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GrainGenes Sequence Report: AE001788

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Sequence
AE001788
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE001788
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCTACAACCGCCGATCTCCGGCGTCCAAGCTCCTCCCAAACCTCGGCGC
GAAATGGCGACCACCGCCGGCGCCGCGCCGACGGCAATGGACGAGAAAGC
CCGGCGCACCCGCGATCTCCTGGCCAGCTTCTACAACACCGATCCCGCGG
CCGCCGGCGCTGTTCCCGCGTCCCCGGCGCGGCCCTCCCCAGCCGCCTCC
TCCGTCTCGCCACTCGAATCCATCAACTCCGCCTCCTTCAACCCTGATGT
CTACATGGACGTCCTGGTTCGCCCACCTGCTCCCTGCTCCCTTTATACGC
GGTCTCTCAGATCCAGCTCCCCGTGTCTTGGTCGGATCTTATGGCTGGGC
GTGCTTTGGAATTACTATGAACGAATATGACCAGCTTGTAATAACTGCTA
GTTGCTATGTTCTGGTTAAAATTTACCTGATTGATGCACATTGCATTAAT
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GTTTATAAGTGCAACTGACACTATAAAAAGGTGATGGGATTTCTTCACAG
TGATAGCTCACTATTCTCCTTCCTTCTTTTAGCGAGTTTGAGGTTCTAGT
GCTATTACCTGCTATAGTTGTAATATTCTTAATGTACCTATATTGTTCCT
GCAGGATGAAGACTAACATTGTTGGTATGGAGACAAACATGGAACAACTA
CTTGGAAAGGTTTGCATTATGATGTTACTAATGTATTCTTTCGGACATTG
TTGAACCAATTCGCCTTTTTTGACAGATAACATCAGTGCAATCAAGAAGT
GACACAGTGAACACATCTCTTTTCAACAAAAGGGAAAACATAGAGAAATT
ACACCGTACACGCAATCTCCTCCGGAAAGTTCAAGTAAATCCTGTTCTAT
TTGTGCTATTCTTCTTAAAGACTAATGGTGTATGACTAATCTTTCTTATC
AACAACGACATATACAGACAAGTTATGCTATGCAGATCCCAGCAATTGCA
GTTTAGTTAAAGCTAAAGTGGTATTCTATTGCTTCCTATAGATACCCTAA
CCCTGCCCATGTTATGTGGTCCAGTTAACCTACGTATGTTGTGGGTTTTG
TCCTATGTTTAGAATTGAATGTTACACTTGGCATAAAACCCAAGGTAACT
GTATAGCTACTTTGAGTTGTCTTCTGCATGAAGCAAGTACAACAGAGCAC
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GCCTTAGGGTAGCTGGACCATTAATCTTAACATCGTTACATTACTCATGT
GTTTGTGTAGCTGTCTCTCCATTATTTCATCCCAAATGGACCTTTCACAA
AATTCCCGGAATCATGTTACCTTTTCATAGGAACCACCATGAGTTTTTAT
TTTGTTGAAGGCATGCCATGAAGATATTTTGTTGTGGACTGCTCTTTCAC
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ACAAACTTTTCATAATGTCAATTTCCACTAATTTTCTCGCAGTTCATATA
TGATTTGCCAACTCGGCTCAACAAATGTATCAAGGCAGAAGCATATGCAG
ACGCTGTCAAATTTTTTACTGGAGCAAAACCTATTTTTGAGGTTTAGTTG
AGCTATTTCATCTTATAAACTTCCTCGACGCCCTTTTAGCATTATCTTCA
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CTATATTATGGCTCAGATTTGTAAGGAAGAGCTAATGTTAATTTTTTCAA
CAACAATTTATGATTTCAGTCTTTTCCCTTGCTATAAGGCATATAGTCTA
ATTCCTATTCTTTATATGTTAAATAATTGTGTTATCCTAATTGTGTCATG
ATCTCTACTGTTATTCTTTACTTATTTCGAGTAAATTTGCAGGCAAAGTT
GTACTCAGATTCTGAACCTATTGAAGCAAGAGCAGAAGCTGTGGTGCTTC
TTAAACAACTTAATTTTCCTGTATGTATTTTGTCTATCTTTTCATTATTT
GCATGCCAGTTTTCGTTCCATGTAGCTCTCACTTTGCCCTTCTTACGCAC
AAAAGTTTATAATTTTGCTCCTCCTTCCACCTATCCTCACTTGCCCACAC
TCCTGATTTGTAGGATGAGTACTGGATGGTCAGAAAAGCATATGTAGATT
GCATTGAATACAAACATGCTGTCACTTTTTTGTTCACACTTGACACACAA
TTTGTTTACTAGTATCCTGTAATGATCACTATGGGACCTTCAGGCATGAG
CTTCTCTAACGTATGCAATGTAACTGCAAAACAAGCAAAATCCTTGAACA
TACGCAAGGTATTTAAAAATGTGGGACGCATAGATGATAACTGGTTCGTG
GTCATAATGTCTAGTGCTTATACCATTGTTTGTGTACGTCAGATAGCCTG
GTGAAATTTCCAAACTTCACAATTTTCTGAACCTTCCTTCCTTGTATCGA
GGCAGAGGATGTGATTTATTTGTTGCACAGGTAAACATGACCTGTTAGTC
AGAGATTAGTTTAGTAAATGGCCATGCCATTCCAAAAAACATGTCCTGTG
ATGCAAATGATGTTGGCTTTTCATGTTAACAGTTACCATCTTCTCTATTC
ATAAATCTTCCAAGATGACACATTCAATCACTCAAACAATGTTGTGTAAA
TACCTCAAATCAGTGTTTGTAGAATGTGCTAGGAACTATGTGTATGTGTT
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TTTTATCATTCACAAAGTATGCAAATAATAACTGTGACTCGTTACAATAT
TATTATGTGCATACTGAACTCGGAGCTTTTGTTCATGTTACTCTGATAGA
AATGTAACACTGTTTGCATATGTTGCCATTTGCTCTGTGAATCCCATCTT
ACTAATTTATGTTGTATCTTTGGACAGGTGGACAACCTAAAATCAAACCT
ACTTGAGAAGCTCGAAGATTGCCTTCTAAATTTCCAGAACAAGCCCACAA
ATGTATGTATGAGAAATATGAGATGAAATAAACAATTTAAATTTTATTTC
AGGTGGAAGTTCTGTAATCTGGCACCACTTTAGCCTGTGTTGCCTATGTT
ATTACTTCGGCGGTGCAGTAAATCATCTATTATTGTTCATACCATATAAA
TCTAGTCTATTTGCAGTACCCAGTTTGCAATCCTTTTTTCCAACTTCTAT
ATCATTAAATCATCTAATACTCTCTTGTGTATTTGTTTTAGGCTTCAATT
GGTGATATTTCCAAGACATTCCGTGCTTATCTCATAATATTTCCTGATTC
AGAAAGACGTCTCATTGAACTTGCACATGCTTTGTTCACAAAGTAAGCCT
TCGCATATTTTATAAAATTTTACTATTAGACCATTAGCTATTTTTAGATC
ATAGATGACTCAATTCTGTTCATGGTACTCGCTATTATTTTTCGAGAAAA
CGCAAAAGACTTTTGTGTTTCATTGCATTGAATAGATAGAGTTTAGCTTA
CATCCTCCTAAGAGGTTCAGAGTTCATTACATCTAGCCAAGCCGAGTCTA
ATGTAAAAATACAATGAAGTGGTACACTAAATCCTGTTTGCTACAACAGG
AAGTAATTTGATTTTGAAAAGTTGAGACTGAAATAGTGCATCGTAGCACA
TTGCATCTCCAGTTCTCAATGCACCTTTAGCGGGTTTACTGTGTTTGTTG
CATGATGTGCAGAGCCTCTGTTTCTTTGCGAACATTAGTAAGTCAAAGTG
TTTTTTGGGAGATGCATTTCTTTGCCACCAAATCCAACGATTGGCTTAAA
CATCCTACTTGAGCCATTTCACTTTATTTTTGGCTCAAGTGTTCTCTAAA
TTGCATGATCCATATTTTTTCATAGTGAAGGCATTTCACAATCTGAGTCC
ATGTATCCAGAAAAAATTGAGATCTCAGTGTACAGCACACCACCAAACTA
AGATCATACTTCCGTTCCAAAATTTAAGCGATTCTAGTTTTGTTCTAAGT
CAAACTTGTTTAAGTTTGACCAAGTGTATGCATCGGTTGCCAACATCTGC
GACACCAAATTAGTTTTATTAGATCCATCACGAGTCAAACTTTAGGGAGT
TTGACTTAGGACAAGGCTAGAATTGCTTACATTTTAAAACAGAGTAAATA
ACAAAAGGTCGGTTGGCAGAATAGTTAAGGGATTCAAATTCCATGTTTTG
AAAGAAATGCCTCCAGACACATATGCCCAAAAAACTTAAGGTATAGCTTA
AGATCACAATCTTCGATTTTCTCAAATCTTTTGTTTCTTTGTTTCTTGAG
ATGATTGAAACAGCTTAAGTTGGTACGAAAGTAGTAGTTTCTTCTAGTGA
TCAAGGTATATTATTGTTTGGTTTGACTGCTCGCATAATATTTTTTTGAG
GAACTTTTGTAAGGGAAGTCCCTATAGTATATAGGAACCCAAATTCGTGT
CTATGAGGACTTGGACCTAGGTGGTGGGTTTGAACCAAATAAGCTAGGCT
GCCTTCCTCTGCTGTCGTAATATTGAGGTCTGAGGTGCCAGACTGACGAA
TGGGCCACATCTTGCGCTCTGGTGTAATCCATGGACAACCTGATGCATGC
TTTGTATCACAGAGTAAAGTCTATTTCAAGCCTCAAACTCATAGTGCTAG
TCAGAAACAAACCCCAAACTCGTAATCCCTGAAATTGGCACCCTTTAGTT
ACTCATCCAGTCATTTGAAACCCTGGAGGTATTTGGCGCACTGGGAAAAG
CACAATACCGGCCGGGGTCACCTGGTCAAAATAAAGTGGCATGCAGAGTA
GATGTGTGCATCCAGCGGCGAACGATCTGTTAGTTCTGGGCCCATGGTGA
GCGGCCCTCGCAGCTCTTGAGCACGACGATGTAGTCGCATCACGCCGGCC
ACTCCGGCGCCCTGCTGTGCCAGTGCCTGTTCCCAGCGTCCCAGCACTCC
ATCGTGGCGCCGGACCCGACCATCCTAGATGCATTTGATGGCCACGACTG
CTTCCACGGTAAGAATTCCGAAGACGTGGAAATATAGAGGCAAAGAACGA
GATTGGGTTAGCAGATGGCAGAGAGGAAGTGTTGAGGAAGATGGATATGA
CACATGGGCCCTAGTGAGACTAGAGACTTATCCCAGTTGGGAATGTTGTT
TTCCCGGTACGTCAAACTGGGCACTACTGCTATAAGGTTAGGATTGACCA
GGATAAGTAACTACAGGGTGCCAATTTCAGGGATTGAGAGTTCTGGGTTT
GATTTCGACCAGCACTTTGAATTCAAGGTTCAAAATATACTCTTTACTCT
TTGATATTGCCAAGTTCAACACCAAAGGAATGGGACTGAAGTAATCTATG
CGAAGTAAAATATTTTCTTATCTCTTGGGCAGCACGTGTGTGTACATACA
TTCGTTTTTTAGTGAGCTGATACATATTCCGTGCTGCATAATGGGGACAC
AAAAATTGCTTCAATATGACCTGATGTCAGATCAACTGAAACTTGCCTTT
CAACGAGGCTTCCTTTTGGCTTTTGCTTTTCGTTTTGTTTCAGTTGGAAT
GTACCTAGAGATTAGCTCTTCATAAGACTGTGCATGGAAATCAGTAATCC
ATGTGCCGGAACCTTAGTTTACTCGTACTTTGTTTACCTTCTTTCTCTTT
CACTTTTTGGTTCCATATGTTTCTGTTGGGTTTGATATCTAGCCTACCCC
AACTTGCTTGGAACAAAGGCTTTGTTGTTATACATTTATTATTATTGAAT
TGGAAATTCAGTCCATATACATTTGTCTTATTTTGTGTCTTATTTTTCAT
GAAGCCGTTATGAAACAGTCAGAGAGACTCTGAAGGAAAGAATTCCATCG
ACGGATCTGTTGGCAATGCTACGTAAGAGCTTTATCTGTTATAGTACCAT
CATAAATTTCTTTCCAGTATATCAAGAATAATAGTGTTAACATCTATGGG
CTCCTCTGTTTTTCTTGCAAAGACACAAGTAGTTGTGTTCCTTTCAGATC
TTGTAGTCATTTGTCATTATACGAGCTTACAAAGGGCATTGTGCACAAAA
TACCATACTGATTTGCTTCCTAGGTTATGATGCTAAGTAAGTTTTAATAT
TTTACCCAAGCATTTTATAAAGATTTACTTCATTTCCAGTTATACTGTGT
GTAATGGGAGGATGACTGCAAAGCAGCGGTCCTTCAAATTAATGGTCAAC
TTTTGTTAACGTTTTGAAGAAAATTACTAACTATTCAAATTTAATCGGTG
TTGATATTCAACTCCTAACTTGGGAAAATTCATATGTTTCTTGTCAGAGC
CCTTAATTTCAGTAATTTTATTATAGTTGAATGTATTGGGTGCTTTTGCC
TTTAGTTCCCATGCATATTAAGTTTCTTACCTTGAGTGGTCGTGCACATA
AAGATGACACTACTGTGTGTTTTCAAAGATCATTTCATTTCTTTTGACTT
AATATTGCTACAATTTGATGCTCATAGGAGGCTTATGGGAGGATGCAACT
GCCATTGATGAAGTTATACCGGAGGCTGCGCTGCCAGCTTTTTCTTTGGA
GGTTTGGTCTGTGCCCTGTAACAGTTCACATTCATGTTTCAAATTATAAT
ATACCATTTAAGGCATGAATTATTCATTCTTTTCCGTGTTTAACAAAATC
TATACTATCTGATTTCATATTATGTCACTAGTTACTTTGTTTTGCCTAAA
ATCAAGTATGAGTCTACATGGCTACATATGCATATATTTCTCCATTCTTT
AGTATTATGTTGATCCTTTCTGGCCGTTTCTTACTTCAGAATATTGGTTG
AAGCCTTCTTGCTTTTTCCTGGCTGGACTATTGTTATGTGTTACAGCACC
ACTTATGACAGGGAATATAGTAATGGAACAAGGGACAGTGCTTGTGGAGG
CAAAACGTGTTAGCTGCTAATTCTGTCCCATTCTCGAAGACGGCATGGGA
GTGCACAGACCCACCAATTGATGCGGTTAGGTTTAGCTGTGTACTCACCC
TGCATTTGATAGTCCTGTTACCCACAATCATTTTTGATGGACTGGAAACA
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CTCCGTCTCAAAATAGATGTCTTAGGTTTGTCAAAATTTGGATGAATCTA
TGTGCTAAATAGCGTCTAGATTCATCCAAATTTTGACAAATCTAAGACAT
CTATTTTGAGACGGAGGGAGTAGTTAGTATTGTTCATGACTATTCAAGAA
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TGTGAATTCACAAATCTATTTGGTAGGATATACTAAATTTCCTTTTTTCC
CTTGCATGTTCTTATTCAGGGGATGAACTGAATATATTATCCAGTTCCCT
TCTGTAGTTGCTTATTTGGGACACCCATGTCTATAAATCTTTGTATATTT
CTCGATGCTGATTTAACATGTAAACGTGTCTCTGCTGTGTAGACTACCCG
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GTGCAGAACTGCTTGTACCCTTTGATTTCTGTTAAGCTTTCATTTGATAG
TAACTTATTTGATTTAGCTTGTAATAGTACATATAGATTTGGAAATAATA
AAGTATGTACTGGGGAAACTTACATTTATTGGGCATGGCTGAGCAGATGT
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GATCTCCTGCAGGTATTATATTTGGAAGCATAAAAAACTTGACCACTCAT
TTCCATTGATAAAATGTCGAATAATGTAAAATAATTCTGCACAAGTACTA
ATTTGCTCATGCTTGTGTTAGAGCATACTTATACAGTTACTCTATTTCAG
TGTTCTCATTTGACTATGTTTCCTTTAGGAATTCCATCACCTTATAGATG
GCGATACCGAGTTGATAGTAAAGCTGAAAGGTTTGATTATTGATTGGGTA
CAAGAAGGTTTTCAAGATTTCTTTCAGAAACTTGATGTGCATTTTCATCT
GCTTTCTGGGAGAAGCAAGAGTTTCTCTCAAGAGTCAAATACCATGGATT
CTGCGCAAATCGACAAGATTCCAACAGTGCTGGTGCTTATGCTTGCACAG
CTTTGTGTTTTCATAGAACAGACAACAATTCCTAAAGTGACAGAGGTATA
TTTCTGCACTTGTTGACAGCCTCGTTTCTTTCATTTTGCATACTGCACTC
CAGTGAATGTGTGCTGAATGATTCTGAACCTTGTTATCTTTTTGAGGACT
TGGCTGCTTCTTTCTCTGGAGGGGGTGCACGCAGCTACGAATATGGACCA
CCTTTTGTACCTGGGGAGATATGTCGGCTCTATCGTTCATCTGGGGAGAA
ATTTTTGAACCATGTAGGCATACATTTTCCGAACCTTCCTTTCGCTTACA
TTGCATTACTTGAATTCTCAGTAGATATTGCTTTTCTCTGTATGGACTAT
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TCTTCAGCTCTGAAATACGGAAGTAATGTAATGCAGAATGTTGAGTATGT
GAAAGTAGGTTGAAAAGTAGCATCAGGACATTAGATGCTGAAGGAACTTA
GAATAACCTTCTGTCATGAAAAGCTGTCAGCCATAATATCGTTATTTGGT
CTAGAATGTTGGACTTATCATTTTCAGCAACCATAACACAGTTCACATGC
GGTGGAGCCTAGTTGGGAACATTTATGTAATTCAAGTTTTTATTATCTGA
GGGTGGCTGCTTTTCATTCACTTCAGAACTACATCTTTGTTTATATGGAT
ATAGCTTAGTATTGTTTTGTTTTCTTGGATCAGTACATAAATATGAAGAC
TCAGAAGATCTCCAAACTTCTTAATAAGCGGTTTTCGACACCAGTCTGGA
TAAAGGTTAGCTATCCTATTCATCAACATGAAATAGTATTTTTAGTCATT
ACCATTCAGTTATTTCTGGTTTTTGCTCAAGTTTTTATTACCACTGTGTA
TATTTGACCAAAACAGCACAAGGAACCGCGGGAAGTTAACATGTTTGTTG
ATCTACTTCTCCTAGAGGTTTGTTCAGTTCCTTATCCTATTGGATCTCTC
TGTTTCTTATGCTGACACACTTTTGAATCCAGAATGGAGCATGCATTATC
ATGCACTGATGCTTACGTCCCATGCTCACTACTCCCTTCGTTCATGTTTA
TTAGGCTCCTAACGAAATCTAGAAAATTCAGGTGATTTGGCCTGATTTAC
AATTAATGCTGCATGTGAATATGGTTAGGATGTTGCATGCGCTTAATCCT
ACGGACTGACTGGCCATCTGCATGCGCTGAACTAATGCTAGATAGGGCAA
TTGGCTGTTGCGCTGCATGCGCCTATTAATTGCCGATTTAATAGCTTTTG
GAGTAATTCTAGGTTAACTCATTGGCTAAAAAGTTGGTTTGAAAAAATTA
CCCCTGCCACTTCTTGTGTGCCTTGGTGGCAGAGCCGGCTCTAATAATCC
CAATAAACCTGAACGGAGGGAGTACTGGTCGCAGAGCCGGCTCTAGTAAG
CCCAATAAACCTGAACAGAGGGAGTACTGCATATGACTGCACCTGCTTTT
CAAAACATGAGCTCATGCTGGAAGTTCTTTCCTTGCAATGGGCCTGGGCG
AGGGGGAACATGCCAAGTATCTGCCAGGGATCATGTTTTCTTAGGTTTAT
TCCGGTTGTACAATGCAATTTCGGTAGTCATTTTCCATTTCAGTTGGAAA
ATGCAGTCGGATGTTTGGCGTACTATCAGTGATTAGCTCACGCTGGAAGT
TCTTTTTTGCAGTCTCTAATACAGTAATATCTGTTTCTCACCCTGCAGTT
CAATGGTGTAGTGTCTGAAGTCAAGCAGATCTTGCCTGGTTTAATTCGGC
GACATCGGCATTCTGATAGCACTGGCAGCACCACTTCCTCTAGAAGCAAT
CCGATGCGAGAGGACATGTTGAACCGATCAAACACAAATCGTACTAGAAG
TCAATTTCTAGAAAATCATCTAGCAAAATTATTCGAACAGAAAATGGAAA
TATTCACCAAAGTTGAATACACACAGGTGGAGATCTGCTTCACTTTCCTG
CTATATAACTCATGAAATTGCCTATTTTACTTTCTGTTTTATAATTTGTA
ATACCTTAGGAGTTTTGGATCCCTTGTTGATTTTAAATCTTTCTCCTTGC
TAGTATAAACATATCGAGTTGATCCTATTGATAATTCAATTTGTTTAGTA
TCTGAACTAGAGCTGTAACTGTCACCAGAGTTAGGGTAGAAGTTAGTTAT
TACTACTCCCAGTCCCAGTCACATGAACTTGTCACAGTGGCGATCTCATA
TTCAGTTCTTACTTAGTCGTGGACCAACAGGATCTTTTCACTGTCTGGAA
TGATCACATGAAAAAGATGAGTACATATTACTGGATTGTCCTAAAAACAA
TTTTTGTAATGTTACACTCTTCGAAGTACAGCTTTGCATAAATCAATCGA
CAAAGATGCACGTTTTAAAATGAAAAAACATCAAGAATTTTCCATAGGAA
TACAAAGAACTGTTCTCTAGAAAGCCATCACAGTCCAAATGCAGCACAAG
TCAGGGTGCTTCTTCTGAAAGAGGTCATACATCAGCTTATGATTGAATTT
TGCTGATGCTTGCTGTGGCAGAAATGCTTTATCAAATTTGTGATTAACTT
GCTAGGTGATCATGTTTTTTTTCCCTTTTACGTACGTGTACATCATATAT
CCATTTTTCACAGTAATTTCTTGTGTGATGAGTAAATTCCAGGAATCTGT
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GGCTTCAGACTTTCAACAGAAGTGGATTTCAGCAGATTCAGTTGGATATG
GAATTTCTAAAGAGCTCACTTAAGGAGTTTATTGATGATGAAGCAGCTAT
AAGCTTTTTACTTAAAGAGGTTAGATACCACCTAACATTGATTCACTGGT
TTCTACAAGGAATCAATCCAAAATAATGTACTCCCTCCGTCCTAAAATAA
GTGACATGGGTTTGTCTAGATTTGGATGTATCTAGACACGTTTTAGTATA
TAGGTACATGCGAATCTAGACAAACTCAAGTCACTTATTTTGGGACGGAG
GGAGTAGTAGTTTTATTTATTTTCCATAATATGCCTGCTTGTAATTCTGT
CTATATAGAACACTAGGCATAAGCATCTGCAGGCATCACATGTGAATAGG
AGTTCGGATCTTTAGGGTGAAAAGCATAATGTAGTAGTTAGGATCACTAG
GCATAAGCATCTGCACACATCTGCTGCATATTTAGTTTGCTGTTGTGAAT
CTGTCTCTGGAAGATGTTTGAACATTGATTATTTCCCCCTCCTTTGCAGG
TGAACAATGCTGCACACGAGAGATGTCTTGACCCAATACCTCTCGAGGCC
CCAATATTAGATAAGCTCATAAATGCAAAACTAGCAAAAATTAAAGAGCA
AGGCCCAGATGTATAGTAGCTACGTACACATCACATCGTTCACCAGCATT
CAGTTTCACTCAATTTAATTTAATACACACTATTCAGACCTATGTGCATA
TACCCGTGGGCTTGTTGTAGCACGTCACCATTTGTAATTTGTAAATCCGA
GGTCTAAACACTCGAATTGTACCAATACAGCCTGAAATGTATGCTTTTTT
GAGCTCCCGTCGACTTTTTGTACTCATTTGTCAATCCATATTTTGCCATT
GTATTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.