Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE004040

[Submit comment/correction]

Sequence	AE004040
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE004040
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCAGGGCCACGCTTTCGGGTCGTACTCCTTAACCGTGTCCGCCTCTGCTT TGCTCTCTTCTTCCTCTCGCCTCTCCAGAATTCACTTGGACCGACCCACC AATCAGTCGCCCCTCCCCCCTTCTTCCTCGGCTCCCCGCACCCCGACGCG GTAGCCGGCCGGCGAGGTAAACCCTCTCGCTCTCTCCCACTTCGTCCAGT TGGTTCGAATTTTGTGCCTGGATCCGGTTCCGGTTCCGGTTGTTTGTCCC GCGGGCTTTTCTTTTGATCCGGAGCGGGTTCGTTCAATTCCTGCTACAGA AAAAGAAAAACCTCCCCTACCCTGCACTCTCGCCTCGCTAGGGTTCTGCA GCCGCCGGAGCACCTCCGCATCCAGCGTCAGAGCCGCCGTTCCAGTCGAC CCCGCCTCGCCTCTACGCGTCCCCCCGTAAGCACGTGGTTGTCATCCCCG TCCCCCTACGCCGCCCTCTCCTTGTAATCGCGCCTAGAACCCCTCCTGTT CTCGCCCTCCTGTAATCCTTCCATCCCCGCCGCTTCCTCCAGCAGAACCT CGTCGCCCTGCTCGCTGGTCAACCGAAGGTCGTAGAGCAGCTAGCTCCTC CTCGTTCCGTCCACAGGCCACAACCCGACCTCGACCCCTCCGCCGCTTTT ACGTGTCACTGATTGTTTTTTATCAGAAGAACTTTCATCTACCAATTAGT TCCAGGAGGGGTTAATTTGTTGAGTTGTATACTTGTATGCAGTGCAAACA ATGGCAATCAATTTGCTGGTATATACATTAGTGGCCAGATGCTGATGATA TGTTCAAACAATGCCAATTAGTTAGTGTATTCTGGTGTGTCATGATCAAC TAGTTAGTTAGTGTAAACATTCTGTTCAGACAATGGCAACTACGTTATAA GTGCAAACAGCTACACTAAATCGATGGAATTATCCATTGGATTACTTTGA AATATAGTTACAACTTCCGTATGCGCACTAAAGAGTTCCAAAAGAATAAT CTTATTTCCAGAGGCAACTACAGACTTTTCATAATTCAACCTAGAAAAGA ATAGGAAAAACAGTTTCTCGGAGCTTCTCCCCTCCGGAGATTCTAAGCAT GGCATTTTGAATGATGGGGTGGAATTCATCGTGCTATAGTATAGGATTGT ATATCTAATCAAATGCTTGTTTTGGTGATGCAATACTCTACAGTCTTGTC ATTTTTTGTTTGTTTGTAATGACACAGCACACATGTCTGTTCAGTATTCT GGAGAATATACTAGCATACTGTCAGCAGTGCTTATCACCTTTGAATATGT TCCTTTCGAGCAGAATTTATTTATATGTTAAAATATTTCAAGTTACATAA CCTTCTCTTTCTTTTGATGCAGATTGCTTTTGTGCAATGAGTTGGAGAAT TCCTCTTTTCGGGTAGGTTAATATCAGTTGTAATTGAAAAGTTATCTACG TGTAATTGTCAATTCTGATATCTGAGTTCTGGCCGTTCATTTTCCAATCT CTTGAAGTGGATTTTGCCTGTTGTATGAACCAAGTTGTCTCTGTTCATGA ACCTAATATATCAGGAAATAGTGTATATAAGTGCCATTCATTTCTTATTC GATCAGGAAATAGTGTACATAAGTGCTATTCATTTCTCATTCTTGTGGAG CTTATGTCGATCTTTTCTTGTATGGATCGGGCGTCCTCTTTTCTTCAAAA CCTAACACTGAGGATTATTGCAAATTAATTAAGTTGTTAGTTCATGCTAA GTTATTAGTATGGTGCCTATCCAGCTACCATGCTTTGTGTGATGTCTAAT TCTTAGTTTCTACAAAAATAGTACATTCAACATGTTCGTGAATCTGCTCA TGTTTCTCTCCAAAGCATCATTTTGTTGTCAGCCAAAGAGAGTCACTCCT GTGTCATTTCCTATGGTTGGATCTTCTGTTACACTTAGTTATAAGAATAT TATATGTGAGTTGTCACTGTATATTTCGTCTTAAGGTTGCTTTGAGAACT TATTTACCTGTCTTGCTTACTTCCTTTGGTTCTGCTAAACGAATGCTATT AGCAGCTCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTGAACCCAATTTCCAGGACAT ATCTACGCAATCCTGGTACCCTCCCTCTGTGGTGGGTTCGTCTTCACGTC CATCCACGCCCACCTCTTCCAGTGCTAGTCCACATCAAAGAGCTTCAGAT CATCCTCAGTCTTCGTCACGTGGCCAGCCATCTCCAGCTGAGGCTGCAGG GATTATTGCTCGTTTGAAGGATAAGAGGTATGCTGTTGGCCTTCTTTTCT TTCACTACTGCTTGTATTGTTTTGCCTACAAGACTATATCTGCATATTTA CCTTACCTGGTCTGCATTCTGGACTATAAATTGCAACCAGCATCTTTGTT TTGCCCGTGATACGACACATATTTCATCTTCAAATTGAGAGTTTTTGGCC TGGTAAACTATTGTTATTTAGAGAAAGGGTCCTTTGAAGTTGTAAAGTTT CGTGCACCACACTGCAATATCAAAATCAAGGCTGACAAAATGGAAAACCA AAACTTCAGTAACTCCGCTTCAAGTAATACTGAACAAGCTTTTTGGTACT CCCTCCGATCCAAATTAATTGACTTGTATTTGTCTAGATTCGGATGTATC TAGACATGCTTTAGTACTAGATACATCCGAATCTAGATAAATCCAAGTCA ATTAATTTGGATCGGAGGGAGTACCAACTAATTAGGGTCGGAGGGAGTAG AAGATTACTACATCCAATTTATAAAGGAGGATATTTTATCTGACACCTTG CACCTTTGAAGAATCCATTCACTGTTCTGCAGTGCTTGATAGTATATGAA AAGAATACTTTGTAAGGTAGCTAAAACTTAGTGGTATGCTACCCTTTTTC GAACCATATAGGAGAGGACTGCATGTGATACATTAAGAGAGAATAGATAG TCAGGAATTGGCCGGGTACACAATACAAAATAAGTTCTGACAAAGTAGAC TACTGTAAACACCAGAACACAGCCCAGATGACCTACAGAAAAGTTCAGTG ATCTGCTATTTCAGGCCATCAAATTTACGTCGTAGGTTCCCCTTAAAAAA ATTCTAATTTTCAGGTTTTTTTCTTATTGTTGTTTCCAACTTACCATAGG AAGTTATGACAAGACACAATACATAACACTCCCAAATTTAGTTTGTTGCT TTTCTTGCGCCGACAGCATCAGCTCTGCATATGCTATTTATCATGTCTTA GTTATGAGAAAATATTGTAAATAATTACTGAACAGAGCCAGATTATTCAT CCATGTGCCATGGTTTGCTACATGGTCATTCTGATATCTGGATATTATAC TTGGGCATGAATGTACCTCTTTCTTTCACAATATGACAGCGGCATTGCAC CGAAAAGAATAACATGGACCATGCAAGAACGAATGATCGTCTACGTTTTT CAGTCAAGACCAGAGCCAAATACAACGTTTTTTTAAGTTGATTCTAGAGG GAAGTTGGAGATTAATTACTGATGAGTAGAAAATAAATTTACATAAAACG TGCCAAATTATAGATGAATCACCAATGAGTAAAACAAATGTACAGAAGCA TGCCAATTAGTGTAGGCTCGAAAGGAGTATATATGCTAGAGAATTTGGAA GGACCACTTATGCATGGTTGTTTATCATGTTTCTAATATCCATATGTTTA CTGTATGTGCATTTGCACAGTATTCCTTTATACAGACCATTACATTGTGA TATGATGCATACTTGCTTGGAATAATAACTATTATGTTCTTACTTTTTCT ATTTGTGCAGTGTTGATGAATTACAAAGGCTGCTAAAAGACAAAGAGGCA TATAATGCTTTTTTCAATTCCCTTGATCAAGTGAAAACCCAAAACAATGT AAGTTTGTTGCTGCATGTACCATTTGTCAATTGTGTTGCTGAACATATCG TGGTATAGTTAAAGTGCTGTTCTACTGGATAGCAACTGTTTTTAATGTAG TTTTTTTGCTGTTGGCCCTAATATAAAAGTGGTCCCAGGTTGCTAACTGC TAAGAATGGTTCCCCTGGTTTGTATTAGTTAGTGGTTATCGTTCTTTTTT AGCATAAATAGACATATAATTCAGTAGGTCAAGAGATGCAAGTGGGATCC CGCCAAGATCCCACGTCTAGTTCATTTGTGTTTTCTAGTACAAAATTTGG GTTAAAATTTTGAACTAGAAATCGCAAAATGAACTAGACGTGGGATTTTG GTGGGATCCCACTTGACGCCTTATGTAGGTCACTTTTCACTTCTTTTGTG CCAGCTTTTTTTCTTGCAGTTTTAACTTCATAAAATTCCTGTGAGCATCA TTACTTTACGTTATATAAATTCATTAAATGGGATGAGTTCACGTTATGAA TTCCTGTGAGTCTATTTAAATAGTTCAGATTTTAACTGTTCATTTGTGTC TTGGAATGTTCTGTTTGTACCTACTCCCTCCGTTCAGAAATATAAGATGT TTTAGATTTGTGAAATGAATGTATCTAGATGCCTTTTAGTGTATAGGTTC ACTCCGAACCTCTACGAACCCATACACTAAAAGATGTGTATATACATTCG ATTCACAAAGCTAAAACGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTATATGCT TTTTAACTAGTTCAGATGTCATTTTGGCGATTATTTTACAATTATTGTAT ATTTTTTGCTGACTGTGGTTAGTTTACAATATACTCCGTATGAGTTACCT GAATGCTAGATCTTGGCAATATTAATTAAAACATACCTAAGAGTGATCTT GTCGGTTTTCTTACTTGTGGCTCTTTATGTTCAGCTACGGGGCGAGCTTA GAAGGGAGACACTGCAGCTTGCGAGTGAGTTACTCATTTTATTTCTATAG ATCAATTATTGGTGTTTCCACATCAAGTGTTGGCTAAAGTACAAAAAGGA TACAAACGGCTTTTGATTGTGTCCCTAAATGGAATATGATGGGTTTTGGT GAATTTATTACAGGAGAAAATTTGGAAAGGGAGCACCGGATTTCAGAGCT CAGGAATCAGGTTTTGCTACTGTTCACACCTCTCCCTCAAGTTCACAGCT AAGCATGCTGTTTTTCTAGTGGTTGTAATATGTAAATGGTCGAAAATTCA GCCCAAACCATTATAAAAAGCCTAAACAATATTTTTACTCTAGTGATTAG TGCAGGTTATATGCTCTTGATAATCCCCTCCCCCCTGAAAATTCTAATTG TGTTTGTTACTTGTGCAGTGCACTATAATAAGAAGTACAGAACTGGCTGC TGCCGAGGACAGGTTGGCTGACTTGGAAAGGCAGAAGGACGAGATTATGA GGTCCTATTCTCCTGCTGCACTGCTCGACAAGCTGCAAAGTAAGTGTGCC GAATCGGCTGCTGCATTTCTTACACAAACCCATGGCACGCCACCTCCCTT ACGCGGCGCTTTGTTCAGGTTCAGTGGCCAAGTTGGACGAGGAGTCAGAG GAGCTACATCAGAAGTTCCTGGAGAAGGACATGGACCTGCCCACCTTCGT GCAGAAGTACAAGAAGATCCGCGCTGCCCACCAGAAGTGCACGTTGCTCC ACGACTCCGGAATTGCCTCGCTTGGCTGATATATCTATCCATCTTCCGTG TTTAGTGTCGTGGCACCTCTATTCTGTTGTATCTCCCGTTTCTGGTGGTG TCTCTCCGCTTGCTAGTGTTTTTGTGACTGCAGACATCAGACTGAGGTCT CATGTACAGTTGTCACATTTTAAGTATGATGATTGGATTGGTGGTTGATG CTGAGGGTACAATATGACCATTGGTAACTGGGGCCACGAAAACAAGGTGA GTTCTGGCATAACAGGCGAATTTGTTCGGGCATGCCATGCATATGCAGTG TTGTCATCACAGTATTTCCTTTCATTCTCTAACCCCATATCACCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.