATTGTCCCCCATAC
CAATTACCCTTATTATTTGCTCTTGTTATGTTGAAGCGGTGAATCATTTT
CATGTTCTTTAGTTAGTTGAGAGACGATGTTGTGCATCCTAAACCATAGA
ATTCTATGATGTTCTACTTGTAGTAGGGGAAATTTTTGCCAAGCATAGGA
TATGCGGTGAGGATACCTTTTTAATTTCTAGACCACCATGAGAGTTTCAG
ATAGATTTTGTAGTGTTTGCTTGTTGTGCTCCAAAGTTGAATGTTGAGCA
TTCAATGGTCGTGGGCCATTGACAATCTCCATAAGCTTTTCGAATCACCT
AGGGACAAGGACAATCGCTCATGACCAAGATATGATCCTTTTTTCCAATT
TCTTTACACTCGAGTTTTGATTTGATCTTATTCCTTACACTCGACCTACC
TTTGTGTTTCCTTATCATTTTGATATGACCAATGCAATAAGAATGGAAGA
AACAGTTGGATTATTTGTTATCCAAAAGTTTAATCGATAGTGTCTCACTT
AGGGGAGAGCCTCTTATGTTTACATCAAAGGGAGATGGTAGTTGACGGAA
TATTGTGGATTATCATACTCTTAACATGGTAACCATCAAGAACAAATATC
ATTTGCCCCATGTCGAGGACTTGGTCTGATCTGATGAATGGAGTGATGGT
ACCCTCGAAGATTAACCTGTCTATAATCAAATTCATATGCGAGATCATGA
TGAGACTGCCTTTCCCATTAAGTATGGGCATTATGAATATAGAGTTATGT
CCTTTGGACTAAACATTACCCTTAAATCCTTATTGATGGATTGAATAGTA
TGCTGAATAGATTCCTTGCTAACTTTCTGGTAGTGTTTGACTGATGATAT
TTGCATATGTTTCAAAACATAAGGAGGGCATGAACGCAATTTGAAGCTTG
TGCTTGAGACTTAGAGGAAGAATAAAATTTTACGCAAAGCTAAACAAATG
CGAGTTCTAGCTTTCGGAAGCGGCTTCTCTAGGCTAGGTTATTAACCAGC
AGGTGTCTTGTTAGACCCTAATAAGGTTTCTATAATTATTGGCTAGCGGC
TGCGATCCAATGTCAAGAAAGTAAGAAATTTATTGGGCTTGGTGGGTTAT
TATTGGAAGTTTGTGAAGGATGTCTCTTACCGCCAAGTTGATGACCAAGC
TAACCCAAAAGGAAGGAGGGGCACACCAATGTGTTTAATTGTTAGATCAA
CTAGGAGAGTGCATTCTATAAGGAAAAACCAGAGAGTTTACTATAGATGG
GATAGTGGATGTTTAGTTTCATGGCTGCCTAAGTGTGCCATAGAAGTCTC
GGGTGAAGGAGGAGATTCTTATGGAGGCACATCATAATCCTACACTATTC
ACCCCACGGCAGACAAACATGTAACCTGAAACAAACTTATTGGTGGAAAA
GAGTGAACGTTGTTGTGGCCAAGTATGTGTCCTCTTATGGGGTTTGTCAG
CGAGTAAAGTCCGGGCGTAAGCGGCTAGTAGAACACTACTATAGTCCTTA
GAGGTTCCAGAATGGCCATGGGATGACATTGCCTTGGAGTTTTTGGTTGG
TCTACCTTGTACGCGAAGGAGGAAAGAGGTTGCTTGGGTGCTTGTGGGTC
GACTTAGAAAAGTTGCTCATTTTATTCCTATCAACACCACTGACTACAAG
CAATTTGGCATTGATATATGTAGGGGAGATCGTAAGGTTGCATGGGCTCC
TAAAACCATCACTTCTAATGGGGATGCTAGGTTTGTGTCAAAGATCTCGG
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CATCCCAAGACAAATGGCCAGCTAGGGTGTACAATCCAAACACTAAAACA
TTTGTTGAGGTGTTGCATCCTACCTTGTCAAAGGAGTTGGGAGGATCACT
TGCCACTTGTGGAGTTTGCTTATAAATCAATTATCAAGCTAGTTATCAGG
CTAGCAGATGGATGTCACCCTACGAGGATCTATATGGAAGAAAGTGTAGA
TCTCCACTATGCGTGTATGTCGTGGGTGAGAAGGTATTTTTAGTACCATA
TTGGGTTCAACAAGCTACTGAGAGGGTAGTTCAGATTAGACAACATATGT
TGACAGCACAAAGTAGGCAAAAGAGTTATGCTGATTCTAAGAGGTCAAAT
GTGAAATTTCAAGTTAGGAAAAGGTACTCTTAAGGGTAGCGCCCACTTAG
AGTGTTATAAGGTTTAACATCAAACGAAAGCTTTGTCTTCAATATATTGG
ATTTTTTTAGTAGTGGCACTAGTGGGAAAGCTGGCCTACTGACTTGAGTT
ACCCGAGTCGATGAATTGTGTGTATAATGTGTTCCATGTCTCTATTACGG
AAATATTTTCGTGATCCAGAATGAGATTACCCTAGAACCAATTATGATAG
AACAATATTTAACATTTGAGGTTCGCCCTGTGAGGATATTGATAAATTTC
GAGAGAGTGATGAGGCGTAAGACACTAAAATATGTGAAGGTTCTTTTGTC
ATAGCAAAACGTGTGTGAGAGGACTTGGTATCTTGAGGCTCGCATGCGCG
ACAAGTATCCATAATTGTTTATGGCTAGTATGTGATGCATTAATATGCTT
TTACCTATTTTGTTAGTGTTATGAGTAGAGGAACGAGAAGGAATTCGGGG
TCTAGTATAGAAAGTAAATTAAATAATTATGACCATGTTGTAGTTTGTAC
GTGGGTTTTGGGAGGAAAATAAAAGAAAAAATAAAATAAAAGTAGATTAG
TGTGTGCACTAGTACTTGAACTTTAGACCTGCCATCTAAAACCTGTAGTT
GCAACCAGCTGCCATTTGTTGTGCTTGTAGTACAATGACAACTGTTTTTC
CTTTGTTTCCACAGTTCGAGAGGAAGGGAAATCGTATGGGCCGGGCTGAA
GGCCTTGTCGGACTCGGCGTCTGGGCTCTACTGTGTCGCCTCTTAGTAGC
ATTCTCGGGCTACGCCCACCTGTTCCGATCTCCCCATATCTCAACCCTAC
CGGTTACCCTCAAGATTGAAGACGCCGCCGCCGTCCGGTCACTGCTGGAG
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TCTGGTCTGCCAGTTGCCGAATCAAGTGGTTCTCGCCATCGTCCGTCGCC
ACAGTACTACGTGCATCTGTCCCCTGGTGTCTTCTCGTTCTTCCATCAAC
GTTGTAGCATGGCCGTTCTTGTAGTATTCTCTGGTGGGTTAGCTACAAAA
TTGGATTTGTGTTGTTTGTTTATTCCAGGTTCACATGCTCCATCGCTTGA
GCAGCATGTACTTTGGCGCTAAATCAATCTACAGTTTTCTAGCTGCGTTT
TGTTTACTCCTTGTCCCTGTACTCAAATGGATAGCAAATCTAGAGTCTGT
ATTCTTTTTCTAAAAACAAATCTGCAGCAGTATTGAAAGTTCGGCTTCAG
CTTTATTACACAGTTCAGTGTTCGTCTGTTTTGTGTAGTCAGCTTAGATA
TAATCCTAGTCTTTCTTCAAGCATAATTTTGTGGTACTCTCTGAATAAGA
GTTGTAGATTATGTTTCAGACCTTCCGTAGTGTACCTTATCGCGCATTTT
GGTTGGAGGGGTTGAAAGCAACGTTTGATTTAATGATCTGTATAGTATTT
AGTTTTTCTACACGTAGTGGTCTTCCCAAGGTAACCTTGGGATTGCTTAA
CATTTGGATAAATTATGAGCTAAGCTTGAAAGTAGGGGACAACGTTTTTC
TGTTGTTAGAACCCTTATATTCTGCTAGACTCCATGTAGAAATTAATTCT
TATGTCTTTTAGGTGATCTGTCCTGTGTGGACAGATTTGCATTGATGATT
AAGCTTGAGTTGTTTTGGTTTTATAAACTATATATATGGTTGAGTTTAGT
TATATGTTGTGAGGTCACTTTTGTTGTGAGGGCTGGGCATTTGTTACTTT
AGGGGTTCTGCGCGTAGGCACAATAATGATCTGTGAACGATTATGCTATG
TAGGCATGATGTGTACCGAGTGTTATATATGTTGCATAACAGGAGCCGGT
ACTTCTAGTTCGGAACCCTACAGGTCACAGTCTATGCCCCGCGCGGTTGA
GGCAAGTTCATGATGGATAGTAAAATTTGCATATTTCTTTACATTCAATT
TTTCTTATGATTATGATATGTCGATGATGGCAATGATAAAAATGATGATG
GCATGTGCATATTATGCGTATTTTTTGCATACCATGATTATAGTGATGAT
AAATATGAACTACTTCGATGGGCACAATGCGACCTTCATTGATGGGTTGC
GACCCACTTTGGAGGCACCCTCCACGAGTTGGAGCGAGTGGATGCCGACG
GGTGTCCATTCGAGCGATACCGGTATTCGCAATGAGATGAAATGAGCATA
TAGGTATTTAGAACATTATATTATGTTTTAAAGGATGAATGATGTCTTAG
TGTTTTAATTTATATAAAGTTACTATTTGTTCGTGAACTCGTTGAGTCTT
TATACTCACCCTTTGTTGCTTTCATGATTTTAGGTAAACCTTGACGACGT
CATGCATGGGAAATATGGGGGTAGAGCCACCGCCTACTACACATCACAAC
CTCACATTTATCTTGGAATGATTCCTTTCTAAATAATAAGATTACCTTGT
CTGGTCGGGTTTGGAGTACTGTTTAATAGTACATAACAGCTTTGATTATC
TTCTTGCGTGTGGTTGATAAATTCTCTATTTCCTAGTAGTTTAGAGATTT
GGCATATTATTGTGGTGATGAAGTTGTACTATCTGGTGATATATTCTTCC
TTTCTGGTATTCCTACAACCTGTCTATTGTGGATGCCCTTAAATACAAAG
GGGACTCTGCCCAAAATTTTCTAAAACATTTTTTTTATATGTGTAATGTA
TGTTGTAACACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.