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GrainGenes Sequence Report: AE031525

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Sequence
AE031525
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE031525
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGGAGTCCAGGACCCCCTCTAGCTTAAGCCTTAACCCTCCTGCCGTCTA
ATCCGCCATTGGAGATTGGAGCGAGGACGGACGACCAAGGGAGAGCGGCG
GGTTTACAGCGAGGAGTCCAGATGGCGGTGCCGGTCGCGGCCGCGGCGTC
GGGCAATGTGGTGGAGTTCATCCGCGCGCGGAGCGACAAGCGGGAGTACC
GGCGCGTGGTGCTCCCCAACGCGCTCGAGTGCCTCCTCATCAGCGACGCC
GAAACCGACAAGGTCCGTCCCCCCGTCCCGGCGACTCCTCTCTCGCTCGT
CCCCCGTGCCAGCGTCGCGGCAGCAGAGAATGCTCGCCGCCGGCTGATGA
TTCGATCGTTCACGCCTGATTCATTCGGGGTTCTGTTTTCTGTGCGCGCA
GGCGGCGGCGTGTATGGAGGTGGGCGTGGGCTCGTTCAGCGACCCGGAGG
GGCTCGAGGGCCTCGCGCACTTCCTCGGTGAGTTCTCACTCCCCTTCCTC
CTCGTTGTCGCCCGCCGGCCATCTCGCTCGGGCGAGCGCGGCATCTCATC
TGTTGCGTGCGCGTGATCTAACTAACCACCGGATTCCTGGAGCCGGTGGT
GGTAGTGGTTGGGTGGGGATTGTTTGTTCGTTGGGAACACCTGGGCTTTG
GCCCCAGCGCGGTGCTCCTGCCCCGCGATTTGCTCTCGAGCCTCTCGCTT
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CAGATTTGCAATCGGGTCAATGGATGTTCCTACTAGCAGAGCAAGGACAA
TAGTACAGCCAGCTGCTGGCTATAAGCCAAGTGCCATGTCATCTATAGCC
AACTTAGAGTTAGCATGTATAATAATAAGCTACAAAAATATAGTACTTTT
GTACTACATGGCTCATCTTTCACTCTCTCAAAGTGCCTAGAAGCACGTGC
TAGAGCTGGCTTTTGCATAAGAGCCCACTCTTCTTCTCTCTCCTCTTCTC
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GCCAGTGATTGGTCGAGTGTCTCCAGACGTGTTCTGACCGTCCGATCACG
CCCTCGACGGTCCAGAGTAAAGGGCCTGGCCAGAATGTGCTGCGACTATT
TTCCCCCCATCGCAGCGATAAGGGTAGCGGAGTACGATAGCCCGCTAGCC
GTTCCATTTACTGCAACATTTGCAACTGATGTTGCTTTTCTTCTTAAGTG
TCAAACCAAAATCCGTTTGATAATTAATGTCAGTACAGTACTGGTACTAT
CATTATGCGTATAGGCCCATGTGGAAGAAAGGACTGCGTTTATTGAACGA
TCCAACAATTTCATGTGAGACACGAATTTGGTTGGCCGGGCTCCACCGCT
CCAGGATATGGGAGCCTGTCTGCTAGCTGGACTGTGCCTCTGCACGTTGT
TGCACAGTAGGCTCCTTGCAGCTTGCTCAGTGCTCACTCCACGAGTCCGT
GTTGATCTTTTGTCTGGCCTGTGATTTCTACCCATGACTGGTAACATCAC
AAGATAATTCTACTCGATACACATTCGGGGAGCAGTACCAGTTTTTTTTG
CATGTGAGCTAACGTGCTGGGCTTATATTGCAGGAAAAAACTCAAAATGA
AAAGTCGATTTTCTGCGTGACACAATACTCTTGCAGTTATTTTTTTGGGT
CCAGTACAAAGTACAGTAGGATGTAGAATAGTATGTGTCGAATCTACAAA
TCTCAGACTTCTAGTTGTAAGTAGTGTGGCCAGGGTTAAATATGTTGGAG
TCGAACACTATATATCTTAAGCCTCCTATGTACGATGAGGGGAATACCGC
AAGTTTTAACTAAGAAGACATAGCAACAGGCTCGCAAGGGGGATTCGCCG
AGTTTTGCCGGCCGGTGTCGGGGTATCAATGGAGGATCACTTCTAGTCCT
ATGCCCCAGAGATACAGGAGTGTCGCCGTACCTCATTCACAAATCATGTA
GTGTCATCTTGGTGTGAGTGCGCGGTCCTCAGTAGATCATAGTGCACCGG
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GTTTTCCTTTTGTTTTGATTTATTTCTTACCATGGACTTGCTTGCAGAGC
ATATGCTATTTTATGCCAGCGAGAAGTACCCTGGAGAACAAGATTATACA
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GCCCAGTTTCGTTTCACCATATGTTCGCAAGTACGCACTTGATAGCAGGT
TTGTAAGAGTTTTCACCCAGGTCTGCATCATATTAGAAGATCCTGAGCCA
GTCAGAAAATAACACAGAAGATGAACAAGAAAGTAAAAAAGGAATATGTT
AGGTCCAAGTGGCGCATTATGACTGACATAAGTGCTCCTCGTTTAAAATA
AAAACTGACATCAGTCCTTTGCATACATTGTGCAAAGGTTATTGCACTTG
TACACTAGCCCACTTGCTATGCCATTATCATTGAGAAGTGTGGACAAAAT
GATATCTATTTAACATAAACTGTGGACTGTGGTCATGCTTTCTCAGTTGA
AAAAACTCTGTTCATGCGTAAGGCCCAAACTCCAGCATGCAGCTCTCTGA
AACCAAATACACCCAGGGACGGATCCAGGTTCTCGAGCTTGGGTGTTCAA
AAAGATTTTTTTGTAAAAGTTAAAGAAAAAATACTACAAAATCATAATAT
CTTAAGTTTAGATTGATGTTAGGTACCTGTTTTGCTCAAACTACAACACT
ATTTCTACATACACCTGTTATGCATTATACATATGATTTTGTTTGCCAAA
AAAATTGGGTGTACAACCCATGACCCTATATGTATCCGTCCATGAATACA
CCTAGCTCTTATGCTAAGGTGCATAATCGCCAATATGCTATGGCGCTGTG
GTATCATTACAGGGCATGAGGAATGCTGTACAGAAAATTATTACTATATA
ATCTTCCGACTAGGAACAACTTTGTGATCCTATCATAACTCTGTAAATGA
GTCCGCTCCTTCTATGATTTTATTATACTGGAACCCTGTCAGTATAATTC
ATTTGGAACAGCTTGATTTTTTGTTAATGCTTGGAAGTTACATGCAATGT
TCTTGGACTATATGTTTTTTTTGAGTATTTATGTATGTTGTGAAAAATAT
CAGCACGGTGGTTCTTCCAATGCCTTTACATCCTCCGAGACAACAAATTT
CTATTTTGATGTTAATGTGGACAATTTTGAAGAAGCCTTAGATAGGTAAA
CTTTCTTGTAGTATTTTGTAAGACAATGCTTGCATGTTGATTAAGGTTAT
GATTTCTGTGCTGCAGATTTGAATTATTTTTAAACATGAAATAAGGACGT
GGTTTCTGTTGTGCAGATTTGCCCAGTTCTTCATTAAGCCACTGATGTCG
CAGGATGCTGTTCTTAGAGAGATCAAGGCTGTTGATTCGGGTGAGCGGTT
GCTCTGTAACATCGATTTCAGCTTGTCATGATCACTTCATATTTATACTT
GTCTTACTTATTTAGGGCAGTAAGAAACACATTCTGGCTGACATTATGTT
TGGTTGTTTTTACAGAACACAAGAAAAATTTGTTGTCAGATGGCTGGAGG
ATGTATCAGGTACTTAAAAAGTCTCAACCTTCGTAGTTAGATACATCAGA
TATTCCATCTTGCAACACTGTGTATCTTCTTTATAAACTGCAATGGCTAA
TGGTTCAACCTCCAGATAACCATATTCGGCACGTTATAAGCCTGAATTAT
ACTCAGAATGCCATTCACTTCCGCATCTAAGCCTTATTTATTCGCAGAAA
TTGCTGACAACTTTAGCCCTGTACTCTTACTTCAGTTTTGAATCTTTTTT
CCACAGCTTCAAAAGCATCTGGCTTCAAAAGATCACCCTTACCATAAATT
CAGCACTGGTACGAAAATCCTGATGTTCAGATCGTGCTAATACTATCCAG
CTCATTGTGACTGTTGTTTCTGTATTGCTGTACTACTGAGGATGTAAAAC
AACAGTATGTTTCTTTTGTTGTGTTCCACCTATTACTATATCTATCAGAT
GCAGAGATCACATTTTAAATTCACGTCGAAAGAATGTTGAATAATTAAAT
TGTTCATGCATATATATGTTTATATCTTGCTGTGCATCCCTAATAAAAAA
GCTTCTTGTGGAGTTTGAATCTTATTTAAAATTATGCTATCTAATACATC
AGGAAGTTGGGAAACATTGGAGACTAAACCCAAAGAGAGGGGCTTGGACA
TCAGACTTGAACTTCTCAAGTTTTACGAGAAATATTCAGCAAACCTTATG
CACCTTGTTGTTTATGGAAAGGGTAAATATTACAGGTAGTCAATTCTGGC
ATACCTAAACCTATTTGTTACTGATAGTAAAATGATTTTGTAGAGAGTCT
TGATTGCATTCAAAGCTTAGTCGAAAGCTTGTTTAGTACCGTAAAAAACA
CTGACCAGAGAAGCTTCAAATGTCCAAGTCAACCTCTTGCAGCAGAACAT
TTGCAGGTAACTTCAAACAAACACCAATACACCTAACTAAAATAAAAGAA
TGGCAAATGATTTTGGAATTTAGCATATTTTCTTCGTTGTCATGCAGCTT
CTTGTTAAAGCAATCCCGATAACAGAAGGCGACTACCTAAAAATATCGTG
GCCAGTTACACCTGACATCCAGTTTTACAAAGAAGGTCCTTGCCGTTATC
TCGGCCATCTCATTGGGCATGAAGGCGAGGGATCCATCTTCCATATTATA
AAGGAATTAGGCAAGTTAATTTCAACAGTATATTGTTGTAAATATTCTTT
TGCTGGCATTATCTGCCCAAACATTGGTCCTTTTTTAGTTTCTTGTGTCA
ACTTTGTGACCTGTGACATGTCCATTTTTTACTACATTAGGATGGGCCAT
GGACTTGTCCGCTGGCTCTGGCAGTGACAGCACTGAATATTCGTTTTTCT
CAGTAAGCATGAGGCTCACTGATTCTGGCCATGGTAACTTTCCATCTTCA
TTCTGTTCTCTTGGAAGTGAAACAACCATTTCATTTTGTGATTTTAAGCA
TATTTCGGTATTATTTTGCAAGTACCTTATGTGCACATACAATGATTTCA
GAACACATGGAGGATATCATTGGATTGATCTTCAAATACCTCCACCTATT
AAAAGAAGATGGTATCCACGAATGGATATTTGATGAGGTAACTGGCAGAC
ACATCATTTATATAATCATCATGCGAAGTTATTTGATGGATTATGATTCT
AATATGCAGTTACGTTCATTATTTAATGAACATTGTACCTGTGGACTCTG
ATGTGTAACAAAACGAGCTCATTGGGTTTAACTTTTATTACCCAAGGTTG
TTTGTTGCCACAATTCGTAATGTGAATTTTTGTGCATGTCTTAAGTATAG
TGAAAAGCATTGCATTTAGTTACACATATGTACATGCTAACATGTTTATT
ATTATCTAGCTTGTGTCAGTAAGTGAAACAGAATTCCACTATCAAGACAA
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AATAATTTTGAATGCTAAATTCTGATATATATCTTGGGGAGATGTTTGAT
GAATGACAATTTCAAGTACCAATACTCTAACATCTAGGATTTCAACGGGT
CCAGAATCTGTTGAACTGCACCTTTTTCTGTGCTTCAGTACTGTCTTCTT
TCTTCTATTTGAAATACTTGCAAACTGGCTTGCAGTTATTTCCACCAGAG
GAATGGCTGGTTGGAGCATCATTGCCGTCGAAGTACGCACCAAGTAGAAT
AAATATGATACTTGATGAGTTGTCACCTGAAAGAGTAAGGTATGCTTACA
CAGTGTGCATGATTGCTTTTATTATTCCTGCTTCCATACGCATCATATCT
TCAATGTCAACATGTAAAGGCATATATGCAGATGTCTGGCGTTAGAAAAT
TGCTAGCTGATACCGTGACTCATCAATAAAGAATTGGGCACGGCCTTACT
TCATATCATGAACTTACTATTTTGCTGATAAGTTTATGCATCAAATCATG
TGTAGATATGGACTTCAATTAGCATACAATGCTAAGCTAACTATCATGCA
TTTATTCTTACTATGCAATACTATTCTTTGTCTCTAGAATACTCTTCGAG
TCTAAAAAGTTTGAAGGATCTACTGATTGTGCTGAACCATGGTACAATAC
ATCATATTCTGCTGAGAACATCACTCCTTACATGATACAGGTCCCCCCCC
CCCCTTCCCACCCCCAACATGCACATATAGACACTAATCTGATGTTCAAA
AAATTATTTTATTTTAAATCTTATGCCTCTGTTTCTCAGCAATGGATTCA
AAAAGCTCCTACGGAGATGCTCCATCTCCCAAAGCCTAACATTTTCATTC
CAAAGGATTTATCTCTGAAAGAAGTGCAGGACAAGGTAAAATTTGGAGCT
ACTTATATGTTCTGTGTTCACATTAGCGCACTTTATATGAATCTTCTAAA
ACTTCAAATAATCACATTAATTTTGATAAAACATAACTGTCTCACCAGGT
TATATTTCCGACAGTATTAAGGAAGACACCGCTTTCACGGCTGTGGTATA
AGCCCGACATGTTGTTCTTCACTCCGAAGGTTTACATTATAATTGATTTC
CACTGCCCATTGTCAAGCCACTCCCCCGAAGCAGCAGTATCTACAAGTCT
CTTTGTTGATCTGTTAGCCGATTACTTGAATGCTTATGGTAAGAATTAAT
TCTTATATTATTTGAATAACATATTTTACCATACTGACAGTCCATCTGGG
GATTGCTCCCTCCAACTTTAAGTCCAAAATATACACTCTCAGTTAGTTTG
TTCCTTTTGCAGCTTATGATGCTCAACTTGCCGGTTTATTTTATTCGATA
TATCTTACTTCTACTGGATTTCAGGTTCTGTTCTGTTACCATGTTCCTTC
CTGTTTCCTACTAGTGTTCCAGACAGATACATTGCTCTTTTCATGCTGTA
TGTATGTGGTTTGAATTCCAATTCAAATATTTTCCCTGTCTATTTTTTAA
GGTCTCCCTAGGTGGTTATAATGACAAGATGAGAGTTCTTTTGCATGCCA
TACTGAAGCAGATAGTGAACTTTGAGGTTAAACCGAACAGGTTTTCTGCC
CTGAAGGTGAGATGTGATCTTCGTGTTTCCTTGTCAGTTGTCATAATTTT
ACATGGGCTCATTTATATTTATCTGGTCCCTTTGTCATCAACTTTGTGTG
GATCAACTTAAAAGACCATTGAATTTCATTTTCTTAAACACTGGTCATCT
ATTGACTTGCAACTGATAGATGATCAAAGCTAAGGTATGTCAAATTTTAA
GCCGTGCACATGATATTGCTTGAACCAAAAGCATAAAGGTTTCCACAACA
CTCCACACACATAATATGATTGTTTGCTTGCGTCTTTTGCAACATACCCG
TCCGAAGTTTTTTATGGCAACCCCTTACCAAACACGTAGCTAAATAAAAA
AGATTTTGGAGCCTACAGATTCATTTCAAGTACATTAATCTAGATATATA
CCTAGAAAGTCAAAATTTATTAAAAAATCACAATTGTTCAGACTCAGCGT
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AATTGCATGGTATAACTTAGTAAGTGACATTTTGTTAGGTGCAGTTATCA
TGACGTACTGATTATGATAAAACTAGCATACGAGGGTTTGACCCTTTTGG
GCGAAGCAATTACGGAAAGCCCAAAGGAGGTGCTACCAATGCATGCTCAT
TATCCCAACTGGGGTTTTTCCTTGCAGCAAATTTTGGGCAGGGTATTGCA
AAATTTACTTATCAAGTTGTGGTAATACTATGGATCCTCATGATGGTCGA
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TTTCATGGCTAACTTTTTACCAACATCTTACCATCACAGGAAACTTCTGT
TAAGGACTACCAAAATTTTAACTTCAGCCAACCCCATTCTCAAGCTTCAT
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ACACTTGCTATCAAAGACATATTTGGAATGCTATATTCAAGGTTTGGTTA
ATTTCATGTTAATCACCGAAATGTATTTCCAAGGACTGGAATGCAAAGCC
AATTATGCTTATCATTAAAACTTCCTGTAGGGAACATTGAACCAGGTGAG
GCTGAGTCTATTGTCCAGGAGATTGAAGATACTATATTTAATACCCCCAG
TTCTTTATTCAAATCCATGTCTCCATCACAATATCTGATCAAAAGGGTTA
TCATGCTTGAAAATGAGTTAAAATGCTACTACCAAATCGAGGGATTAAAT
CCGAAGAATGAGAATTCATCGATTATCCAATATATTCAGGTATACCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCTCTTTTAATTTAATGCAGGTAATGTTATCCAAAGCG
GCTACCTGTCAGTGGTAAGTACCTTCTAATGTTTGTTGCAAAACTAATGA
TCACCCAACCTGTCATTAATCGGCGATCCTGCTTTCAGCTAATTATTGGT
TATGATCAACCTACTTTTTCGTGCTTGAACAGTTATGTGTGGTATGTCTT
ACATGCGAAATTGTTGCCAATTTCTCCAACTAAAACATTATTGGATTTAT
AAGGTAGACTGGATTTATCTGAGGAATAAATCATTTCTCCAAACGTTTAA
AATGTTCATATGGACTGTGCCCTGTAAAACAACTACTTATATCTCAAAGA
TTTTACTTCGTTTTTTTCATTATCTATACTGGTCTTTACTAAGGAAATTG
AGTTTCATGCCAAAATCATTTCTTTTGCACAACGCTTCTTTATTCTTTTA
AGTTATCTCTAATTCTAAGATATGTTCTGCTACAGCAACTAGCGTATGTG
AGATATCATGTGACGATTGCCAGAAATCAAAAAACATATACTGTCAAATT
TCTTGAAACAATCCATGCTGAAATGAGATCAAGAATGTTACAAAAACTAT
TCGAATATATAAATAATAACTGGCTCGTGTATGACTAGTACTGATCATGA
CGGTCGACTAAGACTTCAGTTACCAAGTCGTAAGGGGACGCCTGACTGAA
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AGGGACAGAAAATTAGTGTACACTTATCTTTACCCGTTTGTGAAAAGAGC
TAGGGCATGCTTAAGCCACCAAGTGATGCTCTAACGAGTCAATAGCATAT
CAAATCAGTAAAGTACAGCGGCATGACTGACTATGACGCGCCTATATGTG
TAAAACATATGGCAATGTTTTTGTTCTATTAACTTCCTTAAAGAATTGTT
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AATGCATAACGTTCTACGGCAAGAAGCATGCGAGATTACTAAGCATCATC
AATATATTCAGGTCCATGAGGACGACGCCATTTCGAACATCAAACTTCAG
CTGTTCTCTCAAATTGCTAGCCAGCCTGCTTTCAATCAGCTGCGGACTGT
TGAGCAACTTGGGTATATAGCAGGTCTTTCTCTAAGGTATAATTCTTTCA
GAAGAAACCTGTAGATTTAGTTTTCGTTGATCATTTACAATCCTTGCTTA
TTATGAATATCCTAATCTATCAGATCTGACCGTGGAGTCTGGGCACTTGA
AGTTGTTATTCAATCCACAGTGAAGGTAAAGGTTCAAAGACAAGGGTAAT
AAGTATGACAATGCTTTTTGCTGCTTTCTCCTTCTGATCTTATACTGGAA
TTCGTAGGATCCTTCATATCTTGATGCAAGAGTTGATGAATTCTTTAAGA
CGTTCGAAAGAAAAATCCATGAACTGTCTGACAAGGATTTCAAGGTTAGT
GGCTTCAGTTAGCTTCAGAACTAACTGATGCACCTGTCAATTTTTTTATC
TCTTTCACAGTGCACAGTACTCACGATATGATCAGTATTTGACTAAATTA
GCACATTAGTGTCTTTAAAAAAAATGCAAATGTATGATGTATCTCATGTG
GGTACTGACATGTCCTTATGACAGAGAAATGTCAAATCACTTGTTGATTC
GAAACTAGAGAAATTCAAAAACTTGTGGGAGGAAGCTGACTTCTACTGGG
GAGAGATTGAAGCTGGAACTCTCAAGTTTGATAGGATCGAGTCCGAGGTA
AGTGATTTAGCCTCAGGCAACAATGCACAACCACGATAAGTGAAAATTGT
GTTGAATATAAAGCAAAAAAGGACAGAAATGGTCAATACTAGTGTTGTGT
CTTTGACCCACATTATATTTGACCTGAAAATAACATATGCAGGTTGCTCT
CCTAAGAGAGCTGAAGAAAGATGAATTTATCGAATTCTTTGATCAGTACA
TAAAAGTTGATGCGCCTCAAAGGCGGACAGTAAGCGTGCAAGTCTTCAGC
GGCAACCATTTGGCAGAGTTCAAGAAGGCGATCGTCGAAGCCGAGCCGCC
CAAAACTTGCCGGATTACTGATGTATTCGGCTTCAAGCGATCAAGGCCTC
TGCACCGCTCGCTAAAGGGAGGTCCAGGCCGGATCACAATGGACTGACAC
ATATACTCTGCTACATATATTCTCTGTATCATGATGCATAGTATATAGCC
TGTGCGCATGCATGAACTAAATTTTTGATTGATTTTCGAATGCTCACACA
CGATCACACGATTGCACATTGCTATTCTTCATGTATGGAGCAACCATGTG
ATGCTATTTTTCATAACAAATCTACCAGCTGTAGAAATCAAACTGTAGTA
ACCATGTGATGCTATTCTTCATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.