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GrainGenes Sequence Report: AE040157

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Sequence
AE040157
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE040157
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAGCACTCATCCTCCCACCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCTCTCTCTCTCTC
TCTGGCTTCGCTTCCCCTCCACTCCACTCCACTCCACCACTAACCGAACC
ATCCTCCGTCCGTGGGAGCAGGGGCAGGAGCAGGACATGGCGAGCGCCAG
CAATGCGCAATGAGCTGACAACCTGCTCCCAATTCCTCGCCGACCTGCCC
TGAAAGCAGCGAAATTTCTCGCCTCCCGGCCAGTATCCGGAGCTGCTTCC
GCCGAGCCGCGCCGTACCTTAGCGGGGGCCACCGCCGCCGGACGGCCCGA
GATCCCGCCCGGCCTCACGCGCGCCGCTCCCACCGCCTTCTTCCTCGGTC
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GCAGGTTTGCTTTACATTATATCTCCTTGCTTTTGTTTGCACTTCTTGCT
CTGAGCAATGTTTGTTACTACTTAGTACTACTCACATGTTATCACTTGAT
CTCTGCTGCTTTCAGTGGATTGAAAATAACTGTCAAGGTATTATCTTTGT
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TTTTGTTTCGACACTGCTAAACTGCGATATAGTCTCATTTATGCTTCACA
TCATGATGACTGACCTACCTTTTGATAATGTATCATGCGCAGAGCCTTTT
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AGACTTCTACTTTCACATACTTCCGACAGAGATGCAAGATGTAAGGAGCA
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GCCCCTTCACCATCAGTCTGCCTTCTGATCCAGCTAGATAAGTCTGCTAC
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TGGTCTCGAATCATGCCATATAGAGAGCCATTTGCGTGGGCAATGATTCC
TCTGTTTGAAAGCAACCATGCTGCTGGTGCTGGTGATGCTGCCTCTCCTA
GCAGTCCTTTAGCACCAAGTATGTCAGCCTCAAGTTCTCAAGATAGCATT
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AAAGCTACATCGAGGACTCCCTCCAAGTAAAGCATTATTAACTGAGCAAA
GTTAGTTAATGTTGTTACTTATGTGATTATTAAATGATTAATTATGCCAA
TTCTTTTGTCCTTTGTAGGATCCGAAAAGGAAAGTACACAAACCAGTGAA
AGGTCTGCTGAAGCTAGAGGTGGAAAAACTCCATAATGAACGTAATGACG
TGGATAACATTTCTGAAGGTGGGAGCATGACCAATGAATTGCATGATGCT
GGTGAGCTCAGCAATGGTAGACACAGCAGGAATAGCGTTGATAGGATCCA
CAGTTCTCAGAATTCTAGTGCCATTGTCAAGAAAGATACACACCAGAATG
GTCAAAGTTCAAATACAGAGAATGTCGACAATGTAAATAGACAAGCTCCT
CATCCGCCTCCTTTTGTGTTGAGTTTTCAGTTTTGAAACTTATGGCGTAG
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AAAGAAATCTATTTATAAGAGTAGAACTGAGAAAGGATGATTCTGACATC
CGTAAACCTCCAGTAGAGGTTTGTTCACAAAATTTTCATACTCTTTTTAT
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AGATTAGTCTGCCTGCTCTATTGACACCCCAACACCATCTTCTGTTCACA
TTTTTCCATGTAGATCTCCAAATGAAGCTTGAAGCCCCTAAACCAGTATG
CATTCTGTTCCTTCTCAATTAGAGAACACTACTATGGTTGGTTCATCCCT
TCCTGTTTATTTTGCTGGTGTCTAACATGTTTGTGCTCCTTCAGGTGGTT
GTGGGATACTCTGCACTTCCACTGTCGACACACATCCAGTATGTATTAAT
TTGTCATGTTTACTTTTTATATACACGAAATGCTTAAATTGAACTAGTCC
GAGTCCGCTTAAATTGAAATGCTTTATTAGCATGTTATAACTTATTCTGT
TTATGTGACAGAAAGGGAATATATGAACTAAGCTTTAGATCTAAAACTTG
GGAGGCGATCTTTTGATTTGTTTTGTTTGACTCGTTAAGCTTTGTTGCTA
CGTATCTTTGGCTAGCAAATTAACTATCTTAGTAATTTTTTTATCAGTAT
TCCTGCCACTTGTGTAATTAAGAAGTAAACACTGTGATACTCATTCACTT
GCAAGACTGCATTGATACTGCATAGTGCGTGCTGCATACTGCATAGTGAA
CTGATAAGAATAGAATTGAATTTGATATGTAGCAATCTTCTGTGAATCCA
ATAGGTTACTTTCGGACGTATCTTTGCCAATTTTACGAGAGCTTGTTCCA
CATTACCTGCAGGAAAGTGGAAAGGTTTGCTACTTGTCCTTTTTTTTTGC
TGTTTGCACCTTGATTGCAGAATTATCTTCAAATACATTTGCTGTAATAG
TATTTGAAAGTTTGAATTGTTATACAGGAGAGAATGGACTACCTGGAGGA
TGGAAAAACTGTTTTCAGGCTGCGGTTAAGACTTTGCTCTTCGTTGTTTC
CAGTTAATGAAAGGATAAGAGACTTTTTCGTCGAGTATGACCGTCACACA
CTACATACAAGTCCACCTTGGGGTTCTGAGCTTCTTGAGGTATCTCTTTG
CTGTAGAATGGCTTAGATTTGAGCTTCTGCTGTTAGTTTCCTTCATGATC
TCTTCCCTGCTGATGTTCTTGCATTTGTGCAAAACACACAAGCAGGATAT
CCTCCTTTTGCAGCCAGCAGATGATAGTCTTTTTGGCCTGTTGTTTATTA
GTGTTGCTTTACAATGAGCAGAAGTATCACAGACCCATATTCTTGAACTG
CTTGCAAATCCTGTTCCGACTGTTATGTGTTGAAACATTTCCTACTCCGA
GTTCTTTAGATGTTTTTTGTAATTTCCTGTTGACGTTGCATGCTAATGAT
CTGAGCCTTGTCCTCTCCTGTTTTGGTCTTTGATAATAAACATGCATTTG
GATGCCTGTTCATTGTTATGCCTAGATGATACCCATTGGAATCTGTAAAA
AAAGTTGTGAAGTACTCCCTCCGTTCGGAAATATAAGACGTTTTAGCTTT
GTGAATCAAATGTATCTAGACATCTTTTAGTGTATAGGTTCATAGAGGTT
CAGTGTGAACCTATAAACTAAAAGATGTCTAGATACATTCGTTTCACAAA
GCTAGAATGTCTTATATTTCCGAACCGAGGGAGTATTTGTTATGTTCTAC
AACCTGACTAGGTATTTTGCTACATGTCTAATTAGATGTAGTCTATAGGT
TATAGTCAAGTTTATTGAGCATAACGAAAATTATCTTCACTGTGTATTGC
AATCTTTGTTTGTGATATTTTGCACAAATTACATTGTATTGGTACTTTGC
ACTATATACCAACAACATATATCTCTAACCTTGCATTTTTTTTGAACTGC
AGGCAATAAATAGTTTAAAGAATGTTGAATCTACTGCATTGTTACAGTTT
CTTCAACCAATACTCAATATGCTGCTGCATCTTATTGGTGATGGTGGTGA
AACCCTTCAGGTCAATACTTCTCTTATGTTTCCACTGCGGAACTGTTGTG
CTCCTTCTCTAAAGAGCAAACCTGGCCTTTTGACTGAACTACATTTGGTG
CCGAGTGTTAATCTTGATGATATTGCACACTGGATTTGACCTTACATATT
TATTTTTTCTTGCAGGTTGCTGCATTTCGAGCCATGGTTAATATTCTAAC
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TGTGTGTGCCAGTTTCTTTCTAGAGCTCTAGCATTCCATGTTCATCCAAC
TTCTTACAATCCTAATATCATACATTTAGACGACCTATCATTTACTGACA
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CATATGTTGCAGCACAACAAACACGGATGTGGCAAAAGCTGTTAATATTA
TCTAGCCATATTGCCTTAACTTTTCTTTAGAGGCCCCATCACACAAGATT
TTTGAGCTTTTCTCTCATCTTCAGCAAAATCAGAATCTCTCGCTTTAGTT
CTTTGAAATATTGTTTTACGTTTTTCCCAGTAAATAATTCATTCAGGAGT
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TGCAGGGTGCAGCAGGAATCATCTGATGGAGCTGAGAGAAATAGGTTTCT
TGTTAATTATGTTGATTTTGCTTTCGATGACTTTGGTGATCGACAGACAC
CTGTATACCCTGGTTTAGCTACTGTTTGGGGTAGCCTAGCTCGCAGTAAG
GTTAGTATGGATTTCTTCCTCTGTTTGAAGTAACCAATTATTGAATTTGT
TCTACTCGATTTCTTGTTGTGTTTAAATTTTTATGTAAGGACTTGTTAAT
GATGGAGCCGCGGGTGTAAACATTCATGTGAGGGAGGTCATATGTTGACG
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GAGCACTGGTTAGGGGAGGATTAGACCTAGTATAGTCAACCAAGAGAAGT
GCATGGCAGGCCTTAGAGACTAGGATATACTTCTTTGTTATTCATGTTCC
ATGTAAAGAGATGATAATTCCTTTGCATAGCCATCCGCCTAACAAGATAT
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GTGTGACTCAGGCTAGGGTAGACTTCTTTGTTTATTCATCTGTGATGTAA
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GCAATCAATTTGCCGACGACAACATCATATCCACCGACCAATATGCATCT
TAGGAACTATAGGATTTGCATGCTGCCGACTCGCCTGGCTGGCTGCTGTT
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ATATCTTACTGACTGAATTATGCCTTTGTTACCACTTGCCAGTAGCACTG
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ATAATTTGCATCACAGACTACTTAATACAAGCTGATTTGGTTATTAACCT
TTTCCTGTTACTGTTATTGCATCCCAATATTCACTGTTAAAGGTTCTTTT
TCTTACTTTTTCTGCTTATTTTGAATACTCCAGAGGTGGCTGTTCATTCA
ATCAGCTTAGTTTTAACAGAGATGCATCTTTCTGCTGCTCTGCTTCACCA
TTACACTCTTTTGTCGTTTTAGGCTAAAGGTTATAGAGTTGGACCTGTCT
ATGATGATGTGTTGGCAATGGCTTGGTTTTTTCTGGAGCTTATTGTAAAA
TCAATGGGATTGGAGCAAAGTCGTCTCTTCTACCACAATCTTCCACTAGG
TAGCACCAAACACTGAGCACTTATAACTGCACTTATTAGTATATCAGTTT
CAGTACATAAATAATTTAATTATACTACGAAGCATGGTTCTAATTTGTTT
GCTCTCATGCACTAGGTGAAGATGTCCCGCCGCTACAGTTGAAAGAAGGA
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TTGCTTTCTTCTGTTATGATCTTCTATCAATCATCGAGCCACGCCAAGTT
TTTGAGCTGGTAATGTTGGAAGTCACATTTACGCTTGTTCCTCCCTGTGA
TCTTTATTGTTTATGCTTTTGAATTCTTGACTTCTCCCTGCAAAAGAAGT
CCTGCTTTGCCTCAACATTAAACTGTTTTGTTTCAAGTACGGTCCTTTGA
TCTCATATCTGTGCTTGTTTTAACTTATTTATGATTTGGTTCACTGGAAT
GAAGGTTGTTAGGAGCTTTATTCCAAGTATGGTTATGCATAACTAAGTAC
CTGTGCTCTTCAGGTTTCGTTATACATGGACAAGTTTGCAGGGGTTTGCC
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TGTGTCCTCTAATCTTTACAATGATTAGGCCCCGTTTTACTTGTACATTT
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ATATCCTCCTGAAATTCCAATGAAAACACCAGTCGGTATCTCATGCGCTA
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ACTTTGATATCTCCTTCGTTACAGGAATTATCTCTCATCGGTTCTTATTC
AAGAGATCTTTCTCACCCTTGACCATGATGATTTGTCACAGCGAGCGAAA
GTAAGCATCTCAGTTGACATAAAAAACACTTTGGGCTACCTTTCAGTGCA
TTGCTTGCCATCTCACATGTGATGATTACTTATTCTTGTTTACATGCAAA
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TGCAAGCATGAATTTGACGCACGATATCAAAAAAGTGAAGACAAGCTGTA
CATTGCTCAGCTGTATTTTCCTCTTATAGGACAGGTTTGTGATAATCACT
TCAGTAGTAACTTCCTTGAAAGGAACATCAATAATCAGTACTATGTTTCT
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TCTAGTTCTCGGAGCCCTGATGCTGAGCGCCCTGCGTCCCCCAAGTATTC
TGATCGGTTATCCCCATCGGTTAATGCATATTTGTCTGAGGCTTCACGCC
ATGAAATAAGGGTATGTTGACACATTATTTATAGGAGCCTAAATTTCCAG
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TGCTTTCTGTTTTGTGTGGAAAATAATCTGGTAAGAGTTAAGATGCTATT
GGAGAGAATGTGGACACTAGACATCTCTAGAAGAAACTGGTTGAATTTTG
CTTGTGTTATTCCAAACAGAATTTAGTACGGTTCATGTGTGTCAGCATCT
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CGTGAAAAAATGGTTAGTCATGACTGCTATTTAATGCAGCCTCAGGGAAC
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CAAATCAACCCTATTCGTTGAGGGAAGCACTTGCCCAAGCGCAATCTTCA
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GAGACAAAAGTTGGTAAGTATTGCGTTCCCATGTGAATCTTGTGGTGTTT
TGAACTTTCTTCAGTCTGACAGAAAATTCCTGCAGGAACTCTGGGAAGAA
AATCTCAGTACTGCTGTGAGCCTTGAAGTCCTGGGAATAGTTGACAAGTT
TTCAGTTGCTGCAGCTTCTCGTAGCATCTCGACTGACTATGCTAAGCTAG
ATTGTGTAACATCCATCTTGATGGGTCTTCTATCTAGGAGCCAGCCCTTA
ACTTTCTGGAAAGCTTTCCTTCCCGTGGTCTACAATATATTTAGTCTCCA
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AGGGCCGTTGTTGGGTTGCAGATCCTTGTTAGGGTAAGCTGCTTGCTCAA
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CAAGTAACTCAGATGAAGTCTGATGGATCTCTTGAAGAAAGTGGTGAAGC
TCGGCGTCTTAGGAAATCACTGGAGGAAATGGCTGATGTAAGGAGTAAGG
ATCAATTGAACGATTGCGGCCTCCCTGTTAATGCACTTGAAGTGGCTGCT
GAAGGTTCCACGGACAATAGGTGGTCTTGGGTAGAGGTTAAACATCTATC
CAAGTGTCTGGTCCAGGCCCTTGATGCCGGCCTTGAACATGCCCTTTTGG
TAAGCAAGTTTGACAAAAGAATCCTACTGTGCTATCCAAAAAAGTGATGT
ATCATATATTGCGCTAAATGGGACTGTCCTTCTGAAAACAAAGTTGCCAT
CTGTTAATATCATCTGGACACCTGAAACACCAATATGTGATTATATACTT
GTAGTGGTGTCATTTTTATTCGTCTGAATTTCTTGAGCAAGTACTGAGCA
CTGAACCTGTAAACCCCAATGTTCTTTTCAGGGTTCGGTATTGACCGTGG
ACAGATGTGCAGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCATTGGCATATGCG
CCTGTTCCAGATCTTCACATTATGTGGTTGCTGCACCTATGTGACGCGCA
CCAGGAGATGCAGTCATGGGCTGAAGCCGCGCAGTGTGCAGTTGCTGTAG
CTGGCGTGATCATGCAGGTTTTTATCTTAACTGCTGTTCTTCTATTTCTG
TAACTCTCTGTGTAGTTTTATGACCTTCGGACCCTTTCTTACTTGCAGGC
ACTCGTTGGAAGGAACGATGCTGTGTGGAGCAAGGATCATGTTGCTTCAC
TCTGTAGGATTTGCCCTATCGTGGGCACTGATATCGGCGCAGAAGTAGCC
GCAGCGGAAGTTGAGGGATATGGTGCGTCCAAGCTCACAGTGGATTCAGC
TGTCAAGTATCTTCAACTTGCGAACAAGCTCTTCGCACAAGCAGAACTGT
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CTATGAGTCGATTCTTGAACAGGAGGCTAGCCCTATCCCGTTCATTGATG
CTACATACTACAGAGTTGGGTTCTATGGGGACCGATTCGGCAAACTCAAC
AAAAAGGAGTACGTGTTCAGGGAGCCACGGGATGTCCGTCTGGGTGACAT
CATGGAGAAGCTTAGCCATACCTACGAGGCCAAGATGGATGGCGGCCACA
CCTTGCACATCATCCCCGACTCGAGGCAAGTCAACGCTGATGAGCTGCAG
CCCGGTGTATGCTATCTGCAGATAACCGCTGTCGATCCTGTGATGGAGGA
CGAGGACTTGGAGAGCAGGAGGGAGAGGATATTCTCCTTGTCGACTGGCA
GTGTCCGTGCACGTGTGTTCGACCGTTTCCTCTTCGACACGCCATTCACG
AAGAATGGGAAAACGCAAGGTGGCCTAGAAGATCAGTGGAAGAGACGCAC
TGTGCTCCAGACGGAGGGTTCCTTTCCTGCTCTGGTAAACCGCCTGGTGG
TGGTAAAGTCTGAATCTCTAGAGTTTTCGCCTGTCGAGAACGCGATCGGA
ATGATCGAGACAAGGACGGGTGCGTTGAGAAACGAGCTGGAGGAACCACG
GAGCTCTGAAGGTGATCAACTTCCAAGGCTTCAAAGCCTGCAAAGAATAC
TCCAAGGAAGTGTGGCTGTTCAGGTAGGGGTTGTACTCCTGTAACTCTGC
ATGCACGATATGAACCAACTAGTTTAACTAACTTTGCTTGCTTCTCTTCT
CTTTTGCAACAGGTTAACAGTGGCGTGTTGAGCGTGTGCACCGCGTTCCT
ATCCGGCGAGCCAGCGACGAGGCTCCGGTCGCAGGAGCTGCAGCAGCTGA
TAGCCGCCCTGCTCGAGTTCATGGCCGTCTGCAAGCGCGCGATCCGCGTG
CATTTCAGGCTGATAGGGGAGGAAGACCAGGAGTTCCACACGCAGCTTGT
CAATGGGTTCCAGTCCCTCACCGCTGAGCTCTCCCACTATATCCCCGCTA
TTCTTTCGGAGCTATGACCGTGGCGTCAGTTAATTAGGTACTAGCATGTG
AATGGGTTGGCTGTTGTTTTTGTTGGAGCAGATGTCAATATTTCCAGTAG
CTTTGTTGTATAGTTTGAAGACTAACCAGGTCTGCGATTCTACAATTTTG
GGGTGTAAATTGTGTGTGGGTGATGTATCTGTCTGTAACCACCATGTTGT
TTGTTTGCAGTTTGCTGACAAATTAGCTAGCCACTGTTGAAACCGGCATT
TTTTTAATTGTTACTACTATTCAGGTTTGATGATGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.