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GrainGenes Sequence Report: AE017014

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Sequence
AE017014
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017014
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAGCCTTTCGGCCCATAGGTTATGGGTCACCACAAAACCGTACGCTCCC
ATACTTTCTTTCCTCTTCCTCTCCTCCGGACTCCTGATTCCTGACCTAGA
GCTGCCGCCCGCCGTGCCGTAGCTTGTAGCGTCACGCCGTCACCGCCGAC
GCCTCACCGCCCAACCCACTTAGCCTCTTACGCGCGCCGCCGGAACCATA
TCCCTTGCAGCGTCCCTGCCGTCTCCACCCCGTCCGCAACCTCGGACACT
GCTTCTCGAGGTACGCGCCTTTTGCCATCCAGTGATTCGTTGTTGAACCC
CACTGACCACCTCCACAATTTTTGTGTGCACACCATCTAGATCCGCCCCT
GCCTATCTAGCTAGCGGGTCTTCCTCTTGGGATTTTTGTTGCTGACGATG
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TGGTTTTGCAGCTCTTTGCCAATGTAGTTCCGAGGACGGCAGAGAACTTC
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TATAAGGCATTTCACTTTTCTTTCTTCACAACTAATTGGCGTTTCATTTG
ATCAAGTTTATTGTAAGACTCTAGAGTTCTTCATATGGAAGTAGCAATAT
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TTTATAAGGCCTTACTTCTGGTAACATGTAGGTGAGAGGGGCCTCGGAGA
ATCTACAAAGAAGCCACTTTATTTTAAGGGAACACATATCCATCGCATTA
TCCCAGGATTTATGGCCCAGGTACCAAAATATTGCAGCTGATGTGGTTCA
TGCATATGTTTATTGTAGCTAGTGACAGTATGTTTGGATCTTTTGTGGAT
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TCTTTTATTTTACCACCCATTTTGTTCGAAGTAAAGTCCACTAATCAGAT
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TAGCCCAGGCTTCTTCTTTCAACTGACTTATTGATGTAGTGTACTCTATA
AGCTCAACGTTGCATGCTATTTCCAGGACGTGGTGGGGAGAGCATATATG
GTGGAAAGTTTCCAGGTATGGCTATATCATTTTTTTTGGATATTATAGAA
TTTGTATGTTAGCCACTTAAGGTTAAAGTCCCATGATACTGTGCTATTAT
CATACTACCCTTCTGTTTAAAAAAATGTACTACTGTTTTGTGTTCTACAG
ATGAAAACTTCAAGTTAAAGCATGATCAGCCTGGTATTCTGTCCATGGCA
AACTCTGGAAAAAACACCAACGGATCCCAATTTTTTATAACATTAAAGGC
TACACCACATCTTGATGGGTATTACTTCTTTCCTTGTCATTTAGCACTAA
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GATCCATCATGGGTGGTATATTATCCACAGCAGTATTAATGTCTATTTGA
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ACATCTTAATGAGCCCGCATTGTAATTTTTTGTAGCAAGCATGTGGTCTT
TGGGAAGGTGCTTGATGGAAAAGCTTTGCTTAAGAAGCTTGAAGCAGTGG
GTACTGATTCTGGAAAGCCTACAAGCCCAGTTAAAATCGTAGATTGTGGT
GAAGCCTCTAACACAGATACTCAGAATCAGTTGCATGGAGAGAAAGGCAA
GTAGGGGTTAACATGGAGATCTCCAAACAGTTCACGTGTGATCTCTTCTA
AGCTTTCTCAGCACTTGTTTTTGCAGAAAAGAAGCTTAAAAAGGTAGTAG
AGGATAACTCTGATTCTGAAGGGAAGGTCAAAACCAAAAAAATATCCAGC
GAGGATAAACGAAAGAAAAAGAGAAAGCACTACTCCTCTGACTCATATAG
TTCAGAAACTTCTGACTCACGGTCCTATTCCTCAGATAGTGGTTCCGGGT
CAGAATCGTATTCTTCAGCATCATTGGATACCAGCTCATCTAGTGATCAT
AGGCACAAGAGAAGAAAAGGTTCTAAGAAGGTTAAGCGAAAGTCTACAAA
GAGGAAGAGCAGCCATAAGAAGAGTAAGAGCAATAGTAAAGGAACAAAAA
GAAAATCCAAGCGGTAAATCTTGACCTTTATAACCTGTATAGTTATGTTC
ACTCAGTATTAATACTAACTGAACGATTCCCTTTTGGTGCTGTACTTAGG
AGCTATGGGAGCTCAAGTGATGATTCAGAAAGCTCAAGCAGCAGTTCTGA
GAATGAAAGTGCAGGCCGCCATACCAAGCATTCATTGAAGAAAGGTAGGA
GAACTCCCATTCAGTTTTCTATTTGTGTTCACCATCTATCAACATAGTCT
GGTATGCCGCATGCTGCTTGAATTTAGCTGTTTATATTTCGGACCGTACT
ACCCGGCTGCGTTCTAGAGATAACCAAAATCGGCGGACACTCTGACCAAA
CCGCGTGAGACGCGTTCACGTGTCCTGACCGATCGGTGCAACGTTCCATT
GTCAGCCAAAGCCAAGATCTCGTTACCGATAATACTAGGTAGGATTTATT
GCAAAGCACTACACGACAAACCTGATAGCTTAACCGAAATTAAATACGGA
AATCCATAATTCAAAATATTTTGTACGTCAAACCGTTTATCCGATTTAGA
ATATGTTTTCATCGTTGGACTAGTCATGACGAGATCTTTAAAACTAGATC
CCATGTCGATATGTTCCGATAAATTTTTTTTGAACCCAAAAGTTACCCAT
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TGAAAAGAATGTAAAGATGTTTTGATGCATGTGAAAAATTGAATGTGAGA
TTCAAAAGGTTAAAAATTTGTGTAGTTCAAATCGTTTATCGATTTACCAT
CCCTCTGAACATTGTACTAGTCAGACTAGATCATTACAACTATATCCTAT
CTTGATTTGTGTAGTTCAAAACGTTTATCCGATTTACGATCCATCTGAAC
ATTGTGCTAGTCACGACTAGATCATTACAACTATATCCTATCTTGATATA
TTTTGATGATCATTTTTCTAGATTCAAAAGTTACCCACATGTAACATCTG
AATTATATCGGTAAGCAATAGGTGGATAACTTTGATTGGTTGGTAACTAT
ACCTGATCAGGAGGGTAACTCTATAAGCAATCAGTGAATAACTTTTATCT
AGAAGGTAGGATAACTACATCCAATTGGTGCTGATAGCTATACTGTCACC
ACCTGAATAACTCCATAAGTAGTGTACCTAGAGAGCATGGTAACTACAAT
GATCTGGTGATGATAACTATATGGTTAACACACATGGGTAACTCTACCCT
GAACACCTAGATAAATCCATATGGAATCGGTTTGTAACTGTAACATGATC
AGGTAGGGTAACTTTATAAGGAATGGGTGGATAAATTTTATCTAGAGGAT
AGGGTAACCACGCCGAATTGGTGATGATAGGTAAATTGTAAAAACCTATC
CCGATAACTCTATACATAATAGGTGGATAACTATTATCTAGAGAGCATGG
TATGGTGACTACATCAATCTCGTGGTGATAGTTATACGGTGAACACATGG
GTAACTTTTGCCTGAACACCGAGATAATTCCATATGAAATCGTTGGTAAT
TATACACTAATTGGGTGGATAACTCTATAAGAAATGGACGGATAACTATT
ATCTAAAAGGTAGGGTAACTACATCGAAGTGGTGATGATAGCTATATTAT
AAACACCCAGCCGGATAACTCTATAAGTAATAAGTGGATATACCTTGAGA
GCATGGTAACTACATCTATCTAGTGTTGATAGATATAGACATGGGTATCT
CTACCCTCAACACCCGGATAATTTATATGAATCGGTTGATAACTATACCC
TCATCAGGTGGGTAACTCTATAAGAAATATATGGATAAATTTTATCTAGA
GGGTAGGATAATTACATCGAATTGGTGATGATAGCTATACTATAAATACC
TGGCTGGTTAACTCTATAAGTAAGATGATTATTACCTATAGAGCATGGTA
ACTACATCAATCTGATGATGATAGATATAGACATGGGTAGCTCTACCCTC
AACTCCTGGATAATTCCATATGAATCAGTTGATAAGTATACCCTAATCAG
GTGGGTAACCTATAAGCAATGGATGGATAACTTTTATCTAGAGGGTAGGA
TAACTACATTCAATTGTTGATGATAGCTATACTGTAAACATCTGGCCGGA
TAATTCTGTAAGTAAGATGGCTATTACCTAGAGAGTATGGTAACTACATC
GATCTGGTGATGATAGATATAGACATCGGTAGCTCTACGCTCAACACCTG
GATAATTCCATATGTATCAGTTGATAACTATACCCTAATCAGGTGGGTAA
CTCTATAAGCAATGTATGGATAACTTTTATCTAGAGGGTAGGATAACTAC
ATCGAATTGGTGATGATAGTTATACTGTAAACACCTGGTCAGATAACTCT
ATAAGTAAGATGACTATTGCCTAGAGTGCATGGTAACTACATCGATCTGG
TGATGATAGATATATACAGGATAGCTCTACCCTCAACACCTGGATAATTC
AATATGAATCAGTTGATAACTATACCCTAATCATGTGGGTAACTCTATAA
GAAATGGATGGATAACTTTTTTCTAGAGGGTAGGATAACAACGTCGAATT
GGTGATTATAGCTATACTGTAAACACCTGGCTGGATAACTCTATAAGTAA
GATGACTATTACCTAGAGAGCATGGAAACTACCTCGATCTGGTAATTATA
GTTATGGTGAACATATGGATAACTCCATATGGAATCAGTGGTAACTATAC
CCTGATTAGGTAGATAACTATATAAATACTATGTTGGTAGTTATATCTTT
GTCACCTGGCTAACTTTATCGGTACCTGATTAGTAACTACTCCCTCCGTT
TCAGAATATATGATGTTTTAGCTTTTGTGAAACAAATGCATCTAGACGTC
TTTTCGTGTATAGGTTCGGAGTGAATCTACACATCAAAGATGTCTAGATA
CATTCGTTTCACAAATGGTGAAACATCTTATATTTTGGAACAGATGAAGT
ATTAGCTAAAGGGTAGGGTAACTCCATAAGCTAGAGGAAAGGACAATTTT
TTGTTCTTATCCTTTATTTTGTTGTACAAACATCAGAAACCGACAAAATG
ATTCTAATCTCTTTGAGTAACCTTGTTCGAGCAGCTATACTAGATAACCT
TGGTGTATATCTCCAAGAAACTAGCTGCAATTTCGTCTAATATTGTAGAG
ACCTGTTTCTGCAGCCAAACTGATGCATCATGTAACTGACCAAGCCACAA
AATCTAGATTAGCTAGTAAATAGTTGTTGTGGAAAGGAAGTTTCACTACG
TACACTGATCCGTAGCTAGCTAGCACTAGTACACACAAAAAAGCTAGATA
CTCTCTAGATCAGTACTAGCTAATTGATATGTAAATTGGCAGCACAACTT
ATCTGCACGTCCCAACAACATGGTTCACACGGTGGTGATTTAGTTTACAT
GGAGGAGATTATGATGGAGGCTCTCGCAGAGTCTTGTGGTGGACATGATA
AGCGGCAGAGATTGTTGGCGACACCATTGTTTGAAGAAAGCCGTCAGCAA
ATCAATCCAACGAGGATCTCTGTCGTCGTTGGCGGCCAGGGCCGGAGGAG
CAGGCGAGCAGCGGGCCGTGCCGGGAGAGGAGGGGCACGTAGAAGAGGCG
AGGTAGCGAGGGCGGCTGGCCGGGGCGCCCGATGCGGTCGACGGGGCAGA
TGTGGTGGCTGTCAGGCGTTGAGGAGGACGACGCCTGCTGCTAGCCCAGC
GAAATTGTGGGAGCTCGATGCTACAATTCCTATGATGGGGATGGTCAACG
GGATTGGGAGGAGCGGCTTCCGGGCTCGGCTGGTCGCGGGGTGGCGCGCC
GGCATATCTCGTGCCTCCTGGCAGCATGCGGAGGGAGTTCATGAGAGGAT
GAAAGGGGGCGTTCGGGATGGAGACTCATGATGCGTTCTGCTCCCGATCG
CACGACCCCGATCAGACGGCTGACGGGAGTCCGCCGGGTTTGTTCTGTTT
CAGACCGGTCGGTAGATAGATTTCCCGTATATTTCTGTTCTGTTAACTAT
TTTGAGTTACTTTTCTGTCATCCCCAAGGCAATCCGTATTTGCACTTACG
CTTGCAAATTCCTGGGCATGACCTTCTCGTGTAGTCATGTTTGATTTGGT
TCAACATACTTGTAATAATAATAAAAGGTAAGCATCAATGGAATAAAAAA
TATTTTTTGTTGGCAAACTTTTTTGTGTTTATGTCTGTCATCACTATTCA
CATGACATACCTTGATTCGAAAATACATTCGAAAAGCTTTTGCTTTCTAT
TGCATATGATAATCGTAATTAGAAAGATTGTCGCATAACACTTCAAGTCT
GATAATATGTGTCACTTTTTCTGTCTTTTTTTTTATAATTTTCAACAACC
TGCAATGTATGACATAAGATACTATTTATGTGACCTTGATATTTTCTGTT
TGGTTATGCACTTGGAATGTACTTACTGAGGTGGCCACACTTCAAAGTTT
CTGTACAATTTTGAACTAATAATTATTTTTGTTGATACTTAATAGCAGAC
AAAGAAAATACCAAAATAATAAATTTGGAGAAAGGCAAAACCTTGGAAGG
TGCAGATAAGGGCAAAGAAACGGTTGCAGGAAGCAAACCATTACACAAAG
ATGAAAATCGGGCTCATGTCAGAGTTGGAAATCAAAATTCTGAAGCTAGA
TCTAGCAAATTCAGGTTTAACTTCTTTAAAATATATACTTTTTGTCTGGG
TCCTCTCACTACTATGCAGCGATGATGTAACATCTCCTGTTCATAATTGC
AGGGATGATACCAACCCCGTCAGGGCTGATGCAACTCTGTCAAGGCCAGA
TGGCAACATCACTGCTGATACTGCAAGGGTTGGCATATCTGAAGCTGGTA
CAGAACCAAACCCTGTAAGCAATGAACCTGTACCTACCAATGGTAAAGAT
TTAGCTAAGAGCTCTACAGCGGATGGACGTGTCAGGAAAGGACGTGGTTT
TACACAACAGTATGCATTTGCACGCAGATACCGAACACCGTCTCCAGAGC
GTTCACCTGTTCGGTCTCGCTACAATGGAGGAAGGAATGATAGATGGGGT
AACTTTAATAGGTATGGATATTTGATATTGATTTACCACATTTTGACATA
TATGATATTAATACTGGAATCCCATCATGTTCAGGTATGGAAGAAATGGT
CCTTATGGTGCACGATCACCAGTAAGGAGATACCATGGCTCCTCAAGAGC
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TTTCAAGAACTTACCTAAATCCCTGAAGTAACGACATTTTCTGCCTACCA
GCTGTTCTACTTTTGCACTAGTTTAACAGTATCTATGTGGAGTGCTGGGA
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AATCCAGAACTTTGACTACGTTTTTCACTTGTAAGATGCCTAAAAAGTAA
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GTTATTGATCACATGCCACTTTTAAGGCTTTAAGGCCTTAAATGCTCTAT
AGAGCATGTGCGCTGCTAATGGTTATTTCAGGATTCTTTCATGGGTACAA
GAGTTTCATCAATAACTAAGTCTAATATTATCATATGCATCCTTGATGAA
TGTGGCATTTCTTCGAATTTTAATTTGTCCTCTTCCTTGTCATGTGACCA
AAGCTGTTTCAGTTTAGCGATTGGTGGTAAAATAGTTTGCCGTGTTAGTT
TAGCACTTCTAAGCTAGGGAAGCACCGATACGGCTAGGTCAGCCGTACAC
CTTTGTTGTACATGGGCAAGGCTACACACATCCTCTTTTCTGACTTCTAA
ATTAATAAATAAATAGGGGTACCGGGGTGTGGGGTAGCGTACCTGAGATA
AGGGGATCGAGGCACAGGCAGGAGGTGCCACAGGCTCGACCAGTGGCTGC
CAACCTCATCTTTCTCCTGTAGTTGCTGTTGTTCATGTGTATGCTGGCAC
ACACGGGACCTGAGGAGGTGACACAGTGCGCCAGCGCCACAGCTACCTTT
GGTAGAGGTCTAGAGGAGCCGAGAGACAAAGAATTAGGCTGCGAAGTGGC
ACGGACACGCTGTAGGACGCCTGCATTGGATCAGGAATTGAGGACCATTC
ATTAATTGAGGACGACACTATGTAAGCTTACATAGTTTGACTTTTCAAAA
AAAATATAGGCCTTATTCATTGGAACAGAGGTAGTATTTTAAAGATGTGA
AAACAGAGTACTGCTCATTTGTTGCTTCCTTGTCTCCACTAGTTTCTGTT
TGGGTTTCATATCTAGCCTACCCCAACTTGCTTGGGACAAAAGGCTTAGT
TGTTGTTGTTCAAACTATGTAAGCTTGAGCAAGTTTTTACAATAAATTAT
TAACATGCACAAACAAAACTAATACCGTTATCTACATCATGAAAGATACT
TTCATATAATATCTATATAATATTATAGTTGTTGATTGTTTTTAATAAAA
GTTTGGTCAAACTTTACATAATTTGACTTTTCAAAATAAATATAGGCCTT
ATTCATTGGAATAGAAGGAGTATATTTTTGACTTTGTTTTGTGCTGTACC
TTTTCAATTTATTTACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTCAGGAATTTGT
CTAAATTTGGATGTATCTATATACTCCCTCCGTTTCATATTACTCCACAC
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ACAAAACATCGCTATCTACAATATCAAACGAACTATGCTATGAAAGTATG
TTTCATTATGTTTCCAATAGTACTGATTTAATTTTGTAAATGATTATAAT
TTTAAATTTATAGTTGGTCAAACTCGATAACGTTTGACTTTGACTAAACC
TAATATGCGGAGTAATATGAAACAGAGGGAGTACTAAATAGTGTCTAGAT
ACATCCAAATTTAGACAAATTTGCGACATCTATTTTGAGACAGAGGGAGT
ACATGTAGACGCTGTATCCTTGGCTTTTTCTGGAAAATGCTGTATCCTGT
GTCCCCATATCTATGTCCCCCATAGCAGTGCTTCTTAGCTTTCAAGTGTT
TAATTGTTTCGATTAAGTACCCAAGTATGTTAGCGTTCTCAACACAAACA
GTTACTTTTAAGTTGCTTTTGTTGTGCATGGACAAACTTTCAATACAGCT
AAAGCGTGATGTGTTAAACAAGTTTTACTCTTTGCTGTAGTGAAATAACA
TATCATTATCATGACATTGTACACTTTGCTCAGGTCAAGCAGCTTTACCT
TGTGTTTTCCTTGTGCAAATCCATGTTACATTTTCAGTGACTAATAACTG
ATACTAAACATTACTGAAAATTTAACCAGCGTCCATGATGGTAGGTACAC
AAGGAGAGACCGAAGCAGGAGCAGGTCACGCAGTCCAGTGAGGCGCCGTG
ACGGTGGAGGACATCGCTGTACCAGCCCAAGACGCAGCCGTAGCCCCGCA
GAAGAACATAAACGAGATGTGACCTACAGGCCTCGATCAGGTCGTGGTGG
CGGCGGTGGTGCCATCCCTGGTCACCGTGGTAACAGCCCCTCTGCCAATA
GAGCAAGGTCAAGATCCAGGTCTAAGAGCCATGATGCCTCGAGGTCTAGG
TCTCCTGATGCAGCCCCAGCCAAAAGGGTCAGCTCGAAGTATAACCGCAG
GCGCAGCAGCAGCTCGAGATCCAGTAGCCCCTCCGCGAGTAAAGGCGGTT
TGGTCTCGTATTGAGATGTGATCTCAGGAACTGGAAAGTCAGGAGGTTTC
ATGCAAGCTCAGTACTCTATTACTCTTATCATGGAGACACAGAATCATGT
AGCTACTCCGCTTTTCTTATGTAATGTCTGTCTGCATGAGAATGTTCCGT
GTATTCTCTTGACTCAGTGAAATTTTGTCGATATGATGCTCAACCCTTAG
GTTGCTGCCTTTTTTATGACGATGCTGGTATTTTCATTCCGTGAAACCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.