Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE017111

[Submit comment/correction]

Sequence
AE017111
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017111
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAGTGGCGAACTTGTTTCTCCACTGTCAGTCCAAGGCGAGGTAGCTT
CTTGTAGCTGCACTGCTGCAGGCCAACTGGCCAGAATACCCACCACATGG
CGATCCTGTCCCTCCTCTCCTCCTCTCGGGCACGGTTCTCCTGCCTCCGG
GAACCTCTCCGGCAGGCGGGCCTCCGCGCCCTTCTCCCCCAAGGGGCTCC
CCCGCCCGTCCATCTGCACGCCCGCGCCGCCGAGCATGCCTCGACACGTT
CTCCCACCGAATTCTCCTCTCCTGATGGCGATCGCCCTCCTCCCCTCGAC
TGGACCTGCGTGGGGAGCCGGACGATTTCTTCTGGTGTTGGTAAGGAGCC
ATATCTTGCTTGGATTTGGATTGATTGTTCAATGAGTTCAGTTTTGGAGA
TTTTTTTCTATGCTGCAAGCGATCAAATCCATTAGAGTATTTCTTCTTCT
CTCCTTCCGGTTAGTTGGGATTTGTTTTCTTCAGATTACTGATACGTTGT
CAATGGTTCGCTAATATAATCTTCTAACTCGATTAATATTAAACCCTCTC
ACCCTGCTCCCAAAGTTCCGATCGTAACTACTTGCTATAGAACCAAGCTT
GATATAGCTCCGCTGATCTCCACATAGTTACAGTGTATACTACTCCCTCC
ATTGCAAAATGTAGGGCACATTTTAACTGTCAGATTTTGAACTTTGGCCC
CAAATTTCTTGTAATATATCTTACTTATAATTACAAATCACAGTCACAAG
AAGCACTTCTAAATATGAATCCAACGGCATAGAGTTTATAGATCATAACC
CACATATTAATGTATCGTTGGATTAGCTGTTGGTCAAAGTACACCTTACA
ATTTGCAACGGAGGAGTAATTTTGATTGGAATCAGTGATATCTTATGGTA
CGTGATGATACGCAGGTATGTCCCTCACTCAATATGGATCGACAAACCAT
GCTTTGACTTTGCACAAGAGATTCTATCAGACACTAAGGCCGCAACATCC
TTCTTGTGGACCTAGAGCTAGTATGGCAACAAATAAAGCACGCCGTAGTG
TGAATGGTCCATATGAATTTCAATGTTGTACATTTGGTTCTGTGGCAAAA
CCCATCCAGAGGAATCCAGCTTATTCAGTGCTAAATTCTGATGACGTTTC
TTATTTCAAGAGCATCCTGGGTGACAATGGAGTCATTCAGGATAAAGACA
GAGTGGCTGTTGCAAACGTCGATTGGATGGGTAAATACAAGGGCGCAAGT
CAATTACTGCTTCTACCAAAAAGTACCAATGAGGTTTGTATGTCAGCTTA
GTCAAGTGAAAATTTTAACGTATGAACAGTAGGTAGTTGGAATTCCATTT
CTTGACAATGGCAGTAACAAGTAGTACTAATTTTAATGTATGAACATTAG
GTAGTTGGAATTCCATTTCTTGACAATTGTATGATCTAGTGGCTGAATGA
TCTAATCATCTCAATGCCCCTTAAAATTTCAAATTTTAAATGACACCTGA
GGTGTGATTATGTAGTTAGAAAATCTGTTTGCTTTTGATTGTAGAAGAAT
GTTTGTACAGTAGTTAATTTTTTGGCTTCTGGTCCATTCACAGGCTTTTA
TCCATGGTATCAAGCTATTCCTGTTATCATGCATATTTTCTTTTTGATGT
ATTCCGACATGAAGTAACTACTCCCTCCGACCCTCTGTCCCACAATGTAA
GACGTTTTGACCAGATAAAACAGCTTGGCAAAACGTCTTATATTGTGGGA
AGGAGGGAGTAGTAATTATGCACATTGTTCAAAAAGTTGTTGGCATGTAT
TCATTGGCTGTCTCATGAAAGCCATATTCAGTAGGAGTATAAAATCAGCT
TTGACGGAGTGCAGTATTTCATAAGCAAAACACTGTAGCCTCTGGATATA
ATAACCTGTAAAAAAGCATGCATCACATTGGTGACCTACTCTAATAGATT
TTCCCAAACAACAATACAAGCAATGCTAAAAATAGCTCACGCATAAAAAG
TAAGAGTATCATCTAGGAATACATTTCTTTTTCCATATTGCCCAGTCATT
CTAGTTCTCTACCATTCCAGGTACGACACAACAGAAATTATGTGAAATCT
CTTATTCAACCATTCTTATTTCTAGGTTTCTAAGGTTCTTGCTTATTGTG
ACTCGAGACGGTTGGCGGTGGTTCCTCAGGGTGGGAATACAGGCCTTGTA
GGTGGCAGTGTGCCCGTTCATGATGAGGTAATTAGGAAGTTTCTTTCAAT
GATAAGATCATCTTTTTATTTCTTATCTTTGTAGCAACAGATTGTGGCAG
AGGCCTGGTGTACTTGGTGTCAGCTTGATATTGATATTTATTGCCCTTTA
TAAAAAAAAAAGGCAAACTACTTAAGATGAATATCTTTCTGCATTCTCTA
ATTTCTTTTCAGCTGCTGCATGTGTAAATTGCTGGGATGTTTACTTCATC
ATCAGAATGAACTATACATAATGAACTATTTATTCACATGGATCAACCAG
ATTGGTTGGCAAATCAGGGGCATAAATTAGTGCTTCGAGTTTCCAGTTCA
TGTCTGTATCACCACTACATTGTGTTACAGTTCATCTTACCTGTTCTACT
ACTTGTTGATGTGACATTCTTCTTCTTGTCTGTTTTAAATTTTTGTGTTC
TTTATTTACGTATACTGCTTCTGTGTTTCCATCACTGCTTTATTTACATT
TAGGCCTGAGATCACAAGTTTTGCTCCCTGTGTCTGCAGGTGATTGTCAA
TCTTGGTGGTATGGACAAATTAATCTCCTTTGACAATGTGGGTACAGTTT
CTTTGTTTGGACTTAATGTCCTGAATTCTCTTATCTATCGCATCTTTAAA
ACTTTAAGTTGCCTTAATAATTTTTTGAAAGAGCTTGTCAGGTTCTAAGC
ATGATTATTATGATGCTGTCAGGTAAATGGTATTCTTACCTGTGAAGCTG
GTTGCGTGTTGGAGAACTTAAGTACCTTGGTGGAAAATGAAGGGTAAAGC
CGTCTCCGGTATTTCTTCTACGTTTCAGTTCTACTCCCTCCAGCCCATAA
TATAAGATGTTATTACAACCAATAAGCTCATATATTGCTTATAATAATAT
CTTATAATATGGGATGGAGGGAGTAGTTTGTAATGCATGCATCTTTCATT
CGATGTGTTCAATTCATAAATAGTATGGGCTACCACTGATCCATAATGTT
CTTCAGTTCCTTGCTTATATGATATCCATTTTTTGACGGGATCCCTACTC
ACGTAATCACCTATGGATTCATTGTGTGCCAGTACATTTGTCGCCCATAT
TACCATATAATCATGTCATCGCTGTATACCTTTTTATAAGATCCATATGT
GCCTATTATTTTAAAAATCAAAATGCCTAGATTATTTCTATCATTTATAT
TCAGGTTTATTATGCCTCTTGACTTGGGAGCAAAAGGTAGTTGCCAGATA
GGAGGGAACATTTCAACTAATGCTGGTGGCCTACGTTTCATACGCTATGG
TTCACTTCATGGAAATGTACTTGGTAGGTACAAGTACAACCTTATGTTCA
CGGATCCGCTATTTCTGAACTCTCATTCTATATTGTTTTCACCTGAAGAA
AGTGGATATGCCAATACAGTCTTTGTTTTGCTAAGTTTATCTTGTAAGGA
GCAGGAAAATATTTGTTGTTTGAATATTTCTGTTGCGATATAAGTTACTG
ACATCATGATGCTGCATGAGGAGAATCCCCTAGAAAATTCAACTTTATGC
AACATGTAAGGCTGGAAATTGCTAGATACTTCCTAAAAGTAGAAACAAGT
TCACTCTGTGTATTTTATTTATGTCCAATTCAGGCCTTGAAGTCGTCCTG
GCCAATGGAACTGTCCTTGACATGCTTACTATATTAAGGAAAGATAACAC
TGGATATGATCTGAAGCACTTATTTGTCGGTGAGTATCGAATGCAAACTA
TTTTCCGCATTCTGGGTCTGTTCATTAAGCATGTTTTATGTCAAGCATTG
TTGTAAACACATGATTGATGATCCAGGAAGTGAAGGCTCGCTAGGGGTAG
TCACTAAAGTTTCAATACTTACACCTGCAAAGCTACCTTCAACTAATGTT
GCATTTCTTTCCTGCAATGACTACATGAGCTGCCAGGTCTCTTGCAAACA
CTCATTTGTATAATTAGGCATTGGTGGCCCCTGTTATAAAATGTATGCAT
ATGGTCTTGAACATAGTGATTACTGCTTTTCATTTTTCCAGAAATTACTG
CTGGCAGCTAGAAGGGGCTTGGGTGAGATCATTTCTGCATTCGAGTTCAT
GGATCGTCAGTGTATTGATCTGGTACTTACATAAGCAATTTTTTTAAAGA
AAAGTTACACATCGTAGAGAACAAACTGCATGAAAACAGTACGGTGTCTC
GATATTTTTGTTATGTACTACCACTGTTCTAAATATAAGATGTTATGGAA
ATTCATCCAAATTGAACTCCAAAACTTTTTGTATTTAGGAACGGAGGGAG
TACTTAGCACTAGAAACAAAATATGCTTTGACTGTGTTGCTGTATACGAA
GAAATGTTTCTTATTATCCTGTCAGCATACACATTTAATTTGGTAGCTTG
TTGGTTTTGAAGGCTATGGCACATTTGGAAGGAGTTCACAATCCTTTACC
TCTCTCGCCGTACAAATTTTATGTTCTAATTGAGACCACTGGAAGTGATG
AATCATATGACAAGTAAGTTCTGGTAGCATATTTCGGGTTTCAAAAGTCC
AAACTGATACGCACAAAGCTATTTCGAAAATTAATTTGTGCAGAGTCAAA
ATTCTAACCACTTCTGTGTAGGTGCAATCTTGCACGGCTTGTATTTATTG
ATCTTGGGCTTATTGTGATGGAAATTCTTAAGTGCCATATGTTGTCTACT
TGTCTTTTTGTTGCTTTTCTTTTGTAGAGCAAAACTTGAAGCATTTTTGT
TGCGCTCAATGGAAGATGGCCTTGTAGCGGATGGAGTTATAGCACAGGAT
ATTAGCCAAGCATCTAATTTTTGGAGAATTCGCGAGGTTGCCATCATTGA
ATCTTTACATTTTGCCAATTACTAATATGAACGGTCTTAAAGTGGATAGT
CAATCAACAGTCATCACATGGTTAGTATTCTATGTTGCCGTGTAATAATA
TAAGTTATCGATGTGTAAGGTGATGTTTCATGGTTAACGTGTGCCGAGTC
TCTGATATAAAATATTCAGGGTTTGATTTATATAACCTACAATGAAAACC
TGGTCAAAATGTATTTGGCATGTTGGGTTTGGTCTATCAAAGCAATATTC
TGGTTAAATTTTTTGGAATTGGAATTTATGTAGAGAACTTATGTTAACCA
AACCAAATCAAATCAAAAGCCGATACCTATTGACATCATTTGCGGCAAAA
TAATAATCGGTGAAACTACCATGTATTGTGGTTGCAGGGTATATCAGAGG
CATCTGTCAAAGTTGGGGCGGTCTACAAGTATGACCTTTCCATACCTGTA
GAAAAACTATATGATATTGTTGAAGAAATGCGCAGCCGTCTTGGTAAATT
TTAAACCTTGAGCTATCAGTAATCTGTGAGGCGTTATTAAACCTAGTTCC
TTTCTTTTCTAGGTGATATGGCAGAAGTATTGGGTTATGGTCACCTTGGT
GATGGGAATCTACATCTAAACATCTTGTCAAGCAAGTACAGTGACAATGT
ATGCCTGTTATGACTTGGAAATAGATCATTTACTTAGGTTTGGCTTCTGC
TTCTCAATATAGGACTACATATACTTTGCTTATTATGTTACCTTCACTGA
AAATTTCAGATTCTGGCGCAAATTGAACCATTTGTCTATGAGTGGACAGC
CGGCCACAGAGGAAGCATTAGTGCAGAGCATGGATTGGGGCAAATGAAAG
CCGAGAAGATTCACTACAGCAAGTCACCAGAAGCAGTAAGTATTTAAATA
CCATCTTTCTGCCACTTGCGTTATCTGTGAATTGTGTTCAACTGTTCATC
TTGAGAATTAATCACGATTTCAATTTCTGAATATGCTACCTGTTTAATTC
ATCAAGACTCTGGTGCACTCTAATGCTATGTGTGAAAATGTTACGTATCG
AACATCCTTTATTCATGGACTTGTTCTTGACACATGACATACGTATGCAG
CGCATCTTTATTCATGGACTTGTTCTTGACACATGACATATGTATGCGGT
ACATCTTCACGAGAGTGGTTTAGTTTAGCCTTTATGATTGGGAGAGGTTT
TCTCATTAGGTTTCAGTTATGTTTGCTTTCTACAACTCAGTATGAAGAGT
GATTTCCATGCTTGATGTTGGCAATACAATTTCAACAGAGCTCTCCCTAC
TATTCTCAAGAAAGAATCAGTGTAATAGTTTCGTCAAAAAAAAAAAAAAT
CTTCTAGCTGCATTACAACTAACTCGCCAGTTATTTGTTCCTCACAACAA
ATGTTGTATTGTGATTAGGTGCAACTAATGGCCTCCATCAAGAAGTTAGT
AGACCCTAACTCAATCCTGAACCCATACAAGGTTCTACCTCAGTCTGCGC
TGTAGCTAGAGAAGGTGGCATTCTTGTATCCTTTAGTTGAATGGAAATTG
AATTACATTTTACCCCAATAGTTTTCCCTAACTATGCAGCTGCTTCTGTT
AATAGCAGGTTAGCTGATTGATCTTGTTGGGGACCAAATCAACTTCAGAG
AATACTACTTAGGAAGAAGAAAACAAATAACAGATGGGAGCTTTGTCATG
ATGGCGAGATTGGTCAATACCCAGTAAAGGAAATCAGCAACATTCCTACT
GTTGTAACTAAGTCTGCTGTTAGCGCCTGGGATGTTGTAAACAATTGTTC
AGTGACATGAAAATAGGGAAATGAAGCATCATGAAGAATATAGGACAGTC
TTGGTTAAATCTTTCTTGGTAAAGAAAATGTTCTATGTGGGTTTCAAACC
TCCACAAAATTCATGGAATGCGTAGTGGACGGGTAGAACAGTGAAGCGTG
GCGCAAGGTGTTCATGTGGTACGAATCGATATAACAAAAATAACCCACAC
AATCAAGTCAAGATTCTGAACTGGTCAGTCTGCAATATCCATTACCACAC
TGGTTACAGATCTTCCAAACAAGGCAGACAACAAGCATACAGCCGTAAGT
AAAAACTACTTCCTCTGTTTCAAATTATAAGACTTTTGGTAGGCTAAACT
AGTCTACCAAAACATCTTATAATTTGGAATGGAGGCAGCATACGCATAAA
AGGTCATCTCAAACTCCATTTTTTCTTAAAATGGAGCACCAGGTTCCTTC
GAATCTTCATTTGCACCAGACATACTTACTTCAAGCCCTTGTGCAGAGCT
TCGACACGTTTCTGCCATATAGGCAATACCCAATTACCAAGTGAATTTAC
CTGGCTCGTAAACTTGCTAAGTCATTAAACAGTTGAACTATGCAGACAAC
CCACACAAATCACTGGAAGCATTCGGTTCCACAAACTGCATCTGTTCAAA
TTTGCTGTTCTGTTCTGCGTTTGACAGCCCAGTAACAAAAAAACAGCTGA
TTGACCGAGAGAACTACAAACATAACATTCCCTTCAACAGATGGCACAAA
GTCTCATGTACAATCTTTGAAAGCACATCAATCCTTGTGCAATGCAAGTA
TCACCACCTGATTTCATCACACATCTGACATCAGATAAGCAGCTCCAACA
TTGGTCAGAGATTGGTAGTCTCAAAGATTGACAATGTCAATGATATAAGC
CGAAATTAAGACAGTACAACTCAATCTTAGACTGCAGAGAGTTACAGAAT
ACCATAACAAGGAAGCCGTATCACCCACTGCCTAAGGCCATCTACAATGC
AAGGTGCTTAGACAGGTGCTTAAAGAAATAAACCGGCTTTTTACTAAGCA
TTGATGTTTATTTATACTAGGTAGATGCCTAACTAGGCATCTCTCCTGTT
CAGATAAGCACTGGTGCTAAGAAAACTGCTTGGTTTATTTTGCTAAGCAC
CCGTGTAAGCACCTTGCATTGTACATGGCCTAAGAGTGTACAGCTCCAAC
ATAATAATAACTGAGTACTGTCATATGGACTGAAGAGTACTTAAACAAAC
TGCTCTGAAGAAGAACCATATTTAAGAGTTGAAGCATCAACATAGCGAAG
CCACATAAAATATAGGAACTTGGAACTCAAACTTATATTTAGATCTCTGG
TCTGCTCCAAGGTAACCTCCATCAGTAGCGGTCATCATAAGAGCGAGCTC
CACGACTGGGGCGATCATAGGGAGCAGGTCTATCTCGGTAACTCCCACCA
ACGCGAGCAGGTCCACCACTTCCATATCTGTCACCATTTGCCACACGCGG
AGCACCCCTGCCATAACCACCAGTAGCTCTTGGCTCATCACGGTAATAAC
TTCCACCTGGTCGTCCTCCATCTCTCTCATAGCTTCTTTCTCTGGCAAAT
CCCCCTGATGCATAACGATCCGCAACACCATATCTGTCACCAGAAAAACG
ATCTGCAGCTGGAGGATAGCGATCACGTCCACCACCATATCGATCATCAG
CGTAGCGGCTACCATCATAACGGTCATCAACATAGCGATTAGCAAAACGG
TCTGATCCTCCAAAGCGGTCACCACGCCCACCGGCGCCACTGCCATACCT
GGAAGGAGGAGAGTACCTTCCAGGTCTACCTCCATCCGAATAAGGACATT
CACGAGCCCAGTGTCCAGAACGTCCACACTTGAAGCACTCATCACTTGCA
GCAGGAACCACGTCAGCTGCACCACGATATCCACCTCTAGCACCAGATGA
GTATCCACCACCCCCATATCCATAGCCACCATCATCAGTGCTCATCCTAG
GCTGAGCCTTGTTCACTGAAATGGTCCGGCCATCTAGTTCTCCATTGTGC
ATTTCCCGGATTGCAACATCAACAGCCCGAGGTTCTGAGAATGTGACAAA
CCCAAACCCACGGGAGCGGCCAGTGTCTCTTTCCGTTACAACCTATACAT
ACAATGAAAGTGAACTGATGGGAAGATATATAGTGAACAGCCAAAAAGCC
TAACACTAAAAATAACATGCACATGAAAATTGGGCCATACGAAAATGACA
ACAGCTGATGCATATTTCAAGCATGACAACCAGTGAAATAATCTCAGGAA
ACTGTAAGAACATAGCCAGTCCCTAAGCCACTGCTCAATTGTTGTAACTA
AAGAAATCAGCCTCTGCTTTATCTGCCCCAACAGTACAGTATGATGGTGA
TATCCAGAAGGCATACTATAGGCACAGGTCAGAACTGGTAGCATGTGAAA
CTGACAAAATCAATGCCATCAATGAGCCATAGAGGATATCAGTGGCACTG
CCAGAACAAATTGAACACTTCTGGATCGTCACTCATGTGCTGCAGGAATG
AGTAAACTCCACGTCCAAAAAATTTGGACGAGGCAAATTACTTTGGTCAG
CACTACAGGCACAAATCAATAACTTCAGAGCTGAATTTCTAGTAAGACCA
TGATAGGATCTTAGTTAGTCGGCCACATTCCTTCAGGACAGCATAGTTGC
AATACCTAAAACATTCTTATCGTTTCACTGTTCTTTGTTGATGTACGGCT
AAGCATGTCCATTTGAAGGGAAGGGGCATTTGAGGATGAGAATAATGGTC
TTCCAAGTGACTGTAAAAACCGACAAACACACAACACTTACACTGTAGAG
TCACCTGTAACAGCTCACTAATCAAGGACAACAAACAACTCTGCATCTTC
CTTTTCATATCAGAACTGATCCAGAACATTGCCACTATGCAACGAACTTT
CTGTTAAGTTCATATCGAACATTGCAATCATGTTGCGCTCCGCCGTATTC
ATGCAATTCTAACCTTATGCTGATATCAGTTAGCTTAAACACTACCATGC
CATGGCAACGGAGGAGCTCTGCTTCTGCCCACAAAACAGAGCCTACCAAG
TGGCTTAACAGTATCGTTACTTCAAACTGAATTTTACAGGACCCATCACC
CCAAAAATGCATAATCGTGTGCTCAAATTGATTAATATGTTTCATTTCCT
TCAACTTCATTAACTTCTTAAAATATAAAACTGGAGGTGACTGCAGCATC
CGCGAATCTGTAACCGCTATTAGATTGAAATTAGAAGACAGAAAAATCAA
GAGCGTTTAGTAAGAGCATAGATAAACAGTATCCTTGATAACGTACTAGT
AATAAACTTCCTAGTAAAGCCACCTATTCTTGCAAATTTGTTGAGAAACA
AGCGCATGATAAAAGCAACATGGTACTTCCAAATTAATATGGTTCCACCT
AACACCAAATGAACCACAAAGAAAGCAAGACTCGTCCAACCAATAACAGT
TTCTCAGATCGCAGCCTACTCCCCCGAGCAACAAATAATGTAATATAACT
GAATCACACACGAACTAACACATGACAACCAGCAAGTGATCAAGATTAAC
TTTTCGGTTTATGAATGGAAAATGCTTTGATTTCTACGGCATTTTATGCA
AAATTATGTGTCCAACTAATGCATCCGGCTGTCAGGTTACAACGGACAAC
AAAGGGGATTCACATAGTACATCATCACCTTAAGTTAAATGAACAATCTC
TGCAGAGAAATAGGACAAACCAACTTGTAGATGAAACTTATTATTGGACG
AAAACTAAACTACTAATCCCCGCTAAATTAATCCGTAAGACAAATCCTCA
CACGGGCGTGCACAATACATTCGAACGAAACGAACCGAGGAACATTATCA
TACCTGCGTCTCGATGACCTTGCCAAAATCGCTGAAGGCTCGCTCAAGCG
TGCGTTCCGTGGTGTCCCACGACAGCCCGCCGACGAAGATCCGGCCAACC
TCCTTCTCCGCCATCTCCAATCTAAAATTCCCCACCACCTACACAAAACC
ACCAATTCAACAACGAAAATTCGAGATCCGCACAAATCCGTGCCGCGGAG
CAGAGAAAACCGCACGCCCAGCTGGAGGCGAGATGATTGGAGGCTTTACC
TTTGCGCGAAAACGTAGAAGTGCTCTCTCGGCCTGCGGCGCTAGGGTTTT
GAGAAAGAGGGGAAGTAATGAGATGGGACGTGGAGGCAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.