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GrainGenes Sequence Report: AE027590

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Sequence
AE027590
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE027590
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAGCTCTCTCCGCCAGCGCTGCTGGTCGGAGATGGCGAGGGGATGGTGC
CGAGGTAGTTTCTAGGGTTAGATTTAGGTGCTTTGGCGTGCTGCCAGTAG
ATTGGAGTAGGGTTTGGGATCCTCTTGGTCGGATCTCGAACAGCTCAAGG
GGGAGCTCCGCCGGCGAGCCTCTGGTGGTTGGGGCTACTGCTGGAACTTC
TGCTCTTGGGGATCTCCGAAATAAGGCCAAGTTTTGCTGCTTCTTCTTCC
TTGGTGCGGTGGTGTTGCTGCTTCTCTTTCTGGCCGGTCGTGGCGGCGAG
GGAGAAGAGAGGAGCGGCGCTGTGGTGCCGGGATCTGGAGGCTGCGGGAG
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CGCTTGCCTGTTTGCTTCCGTGGTGGAAGAAGATGGGGGCTTCGACTGTG
GCTCCCGGGAATAAGCGCTTCTGGTTGCGCTCGGGTGGCTCTTGCGCCAT
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CGAATGGTGACCTGGGGTTTCAACCTCCATTGGAGGCCCTTTCTCAAAGC
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TTGCGCCAGCCTGAACTTATATTATCAAGGGTACTCAACCAGCACAGTTC
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TTCTCCTCTTCCATATATTCCATAGGATGGCCGTGCAGATGGTACTGTCA
GTAGGGGAGCGGCAGCGAGAGCTCCAGATCTCCAAGAAACTAGCGGGGTA
AGCACCGCCGTTGGAGAAGAAGCACCAGACCTCCCTAGCGCGGTGGCAGC
TGACGAGCATGTGGTCCACGTCTTCATCGAGAGGGCAAGAAGGGCACGCA
GGAGTCGCAGTCATGTTGTGGCGATGTCGACGTTCATTGGTAGGGAGCCG
GTGGCGACGAGCAAGCCAGTTGAAAATCTTGCACTTGAGAGGCGCCGCAT
TGCTCCACACTGCCATGACATGTTCATCAGTTTGCAAGTGCCTGAAAGAG
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GTGGGGCGAGCCCATGGCGAGTGATGAATAGGACAGAAGCATGGGGCCGG
ACAGAGTGGGAGAACAGAGCGGGCATACGTTCCGCGAGGGTATCGACACC
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TCCGTATCTGCGTCGAAACCAGGCAGCCCAAGGGGCATCACTGGTGGCAT
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TTTTTTGTAACTAGGAGGCCCTTATCTGTTTTTTCTACTTTTGCTAGGGT
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GCATCGACGGCATCAGGAAGATGGCAGATCGTGTGCTGGGTTTGTGGTTC
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CGTTCAACGACAATGGTTTCACCTTGGGTGAGCCATCTTAGAGGTCCGCA
AAGCTGCATGTCAACGATGGAGCTGCATCGAGCTCGGGTGAGGAGGTGAT
CCATCATTATTTTCTTTGGTGGCCGCTATGGTGGTGCCAGAGGCAGGTGA
TGGGCGTCGGCGTCATGCTCAGAGGTTTCTTCGGTTTAGAATGGCCGGTG
GTCCTTTGTGCAAAAGTTTGCGTTTTGCTGTGTTTTTAGTTTTAACTTGT
AGTATGGCTTTATGATATATAAATGAGACACGTATTAAAAAAAAAAGATA
GACGAGCCGTTCTGACCCCCTCCCACTCCCTCACGGGCCTCCCCCGCTAC
CGGCCTCTTCTCCGACTCCGCCGCTACGACCGACCTCACCCTAGCTGTCG
CTTCTTCTCCGTCGCCGGCGTCGATGGAGGCGGATGCGGAGATCCCCAAA
GAAGCGAAGCCGCCACGGAGGATGAACCGCAGGCAGTGGAAGGCCGCGAG
GGGGAACCACGAGGACAAGTGGACGAGGACGAATGCGGAGATACGCCGCG
AGCAGGAGGCCGCGGAGGCGGCGGCGGACGAGGCGGCGGAAGCGGCGAAC
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TTGGATATTCTCCCGCTTCCACGGCTCCTACGAGGACACCAGTAAGCACC
GACTCCGTGGCTCTTCACTCCTCCTCTTTCCTTGATCCCGGCCATTTCTG
TAGGCTCATTCCTCTCACTCTTCGACCTTGAGGGGTTCGTTTTGTCTGAT
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CGTGCAGCGTCTATTCCACCGATGCGATACACCGACGATCTTCCACCGCC
CTCTGCCGGTGTTGTCTATGCTGATGCCGTGGTCATCTTCTCGGTGCAGG
TGACACAATTAGAACATTGCCTGGAGTGGCCGCTTGATGTGTACGGCATC
GTTGCCTCACGGGATTCAGTAGACCGCAATCGAAACCTCATCTTCAACCG
CACCAGAGACAATTGCCAGAAGCTCACCCCAGAGGTATATGCATGGCTTG
ATAGGTGTCCATTTACTTGATGCTATCTGATGTTTATAGGCTAATCGTCA
CACACAGAGGTATTTCATATCATATATGTTTACGACTGGCCGTAGCTAAA
ATAATGTGCATATCTTAGTTGGTGTATGCATAAGTTATTTCAAGTATCGA
TTCTAGACACTGCAGTTAGATCAATTGACCAACTTCTTTGAATGGGTATA
TCTTGAGGTAACTGCAAAAAACCACCACAATTGTGGTAAAAGTAACAACC
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AATTGCCCCAATTGTGGTGTTTTTTTTTAATTCTGTCTGGGTATCTTTCA
ATGATGACCAACCTTTCTTACTCCCTGCTAATTATATCTAATTCGTTGTT
TTTAATACAATATTTTTGGTTGAATTGAATTCACAGATAGCCGAGTCCGT
GCAAACATGCAATGCAAGAGGATGGAAATAAAATGTTCATAGTTGAAAGG
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GTAGTAACTGAATTAAACAAGCACTGCAATAGTCTAAGCTCAACCAGCAA
TGATCTGTACATGTTTTGACAGTGTGATCAGAACTTTTGACAGCACCAGG
TTGTTGGTATTTGGGCGTAACCTTGTGCTTCCCATGGTGCCTCACACAGT
TGCACAACATTGTGTGGTACAAATAACATACATAATGAAGGTGATTTTGA
AATTAAGTATCTCTGATAAAGTGGTGTAGTATGAGTTCTAGCTATCACGT
TTTGACCATGCCTTGTATACATCGGAAACAAGTCGTATACTAGAAAGCAA
GAGTATAGTTAACAAAACAGCTTGTGTCTGGTGCATTTCAAGCACATCCG
CGGTCTTCCTTAAAAGTGATGAATGATCCAAATCATTATAATCAATGGGT
ACCAGAATTAATTGTGCTCACCTATTCTATTCCTTTTCGTGCAAACTGTA
GAAAAGGTATGTTATACTGTGTTATGCATTATTGTAAAAAAAAATGGGGA
GCATGGGGTGGGAAGTAATCGGATGCAAGCTTGGCTGTGTTTTCAACAAT
TGGGCAACTATTGTGATTGCAATCAGAACTCACCTAGCTTACCAGCTTTT
TGGCCATCCCCTGGTTTGGTAGTGGCCAATTTTTTGTCAGGATTTCATTA
TGCATGAGCTAAACATGCCCAAATGCACAGTATCTCAGTCATCTAAATGT
TTTGCAAGTAAACCTCCATCCGAACAGAGACAAACCTCTCTTTTCAAAGT
TATTTGTCTTGCTTCCTTCTTATAGACTAGATTCCTGGATGATATGATAT
GTTGATTTCAGTCTAGTTTCCAACTGCTAGGGTGCCTATCAACCAGTAAA
GTTCATGTTAAATTGCCTTCCAGTAGTGGCAGTCTCACTGTAGAACAGTA
TCACAGTGACATCTTACGGAATATTTATGTCCAAATTTGATTATACTTTG
AAACGTCATAATGCAGGCTGCCTCTCTATCGTTGACCGGTCCTACCCATG
CTATTGTGATGATTGATCCCGTCAACTATGAGGTCGAGCTAAAAGTGAAG
GGCGACACACCTTCTGAAGATAAACTCCTGAGCCTTCTGCTCATCGAGGA
CAAGTACTATCCTCCTACTGAACGTTGCCAAGGAGTTCACTGCCACACAT
ACTCTTCTAAGCTAAGCACAGTCGAGGTGACAGTTGGGCATCTTTCACGA
ACAGTGGAGGCCACCATCGTATTCCAAGTCGTCGAGGGATCTTGGCCAAT
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AGATGGAGCTTGTTGATTCTCGGGGCGGAACGGTAACAACTTCGATTGAT
GGCGCAATCGAGCTCTCACGATGTGTTGTGCCTGTCGAAGCAGATGGGGA
GCTGAAGCTTTGGATGGATGCATGGCAAGGCGATGACAGGGGTATTGTTG
TCGGCAAAGATCAAGTAACCTTTGCACCTAGAAGAGCAGGTAGAAGTGTG
GATTCGTGTTATGTTGGATTTTGTAAGATGCGAGTAACTGTTGCCTGGTC
GCTTCTGGTGACATGTAGGAAATCAGTTAGTTAGCATGTGTGGTTCGACA
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GATTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGACTAATTTTTTTTTACTAGGTACA
TCCGAATCTAGACAAATATAAGAACATTTATATGGATCGTAGGGAGTATC
TAATTTGTGTTACGCGAACCTTAAAACCTGACGTCCAATACTACTCCCTC
TGTCTCAAAATAGAGGTCATAATTTTTTTCTAAATTTGGATGTATCTATA
TACTAAATAGTATCTACATAGATCCAAATTTAGATAAATTTTCGACATCT
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TCTTCCAAGAAAACCTAGCCGCAGCCTACGCCTCCCCCTCCTCTGGCCTC
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CTATTTTTTTTGAGGAACTTTTTCAACAAACTAGGCTACGACTTTGATAA
CCATCTTCTTTTTGGTCTCCATGTCAATGGCTTTGATAACTGTCTTCTTT
TTGGTCTCCGTGTCAATGAAGATGGCATCGTCTATAATAATTGATCTGTA
GCCCCTCGTTTGACGACAAAATTAAATTTCTAGCTATAGGCTTCTAGATC
TTGCTTCAGCAGATCGGTTCTGGATTTTTTCTTATGGTAGCTGCCCTTGC
ACTATTTGTCCGGCTGCTACGTCCTAAAAAATGCTGATTCGTACTCTCGG
CTCCCTAGCGATGTCGACCCACTATTCGGTTGCTTTCCTTCAATTAATGG
TGTTGGTACTCTTGATGATATTGATTGATTACGTTAATGGTTGCGCGCGT
GCGCGTGGCTTTGGCATTGCGGCTCAAACTAAACTTATAGGAGAATTCTC
GCTGAAATGCATAGGTTTATGGTTTAATATCTTTCCCTTTTTGGCTGCCT
TAAGAAAAGTAGAAGGTTGTGTCATAAAAGAAGAAAGCGTTTGAAGACTT
CGTAGATTTAATTTCTTATTTCTTTTAGACTTTATTTTGTAATCATTCAA
CTTCCATCCCAAAATAAGTGACTTGAATTTGTGTATATTTAAATGTATCT
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CTTATTTTGAAATAGAGGGAGTACTAGGAATATTGGTATTGATTGTACTA
GGAATATTGGTATTGATTGTAAAAACATATATTGTATAATACCTCTCTGG
AACAACTATGTATTTGGAAAGCAGCAAATCATGGGAAAATTACTTCACAG
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CGTTTCAAAATATAAAGTGTTTTAGTTTTTTCTGAAACATTCGTATCTAT
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AAAAACTAAAATACGTCTAGATACATGTGTTTTAGAAAATACTAAAACAT
CTTATATTTTAAAACGTAGGGAGTATGTGGAATGTTTAAATATTCTCGAA
ACAGGCTTTCGTCCTGATTTATAAATAAAGTCACACATGGCTGAACCGAT
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TGACAATCATGTTAGACAATGTAATACATGTTCTGACCCGGTATAGCATA
GTACTCTACCTGGTAGCATACCTCTCTTGTATATGCTCGTGTGAGGATTT
TCCACACCCGTAACTCGAGCCCAGAATCAAGTCATCCATTCCTACCTATC
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TGAAAAGACTCTCTTCGACGCCGATCATCGTGCCACAACCAGAAAACCTA
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GGCGCTGGCTTCCACCCTTGGAGCACCCCTGAGGGAAATGTTGGCCCGCG
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ATGCAAGTCATGGGTCTATTGGATGGTTCCGACTTCTCCCCAACAAAAAC
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TTTTTAATTATTTTTTCCAATTTAAACGAGCTTCGTGTGATTTTCCAACA
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AGTTGGAAGGTTTGACCATTTGATATGGATTTTTGTGCCGCCAATTTTGA
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ACAAAGAGTCCTTATGTCTTACATAACCCACTAAAAATACAAAAACTGAG
TTATGATAATTGGTTTTAGTAAGGCTTCTCAAAAATTGTATCATGGATTA
CTTATCTTGGCTTTCAGGGCAGATGCCCATGGAACGGTTAATCCGTGGCA
CATTTCATGATAGTGCATCCAAATTTTGCACAAAGGTGTCTCTTATCATG
GCAAGCAACATTGCCAAAAAGAGTTTTTAACATTGTTTGCCAAAAAATCA
TTTTTCATTTTTCTAGTGCCAAAAAAGGTTTTCAACGCTGCTTTCTGTGA
TGCAGCTACATAAAATAAGATGCTAAATGATACCATTAGATATTCTCGAT
CAAAGTACACCATGTGGGGTGGACAAATCTTGGATATGAAAATTCTTTTC
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ACATTGATCCCATTTTTAAATAAAAATTTAAAAAATTGTAGGATAATAAA
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CCTTGTTCCACACATAGGTGCATACTGGCATGGCAAACAAAAATGTGAAA
GGGTGTTCCCATCTTTTACCATAAATTTGTTACACATTTTGCAAATCGCA
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TGCACGTCAACTGTTCGACAACGTGCTTCAAATGCATGTCAACTGTTCTA
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TGACTAGAGTTTCACATATATTTTGACACGGCCTAGCTTAGCGGTATAGG
GGGATACCGCTAAACATGTTGAGACGTAAATCATTTCTGCCATGTTCCTT
GAACCAGAAAATAGCCATTTCGTCTTCTAGGACCTGCGTGTCCTTAACTA
CTTTATCCCAGTTTCTAGTGATGACTCCACGTCTATCACACATCATACCA
ATTTTGACTTGATGATGAGTTAGGTTAAACTAGTTGGTGACACGCAGAGG
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AGAAGCACTAAAAGCAGAAGAAATCAGCGATTAGAAGTTTATGGATTGTT
GATTGGTGAAATGAGATATGAAAAGAAAGTACCATCGTTCCCTTGTAGAC
CATAGACGAGGTGGTCACGCATACATAAAAAGTTATGTCAGGTTTGATCT
CGGAGAGCTTTTTATCGAGAAAATTCCACCTTCTGTTTGATAAAACTACA
GAGTTACCATAAACGATGTACCTTTCAAAACTTTCTGTAATCCCCTCATT
ACAAGAAATCACATGGAAGAGAAAATAAATTTTAGAGAGTAGTACATTGT
TGCATAGTTGAATTCAATGTTACAGTCCAAATATAACTTTACCCCTTATA
GACACAATGGCTTTTTCTCACTATCAGTTTTAGAGTAGCCATTGTAGCAT
ACTTTATCATCATCGCTGACATTGGTATTGGAACTTTTCAAGATTTCTAC
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GAAATCCAAAGCATTCAAGATTACATCTCCCCAAAATACAGAGGAGGTAC
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AACCTAATAAAGACGACGACTGATCTCGTTTTGCACGGAGATAGGAGTGG
ACGGACGCGTGACGTGGAGCGGTGGAGGCAAGGTTGACGGAGAGGTTTGT
CGCGGAGACGAGAAGGGCAAAAGTGAGGAGTGTTTTGCAAGACAGACCTG
TAAGCGCTTTCTTGTCCCACTCATGTCAGTATGTTAGCAGAGTAACAGTT
AAAGAGTTTTGACTCGACGAAATGCTCCTTCTAGGTACACACGAGGTTAG
TCTACAGTGAGGTGGACAAAAGTGTGAAGCGTTTAAAGTGATAAAACGGA
GTAGTACATGCTCTAGTTTTTCTTTTTGCAAGAGTAGTACATGCTCTAGT
GGGTGACACAAAATAGTTACAGTAACTTTTTTCATACCAACTCATTCTGG
CGAAACCATGCTGGCCCGCTTATTTGACCCGCCAACGCGCCGTGCATAAT
GGGCCATGGAGGAGTAGGAGGAACTAGATGGACGAGCAGTCCTGACCCTT
CCTCCTGGGCCTCTCCCGCCGGGTACTGTGTGCTCTAATCCGACTCCGCC
GCTCCAACCGACCTCGCCTCTTCTCCCGTTCTCCGTCGCCGGCGTCGATG
GAGGCGGATGCGGAGATCCACGAAGAGGCAAAGCCGCCGAGGATGAACCG
CAGGCAGTGGAGGGCCGCAAGGGGGAACCGCGAGGACAAGTGGACGAGGA
AGCAGCGCCTGCTGCGGGAGGCGAACGCGGAGAAACGCCGCGAGCAGGAG
GCCGCGGAGGCGGCGGCGGACTTCGCGGCGGAAGCGGCGAACAGAGAGGA
TCCGGAGGCCGGCATCGCGATGCGGTACCGCGAGAGCTGGATTTGGATGT
TCTCCCGCTTCCACGGCTCCTACGAGGACACAAGTAAGAATCGGTTCCGT
GGGTCTCCGATCCTCCTCTTCTCTGATGCTGGTCGGCTGACTCGTCCCCT
TACTCTTCGATCTGAAGGGTTTGATGATTGATCATGGGTGAATTACTGTC
TGAATTTTCATCCTGCTGCGCGCAGCGTCTATTCCACCGATGCGGTACAC
CGACGAGCCGCCCTCCACCAGTGTTGGCTATGCTGATGGCGTGGTCATTT
TCTCGGTGAAGGTAACACAGCTAAACGATGGCTTGGAGTGGCCGCTTGAT
GTGTACGGCATCGTCGCCGCACGGGATTCAGTAGACCGCAATCGGAACCT
CATCTTCCACCGCACCAGAGACAATTGCCAGACGCTCACCCCAGAGGTAT
ATGCATGGCTTGATAGATGTTCATTTACTTGATGCTATCTGACGTTGATA
TGCTAATCATCACACACAGAGGCGTTCATATATGACTGGTCGTAGCTAAA
TTAATGTGCAAATTTTAGTTGGTGTGTGCATAAGTTATTCCAAGTGTCAA
TTCTAGACACTGCAGTTAGATATCAATTGACCAATTTCTTTGAATGGATT
TCTTTCACAGTGACCAACCTTACTACTCCCTGCAAAATATATTTACTTTT
GTTGTTTTAAATACAATATTTTTGGTTGAATTGAGTTCACAGATAGCTGA
GCCTATGCAAAACATCCAATGGAAGAGAATGGAAATGAAATGTGCATATG
TGAAAGGAAAATATGAATTTGGTTGAAGCACACTTGCGTGACTTTAGTAC
GATAGGTGTGGTAGTAACTGAAACAAACAAGCACTTCATTAGTCTAAGCT
CAACCAGCTATGTTCTGTACATGTTTTTGCAGTGCTTGATCAGAAGTTAC
GACAGCACCATGTTGTTGGTATATGGGTGTAACCTTGTGCTTTCCATGGT
GCCTGGCAGCTTGGGATTTATTATTACAGTAGCACAGTCGCACAACATTG
TATGGTGCAAATGACATACATCATGGAGGTGCTTTTGAAATTAAGTATCT
GTGATAAAGTGATGTTGTTTGAGTTCGAGCCATCATGTTTTGACCGTGCC
TTGCATGTATCCGAATCAAGTCATACACTAGAAAGCAAGAAGTATGCTTC
ACACAAATCAGCTTATGTCTGGTTCATTTTAAGCACATCGGCTGGTCTTT
CTTAAAAGTGGTGAAGGATCCAGGTAATTAGAATCAATGGCTACCAGAAT
TATTTGTGCTCACCTTTTTTATTCCTTTTCATGCAAACTGTAGAAAAGAT
ATGTTATATTGTAACGTAATCAAACAAAAGCGTGGCTATGTTTTCAACTA
TTGTGGTTGCAATCAGAAATCACCTAGCTTAACTTAATCAAACAAAAGCG
TGGCTAGCTTTTTGACCATCTTCTGGTTTGATAGTGGCCAAATATTTGTC
AAGATTTCGTTCTGCATGAGCTAAACATGCCCAAATTCCCAGTATCTCAG
TTATGTGAATGCTTTTGCAAGTAAACTTCCTATCGGAGCAGAGACAAACC
TCACTTTCAAGTTATTGGATTTGTCTTACTTCCTTCTAATAGACTAGATT
CCATTTGTTAGGGCTTATCTGTTAATGCGGCTAGGACTATGCGATACTTT
ATTCAATAGGGAAGATTGACCAGTTAAATTGTCTTCCAGTTCTAGTAGTG
GCAATCTCACTGTAGAACAGTATTGCAGTGACATTTTACTGAATGTTTAC
GTTTGGTTCTCTTATATTCACTAAGAATCCAAATTTGATTACTTTGAAAA
CGTCATAATGCAGGATACCTCTCTATTGTTGACTGGTCCTACCCGTGCTA
TTGTGATGATTGATCCTGTCAACTATGAGGTCGAGCTAAAAGTGAAGGGT
GACACACCATCCGAAGATAAACTCTTAAGCCTTCTGCTCATTGAGGACAA
GTACTATACTGTGGGTGAACGTTGCCAAGGAGTTCAAGGAGTTCACTGCC
ACACATACTCTTCTAAGCAAAGCACAGTGGAGGTGACAGTCGGCCATCTT
GCACAAACAGTAGAGGCTACTATCACAGTCCAGGTTGTCGAGGGATCCTG
GCCAACTCACCATCATGGGCGATTTGTCACACGTATGGCTAGTCTCAATG
ATCTGGAGATGGTGCTGCTTGATTCTCTGGATGGCATGGTGCCTGTCATG
AGTGATGGCACGATTGAGCTTTCACGACGTGTTGTGCCTGTTGAAGCAGA
TGGGGAGCTGAAGCTTTTGGTGGATGCATGGCAGGGCAATGACCGGGCTG
ATGTTGTTGGCCAAGATCAAGTAACATTTGCACCCGGAAGGACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.