Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE042879

[Submit comment/correction]

Sequence	AE042879
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE042879
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCACGTCCGCCGTGTGGACCTAGCGAAGAGTGAGAAGCCATTCAAAGC TGCCACCCGCTGTACCAGGCACGACCCCATTGAAGAAAGGAAAGAAGCCA TATCAGTGCGGGAGAGAGAGAGAGAGAGCAGCAGCATCAGCGGAGCAAAC CCCGCGCAGAAAACTACCTCCTTCCTTCCTTCCCTTCAGCGCAAACTCCT CCTCACAAGATCCCCAAATCCCCTCGCCGGAGCAGCCCCCATTGCGCCAC GAATCGGCCGTTCCGCCGCGGCGGATTCACGCGGGAGGAGGTCTCTCGCG TCCAAGCCTCGGCCACGCGCATTGCGGGGTCAGTTCTTTCTTGCCACCCA GTTCCTCTGTCTGTGGGTTTTCTCGGCCTTTCTTGTTGTTGAAAATTTGC TGTTGTTCTTATGGAGTACTATCTTCTTTTTTTATTAGCTTCCCCGAGTA GTAAAATTCAGTGCTAGAGTTCTTCTCGTATTATCTTCTCGCACTGTTCT AGGAGTATTCTGGACAGCTAGATGCTGTCCAATCCGTTGCAGGATTCGAG TCTCTGCCTCTCTGGTACGACCCGTGGGCTGGCCGTAATTTCCGTGGAGC AGTTGAGCGGTTAGTACTCCAACCGAGAAAAGAAAATGGGGTTCCGTCCG TGTAGACTCACTGTCTGGATCAATGGAGTAATACAGCTGTAGTTCAATTG TTTATATATCTTGATAATGGGGCCCCTGCCTGCAGAGCTTGCAATACTCC ATTGATTTGGAGTAAGCTCAGCTCCCCGCAATATTTTATTTTGGTCTAAA GTATGGTCTTATCTTTAGGTCCAAGTTAAGTTGTACTGTACTCTCTTTTC TAGTAGTACTATATTCCTACTCCTTCATTTCTCTAATTAACAAAACTTTT CTTCATTTTTGTTTGACTTCCTATATGTGGAGTAAATGAGGTGGCAATGT AACCACGTAGCTTAGCTTTGCCATTTCGGTTGCGTCACTTGTGAGTCGTG AGTTGTGACTTGTCTCGTGAAAAAATTCCCATCGTCAGGGCTTTTTTTAG ATGCTATCTTCACGGTTAATTAATAGGACTCAATGCCGTGCTGCCTCTTT GAGTCTCCTCTGCAGCTTTCCATTAGTCTAACTAACAATGGTGGACCACT CCAACTGTAAAGCGGAAATGCTCCGCCTTATTCGCTGATAAAGTTGCATT CTCGCCGTCCTCTAACTGGTCCTGTGTGGAATTCAAGAAAGTGTTGTGAA AAGCAGTTCGCTTACGCTTTGATCTTAATTTCATTCCTAGTGCAAATTTT CTGTGGAGGGGTCTGTCCTGGCTCCTCGGTATGGTACTGATAGGAGGTTC ATGAATGACACCACACAATCTTGCCAACCACCTCCAAGCTCCAATTATTT GTGCCCCCAATTTTTTCCTGGTGTGTAATCAACCATTTGGTTCTTTGTGA GGGTCTAGTCTCTTGGTCATATATATCTTTTCACGTGTTCTGATTTTTTG TTGCTTGCGAACAGATATTTCCCCACCTTCATTTTTCTTGGCTCTTAGTC CCTTGAAAGATTAAGACCGCCTTATGTTTATTAGTCGCTTCACACTAAGC TATTGGTTCTAAAGAATATTTAGGTCATATTTGTATTGCTTATCCAGCCT GTTTCCACCTTTGCATCTTGGAATCCATTGCACAACTTTAGCTCTGAGTC ATTTTTCCACTGTTTTGTGCATGCTTTTTTTAGCAGGAACAATTATCAGA TGTTTAATGCAGTAAGTGTGTTGAATCGTGCAAGGATTAAAAAGTTTGTG TGGAAATTGCAGGATATTTGTATTTTATAGATGACTTGGGCAGCAACTCT TGATTATGGTCGCAAGACAAAAAATGTGGACATACGGCCAGGGCCATTGC GTCCAGCAAATATCATAAGAAATAAATTCCCTACCTACAAGAATGGTTCA AACGGTATAGTGATCAAGCTGGCTGATGGCCCAGAAGTTCCAGCTCTTAA GGAGGCTGTTGCCAAGGAGACTGCAGATCTGCTTGATCGTCGCCAGCGTC TCTCAGTCCGTGAGCTTGCAATGAAGTTTGAGAAGGGACTCAGCACTGCC ACTTTGTTGTCTAAAGAGGTTCAGATCTTTTACACGTGGTGCATGATTGC CTTCATGTAAATCAGTTTAGCTCATGTGTTTATGTTTGTTTTTTTACTTG GTCAAACCTTCAGGTTAAGTGGAGACAAGTGGCTTTGTTGGAGCGAGACA TTCTCCTGAAGAATCTCAAGAGTGTATTGGAGTCACTAAGAGGTCGGGTT ACGGGCAAAACTAAGGACGAAATTGAGGAGTCTATTTCTATGGTTGGTTT CTTCATTTCCTATACTTCAGGCATTTTTCTTCTAGGTTGATCTTTCATTT TGACATGTATTCATGTCTAATAGTAGCATACATCTGTAGAAAAGAATACT GCAATAGCCTGATCTACCTCTAAGAGCTGTTTCATCCTTTCTCTTAGCAT TTACTTCCCCTAGAAAGTTCGAGCTAGCTGCTGAGGTAGCACTCCTTTCT AATGTTCACATTTGATTAGAGTAATGCTATTTTCCAGGTGGAGATTCTTG CAGTTCAGCTCTCCAAAAGAGAAGCCGAGTTACTTGAACAAAAAACGGAG GTCACAAAATTAGCAAAATCATTAAAGCTGGTATGTTCTGATTTGTTTGT TTGCACTTTGCAGTAGGCTAGATGTCAACACCCGGATTTTTAATTCCAGA TGCCTGTTATGCCATACATCGCAATCCTAGGATTACCATTTTTGCGAGAC ATAACAGATTGGATATCACAGTACATCATCCATTACAAACCATAAATAAG GTCTTACACAAATAAAGGATCTCATGATCCAGTCTTAGTACAATCAAGTA CCGGAATAAATAGCGTAGCGGTGGGGTCCATCTTCAGAGTCACAGGCAAT GCTGACTATGGAAGATAGTCCTAGTTATCATAGCCGTCCTGCGGTCCTTC ATCTTGGTAATCTCCTTCATAGTCTGGCCACGGGAATAGCCAGGGACAAA AGCCATGAGTACTCTTTAAGTACTCGCAAACTATCACTAACAAGTACGAT AGTTCTAGTAGGAAATGCTAAACTCGAGTTTAACTATAAAGTTAAGTTTG AAACCTAAGATGAGTTCAGAAACAAAGAAAGATAAAAGAAGTTTGAAAAC ACCTAAGTGGGAACTTAGTCATTATAGTCACAACCATGTTGTGGTCAAGT CATGTCACAAATCATTTCATATGTTGTTTTGAAAACATCTGACAACGGAA CAGTATGGCCACTCCAACTGTCCATAACCGCGGACACGGCTATTCGAATA GTTTGACACTCTGCAGAGGTGGTACACTTTCACCACAAGATTTGATACAT CTGTCAGGGATAACCATGAATCATCATACTTAGTATGCAGATAATCAAAC ATAACCTTTCCTTTACACACCCTAGTATAAGCACCTCTCCTATGAGCATG TCCTCCCAACCATGACCATCTGTCATCTTGGGCACTGCATAGGTGGACAA CAGCGAGGGGTAGCCTCAGCTCAAACCTCTCCCGCGAGGGAACTAATACT AGTGCATATAAACTTCCGGCTAAGCCTTACCCAATTCAGGTATTGTGGTT GTACGGTAAAATTTGAATGGTATCGCATTCGAACCCAACCATCAGTTTTG TAAAAGGGTTAAGGCTCATGGCTCAACATTTTCATCATTATAAACCATTT GTGTTTCTCAACACATGCAAAACATCTCAATAGAATGACTCATCATTCCA AGGTTTTCATAATTCATTTTCACCAATTATTCCCATCTAAGGTGATCTAG TTTTGGTTTTGCTCTAAACTTACTAAGTTAAGAGTGTTCACTAATGTGGG ATGCTAGGATAAATCTCATGCCATAGAATGACATCTAAATATAACTAACT AGGTCAAGTTTTATACTCTTTATGCTACCTTCAAACAAGTAAAGGACTTT AATAAAGTAAAGAAAGTAAAAGCTTGGAAATAAAACTTGGGGTAGGTAAT AGTCAAAGTGGTATAACCAAAGCATGCCTAATGCACCTTGCTTAGGTTAT CTAATTTAATTCCAACTTGCTAACAATAGCTTGCATTGTTAATGATGGCT TGCCTTGTGCAGTGCAGTGGTTGAAGTTCTCTTCCTCCTCATCTTGATAG AACTCCTCCTCGAAAGCTTGGTCGGTACTATCGTCTATAAATACATACGG GATACACAATCACCAAACAATACTTAACTAGTCTACTTAGCACACTAAGG CACACATTTGATGATCTAATATCATCACAAGCATCACAAGTTTGAATTAA CTAGCCTCATTCTTTTTATTTGAGAAAAGTAATTTCTACTCATTGAAATT ACTAAGATTTAATATTCTCCAATTAAAATATGGGATCATGTGGACACATG TCATCACCACATATTCTAACATATGGGAACGTGATTTAAAGGTTGGATCA CATTTTAATAAGTTTAAGTTTAATATTTAATGATTTAAAGTGACTAGAAA TGCCTATATAGCATTATTTTGGTATTAGTCCAAAGTCACTACATGTAAAC CTTAATATTATTACATATTCAGATAGGTATGGTTAAATGTGATTTTTGAG AGTTGGAATCAACTCAAAAGCTATCATGGTTGATTTTATAAAAATGTTTG AATGTGCAAATGCTTCTGTCTTGTTATTTTTACAGGAGAGATCTCTAACT CTAAAAGAATTAAATCCAACGGGCTTGGATAGATCTTTTCAGAAGCTTTC CAACAAAATTGGAATCACTCAATTTGGTTCAGTAAATCTTCCTGAATTGA TTTTTGAACTAAGGGACAAAAATAGTTTTAAGTCTAAATAGAAAAACCTA TATTTGAATTAACTGGGTCGCGCGGGAAATGAAATGGGTCGGCCCAGTGA CGCTCAGCGGCGCAGAGGGCGGCTGACAGGTTGGTCCCGCTTGTCAGCGA GACTTAAAACCCGAAACGGTATCTAGCGATCTGGGCCACACGATTATAAC GCGGATCAACGGCTCACAATCGTCGTCGATGACGGACTCGTCGCCGGCGA GACCGAACCCTAAACGGACGGTGGGGGTCTACTGGGGACGTACCAGGGCT CCAGCTAGTGCGGCGAGGCGGGCGATCGAACTGGACGGCGACGGCGGACT CAGGCGAGGTAGCGGCAGGGGCTGAGGTGGACGGAATCGACGGAATCGAC GGCAGCGTCTCCTCTGCTGCAGCTGCCTCCGGTGAAATTCCGGCGGCCTG TTGCTTGAGCTGCTCCGGCGAGAGGTGGGGAAGGACTGGGAGTGAGAGGG GAGTCGAATGGTGTGGCGATTGAGGTTGGGGAAGGCCTCCTTATATAGGC TCGAGGAGGGGACCGAGGGGGCGACGGCGAGCTCGTCGGTGACGACGATA CAGGGCGCTATCGGCATGGGCGGCGTAGGCGGACGGTGGCTTGCCTCCCA GCGGTGCTCTACGGCTTTATGGCGCAGCTAGGGGCGGTGGCATTTGGTCG GGAGCGTCGCGCGCTCTGGGAGACAGAGACGGTGCTCGACGGCGATCACG GCGACTGTGGGTCGCGCGGCGATGCACGGCCGTGTCTGGCGGATTGCTGG GGTCGAGGCGGAGCGGCGTGCGTGATATGGCGTCAAGGTGCGGTCTGCTG CGTGCTGGCGGCAATCGCGCTCTGGCGCGCTCTGGCTGGCTCGCAGAGAG AAAGGGCGGCGCTGCTGGGGAGTGGTCCAGGGGCTGGGGTTGATCGAGGG GTGGACCGTGGGCGGCGGTAGGGTTGGGCGGAGCTAGGGGACGTGCTGGT TTGGCGCGGCGTGGTCCTTGGCGTGCTGTCCGCGTCTGGCCGGCGATGAC CTCAAACGGGCGGCGCTGCACTGGTGCTGCGGCTAAGGGGGAAGCTGGTT GGGGACTTGGTTGGACTCGGGGGGGACAGAGGAGAGTAGAGAGGGTGCAA TGGGGGACAAGGGTTTAACTTAAAACAGTAATAGTTAGGCAGTTTGATCT ATGTCTGCCACCTGTTCGATCAAATGGCCGCAAGAACAAAATATTTGAAT TTGAGCTGATTTTTGGTGGAGTGATGTAACTTATGCTTAGGCATCTAGGT TTGCTTGGGATTTAAAAATGGAGTTCATTTGAGTGGTTTTTGAATTGGTG TGATCTATACATATGAACTACATTCAATTTTCAAATGTCATTTCAATTTA GTGTTTGAAAGTTTTTGAGATGAAGCAAAGTGGGCCTTGGTACATCACTA CTTCTACTAGCAAGGGGTGCAAAGAACCATAATGGTTTCTGTTAAGATTT GAGTTCTAGGAATAGCCAAAGTAGGCTAGGTGATTAAAATAGCCAAAGTG ACCATTTGCTTACTTTATTTATTTTGATTTATTTTTCTTTGGGAATTGCT TGGGAATGATCTAGATGATGTTTAATTCACCTTAGAATCATTTTACAACC AATGGATCACTCAAACATGGCAATTCAAAACAACTCCTAATTTAAATGCA CACACATATGAATGCTTAATTATTTTTAAAAGGAAAAGTTTTCGTTAACT CTAAATTTGATGATTTGGATCTTAATAACCTTGGATTAGAGTTTTGGGAT GTTACACTAGATATGTTCAGGAATCAGAATCTGTTTACTTCAAAGATTCG AAAGTTCTTAGTAGCATAAATCATTTATTTTGTAGTTGTACTATTTATAT TTGCAGCCAACTTGCATGCTCATTTGCTTTCTTTGTTGTTAGTTATATTA CTAGAGAAGCTATGCACACAGGTGCAGTTTATTGGTTAAGTTGTGAAGTC TTCAGGAAAGTAACTCATAGCTCCTTCTCTTGCTTAACGATAAGCTGAGC AACGCTCTTACAAAAACTCATCGTTATGAACTAATAAAGTTTTGTAATTT TGGAGGTCGATTGATAACACAGAAAGGTTGCTGTCCAGCTAGGGATTATG CCCATTGATCATAAAAAAGTTTAGTAATTCAGTACCAGAGAAACATACTC CCTCCGACCCAAATTAGTTGACTTAGATTTGTCTAGATTCGAATGTATCT AGACTTGTTTTAGTGCTAGATACCTCCGAATCTAGACAAAATCAAGTCAA CTAATTTGGGTCGGAGGGAGTATTATTTTAGCTGGGCATTCAGTACCTAT TTATATTAGAGTAATCTTTGCTTTGTCTTATATAGTAGAATGTATGTGAA AGTTTATGTCCATACGACTTGATTACTCTAGGGGGAGAAAATACGCACTA TTGTATGGCATAGGCTGTGGATCTGTGTGGTTCATGTGTATTCCCCTTTT GCACATTGTCATTTGGTTATACTTTTGAAGTTTCTTTTATCCTGCACATA GGCTTCTGAAGACGCCAAGAGAATTGTTGAAGAAGAAAGAGTTAATGCCC ATGCAGAGGTAGAGAGTGCTAGGTCTGCAGTGCAAAGAGTTCAAGAAGCA CTTCAGGAGCATGAAAAGATGTCCGAAACAACTGGGAAGCAAGTATGTAG ATATTATTTTACCTAAAAGCTTCTCACCTTCATTTGTTGTTACATACCAG TTAGTGCAAGGCTACAAGCTAGTTCATGCAGCGAAGTTTATTGGTTTAGC TGTTCTGTTACTTTGCTTCCAAATCATCAATATCTATCCAAGGTGTGACT TTTATTTGCTGTTTCGAAGGATTTGGAGGAACTAAAGAAAGAAGTTAGAG TGGCCCGGAGAATAAAAATGCTGCATTGCCCTAGCAAGGTAGAGTTGATT ATAATCATTCACAGCCTTATACATTATTTGGAGCCTGCCATTTCTATTTC ACATTATTACTTCTCCAGGCAATGGATCTGGAAAATGAAATCAAAACTTT ACGTAAGACATTCACTGATAAGTCCGCAGATTGTATCAATCTTTTGAAAG AGGTATGTGTTACTGCCGCGGGCATAAGAATTTTTGTATTTTATTCTACA TGGCTAGGCCAGTTTCAAAGCATGTTCATGTTCAAAGGTTAAATCGTATA AGCTGTAAGTAACTAAGTGAAAATTATTGAGTATAAATGTATTAGTTCAC TGAAATTGTAATGTCGAATATGACGCACATACACTATTTCTGTTATTTGG TGAATTGGTACTACTTGGACTAGTCACGGAAAAATGATTGTTGTGTTTCT GAACAGAATAAAACGTTGTCCAACGGGGGAATGATCCCTCCCTTGGCTAC ACGTTGTTAGGTAGAAATGAGACCTCTCCAGGCGTTTTTCACGCGGATAG CACCCGTTTAGTTCATCCGCGAATACCGCTATTCGAACCCGGGTGGGCGA GGTCACCACTGTGAGCTCAAGCCACCTGGACATCAAGTTGGCTCTGCTCC TATGCATGTGGCTAGCAGTCTCAAACTCTCATACTCCAAGTTTTCATCAT CGTAAATAATTCCAGTCAGTAGATAACTTGTGTATACTATAGCAGAATAC ATAGGCATATTTCTGATCTCATTGGTTTTCTACCAGTTGGAATTTCACAA AAGACTAAAAGGAAACAGCATTCCTGTGTTCGATTTGGAGGGTCTCCAAT GCTTAGGTTCAATACTACGCATAGTTTCTCAGAGCGGTACTCCCATGGAT TTTTCAAATATTTCAGTCCAGTGGTTCCGGATACATCCAAAAGAAAGCAA CAAAGAGATTATTTCAGGTGTAGTCTCTCTCTCTCCCTCCCTCTCTCTCT CTCTCTAGTTGTACTGTGATTGCAAAGTCTAGAAGCATCTCTGACATTAT TATTTTTCATAATATTGTCTGTTTAATAGTTTCTCAAGAATTTATAAGTT TGGTCTTTTTGTACCATAAGCTATCAAGAAGGAAACTGGGTACTCGTTGC CTGGTGAATTATGATTGTTAAGTTTTGGTCACCGTGTTTTTGGTTTACTA TATAGGCCAACCATTTTAATTGTTGTTGTGAAACTGCTGCAGGTGCTACA AGATTAGTATATGCTCCAGAGCCACATGATGTCGGGCGGTACGTGCAAGC TGAAATCAGTTTTGGGGGTGAAACTGCAATAGCGAAGACAGCTGGGCTAG TAGACCCTGGTTTGTTTAACTGAACACATCTGTCAGGGAAAAGTATCTGC ATCTCTTGTTTCTTACGTGGCTAACATAAGCTTGGTATTCTTCACAGATG CTGGATTGGTGGAATACGTAGAGACACTCGTAAGAAAACCTGAAACTGAG TTCAATGTATGACCATACAATCCTTTCCCAGTTTGTTACCAGTTAAAAGT TGTCCGTCCTAGCATTACCTGTGACGGTGATCCGGTGCTCTTAGTATATG AAATTAAAATCGCAAAAGCACCTATCCATATCTGAAGTCACAAAATATAG TCTCTTGAGGTCCTCGTATTTTCATATAAGCAGCGTCAAGCGTTCATCTT GAAGTATTGTTTCTGAAGTTTCAAATTTTGTTGCATCTCATTGTAGGTTG TTGTGCTCCAGTTGAATGGAGATGATCAGCCGAAAGAGTCTGTCCATGTT CTCAATGTCGGGAGATTGCGCATGAGACTTTCTAAAGGAAAGACGGTGGT CGCCAAAGAATTCTATTCCTCGTCGATGCAGGTAGGTTGCAGCAACATGG CTTCTCTTTCTTGGTTAGGCAGTATCTGCAAACAAATAATAGTGCTCCTT AGTAAAGCAGCTGTTCGATATCATTTTATGTTCAACATGTTGTTCATTCT TAAGGTTTAAAACATCTCTCATTTCAAGAAACGTTTTTGTTACCATAAAT TCAGCTGGCATAACCACACATCACCCTGCCATGTTTCCTGACACTTGATA TAGTCTGATCGTCCGTTAGTATTTGGTGTGCCTCTGACAGCATTCCTGTT GTTTTTCAGTTATGTGGTGTTCGAGGTGGTGGCGAAGCAGCCTCACAGGC AATGTTTTGGCGGCCCCGGAGTGACCTCAGCTTAGCCCTCGCGTTTGAAA CAGAGAGAGAGCGGAACACAGCAATCATGCTGGCGCGGCGGTTCGCCATA GATTGCAATGTACGTGCCTCAGCTGGGATGTGCATACCCACCAGCGACGT AAAATGCTAGTAGCTCTCACAGTCGCATGATTTTCCTTCTTCATGGTTTA TTTTGCAGATCATCCTTGCGGGTCCAGGCGACAAGACTCCCTGGTGAGGA AGGACCAGCTCAAACTGGTGCTGGATGCTTGTGGCTCTGCACTCCGGTCC GATTGGCTACCCGTGCAGACCGTACATGTTGTTGCACATCTACCGTGCGC AAGTGTGTTTGCGTCAGCCTCCATGATGCTGTAGTCTGTTTGGGTTCTGT TCCTTGTAATAGTAGCTGTTGGTGTGGCGGTGGTGGTGGTAGAGGCGGCA CCGTGGGCATCGTTTTAGCCGCCTTGGTGTTGTTCTGACATCCTTCCCAC GGTGCTTCTTCATCTTCGAAGGCGTCGTGATCTGTTAGCTAAGCATTTCT GTTTCTTTCTTCCGCCTGATACATGACACGATGGTAACTAAGCTTGTGAT ATGCTAATTATCTGTTTGTGCAGCTTGTGCTAGTTTGTCTGCACTGTAAT TGTGCTGAATTTTCATTGTGAACTGAATGCTACATATTATCTAGATTTTT TTTACGGAGATTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.